Αφηρημένο

Η πρόγνωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου είναι αρκετά μεταβλητή, ακόμη και μετά την προσαρμογή για κλινικές παραμέτρους, όπως το στάδιο της νόσου και μικροδορυφορικού κατάσταση αστάθειας. Είναι πιθανό ότι η ψυχολογική δυσφορία που βιώνουν οι ασθενείς, συμπεριλαμβανομένων άγχους και της κατάθλιψης, μπορεί να συσχετίζεται με κακή πρόγνωση. Στην παρούσα μελέτη, υποθέτουμε ότι οι γενετικές παραλλαγές μέσα σε τρία γονίδια βιολογικά συνδέονται με την αντίδραση στο στρες, δηλαδή μεταφορέα σεροτονίνης (

SLC6A4

), προερχόμενο από τον εγκέφαλο νευροτροφικός παράγοντας (

BDNF

), και αργινίνη υποδοχέα βασοπρεσίνη (

AVPR1B

) τα γονίδια που σχετίζονται με την πρόγνωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου. Χρησιμοποιήσαμε μια βασισμένη στον πληθυσμό ομάδα των 280 ασθενών που παρακολουθήθηκαν για διάστημα έως 12,5 χρόνια μετά τη διάγνωση. πολυπαραγοντική ανάλυση μας έδειξε ότι μια tagSNP στο

SLC6A4

γονίδιο (rs12150214) ήταν ένας προάγγελος της μικρότερης συνολική επιβίωση (HR: 1,572, 95% CI: 1,142 – 2,164, p = 0,005), ανεξάρτητα από το στάδιο, την ηλικία, βαθμό και την κατάσταση MSI. Επιπλέον, μια πολυπαραγοντική ανάλυση, χρησιμοποιώντας τις συνδυασμένες γονότυπους των τριών πολυμορφισμών στο γονίδιο αυτό αποδεικνύεται ότι η παρουσία οποιουδήποτε από τα ελάσσονα αλληλόμορφα σε αυτές τις πολυμορφικές θέσεις ήταν ανεξάρτητος προγνωστικός δείκτης της τόσο μικρότερη συνολική επιβίωση (HR: 1,631, 95% CI: 1,190 – 2,236 , p = 0,002) και μικρότερη συγκεκριμένες νόσους επιβίωση (HR: 1,691, 95% CI: 1,138 – 2,512, p = 0,009). Η πρωτεΐνη 5-ΗΤΤ κωδικοποιείται από το

SLC6A4

γονίδιο έχει επίσης ενοχοποιηθεί σε φλεγμονή. Ενώ τα αποτελέσματά μας μένει να επαναληφθεί και σε άλλες ομάδες ασθενών, προτείνουμε ότι οι γενετικές παραλλαγές στο

SLC6A4

γονίδιο συμβάλλουν στην κακή επιβίωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος

Παράθεση:. Σάββας S, το Hyde Α , Stuckless SN, Parfrey P, Younghusband ΗΒ, Πράσινη Ε (2012) του μεταφορέα σεροτονίνης Gene (

SLC6A4

) Παραλλαγές σχετίζονται με κακή επιβίωση σε καρκίνο του παχέος εντέρου ασθενείς. PLoS ONE 7 (7): e38953. doi: 10.1371 /journal.pone.0038953

Επιμέλεια: Henrik Einwaechter, Klinikum rechts der Isar der TU München, Γερμανία

Ελήφθη: 18 Ιανουαρίου του 2012? Αποδεκτές: 14, Μάη, 2012? Δημοσιεύθηκε: 24 Ιουλίου 2012 |

Copyright: © 2012 Σάββας et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το καναδικό Ινστιτούτο Υγείας Έρευνας Ινστιτούτο Γενετικής και το Ίδρυμα καναδική Gene Cure, Memorial University of Newfoundland, Έρευνας και Ανάπτυξης Corporation (RDC) της Νέας Γης, Διεπιστημονική Ομάδα για τον καρκίνο του παχέος εντέρου που χρηματοδοτείται από CIHR, και διεπιστημονική ομάδα στην ανθρώπινη γενετική χρηματοδοτείται από το Ταμείο Καινοτομίας Ατλαντικού. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

καρκίνος του παχέος εντέρου είναι μια κοινή ασθένεια με εκατομμύρια νέες περιπτώσεις σε όλο τον κόσμο κάθε χρόνο. Αν και τα αποτελέσματα σε ασθενείς που έχουν βελτιωθεί τις τελευταίες δεκαετίες, λόγω της έγκαιρη ανίχνευση, τη βελτίωση των διαγνωστικών μεθόδων, και την ανάπτυξη καλύτερων θεραπευτικών επιλογών, η τρέχουσα 5 χρόνια τα ποσοστά επιβίωσης για τους ασθενείς είναι αρκετά απογοητευτικό: ~60-65% στη Βόρεια Αμερική [ ,,,0],1] και πολύ χαμηλότερη στις αναπτυσσόμενες χώρες [2]. Ως εκ τούτου, παρόμοιο με άλλους καρκίνους, υπάρχει ανάγκη για την ανάπτυξη καλύτερων στρατηγικών για την κλινική διαχείριση της νόσου αυτής.

Τα κλινικά αποτελέσματα που σχετίζονται με το στάδιο της νόσου, την ηλικία και συννοσηρότητα [3]. Όμως, τα αποτελέσματα των ασθενών μπορεί να τροποποιηθεί από άλλους παράγοντες, όπως η συναισθηματική υγεία και την ποιότητα ζωής. Ένας σημαντικός καθοριστικός παράγοντας της συναισθηματικής υγείας και της ποιότητας ζωής σε ασθενείς με καρκίνο είναι η αποτελεσματικότητα της αντιμετώπισης της ψυχολογικής δυσφορίας που προκαλείται από τη διάγνωση του καρκίνου και τις ανεπιθύμητες συνέπειες της θεραπείας των ασθενών. Σε ασθενείς με προχωρημένο στάδιο, ειδικά στην παρηγορητική φροντίδα, για να αντιμετωπίσουν την προοπτική του θανάτου είναι επίσης ένα σοβαρό συναισθηματικό φορτίο. Αυτές οι προκλήσεις συχνά επιφανειακά όπως η κατάθλιψη ή άγχος σε ασθενείς με καρκίνο, οι οποίες παρατηρούνται σε ποσοστό έως 50% των ασθενών με καρκίνο [4]. Ορισμένες μελέτες έχουν δείξει τη σύνδεση μεταξύ αγωνία να αντιμετωπίσουν την αποτελεσματικότητα και την επιβίωση σε ασθενείς με καρκίνο [5], [6], αν και αντικρουόμενα αποτελέσματα έχουν επίσης αναφερθεί [7].

Η

Η ευπάθεια σε κατάθλιψη ή άγχος έχει που συνδέονται με διάφορα γονίδια, συμπεριλαμβανομένων,

SLC6A4

, το οποίο κωδικοποιεί για την πρωτεΐνη μεταφορέα σεροτονίνης (γνωστή επίσης και ως 5-ΗΤΤ και SERT). Η σεροτονίνη είναι ένας νευροδιαβιβαστής, η ανεπάρκεια των οποίων οδηγεί στην κλινική κατάθλιψη σε ευαίσθητα άτομα [8]. Με τη ρύθμιση της πρόσληψης σεροτονίνης και συναπτική διαθεσιμότητα της, 5-ΗΤΤ έχει ένα σημαντικό ρόλο στο μεταβολισμό της σεροτονίνης. Διάφορα παρατήρησης και πειραματικές μελέτες έχουν δείξει ότι

SLC6A4

και παραλλαγές της εμπλέκονται στην ευαισθησία σε διάφορες ψυχιατρικές παθήσεις σε ανθρώπους και ποντικούς, συμπεριλαμβανομένης της κατάθλιψης και του άγχους [8] – [10]. Η

BDNF

γονίδιο κωδικοποιεί για μια πρωτεΐνη (νευροτροφικός παράγοντας προερχόμενος από τον εγκέφαλο) που συμμετέχουν στην επιβίωση, την ανάπτυξη και διαφοροποίηση των νευρώνων [11], και, όπως

SLC6A4

, εμπλέκεται στην απόκριση να τονίσω. Αρκετές μελέτες, συμπεριλαμβανομένων εκείνων σε

BDNF

μεταλλαγμένου ποντικούς, έχουν δείξει ότι οι μεταβολές στην έκφραση ή λειτουργία αυτού του γονιδίου που συνδέεται με άγχος, κατάθλιψη και διαταραχή μετα-τραυματικού [12], [13]. Ένα άλλο γονίδιο που εμπλέκεται στην απόκριση στρες είναι η

AVPR1B

γονίδιο που κωδικοποιεί για τον υποδοχέα αργινίνη αγγειοπιεσίνη [14]. Λειτουργικές και επιδημιολογικές μελέτες έχουν δείξει ότι αυτό το γονίδιο και βασοπρεσίνη συνδετήρα αυτού συνδέονται επίσης με άγχος και κατάθλιψη σε ανθρώπους και σε είδη μοντέλο [15], [16].

Σε αυτή τη μελέτη, υποθέσαμε ότι οι γενετικές παραλλαγές που βρίσκονται εντός του

SLC6A4

,

BDNF

, και

οι AVPR1B

γονιδίων που σχετίζονται με την πρόγνωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου. Ως εκ τούτου, ελέγξαμε τη σύνδεση των πέντε τέτοιες παραλλαγές από αυτά τα γονίδια με την επιβίωση σε μια ορθοκολικό καρκίνο ομάδα από τη Νέα Γη του Καναδά.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Αυτή η μελέτη εγκρίθηκε από την Επιτροπή Ανθρωπίνων Έρευνα του Πανεπιστημίου Memorial της Νέας Γης, καθώς και τα Περιφερειακά Συμβούλια Υγείας. Ενημερωμένη συγκατάθεση δεν απαιτείται από τις τοπικές ηθική του σκάφους, η μελέτη θεωρήθηκε ένας ανώνυμος ανασκόπηση διαγραμμάτων. δεδομένων των ασθενών αναλύθηκε ανώνυμα.

Η

ασθενή Cohort

Αυτό είναι ένας πληθυσμός με βάση και την αναδρομική μελέτη. Από το Avalon χερσόνησο της Νέας Γης, νέες περιπτώσεις (διαγνωσθεί στο Κέντρο Επιστημών Υγείας, Χάρη Γενικό Νοσοκομείο Mercy Hospital του Αγίου Clare του (όλοι Αγίου Ιωάννη), και το Γενικό Νοσοκομείο Carbonear) διαπιστώθηκαν κατά τη διάρκεια μιας περιόδου δύο ετών μεταξύ της 1ης Ιανουαρίου , 1997 και 31 Δεκεμβρίου 1998. χειρουργικά δείγματα ήταν διαθέσιμα για 280 από τους 292 ασθενείς που εντοπίστηκαν. DNA εκχυλίστηκε από εμπεδωθεί με παραφίνη μη-όγκου κόλον και του ορθού ιστών μονιμοποιηθεί με φορμαλίνη. Τα αποτελέσματα διαπιστώθηκαν με τη χρήση ιατρικών φακέλων μέχρι τον Ιούλιο του 2009.

Επιλογή και γονοτυπικός πολυμορφισμών

Τα τρία γονίδια (

SLC6A4

,

BDNF

και

AVPR1B)

τέθηκαν σε προτεραιότητα και διερευνήθηκαν σε αυτή τη μελέτη, λόγω της βιολογικής τους ρόλους στην κατάθλιψη ή άγχος. Εντοπίσαμε tagSNPs με μια μικρή συχνότητες αλληλόμορφο & gt? 10% σε αυτά τα γονίδια χρησιμοποιώντας τις πληροφορίες γονότυπο για τους Καυκάσιους δημοσιεύτηκε στη βάση δεδομένων HapMap, φάση Ι & amp? II (https://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/) και χρησιμοποιώντας τη λειτουργία Tagger ζεύγη υλοποιηθεί με το πρόγραμμα Haploview [17]. Μετά από αυτήν την προσέγγιση, αρχικά επιλεγεί πέντε tagSNPs στο

SLC6A4

(rs11080121, rs12150214, rs2066713, rs4251417, και rs140700) και δύο tagSNPs στο

BDNF

(rs7124442 και rs6265). Για

AVPR1B

αναλύσαμε προηγουμένως αναφερθεί πολυμορφισμός (rs35369693) [18] δεδομένου ότι υπάρχουν διαθέσιμα στοιχεία HapMap. Οι γενότυποι λήφθηκαν σε εξωτερικό συνεργάτη εγκατάσταση του γονότυπου (Το Κέντρο Εφαρμοσμένης Genomics Διευκόλυνσης, Τορόντο, Καναδάς) με τη χρήση της τεχνολογίας Sequenom MassArray®. Των SNPs που επιλέγονται, rs11080121 και rs2066713 στο

SLC6A4

καθώς και rs7124442 στο

BDNF

δεν θα μπορούσε να θανατωθούν με αυτή τη μέθοδο. Ως αποτέλεσμα, τα δεδομένα από πέντε SNPs συμπεριλήφθηκαν σε αυτή τη μελέτη. Τουλάχιστον το 5% των δειγμάτων γονότυπου δύο φορές και όλοι οι διπλές γονότυπους συμφωνούσαν. δείγματα DNA από τους 8 ασθενείς είχαν αποτύχει θα πρέπει να θανατωθούν και για τα πέντε πολυμορφισμούς διερευνηθεί. Συνολικά, τουλάχιστον 94% των ασθενών ήταν ο γονότυπος για κάθε πολυμορφισμό. Αυτές οι πολυμορφισμοί, δευτερεύουσες συχνότητες αλληλόμορφο τους (MAFs), και τα επιτυχημένα ποσοστά του γονότυπου συνοψίζονται στον Πίνακα 1.

Ανισορροπία Σύνδεσης (LD) Οδηγός:

Η LD χάρτη του

SLC6A4

γονίδιο (Σχήμα S1) κατασκευάστηκε χρησιμοποιώντας το HapMap (φάση Ι & amp? II) δεδομένα γονότυπου που λαμβάνονται από τα δείγματα του Καυκάσου (https://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/) χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα Haploview [17].

Αποτελέσματα Διερευνηθεί

το πρωτεύον καταληκτικό σημείο που αναλύθηκαν ήταν η συνολική επιβίωση (OS) ορίζεται ως ο χρόνος από την ημερομηνία της διάγνωσης μέχρι την ημερομηνία του θανάτου από οποιαδήποτε αιτία. δευτερεύοντα τελικά σημεία μας ήταν ελεύθερη νόσου επιβίωση (DFS) και η επιβίωση συγκεκριμένες ασθένειες (DSS). DFS είναι ο χρόνος από τη διάγνωση μέχρι την εμφάνιση της πρώτης υποτροπής, μετάσταση ή θανάτου από οποιαδήποτε αιτία. DSS ορίζεται ως ο χρόνος από τη διάγνωση μέχρι το θάνατο λόγω καρκίνου του παχέος εντέρου (ή οφείλεται σε μετεγχειρητικές επιπλοκές εντός των 30 ημερών μετά την επέμβαση, n = 17). Οι ασθενείς που δεν παρουσίασαν την εκδήλωση ενδιαφέροντος περικόπηκαν την ημερομηνία της τελευταίας παρακολούθηση. Αριθμός εκδηλώσεων για το OS, DFS, και DSS είναι 162, 171 και 107, αντίστοιχα.

Δημογραφική και κλινικοπαθολογοανατομικές μεταβλητές

το στάδιο της νόσου, Βαθμός (κακώς διαφοροποιημένο ή αδιαφοροποίητα vs καλά ή μετρίως διαφοροποιημένων ), τοποθεσία (ορθό vs παχέος εντέρου), την ηλικία, το φύλο (αρσενικό vs θηλυκό), ιστολογία (βλεννώδες vs μη βλεννώδες), και την κατάσταση της σταθερότητας μικροδορυφορικού (μικροδορυφόρων σταθερό ή αστάθειας του μικροδορυφορικού DNA-χαμηλή (MSS /MSI-L) vs μικροδορυφορικού-αστάθειας υψηλή (MSI-H)) ερευνήθηκαν.

Στατιστική Ανάλυση

Όλοι οι γονότυποι για πρώτη φορά το χέρι αναλύονται για να προσδιορίσουν την κύρια και τα ανήλικα αλληλόμορφα και στη συνέχεια συγκεντρώθηκαν υποθέτοντας ότι το κυρίαρχο μοντέλο κληρονομικότητας (αα + Αα vs AA, όπου α είναι ο ανήλικος αλληλόμορφο και α είναι η κύρια αλληλόμορφο). Απόκλιση των δεδομένων που συγκεντρώθηκαν γονότυπο από Hardy-Weinberg Ισορροπία (HWE) ελέγχθηκε χρησιμοποιώντας ένα online εργαλείο που περιγράφεται από Rodriguez και οι συνεργάτες του [19]. Ηλικία αναλύθηκε ως συνεχή μεταβλητή, όπου, όπως ταξινομήθηκαν οι υπόλοιπες μεταβλητές. Εκτιμήσαμε τις καμπύλες επιβίωσης χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Kaplan-Meier, η οποία προέβλεπε, επίσης, τις τιμές p log-rank. Οι διαφορές μεταξύ των χρόνων επιβίωσης των διαφόρων ομάδων ασθενών εξετάστηκαν με τη μέθοδο της παλινδρόμησης Cox, η οποία υπολόγισε τις τιμές p, αναλογίες κινδύνου (HR), και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης. Αυτές οι μεταβλητές που είχαν τιμές ρ μικρότερες από 0.05 στην μονοπαραγοντική ανάλυση παλινδρόμησης Cox εισήχθησαν σε μία ανάλυση πολλαπλών μεταβλητών χρησιμοποιώντας την ίδια μέθοδο. Στην ανάλυση συνδυασμό γονότυπο για το

SLC6A4

SNPs, συνδυάσαμε ασθενείς με τουλάχιστον ένα ανήλικο αλληλόμορφο (AG γονότυπους + AA στο

SLC6A4

-rs4251417, CG + CC γονότυπους στο

SLC6A4

-rs12150214, ή AG γονότυπους + AA στο

SLC6A4

-rs140700) και τα συνέκριναν με τους ασθενείς ομόζυγο για τις μεγάλες αλληλόμορφα αυτών των πολυμορφισμών.

για να ελέγξετε εάν η ένταξη του

SLC6A4

γονότυπους ως μεταβλητή βελτίωσε την προγνωστική ακρίβεια των πολυπαραγοντικά μοντέλα, υπολογίσαμε και σε σύγκριση με το κριτήριο Akaike Information (AIC) [20] για τρία μοντέλα OS και DSS. Τόσο για το λειτουργικό σύστημα και το DSS, Μοντέλο 1 περιλάμβαναν την ηλικία, το στάδιο, το βαθμό και την κατάσταση MSI? Μοντέλο 2 περιλαμβάνεται το

SLC6A4

-rs12150214 γονότυπο εκτός από τις μεταβλητές στο μοντέλο 1, και το μοντέλο 3 περιλαμβάνονται οι συνδυασμένες

SLC6A4

γονότυπους εκτός από τις μεταβλητές στο μοντέλο 1. Για κάθε μοντέλο, η AIC υπολογίζεται από τον ακόλουθο τύπο: -2 συνδεθείτε πιθανότητα + 2K, όπου -2 log πιθανότητα είναι η πιθανότητα του μοντέλου παλινδρόμησης Cox και Κ είναι ο αριθμός των παραμέτρων στο μοντέλο για τις οποίες υπολογίστηκαν ΥΕ. Το μοντέλο με το μικρότερο AIC αντιπροσωπεύει την καλύτερη ενημερωτική μοντέλο προσαρμογής των δεδομένων.

Συσχέτιση

SLC6A4

-Συμπαραγωγή γονότυπους και τον ασθενή δημογραφικές και κλινικές παράμετροι εξετάστηκαν χρησιμοποιώντας το Chi-square test. Η στατιστική σημαντικότητα ορίστηκε στο p & lt? 0,05, όλες οι στατιστικές δοκιμασίες ήταν δύο όψεων και πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του πακέτου λογισμικού IBM SPSS-(έκδοση 19). Λόγω της υπόθεσης ροών φύση αυτής της μελέτης, η διόρθωση για πολλαπλές δοκιμές δεν έγινε.

Υπολογισμοί Ισχύος

Οι υπολογισμοί ενέργειας για τυχαία επιλεγμένων αριθμοδεικτών κινδύνου των 2 και 1,5 πραγματοποιήθηκαν για κάθε πολυμορφισμό χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα Power and Μέγεθος δείγματος [21] υποθέτοντας ένα χρόνο παρακολούθησης 11 ετών, σε δεδουλευμένη χρόνο 2 χρόνια, και η πιθανότητα σφάλματος τύπου Ι (α) του 0,05. Ως αποτέλεσμα, μια ελάχιστη ισχύ μελέτη το 80% επιτεύχθηκε για κάθε SNP για την ανίχνευση ενός αναλογία κινδύνου του 2, αλλά όχι 1.5. Όπως ήταν αναμενόμενο, η ανεπαρκής ισχύς της μελέτης ήταν πιο βαθιά σε λιγότερο συχνή πολυμορφισμών (rs4251417 και rs140700 στο

SLC6A4

και rs35369693 στο

AVPR1B

γονίδια) σε σύγκριση με άλλες δύο κοινών πολυμορφισμών (rs12150214 στο

SLC6A4

και rs6265 στο

BDNF

).

α) OS (p = 0,030, δοκιμασία log-rank), β) DFS (p = 0,225, δοκιμασία log-rank), και γ) DSS (p = 0,159, δοκιμασία log-rank). Ώρα εμφανίζεται εδώ και χρόνια.

Η

Αποτελέσματα

Η

Τα αρχικά χαρακτηριστικά αυτής της σειράς ασθενών συνοψίζονται στον Πίνακα 2. Όπως αναμενόταν, η πλειοψηφία των περιπτώσεων είχαν καλά ή μέτρια διαφοροποιημένα (δηλαδή χαμηλής ποιότητας? 83,6%), μη-βλεννώδες (84,6%), του παχέος εντέρου (79,6%), και MSS /MSI-L (87,9%) των όγκων. Η διάμεση ηλικία κατά τη διάγνωση ήταν 68,4 χρόνια. Τα συνολικά ποσοστά πενταετούς επιβίωσης και δέκα ετών για αυτή την ομάδα ήταν 50% και 40%, αντίστοιχα. Σχεδόν τα δύο τρίτα των ασθενών που απεβίωσαν (61,4%) ή εξέλιξη της νόσου (δηλαδή επανεμφάνιση, μετάσταση, ή θάνατο? 65,7%) από την τελευταία παρακολούθηση ημερομηνία. Επιπλέον, το 40,4% των περιπτώσεων είχε πεθάνει από καρκίνο του παχέος εντέρου (Πίνακας 2).

Η

Τα ανήλικα συχνότητες αλληλίου (MAFs) των πολυμορφισμών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Όλες οι πολυμορφισμοί ήταν σε ισορροπία Hardy-Weinberg Ισορροπία. Τα μονοπαραγοντική Cox αποτελέσματα της ανάλυσης παλινδρόμησης για το OS, DFS, και DSS συνοψίζονται στους Πίνακες S1, S2, S3. Για το

SLC6A4

-rs12150214 πολυμορφισμός, οι ασθενείς που φέρουν το αλληλόμορφο παραλλαγή C (CG ή CC γονότυπους) διέτρεχαν αυξημένο κίνδυνο θανάτου από οποιαδήποτε αιτία (HR: 1,399, 95% CI: 1,031 – 1,897, p = 0,031 ) σε σύγκριση με τους ασθενείς ομόζυγους για το μείζον αλληλόμορφο (GG γονότυπος) (Σχήμα 1). Ωστόσο, μια σημαντική συσχέτιση αυτού του SNP δεν παρατηρήθηκε ούτε στην DFS ή αναλύσεων DSS (Σχήμα 1). Η αύξηση της ηλικίας, το στάδιο της νόσου, υψηλός βαθμός όγκου (κακώς διαφοροποιημένο ή αδιαφοροποίητα), και MSS /MSI-L φαινότυπο επίσης σχετίζεται με χειρότερη OS, DFS, και DSS. Σημαντικές συσχετίσεις των υπολοίπων τεσσάρων πολυμορφισμοί στο

SLC6A4

,

BDNF

, και

AVPR1B

με το OS, DFS ή DSS δεν είχαν εντοπιστεί.

Η

α) OS (p = 0,005, δοκιμασία log-rank), β) DFS (p = 0,104, δοκιμασία log-rank), και γ) DSS (p = 0,008, δοκιμασία log-rank) . Ώρα εμφανίζεται εδώ και χρόνια.

Η

Τα αποτελέσματα της πολυπαραγοντικής ανάλυσης για το OS παρουσιάζονται στον Πίνακα 3. Παρόμοια με την μονοπαραγοντική ανάλυση, για το

SLC6A4

-rs12150214 πολυμορφισμός, σε σύγκριση στους ασθενείς με μείζονα γονότυπο ομοζυγώτες (ΦΕΚ), οι ασθενείς που φέρουν το αλληλόμορφο παραλλαγή C (CG ή γονότυπους CC) διέτρεχαν αυξημένο κίνδυνο θανάτου από οποιαδήποτε αιτία (HR: 1,572, 95% CI: 1,142 – 2,164, p = 0,005), μετά την προσαρμογή για το φύλο, την ηλικία, το βαθμό, το στάδιο και το καθεστώς MSI. Η αύξηση της ηλικίας, τάξης, το στάδιο, και την κατάσταση MSI ήταν επίσης ανεξάρτητοι προγνωστικοί παράγοντες του OS σε αυτήν την ομάδα (Πίνακας 3). Πρόσθετες αναλύσεις πολλαπλών μεταβλητών έδειξε επίσης την ανεξάρτητη συσχέτιση της ηλικίας, το βαθμό, το στάδιο, και την κατάσταση MSI τόσο με DFS και DSS (

δεν παρουσιάζονται τα δεδομένα

).

Πραγματοποιήσαμε επίσης ανάλυση συνδυασμό γονότυπο για το τρεις SNPs από το

SLC6A4

γονίδιο. Οι ασθενείς με γονότυπους με τουλάχιστον ένα ελάχιστο αλληλόμορφο σε οποιαδήποτε από τις τρεις SNPs συγκρίθηκαν με τους ασθενείς που ήταν ομοζυγώτες για μεγάλα αλληλόμορφα. Μονοπαραγοντική ανάλυση έδειξε ότι η παρουσία ενός τουλάχιστον ελάχιστο αλληλόμορφο σχετίστηκε με χειρότερη OS και DSS, αλλά όχι με DFS σε ομάδα μας (Πίνακας 4? Σχήμα 2). Πιο ενδιαφέρον, όταν προσαρμοστεί για άλλες μεταβλητές, η παρουσία ενός τουλάχιστον έλασσον αλληλόμορφο συσχετίστηκε ανεξάρτητα με τόσο χειρότερα OS (HR: 1,631, 95% CI: 1,190 – 2,236, p = 0,002) και χειρότερα DSS (HR: 1.691, 95 % CI: 1,138 – 2,512, p = 0,009) (πίνακες 5 και 6). Αυτές οι συσχετίσεις ήταν ισχυρότερες από εκείνες που διαπιστώθηκαν κατά την

SLC6A4

-rs12150214 αναλύθηκε μόνη της (Πίνακας 3? Σχήματα 1 και 2). Οι υπολογισμοί AIC έδειξαν ότι η προσθήκη του

SLC6A4

-rs12150214 γονότυπο στα πολυπαραγοντικά μοντέλα (τόσο για το OS και DSS) που περιέχει επίσης την ηλικία, το στάδιο, οι μεταβλητές κατάστασης βαθμό, και MSI βελτίωσε τις προβλέψεις του μοντέλου (Πίνακας 7) . Ωστόσο, η καλύτερη βελτίωση ανιχνεύθηκε όταν το μοντέλο περιείχε τις συνδυασμένες

SLC6A4

γονότυπους εκτός από τις κλινικές μεταβλητές (Πίνακας 7). Επιπλέον, σε σύγκριση με το μοντέλο DSS, η βελτίωση μοντέλο ήταν πιο βαθιά στο μοντέλο OS.

Δεν υπήρχε συσχέτιση μεταξύ της συνδυασμένης κατάσταση γονοτύπου και δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά που αναφέρονται στον Πίνακα 2 (

τα δεδομένα δεν εμφανίζονται

).

Οι άμεσες συνδέσεις μεταξύ του μεταβάλλεται δραστηριότητα 5-ΗΤΤ καθώς και την κατάθλιψη και την πρόγνωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος απομένουν να καθοριστούν από περαιτέρω μελέτες (βέλη με διακεκομμένες γραμμές).

η

Συζήτηση

Ενώ οι καθιερωμένες προγνωστικοί δείκτες, όπως το στάδιο της νόσου που χρησιμοποιείται στην πρόγνωση, ένα μεταξύ των ασθενών προγνωστική παραμένει η μεταβλητότητα [3]. Καλύτερη προγνωστική απόδοση μπορεί να προέρχεται από την αναγνώριση του ακόμα-να-να αναγνωριστεί προγνωστικούς δείκτες. Για παράδειγμα, αρκετές επιδημιολογικές μελέτες έχουν δείξει μια επίδραση των παραγόντων ζωής (όπως το επίπεδο της φυσικής δραστηριότητας) στην πρόγνωση [22], [23]. Παρά το γεγονός ότι δεν είναι καλά μελετηθεί σε καρκίνο του παχέος εντέρου, συναισθηματικές διαταραχές και ψυχολογικές παρεμβάσεις μετά τη διάγνωση έχουν εμπλακεί στην τροποποίηση του αποτελέσματος [24] – [27]. Ως εκ τούτου, στην παρούσα μελέτη, έχουμε ως στόχο να δοκιμάσουν τις ενώσεις των πέντε γενετικές παραλλαγές σε γονίδια αντίδραση στο στρες (

SLC6A4, BDNF,

και

AVPR1B

) με κλινικά αποτελέσματα σε έναν πληθυσμό με βάση ομάδα των 280 ασθενών καρκίνο του παχέος εντέρου από τη Νέα Γη και Λαμπραντόρ (NL). NL είναι μία από τις 13 επαρχίες /περιοχές στον Καναδά και έχει την υψηλότερη συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του παχέος εντέρου, καθώς και ένα από τα υψηλότερα ποσοστά θνησιμότητας από καρκίνο στον Καναδά [1], [28]. Αυτός ο πληθυσμός χαρακτηρίζεται επίσης από υψηλή συχνότητα εμφάνισης οικογενή καρκίνο του παχέος εντέρου [29], [30]. Μία δύναμη της μελέτης μας είναι η μακρά χρονική περίοδος που οι ασθενείς ακολούθησαν (έως 12,5 χρόνια μετά τη διάγνωση του καρκίνου). Κατά συνέπεια έχουμε τεκμηριωμένα πολλές εκδηλώσεις, οι οποίες αυξήθηκαν δύναμη μελέτη μας. Μια αδυναμία της μελέτης μας είναι ότι τα αποτελέσματα που επιτεύχθηκαν παραμένουν να επαναληφθεί και σε άλλες ομάδες. Επιπλέον, βιοδείκτες ορού με προγνωστικές δυνατότητες, όπως η ιντερλευκίνη-6 (IL-6), καρκινοεμβρυονικό αντιγόνο (CEA), και το αντιγόνο υδατάνθρακα 19-9 (CA 19-9) δεν αξιολογήθηκαν σε μελέτη μας.

τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι οι πολυμορφισμοί ούτε στο

BDNF

ούτε το

AVPR1B

γονίδια συσχετίστηκαν με αποτέλεσμα στην ομάδα μας ασθενή, αν και δεν μπορούμε να αποκλείσουμε τα ψευδώς αρνητικά ευρήματα λόγω της έλλειψης επαρκή δύναμη μελέτη, ειδικά στην περίπτωση της σχετικά σπάνιες

AVPR1B-

rs35369693 πολυμορφισμό. Ωστόσο, βρήκαμε ότι η rs12150214 SNP, η οποία είναι μια σχετικά κοινή G & gt? C υποκατάσταση στη μη κωδικοποιητική περιοχή του

SLC6A4

γονίδιο, συνδέθηκε με την κακή OS σε μια μονοπαραγοντική, καθώς και σε μία ανάλυση πολλαπλών μεταβλητών . Συγκεκριμένα, όταν προσαρμόζεται για το φύλο, το στάδιο, το βαθμό, την ηλικία και την κατάσταση της MSI, οι ασθενείς που φέρουν το αλληλόμορφο παραλλαγή C (δύο ομοζυγώτες CC και ετεροζυγώτες CG) ήταν κατά 57% αυξημένο κίνδυνο θανάτου (95% CI: 1,142 – 2,164? Πίνακας 3 ) σε σύγκριση με τους ασθενείς με το γονότυπο GG. Όταν οι γενότυποι που περιέχουν τα ελάσσονα αλληλόμορφα συνδυάστηκαν για τα τρία

SLC6A4 SNPs

, εντοπίσαμε μια σημαντική συσχέτιση με όχι μόνο OS, αλλά και με DSS (Πίνακες 5 και 6). Αυτές οι ενώσεις ήταν ανεξάρτητα από άλλες κλινικά σημαντικές μεταβλητές όπως η ηλικία, το στάδιο, το βαθμό και την κατάσταση MSI. Παρά το γεγονός ότι η προσέγγισή μας δεν περιλαμβάνουν όλες τις παραλλαγές στο

SLC6A4

γονιδίων, τα αποτελέσματα αυτά δείχνουν τη σύνδεση πολλαπλών

SLC6A4

παραλλαγές με την πρόγνωση σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου. Επιπλέον, τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι η συμπερίληψη του

SLC6A4

γονότυπους, ιδιαίτερα οι συνδυασμένες γονότυπους, ως μεταβλητή βελτιώνει την προγνωστική ακρίβεια τόσο του λειτουργικού συστήματος και τα μοντέλα πολλών μεταβλητών DSS (Πίνακας 7). Τα σχήματα 1 και 2 δείχνουν επίσης ότι οι συνδυασμένες

SLC6A4

γονότυπους, σε σύγκριση με rs12150214 γονότυπους μόνο, οδηγεί σε ένα καλύτερο διαχωρισμό των καμπυλών επιβίωσης των ασθενών.

Η ανισορροπία σύνδεσης (LD) χάρτης του

SLC6A4 γονίδιο

και οι σχετικές θέσεις των τριών SNPs διερευνηθεί στην παρούσα μελέτη (rs4251417, rs12150214, και rs140700) δείχνονται στο Σχήμα S1. Αυτά τα τρία SNPs είναι όλα τα μη-κωδικοποίησης πολυμορφισμών και βρίσκονται σε μη συνδεδεμένες περιοχές του

SLC6A4

γονίδιο (δηλαδή δεν συσχετίζονται με το άλλο? R

2 & lt? 0,8). Συγκεκριμένα, rs4251417 και rs12150214 βρίσκονται στο 5′-άκρο του γονιδίου (στο ιντρόνιο 1) και rs140700 βρίσκεται στο ιντρόνιο 6. Κατά το παρόν, δεν είναι σαφές πώς αυτές οι πολυμορφισμοί μπορούν να επηρεάσουν την

SLC6A4

γονιδιακή έκφραση ή λειτουργία? Ωστόσο, είναι επίσης πιθανό ότι άλλα λειτουργικά πολυμορφισμοί που σχετίζονται στενά με αυτά στην πραγματικότητα μπορεί να είναι οι παραλλαγές που σχετίζονται με βιολογικά αλλαγμένη λειτουργία γονιδίου και κατά συνέπεια την πρόγνωση (Σχήμα S1).

Για τις γνώσεις μας, δεν υπάρχει καμία αναφορά συνδέοντας rs4251417 να τονίσω απάντηση ή άλλη ασθένεια στον άνθρωπο. Ωστόσο, στο παρελθόν, ο πολυμορφισμός rs12150214 (που βρίσκεται στο LD μπλοκ-2 στο σχήμα S1) αναφέρθηκε για να είναι οριακά σχετίζονται με τις βαθμολογίες Απογραφή Κατάθλιψης Beck σε μια μελέτη που διερεύνησε 360 αρσενικά δίδυμα [31]. Οι συγγραφείς αυτοί εκτελούνται επίσης μια ανάλυση απλότυπου με τους πολυμορφισμούς που συνδέονται με rs12150214 και διαπίστωσε ότι αυτή η περιοχή του

SLC6A4

γονίδιο συνδέθηκε με όχι μόνο την κατάθλιψη αλλά και αυξημένα επίπεδα IL-6 στα θέματα της μελέτης. Είναι ενδιαφέρον ότι, η IL-6 είναι ένα προ-φλεγμονωδών κυτοκινών (

βλέπε παρακάτω

). Σε μια άλλη μελέτη στην οποία συμμετείχαν 567 άτομα, Lazary

et al

. [32] πρότειναν ότι ο πολυμορφισμός rs140700 (ή άλλες παραλλαγές που συνδέονται με αυτό) δρα ως τροποποιητής των καταθλιπτικών συμπτωμάτων (αυτός ο πολυμορφισμός βρίσκεται στο LD block-1 στο σχήμα S1). Αυτά έχουν αναφερθεί στο παρελθόν ευρήματα αυτά υποδηλώνουν ότι πολλές παραλλαγές μέσα στο

SLC6A4

γονίδιο είναι πιθανό να εμπλέκονται στην τροποποίηση της λειτουργίας των γονιδίων με αρνητικές συνέπειες για την αντίδραση στο στρες και την κατάθλιψη. Αυτό μπορεί επίσης να εξηγήσει γιατί έχουμε ανιχνευθεί μια ισχυρότερη σύνδεση τόσο με το λειτουργικό σύστημα και το DSS στην ομάδα μας ασθενή όταν τα δεδομένα γονότυπου για τους τρεις

SLC6A4

SNPs συνδυάστηκαν και αναλύθηκαν σε αναλύσεις πολλών μεταβλητών. Ωστόσο, με την απουσία των ψυχολογικών δεδομένων υγείας στην ομάδα μας, δεν μπορούμε να καθορίσουμε αν η παρατηρούμενη συσχέτιση του

SLC6A4

γονίδιο με μικρότερους χρόνους επιβίωσης είναι λόγω του ρόλου της στην ψυχολογική δυσφορία ή λόγω άλλων βιολογικών ρόλων των η

SLC6A4

.

στην πραγματικότητα, εκτός από το ρόλο της στην ψυχολογική αντίδραση στο στρες, η πρωτεΐνη 5-ΗΤΤ κωδικοποιείται από το

SLC6A4

γονιδίου καθώς και συνδέτη του ( σεροτονίνη) λειτουργία στην ανοσολογική απόκριση και φλεγμονή, συμπεριλαμβανομένων του εντέρου. Για παράδειγμα, σηματοδότηση σεροτονίνη ρυθμίζει μετάβαση σκαμνί στο έντερο και τα επίπεδα σεροτονίνης σε αυτό το όργανο μπορεί να τροποποιηθεί (είτε με αλλαγμένη ποσοστά έκκρισης σεροτονίνης ή λειτουργία της πρωτεΐνης 5-ΗΤΤ), ως αποτέλεσμα της τοπικής μόλυνσης και φλεγμονής [33]. Είναι ενδιαφέρον ότι, μια πρόσφατη μελέτη χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο ποντικού της κολίτιδας έδειξε ότι η απώλεια της δραστικότητας 5-ΗΤΤ ενισχύει την σοβαρότητα της φλεγμονής στο κόλον [34]. Αυτά τα ευρήματα υποδηλώνουν την παρουσία ενός αμφίδρομη αλληλεπίδραση μεταξύ 5-ΗΤΤ και φλεγμονή. Ένα παρόμοιο μοτίβο παρατηρείται επίσης σε φλεγμονή και κατάθλιψη, όπου ο ένας φαίνεται να προκαλέσουν ή να επιδεινώσουν το άλλο [35], [36]. Η αύξηση ή η επίμονη φλεγμονή συνδέεται επίσης με την εξέλιξη του όγκου, συμπεριλαμβανομένων των καρκίνων του παχέος εντέρου [37], [38]. Είναι ενδιαφέρον ότι η IL-6 στο παρελθόν έχει αναφερθεί να σχετίζεται με παραλλαγές στο

SLC6A4

γονίδιο [31] (

δείτε την προηγούμενη παράγραφο

), η οποία φαίνεται επίσης να είναι ένας μεσολαβητής της εξέλιξης του όγκου σε ορθοκολικό καρκίνος [37], [39], [40]. Ως εκ τούτου, προτείνουμε ότι η συναισθηματική ή φυσιολογικό στρες (π.χ. φλεγμονή), και που συνδέονται νευρολογικές και ανοσολογικές αποκρίσεις μπορούν να τροποποιηθούν από την δραστηριότητα της πρωτεΐνης 5-ΗΤΤ (είτε από περιβαλλοντικούς παράγοντες ή από τις γενετικές παραλλαγές στο

SLC6A4

γονίδιο), η οποία μπορεί να εξηγήσει την κακή επιβίωση παρατηρήθηκε σε ομάδα μας από ασθενείς με ορθοκολικό καρκίνο (Σχήμα 3). Ως εκ τούτου, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για τις πιθανές ρόλους των

SLC6A4

παραλλαγές γονιδίων και την κατάθλιψη στην επιβίωση των ασθενών με καρκίνο του παχέος δικαιολογημένη.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Οι τρεις

SLC6A4

SNPs διερευνήθηκε σε αυτή τη μελέτη (rs4251417, rs12150214 και rs140700) είναι σε κύκλο. Τα μαύρα τρίγωνα ορίζουν τα μπλοκ LD. Τα κόκκινα τετράγωνα είναι όπου η συσχέτιση μεταξύ των δεικτών είναι η ισχυρότερη. Σημειώστε ότι το γονίδιο εμφανίζεται σε μια 3 ‘έως 5’ προσανατολισμό σε αυτό το σχήμα. Σύμφωνα με την Haploview (ζεύγη Tagger) [17] αποτελέσματα, rs12150214 σχετίζεται σε μεγάλο βαθμό με τις ακόλουθες πολυμορφισμούς κατά μήκος του

SLC6A4

γονίδιο με συντελεστή συσχέτισης (r

2) της & gt? 0.85: rs8076005, rs11080122 , rs6354, rs25528, rs2020936 και rs8071667 (σχολιασμένο με αστέρια στο Σχήμα S1)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0038953.s001

(TIFF)

πίνακα S1.

Σημαντικές αποτελέσματα εμφανίζονται με έντονους χαρακτήρες. CI: διάστημα εμπιστοσύνης, diff: διαφοροποιημένα, HR: αναλογία κινδύνους, MSI-H: μικροδορυφορικού αστάθεια-υψηλή, MSI-L: μικροδορυφορικού αστάθεια-χαμηλό, MSS: μικροδορυφόρων σταθερή, n: αριθμός δειγμάτων που περιλαμβάνονται στην ανάλυση, vs: έναντι .

doi: 10.1371 /journal.pone.0038953.s002

(DOC)

Πίνακας S2.

Σημαντικές αποτελέσματα εμφανίζονται με έντονους χαρακτήρες. CI: διάστημα εμπιστοσύνης, diff: διαφοροποιημένα, HR: αναλογία κινδύνους, MSI-H: μικροδορυφορικού αστάθεια-υψηλή, MSI-L: μικροδορυφορικού αστάθεια-χαμηλό, MSS: μικροδορυφόρων σταθερή, n: αριθμός δειγμάτων που περιλαμβάνονται στην ανάλυση, vs: έναντι .

doi: 10.1371 /journal.pone.0038953.s003

(DOC)

πίνακα S3.

Σημαντικές αποτελέσματα εμφανίζονται με έντονους χαρακτήρες. CI: διάστημα εμπιστοσύνης, diff: διαφοροποιημένα, HR: αναλογία κινδύνους, MSI-H: μικροδορυφορικού αστάθεια-υψηλή, MSI-L: μικροδορυφορικού αστάθεια-χαμηλό, MSS: μικροδορυφόρων σταθερή, n: αριθμός δειγμάτων που περιλαμβάνονται στην ανάλυση, vs: έναντι .

doi: 10.1371 /journal.pone.0038953.s004

(DOC)

Ευχαριστίες

Οι συγγραφείς ευχαριστήσω Payal Sipahimalani για τεχνική βοήθεια και ο Δρ Veeresh Gadag για τη βοήθειά του με τους υπολογισμούς AIC.