PLoS One: Αλληλεπίδραση μεταξύ των πολυμορφισμών στο Pre-miRNA Γονίδια και μαγειρικής έκθεσης Oil Καπνός για τον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική μη καπνίζοντες Γυναίκα Population


Αφηρημένο

Ιστορικό

Τόσο γενετικών πολυμορφισμών και περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου παίζουν σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη του ανθρώπινου χρόνιων νόσων, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα. Αυτή είναι η πρώτη μελέτη ασθενών-μαρτύρων της αλληλεπίδρασης μεταξύ των πολυμορφισμών σε προ-miRNA γονιδίων και το μαγείρεμα των αναθυμιάσεων λαδιού έκθεση σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα.

Μέθοδοι

Μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση 258 περιπτώσεις και 310 έλεγχοι διεξήχθη. Έξι πολυμορφισμοί στο miRNAs προσδιορίστηκαν με τη μέθοδο Taqman αλληλομόρφων των διακρίσεων. Οι αλληλεπιδράσεις γονιδίων-περιβάλλοντος αξιολογήθηκαν τόσο πρόσθετο και πολλαπλασιαστική κλίμακα. Οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν ως επί το πλείστον με SPSS.

Αποτελέσματα

Ο συνδυασμός των γονοτύπων κινδύνου πέντε miRNA SNPs (rs2910164 miR-146a, miR-196a2 rs11614913, miR-608 rs4919510, ΜΙΚ 27α rs895819 και miR-423 rs6505162) με παράγοντα κινδύνου (μαγείρεμα έκθεσης αναθυμιάσεων λαδιού) συνέβαλε σε σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, και οι αντίστοιχες ΕΑΠ (95% διαστήματα εμπιστοσύνης) ήταν 1,91 (1,04 – 3,52), 1,94 (01.16 – 03.25 ), 2,06 (1,22 – 3,49), 1,76 (1,03 έως 2,98) και 2,13 (1,29 – 3,51). Τα άτομα με τα δύο γονότυπους κίνδυνο miRNA SNPs και την έκθεση σε παράγοντα κινδύνου (μαγείρεμα αναθυμιάσεις πετρελαίου) ήταν σε υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα από ό, τι τα άτομα με μόνο έναν από τους δύο παράγοντες κινδύνου (ΕΑΠ ήταν 1,91, 1,05 και 1,41 για rs2910164 miR-146a , ΕΑΠ ήταν 1,94, 1,23 και 1,34 για το miR-196a2 rs11614913, ΕΑΠ ήταν 2,06, 1,41 και 1,68 για το miR-608 rs4919510, ΕΑΠ ήταν 1,76, 0,82 και 1,07 για rs895819 miR-27a, και ΕΑΠ ήταν 2,13, 1,15 και 1,02 για το miR -423 rs6505162, αντίστοιχα). Όλα τα μέτρα της βιολογικής αλληλεπίδρασης δείχνουν ότι δεν υπήρχαν πράγματι βιολογικές αλληλεπιδράσεις μεταξύ των έξι SNPs των miRNAs και την έκθεση με το μαγείρεμα αναθυμιάσεις του πετρελαίου σε μια κλίμακα πρόσθετο. Logistic μοντέλα πρότειναν ότι οι αλληλεπιδράσεις γονιδίων-περιβάλλοντος δεν ήταν στατιστικά σημαντική σε μια πολλαπλασιαστική κλίμακα.

Συμπεράσματα

Οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ miRNA SNPs και το μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις έκθεση προτείνεται από ΕΑΠ διαφορετικών συνδυασμός δεν ήταν στατιστικώς σημαντική

Παράθεση:. Yin Z, Cui Ζ, Guan P, Λι Χ, Wu W, Ren Υ, et al. (2015) Η αλληλεπίδραση μεταξύ πολυμορφισμών στο Pre-miRNA Γονίδια και μαγειρικής έκθεσης Oil Καπνός για τον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική μη καπνίζοντες γυναικείο πληθυσμό. PLoS ONE 10 (6): e0128572. doi: 10.1371 /journal.pone.0128572

Ακαδημαϊκό Επιμέλεια: Hiromu Suzuki, Σαπόρο Ιατρικό Πανεπιστήμιο, ΙΑΠΩΝΙΑ

Ελήφθη: 31 Οκτ 2014? Αποδεκτές: 28 Απρίλη 2015? Δημοσιεύθηκε: 17 Ιουνίου 2015

Copyright: © 2015 Yin et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Νο 81102194). ZY λάβει τη χρηματοδότηση. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Ιστορικό

Στην Κίνα, ο καρκίνος του πνεύμονα έχει καταστεί η κύρια αιτία των θανάτων από καρκίνο σχετίζονται τόσο για τους άνδρες και τις γυναίκες [1]. Η συχνότητα εμφάνισης και ο θάνατος του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική αστικών πληθυσμών έχουν φτάσει στο νούμερο ένα ανάμεσα σε κακοήθεις όγκους [2]. Το κάπνισμα είναι ο κύριος παράγοντας κινδύνου για καρκίνο του πνεύμονα? Ωστόσο, εκτιμάται ότι το 15% αρσενικά και 53% θηλυκά των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα είναι καπνίστριες [3], το οποίο υποδηλώνει ότι και άλλοι παράγοντες κινδύνου έχουν επίσης ενοχοποιηθεί στην αιτιολογία του καρκίνου του πνεύμονα. Το κάπνισμα δεν μπορεί να εξηγήσει πλήρως τα επιδημιολογικά χαρακτηριστικά του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική γυναίκες, γι ‘αυτό είναι πραγματικά σημαντικό να εξερευνήσουν άλλους σημαντικούς παράγοντες κινδύνου για καρκίνο του πνεύμονα στην κινεζική γυναίκες μη καπνίζοντες προκειμένου να ελεγχθεί η επίδραση του καπνού των τσιγάρων.

η έκθεση σε περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου παίζουν σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου του πνεύμονα, αλλά στο ίδιο περιβάλλον άνθρωποι διαφέρουν ως προς την ευαισθησία τους στον καρκίνο. Ορισμένες από αυτές τις διαφορές αποδίδονται στην ιδέα ότι η γενετική προδιάθεση τροποποιεί τις επιπτώσεις της περιβαλλοντικής έκθεσης [4].

Μοριακής επιδημιολογικές μελέτες έδειξαν ότι υπήρχαν εκατοντάδες γονίδια που εμπλέκονται στην καρκινογένεση του πνεύμονα [5]. Τα τελευταία χρόνια, οι αναδυόμενες ενδείξεις υποστηρίζουν μια έκτακτη ρόλο για microRNAs (miRNAs) στην παθογένεση του ανθρώπινου καρκίνου του πνεύμονα. MiRNAs είναι κατηγορίες μη κωδικοποίησης RNAs, περίπου 20 νουκλεοτίδια σε μήκος, οι οποίες θεωρούνται να ρυθμίσουν έκφραση με σύνδεση προς cis-ρυθμιστικές περιοχές των περιφερειών 3′-UTR των γονιδίων στόχων [6]. Οι miRNAs έχουν εμπλακεί σε κρίσιμη βιολογικές διεργασίες, συμπεριλαμβανομένης της ανάπτυξης, της διαφοροποίησης, της απόπτωσης, του πολλαπλασιασμού, και η ανάπτυξη των περισσότερων ασθενειών, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου [7]. Η μελέτη έδειξε ότι περισσότερο από το 50% των γονιδίων miRNA εντοπίσει σε περιοχές του γονιδιώματος σχετίζονται με τον καρκίνο ή σε εύθραυστα θέσεις, γεγονός που υποδηλώνει ότι miRNAs μπορεί να παίζει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου [8]. Οι πολυμορφισμοί απλού νουκλεοτιδίου (SNPs) στην περιοχή σπόρο ή το πρόδρομο στέλεχος-βρόχο του miRNA αναφερθεί ότι επηρεάζουν σημαντικά την παραγωγή ή την επεξεργασία των miRNA [9-10]. Αυτές οι γραμμές των αποδεικτικών στοιχείων υποδηλώνουν ότι miRNA SNPs μπορεί να επηρεάσει την έκφραση ή τη λειτουργία των miRNAs που τους φιλοξενούν. Τώρα, οι ερευνητές καταλήγουν στο συμπέρασμα ότι SNP ή μεταλλάξεις στην ακολουθία miRNA μπορεί να μεταβάλλει την έκφραση, την ωρίμανση και /ή επιλογή στόχου miRNA, και, κατά συνέπεια, να συμβάλει για να τροποποιήσετε τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Κατά τα τελευταία λίγα χρόνια, η σχέση μεταξύ miRNA SNPs και ο κίνδυνος του καρκίνου έχει γίνει το καυτό θέμα στην έρευνα για τον καρκίνο αιτιολογία.

Υπάρχουν μελέτες για τη σχέση μεταξύ miRNA SNPs και τους κινδύνους του καρκίνου του πνεύμονα. Για παράδειγμα, Tian et al. διαπίστωσε ότι η SNP rs11614913 στο miR-196a2 συνδέθηκε με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα, όμως, δεν υπάρχουν σημαντικές επιπτώσεις παρατηρήθηκαν σχετικά με τη σύνδεση για τις άλλες τρεις SNPs (rs2910164, rs2292832 και rs3746444) που βρίσκονται στις περιοχές προ-miRNA του miR -146a, miR-149, miR-196a2, και miR-499 [11]. Η πρόσφατη μελέτη σε Κορέας πρότεινε ότι η rs2910164C » Για κάθε μία από αυτές τις ερωτήσεις, υπήρχαν τέσσερις πιθανές απαντήσεις που κυμαίνονται από «ποτέ», «σπάνια», «μερικές φορές», για να «συχνά». Η έκθεση για το μαγείρεμα των αναθυμιάσεων λαδιού κατηγοριοποιήθηκε ως δείκτης μεταβλητή ισούται με 1 αν οι συμμετέχοντες αναφέρθηκαν συχνά ή μερικές φορές, και ισούται με 0 διαφορετικά.

SNP γονοτυπική

δείγματα Το γονιδιακό DNA απομονώθηκαν με τη χρήση φαινόλης-χλωροφορμίου Μέθοδος. Προσδιορισμό του γονότυπου της SNPs έγινε σε ένα Applied Biosystems 7500 PCR System FAST Real-Time (Foster City, CA, USA) χρησιμοποιώντας Taqman διακρίσεις αλληλομόρφων (Applied Biosystems, Foster City, CA) με ένα εμπορικά διαθέσιμο σετ καθετήρα αστάρι (δοκιμασία ID C_15946974_10 για rs2910164, C_31185852_10 για rs11614913, C_1766455_10 για rs928508, C_2826025_10 για rs4919510, C_3056952_20 για rs895819 και C___11613678_10 για rs6505162). ποιοτικούς ελέγχους περιλαμβάνονται η κατάλληλη αρνητικοί μάρτυρες συμπεριλήφθηκαν σε κάθε εκτέλεση, και το 10% των ασθενών επιλέχθηκαν τυχαία για καθορισμό γονότυπου δύο φορές από διαφορετικά πρόσωπα και τα αποτελέσματα να είναι σύμφωνη προς όλους τους μασκοφόρους σύνολα διπλούν.

η στατιστική ανάλυση

Άνευ όρων ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης έγινε για τον υπολογισμό των λόγων πιθανοτήτων (OR) και τα διαστήματα τους 95% εμπιστοσύνης (CI) για την αξιολόγηση των συσχετίσεων μεταξύ συνδυασμού ή αλληλεπίδρασης των SNPs και το περιβάλλον παράγοντες με καρκίνο του πνεύμονα ή αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα κίνδυνοι. Η αλληλεπίδραση γονιδίων-περιβάλλοντος εκτιμήθηκε με ανάλυση crossover (πρόσθετο αλληλεπίδραση) και λογιστικών μοντέλων παλινδρόμησης (πολλαπλασιαστική αλληλεπίδραση). Σε αυτές τις αναλύσεις, οι συνδυασμοί των προστατευτικών γονότυπων κάθε SNP και απουσία μαγειρέματος έκθεσης αναθυμιάσεων λαδιού θεωρήθηκαν ως ομάδα αναφοράς. Χρησιμοποιούμε συντελεστές παλινδρόμησης και πίνακα συνδιακύμανσης των λογιστικό μοντέλο στο λογισμικό SPSS, και στη συνέχεια να εισαγάγουν ένα υπολογιστικό φύλλο Excel που έχουν συσταθεί από Tomas Andersson για τον υπολογισμό των δεικτών της αλληλεπίδρασης σε ένα πρόσθετο κλίμακα και τα αντίστοιχα διαστήματα εμπιστοσύνης [23]. Τρία μέτρα βιολογικής αλληλεπίδρασης: η σχετική περίσσεια κινδύνου λόγω αλληλεπίδρασης (RERI), τα αναλογούντα αναλογία οφείλεται σε αλληλεπίδραση (ΑΡ), και ο δείκτης συνέργιας (S)? καθώς και το 95% ΚΠ τους υπολογίστηκαν με βάση τις τρεις σχετικές εκτιμήσεις του κινδύνου και του αντίστοιχου πίνακα συνδιακύμανσης από ένα μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης. Οι περισσότερες από τις στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση SPSS 20.0 λογισμικού, εκτός από τα μέτρα του προσθέτου αλληλεπιδράσεων, όπως ορίζεται παραπάνω. Όλες οι δοκιμασίες ήταν δύο όψεων και η στατιστική σημαντικότητα ορίστηκε ως Ρ & lt?. 0.05

Αποτελέσματα

Υπάρχουν 258 περιπτώσεις και 310 έλεγχοι σε αναλύσεις της παρούσας. Όλα τα άτομα nonsmoking θηλυκά. Από τις 258 περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα, 194 (75,19%) των ασθενών ήταν αδενοκαρκίνωμα, 34 (13,18%) ήταν πλακώδες καρκίνωμα κυττάρων και 30 (11,63%) ήταν άλλα είδη.

Οι αναλύσεις των παραγόντων περιβαλλοντικών επιπτώσεων πρότεινε ότι υπήρχε μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα με μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεων έκθεση (OR = 1.52, 95% CI = 01.06 έως 02.17, Ρ = 0.023), αλλά όχι με άλλους παράγοντες κινδύνου για το περιβάλλον (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Σε προηγούμενες μελέτες μας και τις παρούσες αναλύσεις, CG ή GG γονότυπο του rs2910164, ΤΤ γονότυπος του rs11614913, AG ή GG γονότυπο rs928508, GG γονότυπο του rs4919510, TC ή CC γονότυπο rs895819, CA ή ΑΑ γονότυπο του rs6505162 προτάθηκαν να είναι προστατευτικά γονότυπο (-α), έτσι ώστε οι συνδυασμοί αυτών των γενοτύπων και μη έκθεσης σε μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεων ορίστηκαν ως ομάδες αναφοράς σε αναλύσεις η αλληλεπίδραση.

Πίνακας 1 έδειξε την ολοκληρωμένη συνδυασμό έξι SNPs στο miRNAs και μαγειρικού λαδιού αναθυμιάσεων έκθεση σχετικά με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα και το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα στην κινεζική Απαγορεύεται το κάπνισμα σε γυναικείο πληθυσμό. Τα θέματα που μεταφέρουν miR-196a2 rs11614913 TC γονότυπο και την έκθεση με το μαγείρεμα των αναθυμιάσεων του πετρελαίου είχαν 2,08 φορές τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σύγκριση με το συνδυασμό του ΤΤ γονότυπο και μη έκθεση σε μαγείρεμα αναθυμιάσεων λαδιού (95% CI = 1,18 – 3,65). Τα άτομα με miR-608 γονότυπο rs4919510 GC και η έκθεση με το μαγείρεμα αναθυμιάσεων του πετρελαίου είχαν 2,33 φορές σε αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε σύγκριση με το συνδυασμό του GG γονότυπο και μη έκθεση σε μαγείρεμα αναθυμιάσεων λαδιού (95% CI = 1.29 – 4.23). Ο συνδυασμός του miR-423 rs6505162 CC γονότυπο και την έκθεση αναθυμιάσεων λαδιού μαγειρέματος ήταν σημαντικά σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σύγκριση με το συνδυασμό της ΑΑ γονότυπο και μη έκθεση σε μαγείρεμα αναθυμιάσεων λαδιού (OR = 3,14, 95% CI = 1,02 – 9,62). Τα παρόμοια αποτελέσματα έδειξαν σε αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Αν και σε άλλες SNPs, τα αποτελέσματα δεν ήταν σημαντική, θα μπορούσε να υποστηριχθεί ότι οι συνδυασμοί των γονότυπων του κινδύνου και της έκθεσης αναθυμιάσεων μαγειρικό λάδι μπορεί να σχετίζεται με τους αυξημένους κινδύνους του καρκίνου του πνεύμονα. Επιπλέον, ο συνδυασμός των SNPs σε miRNAs και η έκθεση μαγειρικό λάδι για την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα και το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα στο πλαίσιο άλλων συγκρίσεις παρουσιάζονται στον Πίνακα S1.

Η

Πίνακας 2 έδειξε το crossover αναλύει τα αποτελέσματα σχετικά με την αλληλεπίδραση μεταξύ SNPs σε miRNAs και η έκθεση αναθυμιάσεων λαδιού μαγειρέματος για την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική Απαγορεύεται το κάπνισμα σε γυναικείο πληθυσμό. Για miR-146a rs2910164 πολυμορφισμό, τα άτομα με γονότυπο CC (γονότυπος κινδύνου) και την έκθεση στο μαγείρεμα αναθυμιάσεις πετρελαίου (παράγοντας κινδύνου) είχαν περισσότερες πιθανότητες να αναπτύξουν καρκίνο του πνεύμονα σε σύγκριση με εκείνους με CG /γονότυπο GG και μη έκθεση σε μαγείρεμα αναθυμιάσεων λαδιού ( OR = 1.91, 95% CI = 1,04 – 3,52, P = 0,037). Τα παρόμοια στατιστικά σημαντικά αποτελέσματα βρέθηκαν επίσης σε miR-196a2 rs11614913, miR-608 rs4919510, rs895819 miR-27a και miR-423 rs6505162 πολυμορφισμοί, ότι ήταν ο συνδυασμός των γονοτύπων κίνδυνο αυτών των miRNA SNPs με παράγοντα κινδύνου μαγειρέματος έκθεσης αναθυμιάσεων λαδιού συνέβαλε σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, καθώς και τις αντίστοιχες ΕΑΠ (95% ΠΙ) ήταν 1.94 (01.16 – 03.25), 2,06 (1,22 – 3,49), 1,76 (1,03 – 2,98) και 2,13 (1,29 – 3,51). Στον πίνακα 2, θα μπορούσε να διαπιστώσει ότι οι άνθρωποι τόσο μεταφέρουν γονότυπους κίνδυνο miRNA SNPs και την έκθεση σε παράγοντα κινδύνου (μαγείρεμα αναθυμιάσεις πετρελαίου) ήταν σε υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα από ό, τι τα άτομα με μόνο έναν από τους δύο παράγοντες κινδύνου (ΕΑΠ ήταν 1,91, 1.05 και 1.41 για το miR-146a rs2910164, ΕΑΠ ήταν 1,94, 1,23 και 1,34 για το miR-196a2 rs11614913, ΕΑΠ ήταν 2,06, 1,41 και 1,68 για το miR-608 rs4919510, ΕΑΠ ήταν 1,76, 0,82 και 1,07 για rs895819 miR-27a, και ΕΑΠ ήταν 2,13, 1,15 και 1,02 για το miR-423 rs6505162, αντίστοιχα), η οποία προτείνει ότι μπορεί να υπάρχει αλληλεπίδραση μεταξύ αυτών των SNPs και το μαγείρεμα έκθεση αναθυμιάσεων του πετρελαίου, έτσι έχουμε ακόμη διερευνηθεί η αλληλεπίδραση σε μια κλίμακα πρόσθετης ύλης και μια πολλαπλασιαστική κλίμακα από ποσοτική και στατιστικά σημαντική αναλύσεις.

η

Επειδή αδενοκαρκίνωμα είναι ο συχνότερος υπότυπος του καρκίνου του πνεύμονα, με μεγαλύτερη συχνότητα σε γυναίκες, αναλύσαμε την αλληλεπίδραση μεταξύ των παραπάνω SNPs σε miRNAs και μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις έκθεση σχετικά με την ευαισθησία αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα στην κινεζική μη -Καπνός γυναικείο πληθυσμό (Πίνακας 3). Για miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-608 rs4919510, rs895819 miR-27a και miR-423 rs6505162 πολυμορφισμών, οι γενότυποι κίνδυνο που συνδυάζει με τον παράγοντα κινδύνου (μαγείρεμα έκθεσης αναθυμιάσεων λαδιού) είχαν σημαντικά σχετίζονται με τους κινδύνους αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα, και οι αντίστοιχες ΕΑΠ (95% ΠΙ) ήταν 2.13 (01.12 – 04.04), 2,18 (1,25 – 3,81), 2,18 (1,24 – 3,83), 2,19 (1,24 – 3,88) και 2,06 (1,20 – 3,55). Ο συνδυασμός των δύο παραγόντων κινδύνου συνέβαλε σε υψηλότερο κίνδυνο αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα από αυτούς με μόνο μία από αυτές (ΕΑΠ ήταν 2,13, 1,07 και 1,37 για το miR-146a rs2910164, ΕΑΠ ήταν 2,18, 1,31 και 1,20 για το miR-196a2 rs11614913, ΕΑΠ ήταν 2.18, 1.04 και 1.13 για το miR-608 rs4919510, ΕΑΠ ήταν 2,19, 1,04 και 1,13 για rs895819 miR-27a, και ΕΑΠ ήταν 2,06, 1,13 και 1,13 για το miR-423 rs6505162, αντίστοιχα). Επιπλέον, υποστηρίζουν Πληροφορίες S2 πίνακας έδειξε την αλληλεπίδραση μεταξύ των SNPs σε miRNAs και η έκθεση μαγειρικό λάδι για τον καρκίνο του πνεύμονα και την ευαισθησία του αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα υπό άλλες συγκρίσεις.

Η

Ο Πίνακας 4 έδειξαν τα ποσοτικά και στατιστικά σημαντικά αποτελέσματα των αναλύσεων σχετικά με το μέτρα βιολογικής αλληλεπίδρασης μεταξύ των SNPs σε miRNAs και η έκθεση μαγειρικό λάδι για τον καρκίνο του πνεύμονα και το αδενοκαρκίνωμα στην κινεζική Απαγορεύεται το κάπνισμα σε γυναικείο πληθυσμό. Υπάρχουν τρία μέτρα της αλληλεπίδρασης και διαστήματα εμπιστοσύνης τους. Αν δεν υπάρχει βιολογικές αλληλεπιδράσεις, RERI και ΑΡ είναι ίσο με 0 και S είναι ίσο με 1. Όλα τα μέτρα της βιολογικής αλληλεπίδρασης δείχνουν ότι δεν υπήρχαν πράγματι βιολογικές αλληλεπιδράσεις μεταξύ των έξι SNPs των miRNAs και την έκθεση με το μαγείρεμα αναθυμιάσεις του πετρελαίου σε ένα πρόσθετο κλίμακα. Logistic μοντέλα πρότεινε ότι οι αλληλεπιδράσεις γονιδίων-περιβάλλοντος δεν ήταν στατιστικά σημαντικές σε πολλαπλασιαστική κλίμακα (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Από τα αποτελέσματα των αναλύσεων μας, μπορεί να μην υπάρχει στατιστικά σημαντική αλληλεπίδραση μεταξύ των έξι miRNA SNPs και μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις έκθεση στον καρκίνο του πνεύμονα ή αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα μεταξύ των μη καπνιστών γυναίκες στην Κίνα.

Η

Συζήτηση

τα τελευταία χρόνια, ο αιτιολογικός μελέτη του καρκίνου του πνεύμονα παραμένει δημοφιλής σε όλο τον κόσμο, αλλά τα αποτελέσματα είναι ασυνεπής. Είναι γνωστό ότι εκτός από το κάπνισμα, άλλοι παράγοντες επίπτωση του καρκίνου του πνεύμονα δεν είναι οριστικά. Το κάπνισμα δεν μπορεί να εξηγήσει πλήρως τα επιδημιολογικά χαρακτηριστικά του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική γυναίκες, που καπνίζουν σπάνια, αλλά έχουν καρκίνο του πνεύμονα είναι σχετικά συχνά. Αναμφίβολα το κάπνισμα θηλυκά είναι οι ιδανικές θέματα για να εξετάσει άγνωστη, αλλά σημαντικά περιβαλλοντικούς και γενετικούς παράγοντες του καρκίνου του πνεύμονα. Η ερευνητική μας ομάδα έχει αρχίσει τη μελέτη των παραγόντων κινδύνου και γενετική προδιάθεση του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική πληθυσμό. Σε προηγούμενες μελέτες, θα αναφέρονται οι συσχετίσεις μεταξύ μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις της έκθεσης και τους κινδύνους του καρκίνου του πνεύμονα. Πιο πρόσφατα, αναλύουμε το miRNA SNPs και τους κινδύνους του καρκίνου του πνεύμονα. Λαμβάνοντας υπόψη το σημαντικό ρόλο της αλληλεπίδρασης γονιδίων-περιβάλλοντος στην ανάπτυξη του καρκίνου του πνεύμονα, στην παρούσα μελέτη αξιολογήθηκε η αλληλεπίδραση μεταξύ των έξι λειτουργικών πολυμορφισμών των έξι miRNAs και τους κινδύνους του καρκίνου του πνεύμονα σε μια κινεζική μη καπνίζοντες γυναικείο πληθυσμό.

για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη διεξοδικά τη διερεύνηση της αλληλεπίδρασης μεταξύ των miRNA SNPs και τον παράγοντα περιβαλλοντικού κινδύνου και στις δύο προσθετικό κλίμακα και την πολλαπλασιαστική κλίμακα από ποιοτικές και ποσοτικές αναλύσεις. Τα ποιοτικά αποτελέσματα από την cross-over αναλύσεις πρότεινε ότι μπορεί να υπάρχει αλληλεπίδραση μεταξύ των έξι miRNA SNPs και η έκθεση αναθυμιάσεων μαγειρικό λάδι στην ανάπτυξη του καρκίνου του πνεύμονα ή αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα μεταξύ των κινεζικών μη καπνιστών γυναικείο πληθυσμό. Ωστόσο, περαιτέρω ποσοτικές αναλύσεις τόσο αθροιστική κλίμακα και την πολλαπλασιαστική κλίμακας έδειξαν ότι καμία στατιστικά σημαντική αλληλεπίδραση μεταξύ miRNA SNPs και το μαγείρεμα έκθεση αναθυμιάσεων του πετρελαίου βρέθηκαν στον καρκίνο του πνεύμονα ή αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα μεταξύ των μη καπνιστών γυναίκες στην Κίνα.

Στην παρούσα μελέτη , τα άτομα με την έκθεση με το μαγείρεμα αναθυμιάσεων του πετρελαίου είχαν 1,52 φορές αυξημένο κίνδυνο να αναπτύξουν καρκίνο του πνεύμονα, η οποία ήταν σύμφωνη με τις προηγούμενες εκθέσεις μας [14-18]. Υπάρχουν μελέτες που δείχνουν ότι το μαγείρεμα συμπυκνώματα αναθυμιάσεις του πετρελαίου μπορεί να προκαλέσει βλάβες του DNA και η επιρροή του DNA διασυνδέσεις σε μια ορισμένη συγκέντρωση [24-25]. Tung et al βρήκαν ότι η έκθεση με το μαγείρεμα αναθυμιάσεων του πετρελαίου θα μπορούσε να αναστείλει την ανάπτυξη των κυττάρων και προκαλούν οξειδωτικό στρες στα πνευμονικά επιθηλιακά κύτταρα [26]. Υπάρχουν και άλλες μελέτες που προτείνουν τον σημαντικό ρόλο των μαγειρικών ελαίων αναθυμιάσεων έκθεση σε κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα μεταξύ των μη καπνιστών γυναικών [27-29]. Παραπάνω ενδείξεις υποστηρίζουν τους σημαντικούς ρόλους του λαδιού μαγειρέματος αναθυμιάσεων έκθεσης στην ανάπτυξη του καρκίνου του πνεύμονα.

έχει δημιουργηθεί μια ισχυρή σύνδεση μεταξύ αλλαγμένη miRNAs, είτε τη δομή αλλαγές ή έκφραση των ώριμων miRNA, και τον κίνδυνο του καρκίνου, ανοίγοντας μια νέα λεωφόρο έρευνας για μοριακών μηχανισμών της ανάπτυξης του καρκίνου [30]. Αν και βιολογικές λειτουργίες τους παραμένουν σε μεγάλο βαθμό ασαφής, υπάρχουν μελέτες που αποδεικνύουν ότι miRNAs μπορεί να λειτουργήσει ως ογκογονίδια ή /και ογκοκατασταλτικά γονίδια [30-34]. SNPs ή μεταλλάξεων των miRNAs μπορεί να επηρεάσει την περιουσία τους μέσα από την αλλαγή της έκφρασης των miRNAs ή /και ωρίμανση, και έτσι μπορεί να συμβάλει στον κίνδυνο καρκίνου [9,35]. Οι ερευνητές προβλέπουν ότι miRNAs θα μπορούσαν να γίνουν ιδανικοί υποψήφιοι για τον παράγοντα του καρκίνου του προδιάθεση, επειδή η μικρή μεταβολή τους μπορεί να επηρεάσει χιλιάδες των mRNA στόχου και να οδηγήσει σε ποικίλες λειτουργικές συνέπειες. Ωστόσο, ο ρόλος των γενετικών παραλλαγών σε miRNAs στην ευαισθησία του καρκίνου είναι ως επί το πλείστον άγνωστη.

Οι περισσότερες από τις μελέτες αιτιολογικός του καρκίνου δεν ανέλυσε το γονίδιο-περιβάλλοντος αλληλεπίδραση, η οποία θεωρείται πιο σημαντική στην αιτιολογία του καρκίνου, ή μόνο ανέλυσε την πολλαπλασιαστική αλληλεπίδραση με την προσθήκη του όρου αλληλεπίδρασης στην λογιστική παλινδρόμηση. Μια συντακτική δήλωσαν ότι τα στατιστικά αλληλεπίδραση είναι αρκετά διαφορετική από βιολογικές αλληλεπιδράσεις, ο πρώην μπορεί να αντανακλά είτε την αναχώρηση από την προσθετικότητα ή multiplicativity ανάλογα με το επιλεγμένο στατιστικό μοντέλο και το βαθμό της βιολογικής αλληλεπίδρασης μεταξύ των παραγόντων κινδύνου μετράται ως η απόκλιση από την προσθετικότητα και όχι ως απόκλιση από multiplicativity [36]. Το μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης είναι ίσως η πιο συχνά χρησιμοποιούμενη στατιστικό μοντέλο σε επιδημιολογικές αναλύσεις με τη μέρα, όμως λογιστικής παλινδρόμησης είναι εγγενώς πολλαπλασιαστική, γι ‘αυτό χρησιμοποιείται ευρέως μόνο αναλύσει πολλαπλασιαστική αλληλεπίδραση. Έτσι, ένας σημαντικός όρος αλληλεπίδρασης σε ένα τέτοιο μοντέλο υπονοεί μια πολλαπλασιαστική σχέση μεταξύ της νόσου και την παρουσία ενός όρου αλληλεπίδρασης συνεπάγεται απόκλιση από multiplicativity, παρά από προσθετικότητα. Ως εκ τούτου, ο όρος αλληλεπίδρασης σε λογιστικό μοντέλο δεν έχει άμεση δυνατότητα να δηλώσει εάν ή όχι βιολογική αλληλεπίδραση είναι παρούσα. Από την άλλη πλευρά, η βιολογική αλληλεπίδραση μπορεί ακόμα να διερευνηθούν από τα αποτελέσματα μιας μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης, αλλά αυτό προϋποθέτει ότι το μοντέλο καθορίζεται με έναν ειδικό τρόπο και ότι η ανάλυση γίνεται επαρκώς. Andersson et al. περιγράφουν πώς ένα μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης μπορεί να οριστεί για την παραγωγή των προϊόντων που είναι αναγκαία για την αξιολόγηση της βιολογικής αλληλεπίδρασης [23].

Στην παρούσα μελέτη, τα αποτελέσματα της ανάλυσης αλληλεπίδρασης για τη σύγκριση ΕΑΠ διαφορετικών συνδυασμό γονιδίων-περιβάλλοντος από cross-over αναλύσεις έδειξαν ότι σε πέντε miRNA SNPs ο συνδυασμός των γονοτύπων του κινδύνου με παράγοντα κινδύνου (μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις έκθεσης) συνέβαλε σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, γεγονός που υποδηλώνει μπορεί να υπάρχει αλληλεπίδραση γονιδίων-περιβάλλοντος. Ωστόσο, περαιτέρω στατιστικές αναλύσεις για το πρόσθετο αλληλεπίδρασης και πολλαπλασιαστική αλληλεπίδραση έδειξαν ότι αλληλεπιδράσεις μεταξύ miRNA SNPs και της έκθεσης αναθυμιάσεων λαδιού μαγειρέματος δεν ήταν σημαντικές, είτε από multiplicativity χρησιμοποιώντας όρος αλληλεπίδρασης της λογιστικής παλινδρόμησης ή από προσθετικότητα από Andersson et al. Μέθοδο. Η πιθανή αιτία είναι ότι το μέγεθος του δείγματος της παρούσας μελέτης είναι πολύ μικρό για να ληφθούν τα στατιστικά σημαντικά αποτελέσματα. Έτσι μεγαλύτερο πληθυσμό του καρκίνου του πνεύμονα είναι απαραίτητη για να ελέγξει το συμπέρασμα στο μέλλον. Επειδή είναι απλά μια στατιστική εκτίμηση, περαιτέρω μελέτες σχετικά με τη βιολογική εγκυρότητά τους είναι απαραίτητα.

Αυτή η μελέτη είναι η πρώτη μελέτη για την αξιολόγηση της αλληλεπίδρασης γονιδίων-περιβάλλοντος μεταξύ miRNAs SNPs και περιβαλλοντικών παραγόντων κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνου του πνεύμονα στις τόσο πολλαπλασιαστική και πρόσθετο κλίμακα. Αν και τα αποτελέσματα ήταν στατιστικά σημαντική, η ιδέα και η μέθοδος για την αξιολόγηση συνολικά αλληλεπίδραση μεταξύ των δύο παραγόντων είναι πολύτιμες και έχουν ενδεικτική σημασία για τις μελλοντικές παρόμοιες μελέτες. Οι πιο σημαντικοί περιορισμοί της μελέτης ήταν το μικρό μέγεθος του δείγματος και η απουσία άλλων παραγόντων, συμπεριλαμβανομένων πιθανών συνεισφερόντων παραγόντων στις αναλύσεις. Κατά συνέπεια, οι μελλοντικές μελέτες με μεγαλύτερο δείγμα, το μέγεθος του πληθυσμού του καρκίνου του πνεύμονα, λαμβάνοντας υπόψη περισσότερους παράγοντες αντίκτυπου και σχετικά με τη βιολογική εγκυρότητά τους που απαιτούνται για την επαλήθευση της συμπέρασμα.

Εν κατακλείδι, η μελέτη αυτή πρώτον ανέφεραν την αλληλεπίδραση των πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου σε miRNAs και ο περιβαλλοντικός παράγοντας κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνου του πνεύμονα, δηλώνοντας υπήρχαν στατιστικά σημαντική αλληλεπίδραση. Η μελέτη μας θα έχουν κάποια θετική σημασία στην κατανόηση της παθογένειας του καρκίνου του πνεύμονα και στο μέλλον ανάλυση της αλληλεπίδρασης.

Συμπεράσματα

Οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ miRNA SNPs και το μαγειρικό λάδι αναθυμιάσεις έκθεση προτείνεται από ΕΑΠ της διαφορετικός συνδυασμός δεν ήταν στατιστικά σημαντικές.

Υποστήριξη Πληροφορίες

πίνακα S1. . Ο συνδυασμός των SNPs στο miRNAs και μαγειρικό λάδι έκθεση σχετικά με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα και το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα στην κινεζική Απαγορεύεται το κάπνισμα σε γυναικείο πληθυσμό κάτω από άλλες συγκρίσεις

doi: 10.1371 /journal.pone.0128572.s001

(DOC)

S2 πίνακα. Αλληλεπίδραση μεταξύ των SNPs σε miRNAs και το μαγείρεμα, την έκθεση του πετρελαίου για την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική Απαγορεύεται το κάπνισμα σε γυναικείο πληθυσμό κάτω από άλλες συγκρίσεις

doi:. 10.1371 /journal.pone.0128572.s002

(DOC)

Ευχαριστίες

Είμαστε ευγνώμονες στους ασθενείς για τη συμμετοχή τους. Θα ήθελα να ευχαριστήσω όλο το προσωπικό στα νοσοκομεία στη μελέτη μας. Η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Νο 81102194).

You must be logged into post a comment.