PLoS One: HSA-miR-499 rs3746444 Πολυμορφισμός συμβάλλει σε κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση 12 Studies


Αφηρημένο

Ιστορικό

πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) εμφανίστηκε σε προ-microRNAs ή οι στόχοι των microRNAs (Mirs) μπορούν να συμβάλλουν στην κινδύνους του καρκίνου. Από το 2007, πολλές μελέτες έχουν διερευνήσει τη σχέση μεταξύ της κοινής SNPs βρίσκονται σε HSA-miR-499 (rs3746444) και τους κινδύνους του καρκίνου? Ωστόσο, τα αποτελέσματα ήταν ασαφή.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

διεξήγαγε μια μετα-ανάλυση 12 μελετών που περιλαμβάνονται 5765 περιπτώσεις και 7076 ελέγχους για τον προσδιορισμό της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. αναλογία πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (95% CI) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. Συνολικά, τα άτομα με την παραλλαγή AG (OR = 1.215, 95% CI: 1.027, 1.437? P

ετερογένεια & lt? 0,01) και AG /GG (OR = 1.227, 95% CI: 1.046, 1.439? P

ετερογένεια & lt ? 0,01) γονότυποι συσχετίστηκαν με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου από εκείνους με άγρια ​​ΑΑ γονότυπο. ανάλυση υπο-ομάδα αποκάλυψε ότι η παραλλαγή AG (OR = 1.411, 95% CI: 1.142, 1.745? P

ετερογένεια = 0,01) και AG /GG (OR = 1.413, 95% CI: 1.163, 1.717, P

ετερογένεια = 0,01) γονότυπους ακόμα έδειξε αυξημένο κίνδυνο καρκίνου στους Ασιάτες? Ωστόσο, μια τάση μείωσης του κινδύνου καρκίνου παρατηρήθηκε σε Καυκάσιους (AG έναντι ΑΑ: OR = 0,948, 955 CI: 0,851, 1,057, P

ετερογένεια = 0,12? AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 0.959, 95 % CI: 0.865, 1.064? P

ετερογένεια = 0,19). Μετα-παλινδρόμησης έδειξε ότι η εθνικότητα (p = 0,048) και το μέγεθος του δείγματος (p = 0.02), αλλά όχι τύπους καρκίνου (p = 0.89) ή την πηγή του ελέγχου (p = 0.97) ήταν οι πηγές της ετερογένειας.

Συμπεράσματα

Αυτά τα αποτελέσματα μετα-ανάλυση δείχνουν ότι η HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμός σχετίζεται με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδιαίτερα σε πληθυσμούς ασιατικής καταγωγής

Παράθεση:. Qiu MT, Χου JW, Ding XX, Γιανγκ Χ, Zhang Ζ, Γιν R, et al. (2012) HSA-miR-499 rs3746444 Πολυμορφισμός συμβάλλει σε κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση 12 μελετών. PLoS ONE 7 (12): e50887. doi: 10.1371 /journal.pone.0050887

Επιμέλεια: Goli Σαμίμι, Kinghorn Κέντρο Καρκίνου, Garvan Institute of Medical Research, Αυστραλία

Ελήφθη: 23 Αυγ 2012? Αποδεκτές: 26 Οκτωβρίου του 2012? Δημοσιεύθηκε: 7 Δεκεμβρίου 2012

Copyright: © 2012 Qiu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81201830) και Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της επαρχίας Jiangsu (BK2010589, BK2011857), Κίνα. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

τα microRNAs (miRNAs) είναι ένα είδος μη-κωδικοποίησης RNAs, περίπου ~ 22 νουκλεοτίδια σε μήκος. Ώριμη miRNAs στοχεύουν την 3 ‘αμετάφραστη περιοχή του mRNA, οδηγώντας σε υποβάθμιση mRNA ή καταστολή της μετάφρασης [1], [2]. Έχει αναφερθεί ότι ένα μόνο miRNA μπορούσε να συνδεθεί με mRNAs από περίπου 200 γονίδια, ως εκ τούτου miRNAs παίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση των γονιδίων [3], [4], και εμπλέκονται σε φυσιολογικές και παθολογικές διαδικασίες [1], συμπεριλαμβανομένων ογκογένεση [5], πολλαπλασιασμός [6], η απόπτωση [7], και ο μεταβολισμός [8].

miRNA-499 παίζει σημαντικό ρόλο στην βιολογία του όγκου και συσχετίζεται με την πρόοδο [9] και την πρόγνωση του καρκίνου [10]. Το 2010, Χου και οι συνεργάτες του [10] ανέφεραν ότι τα επίπεδα miRNAs έκφραση σε ορό μεταβάλλεται σε μεγάλο βαθμό και το επίπεδο miRNA-499 ήταν ένας προγνωστικός παράγοντας των ασθενών με μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα.

Κοινή πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs ) σε προ-miRNAs και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου έχει διερευνηθεί από μελέτες ασθενών-μαρτύρων κατά την τελευταία δεκαετία, και έχουν μερικά κοινά SNPs σε προ-miRNAs έχει αποδειχθεί με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, όπως HSA-miR-196a2 rs11614913 [11], [12] και rs2910164 HSA-miR-146a [11], [13] πολυμορφισμούς. Μια άλλη κοινή SNP σε προ-miRNA, rs3746444 σε HSA-miR-499 (Α & gt? G), μελετήθηκε επίσης σε διάφορα είδη καρκίνου, όπως ο καρκίνος του μαστού [14] – [16], ο καρκίνος του ήπατος [17], του τραχήλου της μήτρας πλακώδη καρκινικών κυττάρων [18], και γαστρικού καρκίνου [19]. Ωστόσο, αυτές οι μελέτες έδωσαν διαφορετικές ή ακόμη και αμφιλεγόμενα αποτελέσματα. Για παράδειγμα, Χου διαπίστωσαν ότι οι G παραλλαγή φορείς αλληλόμορφο είχαν αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού [16], αλλά Catucci αναφερθεί καμία σημαντική συσχέτιση [15]? Liu διαπίστωσε ότι η AG και AG /GG γονότυπο συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο καρκίνο εκ πλακωδών κυττάρων της κεφαλής και του τραχήλου [20], ωστόσο, Chu και οι συνεργάτες του διαπίστωσαν αυξημένο κίνδυνο στόματος πλακώδους καρκίνου [21].

για να επιβεβαιώσετε τη συσχέτιση μεταξύ HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση με τη συγκέντρωση όλων των επιλέξιμων μελέτες για τον υπολογισμό της εκτίμησης του συνολικού κινδύνου του καρκίνου και να αξιολογείται η επιρροή των τύπων καρκίνου και την εθνικότητα.

Μέθοδοι

Αναγνώριση των επιλέξιμων μελετών

μελέτες ασθενών-μαρτύρων επιλέξιμες εξήχθησαν από την ηλεκτρονική αναζήτηση των βάσεων δεδομένων και χειροκίνητη αναζήτηση των στοιχείων των σχετικών άρθρων και σχολίων. Προκειμένου να εντοπιστούν και πολλά σχετικά άρθρα του δυνατού, PubMed και Υποδομών China National Γνώσης (CNKI) αναζητήθηκαν χρησιμοποιώντας λέξεις-κλειδιά «microRNA», «πολυμορφισμός», και «καρκίνος». Δεν υπήρχε κανένας περιορισμός της έρευνας και η τελευταία έρευνα πραγματοποιήθηκε στις 8 Αυγούστου, 2012. Οι παραπομπές των σχετικών μελετών και αξιολογήσεις έγιναν με το χέρι έψαξε για πρόσθετες μελέτες.

Η

επιλέχθηκαν Σπουδών κριτήρια

Ένταξη και τον αποκλεισμό σύμφωνα με τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης: (1) μελέτες ελέγχου? (2) διερευνά τη σχέση μεταξύ του miR-499 3746444 (A & gt? G) SNP και του καρκίνου κινδύνους? (3) των καρκίνων που διαγιγνώσκονται με ιστοπαθολογική? (4) παροχή συχνότητες γονοτύπου λεπτομέρεια. Μελέτες χωρίς συχνότητες γονοτύπου λεπτομέρεια αποκλείστηκαν. Τίτλοι και περιλήψεις από την αναζήτηση αποτελέσματα ελέγχθηκαν και πλήρεις εργασίες κειμένου περαιτέρω αξιολόγηση για την επιβεβαίωση επιλεξιμότητας. Δύο κριτές (Qiu και Hu) εξάγεται επιλέξιμες μελέτες ανεξάρτητα σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης. Διαφωνία μεταξύ των δύο κριτές συζητήθηκε με άλλο κριτικός (Yang) μέχρι επιτεύχθηκε συναίνεση.

Δεδομένα εξόρυξη

Τα στοιχεία των επιλέξιμων μελετών εξήχθη από δύο κριτές (Qiu και Hu) ανεξάρτητα εις διπλούν, με ένα τυποποιημένο έντυπο συλλογής δεδομένων. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν: όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα όπου διεξήχθη η μελέτη, οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου, την εθνικότητα, τύπους καρκίνου, την πηγή του ελέγχου, Hardy-Winberg ισορροπία, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, η συχνότητα του γονότυπου στις περιπτώσεις και ελέγχους. Διαφορετικές καταβάσεις εθνικότητα είχαν χαρακτηριστεί ως Ασίας και του Καυκάσου. τύπους καρκίνου είχαν ταξινομηθεί ως καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του ήπατος (ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα και ο καρκίνος του ήπατος), πλακώδους καρκίνου (πλακώδες καρκίνωμα της κεφαλής και του τραχήλου, καρκίνωμα του τραχήλου της μήτρας πλακωδών κυττάρων, και καρκίνωμα του στόματος πλακωδών κυττάρων), και άλλους καρκίνους (καρκίνος του στομάχου και του καρκίνου της ουροδόχου κύστης ). Επιλέξιμες μελέτες ορίστηκαν ως νοσοκομείο με βάση (ΗΒ) και με βάση τον πληθυσμό (PB), σύμφωνα με την πηγή ελέγχου. Όταν Hardy-Winberg ισορροπίας (HWE) στους ελέγχους δεν αναφέρθηκε, ένα online πρόγραμμα (https://ihg.gsf.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl) χρησιμοποιήθηκε για να δοκιμαστεί η HWE από chi-square test καλής προσαρμογής [22]. Δύο σχολιαστές επιτευχθεί συναίνεση για κάθε θέμα.

Μεθοδολογική ποιότητα

αξιολόγηση

Η ποιότητα των επιλέξιμων μελετών αξιολογήθηκε από τρεις αναθεωρητές (Qiu, Χου και Yang) ανεξάρτητα από σκοράροντας σύμφωνα με ένα «μεθοδολογική ποιότητα κλίμακα αξιολόγησης «(βλέπε συμπληρωματικές πληροφορίες» Πίνακας S2: κλίμακα για την μεθοδολογική αξιολόγηση της ποιότητας »), η οποία τροποποιημένη μορφή μια προηγούμενη μετα-ανάλυση [23]. Στην κλίμακα, αξιολογήθηκαν 6 στοιχεία, δηλαδή την αντιπροσωπευτικότητα των υποθέσεων, πηγή των ελέγχων, διαπίστωση των σχετικών καρκίνου, το μέγεθος του δείγματος, τον ποιοτικό έλεγχο των μεθόδων προσδιορισμού του γονότυπου, και Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE). βαθμολογίες ποιότητας κυμαίνεται από 0 έως 10 και ένα υψηλό σκορ έδειξε καλή ποιότητα της μελέτης. Τρεις αναθεωρητές λυθεί η διαφωνία με τη συζήτηση

Η στατιστική ανάλυση

Η δύναμη σύνδεσης μεταξύ έχει-miR-499 rs3746444 (A & gt? G). Πολυμορφισμού και του καρκίνου κινδύνους μετρήθηκε με αναλογία πιθανοτήτων (OR) με 95 % διαστήματα εμπιστοσύνης (95% CI). Οι εκτιμήσεις των συγκεντρωμένων ΕΑΠ επιτεύχθηκαν με τον υπολογισμό του σταθμισμένου μέσου όρου του ή από κάθε μελέτη. Ένα 95% CI χρησιμοποιήθηκε για τη δοκιμή στατιστικής σημαντικότητας και 95% CI χωρίς 1 για Ή δείχνει μια σημαντική αυξηθεί ή να μειωθεί κίνδυνο καρκίνου. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ υπολογίστηκαν για σύγκριση ομοζυγώτες (ΦΕΚ έναντι ΑΑ), η σύγκριση ετεροζυγώτες (AG έναντι ΑΑ), κυρίαρχη (AG /GG έναντι ΑΑ) και υπολειπόμενη (ΦΕΚ έναντι AG /ΑΑ) τρόπους, υποθέτοντας κυρίαρχα και υπολειπόμενο επιπτώσεις της παραλλαγής G αλληλόμορφο, αντίστοιχα. αναλύσεις υποομάδων διεξήχθησαν επίσης να διερευνήσει τις επιπτώσεις των παραγόντων σύγχυσης: τύποι καρκίνου, εθνότητες, και η πηγή του ελέγχου. Αναλύσεις ευαισθησίας έγιναν να εντοπίζεται μεμονωμένα μελέτη »επίδραση στα συγκεντρωτικά αποτελέσματα και να εξετάσει την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων.

Chi-square test Q βάση χρησιμοποιήθηκε για να ελεγχθεί η στατιστική ετερογένεια μεταξύ των μελετών, και η ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική όταν ρ & lt ? 0.10 [24]. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (με βάση τη μέθοδο Mantel-Haenszel) και το μοντέλο τυχαίων δράσεων (με βάση τη μέθοδο Dersimonian-Laird) χρησιμοποιήθηκαν για να συγκεντρώσουν τα στοιχεία από διάφορες μελέτες. Το μοντέλο σταθερών επιδράσεων χρησιμοποιήθηκε όταν δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια? Αλλιώς, εφαρμόστηκε το μοντέλο τυχαίων δράσεων [25]. Meta-παλινδρόμησης διεξήχθη για την ανίχνευση της πηγής της ετερογένειας. Η μεταξύ των μελετών διακύμανσης (τ

2) χρησιμοποιήθηκε για την ποσοτικοποίηση του βαθμού ετερογένεια μεταξύ των μελετών και του ποσοστού ofτ

2 χρησιμοποιήθηκε για να περιγράψει την έκταση της ετερογένειας εξήγησε [26].

προκατάληψη Δημοσίευση ανιχνεύθηκε με οικόπεδο Begg του χωνιού και δοκιμή γραμμικής παλινδρόμησης του Egger », και σ & lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική [27]. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις υπολογίστηκαν με το λογισμικό STATA (έκδοση 10.0? StataCorp, College Station, Texas USA). Και όλες οι τιμές P ήταν δύο από την πλευρά

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των επιλέξιμων μελετών

Συνολικά, 11 άρθρα [14] -. [21], [28] – [ ,,,0],30] αναγνωρίστηκαν σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού. Η λεπτομερής διαδικασία ελέγχου παρουσιάστηκε στην Εικόνα 1. Μετά την εξέταση άρθρα πλήρους κειμένου, 4 μελέτες [10], [31] – [33] είχαν αποκλειστεί για το λόγο της όχι για τον καρκίνο ευαισθησία. Στη μελέτη αναφέρεται από Catucci και οι συνεργάτες του [15], οι συμμετέχοντες είχαν προσληφθεί από την γερμανική και την Ιταλία και οι συχνότητες γονοτύπου παρουσιάστηκαν ξεχωριστά, έτσι το καθένα από αυτά θεωρήθηκε ως μια ξεχωριστή μελέτη σε αυτό το μετα-ανάλυση. Ως εκ τούτου, έχει-miR-499 συμπεριλήφθηκαν συνολικά 12 μελέτες ασθενών-μαρτύρων, συμπεριλαμβανομένων και 5765 περιπτώσεων καρκίνου και 7076 ελέγχους, την αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ rs3746444 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Μεταξύ των 12 επιλέξιμες μελέτες, 4 από αυτούς ήταν οι μελέτες του Καυκάσου [15], [20], [28] και 8 μελέτες ήταν της Ασίας [14], [16] – [19], [21], [29], [30] (οι λεπτομέρειες φαίνονται στον πίνακα 1). περιπτώσεων καρκίνου διαγνώστηκαν ιστολογικά ή παθολογικά σε όλες τις μελέτες. Η αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης-περιορισμού μήκους θραύσματος πολυμορφισμού (PCR-RFLP) δοκιμασία χρησιμοποιήθηκε για προσδιορισμό του γονότυπου σε 10 μελέτες [16] – [21], [28] – [30] και TaqMan γονοτυπική δοκιμασία πραγματοποιήθηκε στις άλλες 2 μελέτες [14] , [15]. Δείγμα αίματος χρησιμοποιήθηκε για προσδιορισμό του γονότυπου σε όλες τις μελέτες. Η γονοτύπηση ποιοτικός έλεγχος δοκιμασία πραγματοποιήθηκε σε 7 μελέτες [14] – [17], [20], [21]. HWE κατανομής γονότυπου στους ελέγχους ελέγχθηκε σε 8 μελέτες [16] – [18], [20], [21], [28] – [30] και ήταν όλοι σε συνεπείς με HWE. Στις 4 μελέτες [14], [15], [19], η οποία δεν είχε αναφερθεί HWE, το online πρόγραμμα χρησιμοποιήθηκε για να HWE δοκιμή σε ελέγχους και μόνο μια μελέτη που αναφέρθηκαν από Okubo [19] δεν ήταν σε συμφωνία με HWE (p = 0,048).

* συνολικά 11 άρθρα εντοπίστηκαν και δύο ξεχωριστές μελέτες έχουν αναφερθεί σε μία άρθρα, έτσι 12 μελέτες ήταν επιλέξιμες.

η

αποτελέσματα μετα-ανάλυση

Παρατηρήσαμε σημαντικά αυξημένο κίνδυνο ευαισθησίας καρκίνου σε σύγκριση ετεροζυγώτες (AG έναντι ΑΑ: OR = 1.215, 95% CI: 1.027, 1.437? P

ετερογένεια & lt? 0.01, Σχήμα 2) και κυρίαρχο μοντέλο ( AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 1.227, 95% CI: 1.046, 1.439? P

ετερογένεια & lt? 0.01, Σχήμα 3), όταν συγκεντρώθηκαν όλοι οι επιλέξιμοι μελέτες. Η δύναμη σύνδεσης μεταξύ HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμό και του κινδύνου καρκίνου που φαίνονται στον Πίνακα 2. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε σύγκριση ομοζυγώτη (ΦΕΚ εναντίον ΑΑ: OR = 1.236, 95% CI: 0.988, 1.546? P

ετερογένεια = 0.06) ή υπολειπόμενο πρότυπο (ΦΕΚ εναντίον AG /ΑΑ: OR = 1.164, 95% CI: 0.935, 1.449? P

ετερογένεια = 0.04), ωστόσο, η τάση του αυξημένου κινδύνου θα μπορούσε να να εξαχθούν

π.Χ:. καρκίνο του μαστού? SC: καρκίνος του πλακώδους? OC: άλλες μορφές καρκίνου? . LC: καρκίνο του ήπατος

Η

π.Χ: ο καρκίνος του μαστού? SC: καρκίνος του πλακώδους? OC: άλλες μορφές καρκίνου? LC:. Καρκίνο του ήπατος

Η

Στη συνέχεια πραγματοποιείται υπο-ομάδα αναλύσεις για τη διερεύνηση της επίδρασης των τύπων καρκίνου, την εθνικότητα, και η πηγή του ελέγχου. Όσο για τους τύπους καρκίνου, αυξημένο κίνδυνο καρκίνου βρέθηκε μόνο κατά τη σύγκριση κυρίαρχο μοντέλο για τον καρκίνο του μαστού (AG /GG vs AA: OR = 1.128, 95% CI: 1.013, 1.256? P

ετερογένεια = 0,102). Στην υπο-ομάδα αναλύσεις «καρκίνο του ήπατος», «καρκίνος του πλακώδους», και «άλλους καρκίνους», είχαμε βρεθεί κάποια σημαντική συσχέτιση μεταξύ της HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Σε μία σύμπτωση, οι 4 μελέτες του καρκίνου του μαστού ήταν όλες βάσει πληθυσμού, έτσι αυξημένος κίνδυνος βρέθηκε το κυρίαρχο σύγκριση μοντέλο. Όσο για τις μελέτες του νοσοκομείου με βάση, δεν βρέθηκε καμία στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ του miR-499 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

εθνικότητα, όμως, επηρεάζεται η ευαισθησία του καρκίνου σε μεγάλο βαθμό. Σε Ασιάτες, υπήρξε μια στατιστικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου κατά τη σύγκριση των ετεροζυγωτών (AG έναντι ΑΑ: OR = 1.411, 95% CI: 1.142, 1.745? P

ετερογένεια = 0,01) και κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 1.413, 95% CI: 1.163, 1.717, P

ετερογένεια = 0,01). Τα αποτελέσματα στον Ασιάτες ήταν παρόμοια με εκείνη της συνολικής συγκρίσεις των συγκεντρωμένων επιλέξιμων μελετών. Σε Καυκάσιους, ωστόσο, καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε κάθε σύγκριση. Από την άλλη πλευρά, θα μπορούσε να γίνει μια τάση μείωσης του κινδύνου καρκίνου από ετερόζυγο σύγκριση (AG έναντι ΑΑ: OR = 0,948, 955 CI: 0,851, 1,057? P

ετερογένεια = 0,12) και κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG vs . AA: OR = 0.959, 95% CI: 0.865, 1.064? P

ετερογένεια = 0,19). Λαμβανόμενα μαζί, αυτά τα αποτελέσματα αποκάλυψαν ότι HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμός σχετίζεται μόνο με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου σε Ασιάτες.

Ετερογένεια

ανομοιογένεια μεταξύ των μελετών σε κάθε σύγκριση φαίνονται στον Πίνακα 2 . Ερευνήσαμε την πηγή της ετερογένειας από τύπους καρκίνου, την πηγή του ελέγχου, την εθνικότητα, και το μέγεθος του δείγματος (μελέτες με περισσότερους από 1000 συμμετέχοντες κατηγοριοποιήθηκαν ως «μεγάλο», και μελέτες με λιγότερα από 1000 συμμετέχοντες είχαν χαρακτηριστεί ως «μικρό») με μετα- οπισθοδρόμηση σε σύγκριση παραλλαγή ετεροζυγώτες (AG έναντι ΑΑ). Αποτελέσματα Meta-παλινδρόμησης αποκάλυψε ότι η εθνικότητα (p = 0.05) και το μέγεθος του δείγματος (p = 0.02), αλλά όχι τους τύπους καρκίνου (p = 0.89) ή την πηγή του ελέγχου (ρ = 0.97) συνέβαλαν στην πηγή ετερογένειας. Επιπλέον, η εθνότητα θα μπορούσε να εξηγήσει 34,21% της μεταξύ των μελετών διακύμανσης (τ

2), και το μέγεθος του δείγματος θα μπορούσε να εξηγήσει 53.44% της διακύμανσης (τ

2).

Ανάλυση ευαισθησίας

ανάλυση ευαισθησίας διεξήχθη για να διερευνήσει την επιρροή ατομική μελέτη σχετικά με τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα διαγράφοντας μία μεμονωμένη μελέτη κάθε φορά από την συγκεντρωτική ανάλυση. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι δεν υπάρχει ατομική μελέτη επηρέασε τη συγκεντρωτική ή σημαντικά, δεδομένου ότι καμία ουσιαστική μεταβολή βρέθηκε (εικόνα δεν φαίνεται).

προκατάληψη Δημοσίευση

προκατάληψη Δημοσίευση εκτιμήθηκε με οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του . οικόπεδο χοάνη Begg ήταν περίπου συμμετρική (p = 0,15 για AG έναντι AA) (Σχήμα 4.α). δοκιμή Egger ήταν τότε πραγματοποιείται για στατιστικούς δοκιμής και σφάλματος δημοσίευσης ανιχνεύθηκε (p = 0,02 για AG έναντι ΑΑ). Περαιτέρω μελέτη αποκάλυψε ότι η μελέτη αναφέρεται από τον Liu και οι συνεργάτες του [20] ήταν υπεύθυνος για την ασυμμετρία του οικοπέδου χωνί (Σχήμα 4.α). Όταν αυτή η μελέτη είχε διαγραφεί, δεν υπήρχε καμία απόδειξη της δημοσίευσης προκατάληψη (p = 0,06 για AG vs AA, Εικόνα 4.Β), και η συγκεντρωτική Ή ήταν ακόμα σημαντική (OR = 1.268, 95% CI: 1.081, 1.488), και η μεταξύ των μελετών διακύμανσης (τ

2) επίσης μειώθηκε 0,06 έως 0,04

Α:. χωνί οικόπεδο όλες τις 12 επιλέξιμες μελέτες, Egger της δοκιμής p = 0,02? Β: χωνί οικόπεδο 11 μελέτες (μελέτη του Liu αποκλείστηκε), Egger της δοκιμής p = 0,06? οι κύκλοι αντιπροσωπεύουν το βάρος της ατομικής μελέτης

Η

Συζήτηση

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, 12 επιλέξιμες μελέτες [14] -. [21], [28] – [30], συμπεριλαμβανομένων των 5765 περιπτώσεων καρκίνου και 7076 ελέγχους, εντοπίστηκαν και αναλύθηκαν. Έχουμε αποδείξει ότι HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με μια στατιστικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου στην παραλλαγή AG ετεροζυγώτη και AG /GG γονότυπο σε σύγκριση με την ομοζυγώτη ΑΑ άγριου τύπου. Αυτή η σχέση ήταν σημαντική σε Ασιάτες, ωστόσο, μια αντίθετη τάση βρέθηκε σε Καυκάσιους.

Πιστεύεται ότι ένας SNP στην προ-miRNAs θα μπορούσαν να επηρεάσουν την επεξεργασία και την ιδιότητα δέσμευσης των ώριμων miRNAs [34], [35 ]. Μαζί με τον κρίσιμο ρόλο των miRNAs στη ρύθμιση των γονιδίων, οι διακυμάνσεις των miRNAs θα σχετίζονται με τον κίνδυνο του καρκίνου [16], [23], [35]. Το 2011, Liu και οι συνεργάτες του [9] διαπίστωσε ότι miRNA-499-5p θα μπορούσε να προωθήσει την κυτταρική εισβολή και τη μετάσταση των όγκων σε καρκίνο του παχέος εντέρου με τη στόχευση FOXO4 και PDCD4 και miRNA-499-3p (3746444 A & gt? G) βρέθηκε σε διηθητικό καρκίνο του μαστού κυτταρική γραμμή [34]. Hu διαπίστωσε επίσης miRNA 499 επίπεδο έκφρασης στον ορό ήταν ένας προγνωστικός παράγοντας σε NSCLC [10]. Δεδομένου του σημαντικού ρόλου των miRNA 499, είναι λογικό ότι rs3746444 (A & gt? G). Μπορούν να συμβάλλουν στην ευπάθεια του καρκίνου

Μεταξύ 12 επιλέξιμες μελέτες [14] – [21], [28] – [30], G αλληλόμορφο φορείς παραλλαγή αναφέρθηκαν με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού [16], του τραχήλου της μήτρας καρκίνο πλακωδών κυττάρων [18], από του στόματος καρκίνο πλακωδών κυττάρων [21], και ηπατοκυτταρικό καρκίνωμα [30], και η σημαντική συσχέτιση βρέθηκε κυρίως στο ετεροζυγώτη σύγκρισης (AG έναντι ΑΑ) και κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG έναντι ΑΑ), η οποία ήταν σε συνεπείς με συγκεντρωτική ανάλυση μας. Liu και οι συνεργάτες του [20] διαπίστωσε επίσης σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου με γονότυπους AG και AG /GG της HSA-miR-499. Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι παραλλαγή AG και AG /GG γονότυπους του HSA-miR-499 ήταν οριστική σχετίζονται με την ευαισθησία του καρκίνου.

Κατά την ανάλυση υπο-ομάδα των τύπων καρκίνου, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση βρέθηκε εκτός από το κυρίαρχο μοντέλο σύγκριση του καρκίνου του μαστού. Αλλά για τις 4 μελέτες του καρκίνου του μαστού [14] – [16], 2 από αυτούς βρήκαν αυξημένο κίνδυνο με G φορείς παραλλαγή αλληλόμορφου [14], [16]. Επιπλέον, στην υπο-ομάδα του καρκίνου πλακωδών, δεν υπήρχε σημαντική συσχέτιση, είτε, αν και όλα τα 3 μεμονωμένες μελέτες ανέφεραν αυξημένη [18], [21] ή μειώνονται [20] κίνδυνος καρκίνου με miR-499 πολυμορφισμό. Η διαφορά αυτή μπορεί να εξηγηθεί από το λόγο ότι το μέγεθος του δείγματος των μελετών ήταν σχετικά μικρές και υπήρχε μεγάλη πιθανότητα πιθανότητα οφείλεται σε ανεπαρκή στατιστική δύναμη. Επιπλέον, η εθνικότητα ήταν επίσης ένας σημαντικός λόγος, γιατί οι μελέτες ανέφεραν αυξημένο κίνδυνο πραγματοποιήθηκαν σε Ασιάτες.

Κατά τη διάρκεια αναλύσεις υπο-ομάδα, βρήκαμε ότι η εθνικότητα επηρεάζεται σε μεγάλο βαθμό τη σχέση μεταξύ HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Όπως αναφέρεται στο τμήμα του αποτέλεσμα, υπήρξε αυξημένος κίνδυνος καρκίνου AG και AG /GG γονότυπο σε Ασιάτες, αλλά μια τάση μείωσης του κινδύνου καρκίνου του βρέθηκε σε Καυκάσιους. Οι διάφοροι κίνδυνοι καρκίνου σε Ασιατών και Καυκάσιων αναφέρθηκε επίσης και σε άλλες μετα-αναλύσεις [11], [12], [22], [23]. Οι διαφορές μπορούν να εξηγηθούν από γενετικές ποικιλομορφίες, διαφορετικούς παράγοντες κινδύνου σε στυλ ζωής, και την έκθεση σε διαφορετικούς περιβαλλοντικούς παράγοντες.

Όσον αφορά την προαναφερθείσα προκατάληψη δημοσίευση ανιχνεύεται (AG έναντι ΑΑ) από Egger «δοκιμή, Liu» μελέτη [20] ήταν υπεύθυνος για την προκατάληψη. Ωστόσο, η μελέτη του Liu [20] ήταν η μόνη μελέτη που ανέφερε μειωμένο κίνδυνο καρκίνου με πλακώδες καρκίνωμα της κεφαλής και του τραχήλου σε Καυκάσιους. Επιπλέον, παρατηρήσαμε επίσης μια τάση μείωσης του κινδύνου HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμό σε Καυκάσιους. Έτσι, πιθανολογείται ότι η προκατάληψη δημοσίευση εντοπίσαμε δεν ήταν υπέρ να δημοσιεύσει θετικά αποτελέσματα, αλλά το γεγονός ότι οι τρέχουσες μελέτες που διεξήχθησαν σε Καυκάσιους ήταν πολύ λίγες. Αναμένεται ότι όταν οι περισσότερες μελέτες σε Καυκάσιους που δημοσιεύθηκε, το οικόπεδο χοάνη θα είναι πιο συμμετρική και χωρίς προκατάληψη δημοσίευση θα ανιχνευθούν.

Για την ετερογένεια, βρήκαμε την εθνικότητα και μέγεθος δείγματος ήταν η πηγή της ετερογένειας. Αν και οι μελέτες του μικρού μεγέθους μπορεί να συμβάλει σε ένα φαινόμενο μικρής μελέτης, στην οποία ενέργειες που έχουν αναφερθεί είναι μεγαλύτερα, και να οδηγήσει σε μεταξύ των μελετών διακύμανσης, το μέγεθος του δείγματος δεν θεωρήθηκε για την ετερογένεια στην προηγούμενη μετα-αναλύσεις. Ωστόσο, αυτού του είδους η ετερογένεια είναι δύσκολο να αποκλείσει, λόγω πρόσληψη αρκετές περιπτώσεις με συγκεκριμένο είδος καρκίνου είναι δύσκολη.

Σε αυτό το μετα-ανάλυση, συμπεριλάβαμε 5765 περιπτώσεις καρκίνου και 7076 ελέγχους, η οποία μπορεί να παρέχει αρκετή στατιστική δύναμη και να ενισχυθεί η αξιοπιστία των αποτελεσμάτων μας. Μετά, συμπεριλαμβανομένων των επιλέξιμων μελετών, μια μεθοδολογική αξιολόγηση της ποιότητας διεξήχθη και όλες οι μελέτες είχαν αποδεκτή ποιότητα. Επιπλέον, δεν υπήρχε κανένας περιορισμός των γλωσσών κατά την αναζήτηση, έτσι υπήρχε μια μικρή πιθανότητα μεροληψία της επιλογής. θα πρέπει να θεωρείται κάποιος περιορισμός της μας μετα-ανάλυση. Πρώτον, τα επιμέρους στοιχεία δεν ήταν διαθέσιμα και μια πιο ακριβή ρυθμιστεί ή για άλλους συμπαράγοντες όπως η ηλικία, το οικογενειακό ιστορικό, και το περιβάλλον παράγοντες δεν επιτρέπονται. Δεύτερον, ο αριθμός των μελετών που περιλαμβάνονται για την ανάλυση υπο-ομάδα των τύπων καρκίνου ήταν πολύ μικρό.

Εν κατακλείδι, έχουμε αποδείξει ότι HSA-miR-499 rs3746444 πολυμορφισμός σχετίζεται αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδιαίτερα σε Ασιάτες. Για να επιβεβαιώσετε αυτήν την ένωση, οι μελλοντικές μελέτες ασθενών-μαρτύρων μεγάλο μέγεθος που απαιτείται, ειδικά σε Καυκάσιους.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0050887.s001

(DOC)

Πίνακας S2.

Κλίμακα για μεθοδολογική αξιολόγηση της ποιότητας

doi:. 10.1371 /journal.pone.0050887.s002

(DOC)

You must be logged into post a comment.