Αφηρημένο

έκφραση παρεκκλίνουσα miRNA ρυθμίζει ασυνήθιστα γονιδιακής έκφρασης στα κύτταρα και μπορεί να συμβάλει στην ογκογένεση στον άνθρωπο. Αυτή η μελέτη εντόπισε λειτουργικά σχετικές διαφορικά εκφρασμένων γονιδίων χρησιμοποιώντας τους παράγοντες μεταγραφής και miRNA-συν-ρύθμιση ανάλυσης του δικτύου για τον καρκίνο του στομάχου. Η συν-ρυθμιστικών δίκτυο TF-miRNA κατασκευάστηκε με βάση τα δεδομένα που προέρχονται από cDNA μικροσυστοιχιών και miRNA προφίλ έκφρασης του γαστρικού καρκινικούς ιστούς. Το δίκτυο μαζί με συν-ρυθμιζόμενων γονιδίων τους αναλύθηκε με τη χρήση βάσεων δεδομένων για το σχολιασμό, την απεικόνιση και την Ολοκληρωμένη Discovery (David) και μεταγραφικό ρυθμιστικό στοιχείο βάσης δεδομένων (TRED). Βρήκαμε δεκαοκτώ (17 έως ρυθμιζόμενα και 1 κάτω-ρυθμιζόμενες) διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια που ήταν συν-ρυθμίζονται από παράγοντες μεταγραφής και miRNAs. Ανάλυση μονοπατιού KEGG αποκάλυψε ότι αυτά τα γονίδια ήταν μέρος της εξωκυττάριας μήτρας αλληλεπίδρασης-υποδοχέα και μονοπάτια σηματοδότησης εστιακής προσκόλλησης. Επιπλέον, qRT- PCR και τα δεδομένα κηλίδας Western έδειξε αύξηση των COL1A1 και μείωση στην NCAM1 mRNA και τα επίπεδα πρωτεΐνης στο γαστρικό καρκινικούς ιστούς. Έτσι, αυτά τα δεδομένα παρείχε την πρώτη απόδειξη για να δείξει ότι αλλαγμένο γονίδιο δίκτυο συνδέθηκε με γαστρικό καρκίνο εισβολή. Περαιτέρω μελέτη με μεγάλο μέγεθος του δείγματος και πιο λειτουργικά πειράματα για να επιβεβαιώσει τα στοιχεία αυτά και να συμβάλει στην διάγνωσης και θεραπείας στρατηγικές για καρκίνο του στομάχου

Παράθεση:. Shi Υ, Wang J, Xin Ζ, Duan Ζ, Wang G , Li F (2015) Μεταγραφή Παράγοντες και microRNA-Co-ρυθμιζόμενα γονίδια σε γαστρικός καρκίνος εισβολή στο

Ex Vivo

. PLoS ONE 10 (4): e0122882. doi: 10.1371 /journal.pone.0122882

Ακαδημαϊκό Επιμέλεια: Jian-Ιουν Zhao, Dana-Farber Cancer Institute, Ηνωμένες Πολιτείες