Αφηρημένο

Σε καρκίνο του παχέος εντέρου (CRC), χρωμοσωμική αστάθεια (CIN) είναι συνήθως μελετήθηκε χρησιμοποιώντας τη συγκριτική γονιδιωματική υβριδισμού (CGH) συστοιχίες. Μελετήσαμε ζεύγη (όγκου και περιβάλλοντα υγιή) κατεψυγμένα ιστό από 86 ασθενείς CRC χρησιμοποιώντας Infinium με βάση σειρά SNP Illumina του. Η μέθοδος αυτή μας επέτρεψε να μελετήσουμε CIN στην CRC, με ταυτόχρονη ανάλυση του αριθμού αντιγράφων (ΣΟ) και Β-αλληλόμορφο συχνότητας (BAF) – μια αναπαράσταση της σύνθεσης αλληλομόρφων. Τα στοιχεία αυτά μας βοήθησαν να ανιχνεύσει μονο-αλληλομόρφων και bi-αλληλομόρφων ενισχύσεις /διαγραφή, αντιγραφή ουδέτερη απώλεια της ετεροζυγωτίας, και τα επίπεδα των μωσαϊκισμού για μικτών κυτταρικών πληθυσμών, μερικές από τις οποίες δεν μπορεί να εκτιμηθεί με άλλες μεθόδους που δεν μετρούν BAF. Εμείς εντοπίστηκαν συσχετισμοί μεταξύ ανωμαλιών ΣΟ και διαφορετικών φαινοτύπων CRC (ιστολογική διάγνωση, την τοποθεσία, το βαθμό του όγκου, το στάδιο, MSI και η παρουσία της λέμφου μετάσταση στους λεμφαδένες). Δείξαμε κοινά στοιχεία μεταξύ των περιφερειών της αλλαγής ΣΟ που παρατηρήθηκαν σε CRC και τις περιοχές που αναφέρθηκαν σε προηγούμενες μελέτες άλλων στερεών καρκίνων (π.χ. ενισχύσεις του 20q, 13q, 8q, 5p και τις διαγραφές των 18q, 17ρ και 8ρ). Από Θεραπευτικές βάση δεδομένων στόχο, εντοπίσαμε σχετικών φαρμάκων, με στόχο να τα γονίδια που βρίσκονται σε αυτές τις περιοχές με τις αλλαγές ΣΟ, εγκριθεί ή σε δοκιμές για άλλους καρκίνους και κοινές ασθένειες. Αυτά τα φάρμακα μπορεί να θεωρηθεί για μελλοντικές θεραπευτικές δοκιμές στην CRC, με βάση την εξατομικευμένη κυτταρογενετική διάγνωση. Βρήκαμε επίσης πολλές περιοχές, που φιλοξενούν γονίδια, τα οποία επί του παρόντος δεν στοχεύουν με κάθε χρήσιμη φάρμακα που μπορεί να θεωρηθεί για μελλοντικές μελέτες ανακάλυψη φαρμάκων. Η μελέτη μας δείχνει την εφαρμογή των συστοιχιών SNP υψηλής πυκνότητας για την κυτταρογενετική μελέτη CRC και πιθανή χρησιμότητα της για την εξατομικευμένη θεραπεία

Παράθεση:. Γιασεμί F, Rahaman R, Dodsworth C, Roy S, Paul R, Ραζά M, et al. (2012) ένα γονιδίωμα-Wide Μελέτη Κυτταρογενετική Αλλαγές στον Καρκίνο του παχέος Χρησιμοποιώντας SNP μικροσυστοιχίες: Ευκαιρίες για το μέλλον της εξατομικευμένης θεραπείας. PLoS ONE 7 (2): e31968. doi: 10.1371 /journal.pone.0031968

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 16 Σεπτεμβρίου, 2011? Αποδεκτές: 19 του Ιανουαρίου, 2012? Δημοσιεύθηκε: 20 Φεβρουαρίου 2012