Αφηρημένο

Ιστορικό

TP53

γονίδιο είναι ένα από τα πιο σημαντικά ογκοκατασταλτικά γονίδια. Αναλάβαμε αυτή την μετα-ανάλυση για να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του δέρματος, κυρίως σε Καυκάσιους.

Μέθοδοι

Ψάξαμε PubMed για την περίπτωση ελέγχου μελέτες που δημοσιεύθηκαν έως τον Μάρτιο του 2013. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 5276 περιπτώσεων καρκίνου του δέρματος και συμπεριλήφθηκαν 5315 μάρτυρες από 20 μελέτες. Συνολικά, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ του

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και τον καρκίνο του δέρματος παρατηρήθηκε σε όλα τα μοντέλα της γενετικής αντίθεσης (Pro /Pro έναντι Arg /Arg, Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro έναντι Arg /Arg + Pro /Arg, Pro αλληλόμορφο έναντι Arg αλληλόμορφο). Παρόμοια αποτελέσματα ελήφθησαν στην στρωματοποιημένη ανάλυση με την εθνικότητα και ιστολογικών τύπων καρκίνου του δέρματος, όπως μελάνωμα, καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων και βασικοκυτταρικό καρκίνωμα. υπολογισμοί ρεύματος που υποδεικνύεται ότι ορισμένες μελέτες ήταν μικρής ισχύος. Δεν προκατάληψη δημοσίευση βρέθηκε με τη χρήση του οικοπέδου χωνί και δοκιμή Egger του.

Συμπεράσματα

Αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμός είχε πιθανώς λίγο συσχέτιση με την ευαισθησία του καρκίνου του δέρματος κυρίως στους Καυκάσιους. Ωστόσο, οι μεγαλύτερες μελέτες δείγμα μεγέθους που απαιτείται για την επαλήθευση της σύναψης τόσο χαμηλά στατιστικά δυνάμεις

Παράθεση:. Ye J, Li XF, Wang YD, Yuan Υ (2013) Arg72Pro Πολυμορφισμός του

TP53

Gene και ο κίνδυνος καρκίνου του δέρματος: μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (11): e79983. doi: 10.1371 /journal.pone.0079983

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: τέταρτης Μαΐου, 2013? Αποδεκτές: 27 Σεπτέμβρη, 2013? Δημοσιεύθηκε: 8 Νοεμβρίου 2013

Copyright: © 2013 Ye et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Σύμφωνα με την επιδημιολογία, καρκίνο του δέρματος συμπεριλαμβανομένου του μελανώματος και μη. -melanoma είναι ο πιο κοινός τύπος καρκίνου σε λευκό πληθυσμούς [1]. Οι στατιστικές δείχνουν ότι η συχνότητα εμφάνισης καρκίνου του δέρματος έχει αυξηθεί στην Ευρώπη και τις ΗΠΑ, ιδιαίτερα μελάνωμα, τις δύο τελευταίες δεκαετίες [2,3]. Ο καρκίνος του δέρματος έχει αρκετές ιστολογικές υποτύπους, συμπεριλαμβανομένου του μελανώματος, πλακώδες καρκίνωμα (SCC) και καρκίνωμα βασικών κυττάρων (BCC) [4]. Πολλές μελέτες δείχνουν ότι η υπεριώδης (UV) η έκθεση είναι ένας σημαντικός παράγοντας κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνου του δέρματος [5-7]. Ωστόσο, σε μοριακό επίπεδο, η καρκινογόνος μηχανισμός της UV δεν έχει ανέπτυξε ακόμη.

TP53

γονίδιο είναι ένα ογκοκατασταλτικό γονίδιο, το οποίο μπορεί να ρυθμίσει τη διακοπή του κυτταρικού κύκλου, την κυτταρική απόπτωση και επιδιόρθωση του DNA [8]. Ως εκ τούτου, καλείται φύλακας του γονιδιώματος. Μεταλλάξεις του

ΤΡ53

γονίδιο είναι η πιο κοινή γενετική ανωμαλία που βρέθηκαν σε πολλά είδη καρκίνων του ανθρώπου, όπως ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του παχέος εντέρου, γαστρικό καρκίνο, καρκίνο του δέρματος, et al [9]. Arg72Pro πολυμορφισμός του

ΤΡ53

γονίδιο είναι ένα μεταστροφής G-C στο κωδικόνιο 72, με αποτέλεσμα μια αλλαγή αμινοξέος από αργινίνη (Arg) έως προλίνη (Pro) [10]. Μελέτες έχουν δείξει ότι

ΤΡ53

γονίδιο παίζει σημαντικό ρόλο στην κυτταρική προστασία από την υπεριώδη γονιδίωμα έκθεση [11,12]. Αλλά η λεπτομερής μοριακός μηχανισμός δεν είναι σαφής.

Πολλές μελέτες τα τελευταία χρόνια έχουν ερευνήσει τη σχέση μεταξύ

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του δέρματος, αλλά τα αποτελέσματά τους παραμένουν ασαφή. Έτσι, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση όλων των μελετών που είναι επιλέξιμες ασθενών-μαρτύρων που έχουν δημοσιευθεί για να μας βοηθήσει για την καλύτερη κατανόηση της επίδρασης των

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό.

Μέθοδοι

Αναζήτηση Δημοσίευση

Ψάξαμε PubMed για τις δημοσιεύσεις μέχρι το Μάρτιο του 2013, χρησιμοποιώντας τους όρους «TP53,» «πολυμορφισμός» και «τον καρκίνο του δέρματος.» Η έρευνα διεξήχθη χωρίς περιορισμούς όσον αφορά τη γλώσσα. Εκτός αυτού, ψάξαμε τις λίστες αναφοράς για τις αξιολογήσεις και να ανακτηθεί άρθρα χειροκίνητα. Όταν το ίδιο πληθυσμό ασθενών εμφανίστηκε σε πολλά άρθρα, εμείς επιλέξαμε το μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος ή την πιο πρόσφατη

Κριτήρια Ένταξης

Οι επιλεγμένες μελέτες πρέπει να έχουν εκπληρώσει τα ακόλουθα κύρια κριτήρια: (1). καλά σχεδιασμένες μελέτες ασθενών-μαρτύρων για την αξιολόγηση

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και ο κίνδυνος καρκίνου του δέρματος? (2) καρκίνος του δέρματος διαγνώστηκε με παθολογία? (3) που περιέχει χρήσιμες συχνότητες γονοτύπου? και (4) η κατανομή των γονότυπων μεταξύ των ελέγχων ήταν σε ισορροπία Hardy-Weinberg

Κριτήρια αποκλεισμού

Τα κριτήρια αποκλεισμού περιλαμβάνονται:. (1) ο γονότυπος συχνότητες ή ο αριθμός δεν παρουσιάζονται? (2) μελέτες σε ζώα, σχόλια, αναφορές περιστατικών, περιλήψεις και μελέτες που βασίζονται στην οικογένεια? (3) η επανάληψη της προηγούμενης δημοσίευσης.

Data Extraction

Δύο ερευνητές πληροφορίες που προκύπτουν από επιλέξιμες μελέτες ανεξάρτητα, σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού παραπάνω. Οι διαφωνίες επιλύθηκαν από τη συζήτηση ή από τρίτο ερευνητή. Οι παρακάτω πληροφορίες συλλέχθηκαν: πρώτο συγγραφείς, το έτος δημοσίευσης, την εθνικότητα, τα χαρακτηριστικά των περιπτώσεων και των ελέγχων (μέση ηλικία, η κατανομή των δύο φύλων), ιστολογικό τύπο των περιπτώσεων, η μέθοδος προσδιορισμού του γονότυπου, ο αριθμός των γονοτύπων και ο συνολικός αριθμός των υποθέσεων και των ελέγχων.

Στο έγγραφο της RIZZATO et al η μη κωδικοποίησης σκέλος έχει ο γονότυπος, έτσι ώστε να αναστρέφεται τους γονότυπους του στο χαρτί.

Στατιστική Ανάλυση

Η δύναμη της σχέσης μεταξύ

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και ο κίνδυνος καρκίνου του δέρματος αξιολογήθηκε από συγκεντρωτικά αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ). Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ για το κυρίαρχο μοντέλο (Arg /Arg + Pro /Arg έναντι Pro /Pro), υπολειπόμενο μοντέλο (Arg /Arg έναντι Arg /Pro + Pro /Pro), συνεπικρατούν μοντέλο (Arg /Arg έναντι Pro /Pro και Arg /Pro έναντι Pro /Pro) και η αντίθεση αλληλόμορφο (Pro αλληλόμορφο έναντι Arg αλληλόμορφο) υπολογίστηκαν, αντίστοιχα. Στρωματοποιημένη αναλύσεις διεξήχθησαν από την εθνικότητα και το ιστολογικό τύπο καρκίνου του δέρματος. Η υπόθεση ετερογένεια εκτιμήθηκε από την Q-τεστ Chi-square-βάση. Αν P CI, διάστημα εμπιστοσύνης? n, ο αριθμός των μελετών ασθενών-μαρτύρων? P

Ή, Ρ αξία των Ζ-δοκιμή? P

H, P τιμή για ετερογένεια αναλύσεις? BCC, καρκίνωμα βασικών κυττάρων? SCC, καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων. CSV CSV Κατεβάστε

Η

Η

Στο στρωματοποιημένη ανάλυση από ιστολογικών τύπων καρκίνου του δέρματος, δεν υπήρχε καμία ένδειξη μιας σημαντική συσχέτιση μεταξύ του κωδικονίου 72 του πολυμορφισμού του

TP53

γονίδιο και ο κίνδυνος μελανώματος, SCC και BCC. Παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα. Διαφορετική από τις άλλες υποομάδες, οι υπολογισμοί εξουσία στα μοντέλα γονίδιο SCC ήταν όλα πάνω από το 80%, η οποία αποκάλυψε επαρκή μεγέθη δειγμάτων (Πίνακας 2).

Δημοσίευση Bias

Η προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκε με Begg του οικόπεδο χωνί και δοκιμή Egger του. Το σχήμα των αγροτεμαχίων χοάνη φάνηκε συμμετρικές και τα αποτελέσματα των δοκιμών Egger δεν ήταν σημαντική σε όλα τα γενετικά μοντέλα (Pro /Pro έναντι Arg /Arg, Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro έναντι Arg /Arg + Pro /Arg, Pro αλληλόμορφο έναντι Arg αλληλόμορφο), η οποία δεν έδειξε προκατάληψη δημοσίευση. Το σχήμα 6 δείχνει χοάνη οικόπεδο Begg της συνολικής Pro /Pro έναντι Arg /Arg. Στις στρωματοποιημένη αναλύσεις από την εθνικότητα και ιστολογικών τύπων, ούτε οικόπεδο χοάνη Begg ούτε τεστ Egger παρουσίασε καμία προφανή ένδειξη σφάλματος εκ της δημοσίευσης (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν καμία προκατάληψη δημοσίευση μας μετα-ανάλυση.

Η

Συζήτηση

TP53

ογκοκατασταλτικό γονίδιο παίζει σημαντικό ρόλο στη σύλληψη του κυτταρικού κύκλου και την ενεργοποίηση του προγραμματισμένο κυτταρικό θάνατο [8,36]. Μεταλλάξεις του

ΤΡ53

γονιδίου έχουν ανιχνευθεί σε 50% όλων των ανθρώπινων καρκίνων και σε όλες σχεδόν τις καρκινώματα του δέρματος [37]. Μελέτες έχουν αποδείξει ότι η απενεργοποίηση του

TP53

γονίδιο περιλαμβάνει την επαγωγή καρκίνου του δέρματος από την υπεριώδη ακτινοβολία [11,12,38]. Η πιο κοινή πολυμορφισμός του

ΤΡ53

γονίδιο τοποθετεί στο κωδικόνιο 72, η οποία είναι μια μεταστροφή G-C, προκαλώντας μια αλλαγή αμινοξέος από αργινίνη (Arg) έως προλίνη (Pro) [10]. Οι λειτουργίες των δύο πολυμορφικών παραλλαγών του

TP53

γονίδιο είναι διαφορετικά. Σύμφωνα με τη μελέτη που διεξήχθη από Dumont et al, η Arg72 παραλλαγή επάγει κυτταρική απόπτωση αισθητά καλύτερη από ό, τι η παραλλαγή Pro72 κάνει [39]. Πρόσφατα, πολλές μελέτες έχουν διερευνήσει τη σχέση μεταξύ

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και την ευαισθησία του καρκίνου του δέρματος, αλλά τα συμπεράσματά τους είναι αντιφατικές. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση για να διερευνήσει περαιτέρω την επίδραση του

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμού σχετικά με την ανάπτυξη του καρκίνου του δέρματος.

Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμό και ο κίνδυνος καρκίνου του δέρματος σε οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο (Pro /Pro έναντι Arg /Arg, Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg έναντι Arg /Arg, Pro /Pro έναντι Arg /Arg + Pro /Arg). Στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα και ιστολογικών τύπων καρκίνου του δέρματος, δεν υπήρχε καμία ένδειξη μιας σημαντικής σύνδεσης, ούτε. Τα αποτελέσματά μας ήταν παρόμοια με τη μετα-ανάλυση που πραγματοποιήθηκε από τον Jiang το 2011 [40].

Ωστόσο, τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση θα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή. Εκτός SCC υποομάδα, οι περισσότεροι από τους υπολογισμούς εξουσίας επί των συγκεντρωμένων συχνότητες ήταν χαμηλότερες από το 80%, η οποία αποδεικνύεται ανεπαρκής μεγέθη δείγματος.

Αυτή η μετα-ανάλυση είχε επίσης κάποιους περιορισμούς. Κατ ‘αρχάς, δεδομένου ότι μόνο είκοσι μελέτες συμπεριλήφθηκαν, προκατάληψη δημοσίευση θα μπορούσε δυνητικά έξοδο, ακόμα κι αν προσπαθήσαμε να βρούμε όσες μελέτες, όπως θα μπορούσαμε, αξιολόγησε προσεκτικά την λογοτεχνία και χρησιμοποιούνται στατιστικές μέθοδοι για την ελαχιστοποίηση του σφάλματος εκ της δημοσίευσης, και καμία στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση ήταν που παρατηρείται σε αυτή την μετα-ανάλυση. Δεύτερον, στις στρωματοποιημένη αναλύσεις από εθνικότητα, οι περισσότερες μελέτες διεξήχθησαν σε Καυκάσιους, καθώς και πληροφορίες σχετικά με άλλες εθνότητες, όπως οι χώρες της Αφρικής, ήταν ανεπαρκής. Έτσι, οι περισσότερες μελέτες με μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος και υψηλής ποιότητας, ειδικά για μη-Καυκάσιους πληθυσμούς που απαιτούνται για να αποδείξουν τα συμπεράσματά μας για το μέλλον. Τέλος, η μελέτη ασθενών-μαρτύρων ανήκει σε αναδρομικές έρευνες που έχει μεθοδολογικές ελλείψεις.

Παρά τους περιορισμούς, αυτό το μετα-ανάλυση έδειξε ότι

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμός είχε πιθανώς λίγο συσχέτιση με τον κίνδυνο του δέρματος καρκίνο, κυρίως σε Καυκάσιους. Παρ ‘όλα αυτά, εξακολουθεί να είναι αναγκαία η διεξαγωγή μελετών μεγαλύτερο μέγεθος και καλύτερα-σχεδιαστεί για να εξερευνήσουν

TP53

Arg72Pro πολυμορφισμού ως χαμηλή στατιστική δυνάμεις.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1. διάγραμμα ροής

της βιβλιογραφίας.

doi: 10.1371 /journal.pone.0079983.s001

(DOC)

Λίστα ελέγχου S1. Λίστα ελέγχου

PRISMA.

doi: 10.1371 /journal.pone.0079983.s002

(DOC)