Αφηρημένο

Εισαγωγή

Ένας αυξανόμενος αριθμός μελετών έχουν διερευνήσει microRNAs (miRNAs) ως πιθανοί δείκτες της διάγνωσης, της θεραπείας και την πρόγνωση. Μέχρι στιγμής, η συμφωνία μεταξύ των μελετών ήταν ελάχιστη, η οποία μπορεί εν μέρει να εξηγηθεί από ενδοογκική ετερογένεια της έκφρασης των miRNAs. Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν να αξιολογηθεί η ετερογένεια μιας ομάδας επιλεγμένων miRNAs στον καρκίνο του ορθού, χρησιμοποιώντας δύο διαφορετικές τεχνικές προσεγγίσεις.

Υλικά και Μέθοδοι

Η έκφραση των miRNAs διερευνώνται αναλύθηκε με πραγματικού χρόνου ποσοτική αλυσίδα αντίδρασης πολυμεράσης (RT-qPCR) και

in situ υβριδισμού

(ISH) σε δείγματα όγκων από 27 ασθενείς με καρκίνο του ορθού T3-4. Από κάθε όγκου, εξετάσθηκε ιστός από τρεις διαφορετικές αυλού εντοπιότητας. Δια- και ενδο-ασθενούς μεταβλητότητα εκτιμήθηκε υπολογίζοντας εντός των τάξεων συντελεστές συσχέτισης (ICCs). Συσχετίσεις μεταξύ RT-qPCR και ISH αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας συσχέτισης Spearman του.

Αποτελέσματα

ΔΠΔ

και μόνο (ένα δείγμα από κάθε ασθενή) ήταν υψηλότερη από 50% για το miRNA-21 και miRNA- 31. Για miRNA-125β, miRNA-145, και miRNA-630, ICC

και μόνο ήταν χαμηλότερο από 50%. Το ΔΠΔ

σημαίνει (μέσος όρος τριών δειγμάτων από κάθε ασθενή) ήταν υψηλότερη από 50% για το miRNA-21 (RT-qPCR και ISH), miRNA-125β (RT-qPCR και ISH), miRNA-145 (ISH), miRNA-630 (RT-qPCR), και miRNA-31 (RT-qPCR). Για miRNA-145 (RT-qPCR) και miRNA-630 (ISH), ICC

μέση τιμή ήταν χαμηλότερη από 50%. Spearman συντελεστές συσχέτισης, συγκρίνοντας τα αποτελέσματα που λαμβάνονται με RT-qPCR και ISH, αντίστοιχα, κυμαίνονταν από 0,084 να 0,325 για τη μέση τιμή από κάθε ασθενή, και από -0,085 να 0,515 στο τμήμα συμπεριλαμβανομένου βαθύτερο σημείο του όγκου.

Συμπέρασμα

η ενδονεοπλασματική ετερογένεια μπορεί να επηρεάζει τη μέτρηση της έκφρασης των miRNAs και, κατά συνέπεια, ο αριθμός των δειγμάτων που απαιτούνται για τις αντιπροσωπευτικές εκτιμήσεις. Τα ευρήματά μας με δύο διαφορετικές μεθόδους δείχνουν ότι ένα δείγμα είναι επαρκές για την κατάλληλη αξιολόγηση των miRNA-21 και miRNA-31, ενώ περισσότερα δείγματα θα βελτιώσουν την αξιολόγηση των miRNA-125β, miRNA-145, και miRNA-630. Είναι ενδιαφέρον, βρήκαμε μια φτωχή συσχέτιση μεταξύ των εκτιμήσεων της έκφρασης που λαμβάνονται με RT-qPCR και ISH, αντίστοιχα

Παράθεση:. Eriksen AHM, Andersen RF, Nielsen BS, Sørensen FB, Appelt AL, Jakobsen A, et al. (2016) Η ενδονεοπλασματική ετερογένεια των microRNA έκφρασης σε καρκίνο του ορθού. PLoS ONE 11 (6): e0156919. doi: 10.1371 /journal.pone.0156919

Επιμέλεια: Rajvir Dahiya, UCSF /VA Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες