Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι περισσότερες γυναίκες με κλινική εικόνα συνάδει με καρκίνο των ωοθηκών έχουν ευνοϊκές συνθήκες. Ως εκ τούτου, οι μέθοδοι για τη διάκριση των γυναικών με καρκίνο των ωοθηκών από εκείνους με καλοήθεις συνθήκες θα ήταν επωφελής. Περιγράφουμε την ανάπτυξη και την προκαταρκτική αξιολόγηση ενός ποσοτικού προσδιορισμού πολλών μεταβλητών ορό βάση για τον καρκίνο των ωοθηκών. Η μελέτη αυτή υπόθεση με γνώμονα εξέτασε κατά πόσον ένα ενημερωτικό μοτίβο θα μπορούσε να ανιχνευθεί στο I στάδιο της νόσου που παραμένει μέσα μεταγενέστερα στάδια.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Sera, που συλλέγονται στο πλαίσιο ενιαίων πρωτοκόλλων από πολλούς οργανισμούς, που εκπροσωπούν 176 περιπτώσεις και 187 μάρτυρες από τις γυναίκες που παρουσιάζουν για τη χειρουργική επέμβαση εξετάστηκαν χρησιμοποιώντας υψηλής απόδοσης, πολυπλεκτικές ανοσοπροσδιορισμούς. Όλα τα στάδια και τα κοινά τους υποτύπους του επιθηλιακού καρκίνου των ωοθηκών, και οι πιο κοινές καλοήθεις συνθήκες ωοθηκών αντιπροσωπεύθηκαν. Μια ομάδα 104 αντιγόνα, 44 αυτοάνοση και 56 δείκτες μολυσματικών ασθενειών αναλύθηκαν και ενημερωτική συνδυασμοί που εντοπίστηκαν. Χρησιμοποιώντας ένα σύνολο εκπαίδευσης των συνόλων μου δεδομένων 91 στάδιο, που αντιπροσωπεύουν 61 μεμονωμένα δείγματα, και ένα ισοδύναμο αριθμό των ελέγχων, ένα προφίλ 11-αναλυτή, αποτελούμενο από CA-125, CA 19-9, EGF-R, C-αντιδρώσα πρωτεΐνη, μυοσφαιρίνης , απολιποπρωτεΐνη Α1, απολιποπρωτεΐνης CIII, ΜΙΡ-1α, IL-6, IL-18 και τενασκίνης C ταυτοποιήθηκε και φαίνεται κατατοπιστική για όλα τα στάδια και τα κοινά τους υποτύπους του καρκίνου των ωοθηκών. Χρησιμοποιώντας μια δοκιμή που 245 δείγματα, περίπου δύο φορές το μέγεθος του συνόλου μοντέλο του κτιρίου, ο ταξινομητής είχε 91,3% ευαισθησία και 88,5% ειδικότητα. Ενώ αυτά τα προκαταρκτικά αποτελέσματα που υπόσχονται, περαιτέρω επεξεργασία και εκτεταμένη επικύρωση του ταξινομητή σε μια κλινική δοκιμή είναι απαραίτητο να καθοριστεί αν η δοκιμή έχει κλινική αξία.

Συμπεράσματα /Σημασία

Έχουμε περιγράψει ένα από αίμα με βάση δοκιμασία χρησιμοποιώντας 11 αναλύτες που μπορούν να διακρίνουν τις γυναίκες με καρκίνο των ωοθηκών από εκείνους με ευνοϊκές συνθήκες. Προκαταρκτική αξιολόγηση του ταξινομητή δείχνει ότι έχει τη δυνατότητα να προσφέρει περίπου 90% ευαισθησία και 90% ειδικότητα. Ενώ πολλά υποσχόμενη, η απόδοση πρέπει να αξιολογείται σε τυφλή κλινική μελέτη επικύρωσης

Παράθεση:. Amonkar SD, Bertenshaw GP, ο Τσεν Τ-Η, Bergstrom KJ, Zhao J, Seshaiah P, et al. (2009) Ανάπτυξη και Προκαταρκτική Εκτίμηση μίας δοκιμασίας Δείκτη Πολυμεταβλητών για καρκίνο των ωοθηκών. PLoS ONE 4 (2): E4599. doi: 10.1371 /journal.pone.0004599

Επιμέλεια: Ewout W. Steyerberg, Ιατρικό Κέντρο του Πανεπιστημίου του Ρότερνταμ, Ολλανδία

Ελήφθη: 21 Νοεμβρίου, 2008? Αποδεκτές: 14 του Ιανουαρίου 2009? Δημοσιεύθηκε: 25 Φεβρουαρίου του 2009

Copyright: © 2009 Amonkar et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Όλοι οι συγγραφείς απασχολούνται από Correlogic Systems, Inc.

Αντικρουόμενα συμφέροντα: Όλοι οι συγγραφείς είναι πλήρους απασχόλησης εργαζόμενοι της Correlogic Systems, Inc. και έχουν δικαιώματα προαίρεσης αγοράς μετοχών. Correlogic Systems, Inc. έχει καταθέσει αιτήσεις για διπλώματα ευρεσιτεχνίας σχετικά με τις πτυχές αυτού του έργου.

Εισαγωγή

Ο καρκίνος των ωοθηκών είναι η πιο θανατηφόρα γυναικολογική καρκίνου στις Ηνωμένες Πολιτείες [1]. Το 2008, εκτιμάται ότι περίπου 21.650 νέες περιπτώσεις καρκίνου των ωοθηκών θα πρέπει να ανιχνεύεται. Η πρώιμη διάγνωση συνδέεται με ένα ποσοστό επιβίωσης 5 ετών το 92%, ενώ μόνο το 19% των καρκίνων των ωοθηκών εντοπίζονται πρώιμη [1], [2]. Η πλειοψηφία των περιπτώσεων που εντοπίστηκαν είναι προχωρημένο στάδιο της νόσου όπου τα ποσοστά επιβίωσης 5 ετών για τις γυναίκες με τις περιφερειακές κακοήθεια και μακρινά νόσο είναι 71% και 30% αντίστοιχα. Ως αποτέλεσμα, πάνω από 15.000 γυναίκες πεθαίνουν από καρκίνο των ωοθηκών στις ΗΠΑ κάθε χρόνο [1].

Τα πρώτα συμπτώματα του καρκίνου των ωοθηκών, οι οποίες περιλαμβάνουν πυέλου και κοιλιακό άλγος, επιτακτική ούρηση και τη συχνότητα, κοιλιακό φούσκωμα, και δυσκολία στο φαγητό είναι μη ειδικά και τυπικά πολλών μη-καρκινικές και ευνοϊκές συνθήκες [3]. Ως εκ τούτου, η διάγνωση δεν συμβαίνουν, κατά κανόνα μέχρι την ανάπτυξη είτε μιας σημαντικής ποσότητας υγρού στην κοιλιακή χώρα, ή μια πυελική μάζα, ανιχνεύεται από τη φυσική εξέταση ή με ακτινολογική αξιολόγηση [4]. Μια πρόσφατη έκθεση έχει προταθεί ότι ένας μοναδικός συνδυασμός των συμπτωμάτων, αν τεκμηριώνονται πλήρως για κάθε ασθενή, μπορεί να είναι πιο κατατοπιστική από ότι προηγουμένως αναγνωριστεί, αν και τα ευρήματα πρέπει ακόμη να επικυρωθεί [5]. Πολλές εκθέσεις δείχνουν ότι οι πιο συχνά χρησιμοποιούμενες τεχνικές απεικόνισης – διακολπικό υπερηχογράφημα (TVS), ποζιτρονίων-Εκπομπής Ποζιτρονίων (ΡΕΤ), απεικόνιση μαγνητικού συντονισμού (MRI), Ραδιοανοσοσπινθηρογραφία και αξονική τομογραφία (CT) δεν έχουν επαρκή ειδικότητα για να γίνει διάκριση μεταξύ καλοήθων και κακοήθων ασθενειών των ωοθηκών [6]. Ορισμένες πρόσφατες μελέτες έχουν προτείνει ότι το υπερηχογράφημα μόνο, ή σε συνδυασμό με άλλους προγνωστικούς μεταβλητές μπορεί να είναι σημαντικά πιο κατατοπιστική στα χέρια ενός εξειδικευμένου εμπειρογνώμονα ωοθηκών υπερήχων [7], [8], ωστόσο, πολλοί ασθενείς δεν έχουν πρόσβαση στις δεξιότητες του όπως οι ειδικοί. Επιπλέον, σαφή διάγνωση συνήθως απαιτεί, τουλάχιστον, τη χειρουργική επέμβαση με τη μορφή λαπαροτομία ή λαπαροσκόπηση. Ως εκ τούτου, μια ακριβής, πληροφοριακό, ακόμη μη επεμβατική, δοκιμή θα είναι από κλινική αξία.

Δεν υπάρχουν FDA-εγκριθεί βιοδεικτών για τη διάγνωση του καρκίνου των ωοθηκών, ή για την διαλογή των γυναικών με υποψία καρκίνου των ωοθηκών . Παρά την ευρεία χρήση της, καρκινικό αντιγόνο 125 (CA-125) είναι μόνο εγκεκριμένο από την FDA για την παρακολούθηση της υποτροπής και θεραπευτική ανταπόκριση [9] – [11]. Σε μελέτες των γυναικών με γνωστές ή πιθανολογούμενες καρκίνο των ωοθηκών, οι αναφερόμενες ευαισθησίες του CA-125 στην ανίχνευση στάδιο Ι και II καρκίνων κυμαίνεται ευρέως από 29-75% και 67-100%, αντίστοιχα. Ωστόσο, CA-125 είναι αυξημένα σε μια ευρεία ποικιλία των φυσιολογικών, καλοήθων και κακοήθων συνθήκες [12] – [14] και 86% των γυναικών που παρουσιάζουν ανώμαλη CA-125 τεστ επίλυση σε 3-6 μήνες [15]. Πολλές προσεγγίσεις έχουν ληφθεί για να βελτιωθεί η προβλεπτική αξία της CA-125 μέσω σειριακής μετρήσεις [16], [17] ή σε συνδυασμό με επιπρόσθετους δείκτες [18] – [21]. Ωστόσο, μια απλή και κλινικά πρακτικό εργαλείο καρκίνο διαλογή των ωοθηκών παραμένει άπιαστο

Μια πρόσφατη μελέτη [22] περιγράφεται ένα πάνελ των έξι δεικτών -. CA-125, προλακτίνη, η λεπτίνη, μακροφάγων ανασταλτικού παράγοντα (MIF), οστεοποντίνη και ινσουλίνη αυξητικού παράγοντα II (IGF-II) ότι όταν συνδυάζεται είχαν πολύ υψηλή ευαισθησία (95,3%) και η ειδικότητα (99,4%). Η δοκιμή προορίζεται ως μια οθόνη σε γυναίκες υψηλού κινδύνου, ωστόσο, τα τελικά χαρακτηριστικά απόδοσης δεν είχαν αξιολογηθεί στις γυναίκες υψηλού κινδύνου και περιλαμβάνονται δείγματα που χρησιμοποιούνται επίσης για την κατασκευή μοντέλων που μπορεί να έχουν ως αποτέλεσμα την υπερεκτίμηση της απόδοσης του ταξινομητή του. Επιπλέον, τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού για τους συμμετέχοντες δεν ήταν σαφώς καθορισμένα, και τα καρκινικά και ελέγχου δείγματα συλλέχθηκαν κάτω από διαφορετικές κλινικές ρυθμίσεις, το οποίο μπορεί να οδηγήσει σε προκατάληψη στο σύνολο του δείγματος. Προλακτίνης και IGF-II αναφέρθηκαν το κάθε ένα να είναι ξεχωριστά περισσότερες πληροφορίες από CA-125, σε αυτή τη μελέτη, αλλά αυτό δεν συνάδει με αναφορές σε άλλες ανεξάρτητες σύνολα δειγμάτων [23], [24]. Σε μια άλλη μελέτη, Moore και οι συνεργάτες χρησιμοποιηθεί λογιστικής παλινδρόμησης για να βρείτε συνδυασμούς δείκτη καθιστά δυνατή τη διάκριση μεταξύ καλοήθων και κακοήθων συνθηκών σε γυναίκες με πυελική μάζα [25]. Με το συνδυασμό HE-4 και CA-125, 76,4% ευαισθησία και 95% ειδικότητα επιτεύχθηκε. Ενώ πολλά υποσχόμενη, μόνο 67 από τα 233 δείγματα ήταν από άτομα με καρκίνο των ωοθηκών και μόνο 15 από αυτούς από τις γυναίκες με σταδίου Ι και ΙΙ καρκίνους. Επιπλέον, ανέφεραν απόδοση βασίστηκε στα αποτελέσματα διασταυρούμενης επικύρωσης, το οποίο έλειπε ένα ανεξάρτητο σύνολο προπύργιο των δειγμάτων.

Ο καρκίνος των ωοθηκών είναι μια συλλογή από διάφορες οντότητες με περισσότερα από 30 υποτύπων των κακοηθειών, το καθένα με ένα διακριτικό ιστολογία, παθολογία και η κλινική συμπεριφορά [26]. Η ποικιλομορφία και η χαμηλή συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου των ωοθηκών εμποδίζει την αναζήτηση για βιοδείκτες. Σε μια ξεχωριστή, post-hoc ανάλυση, από ένα υποσύνολο των δειγμάτων που χρησιμοποιούνται στην παρούσα μελέτη, δεν μπορέσαμε να προσδιορίσει ένα μοναδικό δείκτη ικανό από μόνο του η ακριβής πρόβλεψη της παρουσίας του καρκίνου των ωοθηκών [24]. Στην παρούσα μελέτη, περιγράφουμε την ανάπτυξη και την προκαταρκτική αξιολόγηση του προφίλ πολλών-αναλυτών που μπορεί να χαρακτηρίσει τις γυναίκες με υποψία καρκίνου των ωοθηκών, σε άτομα με και χωρίς καρκίνο των ωοθηκών.

Μέθοδοι

Δείγμα Cohort

Όλα τα αλλά 20 δείγματα ήταν από τον ιστό-banking αποθετήριο του National Cancer Institute που χρηματοδοτείται από Γυναικολογικής Ογκολογίας του Ομίλου (GOG? Columbus, OH? πίνακα 1? Πίνακας S2). Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από την κυβέρνηση της Γκάνας για όλους τους συμμετέχοντες και το Διοικητικό κριτική ΔΑΓ Θεσμική (IRB) ενέκρινε τη χρήση των δειγμάτων στη μελέτη μας. Αυτά τα δείγματα συλλέχθηκαν από πολλαπλές τοποθεσίες, σύμφωνα με τα πρωτόκολλα που εγκρίθηκε από το IRB ΔΑΓ. Επιλέξιμες ασθενείς ήταν γυναίκες προγραμματιστεί για χειρουργική επέμβαση με την υποψία της ύπαρξης ενός γυναικολογικού καρκίνου ή προγραμματιστεί για την προφυλακτική χειρουργική επέμβαση, λόγω του αυξημένου κινδύνου καρκίνου των ωοθηκών (1ο ή 2ο βαθμό σε σχέση με τη νόσο). Όλα τα δείγματα, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που χαρακτηρίζονται ως κάθετους, μετά τη χειρουργική επέμβαση, συλλέχθηκαν πριν από οποιαδήποτε διαγνωστική ή θεραπευτική παρέμβαση. δείγματα ορού διαβίβασε στο Correlogic Systems, Inc.® (Rockville, MD) είχε απο-προσδιορίζονται και κωδικοποιούνται με ένα μοναδικό αναγνωριστικό GOG. Κάθε δείγμα συνοδεύεται από πλήρη έκθεση clinicopathology, την ηλικία και τη φυλή των ασθενών, και μια de-εντοπίστηκαν κώδικα που δηλώνει την περιοχή συλλογής. Παθολογία επανεξετάστηκε και επιβεβαιώθηκε από παθολόγους GOG να διασφαλιστεί η συνοχή. Τα δείγματα επιλέχθηκαν από τη συλλογή GOG να εξισορροπήσει τη διανομή της ηλικίας του ασθενούς, την ημερομηνία της συλλογής ορού, και την εκπροσώπηση των περιπτώσεων και των ελέγχων σε χώρους συλλογής. Το υπόλοιπο οροί αποτελείτο από 20 δείγματα από άτομα με καλοήθεις συνθήκες από Correlogic υποψήφιους συλλογή, η οποία χρησιμοποιεί ένα παρόμοιο πρωτόκολλο συλλογή ορού. Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους συμμετέχοντες. Οι «υποψήφιους» δείγματα Correlogic που συλλέγονται στο πλαίσιο IRB έγκριση για να στηρίξει την ανάπτυξη μιας κλινικής δοκιμής για τον καρκίνο των ωοθηκών. Ο πληθυσμός της μελέτης είναι οι γυναίκες με συμπτώματα του καρκίνου των ωοθηκών και έχει προγραμματιστεί για χειρουργική επέμβαση. Ως εκ τούτου, το καθεστώς νόσος αυτή επιβεβαιώνεται από παθολογία μετά από χειρουργική επέμβαση. Τα 20 δείγματα αποσύρθηκαν από τον υποψήφιο συλλογή κατά τρόπον ώστε να αποφεύγεται η εισαγωγή οποιαδήποτε προκατάληψη στο υπόλοιπο συλλογής και ως εκ τούτου δεν ήταν σκόπιμα επιλεγεί για να εκπροσωπεί κανένα συγκεκριμένο πληθυσμό. Η μελέτη εγκρίθηκε από την Δυτική IRB (Olympia, WA) και από το IRB του κάθε συμμετέχοντα χώρο.

Η

Επεξεργασία ορού, αποθήκευση, το χειρισμό και την αποστολή

Τα δείγματα αίματος (5- 20 ml) συλλέχθηκαν σε κόκκινο κορυφή σωλήνες γυαλιού Vacutainer (Becton-Dickinson, NJ), με θρόμβους για 30-180 λεπτά στους 4 ° C, και κατόπιν φυγοκεντρήθηκε στα 3.500 g για 10 λεπτά στους 4 ° C. Ορός αποχύθηκε σε κρυοσωλήνες, και αποθηκεύεται αμέσως στους -80 ° C. Κλάσματα από το απόθεμα απεστάλησαν Correlogic σε ξηρό πάγο και αποθηκεύονται αμέσως στους -80 ° C. Τα κατεψυγμένα δείγματα θερμάνθηκαν ήπια με το χέρι μέχρι σχεδόν αποψυχθούν, ολοκληρώθηκε επί πάγου, στροβιλίζεται, κλασματοποιήθηκε σε 150 όγκους ul και εκ νέου κατάψυξη στους -80 ° C. Τέλος, τα δείγματα αποστέλλονται σε ξηρό πάγο να βασίζεται σε κανόνες ιατρικής, Inc. (ΔΒΔ? Austin, TX). Ένα συνοδευτικό έγγραφο που προβλέπει ένα κωδικοποιημένο αριθμό αναγνώρισης του δείγματος και μια συγκεκριμένη σειρά της ανάλυσης. Η αναλυτική ιστοσελίδα ΔΒΔ ήταν εντελώς τυφλωμένοι σε όλες τις λεπτομέρειες του δείγματος συμπεριλαμβανομένης της κατάστασης της νόσου.

Multiplex Ανοσοαναλύσεις

Οι πολυπλεξίας ανοσολογικές δοκιμασίες περιγράφονται αλλού [24]. Εν συντομία, δύο γύρους της πολυπλεξίας ανοσολογικές δοκιμασίες διεξήχθησαν σε ΔΒΔ στο Luminex-based CLIA-πιστοποιημένο εργαστήριο τους. Αναλύτες ποσοτικοποιήθηκαν με αναφορά σε καμπύλες βαθμονόμησης 8 σημείων και την απόδοση της μηχανής επαληθεύτηκε χρησιμοποιώντας τρία έλεγχο ποιότητας (QC) δείγματα για κάθε αναλύτη. δείγματα QC διανεμήθηκαν σχετικώς ομοιόμορφα σε όλο το δυναμικό εύρος του προσδιορισμού σε χαμηλής, μέσης και υψηλής συγκέντρωσης και γενικά είχαν συντελεστές διακύμανσης κάτω από 15%. πρότυπα βαθμονόμησης και τα δείγματα QC ήταν σε ένα συγκρότημα μήτρας με βάση το πλάσμα για να ταιριάζει με το φόντο του δείγματος και αναλύθηκαν εις διπλούν. Στον πρώτο γύρο, συνολικά 204 αναλυτών που αντιπροσωπεύουν 104 αντιγόνα, 44 αυτοάνοση και 56 μολυσματικών μορίων ασθένειας μετρήθηκαν σε 147 επιθηλιακά δείγματα ωοθηκικού καρκίνου (40 σταδίου Ι, 23 σταδίου ΙΙ, 67 σταδίου ΙΙΙ, 12 σταδίου IV, πέντε μη σταδιοποιημένο) και 149 δείγματα ελέγχου (104 ευνοϊκές συνθήκες, 29 φυσιολογικά υγιή, 14 άλλους καρκίνους και δύο χαμηλής κακοήθους δυναμικού) που χρησιμοποιούν ιδιόκτητη πολυπλεξίας ανοσολογικές δοκιμασίες (Πίνακας S1). Ένας δεύτερος γύρος ανάλυση διεξήχθη 86 ημέρες μετά την πρώτη αναλυτική γύρο, στις 104 αντιγόνα, χρησιμοποιώντας ένα δεύτερο κλάσμα του ορού που είχε υποβληθεί σε πανομοιότυπη ιστορία κατάψυξης /απόψυξης όπως τα δείγματα που χρησιμοποιούνται στον πρώτο γύρο. Λόγω των περιορισμών του όγκου του δείγματος, 27 δείγματα δεν είχαν να αναλύονται στο δεύτερο γύρο. Έτσι, στο δεύτερο γύρο, 132 δείγματα ωοθηκικού καρκίνου (30 σταδίου Ι, 21 σταδίου ΙΙ, 65 σταδίου ΙΙΙ, 11 σταδίου IV και πέντε μη σταδιοποιημένο) και 135 ελέγχους (94 ευνοϊκές συνθήκες, 28 φυσιολογικά υγιή, 13 άλλους καρκίνους) ήταν να αναλύονται πάλι. Επιπλέον, ένα περαιτέρω 69 δείγματα, που δεν περιλαμβάνονται στον πρώτο γύρο, αναλύθηκαν (21 σταδίου Ι, οκτώ στάδιο ΙΙ, 36 καλοήθεις, τρεις φυσιολογικούς υγιείς και ένας καρκίνος του παχέος εντέρου). Για τους δύο γύρους της ανάλυσης, η σειρά της ανάλυσης συστάθηκε για να αποφευχθεί οποιαδήποτε διαδοχική προκατάληψη λόγω της παρουσίας της νόσου ή της απουσίας, υπότυπος ή το στάδιο της νόσου, την ηλικία του ασθενούς, ή την ηλικία του δείγματος ορού. Σε γενικές γραμμές, τα δείγματα εναλλάσσεται μεταξύ ασθενών και μαρτύρων.

Δεδομένα Χειρισμός

Από οροί αναλύθηκαν σε προηγούμενα βελτιστοποιημένη αραίωση, κάθε δείγμα που υπερβαίνει την μέγιστη συγκέντρωση της καμπύλης βαθμονόμησης αυθαίρετα ανατεθεί η συγκέντρωση της υψηλότερα πρότυπα, ενώ αυτοί προσδιορίστηκαν κάτω από την ελάχιστη συγκέντρωση της καμπύλης βαθμονόμησης ήταν λαμβάνει την τιμή 0.0. Μια ενιαία δοκιμασία (IL-1α), που δεν έδειξε μεταβολή στην έκφραση σε όλα τα δείγματα θεωρήθηκαν αμετάβλητες /uninformative και αφαιρείται από το σύνολο δεδομένων εξάγεται. Τα υπόλοιπα δεδομένα στη συνέχεια κλιμακώνεται με το biweight κλίμακα? ένα ισχυρό και αποτελεσματικό μηχανισμό κλιμάκωσης που αντιπροσωπεύει τη διακύμανση μέσα σε κάθε μία από τις επιμέρους αναλύσεις [27]. Μια ενιαία κλίμακα για κάθε δοκιμασία προσδιορίστηκε σε έναν πληθυσμό σταθμισμένο τρόπο. Κάθε δοκιμή που αποδίδει μια κλίμακα συντελεστή μηδέν απομακρύνθηκε από το σύνολο δεδομένων. Τα δεδομένα που προκύπτουν στη συνέχεια εξάγονται σε μεμονωμένα αρχεία, όπου κάθε αρχείο εκπροσωπούνται τα αποτελέσματα όλων των ειδικευμένων δοκιμασίες για ένα μόνο δείγμα

Modeling -. «Out-of-Bag» Εκτίμηση σφάλματος και Bootstrap Επικύρωση

για την ελαχιστοποίηση του δείγματος σύνολο προκατάληψη και να βοηθήσουν στην αξιολόγηση της ενδιάμεσης μοντέλα, χρησιμοποιήσαμε ένα τρίτο «out-of-bag» (OOB) εκτίμηση σφάλματος και ένα εξωτερικό 100 φορές εκκίνησης επικύρωση με 10% δολώματά προπύργιο. Αυτές εκκίνησης εκτιμήσεις μας επέτρεψε να εκτιμηθεί η δυνητική αξία της πολλά μοντέλα, χρησιμοποιώντας μόνο τα δεδομένα εκπαίδευσης. Με τον τρόπο αυτό ήμασταν σε θέση να διατηρήσει την ανεξαρτησία της hold-out σετ δοκιμών των δειγμάτων. Μόνο μετά από ένα συγκεκριμένο ταξινομητή είχε κλειδωθεί σε ένα σύστημα ανιχνεύσιμα διαχείρισης εγγράφων (DMS) ήταν η αναμονή-out σύνολο έλεγχο των δεδομένων που χρησιμοποιούνται για τη δοκιμή των επιδόσεων του επιλεγμένου μοντέλου

Modeling -. Απόδειξη-of-Αρχή ταξινομητή

Αρχικά, μοντελοποίηση διεξήχθη με τα δεδομένα που παράγονται στον πρώτο γύρο (Σχήμα 1) χρησιμοποιώντας μια τροποποίηση του κώδικα Random Forest Breiman του [28]. Η μέθοδος βελτιώθηκε με δυνατότητα αυτοματισμού παρτίδα, προσθέτοντας ένα εξωτερικό στρώμα της bootstrapping, παρέχοντας μεγαλύτερο έλεγχο τρέξει παραμέτρους, και την προσαρμογή της παραγωγής. Οι προκύπτουσες δέντρα σώθηκαν και ένα ιδιόκτητο ρουτίνας χρησιμοποιήθηκε για δείγματα σκορ και πληροφορίες δείγματος εξόδου, βαθμολογίες πιθανότητα, και το αποτέλεσμα ταξινόμησης. Σαράντα σταδίου Ι καρκίνο των ωοθηκών και 40 δείγματα ελέγχου χρησιμοποιήθηκαν για το μοντέλο του κτιρίου. επιλέχθηκαν οι έλεγχοι για να διασφαλιστεί ότι το σύνολο μοντελοποίηση αντιπροσώπευαν τις ίδιες αναλογίες της κανονικής, καλοήθεις και άλλες συνθήκες καρκίνο ως το σύνολο ελέγχου, ωστόσο, σε καθεμία από τις κατηγορίες αυτές, επιλέχθηκαν τυχαία δείγματα. Μοντελοποίηση βελτιστοποιήθηκε μεταβάλλοντας τόσο τις μετρήσεις δέντρο (50, 100, 500 και 1000) σε ένα δάσος, και τον αριθμό των βιοδεικτών (5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50) διερευνηθεί στο κάθε διακλάδωση σημείο, με αποτέλεσμα 40 μοντέλα. Από αυτά τα μοντέλα, οι 20 πιο κατατοπιστική αναλυτών ταυτοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας τη μεταβλητή αξία σημασίας. Στο δεύτερο βήμα, μια σειρά από μοντέλα κατασκευάστηκαν που περιορίζονταν στο (μοντέλο 1-αναλύτη) σημαντικότερο αναλύτη, τα δύο σημαντικότερα αναλυτών (μοντέλο 2-αναλύτη) και ούτω καθεξής σε 20-αναλύτη μοντέλο, συνολικά 20 μοντέλα. Η OOB και εξωτερικών σφάλματα εκκίνησης, και οι τυπικές αποκλίσεις τους, συνοψίζονται για κάθε ένα από αυτά τα μοντέλα. Από αυτά τα αποτελέσματα προσδιορίστηκε ότι ένα ελάχιστο επτά αναλυτών απαιτήθηκαν για να επιτευχθεί η πιο ακριβή ταξινόμηση. Ένα τελευταίο, μόνο, το μοντέλο στη συνέχεια χτίστηκε στις ακόλουθες επτά αναλυτών και κατατίθεται στο DMS ως «κλειδωμένο» μοντέλο

Η

Modeling -. Τελική Classifier

Το τελικό μοντελοποίησης ενσωματώνονται όλες στάδιο έχω δεδομένων καρκίνου από γύρους ένα και δύο, συμπεριλαμβανομένων των διπλών – ένα σύνολο συνόλων μου δεδομένων 91 στάδιο, που αντιπροσωπεύουν 61 μοναδικά δείγματα και τον ίδιο αριθμό των ελέγχων, σε συνδυασμό όπως και πριν, και ισορροπημένο στον ίδιο γύρο να ολοκληρώνεται δύο αναλογία (Σχήμα 1). Αυτά τα σύνολα δεδομένων (δηλαδή το σύνολο εκπαίδευσης) χρησιμοποιήθηκαν μόνο στην κατασκευή του μοντέλου και επιλογής. Η ανάλυση μοτίβο πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας μια μοναδική, δίπλωμα ευρεσιτεχνίας-εν αναμονή της αλγόριθμο, Ανακάλυψη Γνώσης κινητήρα-VS (KDE-VS ™). KDE-VS χρησιμοποιεί μια ομάδα των δομών ψήφου παρόμοια με δέντρα απόφασης με μια μοναδική μέθοδο του κτιρίου και τον καθορισμό των τιμών αποκοπής σε κάθε διάρθρωση των δικαιωμάτων ψήφου, χρησιμοποιώντας όχι μόνο την μετρούμενη τιμή ενός αναλυτή, αλλά και την εκτίμηση σφάλματος εργαστήριο που βασίζεται συνδέονται με ότι η μέτρηση, που προέρχονται από τα ιστορικά QC μετρήσεις για κάθε αναλυτή. Ο χρήστης μπορεί να μεταβάλλει την κλασματική τιμή της εκτίμησης σφάλματος ενσωματωθούν σε ένα ταξινομητή κατά την διάρκεια μοντελοποίησης. Το αποτέλεσμα είναι μια ισχυρή ταξινομητής που μπορεί να αντέξει σημαντική διατάραξη της πειραματικά προσδιορισμένες τιμές σημείο συγκεντρώσεων αναλύτη. Κατά τη διάρκεια μοντέλο του κτιρίου, κάθε τερματικό κόμβο για τη διάρθρωση των δικαιωμάτων ψήφου έχει εκχωρηθεί σε μια δεδομένη κατάσταση – είτε τον καρκίνο των ωοθηκών ή καρκίνο μη-ωοθηκών. Να σκοράρει ένας άγνωστος, το λογισμικό μας εξάγει τις τιμές των αναλυτών που ενδιαφέρουν για να καθοριστεί ποια κόμβο το δείγμα πέφτει.

Δύο διαφορετικές πίστες μοντελοποίησης, με κλασματική τιμή των ορίων σφάλματος των 1.0 και 3.0, πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση των δεδομένων για τις δοκιμασίες του αντιγόνου 104. Οι 20 πιο ισχυρές αναλυτών προσδιορίστηκαν για κάθε διαδρομή και αυτά στη συνέχεια συναρμολογούνται σε έναν εξαντλητικό σύνολο των μοντέλων 7-δείκτη. Ωστόσο, όλα τα μοντέλα ήταν υποχρεωμένοι να περιέχουν ένα αμετάβλητο πυρήνα των τριών πιο ισχυρή και κατατοπιστική αναλυτών, δηλαδή CA-125, C-αντιδρώσα πρωτεΐνη και EGF-R, η οποία μείωσε το χώρο αναζήτησης σε 2380 συνδυασμούς. Και για τα δύο επίπεδα ανοχής σφαλμάτων που εντοπίστηκαν το δέκα πιο ευαίσθητη και δέκα πιο συγκεκριμένα μοντέλα – δίνοντας συνολικά 40 μοντέλα. Η συχνότητα χρήσης των μεμονωμένων αναλυτών και διάφορους συνδυασμούς αναλύτη σε όλα τα 40 μοντέλα, οδήγησε στον προσδιορισμό των 11 αναλυτών που μαζί εμφανίστηκε ισχυρή και κατατοπιστική. Τέλος, ένα ενιαίο μοντέλο χτίστηκε σε αυτά τα 11 αναλυτών και κλειδωμένο στο DMS. Μόνο μετά το κλείδωμα του μοντέλου ήταν τα υπόλοιπα δεδομένα, που δεν χρησιμοποιούνται στην εκπαίδευση, σημείωσε για να ελέγξετε το μοντέλο (Σχήμα 1).

Ανάλυση Δεδομένων

διαστήματα εμπιστοσύνης υπολογίσθηκαν με τη μέθοδο της Newcombe [29] .

Αποτελέσματα

Προκαταρκτική Αξιολόγηση της η απόδειξη της αρχής ταξινομητή

το πρώτο σύνολο δεδομένων, που παράγονται σε 147 τον καρκίνο των ωοθηκών και 149 δείγματα ελέγχου του καρκίνου των ωοθηκών δεν ήταν χρησιμοποιείται για να διερευνήσει τις δυνατότητες της χρήσης ενός υψηλής απόδοσης πλατφόρμα multiplex ανοσολογική δοκιμή ως εργαλείο ανακάλυψης. Υποθέσαμε ότι ένα σχέδιο ταξινόμησης για τον καρκίνο των ωοθηκών στάδιο θα εξακολουθούν να υπάρχουν σε όλα τα μετέπειτα στάδια ασθενειών, έτσι ώστε μόνο τα δείγματα καρκίνου του σταδίου Ι χρησιμοποιήθηκαν για την ανάπτυξη του μοντέλου. Η προσέγγιση αυτή εξισορροπείται και η μέση ηλικία της υπόθεσης και του ελέγχου των ασθενών, αφαιρώντας προκατάληψη σχετίζονται με την ηλικία κατά τη διάρκεια της μοντελοποίησης (Πίνακας 1). Μέσα από αρκετούς γύρους εμπλουτισμού για τα πιο κατατοπιστική βιοδείκτες, οδηγείται από την αξιολόγηση των σφαλμάτων εκκίνησης για το σύνολο του δείγματος μοντέλο ανάπτυξης, ένα μοντέλο 7-αναλυτή εξελίχθηκε, που αποτελείται από CA-125, EGF-R, C-αντιδρώσα πρωτεΐνη, απολιποπρωτεϊνών CIII και Α1, IL-18 και τενασκίνης C. Αυτό το στάδιο Ι συγκεκριμένο προφίλ ήταν κλειδωμένη μέσα στο DMS. Μόνο μετά το μοντέλο ήταν κλειδωμένη μέσα στο DMS ήταν τα στοιχεία για τα δείγματα δοκιμής (αυτά που δεν χρησιμοποιούνται στην μοντελοποίηση) πρόσβαση και σκόραρε από το μοντέλο για να δώσει τα αποτελέσματα που περιγράφονται παρακάτω (Εικόνα 1).

Αφού όλα σταδίου Ι τα δεδομένα που παράγονται στον πρώτο γύρο δοκιμασιών είχαν χρησιμοποιηθεί στη μοντελοποίηση, δεν υπήρχαν ανεξάρτητα στοιχεία για ευαισθησία της δοκιμασίας σταδίου Ι. Ωστόσο, το 100-πλάσια bootstrap εκτίμηση της ευαισθησίας σταδίου Ι ήταν 87% (Πίνακας 2). Η bootstrap εκτίμηση για ειδικότητα, με βάση τους ελέγχους που χρησιμοποιούνται στο μοντέλο ανάπτυξης ήταν 82,3%. Ο ταξινομητής στη συνέχεια αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας ένα γύρο δείγματα δοκιμής, ένα σύνολο ανεξάρτητων δειγμάτων δεν χρησιμοποιείται σε οποιαδήποτε πτυχή της ανάπτυξης του μοντέλου. Ο ταξινομητής είχε 95,3% ευαισθησία και 70,6% ειδικότητα. Απόδοσης για καλοήθη δείγματα ήταν χαμηλότερο (67,1%) από ό, τι άλλα στοιχεία ελέγχου. Δεν υπήρχε ενιαία υπότυπο του καρκίνου που σημείωσε σημαντικά διαφορετικό από τα άλλα και όταν κατανεμημένες ανά στάδιο, η ευαισθησία ποικίλει λίγο (94,0 έως 100%), υποστηρίζουν την υπόθεση ότι ένα μοτίβο στάδιο θα μπορούσα να εξακολουθούν να υφίστανται σε όλα τα στάδια της νόσου. Μετά το δεύτερο γύρο των δοκιμασιών, όλα τα δύο στρογγυλά στοιχεία βαθμολογήθηκαν σε αυτό το κλειδωμένο μοντέλο. Οι κοινές σε ένα γύρο δείγματα έδειξε μια επαναλήψιμη απόδοση με 97,1% ευαισθησία (95% CI, 91,0 – 99,2%) και 74,5% ειδικότητα (95% CI, 64,7 – 82,4%). Τα επιπλέον 69 δείγματα, που δεν έχουν προηγουμένως αναλυθεί, παρέχεται μια δεύτερη σειρά δοκιμών και απέδωσε 85,7% ευαισθησία για το στάδιο Ι, 100% ευαισθησία για το στάδιο ΙΙ και 67,5% ειδικότητα.

Η

Προκαταρκτική αξιολόγηση των τελικών ταξινομητή

Η απόδειξη της αρχής ταξινομητή επιβεβαίωσε την υπόθεσή μας ότι η χρήση των δεδομένων μόνο στο στάδιο Ι και για τις δύο μοντέλο ανάπτυξης και της αξιολόγησης θα μπορούσαν να προσδιορίσουν ένα ενημερωτικό μοτίβο που μπορεί να υπάρχουν και να επιμένει μέσω μεταγενέστερα στάδια του καρκίνου. Ως εκ τούτου, προσπαθήσαμε να αναπτύξουμε το μοντέλο του σταδίου Ι περαιτέρω χρησιμοποιώντας όλα τα στάδια διαθέσιμα δείγματα εγώ. Η ίδια στρατηγική μοντελοποίησης επαναλήφθηκε με δύο σημαντικές τροποποιήσεις. Κατ ‘αρχάς, μια διαφορετική, ιδιόκτητο αλγόριθμο υλοποιήθηκε, και το δεύτερο, όλοι το στάδιο Ι δείγματα που αναλύθηκαν στα δύο γύρους ένα και δύο χρησιμοποιήθηκαν για να αυξηθεί το μέγεθος του συνόλου δεδομένων μοντέλο ανάπτυξης (Σχήμα 1). Η στρατηγική μοντελοποίησης πέρασε από διάφορες επαναληπτική βήματα για να εμπλουτίσουν τις πιο κατατοπιστική βιοδείκτες, με βάση την αξιολόγηση μόνο των δεδομένων εκπαίδευσης σταδίου Ι πριν αποκορύφωμα μια σχεδόν εξαντλητική αναζήτηση των συνδυασμών βιοδεικτών που παράγεται 2380 μοντέλα. επιλεγμένα Σαράντα μοντέλα βασίστηκαν σε bootstrap ευαισθησία και ειδικότητα τους για το σύνολο του δείγματος Ι στάδιο. Με τη σύγκριση των συνδυασμών βιοδεικτών σε αυτές τις top 40 μοντέλα (Πίνακας 3), και λαμβάνοντας υπόψη την ισορροπία που έδειξε εκκίνησης την ακρίβεια, την ευαισθησία, την ειδικότητα και τυπικές αποκλίσεις, εντοπίστηκαν το τελικό σύνολο των 11 ενημερωτικών βιοδεικτών. Ορισμένοι συνδυασμοί αναλυόμενη ουσία ήταν κοινή σε πολλά μοντέλα, ενώ υπήρχαν και καθαρά «πρότυπα υποκατάστασης» όπου ένα διαφορετικό αναλύτη ή συνδυασμός των αναλυτών θα μπορούσε να αποφέρει τα αντίστοιχα μοντέλα. Οι 11 βιοδείκτες – CA-125, C-αντιδρώσα πρωτεΐνη, EGF-R, CA 19-9, απολιποπρωτεϊνών Α1 και ΟΠΙ, μυοσφαιρίνη, ΜΙΡ-1α, IL-6, IL-18 και τενασκίνης C – συναρμολογήθηκαν σε ένα τελικό μοντέλο χρησιμοποιώντας τον αλγόριθμο του KDE-VS και κλειδωμένο στο DMS ως το τελικό μοντέλο (Σχήμα 1).

η

ως προκαταρκτική δοκιμή της απόδοσης του ταξινομητή, η βαθμολογήθηκαν όλα τα δεδομένα που δεν χρησιμοποιούνται στο μοντέλο ανάπτυξης, αποδίδοντας 91,3 % ευαισθησία και 88,5% ειδικότητα (Πίνακας 4, Εικόνα 1). Αξίζει να σημειωθεί ότι, η ευαισθησία στάδιο ΙΙ ήταν 83,9% και η απόδοση στα καλοήθη δείγματα βελτιώθηκε σε 90,4%. δείγματα πρόσθετο στάδιο δεν ήταν διαθέσιμα, εκείνη την εποχή, για τον έλεγχο της απόδοσης. Ωστόσο, η bootstrap εκτίμηση της ευαισθησίας για το σύνολο εκπαίδευσης ήταν 83,4% για το Ι στάδιο της νόσου και 84,2% (± 12,5%) ειδικότητα (Πίνακας 4). Ως ξεχωριστή άσκηση, βαθμολογήθηκαν όλα τα διπλότυπα στοιχεία από τον δεύτερο γύρο που δεν χρησιμοποιείται στην ανάπτυξη του μοντέλου. Όπως αναμενόταν από τα προηγούμενα αποτελέσματα, η απόδοση ήταν παρόμοια με 96,1% ευαισθησία (95% CI, 89,7 – 98,7%) και 88,1% ειδικότητα (95% CI, 80,8 έως 93,0%) με καλοήθη δείγματα σκοράροντας 87,0% (95% CI, 76,2 – 93,5%). Να παρέχει ένα πλαίσιο αναφοράς, συγκρίναμε την επίδοση του μοντέλου με εκείνη μιας κλινικής απόφασης με βάση τα επίπεδα έκφρασης CA-125. Δεδομένου ότι η τιμή αποκοπής των 35 IU /ml έχει ήδη καθιερωθεί, το πλήρες σύνολο δεδομένων χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί η προγνωστική αξία της CA-125. Με αυτή την τιμή αποκοπής, CA-125 έδωσε 94,9% ευαισθησία και 58,6% ειδικότητα (Πίνακας 5). Για τα δείγματα σταδίου Ι και μόνο, η ευαισθησία μειώθηκε στο 88,5%.

Η

εφαρμοστούν δύο μέθοδοι για να εκτιμηθεί η σημασία των διαφόρων αναλυτών στη συνολική ταξινομητή. Πρώτον, αξιολογείται μοντέλο επιδόσεων όταν όλα εκτός από ένα αναλύτη διατηρήθηκε σταθερή στα αρχεία δεδομένων, με την τιμή του επιλεγμένου αναλύτη τυχαία. Αυτό επαναλήφθηκε διαδοχικά για κάθε αναλύτη. Η σχετική αξία κάθε αναλύτη στη συνέχεια ανάλογα με τον προσδιορισμό των αναλυόμενο προκάλεσε απόδοση ταξινόμησης για να μειωθεί περισσότερο όταν τυχαία. Παρατηρήσαμε ότι βιοδείκτη σημασία έτειναν να συγκεντρωθούν. Συγκεκριμένα, CA-125 ήταν το πιο σημαντικό βιοδεικτών, ακολούθησε μια ομάδα που αποτελείται από C-αντιδρώσα πρωτεΐνη, CA 19-9 και EGF-R, που ακολουθείται από ΜΙΡ-1α, που ακολουθείται από μυοσφαιρίνης, απολιποπρωτεΐνη ΟΠΙ, απολιποπρωτεΐνη Α1, IL-18 και IL-6 και τελικά τενασκίνης C. Ως δεύτερη μέθοδο εκτίμησης αναλύτη σημασίας, αναλύσαμε τα σημεία διακλάδωσης των δομών ψηφοφορίας. Σε όλες σημείων διακλάδωσης των δομών ψηφοφορίας, CA-125 ενεπλάκη η πιο συχνά (15,8%), ακολουθούμενη από την CA 19-9 (12.1%), μυοσφαιρίνη (11,1%), C-αντιδρώσα πρωτεΐνη (10,8%) και EGF-R (9,9%). CA-125 χρησιμοποιήθηκε σε 80% των σημείων διακλάδωσης ανώτατου επιπέδου, που αντιπροσωπεύει την πρώτη μεγάλη δείγμα χωρισμάτων, που ακολουθείται από C-αντιδρώσα πρωτεΐνη (11,2%), EGF-R (5,0%) και CA19-9 (1,8%). Κατά τη δεύτερη βαθμίδα, CA19-9 χρησιμοποιήθηκε πιο συχνά (20,3%) ακολουθούμενη από EGF-R (18,8%), CA-125 (11,4%), μυοσφαιρίνη (9,8%), τενασκίνης C (8,0%), IL-18 (7,2%), και της απολιποπρωτεΐνης Α1 (6,9%). Οι δείκτες οξείας φάσης ΜΙΡ-1α και IL-6 παρατηρήθηκαν μόνο 6,2% και 1,3% αντίστοιχα, σε αυτό το επίπεδο.

Συζήτηση

Στη μελέτη αυτή εντοπίσαμε ένα πρότυπο ταξινόμησης για τον καρκίνο των ωοθηκών στο proteome στον ορό των ασθενών με σταδίου Ι νόσο, η οποία παραμένει εμφανής μέσα από μεταγενέστερο στάδιο της νόσου. Οροί από ασθενείς με παθολόγο-επιβεβαίωσε συνθήκες – είτε με είτε χωρίς επιθηλιακό καρκίνο των ωοθηκών – είχαν μορφοποιημένης χρησιμοποιώντας μια προσέγγιση προφίλ πολλών-αναλυτών με βάση σφαιρίδια. Οι αναλύτες κάλυψαν ένα ευρύ φάσμα βιολογικών δομών και των λειτουργιών, συμπεριλαμβανομένων αντιγόνων του καρκίνου, ορμόνες, παράγοντες πήξεως, παράγοντες μοντελοποίηση ιστού, λιποπρωτεΐνη συστατικά, πρωτεάσες και αναστολείς πρωτεάσης, δείκτες καρδιαγγειακού κινδύνου, αυξητικούς παράγοντες, κυτοκίνες /χημειοκίνες, διαλυτές μορφές του κύτταρο- υποδοχείς, και φλεγμονώδεις και οξείας φάσεως καθώς και δείκτες για αυτοανοσία και μόλυνση (Πίνακας S1) σηματοδότησης. Δύο ανεξάρτητες αναλύσεις των δειγμάτων διεξήχθησαν 86 ημέρες διαφορά. Υπήρχαν πολλές παρτίδα αντιδραστηρίων και παρτίδα αλλαγές κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, παρέχοντας ένα πραγματικό κόσμο πρόκληση για την ευρωστία των υποκείμενων προσδιορισμούς και το μοντέλο.

Τέσσερα κύρια συστατικά ήταν κρίσιμη για την επιτυχία αυτής της μελέτης. Πρώτον, ήταν απαραίτητο να εντοπιστούν εξαιρετικά συνεπή, καλά τεκμηριωμένη και κλινικά αντιπροσωπευτικό δείγμα σύνολο των επιβεβαιωμένων κρουσμάτων και των ελέγχων. Για τον καρκίνο των ωοθηκών, η επιβεβαίωση μπορεί να προέλθει μόνο από την παθολογική εξέταση του χειρουργικά με εκτομή ιστού. Έχουμε επιλέξει δείγματα ορού από καλά χαρακτηρισμένο συλλογές από τις γυναίκες που έχουν ήδη προγραμματιστεί για τη χειρουργική επέμβαση. Η μεγάλη πλειοψηφία των ελέγχων σε αυτόν τον πληθυσμό είχαν παθολογία-επιβεβαίωσε καλοήθεις καταστάσεις, οι οποίες βασίζονται σε μονοπαραγοντική ανάλυση, θα πρέπει να αποτελέσει μεγαλύτερη πρόκληση για την ταξινόμηση των ορών από μη-συμπτωματική γυναίκες (Σχήμα 2? [24]). Δεύτερον, χρησιμοποιείται ένα πάνελ του έγκυρου, υψηλής απόδοσης, ανοσοαναλύσεις που μετρούν μια ευρεία ποικιλία των μορίων, συμπεριλαμβανομένων αυτοάνοσων και δείκτες μολυσματική ασθένεια, και ένα ευρύ φάσμα καλώς χαρακτηρισμένων πρωτεϊνών του ορού, συμπεριλαμβανομένων εκείνων που προηγουμένως εμπλακεί στον καρκίνο των ωοθηκών. Τρίτον, χρησιμοποιήσαμε μία νέα προσέγγιση πολυμεταβλητή μοντελοποίησης για τον εντοπισμό ενός ισχυρού πρότυπο μορίων κατατοπιστική για τον καρκίνο των ωοθηκών. Το ιδιόκτητο αλγόριθμο (KDE-VS) βελτιωμένη απόδοση κατάταξη σε σύγκριση με Τυχαία Forest και άλλους αλγορίθμους ταξινόμησης με την οικοδόμηση ισχυρή ορίων απόφασης σε δομές της ψήφου, η οποία ενσωματώνει σε πραγματικό κόσμο πειραματική διακύμανση στα δεδομένα που διαμορφώνεται. Τέλος υπήρχε σαφής διαχωρισμός μεταξύ των δειγμάτων που χρησιμοποιούνται για την ανάπτυξη και να προσδιορίσει ένα ενιαίο πληροφοριακό μοντέλο, και τα δείγματα που χρησιμοποιούνται για την αξιολόγηση των επιδόσεων ότι τα μοντέλα

Για κάθε αναλυτή, τα οικόπεδα κουτί-μουστακιού δείχνουν:. Η χαμηλότερη παρατήρηση, χαμηλότερο τεταρτημόριο, διάμεση τιμή, ανώτερο τεταρτημόριο, και υψηλότερη παρατήρηση. Όλες οι αναλύσεις, συμπεριλαμβανομένων και τα διπλά κανάλια. CA-125 – ένα καρκίνο των ωοθηκών, 11 καλοήθεις και πέντε φυσιολογικά δείγματα κάτω από τη χαμηλότερη τιμή βαθμονόμησης? CA 19-9 – 14 τον καρκίνο των ωοθηκών, 18 καλοήθεις, εννέα φυσιολογικά και τέσσερα άλλα δείγματα καρκίνου του κάτω από τη χαμηλότερη τιμή βαθμονόμησης? C-αντιδρώσα πρωτεΐνη – 93 ο καρκίνος των ωοθηκών, 21 καλοήθη, δύο κανονικές και δύο άλλα δείγματα καρκίνου του άνω υψηλότερη τιμή βαθμονόμησης? IL-6-82 καρκίνο των ωοθηκών, 161 καλοήθη, 28 κανονικά και 14 άλλα δείγματα καρκίνου του κάτω από το χαμηλότερο επίπεδο βαθμονόμησης? ΜΙΡ-1α – 50 τον καρκίνο των ωοθηκών, 53 καλοήθεις, 10 κανονική και τέσσερα άλλα δείγματα καρκίνου του κάτω από το χαμηλότερο επίπεδο βαθμονόμησης? τενασκίνης C – δύο καρκίνου των ωοθηκών και ένα καλοήθη δείγμα πάνω από υψηλότερο επίπεδο βαθμονόμησης. OVCA, καρκίνος των ωοθηκών? Ca, καρκίνο? Apo, απολιποπρωτεΐνη? CA-125, το αντιγόνο του καρκίνου 125? CA 19-9, καρκινικό αντιγόνο 19-9? EGF-R, υποδοχέας του επιδερμικού αυξητικού παράγοντα (διαλυτή μορφή)? IL, ιντερλευκίνη? . ΜΙΡ-1α, φλεγμονώδης πρωτεΐνη μακροφάγων 1 άλφα

Η

Η μελέτη μας επικεντρώθηκε στην ανάλυση της πρώιμης νόσου σκηνή με & gt? 50% του συνόλου του δείγματος καρκίνου που αντιπροσωπεύουν τα στάδια Ι και ΙΙ της νόσου (Πίνακας 1). Σύμφωνα με την βιβλιογραφία, η μέση ηλικία των ασθενών κατά τη διάγνωση συσχετίζεται με το στάδιο της νόσου κατά τη διάγνωση (Πίνακας 1? [22]). Η κατανομή υπότυπο ήταν αντιπροσωπευτικό του πληθυσμού των ΗΠΑ, με ένα μεγαλύτερο ποσοστό των ορώδες (42%) και ενδομητριοειδές (26%) καρκινώματος (Πίνακας 1). Τα δείγματα ελέγχου ήταν κυρίως από άτομα με κοινά καλοήθεις συνθήκες ωοθηκών (75%), καθώς και άλλες γυναικολογικές και μη-γυναικολογικούς καρκίνους (8%), και ένα μικρό αριθμό μη-νοσούντα δείγματα (17%), σύμφωνα με την ανάγκη για μια κλινική δοκιμή για τη συμπτωματική γυναίκες (Πίνακας 1).

σκεπτικό μας να επικεντρωθεί σε αρχικό στάδιο της νόσου ήταν διττός. Πρώτον, ο καρκίνος των ωοθηκών πρώιμο στάδιο θεωρείται ιάσιμη, αλλά σε πολλές περιπτώσεις τα συμπτώματα είναι λεπτές και δύσκολο να ανιχνευθούν.