Αφηρημένο

Στόχος

Λειτουργική πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) του microRNA (miRNA) αλληλουχίες ή θέσεις δέσμευσης (miRNA-SNPs) σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα και η επιβίωση. Ο στόχος αυτής της μελέτης ήταν να εξετάσει συστηματικά μελέτες γενετικής σύνδεσης για miRNA-SNPs στον καρκίνο του πνεύμονα.

Μέθοδοι

Επιλέξιμες γενετικές μελέτες σύνδεσης είχαν ανακτηθεί από τις βάσεις δεδομένων του PubMed, EMBASE, China National γνώση της υποδομής και SinoMed. Δύο ερευνητές επιλεγμένων σχετικών μελετών και αξιολογούνται μεθοδολογικής ποιότητας ανεξάρτητα. σύνθεση ποσοτικά δεδομένα διεξήχθη για κοινή SNPs των miRNA (miRNA-196a2 rs11614913, rs2910164 miRNA146a, rs2292832 miRNA149, miRNA-605 rs2043556 και rs3746444 miRNA499). ΒΑΘΜΟΣ profiler χρησιμοποιήθηκε στον βαθμό την ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων για κάθε miRNA-SNP.

Αποτελέσματα

15 επιλέξιμες μελέτες και 27 miRNA-SNPs ανακτήθηκαν και 10 miRNA-SNPs αναφέρθηκαν με σημαντική συσχέτιση με ευαισθησία σε ή την επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα. Μεθοδολογική ποιότητα των επιλέξιμων μελετών ήταν επαρκής με μέσο όρο βαθμολογίας 8,5. miRNA-196a2 rs11614913 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (σύγκριση ομοζυγώτες, OR = 1.299, 95% CI: 1,096 – 1,540? κυρίαρχο μοντέλο, OR = 1.217, 95% CI: 1,041 – 1,421) και μειωμένη επιβίωση. Και ανάλογα με τον βαθμό profiler, την ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων ήταν μέτρια για rs3134615 MYCL1, ενώ η ποιότητα των άλλων σημαντικών ενώσεων ήταν χαμηλή.

Συμπεράσματα

Με βάση αυτή την πρώτη συστηματική αξιολόγηση για το miRNA-SNPs σε πνεύμονα καρκίνο, την ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων ήταν χαμηλή για τις περισσότερες μελέτες γενετικής σύνδεσης. Οι πολυμορφισμοί των miRNA-196a2 rs11614913 και rs3134615 MYCL1 θα μπορούσε να είναι εν δυνάμει βιοδείκτες του καρκίνου του πνεύμονα

Παράθεση:. Chen Ζ, Xu L, Ye Χ, Shen S, Li Ζ, Niu Χ, et al. (2013) Οι πολυμορφισμοί των microRNA Ακολουθίες ή τοποθεσίες βιβλιοδεσίας και καρκίνο του πνεύμονα: Μια μετα-ανάλυση και συστηματική αναθεώρηση. PLoS ONE 8 (4): e61008. doi: 10.1371 /journal.pone.0061008

Επιμέλεια: Ramon Andrade de Mello, Πανεπιστήμιο του Πόρτο, Πορτογαλία

Ελήφθη: 13 Δεκεμβρίου, 2012? Αποδεκτές: 5 Μαρ 2013? Δημοσιεύθηκε: 16 Απρίλη του 2013

Copyright: © 2013 Chen et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Δεν υπάρχει τρέχουσα εξωτερικές πηγές χρηματοδότησης για τη μελέτη αυτή

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του πνεύμονα είναι η κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται με σε όλο τον κόσμο [1]. Είναι ευρέως αποδεκτό ότι τόσο η γενετική προδιάθεση και η έκθεση του περιβάλλοντος συμβάλλει στον καρκίνο του πνεύμονα και πολλοί πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) συνδέονται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα [2], [3]. Επιπλέον, πρόσφατες μελέτες πρότειναν ότι η λειτουργική SNPs που συμβαίνουν σε micorRNA (miRNA) αλληλουχίες ή θέσεις δέσμευσης των miRNAs, δηλαδή το miRNA-SNPs, συνδέθηκαν με ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα [4] – [7], το οποίο επισημαίνεται ένα νέο παράδειγμα για γενετική ευαισθησία .

miRNAs, ένα είδος ενδογενών μικρών μη-κωδικοποίησης RNAs, είναι περίπου ~ 22 νουκλεοτιδίων σε μήκος και λειτουργούν ως αρνητικοί ρυθμιστές της γονιδιακής έκφρασης μετα-μεταγραφικό [8] – [10]. Ώριμη miRNAs στοχεύει πρωτίστως στην 3 ‘αμετάφραστη περιοχή (3’UTR) του mRNA στόχου τους, που οδηγεί σε αποικοδόμηση του mRNA ή καταστολή της μετάφρασης [8], [11]. miRNAs είναι κρίσιμα για τη ρύθμιση των διαφόρων βιολογικών διαδικασιών, όπως γονιδιακή ρύθμιση, ογκογένεση, τον πολλαπλασιασμό, την απόπτωση, και το μεταβολισμό [12] – [14]. Εκτιμάται ότι τουλάχιστον το 30% των γονιδίων που κωδικοποιούν πρωτεΐνες ρυθμίζονται από miRNAs [15] και από την άλλη πλευρά, ένα μόνο miRNA μπορεί επίσης να συνδεθεί με 3’UTR πολλών mRNA [16]. SNPs που συμβαίνουν σε ακολουθίες miRNA μπορεί να επηρεάσει την επεξεργασία και δεσμευτική ικανότητα των ώριμων miRNAs. Λειτουργική SNPs του miRNA-146a [17], miRNA-499 [18], και miRNA-196a2 [19] έχουν βρεθεί σχετίζονται με την ευαισθησία του καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα. Αρκετές μελέτες [4] – [6] έχουν ερευνήσει τη συσχέτιση μεταξύ rs11614913 miRNA-196a2 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα? Ωστόσο, τα αποτελέσματα είναι αποκλεισμούς.

Εκτός από πολυμορφισμούς του miRNAs, πολυμορφισμοί στις θέσεις πρόσδεσης του miRNAs μπορούν επίσης να συμβάλλουν στην ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Chin και οι συνεργάτες του [20] εντόπισε νέα SNP στην 3’UTR του KRAS γονιδίου που μεταβάλλεται η συγγένεια δέσμευσης των miRNA ας-7. Βρήκαν επίσης ότι αυτό το SNP (LCS6) σχετίστηκε με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στους καπνιστές χαμηλή δόση. Επιπλέον, λειτουργική miRNA-SNPs μπορεί να είναι δυναμικό βιοδείκτες για να προβλέψει την κλινική έκβαση του καρκίνου του πνεύμονα.

Η τρέχουσα κριτική είναι η πρώτη συστηματική αξιολόγηση για SNPs των ακολουθιών miRNA και θέσεις πρόσδεσης στον καρκίνο του πνεύμονα. Σε αυτή τη μελέτη, ο πρωταρχικός στόχος ήταν να αξιολογηθεί η αντοχή συνδέσεως των κοινών miRNA-SNPs με ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα. Και ο δεύτερος στόχος ήταν συστηματικά την αναθεώρηση τρέχουσες μελέτες για miRNA-SNPs και τον κίνδυνο ή την κλινική έκβαση του καρκίνου του πνεύμονα και την αξιολόγηση του επιπέδου των αποδεικτικών στοιχείων που χρησιμοποιούν GRADE profiler.

Μέθοδοι

Αναζητώντας στρατηγική

Επιλέξιμες μελέτες εξήχθησαν από την αναζήτηση ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων. Μια πλήρης αναζήτηση των μεγάλων βάσεων δεδομένων διεξήχθη, δηλαδή PubMed, EMBASE, Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) και SinoMed (CBM) ερευνήθηκαν. Οι ακόλουθες λέξεις κλειδιά και ιατρικές διακρίσεις χρησιμοποιήθηκαν, «Τα microRNAs», «νεοπλάσματα πνεύμονα», και «ενιαίο πολυμορφισμός νουκλεοτιδίου». Εξετάστηκαν επίσης εναλλακτικές ορθογραφίες. Η τελευταία έρευνα πραγματοποιήθηκε στις 3 Δεκεμβρίου του 2012, και δεν υπήρχε όριο των γλωσσών.

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Οι επιλέξιμες μελέτες επιλέχθηκαν από δύο κριτές (Chen και Xu) ανεξάρτητα σύμφωνα με ακόλουθα κριτήρια ένταξης: 1) τη διερεύνηση miRNA-SNPs και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ή κλινική έκβαση? 2) δημοσιεύονται άρθρα πλήρους κειμένου. Μετά την αρχική διαλογή των τίτλων και των περιλήψεων, άρθρα πλήρους κειμένου ανακτήθηκαν και περαιτέρω εξετάζονται για την επιλεξιμότητα. Οι δύο κριτικός επιτευχθεί συναίνεση για κάθε μελέτη.

Εξόρυξη Δεδομένων

Δύο σχολιαστές (Chen και Xu) εξάγονται τα δεδομένα από τις επιλέξιμες μελέτες εις διπλούν με ένα τυποποιημένο έντυπο συλλογής δεδομένων, και κατέληξε σε συναίνεση για κάθε είδος. Τα ακόλουθα δεδομένα προέρχονται: το όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα, την εθνικότητα, τον αριθμό των συμμετεχόντων, το μοντέλο σύγκρισης, και οι λόγοι πιθανοτήτων (OR) ή αναλογίες κινδύνου (HR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (CI). Για τις μελέτες που διερευνούν SNPs των ακολουθιών miRNA και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, λεπτομερώς γονότυπο επίσης συλλέγονται. καταβάσεις εθνότητα απλώς ταξινομούνται ως ευρωπαϊκή και ασιατική. Στη μελέτη αναφέρεται από Nelson και οι συνεργάτες του [21], δεν HR ή 95% ΠΙ ήταν διαθέσιμα, έτσι οι ΥΕ και 95% ΚΠ υπολογίστηκαν από τις καμπύλες Kaplan-Meier, χρησιμοποιώντας τη μέθοδο που προτείνει Tierney et al [22].

μεθοδολογικά αξιολόγησης της ποιότητας

Δύο μεθοδολογικές κλίμακες ποιότητας υιοθετήθηκαν για την αξιολόγηση της ποιότητας των επιλέξιμων μελετών. Για μελέτες σχετικά με miRNA-SNPs και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, μια κλίμακα ποιότητας ( «Πίνακας S2: Μεθοδολογικά ποιότητας κλίμακα αξιολόγησης για τον κίνδυνο») που αναφέρονται από τις προηγούμενες μετα-ανάλυση [19] χρησιμοποιήθηκε. Για τις μελέτες που αφορούν την επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα και miRNA-SNPs, μια άλλη κλίμακα ποιότητας (τροποποιημένο από προηγούμενη μελέτη [23], «Πίνακας S3: Μεθοδολογικά ποιότητας κλίμακα αξιολόγησης για την επιβίωση») εφαρμόστηκε. βαθμολογίες ποιότητας των δύο κλίμακες κυμαίνονται από 0 έως 10, και ένα υψηλό σκορ δείχνει καλή ποιότητα. Μεθοδολογική ποιότητα των επιλέξιμων μελετών αξιολογήθηκε από δύο ερευνητές ανεξάρτητα (Shen και Ye).

ΒΑΘΜΟΣ Αξιολόγησης της Ποιότητας

ΒΑΘΜΟΣ profiler (έκδοση 3.6) εγκρίθηκε με την ποιότητα βαθμού των αποδείξεων για κάθε ένωση. Παράγοντες εκείνους που θα αναβαθμίσει (μεγάλη επίδραση, εύλογη σύγχυση, και απόκριση στη δόση) και υποβάθμιση (κίνδυνος μεροληψίας, ασυνέπεια, Έμμεση, ανακρίβεια και μεροληψία δημοσίευση) ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων αξιολογήθηκε. Δύο ερευνητές (Shen και Ye) αξιολόγησε την ποιότητα ανεξάρτητα και έλυσε τη διαφωνία με τη συζήτηση.

Στατιστική Ανάλυση

ΕΑΠ και 95% ΠΙ υπολογίστηκαν για την εκτίμηση της αντοχής σύνδεση των κοινών miRNA-SNPs με καρκίνο του πνεύμονα κίνδυνος. Για τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, σύνθεση δεδομένων έγινε για 5 κοινά SNPs των miRNA (rs11614913 miRNA-196a2, miRNA146a rs2910164, rs2292832 miRNA149, miRNA-605 rs2043556 και rs3746444 miRNA499), αλλά ποσοτική σύνθεση δεν έγινε για την πρόγνωση με περιορισμένα δεδομένα. Μια σειρά από 4 μοντέλα σύγκρισης διεξήχθησαν για κάθε SNP, δηλαδή σύγκριση ομοζυγώτες (Μ1: AA εναντίον αα), η σύγκριση ετεροζυγώτες (M2: Αα εναντίον αα), κυρίαρχο μοντέλο (Μ3: ΑΑ /Αα εναντίον αα), και υπολειπόμενο μοντέλο (M4: AA έναντι αα /αα) (α: αλληλόμορφο παραλλαγή, ένα: άγρια ​​αλληλόμορφο). Τυχαία εφέ μοντέλο (μέθοδος Dersimonian-Laird) εκδόθηκε σε κάθε σύγκριση με την ελαχιστοποίηση προκατάληψη, σχετικά με τον περιορισμένο αριθμό μελετών. Μια CI 95%, χωρίς να 1Για Ή έδειξε μια σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Ετερογένεια μεταξύ των μελετών ελέγχθηκε με τη δοκιμασία Q βασίζεται chi-square και P & lt? 0.1 υποδεικνύεται σημαντική ετερογένεια [24]. Δεδομένου του περιορισμένου αριθμού μελετών που περιλαμβάνονται στη σύνθεση των δεδομένων, η ανάλυση υποομάδας και ανάλυση ευαισθησίας δεν πραγματοποιήθηκε. προκατάληψη δημοσίευση ελέγχθηκε από την δοκιμασία Begg και δοκιμή του Egger »και μια τιμή Ρ μικρότερη από 0,05 θεωρήθηκε σημαντική [25].

Όλες οι τιμές P ήταν δύο-side. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις υπολογίστηκαν με το λογισμικό STATA (έκδοση 10.0? StataCorp, Κόλετζ Στέισον, Τέξας ΗΠΑ).

Αποτελέσματα

επιλογή των επιλέξιμων Σπουδών

Ένα σύνολο των 135 εγγραφών ήταν ανακτηθεί από τις βάσεις δεδομένων. Μετά από προκαταρκτικό έλεγχο των τίτλων και των περιλήψεων, 17 άρθρα πλήρους κειμένου περαιτέρω εξετάζονται για την επιλεξιμότητα. Δύο άρθρα αποκλείστηκαν για το λόγο ότι είναι αφηρημένη [26] και όχι για miRNA-SNPs [27]. Έτσι, 15 επιλέξιμες μελέτες [4] – [7], [20], [21], [28] – [36] ανακτήθηκαν και επανεξετάζονται και 4 από αυτά [4] – [7] συμπεριλήφθηκαν σε ποσοτική σύνθεση (που δείχνεται στο Σχήμα 1).

Η

χαρακτηριστικά επιλέξιμων Σπουδών

Ο Πίνακας 1 δείχνει τα χαρακτηριστικά των επιλέξιμων μελετών. Όπως φαίνεται, 12 από 15 μελέτες διεξήχθησαν σε ασιατικό πληθυσμό και μόνο 3 μελέτες [20], [21], [29] διεξήχθησαν σε ευρωπαϊκό πληθυσμό, η οποία μπορεί να οδηγήσει σε μια διαφορά της εθνικότητας. Τα μεγέθη των δειγμάτων του περιλαμβάνονται μελετών ήταν επαρκής εκτός από μία μελέτη που αναφέρθηκε από Ding et al [30]. Όλες οι μελέτες είχαν υψηλή μεθοδολογική ποιότητα με μέσο όρο βαθμολογίας της ποιότητας 8.5.

Η

Σύλλογος Δύναμη των miRNA-SNPs και τον Καρκίνο του Πνεύμονα

Ένα σύνολο των 27 miRNA-SNPs αναφέρθηκαν στην τρέχουσα μελέτες και 10 από αυτούς είχαν σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ή την επιβίωση.

Πέντε κοινά SNPs εμφανίστηκαν σε αλληλουχίες miRNA περιελήφθησαν στην ποσοτική σύνθεση, και τα αποτελέσματα λεπτομέρεια φαίνονται στον πίνακα 2. miRNA-196a2 rs11614913 πολυμορφισμός έχει καταδειχθεί με αυξημένο κίνδυνο πολλών μορφών καρκίνου, αλλά μόνο 3 μελέτες [4] – [6] ερεύνησε rs11614913 πολυμορφισμό και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα. Με τη συγκέντρωση των επιλέξιμων δεδομένων, διαπιστώσαμε ότι το αλληλόμορφο παραλλαγή C αυξημένη ευαισθησία σε καρκίνο του πνεύμονα σε σύγκριση ομοζυγώτες (OR = 1.299, 95% CI: 1,096 – 1,540, P

ετερογένεια = 0,895) και κυρίαρχου μοντέλου (OR = 1.217, 95 % CI: 1,041 – 1,421, P

ετερογένεια = 0,281, P

Begg = 0,296, P

Egger = 0,094? Σχήμα 2). Ωστόσο, ανάλογα με τον βαθμό profiler, η ποιότητα αυτής της ένωσης ήταν χαμηλή. Καμία σημαντική συσχέτιση με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ανιχνεύθηκε για miRNA-149 rs2292832 (κυρίαρχο μοντέλο, OR = 1.068, 95% CI: 0,913 – 1,248, P

ετερογένεια = 0,975), miRNA-146a rs2910164 (κυρίαρχο μοντέλο, OR = 1.052 , 95% CI: 0,878 – 1,259), miRNA-499 rs3746444 (κυρίαρχο μοντέλο, OR = 0,956, 95% CI: 0,788 – 1,161), ή miRNA-605 rs2043556 (κυρίαρχο μοντέλο, OR = 0,840, 95% CI: 0.587- 1.203). Δεν υπάρχουν ενδείξεις για μεροληψία δημοσίευσης ανιχνεύθηκε.

Εκτιμώμενο με το μοντέλο τυχαίας επίδρασης (CC + CT έναντι ΤΤ).

Η

Χου και οι συνεργάτες του [31] διερευνήθηκε η συσχέτιση μεταξύ των κοινών SNPs των miRNAs (miRNA-196a2 rs11614913, miRNA-149 rs2292832, miRNA-146α rs2910164, και miRNA-499 rs3746444) και τη μακροπρόθεσμη επιβίωση των μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC). Βρήκαν rs2910164 και rs11614913 συσχετίστηκαν με την επιβίωση και την ποιότητα αυτής της ένωσης ήταν χαμηλή ανάλογα με τον βαθμό pofiler (Πίνακας 3). Αλλά η προγνωστική ρόλος των miRNA-196a2 rs11614913 πολυμορφισμός διέφερε μεταξύ των NSCLC και μικροκυτταρικού καρκίνου του πνεύμονα (SCLC). Zhan και οι συνεργάτες του [28] αξιολόγησε την προγνωστική αξία της rs11614913 πολυμορφισμού σε SCLC. Zhan [28] δεν παρατηρούμε μια σημαντική συσχέτιση του πολυμορφισμού rs11614913 με ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία σε SCLC (OR = 0,88, 95% CI: 0,50 – 1,55)? Ωστόσο, rs11614913 πολυμορφισμός θα μπορούσε να προβλέψει τη συνολική τοξικότητα (OR = 1,73, 95% CI: 1,10 – 2,71).

Η

Άλλα SNPs των miRNAs ερευνήθηκαν επίσης. Hu et al [32] εντόπισε μια νέα SNP των miRNA (miR-30γ-1 rs928508) σε κινεζικού πληθυσμού, η οποία σχετίζεται με την επιβίωση σε NSCLC. Yoon et al [35] διερεύνησε την προγνωστική επίδραση διαφόρων πολυμορφισμών miRNA σε εκτομή NSCLC, και μόνο miR-146a rs2910164 ήταν προγνωστική αξία. Αυτές οι δύο μελέτες διεξήχθησαν σε πληθυσμό Ασία και η ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων ήταν χαμηλή.

Πολλά SNPs θέσεων δέσμευσης miRNA μελετήθηκαν και ταυτίστηκε σημαντική σχέση με την ευαισθησία και την επιβίωση. Συνολικά 6 SNPs στις θέσεις δέσμευσης miRNA βρέθηκαν σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ή την επιβίωση μέχρι σήμερα (Πίνακας 3), αλλά μόνο με τη σύνδεση των rs3134615 (3’UTR της MYCL1? OR = 2,08? 95% CI: 1,39 – 3,12) είχε μια μέτρια ποιότητα [33] (Πίνακας 3). Αξίζει να σημειωθεί ότι, τα γονίδια στα οποία σημειώθηκαν οι πολυμορφισμοί των θέσεων πρόσδεσης είναι ογκογονίδια ή συμμετέχουν σε μονοπάτια επιδιόρθωσης του DNA. Για παράδειγμα, REV3L είναι υπεύθυνη για το DNA επισκευή [36] και MYCL1 είναι μέλος της οικογένειας ογκογονιδίων MYC [33]. Επιπλέον, αυτοί οι πολυμορφισμοί μπορεί να επηρεάσουν τις λειτουργίες των γονιδίων και της έκφρασης της πρωτεΐνης, η οποία ήταν σε συνεπή με την έξυπνη ρόλος αυτών των miRNA-SNPs.

Chin et al [20] εντοπιστεί ένας πολυμορφισμός στην 3’UTR του KRAS (LCS6) και η LCS6 πολυμορφισμός αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στους καπνιστές χαμηλή δόση (GRADE ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων, χαμηλή) αλλά αυτή τη συσχέτιση δεν ήταν σημαντική στο συνολικό πληθυσμό (βαθμού ποιότητας των αποδεικτικών στοιχείων, είναι πολύ χαμηλή). Στη συνέχεια, ο Νέλσον και οι συνεργάτες του [21] διερευνάται LCS6 πολυμορφισμό και την επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα και απέτυχε να βρει οποιαδήποτε σημαντική συσχέτιση (HR = 0,99, 95% CI: 0,56 – 1,74). Περιέργως, αυτοί οι δύο μελέτες σχετικά με LCS6 πολυμορφισμός και οι δύο διενεργούνται του πληθυσμού της Ευρώπης, και ο πολυμορφισμός LCS6 δεν έχει επικυρωθεί σε άλλες εθνότητες.

Κάθε ένα από τα 6 SNPs σε θέσεις δέσμευσης miRNA αναφέρθηκε σε μία μόνο μελέτη, και λόγω της ανακρίβειας, οι μελέτες αυτές δεν θα μπορούσε να παράσχει αποδεικτικά στοιχεία της υψηλής ποιότητας.

Συζήτηση

σε αυτή την πρώτη εκτεταμένη συστηματική ανασκόπηση σχετικά με miRNA-SNPs στον καρκίνο του πνεύμονα, εντοπίσαμε 15 γενετικές μελέτες σύνδεσης σε αυτό θέμα και να αξιολογεί την ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων της 27ης miRNA-SNPs. Μεθοδολογική ποιότητα των επιλέξιμων μελετών ήταν επαρκή και GRADE Profiler πρότεινε ότι το επίπεδο σύνδεσης της πιο miRNA-SNPs ήταν χαμηλή, με εξαίρεση rs3134615 πολυμορφισμό στην 3’UTR του MYCL1 [33] (μέτρια).

Πολυάριθμες μελέτες έχουν ερεύνησε τα κοινά SNPs των miRNA και τους κινδύνους των διαφόρων ειδών καρκίνου. Σε αυτή τη μελέτη, βρήκαμε πολυμορφισμό των miRNA-196a2 αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σύγκριση ομοζυγώτες (OR = 1.299, 95% CI: 1,096 – 1,540) και κυρίαρχου μοντέλου (OR = 1.217, 95% CI: 1,041 – 1,421). Και οι πολυμορφισμοί των miRNA-146α, Miran-149, και miRNA-499 δεν έδειξαν καμία σημαντική συσχέτιση, αν και παρατηρήθηκε αλλαγμένη κινδύνου σε άλλους καρκίνους. Ωστόσο, στη μελέτη από τον Hu et al [31], πολυμορφισμοί των miRNA-149 και miRNA-196a2 συσχετίζονταν σημαντικά με τη μακροπρόθεσμη επιβίωση των NSCLC. Επιπλέον, Zhan και οι συνεργάτες του [28] έδειξε ότι rs11614913 miRNA-196a2 θα μπορούσε να προβλέψει τη συνολική τοξικότητα της χημειοθεραπείας σε NSCLC. Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι οι πολυμορφισμοί miRNA-196a2 rs11614913 μπορεί να είναι ένας πιθανός βιολογικός δείκτης για τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα και κλινική έκβαση των NSCLC.

Έξι SNPs στις θέσεις δέσμευσης των miRNA ανακτήθηκαν από τις επιλέξιμες μελέτες και όλα αυτά συνδέθηκαν με ευαισθησία σε ή την επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα. Αλλά μόνο rs3134615 (3’UTR του MYCL1) έδειξε μέτρια ποιότητα [33], η οποία τονίζει τον ρόλο του rs3134615 ως πιθανό βιοδείκτη σε SCLC. Όπως λίγες μελέτες διερευνήθηκε γενετική παραλλαγή σε SCLC, ο πολυμορφισμός του MYCL1should επικυρωμένων περαιτέρω σε διαφορετικές εθνότητες με μεγάλο μέγεθος δείγματος. Ding και οι συνεργάτες αταξινόμητους ένα SNP στο rs16917496, η 3’UTR της SET8 [30], και διαπίστωσε ότι σχετίζονται με την επιβίωση του SCLC. Περιέργως, SET8, μια μεθυλοτρανσφεράση, ρυθμίζει την έκφραση p53 [37]. Επιπλέον, η προγνωστική αξία της KRT81 rs3660 πολυμορφισμού ήταν πιο έντονη σε καρκίνο εκ πλακωδών κυττάρων [29]. Παρά το γεγονός ότι το επίπεδο συνδέσμου KRT81 rs3660 και SET8 rs16917496 ήταν χαμηλή ανάλογα με τον βαθμό profiler, περαιτέρω μελέτες είναι εντάλματος.

Αυτά τα SNPs των θέσεων δέσμευσης miRNA βρίσκονταν σε ογκογονίδια ή κρίσιμης σημασίας γονίδια που εμπλέκονται σε μονοπάτια DNA επισκευή. Αυτά τα γονίδια είναι κρίσιμης σημασίας για την καρκινογένεση και την ακεραιότητα του γονιδιώματος. Με βάση τα χαρακτηριστικά αυτών των γονιδίων του ξενιστή, θα μπορούσαμε να συμπεράνουμε ότι άλλες SNPs στην 3’UTR ογκογονιδίων ή γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA θα είναι, ενδεχομένως, των προγνωστική αξία για τον κίνδυνο καρκίνου ή την επιβίωση.

Με βάση την συστηματική ανασκόπηση μας, μερικοί ταυτίστηκε αδυναμία τρέχουσες μελέτες. Κατά την πρώτη, το επίπεδο σύνδεσης που προσδιορίζονται από τις τρέχουσες μελέτες ήταν χαμηλή λόγω της ανακρίβειας ανάλογα με τον βαθμό profiler. Επιπλέον, οι περισσότεροι SNPs εντοπίστηκαν από μία μόνο μελέτη και δεν χρειάζεται περαιτέρω επικύρωση ήταν διαθέσιμο. Δεύτερον, οι περισσότερες μελέτες διεξήχθησαν σε ασιατικό πληθυσμό και μόνο 3 μελέτες [20], [21], [29] και 2 SNPs διεξήχθησαν σε ευρωπαϊκό polulation. Επιπλέον, στις 7 μελέτες [20], [21], [29], [30], [33], [34], [36] σχετικά με SNPs των miRNA θέσεις δέσμευσης, μόνο μία μελέτη [33] ανέφερε ασήμαντη συσχέτιση με πνεύμονα επιβίωση του καρκίνου, η οποία ανέφερε την ύπαρξη μεροληψίας δημοσίευση.

Εν κατακλείδι, εντοπίσαμε 10 SNPs των ακολουθιών miRNA ή θέσεις σύνδεσης που σχετίζονται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ή την επιβίωση. Ωστόσο, η ποιότητα των αποδεικτικών στοιχείων ήταν χαμηλή ανάλογα με τον βαθμό profiler. Αδυναμία της τρέχουσας μελέτες τονίστηκε και μεταφραστικό δυναμικό των miRNA-196a2 rs11614913 και MYCL1rs3134615 συζητήθηκε επίσης.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0061008.s001

(DOC)

Πίνακας S2. .

Μεθοδολογικά κλίμακα αξιολόγησης της ποιότητας για τον κίνδυνο

doi: 10.1371 /journal.pone.0061008.s002

(DOC)

Πίνακα S3.

Μεθοδολογική ποιότητα κλίμακας αξιολόγησης για την επιβίωση

doi:. 10.1371 /journal.pone.0061008.s003

(DOC)