Αφηρημένο

Ιστορικό

mononucleotide εκτάσεις στις περιοχές κωδικοποίησης του

TGFBR2

και

ΒΑΧ

γονίδια συνήθως μεταλλαχθεί σε αστάθεια μικροδορυφόρου-υψηλή ( MSI-υψηλή) καρκίνων του παχέος εντέρου. Ο υποδοχέας TGFBR2 παίζει ένα σημαντικό ρόλο στην TGFB1 (αυξητικός παράγοντας μεταμόρφωσης-β, ΤΟΡ-β) μονοπατιού σηματοδότησης, και ΒΑΧ διαδραματίζει βασικό ρόλο στην απόπτωση. Ωστόσο, ο ρόλος του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μονονουκλεοτίδης μετάλλαξη σε καρκίνο του παχέος εντέρου ως προγνωστικό βιοδείκτη παραμένει αβέβαιη.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Αξιοποιήσαμε μια βάση δεδομένων του 1072 καρκίνων του ορθού και του παχέος εντέρου σε δύο προοπτικές μελέτες κοόρτης (Μελέτη Nurses ‘Health και οι Επαγγελματίες Υγείας Συνέχεια Μελέτη). Cox μοντέλο αναλογικών κινδύνων χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό αναλογία κινδύνου θνησιμότητας (HR), προσαρμοσμένο για κλινικές, παθολογικές και μοριακά χαρακτηριστικά, συμπεριλαμβανομένης της CpG νησί methylator φαινότυπο (CIMP), LINE-1 μεθυλίωση, και

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

μεταλλάξεις. MSI-υψηλής παρατηρήθηκε στο 15% (162/1072) όλων των καρκίνων του παχέος εντέρου.

TGFBR2

και

ΒΑΧ

μεταλλάξεις μονονουκλεοτίδης ανιχνεύθηκαν στο 74% (117/159) και 30% (48/158) του MSI-υψηλών όγκων, αντίστοιχα. Στην ανάλυση Kaplan-Meier, καθώς και μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική παλινδρόμησης Cox αναλύσεις, σε σύγκριση με μικροδορυφόρων σταθερό (MSS) /MSI-χαμηλή περιπτώσεις, MSI-υψηλή υποθέσεις που σχετίζονται με την ανώτερη καρκίνο του παχέος εντέρου-ειδική επιβίωση [adjusted HR, 0.34? 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI), 0,20 – 0,57] ανεξάρτητα από το

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης. Μεταξύ MSI-υψηλών όγκων,

TGFBR2

μετάλλαξη μονονουκλεοτίδης συνδέθηκε με CIMP-υψηλή ανεξάρτητα από άλλες μεταβλητές [πολυμεταβλητή αναλογία πιθανοτήτων, 3,57? 95% CI, 1,66 – 7,66? p = 0,0011].

Συμπεράσματα

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μονονουκλεοτίδης μεταλλάξεις δεν συνδέονται με το αποτέλεσμα της επιβίωσης ασθενών σε MSI-υψηλής καρκίνο του παχέος εντέρου. Τα δεδομένα μας δεν υποστηρίζουν αυτές τις μεταλλάξεις ως προγνωστικούς βιοδείκτες (πέρα MSI) σε ορθοκολικό καρκίνωμα

Παράθεση:. Σίμα K, Morikawa T, Yamauchi M, Kuchiba Α, Imamura Υ, Liao Χ, et al. (2011)

TGFBR2

και

ΒΑΧ

μονονουκλεοτιδίου Φυλλαδική μεταλλάξεις, αστάθεια μικροδορυφόρου και πρόγνωση σε 1072 παχέος εντέρου. PLoS ONE 6 (9): e25062. doi: 10.1371 /journal.pone.0025062

Επιμέλεια: Pierre-Antoine Defossez, Université Paris-Diderot, Γαλλία

Ελήφθη: 19 Μαρ, 2011? Αποδεκτές: 25 Αυγ 2011? Δημοσιεύθηκε: 20 Σεπτεμβρίου 2011

Copyright: © 2011 Shima et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από Ηνωμένες Πολιτείες Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας (NIH) χορηγεί P01CA87969 (σε SE Hankinson), P01CA55075 (με WC Willett), P50CA127003 (για να ΚΠΣ), K07CA122826 (σε SO) και R01CA151993 (σε SO), και εν μέρει από τις επιχορηγήσεις από το Ταμείο Bennett Οικογένεια και από το Ίδρυμα βιομηχανίας της ψυχαγωγίας μέσω της Εθνικής παχέος Cancer Research Alliance. Το περιεχόμενο είναι αποκλειστική ευθύνη των συγγραφέων και δεν αντιπροσωπεύουν απαραίτητα τις επίσημες απόψεις του NCI ή ΝΙΗ. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο ορθοκολικός καρκίνος αντιπροσωπεύει μία ομάδα του μοριακά ετερογενών ασθενειών με διαφορετικά σύνολα επιγενετικών και γενετικών ανωμαλιών. Υψηλός βαθμός αστάθεια μικροδορυφόρου (MSI-υψηλή) προκαλείται από ανεπάρκεια του συστήματος επιδιόρθωσης αταίριαστων βάσεων του DNA, και παρατηρείται σε περίπου το 15% των καρκίνων του παχέος εντέρου. δοκιμή MSI χρησιμοποιείται ευρέως ως εξέταση για ασθενείς με σύνδρομο Lynch /κληρονομικό μη-πολυποειδούς ορθοκολικού καρκίνου (HNPCC) [1], [2], [3]. Επιπλέον, MSI είναι γενικά αποδεκτό ως προγνωστικός δείκτης [4], και πιθανόν μία προγνωστική δείκτη για αντίσταση σε 5-φθοριοουρακίλη [5]. Από Markowitz et al. [6] ανακάλυψε μεταλλάξεις στα επαναλήψεις κωδικοποίηση μονονουκλεοτίδης του

TGFBR2

στην MSI-υψηλής καρκινικά κύτταρα του παχέος εντέρου, παρόμοιες μεταλλάξεις της κωδικοποίησης επαναλήψεων μονονουκλεοτιδίου σε πολλά άλλα γονίδια (συμπεριλαμβανομένων των

ΒΑΧ

,

MSH3

,

MSH6

,

IGF2R

και

PTEN

) έχουν βρεθεί σε MSI-υψηλής παχέος εντέρου [3], [7], [8], [ ,,,0],9]. Μεταξύ αυτών των γονιδίων, που κωδικοποιούν μονονουκλεοτιδίου επαναλήψεις του

TGFBR2

(Α)

10 και

ΒΑΧ

(G)

8 έχουν συχνές μεταλλάξεις μετατόπισης πλαισίου με αποτέλεσμα την παραγωγή του κόλουρου, ανενεργό μορφή των πρωτεϊνών [3], [10]. TGFB1 (αυξητικός παράγοντας μεταμόρφωσης-β, ΤΟΡ-β) και ο υποδοχέας της TGFBR2 αποτελούν μία οδό σηματοδότησης που ρυθμίζει την μεταγραφή πολλών γονιδίων, και λειτουργεί ως καταστολέας όγκου [11], [12], [13], [14] και μια ανοσολογική απόκριση ρυθμιστής [15]. ΒΑΧ προάγει απόπτωση γενικά και ανταγωνίζεται την επίδραση της BCL2 [16], [17], [18]. Έτσι, η απενεργοποίηση των TGFBR2 ή ΒΑΧ μπορεί να συμβάλλει στην εξέλιξη του όγκου.

Αρκετές προηγούμενες μελέτες έχουν εξετάσει την προγνωστική ρόλο του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μονονουκλεοτίδης μεταλλάξεις στο MSI-υψηλής παχέος καρκίνοι, δίδοντας αμφίβολα αποτελέσματα, λόγω της περιορισμένης στατιστική ισχύ στις περισσότερες μελέτες [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25] (Πίνακας 1). Όλα εκτός από ένα προηγούμενη μελέτη [23] εξέτασαν την προγνωστική ρόλο του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μονονουκλεοτίδιο μετάλλαξη σε λιγότερο από 100 MSI-υψηλής όγκους (ο αριθμός των MSI-υψηλής όγκους που κυμαίνονται από 16 έως 98) [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25]. Επιπλέον, καμία από τις προηγούμενες μελέτες [19], [20], [21], [22], [23], [24], [25] εξέτασε διεξοδικά ενδεχόμενους δημιουργούν σύγχυση επίδραση των βασικών μοριακών βιοδεικτών σε καρκίνο του παχέος εντέρου, συμπεριλαμβανομένων το ΚΚΕ νησί methylator φαινότυπο (CIMP), και

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

μεταλλάξεις. Έτσι, ο προγνωστικός ρόλος της

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μονονουκλεοτίδης μετάλλαξη στο MSI-υψηλών όγκων παραμένει αβέβαιο.

Η

Πραγματοποιήσαμε αυτή τη μελέτη για να ελεγχθεί η υπόθεση ότι

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μεταλλάξεις μονονουκλεοτιδίου σε καρκίνο του παχέος εντέρου συνδέθηκαν με αλλαγμένη συμπεριφορά του όγκου (πέρα MSI), χρησιμοποιώντας μια βάση δεδομένων του 1072 το στάδιο Ι έως IV καρκίνους του παχέος εντέρου σε δύο προοπτικές μελέτες κοόρτης. τρέχουσα μελέτη μας αποτελεί την πρώτη μελέτη που χρησιμοποίησε μια βάση δεδομένων προοπτικές μελέτες κοόρτης για τον έλεγχο της δήλωσε υπόθεση. Το γεγονός αυτό αυξάνει γενίκευσης των ευρημάτων της μελέτης μας. Επιπλέον, επειδή ταυτόχρονα αξιολογείται κλινική, παθολογική και όγκου μοριακή μεταβλητές όπως το CpG νησί methylator φαινότυπο (CIMP), LINE-1 μεθυλίωση,

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

μεταλλάξεις, θα μπορούσαμε να αξιολογηθεί η επίδραση του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μετάλλαξη, ανεξάρτητα από αυτούς πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες.

Μέθοδοι

Μελέτη ομάδα

Αξιοποιήσαμε τη βάση δεδομένων των δύο προοπτικές μελέτες κοόρτης, μελέτη Nurses ‘Health (Ν = 121.701 γυναίκες που ακολουθείται από το 1976) και οι Επαγγελματίες Υγείας Μελέτη παρακολούθησης (Ν = 51.529 άνδρες που ακολουθείται από το 1986) [26], [27 ]. Οι συμμετέχοντες έχουν αποσταλεί ανά διετία ερωτηματολόγια για να ενημερώσετε τις πληροφορίες σχετικά με τους δυνητικούς παράγοντες κινδύνου και να προσδιοριστούν νεοδιαγνωσθέντες καρκίνους στον εαυτό τους και πρώτου βαθμού συγγενείς τους. Συλλέξαμε μπλοκ ιστού όγκου εμπεδωθεί με παραφίνη των καρκίνων του παχέος περιστατικό από νοσοκομεία σε όλη την ΗΠΑ όπου οι συμμετέχοντες με καρκίνο του παχέος εντέρου υποβλήθηκαν εκτομή του όγκου [26], [27]. Τα κλινικά χαρακτηριστικά των περιπτώσεων που περιγράφονται στον Πίνακα 2 (στα αριστερά, κάτω από τον τίτλο «Όλες οι περιπτώσεις» στήλη). Δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στα δημογραφικά χαρακτηριστικά μεταξύ των περιπτώσεων με τον ιστό διατίθενται και αυτές χωρίς διάθεση των ιστών μεταξύ των μελετών κοόρτης μας [26]. Η πλειονότητα των περιπτώσεων έχουν προηγουμένως χαρακτηριστεί για καταστάσεις του

TGFBR2

, MSI, CIMP,

KRAS

,

BRAF

,

PIK3CA

και LINE-1 μεθυλίωση [28], [29], [30], [31]. Ωστόσο, καμία από τις προηγούμενες μελέτες μας έχουν αναλύσει την προγνωστική σημασία της μονονουκλεοτιδίου μετάλλαξη του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

.

ΒΑΧ

μετάλλαξη δεν έχει αναλυθεί σε οποιαδήποτε από τις προηγούμενες μελέτες μας. Έτσι, αυτή η μελέτη αντιπροσωπεύει μια νέα μελέτη που χρησιμοποιεί έναν πόρο των υπαρχόντων υλικών και της βάσης δεδομένων, ανάλογο με τα νέα μελέτες χρησιμοποιώντας καλά περιγραφείσες κυτταρικές σειρές (π.χ., SW480 κυτταρική γραμμή) ή ποντικού μοντέλα (π.χ.,

Αρο

min ποντίκι μοντέλο).

η

αιματοξυλίνη και ηωσίνη τομές ιστού από όλες τις παχέος περιπτώσεων καρκίνου εξετάστηκαν από έναν παθολόγο (SO) αγνοούν άλλα δεδομένα. διαφοροποίηση του όγκου κατηγοριοποιούνται ως πολύ μέτρια εναντίον φτωχών (& gt? 50% έναντι ≤50% αδενικό περιοχές). Αποκλείσαμε τις περιπτώσεις που προεγχειρητικά θεραπεία. Με βάση την διαθεσιμότητα επαρκών δεδομένων παρακολούθησης και καρκινικού ιστού, 1072 περιπτώσεις το στάδιο I-IV του καρκίνου του παχέος εντέρου διαγιγνώσκονται μέχρι το 2004 συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα μελέτη (Σχήμα 1). Οι ασθενείς παρατηρήθηκαν μέχρι το θάνατο ή στις 30 Ιουνίου 2009, εάν ήρθε πρώτο. Ο θάνατος ενός συμμετέχοντος επιβεβαιώθηκε από τον Εθνικό Δείκτη θάνατο. Επιστρέφοντας στο ερωτηματολόγιο που αναφέρεται εν επιγνώσει συναίνεση από όλα τα άτομα της μελέτης. Ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη. συλλογή και ανάλυση των ιστών εγκρίθηκαν από τα Ανθρώπινα Θέματα Επιτροπών στο Harvard Σχολή Δημόσιας Υγείας και Νοσοκομείου Brigham and Women της.

Με βάση την διαθεσιμότητα επαρκούς παρακολούθησης και όγκου μοριακών δεδομένων μεταξύ των καρκίνων του παχέος περιστατικό που προσδιορίζονται στις Νοσηλευτές «Μελέτη Υγείας (NHS? Ν = 121.701) και οι Επαγγελματίες Υγείας Μελέτη παρακολούθησης (HPFS? Ν = 51.529), συμπεριλήφθηκαν συνολικά 1072 περιπτώσεις σταδίου Ι-IV του καρκίνου του παχέος εντέρου διαγιγνώσκονται μέχρι το 2004. MSI, μικροδορυφόρων αστάθεια? MSS, μικροδορυφόρων σταθερή.

Η

αστάθεια μικροδορυφορικού ανάλυσης και ανίχνευσης των

TGFBR2

και

ΒΑΧ

μεταλλάξεις μονονουκλεοτίδης οδού

DNA εκχυλίζεται (MSI) από ενσωματωμένα σε παραφίνη ιστό. Ανάλυση MSI πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας 10 δείκτες μικροδορυφορικού (D2S123, D5S346, D17S250, BAT25, BAT26, BAT40, D18S55, D18S56, D18S67 και D18S487) [30]. MSI-υψηλής ορίστηκε ως η παρουσία της αστάθειας σε ≥30% των δεικτών, και MSI-χαμηλή /μικροδορυφορικών σταθερό (MSS) ως αστάθεια σε 0-29% των δεικτών [30]. Μονονουκλεοτιδίου μεταλλάξεις οδό του

TGFBR2

και

ΒΑΧ

εξετάστηκαν σε MSI-υψηλών όγκων. Εναύσματα και PCR συνθήκες για

TGFBR2

περιγράφηκαν προηγουμένως [28]. Αλληλουχίες εκκινητή για

ΒΑΧ

ήταν? 5 ‘- (FAM) ATCCAGGATCGAGCAGGGCG-3′ και 5’-ACTCGCTCAGCTTCTTGGTG-3 ‘. προϋπόθεση ΡΟΚ προθέρμανση στους 95 ° C για 5 λεπτά, 45 κύκλους (στους 94-55-72 ° C για 30-30-30 sec), και επέκταση στους 72 ° C για 2 λεπτά. Τα προϊόντα PCR υποβλήθηκαν σε ηλεκτροφόρηση και αναλύθηκαν με ΑΒΙ 3730 DNA Analyzer (Applied Biosystems, Foster City, CA).

Pyrosequencing του

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

PCR και Pyrosequencing στόχο για

KRAS

(κωδικόνια 12 και 13) [32],

BRAF

(κωδικόνιο 600) [33] και

PIK3CA

(εξόνια 9 και 20) πραγματοποιήθηκαν όπως περιγράφηκε προηγουμένως [29].

αναλύσεων μεθυλίωσης για CpG νησίδες και LINE-1

όξινο θειώδες νάτριο θεραπεία και την επακόλουθη PCR πραγματικού χρόνου (MethyLight [ ,,,0],34]) είχαν προηγουμένως επικυρωθεί [35], και πραγματοποιήθηκε για την ποσοτικοποίηση της μεθυλίωσης υποστηρικτής σε οκτώ νησιά CpG (

CACNA1G

,

CDKN2A

,

CRABP1

,

IGF2

,

MLH1

,

NEUROG1

,

RUNX3

και

SOCS1

) [36], [37], [38]. CIMP-υψηλής ορίστηκε ως η παρουσία ≥6 /8 μεθυλιωμένο δείκτες, CIMP χαμηλή καθώς η παρουσία 1/8 να 5/8 μεθυλιωμένα δεικτών, και CIMP-0 ως απουσία (0/8) του μεθυλιωμένου δεικτών [37 ], [39]. LINE 1-επίπεδα μεθυλίωσης ήταν ποσοτικά με PCR-Pyrosequencing [40], [41].

Η στατιστική ανάλυση

Χρησιμοποιήσαμε το πρόγραμμα SAS (έκδοση 9.1, SAS Institute, Cary, NC) για όλους στατιστικές αναλύσεις. Όλες οι τιμές ρ ήταν δύο όψεων. Όταν εκτελεί πολλαπλές δοκιμές υπόθεση (δηλαδή, οι αναλύσεις των μοριακών συσχετισμούς και τις αλληλεπιδράσεις), μια τιμή ρ για στατιστική σημαντικότητα ρυθμίστηκε σε p = 0.0038 (= 0,05 /13) με διόρθωση Bonferroni. Το τεστ chi-square (ή ακριβής δοκιμασία του Fisher) εκτελέστηκε για τις κατηγορικές μεταβλητές. Η δοκιμασία t υποθέτοντας άνισες διακυμάνσεις έγινε για να συγκρίνετε μέση ηλικία και σημαίνει LINE-1 επίπεδο μεθυλίωσης. Για την ανάλυση επιβίωσης, χρησιμοποιήθηκαν η μέθοδος Kaplan-Meier και δοκιμασία log-rank. Για τις αναλύσεις του παχέος ειδική θνησιμότητα λόγω καρκίνου, οι θάνατοι ως αποτέλεσμα των αιτιών, εκτός από καρκίνο του παχέος εντέρου είχαν λογοκριθεί. Για τον έλεγχο για συγχυτικούς, χρησιμοποιήσαμε πολυμεταβλητή στάδιο συμφωνημένα (στρωματοποιημένη) Cox μοντέλο αναλογικών κινδύνων για τον υπολογισμό αναλογία κινδύνου (HR) του θανάτου. Για να αποφευχθεί η υπολειπόμενη συγχυτική δράση και υπερπροσαρμογής, το στάδιο της νόσου (I, II, III, IV, άγνωστο) χρησιμοποιήθηκε ως μεταβλητή στρωματοποίηση, χρησιμοποιώντας την «στρώματα» επιλογή στην εντολή της SAS «proc phreg». Το πολυπαραγοντικό μοντέλο περιελάμβανε αρχικά την ηλικία κατά τη διάγνωση (συνεχής), φύλο, έτος διάγνωσης (συνεχής), το δείκτη μάζας σώματος (ΒΜΙ? & Lt? 30 έναντι ≥30 kg /m

2), το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του παχέος εντέρου σε οποιαδήποτε συγγενής πρώτου βαθμού (παρούσα εναντίον απούσα), τη θέση του όγκου (εγγύς εναντίον άπω), η διαφοροποίηση του όγκου (καλά μέτρια εναντίον φτωχών), CIMP (υψηλή έναντι χαμηλής /CIMP-0), LINE-1 μεθυλίωσης (συνεχής),

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

. Μια προς τα πίσω μέθοδο απομάκρυνσης με κατώφλι p = 0,20 χρησιμοποιήθηκε για να περιορίσει τον αριθμό των μεταβλητών στο τελικό μοντέλο και να αποφευχθεί η υπερπροσαρμογής. Για τις περιπτώσεις όπου λείπουν οι πληροφορίες σε οποιαδήποτε από τις κατηγορικές μεταβλητές [BMI (0,1%), τη θέση του όγκου (1,0%), ο βαθμός όγκου (0,6%), CIMP (2,5%),

KRAS

(0,5%),

BRAF

(0,7%) και

PIK3CA

(8,8%)], συμπεριλάβαμε αυτές τις περιπτώσεις, στην πλειοψηφία κατηγορία δεδομένη συμμεταβλητή για την αποφυγή υπερπροσαρμογής. Επιβεβαιώσαμε ότι με εξαίρεση τις περιπτώσεις όπου λείπουν οι πληροφορίες σε οποιαδήποτε από τις συμμεταβλητές δεν μετέβαλε ουσιαστικά αποτελέσματα (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Μια πολυπαραγοντική ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης διεξήχθη για να εξετάσει μια ανεξάρτητη σχέση του κάθε συμμεταβλητή με

TGFBR2

μετάλλαξη (ως μεταβλητή έκβασης). Το πολυπαραγοντικό μοντέλο περιελάμβανε αρχικά μια παρόμοια, αλλά δεν είναι το ίδιο σύνολο των συμμεταβλητές ως το αρχικό μοντέλο Cox, θεωρώντας πιθανή σχέση αιτίας-αιτιατού με

TGFBR2

μετάλλαξη. Συγκεκριμένα, το στάδιο της νόσου και τη διαφοροποίηση του όγκου ήταν πιθανές συνέπειες (και όχι τις αιτίες) του

TGFBR2

μετάλλαξη. Έτσι, αυτές οι μεταβλητές δεν συμπεριλήφθηκαν στο μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης. Ένα προς τα πίσω αποβολής με ένα όριο p = 0,10 χρησιμοποιήθηκε για την επιλογή των μεταβλητών στο τελικό μοντέλο και να αποφευχθεί η υπερπροσαρμογής.

Αποτελέσματα

mononucleotide μεταλλάξεις του

TGFBR2

και

ΒΑΧ

σε MSI-υψηλής παχέος εντέρου

Μεταξύ 1072 καρκίνων του παχέος εντέρου σε δύο προοπτικές μελέτες κοόρτης, MSI-υψηλής παρατηρήθηκε σε 162 (15%) των όγκων.

TGFBR2

και

ΒΑΧ

μεταλλάξεις μονονουκλεοτίδιο οδού ανιχνεύθηκαν σε 117 (159, 74%) και 48 (158, 30%) MSI-υψηλής όγκων, αντίστοιχα. Μεταξύ MSI-υψηλών όγκων,

TGFBR2

μετάλλαξη σχετίζεται σημαντικά με CIMP-υψηλή (p = 0,0010) (Πίνακας 2).

Η πολυπαραγοντική ανάλυση για την αξιολόγηση ανεξάρτητων σχέσεις με

TGFBR2

μετάλλαξη

Πραγματοποιήσαμε πολυμεταβλητή ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης για να εξεταστεί κατά πόσον

TGFBR2

μετάλλαξη συσχετίστηκε ανεξάρτητα με οποιεσδήποτε κλινικές, παθολογικές και άλλες μοριακές μεταβλητές. Σε MSI-υψηλών όγκων,

TGFBR2

μετάλλαξη συσχετίστηκε ανεξάρτητα με CIMP-υψηλή [πολυμεταβλητή αναλογία πιθανοτήτων (OR), 3,57? 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI), 1,66 – 7,66? p = 0,0011].

mononucleotide μεταλλάξεις του

TGFBR2

και

ΒΑΧ

και του παχέος εντέρου πρόγνωση

Κατά τη διάρκεια της κατάλληλης παρακολούθησης (11,6 χρόνια διάμεση παρακολούθηση -up των λογοκρισία περιπτώσεις), υπήρξαν 505 θάνατοι, συμπεριλαμβανομένων 302 ορθοκολικού καρκίνου ειδικά για τους θανάτους. Μεταξύ όλες τις περιπτώσεις, MSI-υψηλής συσχετίστηκε σημαντικά με μεγαλύτερη καρκίνο του παχέος εντέρου, ειδικά επιβίωσης σε σύγκριση με το MSS /MSI-χαμηλό καρκίνους από δοκιμασία log-rank (p & lt? 0,0001), ανάλυση παλινδρόμησης μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική Cox (adjusted HR, 0,34? 95% CI, 0,20 – 0,57? p & lt? 0,0001) (Πίνακας 3). Όταν ξεχωριστά εξετάζεται

TGFBR2

-mutated MSI-υψηλής περιπτώσεις και

TGFBR2

-wildtype MSI-υψηλής περιπτώσεις, και οι δύο ομάδες έδειξαν σημαντικά μεγαλύτερο καρκίνο του παχέος εντέρου, ειδικά επιβίωσης σε σύγκριση με το MSS /MSI-χαμηλό περιπτώσεις (Σχήμα 2, Πίνακας 3). Όταν εξετάσαμε ξεχωριστά

ΒΑΧ

-mutated MSI-υψηλής περιπτώσεις και

ΒΑΧ

-wildtype MSI-υψηλής περιπτώσεις, και οι δύο ομάδες έδειξαν σημαντικά μεγαλύτερο καρκίνο του παχέος εντέρου, ειδικά επιβίωσης σε σύγκριση με το MSS /MSI-χαμηλό περιπτώσεις (Σχήμα 2, Πίνακας 3). Κατά τη συνολική θνησιμότητα αναλύσεις, αν και κάπως εξασθενημένο, τα αποτελέσματα έδειξαν παρόμοιες τάσεις (Πίνακας 3). Μεταξύ MSI-υψηλής περιπτώσεις, η επιβίωση των ασθενών δεν διέφεραν σημαντικά από το

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης.

Kaplan-Meier για καρκίνο του παχέος εντέρου-ειδική επιβίωση (Α) και τη συνολική επιβίωση (Β), σύμφωνα με το

TGFBR2

κατάσταση μετάλλαξης μονονουκλεοτίδιο. Ανεξάρτητα από το

TGFBR2

κατάσταση, MSI-υψηλής περιπτώσεις συσχετίστηκε με μακρύτερη επιβίωση. Kaplan-Meier καμπύλες για τον ορθοκολικό καρκίνο-ειδική επιβίωση (C) και τη συνολική επιβίωση (D), σύμφωνα με

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης μονονουκλεοτίδιο. Ανεξάρτητα από το

ΒΑΧ

κατάσταση, MSI-υψηλής περιπτώσεις συσχετίστηκε με μακρύτερη επιβίωση. MSI, μικροδορυφόρων αστάθεια? MSS, μικροδορυφόρων σταθερή.

Η

σύγκριση καρκίνο του παχέος εντέρου συγκεκριμένη και συνολική επιβίωση μεταξύ των

TGFBR2

-mutated MSI-υψηλής περιπτώσεις και

TGFBR2

-wildtype MSI -Υψηλής περιπτώσεις (ή μεταξύ

ΒΑΧ

-mutated MSI-υψηλής περιπτώσεις και

ΒΑΧ

-wild πληκτρολογήστε MSI-υψηλής περιπτώσεις). Δεν υπήρχε σημαντική διαφορά μεταξύ των δύο ομάδων (Πίνακας 1).

Συζήτηση

Διενεργήσαμε αυτή τη μελέτη για να εξεταστεί η προγνωστική σημασία των μεταλλάξεων μονονουκλεοτιδίου οδού στις περιοχές κωδικοποίησης του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

στην MSI-υψηλής παχέος εντέρου. Αξιοποιήσαμε δύο προοπτικές μελέτες κοόρτης με ένα μεγάλο αριθμό κλινικά και μοριακά καλά σχολιασμένο παχέος περιπτώσεων καρκίνου με την κατάλληλη παρακολούθηση. αποτέλεσμα μας έδειξε ότι η MSI-υψηλή όγκοι που σχετίζονται με βραδείας συμπεριφορά του όγκου, ανεξάρτητα από το

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης μονονουκλεοτιδίου, ανεξάρτητα από CIMP και άλλων μοριακών βιοδεικτών κλειδί όγκου. Παρ ‘όλα αυτά, μπορεί να είναι ενδιαφέρον να εξετάσει τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ αυτών των μοριακών μεταβολών και των διατροφικών συνηθειών και του τρόπου ζωής τους παράγοντες, αν υπάρχει μια υπόθεση στην εξελισσόμενη επιστήμη της μοριακής επιδημιολογίας παθολογικών [42], [43].

Θα πρέπει να σημειωθεί ότι μικρές μελέτες είναι πιο επιρρεπή σε «προκατάληψη δημοσίευση» από μεγάλες μελέτες [44]. Αυτό το φαινόμενο της πόλωσης δημοσίευση συμβαίνει επειδή οι μελέτες με μηδενική ευρήματα έχουν μεγαλύτερη πιθανότητα να είναι άγραφοι και αδημοσίευτα σε σύγκριση με εκείνους με σημαντικά αποτελέσματα. Σε σύγκριση με τις μικρές μελέτες (π.χ. μελέτες με μέγεθος δείγματος & lt? 200 καρκίνοι) με κενά δεδομένα, μεγάλες μελέτες με κενά δεδομένα είναι πιο πιθανό δημοσιεύονται. Ως αποτέλεσμα, μεγάλες μελέτες είναι λιγότερο επιρρεπείς σε προκατάληψη δημοσίευση από μικρές μελέτες. Επιπλέον, ακαδημαϊκά πιέσεις θα μπορούσαν να αναγκάσουν τους ερευνητές να σχεδιάσουν μικρές μελέτες που είναι εύκολο να ολοκληρωθεί και να πάρετε τα στοιχεία για τις εκδόσεις βιασύνη, τα οποία θα μπορούσαν να συμβάλουν στην προκατάληψη [45], [46], [47]. Ως εκ τούτου, θα πρέπει να ζυγίζουν περισσότερο σε μελέτες μεγάλης κλίμακας, όταν αξιολογούμε την δημοσιευμένη βιβλιογραφία σχετικά με προγνωστική σημασία της κάθε βιοδείκτη όπως

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μετάλλαξη μονονουκλεοτίδιο. Δημοσίευση null δεδομένων σε καλά-powered μελέτες [44], [48], [49], [50], [51], [52] είναι σημαντικό, διότι δημοσιεύοντας σημαντικά αποτελέσματα σε μικρές μικρής ισχύος σπουδών οδηγεί στην προκατάληψη δημοσίευση.

τα στοιχεία μας είναι σε γενικές γραμμές σύμφωνο με ορισμένες από τις προηγούμενες μελέτες [19], [22], [24], [25] (Πίνακας 1). Watanabe et al. [21] χρησιμοποιείται σταδίου ΙΙ και ΙΙΙ περιπτώσεις που υποβλήθηκαν σε επικουρική χημειοθεραπεία, και ανέφερε ότι,

TGFBR2

μετάλλαξη σχετίζεται με τη βελτίωση της 5-ετή συνολική επιβίωση μεταξύ των 73 MSI-υψηλών όγκων. Σε μια άλλη μελέτη [20], μεταξύ των 67 MSI-υψηλών όγκων,

ΒΑΧ

μετάλλαξη που σχετίζεται με κακή πρόγνωση. Σε μια μικρής ισχύος μελέτη από Fernández-Peralta et al. [23], μεταξύ των 16 MSI-υψηλών όγκων, τόσο

TGFBR2

μετάλλαξη και

ΒΑΧ

μετάλλαξη που σχετίζεται με καλύτερη πρόγνωση. Η μεγαλύτερη μελέτη (σύνολο Ν = 1427? 170 MSI-υψηλής καρκίνους) από Samowitz et al. [22] έδειξε κανένα προγνωστικό ρόλο του

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

μεταλλάξεις μεταξύ MSI-υψηλής παχέος περιπτώσεων καρκίνου, σε συμφωνία με την παρούσα μελέτη μας – η δεύτερη μεγαλύτερη μελέτη μέχρι σήμερα και η μόνη μελέτη που εξετάστηκαν άλλων βασικών όγκων μοριακοί βιοδείκτες, όπως CIMP, LINE-1 μεθυλίωση και

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

μεταλλάξεις.

Σπουδές σωματικών μοριακές αλλαγές και μοριακών συσχετισμοί είναι σημαντική για την έρευνα του καρκίνου προς την εξατομικευμένη ιατρική [53], [54], [55], [56]. Το ΚΚΕ νησί methylator φαινότυπο (CIMP) έχει καθιερωθεί ως ένα Γενετικής μοριακή ταξινομητή του καρκίνου του παχέος εντέρου [57], [58], [59], [60], [61], [62], [63], [64] , [65], [66], [67], [68], [69], [70], [71]. Στο παρελθόν, Iacopetta et al. [20] δεν έδειξε σημαντική συσχέτιση μεταξύ

KRAS

μετάλλαξη και

TGFBR

2 μετάλλαξη. Εκτιμήσαμε τη συσχέτιση μεταξύ του όγκου μοριακού μεταβλητών (CIMP, LINE-1,

KRAS

,

BRAF

και

PIK3CA

) και

TGFBR2

μετάλλαξη και έκανε δεν βρίσκουν σημαντική σχέση μεταξύ

TGFBR2

μετάλλαξη και

KRAS

ή

BRAF

μετάλλαξη. Είναι ενδιαφέρον, έχουμε βρει ότι, μεταξύ MSI-υψηλής όγκων,

TGFBR

2 μετάλλαξη σχετίζεται με CIMP-υψηλή, ανεξάρτητη από κλινικά και άλλα μοριακά χαρακτηριστικά. Μια πρόσφατη μελέτη [72] ανέφερε ότι οι γενετικές παραλλαγές στις σχετικές TGFB1 οδού γονίδια (

MAPK1

,

RUNX1

και

RUNX2

) συνδέονται με CIMP-υψηλή καρκίνο του παχέος εντέρου . Απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να διευκρινιστεί η ακριβής μηχανισμός της σχέσης μεταξύ CIMP και την πορεία TGFB1.

Υπάρχουν περιορισμοί στη μελέτη αυτή. Για παράδειγμα, τα δεδομένα για τη θεραπεία του καρκίνου ήταν περιορισμένες. Παρ ‘όλα αυτά, είναι απίθανο ότι η χρήση χημειοθεραπείας διέφερε σημαντικά ανάλογα με

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης σε όγκο, δεδομένου ότι τα στοιχεία ήταν συνήθως διαθέσιμη για λήψη αποφάσεων θεραπεία. Ως άλλο περιορισμό, πέρα ​​από αιτία θνησιμότητας, στοιχεία σχετικά με υποτροπές του καρκίνου δεν ήταν διαθέσιμα σε αυτές τις μελέτες κοόρτης. Παρ ‘όλα αυτά, δεδομένου μέση παρακολούθηση άνω των 11 ετών για λογοκρισία περιπτώσεις, καρκίνο του παχέος εντέρου, ειδικά η επιβίωση μπορεί να είναι ένα εύλογο υποκατάστατο του καρκίνου του παχέος εντέρου-συγκεκριμένο αποτέλεσμα.

Υπάρχουν πλεονεκτήματα στην αξιοποίηση της βάσης δεδομένων των δύο υποψήφιους ομάδα μελέτες, μελέτη Nurses ‘Health και οι Επαγγελματίες Υγείας Συνέχεια Μελέτη, να εξετάσει προγνωστική σημασία των βιολογικών δεικτών όγκου. Ανθρωπομετρικές μετρήσεις, το οικογενειακό ιστορικό, σταδιοποίηση του καρκίνου, και άλλες κλινικές, παθολογικές, και μοριακών δεδομένων όγκου προοπτικά συλλέγονται, τυφλωμένοι με τα αποτελέσματα των ασθενών [26]. Κοόρτης συμμετέχοντες που ανέπτυξαν καρκίνο υποβλήθηκαν σε θεραπεία σε νοσοκομεία σε όλη την ΗΠΑ, και ως εκ τούτου πιο αντιπροσωπευτικό του παχέος εντέρου στον πληθυσμό των ΗΠΑ από τους ασθενείς σε μία έως μερικές πανεπιστημιακά νοσοκομεία. Δεν υπήρχαν δημογραφική διαφορά μεταξύ περιπτώσεων με ιστό όγκου αναλύονται και εκείνα χωρίς ιστό όγκου που αναλύθηκαν [26]. Τέλος, πλούσια βάση δεδομένων του όγκου μας, μας έδωσε τη δυνατότητα να αξιολογήσει ταυτόχρονα παθολογικές και όγκου μοριακή συσχετισμοί και ελέγχου για τους πιθανούς συγχυτικούς από τα καρκινικά μοριακά χαρακτηριστικά.

Εν κατακλείδι, μεγάλη βάση δεδομένων του όγκου μας έχει δείξει ότι, σε σύγκριση με το MSS /MSI- χαμηλή περιπτώσεις, MSI-υψηλής καρκίνο του παχέος εντέρου σχετίζεται με την πλέον ειδική για τον καρκίνο επιβίωση, ανεξάρτητα από το

TGFBR2

ή

ΒΑΧ

κατάσταση μετάλλαξης μονονουκλεοτίδιο οδού. Η σημασία των μελετών μεγάλης κλίμακας δεν μπορεί να είναι υπερβολική έμφαση, διότι, σε σύγκριση με μεγάλες μελέτες, μικρές μελέτες είναι πολύ πιο επιρρεπείς σε προκατάληψη δημοσιεύσεων, οι οποίες μπορούν να παραπλανήσουν την κλινική πρακτική.

Ευχαριστίες

Ευχαριστούμε θερμά το Μελέτη Υγείας και των επαγγελματιών υγείας των νοσηλευτών Συνέχεια συμμετέχοντες ομάδα μελέτης που έχουν συμφωνήσει να μας δώσει πληροφορίες μέσω ερωτηματολογίων και βιολογικά δείγματα? νοσοκομεία και τμήματα παθολογίας σε όλη την ΗΠΑ για να μας προσφέρει απλόχερα με τα δείγματα ιστού. Ευχαριστούμε τα ακόλουθα μητρώα καρκίνου του κράτους για τη βοήθειά τους: AL, AZ, AR, CA, CO, CT, DE, FL, GA, ID, IL, IN, ΙΑ, KY, LA, ME, MD, ΜΑ, MI, NE , ΝΗ, NJ, NY, NC, ND, OH, OK, Ή, PA, RI, SC, TN, TX, VA, WA, WY. Ευχαριστούμε επίσης Μοριακής Διευκόλυνση Πυρήνας Βιολογίας στο Dana-Farber Cancer Institute για την τεχνική υποστήριξη.