Αφηρημένο

Ο καρκίνος του προστάτη (PCA) παραμένει ως ένα από τα πιο κοινή αιτία θανάτου που σχετίζονται με τον καρκίνο μεταξύ των ανδρών στις ΗΠΑ. Το ειδικό αντιγόνο (PSA) διαλογής που χρησιμοποιείται ευρέως προστάτη περιορίζεται από τη χαμηλή εξειδίκευση. Η διαγνωστική αξία των άλλων βιοδεικτών, όπως η οικογένεια πρωτεϊνών RAS τομέα ένωση 1 Α (RASSF1A) μεθυλίωση υποστηρικτής στον καρκίνο του προστάτη και τη σχέση μεταξύ RASSF1A μεθυλίωση και παθολογικά χαρακτηριστικά ή το στάδιο του όγκου μένει να αποδειχθεί. Ως εκ τούτου, μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων μελετών διεξήχθη για να κατανοήσουμε τη σχέση μεταξύ RASSF1A μεθυλίωση και του καρκίνου του προστάτη. Συνολικά, 16 μελέτες στις οποίες συμμετείχαν 1.431 περιπτώσεις και 565 έλεγχοι συνενώθηκαν με ένα τυχαίο μοντέλο επίδραση στην παρούσα έρευνα. Η αναλογία πιθανοτήτων (OR) της RASSF1A μεθυλίωσης σε περίπτωση προστάτη, σε σύγκριση με τους μάρτυρες, ήταν 14,73 με 95% CI = 7,58 – 28,61. Οι αναλύσεις έδειξαν στρωματοποιημένη με συνέπεια μια παρόμοια κινδύνου σε διάφορα είδη δειγμάτων και μεθόδων ανίχνευσης μεθυλίωσης. Επιπλέον, RASSF1A μεθυλίωση συσχετίστηκε με υψηλό σκορ Gleason OR = 2.35, 95% CI: 1,56 – 3,53. Επιπλέον, η εξειδίκευση συνενώθηκαν για όλες περιλαμβάνονται μελέτες ήταν 0,87 (95% CI: 0,72 – 0,94), και τα ενωμένα ευαισθησία ήταν 0,76 (95% CI: 0,55 – 0,89). Η εξειδίκευση σε κάθε υποομάδα ανά τύπο δείγματος παρέμεινε πάνω από 0,84 και η ευαισθησία παρέμεινε επίσης πάνω από 0,60. Αυτά τα αποτελέσματα υποδηλώνουν ότι η μεθυλίωση RASSF1A υποστηρικτής θα ήταν μια πιθανή βιοδεικτών στη διάγνωση και τη θεραπεία του προστάτη

Παράθεση:. Παν J, Chen J, Ζανγκ Β, ο Τσεν Χ, Huang Β, Zhuang J, et al. (2013) Σύνδεσης μεταξύ RASSF1A υποστηρικτής μεθυλίωση και καρκίνος του προστάτη: μια συστηματική ανασκόπηση και μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (9): e75283. doi: 10.1371 /journal.pone.0075283

Συντάκτης: Ken Mills, Βασιλικό Πανεπιστήμιο του Μπέλφαστ, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: May 20, 2013? Αποδεκτές: 14, Αυγούστου του 2013? Δημοσιεύθηκε: 20 Σεπτεμβρίου 2013

Copyright: © 2013 Pan et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81272809)? Υποστηρίζεται από Επιστήμη και Τεχνολογία Σχεδιασμού Έργου της Guangdong (2011B050400021) και Guangdong Βασικά Εργαστήριο της Ουρολογίας, το πρώτο συνδεδεμένες Νοσοκομείο της Guangzhou Medical University (2010A060801016). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος του προστάτη παραμένει ως ένα από τα πιο κοινή αιτία θανάτου που σχετίζονται με τον καρκίνο μεταξύ των ανδρών στις ΗΠΑ, με κατ ‘εκτίμηση 29.720 θάνατοι προβλέπεται για το 2013 [1,2]. Ο καρκίνος του προστάτη είναι ιάσιμη αν ανιχνευθεί νωρίς από δακτυλική εξέταση και το ειδικό προστατικό αντιγόνο (PSA) στον ορό [3]. Με ευαισθησία 80%, έλεγχο PSA αυξάνει σημαντικά την έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου του προστάτη, ωστόσο ο έλεγχος του PSA έχει μόνο το 20% ειδικότητα, η οποία μπορεί να οδηγήσει σε περιττές βιοψίες και υπερθεραπεία [4]. Ως εκ τούτου, τη διάγνωση και τη διαχείριση είναι διαταράσσεται από την έλλειψη διαγνωστικών τεχνικών ειδική για τον καρκίνο που θα χρησιμοποιηθεί κατά τα αρχικά στάδια της νόσου. Νέες προσεγγίσεις για την οριστική ανίχνευση και τον έλεγχο του καρκίνου αυτού χρειάζονται επειγόντως.

Μοριακές μελέτες έχουν αποκαλύψει σημαντικά γεγονότα στην εξέλιξη του καρκίνου του προστάτη και την εξέλιξη και την ανάδειξη νέων βιοδεικτών μπορεί να βελτιώσει τη διάγνωση του καρκίνου του προστάτη [5]. Η ανώμαλη μεθυλίωση του DNA του γονιδίου υποκινητών είναι χαρακτηριστική των καρκινικών κυττάρων, και αρκετά γονίδια επιγενετικώς μεταβάλλονται κατά του καρκίνου ειδικό τρόπο. GSTP1 μεθυλίωση του γονιδίου υποκινητή είναι ευρέως χαρακτηρίζεται από διάφορες ανεξάρτητες ομάδες και βρίσκεται να είναι έχουν διαγνωστική αξία στον καρκίνο του προστάτη [6,7]. Μέχρι σήμερα, περισσότεροι από εκατό γονίδια αναφέρονται ως στόχοι μεθυλίωσης στον καρκίνο του προστάτη, η οποία μπορεί να αντιπροσωπεύει μια πολλά υποσχόμενη μέθοδος για την παρακολούθηση της εμφάνισης και εξέλιξης του καρκίνου [7-9]. Πρόσφατα, μελέτες αλληλουχίας με βάση επόμενης γενιάς έχουν επίσης εντοπιστεί επιπλέον υποψήφια γονίδια [10]. Η χρωμοσωμική περιοχή 3ρ21 υπόκειται σε συχνή απώλεια (ετερόζυγο και τα ομόζυγα) σε πολλαπλούς τύπους όγκου, η περιοχή σύνδεσης οικογένεια πρωτεϊνών 1 Α (RASSF1A) γονίδιο RAS βρίσκεται σε αυτή την περιοχή, είναι μια υποθετική καταστολέας όγκου που μοιράζεται υψηλή ομολογία αλληλουχίας με έναν γνωστό ποντίκι πρωτεΐνη (Nore1) [11,12]. Μελέτες δείχνουν το ρόλο για RASSF1 ως τελεστή που διαδίδει τις αποπτωτικά αποτελέσματα του RAS με σύνδεση RAS σε τριφωσφορική γουανοσίνη τρόπο που εξαρτάται [13]. Υπερμεθυλίωση στο CpG νησίδες εντός της περιοχής RASSF1A υποκινητή είναι η κύρια αιτία απώλειας της έκφρασης [14]. Σε πολλές συμπαγείς όγκους, μεθυλίωση RASSF1A έχει ταυτοποιηθεί και τη συχνότητα της κυμαίνεται μεταξύ 30% έως 50% [12]. Ως εκ τούτου, RASSF1A μεθυλίωση επηρεάζει ογκοκατασταλτικό του ρόλο και συνδέεται με δυσμενείς πρόγνωση [15,16].

Παρά τον αριθμό των μεμονωμένων μελετών που έχουν διεξαχθεί σε ασθενείς με καρκίνο του προστάτη, η διαγνωστική αξία της κατάστασης RASSF1A μεθυλίωσης στον καρκίνο του προστάτη και η σχέση μεταξύ RASSF1A μεθυλίωση και παθολογικά χαρακτηριστικά ή το στάδιο του όγκου παραμένει αμφιλεγόμενη. Ως εκ τούτου, ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να διεξάγει μια μετα-ανάλυση για την προγνωστική αξία της κατάστασης RASSF1A μεθυλίωσης στον καρκίνο του προστάτη, και τη σχέση μεταξύ RASSF1A μεθυλίωση και παθολογικών στάδιο, το σκορ Gleason, και το επίπεδο PSA. Εκτιμήσαμε επίσης την ευαισθησία και την ειδικότητα των RASSF1A μεθυλίωσης στα υγρά του σώματος και τους ιστούς για την ανίχνευση του καρκίνου του προστάτη.

Υλικά και Μέθοδοι

Επιλογή Μελέτη

Προηγουμένως δημοσιευμένα άρθρα που μελετήθηκαν RASSF1 υποστηρικτής μεθυλίωσης του DNA στον καρκίνο του προστάτη εντοπίστηκαν μέσω ενός ηλεκτρονικού αναζήτηση PubMed χρησιμοποιώντας τις ακόλουθες λέξεις-κλειδιά? Ο καρκίνος του προστάτη, του προστάτη, RAS τομέα σύνδεσης της οικογένειας protein1A και RASSF1A. Πρόσθετες μελέτες βρέθηκαν μέσω των καταλόγων αναφοράς των εντοπίστηκαν άρθρα. Μόνο μελέτες που δημοσιεύονται ως άρθρα πλήρους κειμένου στα αγγλικά συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα μελέτη. Η τελευταία ανάκτηση διεξήχθη Μαρτίου 2013.

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

επιλέχθηκαν Μελέτες για ανάλυση εφόσον πληρούνται τα ακόλουθα κριτήρια (1): μέτρηση της μεθυλίωσης του DNA σε ένα από τα ακόλουθα δείγματα : αίμα, πλάσμα, ορό, ούρα ή προστάτη ιστών? (2) τα υποκείμενα σε κάθε μελέτη αποτελείται από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη και μάρτυρες μη καρκίνο? (3) Τα δεδομένα που περιλαμβάνονται στην ανάλυση μόνο εάν το πλήρες κείμενο του άρθρου ήταν στα αγγλικά. Τα κριτήρια αποκλεισμού ήταν: (1) RASSF1A μεθυλίωση διεξάγεται μόνο στις κυτταρικές γραμμές? (2) Δεν διατίθενται ανεπεξέργαστα δεδομένα ή δεν μπορεί να ανακτήσει οποιαδήποτε ανεπεξέργαστα δεδομένα? (3) Τα έγγραφα επανεξέταση.

Συλλογή δεδομένων

Για κάθε μελέτη, δύο ανεξάρτητους ερευνητές εξάγονται τα ακόλουθα στοιχεία τα οποία περιλαμβάνουν το επώνυμο του συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα, τη φυλή, το είδος των περιπτώσεων και ελέγχους. Επιπλέον, οι πληροφορίες συλλέγονται επίσης σχετικά με το είδος της μεθόδου προσδιορισμού (όπως PCR), ο καρκίνος ταξινόμηση κλινικό στάδιο, PSA, το σκορ Gleason, αστάρια τοποθεσία, CpG θέση και την ακολουθία εκκινητές. Λεπτομέρειες συνοψίζονται στον Πίνακα 1, ο Πίνακας S2 και S3 Πίνακα. Πριν πραγματοποιήσαμε των αναλύσεων ευαισθησίας και ειδικότητας, συνοψίζονται τα δεδομένα μεθυλίωση περίπτωση και ελέγχου. Μεταξύ των περιελάμβανε μελέτες, δύο κατηγορίες ορίστηκαν ως μάρτυρες: κανονικοί έλεγχοι και οι ασθενείς οι οποίοι είχαν αρνητικές βιοψίες, αλλά είχε άλλες ασθένειες, συμπεριλαμβανομένων της καλοήθους υπερπλασίας του προστάτη (BPH). Μόνο βιοψία επιβεβαίωσε προστάτη και υψηλής ποιότητας προστατικής ενδοεπιθηλιακής νεοπλασίας (HGPIN) θεωρήθηκαν ως περιπτώσεις. Ως εκ τούτου, η πραγματική θετική (TP) δείγματα περιορίζονται σε εκείνες που είχαν μεθυλίωση στην περίπτωση του δείκτη, ενώ το ψευδώς αρνητικό (FN) ήταν έδειξε να μην έχει καμία μεθυλίωσης μεταξύ των δειγμάτων περίπτωση. Οι ίδιοι ορισμοί δόθηκαν για ψευδώς θετικά (FP) και αληθινό αρνητικό (ΤΝ) σε ελέγχους (Πίνακας S1).

Συγγραφέας

Χώρα

Έτος

Δείγμα

Μέθοδοι

υπόθεση

Έλεγχος

υπόθεση Met

υπόθεση Umet

Ελέγχου Met

Ελέγχου Umet

1.Hoque et alUSA2005UrineQMSPPCaBPH /OCD ή Normal

# 38 (73,1%) 1410 (11,0%) 812. Roupret et alFrance2007UrineQMSPPCaNormal

# 74 (77,9%) 213 (7,9%) 353.Bastian et alPortugal2008SerumMSPPCaNormal

# 3 (1,4%) 2070 (0) 354.Roupret et alUK2008BloodQMSPPCaBPH41 (97,6%) 15 (22,7%) 175 .Maruyama et alUSA2002TissueMSPPCaBPH /Κανονική * (7) 54 (53,5%) 475 (15,6%) 276.Kang et alKorea2004TissueMSPPCa /HGPINNormal

# 40 (78,4%) 110 (0) 207.Jeronimo et alPortugal2004TissueQMSPPCa /HGPINBPH117 (99,2% ) 128 (93,3%) 28.Yegnasubramanian et alUSA2004TissueQMSPPCaNormal * (12) 70 (95,9%) 30 (0) 259.Singal et alUSA2004TissueMSPPCaBPH40 (49,4%) 418 (19,0%) 3410.Woodson et alUSA2004TissueQMSPPCa /HGPINNormal * (11) 23 (67,6%) 110 (0) 1111.Florl et alGermany2004TissueMSPPCaNormal

# 88 (77,9%) 2519 (52,8%) 1712.Bastian et alGermany2005TissueQMSPPCaBPH36 (67,9%) 174 (28,6%) 1013.Cho et alKorea2007TissueMSPPCaBPH155 (86,6%) 247 (23,3%) 2314.Kawamoto et alJapan2007TissueMSPPCaBPH97 (74,0%) 3,412 (18,5%) 5315.Syeed et alIndia2010TissueMSPPCaBPH17 (34.0%) 337 (15.6%) 3816.Vasiljevic et alUK /China2011TissuePYROPCaBPH44 (91,7%) 42 (6,9%) 27Table 1. Χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση

BPH, Καλοήθης υπερπλασία προστάτη.? MSP, Methlation-Ειδικά PCR? QMSP, Ποσοτική πραγματικού χρόνου PCR μεθυλίωση Ειδικές? PYRO, Pyrosequencing? Met, μεθυλίωση? Umet, δεν μεθυλίωση? Προστάτη, τον καρκίνο του προστάτη? HGPIN, υψηλού βαθμού ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία Postatic? OCD, άλλη ασθένεια του καρκίνου? * Οι αριθμοί σε παρένθεση κάτω από τη στήλη ελέγχου δείχνει συμφωνημένα φυσιολογικούς ιστούς? # Υποδηλώνει φυσιολογικό προστατικό ιστό από τους ανθρώπους χωρίς ένδειξη καρκίνου του προστάτη. CSV Λήψη CSV

Μετα-ανάλυση και στατιστική ανάλυση.

αναλογία Αποδόσεις (OR) με το αντίστοιχο 95% CI χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει τις διαφορές στη συχνότητα της RASSF1A μεθυλίωσης μεταξύ περίπτωση του καρκίνου του προστάτη και των ελέγχων. Ομοίως, εξετάστηκαν επίσης η συσχέτιση μεταξύ RASSF1A μεθυλίωση και του καρκίνου του προστάτη παθολογική στάδιο, το σκορ Gleason, και τα επίπεδα PSA. Για να εκτιμηθεί η ετερογένεια μεταξύ των μελετών, ένα στατιστικό τεστ για την ετερογένεια εκτελέστηκε. Εάν οι μελέτες έδειξαν να είναι ομοιογενές με την P & gt? 0,05 για τα Q-στατιστικά στοιχεία, η περίληψη των OR υπολογίστηκε με ένα μοντέλο σταθερής αποτελέσματα, διαφορετικά, επιλέχθηκε ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων. Επιπλέον, στρωματοποιημένη αναλύσεις διεξήχθησαν επίσης με τα δείγματα και τις μεθόδους, μετα-παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκε για να μελετηθεί η πηγή ετερογένειας, και μια ανάλυση ευαισθησίας, με την οποία μία μελέτη στην μετα-ανάλυση διαγράφηκε κάθε φορά για να προσδιοριστεί η επίδραση του ατόμου σύνολο δεδομένων στη συνολική ομαδοποιήθηκαν OR, διεξήχθη για να αξιολογηθεί η σταθερότητα. Η πιθανή προκατάληψη δημοσίευση εξετάστηκε οπτικά με οικόπεδο χοάνη του log [OR] κατά το τυπικό σφάλμα της (SE), και ο βαθμός ασυμμετρίας ελέγχθηκε με δοκιμή Egger του. Τέλος, μια μέθοδος τελειώματα-and-γέμισμα χρησιμοποιήθηκε για να επιστήσει σταθερό συμπέρασμα. Αυτή η μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας το λογισμικό STATA 11.0. Όλες οι p-τιμές βασίζονται σε δύο όψεων και δοκιμές p & lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Η ευαισθησία και η ειδικότητα αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας τυχαία εφέ μοντέλα και σε αυτή την ανάλυση, τόσο οι υγρών και των ιστών υποομάδες υποβλήθηκαν σε επεξεργασία.. Αξιοποιήσαμε την περίληψη που λαμβάνουν λειτουργούν χαρακτηριστικό (S-ROC) καμπύλη, για να εκτιμηθεί κατά πόσον διακύμανση στον καθορισμό ορίου του θετικού αποτελέσματος που παράγεται σύνδεσης μεταξύ ευαισθησίας και ειδικότητας τιμές σε όλες τις μελέτες. Εκτίμηση της γραμμικής παλινδρόμησης του λόγου log-αποδόσεις από κάθε μελέτη σχετικά με το άθροισμα των logits των αληθινών θετικών και ψευδώς θετικά ποσοστά ενεργοποιημένη υπολογισμούς S-ROC. Όταν η παλινδρόμηση μεταξύ αυτών των ποσοτήτων ήταν μηδενική, εγκρίθηκε ένα ανεξάρτητο αναλύσεις συγκεντρωμένων ευαισθησία και ειδικότητα με τη χρήση τυποποιημένων μεθόδων για δυαδικά δεδομένα. Υπό αυτές τις συνθήκες, τα δεδομένα αναλύθηκαν από την λογαριθμική κλίμακα πιθανοτήτων (π.χ., για τις ιδιαιτερότητες, το μέγεθος της επίδρασης που χρησιμοποιήθηκε ήταν log (Spec /(1-Spec)). Όλες οι αναλύσεις έγιναν σε STATA 11.0.

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Μελέτη

Ένα σύνολο των 16 επιλέξιμων μελετών στις οποίες συμμετείχαν 1431 περιπτώσεις και 565 έλεγχοι περιλαμβάνονται στο συγκεντρωτικές αναλύσεις με βάση τα κριτήρια ένταξης μας [15-30]. Τα χαρακτηριστικά αυτών των μελετών συνοψίζονται στον πίνακα 1. μεταξύ των 16 μελέτες, 12 μελέτες χρησιμοποιήθηκαν δείγματα ιστού και 4 που χαρακτηρίζεται από τα σωματικά υγρά, όπως αίμα, ούρα μεταξύ άλλων. τα μεθυλιωμένα επίπεδα RASSF1A παρακολουθήθηκαν χρησιμοποιώντας είτε μεθυλίωσης ειδική PCR (MSP), ποσοτική μεθυλίωση ειδική PCR (QMSP) ή Pyrosequencing. Όλες οι περιπτώσεις ήταν από βιοψία επιβεβαίωσε προστάτη ή HGPIN, ενώ οι έλεγχοι περιορίζονται είτε σε καλοήθη υπερπλασία του προστάτη, υγιή άτομα ή σε εκείνους που είχαν ουροποιογεννητικού καρκίνο (καρκίνωμα της ουροδόχου κύστης), με μια υγιή προστάτη. Τα δείγματα από τις 11 μελέτες ήταν κυρίως από άτομα της καυκάσια φυλή, ενώ τέσσερις μελέτες που χαρακτηρίζεται δείγματα από ασιατικό πληθυσμό, μία μελέτη περιέλαβε άτομα από πολλές φυλές που προέρχονται από διαφορετικές ηπείρους. καρκίνοι του προστάτη επιβεβαιώθηκαν παθολογικά σε όλες τις μελέτες.

Σύνδεσης μεταξύ της μεθυλίωσης RASSF1A υποκινητή και παθολογικές στάδιο, το σκορ Gleason, και τα επίπεδα του PSA στον προστάτη περιπτώσεις

Σύμφωνα με το μοντέλο τυχαίων δράσεων, η συγκεντρωτική Ή του RASSF1A μεθυλίωσης σε περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη, σε σύγκριση με ελέγχους μη καρκινικών, ήταν 14,73 με 95% CI = 7,58 – 28,61 (Πίνακας 2). Στην στρωματοποιημένη ανάλυση δείγματος, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο συνδέθηκε με RASSF1A μεθυλίωση και στα δύο δείγματα υγρών (OR = 26,27, 95% CI = 7,79 – 88,61) και σε ιστούς (OR = 12,28, 95% CI = 5,86 – 25,76). Όπως στρωματοποιημένη ανάλυση με τη μέθοδο, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο βρέθηκε επίσης σε MSP (OR 6,75, 95% CI = 3,42 – 13,22) και QMSP (OR = 31,50, 95% CI = 10,95 – 90,62) (Εικόνα 1Α). Πραγματοποιήσαμε επίσης ανάλυση της σχέσης μεταξύ της παθολογικής στάδιο, το σκορ Gleason, και τα επίπεδα PSA μεταξύ των περιπτώσεων προστάτη και RASSF1A μεθυλίωσης. Επτά μελέτες [17,19,21-23,25,26] είχε επαρκείς πληροφορίες για να εκτελέσει αυτή την ανάλυση (Πίνακας S2), βρήκαμε καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ των ομάδων με τα κατάλληλα μοντέλα εκτός από το σκορ Gleason (OR = 2,35, 95% CI: 1,56 – 3,53, I

2 = 32,3%). Τα στοιχεία παρουσιάζονται στον Πίνακα 3.

μεταβλητές

p

α

OR (95% ΠΙ)

ετερογένεια Test (Ι

2, p-value)

RASSF1ATotal1614.73 (7,58 – 28,61) 75,5%, 0.000Sample TypeFluid426.27 (7,79 – 88,61) 56,6%, 0.075Tissue1212.28 (5,86 – 25,76) 75,5%, 0.000MethodQMSP731.50 (10,95 – 90,62) 61,8%, 0.015MSP86.75 ( 3,42 – 13,22) 67,9%, 0.003Pyrosequencing1148.50 (25,45 – 866,36) NATable 2. Διαστρωμάτωση αναλύσεις RASSF1A μεθυλίωσης και του κινδύνου καρκίνου του προστάτη

MSP, μεθυλίωσης-ειδική PCR.? QMSP, Ποσοτική πραγματικό χρόνο ειδικούς μεθυλίωσης PCR? Λόγος Ή, Αποδόσεις? CI, διάστημα εμπιστοσύνης?

Μια σειρά από μελέτες? NA, Δεν εφαρμόζεται. CSV Λήψη CSV

(Α) οικόπεδο Δάσος της 16ης μελέτες έδειξαν ότι RASSF1A μεθυλίωση σχετίζεται με προστάτη τον κίνδυνο, όπως στρωματοποιημένη ανάλυση με μεθόδους. (Β) οικόπεδο Δάσος μετά την ανάλυση ευαισθησίας αφαίρεση 6 μελέτες έδειξε τον ίδιο κίνδυνο, χωρίς ετερογένεια (p = 0,089). Το σύμβολο διαμάντι αντιπροσωπεύει την συνολική εκτίμηση από την μετα-ανάλυση και CI (διάστημα εμπιστοσύνης), ενώ το κέντρο του είναι τοποθετημένη στην τιμή για τη συνολική εκτίμηση αποτελέσματος. πλάτος διαμαντιού απεικονίζει το πλάτος της συνολικής CI.

Η Clinicopathology

Κατηγορία

OR (95% ΠΙ)

δοκιμή ετερογένεια (Ι

2, P-value)

Δημοσίευση δοκιμή προκατάληψη (P-value)

Gleason scoreGS≥72.35 (1,56 – 3,53) 32,3%, 0.1820.40GS & lt? 7PSA levelsPSA & gt? 4 2.19 (0,27 – 17,76) 67,4%, 0.0460.04PSA≤4Pathological stageⅢ & amp? ⅳ2.01 ( 0,77 έως 5,23) 68,4%, 0.0070.73Ⅰ & amp? ⅱTable 3. σύνδεσης μεταξύ μεθυλίωση RASSF1A υποκινητή και Παθολογικής στάδιο, το σκορ Gleason, και τα επίπεδα του PSA σε περιπτώσεις προστάτη

Ή, Λόγος Αποδόσεις.? CI, διάστημα εμπιστοσύνης? PSA, ειδικό προστατικό αντιγόνο? GS Gleason Score. CSV Λήψη CSV

Τα αποτελέσματα της μετα-παλινδρόμησης έδειξε ότι η τάση στο ΕΑΠ σχετίζεται με μεθόδους ανίχνευσης μεθυλίωσης, η οποία αντιπροσώπευε το μέρος της ετερογένειας (συντελεστής = -1,69, p = 0,024, προσαρμοσμένο R

2 = 47.41% ), όμως, άλλοι παράγοντες, όπως τα είδη του δείγματος (p = 0,525), έτος δημοσίευσης (p = 0,608), και την προέλευση των ασθενών (p = 0,847) δεν θα μπορούσε να εξηγήσει την ετερογένεια. Πραγματοποιήσαμε επίσης αναλύσεις ευαισθησίας για τον προσδιορισμό των επιπτώσεων της παραλείποντας μια ενιαία μελέτη σχετικά με το συνολικό αποτέλεσμα όπου έξι ανεξάρτητες μελέτες βρέθηκαν να εισάγουν κάποια πηγή ετερογένειας. Ως εκ τούτου, όταν αποκλείσαμε τις έξι μελέτες που θα ήταν πιθανό να εισάγουν μεγάλη ετερογένεια οφείλεται σε διαφορετικούς τύπους περιπτώσεων και ελέγχων, παρατηρήσαμε μια μείωση στην ετερογένεια (p = 0,089) με σταθερό συμπέρασμα (OR = 14,45, 95% CI = 8,35 – 25,01) ( . Εικόνα 1Β)

Εμείς δεν τήρησε καμία προκατάληψη δημοσίευση (δοκιμή Egger του? p = 0,066), και επιβεβαίωσε περαιτέρω αυτή την παρατήρηση με την εφαρμογή μιας μεθόδου τελειώματα-and-γέμισμα. Η μετα-ανάλυση, με ή χωρίς τη μέθοδο τελειώματα-and-γέμισμα δεν άντλησε διαφορετικά συμπεράσματα, υποδεικνύοντας ότι τα αποτελέσματά μας ήταν στατιστικά ισχυρή. δοκιμή του Egger πρότεινε την απουσία προκατάληψης δημοσίευση (P & gt?. 0 05). σε μελέτες συσχέτισης RASSF1A μεθυλίωση και παθολογικών στάδιο ή σκορ Gleason (Πίνακας 3)

Η ειδικότητα και η ευαισθησία της μεθυλίωσης RASSF1A υποστηρικτής τη χρήση διαφορετικών τύπων των δειγμάτων

η συγκεντρωτική ειδικότητα για όλους τους περιλαμβάνονται μελέτες ήταν 0,87 (95% CI: 0,72 – 0,94), και η συγκεντρωτική ευαισθησία ήταν 0,76 (95% CI: 0,55 – 0,89). Για την παραδοσιακή βιοδεικτών, η ευαισθησία του PSA ποικίλει, αλλά η εξειδίκευση ήταν γενικά χαμηλή σε περίπου 20%, που πρότεινε ότι η δοκιμή RASSF1A μεθυλίωση έχει πολύ υψηλότερη εξειδίκευση από την εξέταση PSA. Η τιμή p για ετερογένεια ήταν & lt? 0.001, υποδεικνύοντας μια σημαντική ετερογένεια. Δεν υπήρξε καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης (p = 0,13). Επιπλέον, όλα τα δείγματα ταξινομούνται σε δύο ομάδες σύμφωνα με τον τύπο δείγματος (υγρό /ιστού). Μεταξύ των υγρών μελέτες (ούρων /αίματος /πλάσματος), η συγκεντρωτική ευαισθησία και η ειδικότητα ήταν 0,60 (95% CI: 0,08 – 0,96) και 0,93 (95% CI: 0,75 – 0,98), αντίστοιχα. Για τις μελέτες των ιστών, ο ομαδοποιήθηκαν ευαισθησία και η ειδικότητα ήταν 0,79 (95% CI: 0,64 – 0,89) και 0,84 (95% CI: 0,63 – 0,94), αντίστοιχα, και η καμπύλη S-ROC παρουσιάζεται στο Σχήμα 2.

SENS: Ευαισθησία, SPEC: Εξειδίκευση, AUC:. η περιοχή κάτω από την καμπύλη

η

Συζήτηση

Τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση έδειξε ότι RASSF1A μεθυλίωση στον καρκίνο του προστάτη σχετίζεται σημαντικά με τον κίνδυνο καρκίνου όταν παρακολουθείται σε δείγματα ούρων, αίματος ή ιστού. Ήταν, επίσης, σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο για υψηλή βαθμολογία Gleason. Το συγκεντρωμένο ειδικότητα (0,87) του RASSF1A ήταν πολύ υψηλότερη από την εξειδίκευση του PSA (20%). Επιπλέον, η εξειδίκευση σε κάθε υποομάδα ανά τύπο δείγματος παρέμεινε πάνω από 0,84 και η ευαισθησία των RASSF1A επίσης παρέμεινε ψηλά πάνω από 0,60. Αυτά τα αποτελέσματα πρότειναν ότι η μεθυλίωση RASSF1A υποκινητής θα ήταν ένας πολύτιμος βιοδείκτης στη διάγνωση PCa.

μεθυλίωση του DNA είναι ένας κοινός μηχανισμός για την απενεργοποίηση των γονιδίων καταστολής όγκων σε καρκίνους [10]. Παρακολούθηση παρεκκλίνουσα προτύπων μεθυλίωσης έχουν βοηθήσει στην ανίχνευση των καρκινικών κυττάρων σε κλινικά δείγματα, όπως βιοψίες ιστών ή σωματικών υγρών. RASSF1A είναι ένα υποθετικό ογκοκατασταλτικό γονίδιο και παίζει σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση των διαφόρων τύπων ανθρώπινων όγκων. Προηγούμενες εκθέσεις έδειξαν ότι η γενετική παραλλαγή του RASSF1A επηρεάζουν προστάτη ευαισθησίας στον καρκίνο και τη συχνότητα των RASSF1A μεθυλίωσης βρέθηκε να είναι σημαντικά υψηλότερη στην ομάδα των ασθενών σε σύγκριση με τον έλεγχο [13]. Για την περαιτέρω επιβεβαίωση RASSF1A υποστηρικτής κατάσταση μεθυλίωσης στη διάγνωση προστάτη ασθενούς, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση 16 μελετών στις οποίες συμμετείχαν 1431 περιπτώσεις και 565 έλεγχοι να αντλήσει μια ακριβέστερη εκτίμηση του συλλόγου. Τα αποτελέσματά μας πρότεινε ότι RASSF1A μεθυλίωση είναι ένας πιθανός παράγοντας κινδύνου για την PCA όπως ανιχνεύεται τόσο σε σωματικό υγρό και τους ιστούς. Η συχνότητα των RASSF1A μεθυλίωσης σε περιπτώσεις PCa ήταν 14,73 φορές υψηλότερο από ότι σε άτομα ελέγχου. Επιπλέον, λόγω των διαφορών μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων μεταξύ των μελετών, πραγματοποιήσαμε αναλύσεις ευαισθησίας και να αφαιρεθεί επιλέξτε μελέτες για να κάνει τα δεδομένα πιο ομοιογενής και παρατηρείται καμία σημαντική αλλαγή στο συμπέρασμά μας. Είναι σημαντικό ότι, η συχνή μεθυλίωση του γονιδίου RASSF1A έδειξε σημαντικές συσχετίσεις με το σκορ Gleason, αν και δεν συσχετίζονται με παθολογικά επίπεδα στάδιο ή PSA σε αυτή τη μελέτη.

Όπως φαίνεται στο παρελθόν, η εξέταση PSA είχε ποικίλες ευαισθησία και την κακή ειδικότητα (περίπου 20%) [1]. Δοκιμές που παρέχουν υψηλότερη ειδικότητα και όχι η ευαισθησία και να συμπληρώσει τη δοκιμή PSA είναι η τρέχουσα απαίτηση. Ελπιδοφόρα, τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι, δοκιμές RASSF1A μεθυλίωση έχει τη δυνατότητα να συμπληρώσει έλεγχο PSA λόγω της υψηλής ειδικότητας του. Εδώ πιστεύουμε ότι ένα διαδοχικό μοντέλο δοκιμών θα είναι πιο χρήσιμη όταν εξέταση PSA θα χρησιμοποιηθεί αρχικά για τον εντοπισμό ασθενών με αυξημένα επίπεδα PSA, που ακολουθείται από τη δοκιμασία μεθυλίωσης RASSF1A να αυξήσει αλήθεια θετικότητα. Οι ασθενείς με αρνητική δοκιμή RASSF1A μπορεί να τοποθετηθεί σε άγρυπνο αναμονής, ενώ τα άτομα με θετικά αποτελέσματα μπορούν να συνιστώνται για βιοψίες. Έτσι διαδοχικών δοκιμών θα μειώσει σημαντικά τις περιττές βιοψία συστάσεις βασίζονται αποκλειστικά στην εξέταση PSA.

Η παρούσα μελέτη έχει αρκετούς περιορισμούς. Πρώτον, η ετερογένεια των μεθόδων που χρησιμοποιούνται όπως MSP, Q-MSP και Pyrosequencing να παρακολουθεί μεθυλίωση προαγωγού γονιδίου. Με βάση τις μελέτες που διεξάγονται, θα είναι χρήσιμο εάν συναίνεση θα μπορούσε να φτάσει για μια τυπική δοκιμή. Τα αλληλουχίας τεχνικές βασίζονται γενικά θεωρείται ότι έχουν ανώτερη απόδοση σε σύγκριση με τις μεθοδολογίες που χρησιμοποιούν μόνο του PCR. Η ραγδαία κερδίζει έδαφος στη χρήση αλληλούχισης επόμενης γενιάς δοκιμασίες (NGS) για την παρακολούθηση της γονιδιωματικής και Γενετικής αλλαγές σίγουρα θα οδηγήσει σε εξελίξεις στον τομέα αυτό [31]. Κάποιος μπορεί να προβλέψει ανάπτυξη ολοκληρωμένων διαγνωστικών τεστ που θα μετρήσει ταυτόχρονα έκφραση μεταγράφου και μεθυλίωσης του DNA αλλαγές ενός πάνελ βιοδεικτών εκτός από τον εντοπισμό γενετικών ανωμαλιών όπως συντήξεις γονιδίου και παραλλαγές αριθμού αντιγράφων για κάθε ασθενή [32]. Η παρούσα μελέτη, μαζί με άλλους βοηθά στην προεπιλογή που βιοδείκτες μεγάλες δυνατότητες που θα πρέπει να δοθεί ιδιαίτερη προσοχή κατά την ανάλυση NGS αποτελέσματα που συνήθως παράγει ένα μακρύ κατάλογο των μεθυλιωμένο περιοχές. Στη συνέχεια, οι διαφορετικές τύπους δειγμάτων χρησιμοποιούνται σε αυτές τις μελέτες οι οποίες περιλαμβάνουν πλάσμα, ορός, ούρα, πλήρες αίμα και τους ιστούς είναι μια πιθανή πηγή ετερογένειας. Εδώ και πάλι την ανάπτυξη της υψηλής απόδοσης ισχυρό δοκιμασίες με υψηλή ευαισθησία και ειδικότητα μπορεί να βοηθήσει να ξεπεραστεί αυτό στο εγγύς μέλλον.

Συμπέρασμα

Αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι RASSF1A μεθυλίωση στον καρκίνο του προστάτη που σχετίζεται με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε διαφορετικούς πληθυσμούς μελέτης. RASSF1A είναι μια πολλά υποσχόμενη βιοδείκτης για τη διαλογή και τον εντοπισμό του προστάτη ειδικά όταν συνδυάζεται με την εξέταση PSA για να μειωθεί το ποσοστό των μη απαραίτητων βιοψιών. Μελλοντικές μελέτες με μεγαλύτερο δείγμα κοόρτης και νέες δοκιμασίες που βασίζονται σε προσεγγίσεις αλληλουχίας επόμενη γενιά θα συμβάλει στην περαιτέρω ενίσχυση παρατηρήσεις μας.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

Χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση.

doi: 10.1371 /journal.pone.0075283.s001

(XLSX)

Πίνακας S2.

Λεπτομέρειες των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση: σύνδεσης μεταξύ μεθυλίωση RASSF1A υποκινητή και παθολογικές στάδιο, το σκορ Gleason, και τα επίπεδα PSA.

doi: 10.1371 /journal.pone.0075283.s002

(XLSX)

Πίνακα S3.

Περίληψη των αλληλουχιών εκκινητών που χρησιμοποιούνται στη μελέτη της μεθυλίωσης του RASSF1A.

doi: 10.1371 /journal.pone.0075283.s003

(XLSX)

Ευχαριστίες

Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε τον Δρ Srinivasan Yegnasubramanian (Johns Hopkins University) για την παροχή των σχετικών ανεπεξέργαστα δεδομένα και ο Δρ Mohan Saravana Dhanasekaran (University of Michigan) για συζήτηση και προετοιμασία του χειρογράφου.