Αφηρημένο

Ιστορικό

Οι πολυμορφισμοί σε γονίδια που εμπλέκονται στο μεταβολισμό του φολικού οξέος και ομάδες μεθυλίου έχουν εμπλακεί με τον κίνδυνο του πεπτικού καρκίνου του συστήματος. Μεθειονίνη συνθάσης (MTR) παίζει ένα κεντρικό ρόλο στην φολικού μεταβολισμό, επηρεάζοντας έτσι μεθυλίωση του DNA. Η συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού A2756G (rs1805087) σε MTR και το πεπτικό ευαισθησίας στον καρκίνο του συστήματος ήταν ασυνεπής σε προηγούμενες μελέτες. Για να διερευνήσουν αυτή την ασυνέπεια, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση.

Μέθοδοι

Βάσεις δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων Pubmed, EMBASE, ISI Web of Science και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) έχουν έψαξε να βρει σχετικές μελέτες. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. Πιθανές πηγές ετερογένειας αξιολογήθηκαν επίσης με ανάλυση υποομάδας και μετα-παλινδρόμησης.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 29 άρθρων με 15.368 ασθενείς και 23.959 έλεγχοι είχαν συμπεριληφθεί. Εμείς δεν βρήκε καμία συσχέτιση μεταξύ MTR A2756G πολυμορφισμό και πεπτικού καρκίνου του συστήματος του συνολικού πληθυσμού (G αλληλόμορφο: OR = 1.03, 95% CI = 0,98-1,09, P = 0,25? Κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.03, 95% CI = 0,97 – 1,10, P = 0,33? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1,02, 95% CI = 0,89 – 1,17, P = 0,79). Στις στρωματοποιημένη ανάλυση ανάλογα με τον τύπο του καρκίνου, το μέγεθος του δείγματος και η μέθοδος προσδιορισμού του γονότυπου, καμία απόδειξη οποιασδήποτε ένωσης γονιδίου-ασθένεια λήφθηκε σε όλες σχεδόν τις γενετικές μοντέλα. Ωστόσο, το οριακό σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν για την Ανατολική Ασία και μελέτες νοσοκομείο.

Συμπεράσματα

Αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού MTR A2756G και του πεπτικού συστήματος κίνδυνο καρκίνου .

Παράθεση: Zhao Υ, Chen Ζ, Ma Υ, Xia Q, Zhang F, Fu D, et al. (2013) Η έλλειψη σύνδεσης μεταξύ συνθάση μεθειονίνης A2756G Πολυμορφισμός και του πεπτικού συστήματος Καρκίνος του κινδύνου: Στοιχεία από 39.327 Θέματα. PLoS ONE 8 (4): e61511. doi: 10.1371 /journal.pone.0061511

Επιμέλεια: Pal Bela Szecsi, Gentofte Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο, η Δανία

Ελήφθη: 27 Σεπτεμβρίου 2012? Αποδεκτές: 10 του Μαρτίου 2013? Δημοσιεύθηκε: 16 Απρίλη του 2013

Copyright: © 2013 Zhao et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από μια επιχορήγηση από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81201535), Ίδρυμα Shanghai Φυσικών Επιστημών (12ZR1436000), Γνώση Πρόγραμμα Καινοτομίας της Σαγκάης Ινστιτούτα Βιολογικών Επιστημών (2012KIP203) και σύνδεσης Προώθησης Νέων καινοτομία, κινεζική Ακαδημία Επιστημών. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

προβλέπεται ότι μέχρι το 2020, ο αριθμός των νέων περιπτώσεων καρκίνου στον κόσμο θα αυξηθεί σε περισσότερα από 15 εκατομμύρια, με τους θανάτους αυξάνεται σε 12 εκατομμύρια [1]. Πεπτικό σύστημα καρκίνοι είναι οι πιο κοινές κακοήθεις όγκους σε όλο τον κόσμο, με τρία εκατομμύρια νέες περιπτώσεις κάθε χρόνο (σχεδόν το 30% όλων των καρκίνων) [1], [2]. Η συχνότητα εμφάνισης του πεπτικού συστήματος καρκίνων θα αυξάνεται συνεχώς, κυρίως λόγω των τάσεων σε γαστρικό καρκίνο (GC) και ορθοκολικό καρκίνο (CRC) [2]. Στις ευρωπαϊκές χώρες, υπήρχαν περίπου 0.910.000 νέα κρούσματα του πεπτικού συστήματος καρκίνων (436.000 CRC και 149.000 GC) και 0.590.000 θάνατοι από αυτά τα προβλήματα της υγειονομικής περίθαλψης το 2008 [3]. Στην πλειονότητα των αναπτυσσόμενων χωρών, οι ανοδικές τάσεις των ποσοστών θνησιμότητας για το πεπτικό σύστημα καρκίνους επίσης έχουν παρατηρηθεί [4], [5].

Η μεθυλίωση του υποκινητή που σχετίζεται με τα νησιά CpG είναι ένα καλά τεκμηριωμένο επιγενετικής τροποποίησης , ενεργώντας ως μηχανισμός για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης που συνδέονται με την ανάπτυξη του καρκίνου [6], [7]. Η ανώμαλη μεθυλίωση του υποκινητή του γονιδίου καταστολής του όγκου ή την επιδιόρθωση του DNA έχει ανιχνευθεί σε πολλούς διαφορετικούς τύπους καρκίνου [8], [9]. Συνθάση μεθειονίνης, μια βιταμίνη Β 12 εξαρτώμενο ένζυμο, παίζει σημαντικό ρόλο στο μεταβολισμό του φολικού οξέος [10]. Είναι καταλύει την επαναμεθυλίωση της ομοκυστεΐνης σε μεθειονίνη και η ταυτόχρονη απομεθυλίωση 5-μεθυλοτετραϋδροφολικό σε τετραϋδροφυλλικό. Η μεθειονίνη συνθάσης είναι κρίσιμη για τη διατήρηση επαρκών ενδοκυτταρικών μεθειονίνη, ένα απαραίτητο αμινοξύ και τον πρόδρομο του S-αδενοσυλμεθειονίνης (SAM). SAM είναι μια κρίσιμη δότης ομάδας μεθυλίου που εμπλέκονται σε περισσότερες από 100 αντιδράσεις μεθυλίωσης συμπεριλαμβανομένων μεθυλίωσης του DNA. Πρόσφατα, ένας πολυμορφισμός στο γονίδιο συνθάση μεθειονίνης (MTR) (2756A → G, rs1805087), με αποτέλεσμα την υποκατάσταση του ασπαρτικού οξέος (D919) με γλυκίνη (G), ταυτοποιήθηκε σε ασθενείς με ανεπάρκεια συνθάση μεθειονίνης και βρέθηκε να είναι πολυμορφικές μεταξύ υγιών μαρτύρων [11]. Επιπλέον, Goode et al. πρότεινε μια μέτρια αντίστροφη σχέση μεταξύ 2756GG πολυμορφισμού και των επιπέδων ομοκυστεΐνης, υποδεικνύοντας αυξημένη ενζυματική δραστικότητα της παραλλαγής γονότυπο [12]. Επιπλέον, ένα μειωμένο επίπεδο ομοκυστεΐνης συνδέθηκε με το γονότυπο GG σε ορισμένες μελέτες [13] – [15], που οδηγεί στην υπόθεση ότι αυτός ο πολυμορφισμός μπορεί να έχει την ενεργοποίηση επίδραση επί του ενζύμου που αυξάνει την μετατροπή της ομοκυστείνης σε μεθειονίνη. Επιπλέον, Paz et al. ανέφερε ότι τα άτομα που διεξάγεται 2756GG έδειξε μια χαμηλότερη συχνότητα CpG νησί υπερμεθυλίωση σε ογκοκατασταλτικά γονίδια [16].

Παρά την βιολογική αληθοφάνεια του MTR λειτουργικής πολυμορφισμό ως ρυθμιστής του πεπτικού ευαισθησίας στον καρκίνο του συστήματος, στο παρελθόν αντιφατικά αποτελέσματα έχουν εμφανιστεί στη βιβλιογραφία. Δημοσιευμένες μελέτες έχουν γενικά περιορισμένη όσον αφορά το μέγεθος του δείγματος και εθνοτική πολυμορφία, και των μεμονωμένων μελετών μπορεί να έχει αρκετή ισχύ για να επιτευχθεί μια ολοκληρωμένη και αξιόπιστη συμπέρασμα. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήθηκε μια μετα-ανάλυση των δημοσιευμένων μελετών για να διευκρινιστεί αυτό το ασυνέπεια και να δημιουργήσει μια ολοκληρωμένη εικόνα της σχέσης μεταξύ του MTR και το πεπτικό σύστημα του καρκίνου.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και Επιλεξιμότητα οι σχετικές μελέτες

μελέτες γενετικής συσχέτισης που δημοσιεύθηκε πριν από το τέλος του Σεπτέμβρη, 2012 στις πεπτικού καρκίνου σύστημα και πολυμορφισμός στο γονίδιο MTR ταυτοποιήθηκαν μέσω μιας αναζήτησης της PubMed, EMBASE, ISI Web of Science, και CNKI (Υποδομή κινεζική Εθνική Γνώση ) χωρίς περιορισμούς γλώσσα χρησιμοποιώντας τις ακόλουθες λέξεις-κλειδιά και υπό όρους: «μεθειονίνη συνθετάση» ή «MTR», «πολυμορφισμός» ή «παραλλαγή» και «καρκίνος» ή «καρκίνωμα» ή «νεόπλασμα». Οι τίτλοι και οι περιλήψεις των πιθανών άρθρα ελέγχθηκαν για να προσδιοριστεί η σημασία τους, και είχαν αποκλειστεί τυχόν σαφώς άσχετο μελέτες. Τα πλήρη κείμενα των υπόλοιπων άρθρων διαβάστηκαν να καθοριστεί εάν περιείχε πληροφορίες σχετικά με το θέμα των τόκων. Επιπλέον, λίστες αναφοράς του πρωτογενούς μελέτες και άρθρα ανασκόπησης ήταν επίσης αναθεωρηθεί με χειροκίνητη αναζήτηση για τον εντοπισμό πρόσθετων σχετικών εκδόσεων. Μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση έπρεπε να πληρούν όλα τα ακόλουθα κριτήρια: (1) πρωτότυπα έγγραφα που περιέχουν ανεξάρτητα στοιχεία, (2) μελέτες ασθενών-μαρτύρων ή ομάδα, (3) συσχέτιση μεταξύ MTR πολυμορφισμό και το πεπτικό κίνδυνο καρκίνου σύστημα διερευνηθεί (4 ) τον προσδιορισμό των περιπτώσεων καρκίνου του πεπτικού συστήματος επιβεβαιώθηκε ιστολογικά ή παθολογικά και (5) αναλογία πληροφορίες κατανομή γονότυπο ή πιθανοτήτων (OR) με 95% διάστημα εμπιστοσύνης του (CI) και P-αξίας. Οι κυριότεροι λόγοι για τον αποκλεισμό των μελετών ήταν (1) επικάλυψη δεδομένων και (2) την περίπτωση μόνο μελέτες και άρθρα ανασκόπησης.

Data Extraction

Για κάθε μελέτη, τα ακόλουθα δεδομένα εξήχθησαν ανεξάρτητα από δύο συγγραφείς: ο πρώτος συγγραφέας, έτος δημοσίευσης, κριτήριο τη διάγνωση, την ηλικία, το φύλο, την εθνικότητα, Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) κατάσταση, η μέθοδος του γονότυπου, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή του ελέγχου, ο συνολικός αριθμός των υποθέσεων και των ελέγχων, MTR πολυμορφισμός μετράει γονότυπο και τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ περιβαλλοντικών παραγόντων ή γονιδίων. Τα αποτελέσματα συγκρίθηκαν και διαφωνίες συζητήθηκαν μεταξύ όλων των συγγραφέων και να επιλυθούν με κοινή συναίνεση. Αν υπάρχουν πολλές δημοσιευμένες αναφορές από τον ίδιο πληθυσμό της μελέτης ήταν διαθέσιμα, συμπεριλάβαμε μόνο το ένα με το μεγαλύτερο μέγεθος του δείγματος και το πιο λεπτομερείς πληροφορίες. Μελέτες με διαφορετικές εθνοτικές ομάδες θεωρήθηκαν ως μεμονωμένες μελέτες για τις αναλύσεις μας.

Στατιστική Ανάλυση

Απόκλιση από την ισορροπία Hardy-Weinberg εξετάστηκε από Chi-square test με 1 βαθμό ελευθερίας. αναλογία αργού Αποδόσεις (ΕΑΠ) με τα αντίστοιχα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ του πολυμορφισμού MTR γονίδιο A2756G και το πεπτικό τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του συστήματος. Για τον πολυμορφισμό A2756G, διερευνήσαμε τη συσχέτιση μεταξύ των γενετικών παραλλαγών και το πεπτικό τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στο πολλαπλασιαστικό μοντέλο (G-αλληλόμορφο εναντίον A-αλληλόμορφο), κυρίαρχη (ΑΑ + AG έναντι GG) και υπολειπόμενη γενετική μοντέλο (ΦΕΚ έναντι ΑΑ + AG ). Μεταξύ μελέτη ετερογένεια μετρήθηκε χρησιμοποιώντας πρότυπη δοκιμή Q-στατιστική [17]. Τυχαίων δράσεων και περίληψη των μέτρων σταθερού αποτελέσματος υπολογίστηκαν ως αντίστροφος-διακύμανση σταθμισμένος μέσος όρος του λόγου πιθανοτήτων καταγραφής [18]. Τα αποτελέσματα της περίληψης τυχαίων δράσεων αναφέρθηκαν στο κείμενο, διότι λαμβάνει υπόψη τη διακύμανση μεταξύ των μελετών. Το τεστ Z χρησιμοποιήθηκε για να προσδιοριστεί η σημασία του ομαδοποιημένου OR. ανάλυση των υποομάδων στρωματοποιημένη από το χαρακτηριστικό της μελέτης, σύμφωνα με την εθνικότητα (Ανατολικής Ασίας, του Καυκάσου και άλλα), ο σχεδιασμός της μελέτης (νοσοκομείο με βάση vs βάσει πληθυσμού) το μέγεθος του δείγματος (≥500 ή & lt? 500 περιπτώσεις), τη μέθοδο προσδιορισμού του γονότυπου (RFLP vs άλλοι) και τον τύπο του καρκίνου (ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του οισοφάγου, γαστρικό καρκίνο, καρκίνο του παγκρέατος και ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα), αντίστοιχα. Επιπλέον, η ανάλυση μετα-παλινδρόμησης έγινε για να ερευνήσει επτά πιθανές πηγές ετερογένειας συμπεριλαμβανομένων εθνικότητα, το μέγεθος του δείγματος, την πηγή των ελέγχων, η μέθοδος του γονότυπου, τον τύπο του καρκίνου, τη διανομή σεξ μεταξύ ασθενών και μαρτύρων, η μέση ηλικία των υποθέσεων και των ελέγχων [19]. προκατάληψη δημοσίευση ερευνήθηκε από οικόπεδο χοάνη. οικόπεδο χοάνη ασυμμετρία εκτιμήθηκε με τη μέθοδο της δοκιμής γραμμικής παλινδρόμησης Egger [20]. ανάλυση ευαισθησίας, η οποία καθορίζει την επιρροή των μεμονωμένων μελετών σχετικά με την συγκεντρωτική εκτίμηση, προσδιορίστηκε με τη διαδοχική αφαίρεση κάθε μελέτη και επανυπολογισμός της συγκεντρώνονται σχετικό κίνδυνο και το 95% διάστημα εμπιστοσύνης. Οι στατιστικές αναλύσεις έγιναν με το Stata έκδοση λογισμικού 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX). Το ποσοστό σφάλματος τύπου Ι ορίστηκε στο 0,05. Όλα τα P-τιμές ήταν δύο-ουρά.

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά Σπουδών

Η συνδυασμένη αναζήτηση απέδωσε 217 αναφορές. διαδικασία επιλογής Μελέτη δείχθηκε στο Σχήμα 1. Τέλος, συνολικά 29 μελέτες με 34 σύνολα δεδομένων περιλήφθηκαν τελικώς τη συμμετοχή 15.368 ασθενείς και 23.959 ελέγχους [15], [21] – [48]. Τα λεπτομερή χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Από τις υποθέσεις, 82% Καυκάσιοι, 16% ήταν Ανατολικής Ασίας και 2% ήταν άλλη εθνοτική καταγωγή. Η κατανομή των γονότυπων στους ελέγχους ήταν σύμφωνο με Hardy-Weinberg ισορροπία σε όλες τις μελέτες για MTR A2756G πολυμορφισμό.

Η

Σύνθεση Δεδομένων Οι ποσοτικοί

Όπως φαίνεται στο Σχήμα 2, η G διανομή αλληλόμορφο του πολυμορφισμού A2756G ποικίλλει μεταξύ των ελέγχων σε διαφορετικές εθνικότητες, που κυμαίνονται 0,06 – 0,25. Για τους ελέγχους της Ανατολικής Ασίας, η συχνότητα G αλληλόμορφο ήταν 0,14 (95% CI: 0,11 – 0,18), η οποία ήταν χαμηλότερη από ότι στους Καυκάσιους μάρτυρες (0,20? 95% CI: 0,18 – 0,22), υποδεικνύοντας μια σημαντική διαφορά μεταξύ Ανατολής Ασιάτες, σε σύγκριση με Καυκάσιους (P = 0,003).

η

σε γενικές γραμμές, δεν υπήρχε καμία ένδειξη ότι υπάρχει συσχετισμός μεταξύ του αυξημένου κινδύνου πεπτικού καρκίνου συστήματος και του πολυμορφισμού A2756G σε διαφορετικά γενετικά μοντέλα, όταν όλες οι επιλέξιμες μελέτες συγκεντρώνονται σε ένα μετα-ανάλυση. Σύμφωνα με το μοντέλο τυχαία επίδραση, η ανά-αλληλόμορφο συνολική Ή της παραλλαγής G για τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος ήταν 1,03 [95% CI: 0,98-1,09,

P

(Ζ) = 0.25,

P

(Q) = 0,05], με τα αντίστοιχα αποτελέσματα σύμφωνα με κυρίαρχο και υπολειπόμενη γενετική μοντέλα των 1,03 [95% CI: 0,97 – 1,10,

P

(Ζ) = 0.33,

P

(Q) = 0,06] και 1,02 [95% CI:. 0,89 – 1,17,

P

(Ζ) = 0.79,

P

(Q) = 0.25], αντίστοιχα

Αυτή η ανάλυση βασίζεται σε ομαδοποίηση των δεδομένων από έναν αριθμό διαφορετικών εθνικών πληθυσμών. Όταν διαστρωμάτωση για την εθνότητα, μια Ή 1,00 (95% CI: 0,94 – 1,05, P = 0,88) και 1,13 (95% CI: 01.02 – 01.25, Ρ = 0.02) είχε ως αποτέλεσμα για το G αλληλόμορφο, μεταξύ των Καυκασίων και την Ανατολική Ασία, αντίστοιχα. Στην στρωματοποιημένη ανάλυση ανά τύπο καρκίνου, δεν αύξησε σημαντικά τον κίνδυνο καρκίνου αποτελέσματα για καρκίνο του παχέος εντέρου, ο καρκίνος του οισοφάγου, γαστρικός καρκίνος, καρκίνος του παγκρέατος και το ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα σε όλες τις γενετικά μοντέλα (Σχήμα 3). Με την εξέταση υποομάδες πηγή ελέγχου, το OR ήταν 1,01 (95% CI: 0,95 – 1,07, P = 0,78) σε ελέγχους βάσει πληθυσμού, σε σύγκριση με 1,13 (95% CI: 01.02 – 01.25, Ρ = 0,02) σε ελέγχους στο νοσοκομείο. Επιπλέον, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ του γονότυπου του MTR A2756G και του πεπτικού συστήματος κίνδυνο καρκίνου στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανάλογα με το μέγεθος του δείγματος ή τη μέθοδο προσδιορισμού του γονότυπου (Πίνακας 2).

Η

Αν και η επίσημη δοκιμή για την ετερογένεια δεν ήταν σημαντική στη γενική ανάλυση, πραγματοποιήσαμε μετα-παλινδρόμησης όπως υπήρχαν και λόγοι για τους οποίους το εθνικότητα, το μέγεθος του δείγματος, η μέθοδος του γονότυπου, τον τύπο του καρκίνου, και κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών και μαρτύρων (ηλικία, και την κατανομή του φύλου) ως πιθανές πηγές ανομοιογένεια. Στην ανάλυση μετα-παλινδρόμησης, εθνικότητα (P = 0,19), τον τύπο του καρκίνου (P = 0,96), η πηγή των ελέγχων (P = 0,07), η μέση ηλικία των περιπτώσεων (P = 0,62) και ελέγχων (P = 0,72), η μέθοδος προσδιορισμού του γονότυπου ( Ρ = 0,29) και η κατανομή των φύλων μεταξύ περιπτώσεις (Ρ = 0,65) και τους ελέγχους (Ρ = 0,97) δεν συσχετίζεται σημαντικά με το μέγεθος της γενετικής επίδρασης. Αντίθετα, το μέγεθος του δείγματος (P = 0,008) συσχετίστηκε σημαντικά με μεταξύ μελετών ετερογένεια.

Αναλύσεις ευαισθησίας και Δημοσίευση Bias

Για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων της μετα- ανάλυση, πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση ευαισθησίας με διαδοχικά αποκλείονται μεμονωμένες μελέτες. Στατιστικώς παρόμοια αποτελέσματα ελήφθησαν μετά διαδοχικά με εξαίρεση κάθε μελέτη, υποδηλώνοντας σταθερότητα των μετα-αναλύσεις. οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του έγιναν για να αποκτήσετε πρόσβαση στην προκατάληψη δημοσίευση των λογοτεχνιών. Το σχήμα των αγροτεμαχίων χοάνης ήταν συμμετρική ως προς τον πολυμορφισμό (Σχήμα S1). Τα αποτελέσματα στατιστική έδειξε επίσης ένα μη δημοσίευση μεροληψία της τρέχουσας μετα-ανάλυση. (Δοκιμή Egger του:

P

= 0,25)

Συζήτηση

Μεγάλες δείγματος και αμερόληπτη επιδημιολογικές μελέτες των γονιδίων προδιάθεσης πολυμορφισμών θα μπορούσε να προσφέρει διορατικότητα της σχέσης in vivo μεταξύ των υποψηφίων γονιδίων και ασθενειών. σύνθεση μεθειονίνη είναι το πρώτο στάδιο στη σύνθεση του SAM που είναι μια καθολική δότης μεθυλ-ομάδα εμπλέκεται σε αντιδράσεις μεθυλίωσης συμπεριλαμβανομένων DNA μεθυλίωση. Η έκθεση αυτή είναι η πρώτη μετα-ανάλυση που εξετάζει την επίδραση του MTR A2756G πολυμορφισμού για τον κίνδυνο πεπτικού καρκίνου του συστήματος. Συνολικά, η μετα-ανάλυση συμμετέχουν 29 μελέτες για το πεπτικό σύστημα του καρκίνου που παρέχεται 15.368 περιπτώσεις και 23.959 ελέγχους. Τα αποτελέσματα μας έδειξαν ότι ο G αλληλόμορφο του πολυμορφισμού A2756G επί MTR δεν είναι ένας παράγοντας κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνου του πεπτικού συστήματος. Ανάλυση ευαισθησίας έδειξε την ευρωστία των αποτελεσμάτων μας.

Σε μετα-ανάλυση, αξιολόγηση ετερογένεια πάντα διεξάγεται. Έτσι, διεξήχθησαν υποομάδα μετα-αναλύσεις. Σε υποομάδες τύπου καρκίνου, καμία στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ του MTR πολυμορφισμό και διαφορετικών τύπων καρκίνου βρέθηκαν. Ωστόσο, σε μας μετα-ανάλυση, μόνο ένα ή δύο μελέτες ήταν διαθέσιμα για ορισμένες ειδικές μορφές καρκίνου, και είχαν περιορισμένο μέγεθος του δείγματος, και ως εκ τούτου, τα αποτελέσματα μπορεί να είναι άστατος και θα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή. Η μετα-ανάλυση είναι συχνά κυριαρχείται από λίγες μεγάλες μελέτες, η οποία μειώνει σημαντικά τις αποδείξεις από τις μικρότερες μελέτες. Ωστόσο, στην στρωματοποιημένη ανάλυση σύμφωνα με το μέγεθος του δείγματος, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πεπτικού συστήματος ευαισθησίας στον καρκίνο μια MTR βρέθηκαν τόσο σε μεγάλες και μικρές μελέτες για όλα τα γενετικά μοντέλα. Εκτός αυτού, οι μελέτες χρησιμοποιώντας διαφορετική μέθοδο του γονότυπου επίσης να πάρετε συνεπής αρνητικά αποτελέσματα.

Στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, δεν υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν σε Καυκάσιους για τον πολυμορφισμό σε όλες τις γενετικές μοντέλα. Ωστόσο, παρατηρήσαμε μια περιθωριακή σημαντική συσχέτιση μεταξύ πολυμορφισμού A2756G και αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο του πεπτικού συστήματος σε πληθυσμούς της Ανατολικής Ασίας. Υπάρχουν διάφορες εξηγήσεις αυτού του φαινομένου. Πρώτον, ο καρκίνος είναι μια πολύπλοκη ασθένεια και διαφορετικό γενετικό υπόβαθρο μπορεί να προκαλέσει την διαφορά αφού οι κατανομές αλληλόμορφο Ζ του πολυμορφισμού A2756G κυμαίνεται μεταξύ Ανατολικής Ασίας και του Καυκάσου. Επιπλέον, διαφορετικοί πληθυσμοί συνήθως έχουν διαφορετικά πρότυπα ανισορροπία σύνδεσης. Ένας πολυμορφισμός μπορεί να είναι σε στενή σύνδεση με μια άλλη κοντινή παραλλαγή αιτιώδης σε μία εθνοτική πληθυσμού, αλλά όχι σε κάποιο άλλο. MTR A2756G πολυμορφισμός μπορεί να είναι σε στενή σύνδεση με διάφορα κοντινά παραλλαγές αιτιώδης σε διαφορετικούς πληθυσμούς. Επιπλέον, η κλινική ετερογένεια όπως η ηλικία, το φύλο αναλογία, διατροφικές, ετών από την έναρξη και τη σοβαρότητα της νόσου μπορεί επίσης να εξηγήσει την διαφορά. Διαφορετικούς πληθυσμούς μπορεί να έχει διαφορές στην διαιτητική πρόσληψη των θρεπτικών συστατικών, μερικά από τα οποία συμμετέχουν στο σχηματισμό όγκων.

Τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι το οριακό σημαντικά αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πεπτικού συστήματος G φορείς αλληλόμορφο βρέθηκαν ανάμεσα στα νοσοκομείο με βάση μελέτες αλλά όχι σε πληθυσμιακές μελέτες. Αυτός ο λόγος μπορεί να είναι ότι το νοσοκομείο με βάση μελέτες που έχουν κάποιες προκαταλήψεις, διότι οι εν λόγω έλεγχοι μπορούν να αντιπροσωπεύουν μόνο ένα δείγμα της κακής ορίζεται πληθυσμό αναφοράς, και μπορεί να μην είναι αντιπροσωπευτικό του γενικού πληθυσμού πολύ καλά, ιδιαίτερα όταν οι γενότυποι στο πλαίσιο έρευνας που σχετίζονται με το νοσηρές καταστάσεις που μπορεί να έχουν οι έλεγχοι νοσοκομείο. Ως εκ τούτου, χρησιμοποιώντας ένα κατάλληλο και αντιπροσωπευτικό του πληθυσμού με βάση άτομα ελέγχου είναι πολύ σημαντικό να μειωθούν οι προκαταλήψεις σε τέτοιες γενετικές μελέτες σύνδεσης.

Πεπτικό σύστημα του καρκίνου είναι μια εξαιρετικά πολύπλοκη ασθένεια και το ίδιο πολυμορφισμός μπορεί να έχει διαφορετικούς ρόλους σε διαφορετικές περιοχές του όγκου . Ως εκ τούτου, οι περισσότερες μελέτες για ένα συγκεκριμένο τύπο του πεπτικού καρκίνου του συστήματος που απαιτούνται για τον εντοπισμό πιθανών όγκου-ειδικά επίδραση της MTR πολυμορφισμό. Επιπλέον, είναι πιθανό ότι η επίδραση ενός ενιαίου πολυμορφισμού επί πεπτικό κίνδυνο καρκίνου σύστημα μπορεί να είναι πολύ μικρή. Αρκετές άλλες πολυμορφισμοί εντοπίστηκαν, γεγονός που υποδηλώνει ότι μπορεί να υπάρχουν πιθανές συνδυασμένες επιδράσεις αυτών των πολυμορφισμών σε δραστηριότητα MTR [49]. Επιπλέον, η επίδραση της ενιαίας γενετικό παράγοντα για τον κίνδυνο πεπτικού καρκίνου του συστήματος μπορεί να είναι πιο έντονη παρουσία των άλλων κοινών παραγόντων γενετικών ή περιβαλλοντικών κινδύνων, όπως η κατάχρηση αλκοόλ, το κάπνισμα, λοίμωξη από τον ιό της ηπατίτιδας.

Σε σύγκριση με το προηγούμενη μετα-ανάλυση [50], [51], η παρούσα μελέτη είναι πολύ μεγαλύτερο, με περισσότερες από δύο φορές τόσο πολλά πεπτικό περιπτώσεις καρκίνου του συστήματος, όπως την προηγούμενη μετα-ανάλυση. Επιπλέον, αρκετές ανάλυση υποομάδων και μετα-παλινδρόμησης ανάλυση διεξήχθησαν για τον εντοπισμό δυνητικών πηγή ετερογένειας.

Ορισμένοι από τους περιορισμούς αυτής της μετα-ανάλυσης θα πρέπει να αναγνωριστεί. Πρώτον, οι υποομάδα μετα-αναλύσεις σχετικά με τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ MTR γονότυπο και διαφορετικό τύπο όγκου βασίζεται σε ένα μικρό αριθμό μελετών με τις πληροφορίες αυτές διαθέσιμες. Δεύτερον, τα αποτελέσματά μας βασίστηκαν σε αδιόρθωτη εκτιμήσεις, ενώ μια πιο ακριβή ανάλυση πρέπει να διενεργείται εάν υπήρχαν διαθέσιμα στοιχεία σε ατομικό επίπεδο, η οποία θα επιτρέψει την προσαρμογή από άλλους συμπαράγοντες συμπεριλαμβανομένης της κατάστασης πόσιμο, η κατανάλωση τσιγάρων, φυλλικού οξέος και βιταμίνης Β12, το οικογενειακό ιστορικό , περιβαλλοντικών παραγόντων και του τρόπου ζωής [52]. Τρίτον, μόνο δημοσιευμένες μελέτες συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση. Ως εκ τούτου, η προκατάληψη δημοσίευση μπορεί να έχει συμβεί, ακόμη και αν η χρήση ενός στατιστικού τεστ δεν το δείχνουν. Παρά αυτά, το παρόν μας μετα-ανάλυση είχε επίσης κάποια πλεονεκτήματα. Κατ ‘αρχάς, δεν υπάρχει σημαντική σχέση μεταξύ των σπουδών ετερογένεια ανιχνεύθηκαν σε όλα σύγκριση. Δεύτερον, υπάρχουν προκαταλήψεις δημοσίευση βρέθηκαν, υποδεικνύοντας ότι το σύνολο συγκεντρωτικά αποτελέσματα μπορεί να είναι αμερόληπτη.

Για να ολοκληρώσω, μας μετα-ανάλυση δεν υποστηρίζει ένα σύλλογο του A2756G πολυμορφισμού του MTR με το πεπτικό σύστημα του καρκίνου. Για τις μελλοντικές μελέτες συσχέτισης, καλά σχεδιασμένες μελέτες με μεγάλο μέγεθος του δείγματος σε διάφορες πληθυσμιακές ομάδες, περισσότερα είδη πεπτικών καρκίνων σύστημα μαζί με τα απαιτούμενα ιστό-συγκεκριμένες βιοχημικές, λειτουργικές και εκφραστικές χαρακτηριστικά.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1. χοάνη οικόπεδο

Begg του MTR A2756G πολυμορφισμού και του πεπτικού καρκίνου σύστημα

doi:. 10.1371 /journal.pone.0061511.s001

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0061511.s002

(DOC)