Αφηρημένο

Σκοπός

Pigmentosum ξηροδερμίας ομάδα D (

XPD

) κωδικοποιεί για μια ελικάση DNA που εμπλέκονται στην νουκλεοτίδιο επιδιόρθωση εκτομής που αφαιρεί πλατίνα που προκαλείται από βλάβη του DNA. Γενετικοί πολυμορφισμοί του XPD μπορεί να επηρεάσει την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και να οδηγήσει σε ατομικές διαφορές στην έκβαση των ασθενών μετά από χημειοθεραπεία. Η μελέτη αυτή έχει ως στόχο να προσδιορίσει εάν

XPD

πολυμορφισμοί επηρεάζουν την κλινική αποτελεσματικότητα μεταξύ προχωρημένο μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία.

Πειραματικός Σχεδιασμός

353 σταδίου ασθενείς ΙΙΙ-IV NSCLC που λαμβάνουν με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία ως θεραπεία πρώτης γραμμής εντάχθηκαν σε αυτή τη μελέτη. Τέσσερα δυνητικά λειτουργικά

πολυμορφισμών XPD

(

Arg

156Arg

,

Asp

312Asn

,

Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

) ήταν ο γονότυπος με λέιζερ εκρόφησης /ιοντισμού χρόνου πτήσης φασματομετρίας μάζας υποβοηθούμενης από μήτρα ή αλληλουχίας που βασίζεται στην PCR.

Αποτελέσματα

παραλλαγή γονότυπους των

XPD Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

ήταν σημαντικά σχετίζεται με φτωχότερη επιβίωση ΜΜΚΠ (

P

= 0.006, 0.006, 0.014 , αντίστοιχα, από δοκιμασία log-rank). Η πιο κοινή GCA απλότυπος (κατά σειρά

Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

) παρουσίασε επίσης σημαντική επίδραση κίνδυνο για NSCLC επιβίωση (ημερολόγιο κατάταξη

P

= 0,001). Αυτή η επίδραση ήταν πιο κυρίαρχο για τους ασθενείς με νόσο σταδίου ΙΙΙΒ (

P

= 2,21 × 10

-4, δοκιμασία log-rank). Αυξημένους κινδύνους για την παραλλαγή απλοτύπων των

XPD

παρατηρήθηκαν επίσης μεταξύ των ασθενών με κατάσταση απόδοσης του 0-1 και οι ασθενείς με αδενοκαρκίνωμα. Ωστόσο, υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν μεταξύ αυτών των πολυμορφισμών, απάντηση χημειοθεραπεία και PFS.

Συμπεράσματα

Η μελέτη μας παρέχει στοιχεία για την προγνωστική ρόλο του

XPD Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμούς /απλότυπος για NSCLC πρόγνωση σε ανεγχείρητο προχωρημένο NSCLC ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία

Παράθεση:. Wu W, Li H, Wang Η, Zhao Χ, Gao Ζ, Qiao R, et al. (2012) Επίδραση των πολυμορφισμών στο

XPD

στην κλινική έκβαση με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία για τις κινεζικές μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα ασθενείς. PLoS ONE 7 (3): e33200. doi: 10.1371 /journal.pone.0033200

Επιμέλεια: Alfons Navarro, Πανεπιστήμιο της Βαρκελώνης, Ισπανία

Ελήφθη: 9 του Νοεμβρίου του 2011? Αποδεκτές: 6η Φεβρουαρίου του 2012? Δημοσιεύθηκε: 29 Μαρ 2012

Copyright: © 2012 Wu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε εν μέρει από την China National High-Tech Έρευνας και του Προγράμματος Ανάπτυξης Grant (2012AA02A517, 2012AA02A518), Σαγκάη Επιστήμης και Τεχνολογίας Πρόγραμμα Έρευνας (06DZ19501, 09JC1402200, 10410709100), επιστημονική και τεχνολογική σχέδια στήριξης από την επαρχία Jiangsu (BE2010715), Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (30800622) και τη Σαγκάη Θέμα Chief Scientist για τη Δημόσια Υγεία 08GWD07. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

μη μικροκυτταρικός καρκίνος του πνεύμονα (NSCLC) αντιπροσωπεύει περίπου το 80% των πρωτογενών καρκίνων του πνεύμονα, με τους περισσότερους από τους ασθενείς διαγιγνώσκονται σε προχωρημένο στάδιο (στάδιο ΙΙΙ ή IV) [1]. Αν και η χημειοθεραπεία που εμπλέκουν παράγοντες πλατίνας αποτελεί μια από τις πιο κοινές θεραπείες πρώτης γραμμής για τους ασθενείς αυτούς [2], το ποσοστό επιβίωσης 5-ετών παραμένει λιγότερο από το 15% [3]. Κλινική παράγοντες, όπως τα χαρακτηριστικά του ασθενούς (ηλικία και κατάσταση απόδοσης) και επέκταση της νόσου, περίπου χαρακτηρίζεται από το στάδιο, παρέμειναν οι κύριοι προσδιορισμών για πρόγνωση του NSCLC [4]. Ωστόσο, η μεταβλητότητα στα αποτελέσματα έχει ακόμα παρατηρηθεί σε ασθενείς με παρόμοια κλινικά χαρακτηριστικά. Φαίνεται ότι υποδοχής κληρονομικούς παράγοντες μπορεί να έχουν σημαντικό ρόλο στον καθορισμό του αποτελέσματος της θεραπείας για NSCLC, η οποία υπογραμμίζει την ανάγκη εντοπισμού γενετικών δεικτών για τη βέλτιστη εξατομικευμένη θεραπεία [5].

Λαμβάνοντας υπόψη ότι οι παράγοντες πλατίνας που χρησιμοποιείται για χημειοθεραπεία αιτία βλάβη του DNA ή κυτταρικό θάνατο με την ενεργοποίηση των κυττάρων μονοπατιών σηματοδότησης [6], η ικανότητα επιδιόρθωσης κυτταρικό DNA ξενιστή πιθανώς επηρεάζει την έκβαση των ασθενών με NSCLC μετά τη χημειοθεραπεία. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι η μη βέλτιστη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA εντός του όγκου μπορεί να οδηγήσει σε μειωμένη απομάκρυνση των βλαβών του DNA, και ως εκ τούτου αυξάνουν την ευαισθησία σε πλατίνα χημειοθεραπεία με βάση, με αποτέλεσμα την καλύτερη κλινική έκβαση [7] – [9].

επισκευή νουκλεοτιδίων εκτομή (NER) είναι η κύρια οδός για την επισκευή της πλατίνας που προκαλείται DNA διασυνδέσεις σε κύτταρα θηλαστικών [10]. Η

XPD

γονίδιο κωδικοποιεί για μια ΑΤΡ-εξαρτώμενη ελικάση, η οποία μεσολαβεί DNA ξετύλιγμα για την έναρξη της NER [11]. Αρκετές μελέτες έχουν δείξει ότι

XPD

πολυμορφισμούς φαίνεται να έχει επίδραση στην ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA, ενδεχομένως, με την αλλαγή της λειτουργίας της πρωτεΐνης του προϊόντος [12], [13]. Κοινή παραλλαγές στο

XPD

γονίδιο βρέθηκε να συσχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου [14], [15]. Και κλινικές και επιδημιολογικές ενδείξεις υποδεικνύουν περαιτέρω ότι το

XPD Lys

751Gln

πολυμορφισμού συσχετίστηκε σημαντικά με αποτέλεσμα χημειοθεραπεία [16], [17]. Ωστόσο, για τους πολυμορφισμούς του

XPD Arg

156Arg

και

XPD Asp

711Asp

, επιδημιολογικά δεδομένα σχετικά με την κλινική έκβαση των ασθενών με NSCLC είναι ακόμα λιγοστές. Ως εκ τούτου, η προγνωστική σημασία της

XPD

πολυμορφισμοί παραμένει ασαφής.

Το

XPD Asp

312Asn

(rs1799793) και

Lys

751Gln

(rs13181) πολυμορφισμοί είναι nonsynonymous πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs), με αποτέλεσμα να αλλάζει η αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης. Ότι, οι

Arg

156Arg

(rs238406) και

Asp

711Asp

(rs1052555) πολυμορφισμοί είναι και οι δύο σιωπηλές μεταλλάξεις. προηγούμενη μελέτη μας έχει δείξει ότι παραλλαγή γονότυπους του

XPD Arg

156Arg

συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο σοβαρής αιματολογικής τοξικότητας στην κινεζική πληθυσμό Han [18].

Με βάση αυτές τις παρατηρήσεις, υποθέσαμε ότι αυτές οι τέσσερις εν δυνάμει λειτουργική SNPs του

XPD

(στα κωδικόνια 156, 312, 711 και 751) μπορούν να επηρεάσουν NSCLC πρόγνωση. Σε αυτή τη μελέτη, χρησιμοποιώντας δείγματα DNA που λαμβάνεται από μια σειρά ασθενών με NSCLC, αξιολογήσαμε τη συσχέτιση μεταξύ

πολυμορφισμούς XPD

και την επιβίωση σε προχωρημένο NSCLC ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία.

Υλικά και Μέθοδοι

ασθενείς πρόσληψη και την παρακολούθηση

Ο σχεδιασμός της μελέτης και τα θέματα πρόσληψης έχουν περιγραφεί στο παρελθόν [18]. Οι ασθενείς με ανεγχείρητο και ιστολογικά επιβεβαιωμένη σταδίου III έως IV NSCLC είχαν διαδοχικά προσλαμβάνονται μεταξύ Μαρτίου 2005 και Αυγούστου 2008, από τη Σαγκάη στο στήθος Νοσοκομείο στη Σαγκάη της Κίνας. Οι επιλέξιμες ασθενείς για τη μελέτη αυτή ήταν τουλάχιστον 18 ετών και είχαν την υποχρέωση να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: την παρουσία μιας μετρήσιμης βλάβης? Eastern Cooperative Oncology Group κατάσταση απόδοσης (ECOG PS) 0~2 (Η Κατάσταση Απόδοσης Eastern Cooperative Oncology Group Τα κριτήρια που χρησιμοποιούνται για την εκτίμηση πως η ασθένεια επηρεάζει την καθημερινή ικανότητα ζωής των ασθενών με την κατάταξη του σε 5 βαθμούς.) [19]? απόλυτο αριθμό ουδετερόφιλων (ANC) ≥1.5 × 10

9 κύτταρα /L? αιμοπεταλίων ≥100 × 10

9 κύτταρα /L? κρεατινίνης ορού ≤1.5 × ανώτατο όριο φυσιολογικό? Ασπαρτική αμινοτρανσφεράση (AST) και της αμινοτρανσφεράσης της αλανίνης (ALT) ≤1.5 × ανώτατο όριο φυσιολογικό? εκτιμώμενη κάθαρση κρεατινίνης ≥60 mL /min. Οι ασθενείς αποκλείστηκαν εάν είχαν προηγούμενο ιστορικό κακοήθειας εκτός από μη-μελάνωμα καρκίνος του δέρματος, καρκίνωμα

in situ

του τραχήλου της μήτρας, ή ένα ήδη θεραπευτεί όγκου (& gt? 5-y ελεύθερη νόσου επιβίωση)? προηγούμενη χημειοθεραπεία, ακτινοθεραπεία ή χειρουργική επέμβαση? ενεργός συμφορητική καρδιακή ανεπάρκεια, καρδιακή αρρυθμία, ή πρόσφατη (& lt? 3 GA πριν από την ημερομηνία της θεραπείας) έμφραγμα του μυοκαρδίου? κάποια σοβαρή ψυχική διαταραχή? μολυσματική ασθένεια που χρειάζεται ανοσοθεραπεία. Μια γραπτή συγκατάθεση δόθηκε από κάθε ασθενή. Η μελέτη διεξήχθη με την έγκριση της επιτροπής δεοντολογίας αναθεώρηση του νοσοκομείου.

Πριν από τη θεραπεία, όλοι οι ασθενείς έλαβαν αξιολόγησης, συμπεριλαμβανομένης της πλήρους ιατρικού ιστορικού, εξέταση της υγείας, σκοράροντας κατάστασης απόδοσης, δοκιμές ρουτίνας κλινικής βιοχημείας, ακτινογραφίες θώρακα και αξονική τομογραφία του θώρακα και την κοιλιά. Δεδομένα σχετικά με δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά (όπως η ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα, και ιστολογία του όγκου) ελήφθησαν από κλινικές ιατρικά αρχεία με κριτική από τους ογκολόγους. Για την κατάσταση καπνίσματος, εκείνοι που είχαν καπνίσει λιγότερο από ένα τσιγάρο ανά ημέρα και λιγότερο από 1 έτος στη διάρκεια της ζωής τους, ορίστηκαν ως μη-καπνιστές, αλλιώς θεωρήθηκαν καπνιστές. Πληροφορίες σχετικά με τις στατιστικές επιβίωσης συλλέχθηκαν από διάφορες πηγές, συμπεριλαμβανομένων των κλήσεων παρακολούθησης, Κοινωνικής Ασφάλισης Δείκτης θανάτου, και ενδονοσοκομειακή και εξωνοσοκομειακή κλινική ιατρικά αρχεία. Όλοι οι ερευνητές ήταν τυφλοί για το καθεστώς γενετικού πολυμορφισμού των ασθενών.

Όλοι οι ασθενείς που συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη ήταν ακατάλληλο για χρήση και έλαβε την πρώτης γραμμής με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία. Οι χημειοθεραπευτικές αγωγές είχαν ως εξής: ναβελβίνη (25 mg /m

2) την ημέρα 1 και την ημέρα 8 σε συνδυασμό με σισπλατίνη (75 mg /m

2) ή η καρβοπλατίνη (AUC 5) την ημέρα 1, επαναλαμβάνεται κάθε 3 εβδομάδα ? gemicitabine (1.250 mg /m

2) την ημέρα 1 και 8 συν σισπλατίνη (75 mg /m

2) ή καρβοπλατίνη (AUC 5) την 1η ημέρα, επαναλαμβάνεται κάθε 3 εβδομάδες? Ταξόλη (175 mg /m

2) συν σισπλατίνη (75 mg /m

2) ή καρβοπλατίνη (AUC 5) την 1η ημέρα, επαναλαμβάνεται κάθε 3 εβδομάδες? docetaxel (75 mg /m

2) συν σισπλατίνη (75 mg /m

2) την 1η ημέρα, επαναλαμβάνεται κάθε 3 εβδομάδες. Λίγοι ασθενείς έλαβαν άλλη χημειοθεραπεία με βάση την πλατίνα. Όλα τα φάρμακα χημειοθεραπείας χορηγήθηκαν ενδοφλεβίως, και όλες οι θεραπείες ήταν για δύο έως έξι κύκλους. απαντήσεων των ασθενών στη θεραπεία αξιολογήθηκαν μετά από κύκλους πρώτης γραμμής χημειοθεραπεία με τα Κριτήρια Αξιολόγησης απόκρισης σε συμπαγείς όγκους (RECIST) κατευθυντήριες γραμμές για την έκδοση 1.0.

Ένα σύνολο 445 ασθενών με προχωρημένο NSCLC συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη, από τα οποία 353 είχαν εντελώς παρακολουθούνται. Δεν παρατηρήθηκε στατιστικά σημαντική διαφορά δεν παρατηρήθηκε στην κατανομή των δημογραφικών και κλινικά χαρακτηριστικά μεταξύ των ασθενών που συμπεριλήφθηκαν σε αυτή τη μελέτη και εκείνων που δεν το έκαναν (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Ως αποτέλεσμα, η τελική μας ανάλυση περιορίστηκε σε αυτές τις 353 ασθενείς.

SNP Γονοτυπικές

Τα δείγματα αίματος συλλέχθηκαν από κάθε άτομο κατά τη στιγμή της πρόσληψης, και το γονιδιακό DNA εκχυλίζεται χρησιμοποιώντας QIAamp DNA κιτ Maxi (Qiagen GmbH). Η

XPD Arg

156Arg

,

Asp

312Asn

, και

Asp

711Asp

πολυμορφισμοί προσδιορίστηκαν με τη χρήση της πλατφόρμας Sequenom MassARRAY iPlex από τη μήτρα φασματόμετρο -assisted λέιζερ εκρόφησης /ιοντισμού χρόνου πτήσης μάζας όπως περιγράφηκε προηγουμένως [18], και το

Lys

751Gln

εταυτοποιήθη διά προσδιορισμού σειράς PCR-based. Primer ακολουθίες είναι διαθέσιμα κατόπιν αιτήματος. Συνολικά, & gt? 98% των γονότυπων επιτυχώς καθορίζεται για όλα τα SNPs. Για τον έλεγχο της ποιότητας, 5% δείγματα από τα θέματα που επιλέχθηκαν τυχαία για να ξανά-γονότυπο. Όλα τα διπλά δείγματα είχαν γονότυπο συμφωνία του 100%.

Η στατιστική ανάλυση

Hardy-Weinberg ισορροπία ελέγχθηκε για κάθε SNP από την καλοσύνη-of-fit X

2 τεστ. Pearson X

2 τεστ (για τις κατηγορικές μεταβλητές) ή έλεγχος τ (για τις συνεχείς μεταβλητές) χρησιμοποιήθηκε για να συγκρίνει τα δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά. Ασθενείς επίτευξη πλήρους απόκρισης (CR) ή μερική ανταπόκριση (PR) ορίστηκαν ως «αποκριτές», και οι ασθενείς με σταθερή νόσο (SD) ή προοδευτική νόσος ορίστηκαν ως «μη-ανταποκρινόμενοι». Πρόσθετες αναλύσεις έγιναν με την ομαδοποίηση των ασθενών με CR, PR και SD (που ορίζονται ως «οι ασθενείς με κλινικό όφελος») έναντι εκείνων με PD (που ορίζεται ως «ασθενείς χωρίς κλινικό όφελος»).

Η συνολική επιβίωση (OS) υπολογίστηκε ως ο χρόνος μέχρι το θάνατο από την ημερομηνία της διάγνωσης. Επιβίωση χωρίς εξέλιξη (PFS) υπολογίστηκε ως ο χρόνος μέχρι την πρόοδο ή θάνατο χωρίς εξέλιξη από την ημερομηνία της διάγνωσης. μέθοδο Kaplan-Meier χρησιμοποιήθηκε για να σχεδιάσετε PFS ή OS καμπύλη, και η δοκιμασία log-rank εφαρμόστηκε η σύγκριση της κατανομής μεταξύ των ομάδων. Πολυμεταβλητή αναλογικών κινδύνων κατά Cox μοντέλα χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμάται αναλογίες κινδύνου (HR) με διάστημα εμπιστοσύνης 95% (95% CI). Οι κλινικές μεταβλητές με log-rank

P

& lt? 0,05 σε μονοπαραγοντική ανάλυση εισήχθησαν σε πολυπαραγοντική ανάλυση. Λόγω του περιορισμένου αριθμού των ομόζυγη γονότυπων παραλλαγή,

Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμοί απεικονιστεί σε ένα κυρίαρχο μοντέλο. Για την ανάλυση ανισορροπίας σύνδεσης (LD), Δ ‘και Ε

2 τιμές για τις γονότυπου SNPs υπολογίστηκαν από το λογισμικό Haploview (https://www.broad.mit.edu/personal/jcbarret/haplo/). Η αξιολόγηση απλότυπος διεξήχθη χρησιμοποιώντας ΦΑΣΗ 2.0. Τα δεδομένα αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας SPSS, έκδοση 15.0 (SPSS, Inc.). Όλες οι τιμές P ήταν δύο πλευρές, και η στατιστική σημαντικότητα ορίστηκε στο 0,05 επίπεδα.

Για να αξιολογηθεί η ευκαιρία απόκτησης ενός ψευδώς θετική συσχέτιση οφείλεται σε πολλαπλές δοκιμές υπόθεση, χρησιμοποιήσαμε την Bayesian πιθανότητα ψευδώς ανακάλυψη (BFDP) δοκιμής [20] για τον υπολογισμό της πιθανότητας μη συνδυασμό με ένα μέτριο εύρος των προτέρων πιθανότητες 0,1 και 0,05 με την παρουσία μιας ένωσης. Το όριο BFDP ορίστηκε σε 0,8, όπου ένα ποσοστό εσφαλμένης μη ανακάλυψη είναι τέσσερις φορές πιο δαπανηρή ως ψευδή ανακάλυψη.

Αποτελέσματα

Τα χαρακτηριστικά των ασθενών και τα κλινικά αποτελέσματα

Η δημογραφική και τα χαρακτηριστικά γνωρίσματα κλινική των ασθενών παρουσιάζονται στον πίνακα 1. Η μέση ηλικία ήταν 57 (εύρος, 32 έως 80 ετών), και 246 (69,7%) ασθενείς ήταν άνδρες. Μεταξύ των θεμάτων, 34 (9,6%) είχαν νόσο σταδίου ΙΙΙΑ, 107 (30,3%) είχαν σταδίου IIIB, και 212 (60,1%) είχαν νόσο σταδίου IV. Λαμβάνοντας υπόψη την ιστοπαθολογική τύπου, 213 (60,3%) ασθενείς είχαν διαγνωστεί με αδενοκαρκίνωμα, 75 (21,2%) με καρκίνωμα των πλακωδών κυττάρων, 12 (3,4%) με adenosquamocarcinoma, και 53 (15,0%) με άλλες καρκίνωμα.

Η

σύνδεσης μεταξύ πολυμορφισμών και των κλινικών

όφελος

πληροφορίες γονότυπος παρουσιάζεται στον πίνακα 2. Όλες οι κατανομές γονότυπου ήταν σύμφωνα με την ισορροπία Hardy-Weinberg (

P

& gt? 0,05). Συσχετίσεις μεταξύ των πολυμορφισμών και την έκβαση της αποτελεσματικότητας του ποσοστού ανταπόκρισης και κλινικού οφέλους αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας Pearson X

2 δοκιμών και μονοπαραγοντική λογιστική παλινδρόμηση. Δεν SNPs ήταν σημαντικοί προγνωστικοί του ποσοστού ανταπόκρισης ή κλινικό όφελος συνολικά (Πίνακας 2).

Η

Σύνδεσης μεταξύ

XPD

πολυμορφισμούς /απλοτύπων, PFS και OS

Πίνακας 3 δείχνει τα δεδομένα ανάλυσης PFS και OS σύμφωνα με εξετάζονται πολυμορφισμούς. Συνολικά διάμεση PFS ήταν 7,3 μήνες (95% διάστημα εμπιστοσύνης, 6,52 – 8,14 μήνες). Παρά το γεγονός ότι

Lys

751Gln

πολυμορφισμού έδειξαν οριακή συσχέτιση με PFS, δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές στη PFS σε σχέση με το

XPD

γονότυπους.

Η

asp

312Asn

,

asp

711Asp

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμών έδειξε στατιστικά σημαντικές συσχετίσεις με το OS από δοκιμασία log-rank (Πίνακας 3, Πίνακας 4 και το Σχ. 1). Για

XPD Asp

312Asn

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμούς, ο διάμεσος χρόνος επιβίωσης για τους ασθενείς με παραλλαγή γονότυπους (13 μήνες, 15 μήνες, αντίστοιχα) ήταν μικρότερη από ότι με ομοζυγώτες φυσικού τύπου (MST, 19 μήνες? log-rank

P

= 0,006, 0,014, αντίστοιχα). Αυτές οι έννοιες παρέμεινε μετά την προσαρμογή για την κατάσταση απόδοσης, το στάδιο και τη θεραπεία σχήματα (παράγοντες που συσχετίστηκαν σε σημαντικό βαθμό με το OS από δοκιμασία log-rank, Πίνακας S1) στο μοντέλο παλινδρόμησης Cox (προσαρμοσμένο

P

= 0,032, 0,034, αντίστοιχα ) (Πίνακας 4). Για

Asp

711Asp

πολυμορφισμό, οι γονότυποι Τ-φορέα συσχετίστηκαν με μειωμένη επιβίωση σε σύγκριση με τον άγριου τύπου

C /C

γονότυπο (14 μήνες έναντι 19 μηνών, log-rank

P

= 0,006). Μια οριακά σημαντική

P

αξίας (0.053) παρατηρήθηκε μετά από προσαρμογή για τα κλινικά χαρακτηριστικά (adjusted HR, 1.54? 95% CI, 1,00 έως 2,38). Δεν παρατηρήθηκε σημαντική διαφορά μεταξύ του

Arg

156Arg

και παρατηρήθηκε OS.

Η

ζεύγη ανισορροπία σύνδεσης (LD) για τα τέσσερα SNPs παρουσιάστηκε στον Πίνακα S2. Μια μέτρια LD παρατηρήθηκε μεταξύ των

Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

παραλλαγές (0,42 & lt?

Δ ‘

& lt? 0.86). Η πιο κοινή GCA απλότυπος (κατά σειρά

Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

) βρέθηκε να αντιπροσωπεύουν το 90,5% των υπό μελέτη πληθυσμών . Η επιβίωση των ασθενών με δύο αντίγραφα του GCA απλότυπου (άγριου τύπου) ήταν σημαντικά μεγαλύτερη από εκείνη των ασθενών με μηδέν έως ένα αντίγραφο (Πίνακας 4).

Οι τιμές BFDP για τις παρατηρούμενες ενώσεων υπολογίστηκαν σε δύο επίπεδα του εκ των προτέρων πιθανότητες (0,1 και 0,05) (Πίνακας 4). Κατά την εκ των προτέρων πιθανότητα της τάξης του 0,1, δύο SNPs (

Asp

312Asn

και

Lys

751Gln

) και ο απλότυπος παρέμεινε αξιοσημείωτα (BFDP≤0.8).

η ανάλυση των υποομάδων της σύνδεσης μεταξύ

XPD

απλοτύπων και τη συνολική επιβίωση

Τα αποτελέσματα του

Asp

312Asn

απλοτύπων σε NSCLC επιβίωση περαιτέρω αξιολογήθηκαν από υποομάδες ανάλυσης του σταδίου, ιστολογικό τύπο, σχήμα χημειοθεραπείας και κατάσταση απόδοσης (Πίνακας 5). Μια πιο εμφανής απόδειξη της σύνδεσης μεταξύ των απλοτύπων και OS παρατηρήθηκε στο στάδιο IIIB ασθενείς (log-rank

P

= 2,21 × 10

-4). Οι απλότυποι παραλλαγή συσχετίστηκαν με σημαντικά μειωμένη επιβίωση (MST, 15 μήνες? Ρυθμίζεται HR, 3,11? 95% CI, 1,66 – 5,81), σε σύγκριση με το GCA απλότυπο άγριου τύπου (MST, 20 μήνες). Eπίσης, παρατηρήθηκαν στατιστικά σημαντικές διαφορές σε άλλες υποομάδες (ασθενείς με κατάσταση απόδοσης ECOG 0-1 και ασθενών με αδενοκαρκίνωμα) (Πίνακας 5). Επιπλέον, η διανομή απλότυπος δεν διέφεραν σημαντικά σε ασθενείς με ΜΜΚΠ, λαμβάνοντας υπόψη κλινικούς παράγοντες όπως ο τύπος ιστολογίας, κλινικό στάδιο και PS (Πίνακας S3).

Η

BFDP διεξήχθη για την στρωματοποιημένη ανάλυση χρησιμοποιώντας την προηγούμενη πιθανότητα 0.1 και 0,05 (Πίνακας 5). Οι παρατηρούμενες συσχετίσεις παρέμειναν αξιοσημείωτα ακόμη και στην προηγούμενη πιθανότητα 0.05.

Συζήτηση

Αυτή η μελέτη αξιολόγησε κατά πόσο πολυμορφισμοί XPD θα μπορούσε να επηρεάσει την κλινική έκβαση των ασθενών κινεζική NSCLC αγωγή με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία. Βρήκαμε ότι οι γονότυπους παραλλαγή και απλοτύπων του

Asp

312Asn

,

Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμούς σημαντικό να συμβάλει στην μικρότερη επιβίωση χρόνο σε σύγκριση με αντίστοιχο άγριου τύπου ομόζυγη γονότυπους. Μετά την προσαρμογή για κλινικούς παράγοντες, οι

XPD

απλοτύπων εξακολουθούσαν να σχετίζονται σημαντικά με το OS, και αυτό το αποτέλεσμα ήταν πιο κυρίαρχο για τους ασθενείς με νόσο σταδίου IIIB. Επιπλέον, η διόρθωση BFDP μας πρότεινε ότι παρατηρούμενη ενώσεις αυτών των SNPs στο κύριο αποτέλεσμα και ανάλυση υποομάδας ήταν κατά πάσα πιθανότητα δεν οφείλεται σε ψευδή ευρήματα.

XPD είναι μέλος μιας εννέα-υπομονάδα συγκρότημα ΤΡΙΙΒ που δρα στην NER, και ελικάσης δραστηριότητα του απαιτείται για την έναρξη της διαδικασίας NER. Τόσο

in vivo

και

in vitro

μελέτες έχουν δείξει ότι οι διακυμάνσεις στο

XPD

γονίδιο μπορεί να επηρεάσει κλινικά οφέλη της θεραπείας με βάση την πλατίνα. Οι πολυμορφισμοί του

XPD

κωδικόνιο 312 και 751 έχουν μελετηθεί σε αρκετές μελέτες [12] – [17], [21] – [27], αλλά δεν έχει επιτευχθεί συναίνεση. Οι γενετικές παραλλαγές στο κωδικόνιο 312 και 751 είναι nonsynonymous πολυμορφισμοί, με αποτέλεσμα μία αλλαγή στην αλληλουχία αμινοξέων της πρωτεΐνης. Σε μια προηγούμενη μελέτη, Seker et al. [28] ανέφεραν ότι λεμφοβλαστοειδή κύτταρα που φέρουν την παραλλαγή Α /Α γονότυπος στο κωδικόνιο 312 που εμφανίζεται υψηλότερη αποπτωτική απόκριση σε υν σε σύγκριση με εκείνους που φέρουν το γονότυπο άγριου τύπου. Εκτός αυτού, πολλές μελέτες πρότειναν ότι

XPD

751-Gin αντικαταστάσεις μπορεί να προκαλέσει σημαντική διαμορφωτική αλλαγή στην πρωτεΐνη [25], που οδηγεί σε ένα μικρό αριθμό των χρωματίδων εκτροπή και μειωμένο κίνδυνο αναντίστοιχο επιδιόρθωσης του DNA [12]. Τα αποτελέσματά μας συμφωνούν με προηγούμενες πειραματικές και επιδημιολογικές ευρήματα που οι γονότυποι παραλλαγή σχετίστηκαν με πιο αποτελεσματική ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA σε ανθρώπινους ιστούς, με αποτέλεσμα την μειωμένη επίδραση της κυτταροτοξικής χημειοθεραπείας. Ο πολυμορφισμός Asp711Asp είναι μια κοινή σιωπηλή υποκατάσταση. Οι πολυμορφισμοί Asp711Asp και Lys751Gln ήταν σε ισχυρή LD (D ‘= 0,86), και η ακριβής λειτουργία του Asp711Asp δεν έχει διευκρινιστεί ακόμα. Θα μπορούσε ενδεχομένως να επηρεάσει τη σταθερότητα του mRNA ή επηρεάζουν το ρυθμό της μετάφρασης με τη μετατροπή ενός υψηλού χρήση κωδικονίων σε ένα χαμηλό ποσοστό χρήσης ένα. Εναλλακτικά, ήταν βιολογικά εύλογο ότι αυτή η συσχέτιση που προκαλείται από ανισορροπία σύνδεσης με Lys751Gln ή κάποιες άλλες δυνητικά λειτουργικά SNPs.

Στην ανάλυσή μας, μια πιο σημαντική συσχέτιση βρέθηκε με την μειωμένη επιβίωση στην ανάλυση απλότυπου. Αυτή η επίδραση ήταν ακόμα σημαντική μετά την προσαρμογή για κλινικούς παράγοντες (προσαρμοσμένο P = 0,008). Το σωρευτικό αποτέλεσμα των XPD απλότυπου μπορεί να είναι το αποτέλεσμα της συνεργιστική δράση της κάθε SNP [29]. Περαιτέρω in vitro /in vivo μελέτες με βάση το συνδυασμό των τριών αυτών τόπων θα βοηθούσε να διερευνήσει τα πραγματικά βιολογικούς μηχανισμούς. Επιβίωση διαφορά απλότυπου ήταν πιο εμφανής σε ασθενείς με νόσο σταδίου IIIB, η οποία ήταν εξαιρετικά σύμφωνα με τη μελέτη του Gurubhagavatula κ.ά. [8]. Μία από τις πιθανές εξηγήσεις είναι ότι τα άτομα με νόσο σταδίου IV μπορεί να έχουν συσσωρευτεί πάρα πολλές μεταλλάξεις κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης του όγκου, η οποία μπορεί να οδηγήσει αντίσταση θεραπεία και να συντρίψει οποιαδήποτε γενετική αλλαγή που μπορεί να έχουν μεταβληθεί ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA [8].

Μια πρόσφατη μετα-ανάλυση επεσήμανε ότι κανένα από

Asp

312Asn

και

Lys

751Gln

μόνη συσχετίστηκε σημαντικά με το OS σε ασθενείς με ΜΜΚΠ οι οποίοι έλαβαν με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία [ ,,,0],30]. Ωστόσο, όταν μόνο τον πληθυσμό Ασιάτες είχαν συμπεριληφθεί, για το

Lys

751Gln

πολυμορφισμό, μόνο μία μελέτη η οποία περιελάμβανε 108 ασθενείς ήταν επιλέξιμοι για την τελική ανάλυση OS? και για το

Asp

312Asn

, καμία μελέτη δεν ήταν επιλέξιμη για την ανάλυση OS. Ως ήσσονος σημασίας συχνότητες αλληλόμορφο για αυτές τις τρεις πολυμορφισμούς είναι σημαντικά χαμηλότερα σε ασιατικό πληθυσμό από εκείνες των ευρωπαϊκών πληθυσμών [31] – [33], το κατάλληλο μέγεθος του δείγματος ήταν αναγκαία για να ενισχύσει τη δύναμη αυτής της μελέτης. Ως εκ τούτου, η εξέταση αυτών των SNPs στο κινεζικού πληθυσμού μας θα βοηθήσει επίσης διαλεύκανση του μηχανισμού των εθνοτήτων διαφορές στην έκβαση των ασθενών μετά από χημειοθεραπεία.

Τα στατιστικά σημαντικές διαφορές στο OS για αυτά τα SNPs παρατηρήθηκαν επίσης σε ασθενείς με αδενοκαρκίνωμα. Επειδή αδενοκαρκίνωμα ήταν ο πιο κοινός τύπος του όγκου σε κινέζικα πληθυσμού και έτειναν να δείχνουν χειρότερη πρόγνωση [34], το εύρημα αυτό ήταν ουσιαστικές για την αποτελεσματική πρόβλεψη σε μια συγκεκριμένη υποομάδα των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα. Ωστόσο, η κατάσταση XPD σε κύτταρα όγκου που απαιτείται για να προσδιοριστεί σε δείγματα όγκων. Παρά το γεγονός ότι το αποτέλεσμα επιβίωσης διέφεραν σε όλη την

XPD

γονότυπους, η απόκριση στη θεραπεία δεν ήταν διαφορετική μεταξύ των υποομάδων. Πρότεινε ότι οι γενετικοί παράγοντες που ευθύνονται για τη βραχυπρόθεσμη αποτελεσματικότητα ήταν πιθανό να είναι διαφορετικές από εκείνες για το OS [35].

Η μελέτη μας έχει πολλές αντοχές. Σε σύγκριση με δημοσιευμένες μελέτες, ένας σχετικά μεγάλος αριθμός των ασθενών με προχωρημένο NSCLC αγωγή με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία ως θεραπεία πρώτης γραμμής εντάχθηκαν σε αυτή τη μελέτη. Η σχετικά ομοιογενή καθιερωμένη θεραπεία περιορίζεται το ενδεχόμενο σύγχυσης αποτέλεσμα. Τόσο η πρόσληψη του ασθενούς και τη συλλογή δεδομένων πραγματοποιήθηκαν χωρίς τη γνώση της γενετικής κατάστασης. Επιπλέον, η συνοχή της ανάλυσης υποομάδας έδειξε ότι τα ευρήματά μας ήταν πιθανό να είναι βιολογικά αληθοφανής.

Οι περιορισμοί αυτού του έργου περιλαμβάνονται η αναδρομική σχεδιασμό ενιαίου κέντρου της και της έλλειψης άλλων γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA. Μέχρι να επιβεβαιωθεί από πολυκεντρικές προοπτικές μελέτες, τα αποτελέσματα από τη μελέτη αυτή δεν πρέπει να είναι πάνω-ερμηνεύεται. Δεδομένου ότι η συχνότητα εμφάνισης της μετάλλαξης του EGFR αναμένεται να είναι ιδιαίτερα υψηλό στις ασιατικές πληθυσμού Ανατολή, τις κλινικές δοκιμές που εξετάζουν

XPD

SNPs σε ασθενείς με NSCLC όσον αφορά την μετάλλαξη του EGFR μπορεί να βοηθήσει να διευκρινίσει εάν

XPD

πολυμορφισμούς ή απλότυπος θα μπορούσε να λειτουργήσει ως προγνωστικό δείκτη της χημειοθεραπείας.

Εν κατακλείδι, τα αποτελέσματά μας δεν παρείχε αποδείξεις για την προγνωστική ρόλο του

XPD Asp

312Asn, Asp

711Asp

και

Lys

751Gln

πολυμορφισμούς /απλότυπος για NSCLC πρόγνωση σε ασθενείς με ΜΜΚΠ αντιμετωπίζεται με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία, η οποία πρότεινε ότι αυτά

XPD

πολυμορφισμούς θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί στην αξιολόγηση των κινδύνων για την πρόβλεψη αποτελέσματος χημειοθεραπεία και εξατομικευμένη βελτιστοποίηση της θεραπείας .

Υποστήριξη Πληροφορίες

πίνακα S1.

Σύγκριση της συνολικής επιβίωσης σύμφωνα με κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών.

doi: 10.1371 /journal.pone.0033200.s001

(DOC)

Πίνακας S2.

ανισορροπία σύνδεσης (Δ ‘και r

2) μεταξύ των SNPs στο

XPD

.

doi: 10.1371 /journal.pone.0033200.s002

(DOC)

Πίνακα S3.

διανομή απλότυπος σύμφωνα με κλινικούς παράγοντες.

doi: 10.1371 /journal.pone.0033200.s003

(DOC)

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε Hongliang Liu για βοήθεια σχετικά με τη συλλογή του δείγματος. Ευχαριστούμε επίσης τους εθελοντές μας για την αιμοδοσία και τους συνεργάτες τους για τη συλλογή των δειγμάτων αίματος και των πληροφοριών.