Αφηρημένο

Ιστορικό

επισκευής εκτομή cross-δωρεάν ομάδας 1 (ERCC1) είναι ένα βασικό συστατικό του συστήματος επιδιόρθωσης νουκλεοτιδίων εκτομή η οποία είναι υπεύθυνη για την επισκευή του κατεστραμμένου DNA. Λειτουργική γενετικές παραλλαγές στο

ERCC1

γονίδιο μπορεί να μεταβάλλει την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και διαμορφώνουν τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Οι υποθετικές ρόλοι του

ERCC1

πολυμορφισμών του γονιδίου της ευαισθησίας του καρκίνου του πνεύμονα έχουν ευρέως ερευνηθεί. Ωστόσο, τα αποτελέσματα παραμένουν αμφιλεγόμενα

Στόχοι

Ένα ενημερωμένο μετα-ανάλυση διεξήχθη για να διερευνήσει κατά πόσον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα θα μπορούσε να αποδοθεί με το ακόλουθο

ERCC1

πολυμορφισμοί:. Rs11615 ( T app = snpexp), αντίστοιχα. Αυτοί οι πόροι διευκολύνουν τους ερευνητές για να προσδιοριστεί η συσχέτιση των γονοτύπων HapMap σε μία γονιδιωματική περιοχή των επιπέδων έκφρασης ενδιαφέροντος και γονίδιο [9]. Η διεθνής φάση HapMap (ΙΙ + ΙΙΙ) απελευθέρωση # 28 δεδομένων που περιέχουν δεδομένα γονότυπου 3960000 πολυμορφισμών για 270 άτομα από τέσσερις σε όλο τον κόσμο πληθυσμούς [CEU: 90 Γιούτα κάτοικοι με καταγωγή από τη βόρεια και δυτική Ευρώπη? CHB: 45 άσχετες Κινέζων Χαν στο Πεκίνο? JPT: 45 άσχετες Ιάπωνες στο Τόκιο? YRI: 90 Γιορούμπα σε Ibadan, Νιγηρία] [10]. Τα στοιχεία έκφρασης mRNA ελήφθησαν από τις ίδιες 270 άτομα. (Gene Expression παραλλαγή, http:. //www.sanger Ac.uk/resources/software/genevar/)

Στατιστικές Μέθοδοι

αργού αναλογία πιθανοτήτων (OR) με 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) χρησιμοποιήθηκαν για να αποκτήσετε πρόσβαση στην σχέση μεταξύ κάθε ένα από τα πέντε

ERCC1

πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Γράμματα V και W εκπροσωπούνται παραλλαγή και άγρια ​​αλληλόμορφα κάθε πολυμορφισμού. Διαφορετικά γενετικά μοντέλα εγκρίθηκαν κατά τη διάρκεια της εκτίμησης του κινδύνου: ομόζυγη (VV εναντίον WW), ετερόζυγη (WV εναντίον WW), υπολειπόμενο (VV εναντίον WV /WW), και κυρίαρχη (VV /WV εναντίον WW) μοντέλο. Μια chi-square-based

Q

-test χρησιμοποιήθηκε για να ελέγξετε την παραδοχή ετερογένεια. Ένα

P-

αξία & gt? 0,10 για τη δοκιμή Q πρότεινε την απουσία της ετερογένειας μεταξύ των μελετών, και στη συνέχεια το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (η μέθοδος Mantel-Haenszel) [11] θα πρέπει να εγκριθεί? Αλλιώς, το μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Dersimonian και Laird) [12] θα πρέπει να εκτελεστούν. Το Z-test χρησιμοποιήθηκε για να προσδιοριστεί η σημασία του ομαδοποιημένου OR. Το οικόπεδο χοάνη δημιουργήθηκε για να δοκιμάσει προκατάληψη δημοσίευση. Εν συντομία, το πρότυπο σφάλμα του log (OR) της κάθε έρευνας σχεδιάστηκε έναντι log της (OR), και η ασυμμετρία του οικοπέδου χοάνης εκτιμήθηκε με τη μέθοδο δοκιμής γραμμικής παλινδρόμησης Egger [13]. Επιπλέον, η ανάλυση ευαισθησίας χρησιμοποιείται για τον προσδιορισμό της σταθερότητας του αποτελέσματος, δηλαδή, ένα άτομο της μελέτης αποκλείστηκε σε μια στιγμή, και στη συνέχεια οι εκτιμήσεις κινδύνου υπολογίστηκαν εκ νέου για να εξετάσει την επίδραση της ενιαίας μελέτης σχετικά με τις συγκεντρωμένων ΕΑΠ. Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) στην ομάδα ελέγχου για κάθε

ERCC1

πολυμορφισμό ελέγχθηκε με το τεστ chi-square καλοσύνη-of-fit της κατά Pearson. t test και ανάλυση των δοκιμών διακύμανσης του Student χρησιμοποιήθηκαν για να αξιολογηθούν οι διαφορές στα σχετικά επίπεδα έκφρασης του mRNA μεταξύ των διαφορετικών ομάδων γονότυπο. Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση STATA έκδοση 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX) και SAS έκδοση 9.1 (SAS Institute, Cary, NC). Όλες οι στατιστικές αναλύσεις ήταν διπλής όψης, και

P

& lt?. 0.05 θεωρήθηκε σημαντική

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των μελετών

αναζήτηση Λογοτεχνία αρχικά παράγονται 129 άρθρα. Μετά την εξέταση και αναθεώρηση άρθρα για την επιλεξιμότητα της μελέτης, 113 άρθρα αποκλείστηκαν λόγω αναθεώρηση άρθρα ή μελέτες μη-μαρτύρων, επικαλύπτονται οι συμμετέχοντες, μη υποβολή στοιχείων διανομής γονότυπο, και για άλλους λόγους που περιγράφηκε προηγουμένως [14] (Σχήμα 1). Για παράδειγμα, μεταξύ των 15 μελετών σχετικά με

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμός [4], [15] – [28]., 5 αναφέρθηκαν από Yin JY

et al

[18], [25 ] – [28], στην οποία τα δείγματα συλλέχθηκαν στο ίδιο ινστιτούτο, Λιαονίνγκ Αντικαρκινικό Νοσοκομείο. Ένας από αυτούς [25] δεν ήταν μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων και έτσι αποκλείστηκε. Προκειμένου να αποφευχθεί η επανάληψη της δειγματοληψίας, επιλέξαμε ένα [18] από το υπόλοιπο των 4 μελετών [18], [26] – [28], η οποία έχει το μεγαλύτερο μέγεθος του δείγματος και επίσης δημοσιεύθηκε πιο πρόσφατα. Τελικά, 16 μελέτες [4], [5], [15] – [24], [28] – [31] με 10.106 περιπτώσεις και 13.238 έλεγχοι επιλέχθηκαν για αυτή την μετα-ανάλυση (Σχήμα 1). Από τα προκύπτοντα 16 μελέτες, 9 διεξήχθησαν σε κινεζικού πληθυσμού, και 7 σε Καυκάσιο πληθυσμό. Όλες οι μελέτες ανέφεραν τη σχέση μεταξύ ενός τουλάχιστον

ERCC1

πολυμορφισμό του ενδιαφέροντος και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα. Μελέτες, την επιθεώρηση των ενώσεων μεταξύ πολλών

γενετικές παραλλαγές και τον καρκίνο του πνεύμονα ERCC1

κίνδυνο χωρίστηκαν σε διάφορες υπο-μελέτες, καθένα από τα οποία περιλάμβανε την ανάλυση ενός ενιαίου πολυμορφισμό. Γονοτυπική σε αυτές τις 16 μελέτες που διεξήχθη μέσω διαφορετικών μεθόδων, οι λεπτομέρειες των οποίων παρατίθενται στον Πίνακα 1. Συνολικά, η παρούσα μετα-ανάλυση που περιέχεται 11 μελέτες για rs11615 [4], [15] – [24], 6 για rs3212986 [4] , [15], [16], [20], [22], [31], 4 για rs3212961 [4], [16], [28], [30], 3 για rs3212948 [5], [29] , [30], και 4 για rs2298881 [20], [22], [28], [29] πολυμορφισμούς, αντίστοιχα. Οι περισσότερες από αυτές αφορούσαν όλους τους τύπους καρκίνου του πνεύμονα τόσο μεταξύ των καπνιστών και των μη καπνιστών, εκτός από δύο μελέτες. Μια μελέτη που διεξήχθη από Zienolddiny

et al

. [4] επικεντρώθηκε σε NSCLC σε καπνιστές και πρώην καπνιστές, ενώ το άλλο από τον Yin

et al

. [17] διερευνηθεί μόνο αδενοκαρκίνωμα σε μη-καπνιστές

Η

ERCC1

rs11615 (T & gt? C). Πολυμορφισμού

Στη μετα-ανάλυση 11 μελέτες με 8.215 περιπτώσεις και 11.402 έλεγχοι, η συγκεντρωτική ή για την συσχέτιση μεταξύ

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ήταν στατιστικά σημαντική (ομόζυγη: CC έναντι TT, OR = 1,24, 95% CI: 1,04 – 1,48,

P

= 0,02) με μέτρια μεταξύ μελέτη ετερογένεια (

2

= 22,8%,

P

= 0,01) (Εικόνα 2Α). Στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα ή την πηγή του ελέγχου ανιχνεύθηκε κανένα αξιοσημείωτο ενώσεις μεταξύ κάθε υπο-ομάδα (δηλαδή, της Ασίας έναντι του Καυκάσου πληθυσμούς, το νοσοκομείο με βάση έναντι βασισμένη στον πληθυσμό). Στη συνέχεια αφαιρείται μία μελέτη σε ένα χρόνο για να εξερευνήσετε την πηγή της ετερογένειας. Διαπιστώθηκε ότι ο αποκλεισμός της μελέτης από Zienolddiny

et al

. [4] μείωσε το

2

αξία σε 11,3% (

P

= 0.338), και στη συνέχεια τη σημασία της σύνδεσης δεν υπήρχε πλέον (Πίνακας 2). Η μελέτη αυτή αντιπροσώπευαν μόνο το 7,31% του βάρους της μετα-ανάλυσης. Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η μελέτη αυτή υπαγορεύει την ετερογένεια μεταξύ μελέτη, και οδηγεί το αρχικά παρατηρήθηκε συσχέτιση του κινδύνου. Ενώ προσεκτικά αναθεώρηση μελέτης Zienolddiny του, διαπιστώθηκε ότι η μελέτη αυτή πραγματοποιήθηκε μεταξύ των καπνιστών. Θέματα σε δύο περιπτώσεις και την ομάδα ελέγχου ήταν είτε νυν καπνιστές ή πρώην καπνιστές που έχουν κόψει το κάπνισμα για λιγότερο από 5 χρόνια. Ειδικότερα, η μέση τσιγάρα την ημέρα για χρόνια του καπνίσματος ήταν 15,6 ± 8,3 και 14,8 ± 6,3 για 40,4 ± 12,1 και 42,3 ± 7,9 έτη για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους, αντίστοιχα. Αυτά τα κριτήρια ένταξης οδήγησε σε μια μικρή συχνότητα αλληλόμορφο (MAF) από 0,46 σε αυτή τη μελέτη που παρέκκλινε από MAFs περίπου 0,60 σε Καυκάσιο πληθυσμό. Ως εκ τούτου, η πρόσληψη των ατόμων με μακρά ιστορία του καπνίσματος θα μπορούσε να είναι ο κύριος παράγοντας που αντιπροσωπεύουν την ετερογένεια.

Α, Δάσος οικόπεδο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμού από ένα ομόζυγο μοντέλο. Β, Δάσος οικόπεδο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμός στα στρωματοποιημένη αναλύσεις από το κάπνισμα. Τα οικόπεδα των ετερόζυγο μοντέλο έδειξαν. SMK, καπνιστής? NSMK, μη καπνιστής. Η εκτίμηση της OR και 95% CI της απεικονίζονται με ένα κουτί και μια οριζόντια γραμμή για κάθε μελέτη? ◊ αντιπροσωπεύει συγκεντρωτικά ΕΑΠ και του 95% ΠΙ.

Η

Επιπλέον, τέσσερα από τα έντεκα εκδόσεις, συμπεριλαμβανομένων έξι μελέτες (1.151 περιπτώσεις και 1.084 μάρτυρες) ανέφεραν κατανομές γονότυπου rs11615 πολυμορφισμού για καπνιστές και μη καπνιστές . Με αυτές τις επιπλέον πληροφορίες που βασίζονται σε κατάσταση καπνίσματος, στρωματοποιημένη αναλύσεις από το κάπνισμα έδειξαν ότι η συσχέτιση του πολυμορφισμού rs11615 με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα ήταν ισχυρότερη σε μη-καπνιστές σε σχέση με καπνιστές (ομόζυγη, OR (95% CI): 2,39 (1,47 – 3,88 ) /2.16 (1,41 – 3,30)? ετερόζυγο, 2,39 (1.44-3.95) /1.77 (1.21-2.60)? κυρίαρχη, 2,40 (1.49-3.85) /1.94 (1.36-2.79)) χωρίς ουσιαστική ετερογένεια (Σχήμα 2Β, Πίνακας 2 )

ERCC1

rs3212986 C & gt?. Ένας πολυμορφισμός

για να διερευνήσει πιθανές συσχετίσεις των

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμό με τους κινδύνους για καρκίνο του πνεύμονα, 6 επιλέξιμες μελέτες με 6639 περιπτώσεις και 8.630 μάρτυρες ομαδοποιήθηκαν μαζί για ανάλυση [4], [15], [16], [20], [22], [31]. Καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε (ομόζυγο, AA έναντι CC, OR = 1.00, 95% CI: 0,88 – 1,14? Ετερόζυγο, CA έναντι CC, OR = 0,97, 95% CI: 0,91 – 1,04? Κυρίαρχη, ΑΑ /CA έναντι CC, OR = 0,97, 95% CI: 0,91 – 1,04, υπολειπόμενο, AA έναντι CC /CA, OR = 1.01, 95% CI: 0,89 – 1,15) (Σχήμα 3Α, Πίνακας 2). Στη μελέτη από Kang

et al

. [31], τη διανομή γονότυπου στην ομάδα ελέγχου δεν ακολούθησε HWE. Η μελέτη αυτή είχε συμπεριληφθεί στην τελική ανάλυση, διότι η άρση δεν ποιοτικά μεταβάλλει την ένωση. Επιπλέον, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση αποκαλύφθηκε είτε στην ασιατική ή του Καυκάσου υποομάδα (Πίνακας 2).

Α, Δάσος οικόπεδο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμό. Το οικόπεδο κυρίαρχο μοντέλο παρουσιάστηκε. Β, οικόπεδο Δάσος του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

ERCC1

rs3212948 πολυμορφισμό. Το οικόπεδο κυρίαρχο μοντέλο παρουσιάστηκε. C, Δάσος οικόπεδο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σχετίζεται με το

ERCC1

rs2298881 πολυμορφισμό. Το οικόπεδο κυρίαρχο μοντέλο παρουσιάστηκε

Η

ERCC1

rs3212961 Α & gt?. C πολυμορφισμός

Μέχρι σήμερα, τέσσερις επιλέξιμες μελέτες που διερευνούν το ρόλο του

ERCC1

rs3212961 του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα ήταν διαθέσιμα [4], [16], [28], [30]. Οι μελέτες αυτές περιλαμβάνονται 1.770 περιπτώσεις και 1.830 ελέγχους. Συγκεντρωτική ανάλυση απέτυχε να παρέχει στατιστικά στοιχεία για μια σημαντική συσχέτιση του

ERCC1

rs3212961 πολυμορφισμού με κίνδυνο τη συνολική καρκίνο του πνεύμονα (ομόζυγη: CC έναντι ΑΑ, OR = 0,87, 95% ΚΠ: 0,71 – 1,07? Ετερόζυγο: CA έναντι AA , OR = 0,92, 95% ΚΠ: 0,77 – 1,11, κυρίαρχη, CA /CC έναντι ΑΑ, OR = 0,90, 95% ΚΠ: 0,76 – 1,07, και υπολειπόμενο μοντέλο, CC έναντι ΑΑ /CA 0.91 95% ΠΙ: 0,79 – 1,06 ) χωρίς ουσιαστική μεταξύ μελετών ετερογένεια (Πίνακας 2). Λόγω του σχετικά μικρού αριθμού και μικρές ετερογένεια των διαθέσιμων μελετών, ανάλυση ευαισθησίας σχετικά με τον πολυμορφισμό αυτό δεν έγινε

ERCC1

3212948 G & gt?. C πολυμορφισμός

Ένα tagSNP

ERCC1

3212948 G & gt? C, που αντιπροσωπεύει την κοινή γενετική παραλλαγή στην περιοχή κωδικοποίησης του

ERCC1

γονίδιο [5], έχει όλο και έλαβε την προσοχή. Εντοπίστηκαν τρεις επιλέξιμες μελέτες με 1.537 περιπτώσεις και 1.835 ελέγχους [5], [29], [30]. Αυτή η παραλλαγή βρέθηκε να σχετίζεται σημαντικά με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (ετερόζυγη: CG έναντι GG, OR = 0,78, 95% CI: 0,67 – 0,90,

P

= 0.001? Κυρίαρχη: CG /CC έναντι GG, OR = 0.79, 95% CI:. 0,69 – 0,91,

P =

0.001) χωρίς εμφανή ετερογένεια (Σχήμα 3Β, Πίνακας 2)

ERCC1

rs2298881 C & gt? A πολυμορφισμός

Τέσσερις επιλέξιμες μελέτες με 4.653 περιπτώσεις και 6.921 μάρτυρες αποκτήθηκαν για την αξιολόγηση της σύνδεσης του άλλου

ERCC1

tagSNP rs2298881 με καρκίνο του πνεύμονα [20], [22], [28], [29 ]. Τα συνολικά συγκεντρωτικά ΕΑΠ υπολογίστηκαν όπως αναφέρεται παρακάτω: ομόζυγη: AA έναντι CC OR = 1,11, 95% CI: 0,91 – 1,36,

P

= 0,288? ετερόζυγο: OR = 1.03, 95% CI: 0,94 – 1,13,

P

= 0,53? κυρίαρχη: AC /AA έναντι CC, OR = 1,04, 95% CI: 0,95 – 1,13),

P

= 0,41? υπολειπόμενο: OR = 1.10, 95% CI: 0,91 – 1,32,

P

= 0,322. εκτιμήσεων κινδύνου πρότεινε ότι

ERCC1

rs2298881 δεν αποτελεί κίνδυνο που σχετίζεται με τον πολυμορφισμό στον καρκίνο του πνεύμονα (Σχήμα 3C, Πίνακας 2).

Οι αναλύσεις ευαισθησίας

Όπως αναφέρθηκε προηγουμένως, η μελέτη από Zienolddiny

et al

. [4] αφαιρέθηκε από την τελική ανάλυση για το

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμό. Στη συνέχεια, η ανάλυση έδειξε ότι η επιρροή παραλείποντας οποιαδήποτε άλλη μελέτη ουσιαστικά δεν μετέβαλε τα αποτελέσματα, επιβεβαιώνοντας έτσι τη σταθερότητα αυτής της μετα-ανάλυσης. Στη συνέχεια, η ίδια ανάλυση έγινε για

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμό, και η ένωση παρέμεινε αμετάβλητη, γεγονός που υποδηλώνει ότι αυτή η συγκεντρωτική ανάλυση είναι επίσης σταθερό.

προκατάληψη Δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg του και δοκιμή Egger για διεξήχθησαν για την ανίχνευση της πόλωσης δημοσίευση της μετα-ανάλυσης. Τα σχήματα του οικοπέδου χοάνη για το

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμός φάνηκε συμμετρικά κάτω από όλα τα μοντέλα (Σχήμα 4). Παρ ‘όλα αυτά, δοκιμή Egger στο πλαίσιο ομόζυγη και κυρίαρχα μοντέλα ήταν σημαντική (

P

= 0,03 για CC έναντι ΤΤ,

P

= 0,03 για TC /CC έναντι ΤΤ,

P

= 0,06 για TC εναντίον TT,

P

= 0,28 για CC εναντίον TC /TT). Η προκατάληψη δημοσίευση δεν μετέβαλε το συμπέρασμα, επειδή τα αποτελέσματα σε όλα τα μοντέλα σύγκριση κατηγορηματικά πρότεινε ότι τα κοινά ή για την ένωση δεν ήταν στατιστικά σημαντική. Επιπλέον, δεν υπάρχει μεροληψία δημοσίευσης ανιχνεύθηκε για τις ενώσεις του rs3212986 πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (Σχήμα 4), η οποία επιβεβαιώθηκε με δοκιμή Egger του (

P

= 0,55 για AA εναντίον CC,

P

= 0,16 για CA εναντίον CC,

P

= 0,08 για CA /AA εναντίον CC, και

P

= 0,73 για AA εναντίον AC /CC).

καμία σημαντική προκατάληψη δημοσίευση βρέθηκε. Κάθε σημείο αντιπροσωπεύει μια ξεχωριστή μελέτη για την υποδεικνυόμενη ένωση. Μέγεθος κάθε σημείο είναι ανάλογη με το βάρος του.

Η

Συσχέτιση μεταξύ γονότυπων του

ERCC1

πολυμορφισμών και έκφρασης του mRNA

Θεωρήθηκε ότι

ERCC1

rs3212986 και rs11615 μπορεί να επηρεάσει τη σταθερότητα απομαγνητοφώνηση και τα επίπεδα mRNA, αντίστοιχα [4], [5]. Ωστόσο, τα αποτελέσματά μας δεν αποκάλυψε καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ είτε των πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Όπως έχει ήδη δημοσιευθεί [14], [32], χρησιμοποιήσαμε πληροφορίες από HapMap και SNPexp online εργαλείο για την περαιτέρω εκτίμηση κατά πόσον τα επίπεδα έκφρασης του

ERCC1

μεταγραφή συσχετίζεται με γονότυπους των δύο αυτών πολυμορφισμών. Λαμβάνοντας υπόψη τα θέματα σε μας μετα-ανάλυση ήταν από την κινεζική και του Καυκάσου πληθυσμούς, πραγματοποιήσαμε αναλύσεις συσχέτισης για CHB (κινέζικα), CEU (Καυκάσου), και ο συνδυασμός αυτών των δύο πληθυσμών, αντίστοιχα. Πληροφορίες σχετικά με γονότυπο της rs11615 πολυμορφισμού και των αντίστοιχων

ERCC1

έκφραση mRNA ήταν διαθέσιμα για 32 CC (ΦΕΚ), 55 TC (AG), και 37 TT (AA) άτομα. Για

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμός, υπήρχαν 6 ΑΑ, 48 AC και 70 φορείς CC με δεδομένα έκφρασης (Σχήμα 5). Παρά το γεγονός ότι τα επίπεδα έκφρασης του

ERCC1

μεταγραφή έδειξε μια τάση μείωσης από το ευρύ τύπου (ΤΤ) με το γονότυπο ομόζυγη παραλλαγή (CC) του rs11615 πολυμορφισμού σε πληθυσμό CHB, η διαφορά δεν ήταν στατιστικά σημαντική. Συνολικά, δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στο

ERCC1

επίπεδα έκφρασης μεταγραφής μεταξύ των διαφορετικών γονότυπων των rs11615 πολυμορφισμού σε CHB, CEU, και σε συνδυασμό των πληθυσμών στο πλαίσιο όλων των γενετικών μοντέλων. Ομοίως, γονότυπος του

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμός δεν φάνηκε να συσχετίζεται με το επίπεδο έκφρασης του mRNA της

ERCC1

γονιδίου, είτε. Η επίδραση του

ERCC1

rs3212948 πολυμορφισμός στο

ERCC1

γονιδιακή έκφραση ήταν επίσης διερευνηθεί, δεδομένου ότι προτάθηκε να συνδεθεί με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι rs3212948 συνδεόταν με μειωμένα επίπεδα έκφρασης του

ERCC1

γονιδίου σε CHB, αλλά αυξημένη έκφραση σε CEU. . (Υπολειπόμενο μοντέλο: CEU:

P

= 0,0433? CHB:

P

= 0.0538) (Σχήμα S1)

Η

Συζήτηση

Συσσωρευμένα οι μελέτες των ενώσεων μεταξύ

ERCC1

πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα έχουν διεξαχθεί, αλλά απέδωσε αντικρουόμενα αποτελέσματα. Η σημερινή μετα-ανάλυση εξέτασε κατά πόσον τα πέντε πιο συχνά μελετηθεί

πολυμορφισμών ERCC1

(rs11615, rs3212986, rs3212961, rs3212948 και rs2298881) σχετίστηκαν με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. Σύνδεσης μεταξύ

ERCC1

rs11615 ή rs3212986 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα είναι φαινομενικά βιολογικά αντάξια της έγκρισης, δεδομένου ότι αυτές οι δύο πολυμορφισμοί έχουν σκεφτεί να αλλάξει τη σταθερότητα απομαγνητοφώνηση και τα επίπεδα mRNA [4], [5], αντίστοιχα. Παρ ‘όλα αυτά, τα αποτελέσματα που προέρχονται από την τρέχουσα μετα-ανάλυση δεν υποστηρίζει μια τέτοια ένωση. Αρχικά, η μετα-ανάλυση έδειξε μία σημαντική συσχέτιση του

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμού με καρκίνο του πνεύμονα υπό την ομόζυγη μοντέλο με μέτρια αντιστοιχούν μεταξύ μελέτη ετερογένεια (

2

= 22,8% ,

P

= 0,01). Παρ ‘όλα αυτά, η ανάλυση επιρροής αποκάλυψε ότι η ένωση προέκυψε κυρίως από μία μελέτη από Zienolddiny και οι συνεργάτες του [4], η οποία αντιπροσώπευε μόνο το 7,31% κατά βάρος στο σύνολο της μετα-ανάλυσης. Επιπλέον, αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι δεν υπάρχει στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ του

ERCC1

rs3212986 πολυμορφισμό και τον καρκίνο του πνεύμονα κίνδυνο.

Πρόσφατα, αρκετές μετα-αναλύσεις έχουν αναφερθεί αντικρουόμενα συμπέρασμα σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [6] – [8]. Αρχικά, μια στρωματοποιημένη ανάλυση περιλαμβάνει 4 μελέτες των 2.279 περιπτώσεις και 2.808 ελέγχους σε μια μετα-ανάλυση έδειξε καμία σχέση μεταξύ αυτού του κινδύνου πολυμορφισμό και καρκίνο του πνεύμονα [7]. Cao

et al

. αναλύθηκαν συνολικά 7 μελέτες [4], [15], [16], [19], [21], [24], [26] με 3.810 περιπτώσεις /4332 έλεγχοι και βρέθηκαν παρόμοια αποτελέσματα. Πρόσφατα, Zhang

et al

. έδειξαν αντικρουόμενα στοιχεία, των οποίων η μετα-ανάλυση με επίκεντρο τη συμβολή των

ERCC1

πολυμορφισμούς στο συνολικό κίνδυνο του καρκίνου. Διαστρωματική ανάλυση με 9 μελέτες [4], [15] – [17], [19], [21], [23], [24], [26], [27] του 4652 περιπτώσεις και 5.164 μάρτυρες έδειξαν ότι

ERCC1

rs11615, αλλά δεν rs3212986 πολυμορφισμός σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα.

σε σύγκριση με αυτά προηγούμενων μετα-αναλύσεις, η παρούσα μελέτη έχει πολλά μοναδικά χαρακτηριστικά που αφορούν rs11615 πολυμορφισμό. Κατ ‘αρχάς, τρεις νέες μελέτες [18], [20], [22] η οποία δημοσιεύθηκε το 2012, που περιέχει 3.780 υποθέσεις και 6.081 ελέγχους συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα ανάλυση. Δεύτερον, δύο μελέτες [26], [27] που ενσωματώθηκαν σε μετα-ανάλυση του Zhang αποκλείστηκαν από την παρούσα ανάλυση [6]. Κατά τη διάρκεια της εντατικής ανασκόπηση της βιβλιογραφίας, τέσσερα άρθρα που διεξήχθη από Yin

et al

. [18], [26] – [28] με τον ίδιο νοσοκομείο φάνηκε να χωρέσει κριτήριο επιλογής. Για να εξαλειφθεί η πιθανότητα ότι τα δείγματα θα μπορούσαν να χρησιμοποιηθούν κατ ‘επανάληψη σε αυτές τις μελέτες, καταλήξαμε διατηρώντας μόνο μία μελέτη, η οποία είχε το μεγαλύτερο μέγεθος του δείγματος, και δημοσιεύθηκε πιο πρόσφατα. Τρίτον, η μελέτη από Zienolddiny

et al

. [4] αφαιρέθηκε από την τελική ανάλυση λόγω δυσανάλογη συνεισφορά της στις εκτιμήσεις του κινδύνου και μεταξύ-ετερογένεια. Τέταρτον, τα διαθέσιμα δεδομένα ήταν στρωματοποιημένη και αναλύθηκαν με βάση την κατάσταση του καπνίσματος των συμμετεχόντων στην μελέτη. προκαταρκτικό αποτέλεσμα μας πρότειναν ότι η συσχέτιση μεταξύ των

ERCC1

rs11615 και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα μπορεί να είναι ισχυρότερη σε μη-καπνιστές σε σχέση με τους καπνιστές, το οποίο μπορεί να είναι, σύμφωνα με την έννοια της γενετικής προδιάθεσης που υποδεικνύουν τα άτομα με προδιάθεση για καρκίνο τείνουν να αναπτύξουν καρκίνο, όταν πάσχουν χαμηλή δόση επικίνδυνη έκθεση (π.χ., παθητικό). Ωστόσο, λόγω του σχετικά μικρού μεγέθους του δείγματος και η μεροληψία επιλογής, το αποτέλεσμα αυτό θα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή. Πέμπτον, σε σύγκριση με την πιο πρόσφατη μετα-ανάλυση που αφορά

ERCC1

rs11615 πολυμορφισμός [6], δείγματα μεγέθους σε αυτό το μετα-ανάλυση σχεδόν διπλασιάστηκε. Επιπλέον, σύμφωνα με τις προηγούμενες μετα-αναλύσεις [6], [8], η ανάλυση αυτή επιβεβαίωσε ότι rs3212986 πολυμορφισμού ισχύει μηδενική επίδραση στον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Επιπλέον, διαπιστώθηκε ότι οι συσχετίσεις των

ERCC1

rs11615 ή rs3212986 πολυμορφισμού με τα αντίστοιχα

ERCC1

επίπεδα έκφρασης του mRNA ήταν αρνητικές. Αυτά τα αποτελέσματα παρέχουν ενδείξεις που υποστηρίζουν τα ευρήματα μας ότι αυτά τα δύο

ERCC1

πολυμορφισμοί που δεν συνδέονται με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα.

ERCC1

rs3212961 πολυμορφισμός έχει επίσης χαρακτηρισθεί καλά. Με 4 μελέτες (1.770 περιπτώσεις και 1.830 έλεγχοι), αυτή η μετα-ανάλυση δεν έδειξε καμία σχέση μεταξύ αυτού του πολυμορφισμού και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα. Αξιολογήσαμε επίσης δύο επιπλέον

ERCC1

ετικέτες SNPs (rs3212948 και rs2298881). εκτιμήσεων κινδύνου πρότεινε ότι

ERCC1

rs3212948 είναι μια προστασία που σχετίζεται με γενετική παραλλαγή στον καρκίνο του πνεύμονα, ενώ δεν διαπιστώθηκε καμία συσχέτιση για rs2298881. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μετα-ανάλυση που εκτιμάται ενώσεις

ERCC1

rs3212961, rs3212948 και rs2298881 πολυμορφισμών με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Παρ ‘όλα αυτά, η ανάλυση συσχέτισης μεταξύ γονότυπων των πολυμορφισμών rs3212948 και η έκφραση του mRNA δεν συμφωνούν με τη μελέτη σύνδεσης. Αποτελέσματα για συσχέτιση πρότεινε ότι rs3212948 μπορεί να μειώσει τα επίπεδα έκφρασης του

ERCC1

γονιδίων σε CHB, αλλά αυξάνουν την έκφραση στο CEU (υπολειπόμενο μοντέλο: CEU:

P

= 0,0433? CHB:

P

= 0,0538). Συνολικά, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε συνδυασμό με ΧΗΒ και τον πληθυσμό CEU. Πολλοί είναι οι λόγοι μπορεί να βοηθήσει να εξηγήσει τη διαφορά: 1) ο αριθμός των διαθέσιμων μελετών για rs3212948 ήταν πολύ λίγα, και μετα-αναλύσεις με περισσότερες μελέτες που απαιτούνται για την επικύρωση ευρήματά μας σχετικά με τη σύνδεση. 2) με μόνο τρεις μελέτες, ήμασταν σε θέση να εκτελέσει αποτελεσματική ανάλυση στρωματοποίησης από την εθνικότητα για να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ rs3212948 και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα είτε κινέζικα ή του Καυκάσου ομάδα. Ωστόσο, τα αποτελέσματα μεταφέρω κάποιες σημαντικές πληροφορίες: 1)

ERCC1

rs3212948 πολυμορφισμός μπορεί να επηρεάσει την έκφραση του mRNA και 2) η επίδραση στην έκφραση του mRNA είναι η εθνικότητα-εξαρτώμενη.