Αφηρημένο

Ο σκοπός της εργασίας αυτής ήταν η διερεύνηση των πτητικών οργανικών ενώσεων (VOC) που προέρχονται από δείγματα ούρων για να διαπιστωθεί κατά πόσον μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την ταξινόμηση των δειγμάτων σε εκείνους από καρκίνο του προστάτη και μη-καρκίνου ομάδες. Οι συμμετέχοντες ήταν άνδρες που αναφέρεται για ένα trans-ορθού υπερήχους καθοδηγούμενη βιοψία του προστάτη εξαιτίας ενός συγκεκριμένου επιπέδου αντιγόνο αυξημένα προστάτη (PSA) ή παθολογικά ευρήματα στην δακτυλική εξέταση. Τα δείγματα ούρων συλλέχθηκαν από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη (n = 59) και του καρκίνου χωρίς ελέγχους (n = 43), κατά την ημέρα της βιοψίας τους, πριν από την διαδικασία τους. VOCs από τον υπερκείμενο χώρο του αλκαλοποιήθηκε δείγματα ούρων εκχυλίζονται χρησιμοποιώντας μικρο-εκχύλισης στερεάς φάσης και αναλύθηκαν με χρωματογραφία φασματομετρία αερίου /μάζας. Ταξινομητές αναπτύχθηκαν χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσους (RF) και τεχνικές ταξινόμησης Γραμμική Διαχωριστική Ανάλυση (LDA). PSA μόνο είχε ακρίβεια 62-64% σε αυτά τα δείγματα. Ένα μοντέλο με βάση 4 VOCs, 2,6-διμεθυλο-7-οκτεν-2-όλης, πεντανάλη, 3-οκτανόνη, και 2-οκτανόνη, ήταν οριακά πιο ακριβή 63-65%. Όταν συνδυάζονται, επίπεδο PSA και οι τέσσερις αυτοί VOCs είχαν μέση ακρίβειες του 74% και 65%, με τη χρήση RF και LDA, αντίστοιχα. Με την επαναλαμβανόμενη διπλό σταυρό-επικύρωσης, η μέση ακρίβεια έπεσε στο 71% και 65%, με τη χρήση ραδιοσυχνοτήτων και LDA, αντίστοιχα. Τα αποτελέσματα από VOC προφίλ του υπερκείμενου χώρου ούρων είναι ενθαρρυντικά και δείχνουν ότι υπάρχουν και άλλες μεταβολομική λεωφόρους που αξίζει να εξεταστούν που θα μπορούσε να συμβάλει στη βελτίωση της διαστρωμάτωσης των ανδρών σε κίνδυνο του καρκίνου του προστάτη. Αυτή η μελέτη προσθέτει, επίσης, με τις γνώσεις μας σχετικά με το προφίλ των ενώσεων που βρίσκονται στα ούρα γίνεται βασικό, από τους ελέγχους και ασθενείς με καρκίνο, που είναι χρήσιμες πληροφορίες για μελλοντικές μελέτες που συγκρίνουν τα ούρα από ασθενείς με άλλες νοσηρές καταστάσεις

Παράθεση:. Khalid Τ , Aggio R, Λευκό P, De Lacy Costello Β, Persad R, al-Kateb H, et al. (2015) του ουροποιητικού Πτητικές Οργανικές Ενώσεις για την ανίχνευση του καρκίνου του προστάτη. PLoS ONE 10 (11): e0143283. doi: 10.1371 /journal.pone.0143283

Επιμέλεια: Franky L. Chan, το Κινεζικό Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 10 Ιουλ 2015? Αποδεκτές: 3 Νοέμβρη, 2015? Δημοσιεύθηκε: 24 του Νοέμβρη, 2015

Copyright: © 2015 Khalid κ.ά.. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. το έργο αυτό χρηματοδοτήθηκε από το Ροταριανό Όμιλο, https://www.rotary.org/en. Πρόσθετη χρηματοδότηση που παρέχονται από τον Ralph Shackman Trust, Woodfines LLP, Lockton Σπίτι, Clarendon Road, Cambridge, CB28FH. Καμία επίσημη διεύθυνση URL είναι διαθέσιμη αν τα στοιχεία εγγραφής του στο φιλανθρωπικό ίδρυμα μπορεί να βρεθεί στη διεύθυνση: https://opencharities.org/charities/287406. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του προστάτη είναι η δεύτερη πιο διαδεδομένη κακοήθεια που επηρεάζει τους άνδρες σε όλο τον κόσμο, και όμως δεν υπάρχει αξιόπιστο εργαλείο ελέγχου. Πάνω από 40.000 περιπτώσεις ανιχνεύθηκε στο Ηνωμένο Βασίλειο κάθε χρόνο [1], συνήθως με ένα συνδυασμό δακτυλική εξέταση (DRE), ειδικό αντιγόνο (PSA) μετρήσεις του προστάτη ορού και ακολούθησε trans-ορθού υπερηχογραφικό έλεγχο (TRUS) βιοψία του προστάτη. Ο καρκίνος του προστάτη είναι η δεύτερη συνηθέστερη αιτία θανάτου από κακοήθεια στο Ηνωμένο Βασίλειο [2].

Ο ορός PSA, σε μια αποκοπής των 4 ng /ml, είναι μέρος μιας FDA-εγκεκριμένο πρόγραμμα προσυμπτωματικού ελέγχου του USA [3]. Ωστόσο, οι δοκιμές PSA δεν χρησιμοποιείται για τη διαλογή αλλού λόγω της χαμηλής ευαισθησίας της, εκτιμάται ότι είναι 21% για την ανίχνευση κάθε καρκίνο του προστάτη και 51% για την ανίχνευση καρκίνων υψηλής ποιότητας (Gleason ≥8) με PSA τιμές αποκοπής του 4,0 ng /ml [4]. Το ψευδώς αρνητικό ποσοστό είναι έως και 20% σε αυτό το cut-off [5, 6]. Στην διαλογή, μόνο 25 έως 30% των ανδρών με αυξημένα επίπεδα PSA μεταξύ 4-10 ng /ml έχουν καρκίνο του προστάτη [7, 8].

Διαλογή με βάση τα επίπεδα του PSA έχει οδηγήσει σε ανησυχία για πολλούς άνδρες, οι οποίοι δεν έχουν καρκίνο του προστάτη και την υπερ-διάγνωση των καρκίνων βραδείας ανάπτυξης που ήταν απίθανο να ενέχουν σημαντικό κίνδυνο για τους ασθενείς. Δύο πρόσφατες μεγάλες μελέτες προσυμπτωματικού ελέγχου δεν διαπίστωσαν σημαντική μείωση της θνησιμότητας από καρκίνο του προστάτη ακόλουθες δοκιμές προσυμπτωματικού ελέγχου PSA-based [9, 10]

Άλλα βιοδείκτες δυναμικό αίματος και ούρων βασίζεται για τον καρκίνο του προστάτη περιλαμβάνουν:. Προστατικό αντιγόνο του καρκίνου του 3 [PCA3 ] [11], η ενδοκυτταρική PSA [12], παράγωγα PSA [13], η πρώιμη αντιγόνο καρκίνου του προστάτη 2 [14], αννεξίνη A3 [15], το γονίδιο σύντηξης TMPRSS2: ERG [16, 17], την ανθρώπινη καλλικρεΐνη 2 [18] και η πρωτεΐνη Engrailed-2 (EN2) [19, 20]. Ωστόσο, κανένα από αυτά χρησιμοποιούνται για τη διαλογή [21, 22]. Σαρκοσίνη προτάθηκε ως βιοδείκτη για τον μεταστατικό καρκίνο του προστάτη [23], αλλά το εύρημα αυτό δεν έχει αναπαραχθεί [24-26].

Αρκετές μελέτες έχουν αναφέρει ότι οι σκύλοι μπορούν να εκπαιδευτούν για τον εντοπισμό του δέρματος, της ουροδόχου κύστης, του πνεύμονα, δείγματα του μαστού και τον καρκίνο των ωοθηκών από την αναπνοή, ο ιστός και τα ούρα [27-30]. Cornu

et al

εκπαιδεύσει μια βελγική Mallinois για τον εντοπισμό του καρκίνου του προστάτη από δείγματα ούρων ελέγχου με ευαισθησία και ειδικότητα από 91% [31]. Elliker

et al

εκπαιδευμένο δύο σκυλιά για τον εντοπισμό του καρκίνου του προστάτη από δείγματα ούρων έλεγχο, ωστόσο, δεν ήταν σε θέση να διακρίνουν τους καρκίνους από τους ελέγχους, όταν παρουσιάζονται με νέα δείγματα σε μια δοκιμή διπλή-τυφλή [32]. Ταβέρνα

et al

συλλέγονται δείγματα από 362 ασθενείς με καρκίνο του προστάτη και 540 έλεγχοι: 2 σκυλιά ελέγχθηκαν, σκύλος 1 πραγματοποιείται καλύτερα με ευαισθησία 100% και ειδικότητα 98,7% και το σκυλί 2 επιτευχθεί ευαισθησία 98,6% και ειδικότητα από 97,6% [33].

Μετά την απόδειξη της έννοιας μελέτες σε σκύλους, οι ερευνητές έχουν επίσης δοκιμαστεί ηλεκτρονικής τεχνολογίας μύτη να διακρίνουν την οσμή των ούρων από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη και των ελέγχων, επιτυγχάνοντας μια ευαισθησία 71 έως 82 % και ειδικότητα 67 έως 93% [34, 35].

Η οσμή υπογραφή των ούρων παράγεται με ουσίες που είναι γνωστό ως πτητικές οργανικές ενώσεις (VOCs), τα οποία μπορούν να διαχωριστούν και να προσδιορίζονται από /φασματοσκοπία μάζας αερίου χρωματογραφίας (GC /MS). Στην παρούσα μελέτη, έχουμε σύγκριση των προφίλ VOC του υπερκείμενου χώρου ούρων από 102 ασθενείς με ουρολογικά συμπτώματα, 59 από τους οποίους είχαν καρκίνο του προστάτη και 43 που δεν έκανε. Για το καλύτερο της γνώσης μας, δεν εκτεταμένες εργασίες έχει δημοσιευθεί για το θέμα αυτό μέχρι σήμερα.

Υλικά και Μέθοδοι

Η δεοντολογική έγκριση για τη μελέτη λήφθηκε από την Επιτροπή Wiltshire Δεοντολογίας Έρευνας (REC αριθμός αναφοράς 08 /H0104 /63? πρωτόκολλο SU /2008/2901, έκδοση 3 εγκριθεί 09/06/2009) με R &? έγκριση D από το Πανεπιστήμιο του Μπρίστολ Νοσοκομεία NHS Foundation Trust από όπου οι συμμετέχοντες είχαν προσληφθεί για μια περίοδο 13 μηνών. Κάθε συμμετέχων μελέτησε ένα δελτίο πληροφοριών και έδωσε γραπτή συγκατάθεση. Όλοι οι συμμετέχοντες ήταν άνδρες οι οποίοι παραπέμφθηκαν για TRUS καθοδηγούμενη βιοψία του προστάτη εξαιτίας ενός αυξημένου επιπέδου PSA ή παθολογικά ευρήματα στην δακτυλική εξέταση, δευτεροβάθμια και σε άλλα ουρολογικά προβλήματα (βλ S1 πίνακα).

Τα δείγματα ούρων συλλέχθηκαν στην καθολική μπουκάλια πριν στους ασθενείς βιοψία του προστάτη TRUS (10-12 πυρήνες) και τα δείγματα ταξινομήθηκαν ως καρκίνο του προστάτη ή των ελέγχων μετά την παθολογική εξέταση των δειγμάτων βιοψίας. Ανάλυση ούρων και το ειδικό βάρος πραγματοποιήθηκαν σε όλα τα δείγματα κάτω από το ΤΕΠ της κλινικής ουρολογία. συγκεκριμένα επίπεδα αντιγόνου του προστάτη μετρήθηκαν στο Bristol Royal Infirmary χρήση IMMULITE δοκιμασία 2000 PSA και IMMULITE αναλυτή 2000 (Siemens Medical Solutions Diagnostics, Νέα Υόρκη, ΗΠΑ). Τα δημογραφικά στοιχεία για τις ομάδες ασθενών που μελετήθηκαν δίνονται στον Πίνακα 1.

Η

Τα συνοδά νοσήματα και φάρμακα των ασθενών που συμπεριλήφθηκαν στο S1 πίνακα μαζί με την αιτία παραπομπής ασθενή για βιοψία του προστάτη. Οι ασθενείς εξαιρέθηκαν εάν είχαν ένα ιστορικό καρκινώματος ουροθηλιακά ή άλλες γνωστές κακοήθειες, μία λοίμωξη του ουροποιητικού συστήματος, ή ουροκαθετήρα in situ. Δεν υπήρχαν κριτήρια αποκλεισμού σχετικά με την εθνικότητα του ασθενούς, την κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα, τα ναρκωτικά, ή τα τρόφιμα. Κλάσματα των νωπών ούρων, 0,75 ml, μεταφέρθηκαν σε φιαλίδια διάφραγμα ολοκληρώνεται υπερκείμενης φάσης (Sigma Aldrich, Dorset, UK) και καταψύχθηκαν στους -20 ° C μέχρι την ανάλυση. Δεν υπάρχουν ενδείξεις ότι η αποθήκευση στους -20 ° C έχει αρνητική επίδραση στην παρουσία των πτητικών οργανικών ενώσεων σε αέρια υπερκείμενης φάσης από δείγματα ούρων [36, 37]. Επιπλέον, τα δείγματα συλλέγονται, αποθηκεύονται και αναλύονται με τυχαίο τρόπο. Συνεπώς, οποιαδήποτε μεταβολή κατά την αποθήκευση του δείγματος θα είχαν παρόμοια επίδραση και στις δύο του καρκίνου και τον έλεγχο των ομάδων που μελετήθηκαν εδώ.

Πριν από την ανάλυση του υπερκείμενου χώρου ούρων κάθε δείγμα αποψυχθεί δι’εμβαπτίσεως του φιαλιδίου σε ένα λουτρό νερού στους 60 ° C για 30 δευτερόλεπτα. Μία και μόνη κατάλληλη ποσότητα του δείγματος ούρων ανά ασθενή χρησιμοποιήθηκε για ανάλυση VOC. Στη συνέχεια, κάθε δείγμα υποβλήθηκε σε επεξεργασία με ένα ίσο όγκο (0,75 ml) υδροξειδίου του νατρίου (1Μ? Fisher Scientific, Leicestershire, UK). Η προσθήκη βάσης, οξέος και άλας χρησιμοποιούνται συνήθως μέθοδοι για τη βελτίωση της ανίχνευσης των πτητικών οργανικών ενώσεων από δείγματα ούρων [36-39]. Σε γενικές γραμμές, αυτές οι μέθοδοι αυξάνουν τη συγκέντρωση των πτητικών οργανικών ενώσεων στον άνω χώρο με την αύξηση της ιοντικής ισχύος του δείγματος. Σε αυτή τη μελέτη, ακριβώς την ίδια μέθοδο θεραπείας εφαρμόστηκε σε δείγματα ούρων από ασθενείς με καρκίνο και των ελέγχων. Ως εκ τούτου, αναμένουμε η επίδραση υδροξειδίου του νατρίου να είναι παρόμοια και στις δύο ομάδες. Το μίγμα εξισορροπήθηκε στους 60 ° C σε υδατόλουτρο για 30 λεπτά πριν από, και κατά τη διάρκεια, την εκχύλιση πτητικών οργανικών ενώσεων από τον υπερκείμενο χώρο με ένα στερεάς φάσης μικρο-εκχύλισης (SPME) ίνα.

Η ίνα SPME ήταν 85 μm σε πάχος και αποτελούνταν από carboxen /πολυδιμεθυλοσιλοξάνης (Sigma Aldrich, Dorset, UK). Η ίνα εκτέθηκε στο υπερκείμενο χώρο πάνω από το μίγμα της ούρα για 20 λεπτά και μετά από εκχύλιση το VOCs αναλύθηκαν με GC /MS (Perkin Elmer Clarus 500 τετράπολο, Beaconsfield, Ηνωμένο Βασίλειο). Οι VOCs θερμικά εκροφάται από την ίνα στους 220 ° C στη θυρίδα έγχυσης του GC /MS για 5 λεπτά. Ένεση έγινε στις splitless λειτουργία και μια διάσπαση των 50 ml /min είχε μετατραπεί σε δύο λεπτά στο τρέξιμο.

φορέα αέριο ήλιο καθαρότητας 99,996% (BOC, Γκίλφορντ, Ηνωμένο Βασίλειο) πέρασε μέσα από ένα σύστημα καθαρισμού του ηλίου , Excelasorb

™ (Supelco, Poole, UK) σε 1 ml min

-1. Η στήλη GC ήταν μήκους 60 μέτρων τριχοειδή στήλη Zebron ΖΒ-624 με εσωτερική διάμετρο 0,25 mm και πάχος μεμβράνης 1.4 μm, που έχει σχεδιαστεί ειδικά για τον διαχωρισμό των πτητικών οργανικών ενώσεων (Phenomenex, Μάκλσφιλντ, UK). Η σύνθεσή του αποτελούνταν από 94% διμεθυλοπολυσιλοξάνιο και 6% κυανοπροπύλιο-φαινυλ

Ο /MS πρόγραμμα θερμοκρασίας GC του πειράματος ήταν ως εξής: α. αρχική θερμοκρασία του κλιβάνου διατηρήθηκε στους 40 ° C για 2 λεπτά και στη συνέχεια η θερμοκρασία ήταν επέκτεινε μέχρι με ρυθμό 5 ° C /min στους 220 ° C, με ένα αμπάρι 4 λεπτό σε αυτή τη θερμοκρασία για να δώσει ένα συνολικό χρόνο εκτέλεσης 42 λεπτών. Το φασματόμετρο μάζας λειτούργησε σε ηλεκτρονική κατάσταση ιονισμού πρόσκρουσης (ΕΙ), σαρώνοντας το εύρος μάζας ιόντων 10-300 σε 0.05 σάρωσης /sec. Μια καθυστέρηση διαλύτη 4 λεπτά χρησιμοποιήθηκε κατά την έναρξη της διαδικασίας.

Η επεξεργασία δεδομένων

Τα δεδομένα GC-MS υποβλήθηκε σε επεξεργασία με τη χρήση ενός αγωγού που περιλαμβάνει το λογισμικό αναγνώρισης Αυτοματοποιημένο Σύστημα Φασματομετρίας Μάζας Αποσυνέλιξη και (AMDIS , έκδοση 2.71, 2012), το NIST φασματομετρίας μάζας βιβλιοθήκη (έκδοση 2.0, 2011) και το πακέτο R (βασική ομάδα R, 2013) Metab [40]. AMDIS και NIST χρησιμοποιήθηκαν για την κατασκευή μιας βιβλιοθήκης VOC που περιέχει 197 μεταβολιτών που υπάρχουν στα δείγματα ούρων που αναλύθηκαν σε αυτή τη μελέτη (S2 πίνακα). Ένα προς τα εμπρός και αντίστροφη αγώνα των 800/1000 και παραπάνω χρησιμοποιήθηκε για την ανάθεση ένωση ταυτοποιήσεις δειλά. Χρησιμοποιώντας αυτή τη βιβλιοθήκη VOC, AMDIS στη συνέχεια εφαρμόστηκε για deconvoluting GC-MS χρωματογραφήματα και τον εντοπισμό των μεταβολιτών. Η έκθεση που παράγεται από AMDIS περαιτέρω επεξεργασία από Metab, προκειμένου να επιβεβαιώσει την ταυτότητα των μεταβολιτών και υπολογίζεται εκ νέου σχετική αφθονία τους με βάση την ένταση ενός ειδικού κλάσματος μάζας ιόντων ανά μεταβολίτη. Προκειμένου να αναπτυχθούν ισχυρές φειδωλή στατιστικά μοντέλα, αυτές οι ενώσεις βρέθηκαν να είναι παρούσα σε λιγότερο από το 20% των ασθενών και στις δύο ομάδες (δηλαδή σχετικά σπάνιες ενώσεις) ή υπάρχει σε περισσότερο από το 90% των ασθενών και στις δύο ομάδες (δηλαδή σχετικά κοινό πτητικά ) αφαιρέθηκαν από τα στοιχεία που πριν από στατιστική μοντελοποίηση.

στατιστική Ανάλυση

τα προφίλ πτητικών οργανικών ενώσεων σε κάθε ασθενή μετατράπηκαν σε δυαδικά δεδομένα με βάση την παρουσία και την απουσία των μεταβολιτών. Στη συνέχεια, τέσσερις διαφορετικές προσεγγίσεις (Πίνακας 2) εφαρμόστηκαν για την επιλογή χαρακτηριστικών πριν από μοντέλο του κτιρίου.

Η

Τα χαρακτηριστικά, ή πτητικές οργανικές ενώσεις, που επιλέγονται από τουλάχιστον μία προσέγγιση επιλογής χαρακτηριστικών χρησιμοποιήθηκαν για την ανάπτυξη ταξινομητές χρήση τόσο του Fisher γραμμική Διαχωριστική Ανάλυση [43] και το δέντρο απόφασης Breiman της Τυχαία δάση [42]. Αυτοί οι ταξινομητές αξιολογήθηκαν ως δύο διαφορετικές προσεγγίσεις. Αυτή η διαδικασία επαναλήφθηκε στη συνέχεια χρησιμοποιώντας VOCs επιλέγονται από τουλάχιστον μία προσέγγιση επιλογής χαρακτηριστικών και των επιπέδων PSA του κάθε ασθενή για να δούμε πώς τα αποτελέσματα σε σύγκριση με εκείνη των πτητικών οργανικών ενώσεων μόνο και τη δοκιμή PSA μόνο. ​​

Είναι γνωστό ότι κτίριο μοντέλο και τη δοκιμή μοντέλο με τα ίδια δεδομένα μπορεί να παράγει προκατειλημμένη αποτελέσματα και μπορεί να υποφέρουν από πάνω τοποθέτηση με τα μοντέλα που περιγράφουν την ευκαιρία ιδιοσυγκρασιακή χαρακτηριστικά του δείγματος και όχι πραγματικές τάσεις. Αυτή η προσέγγιση περιγραφή του δείγματος είναι επιρρεπείς σε διογκωμένες και αισιόδοξη μέτρα της ακρίβειας μοντέλο, και πολύ χαμηλότερα ποσοστά ακρίβειας μπορεί να δει κανείς όταν το μοντέλο εφαρμόζεται σε νέα δεδομένα [44, 45]. Για να ξεπεραστούν αυτές τις πιθανές ατέλειες, μοντέλο επικύρωσης χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται 10 φορές διασταυρούμενης επικύρωσης όπως περιγράφεται από Delen [46] τέθηκε σε εφαρμογή. Επαναλαμβανόμενες διπλό σταυρό-επικύρωσης όπως περιγράφεται, εφαρμόζεται και συνιστάται έντονα από Filzmoser και οι συνεργάτες του [45], καθώς και από Anderssen και οι συνεργάτες του [44], χρησιμοποιήθηκε επίσης για την κατασκευή του μοντέλου και την αξιολόγηση του μοντέλου. Σχήμα 1 δίνει μια σχηματική επισκόπηση επαναλαμβάνεται 10 φορές διασταυρωμένης επικύρωσης και επαναλαμβανόμενες διπλό σταυρό-επικύρωσης. Η στρατηγική της διασταυρωμένης επικύρωσης βασίστηκε σε 30 επαναλήψεις και δέκα-πτυχώσεις. Η διπλή στρατηγική διασταυρούμενης επικύρωσης είχε επίσης 30 επαναλήψεις του εξωτερικού βρόχου (loop μοντέλο αξιολόγησης), με τα δεδομένα βαθμονόμησης και δοκιμής με βάση 3 πτυχώσεις. Ο εσωτερικός βρόχος (ο βρόχος μοντέλο ρύθμισης) χρησιμοποιούνται δεδομένα εκπαίδευσης και δοκιμών που βασίζονται στις 10 διπλώνει και με 30 επαναλήψεις.

Μια παραλλαγή Μόντε Κάρλο κάθε τεχνική επιτυγχάνεται με randomising τις ετικέτες των δειγμάτων δοκιμής.

είναι διδακτικό να επιδείξει μια ταξική δομή πάνω από οποιαδήποτε σχέση ευκαιρία. Με βάση το έργο της Ojala [47], τα δύο συστήματα διασταυρωμένης επικύρωσης επαναλήφθηκαν στα δεδομένα, αλλά με ένα Monte Carlo τυχαία μετάθεση των ετικετών κλάσης (καρκίνος του προστάτη, του ελέγχου) σε κάθε επανάληψη. Αυτή η προσέγγιση μετάθεση παρέχει ένα επίπεδο αναφοράς της συμφωνίας ευκαιρία για τη διαδικασία μοντελοποίησης, η οποία είναι απαραίτητη για να βοηθήσει την ποσοτικοποίηση των επιπτώσεων συλληφθεί από cross-επικυρωμένα μοντέλα που προκύπτουν με αυθεντικά στοιχεία. Όλες οι τεχνικές μοντελοποίησης και το μοντέλο επικυρώσεις εφαρμόστηκαν χρησιμοποιώντας το πακέτο R δρομέα [42].

Αποτελέσματα

εκτιμήθηκε Η διαγνωστική ικανότητα να χρησιμοποιεί τα επίπεδα PSA και μόνο γι ‘αυτή την ομάδα ασθενών. Χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται 10 φορές διασταυρωμένης επικύρωσης, οι ασθενείς θα μπορούσαν να ταξινομηθούν σε καρκίνο του προστάτη και τον καρκίνο-ελεύθερες ομάδες με βάση τα επίπεδα του PSA τους με μέσες ακρίβειες του 62% και 64%, χρησιμοποιώντας τυχαία Forest και γραμμική διακριτική ανάλυση, αντίστοιχα (Πίνακας 3).

η

χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται διπλό σταυρό-επικύρωσης, η μέση ακρίβεια μειώθηκαν σε 61 και 63%, χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσος και Γραμμική Διαχωριστική Ανάλυση, αντίστοιχα (Πίνακας 4).

η

με βάση σχετικά με την παρουσία ή απουσία των πτητικών οργανικών ενώσεων και μόνο, δείγματα ούρων θα μπορούσε να χαρακτηριστεί με μια μέση ακρίβεια 66% με επαναλαμβανόμενες 10 φορές διασταυρωμένης επικύρωσης (Πίνακας 5). δεδομένα προέλευσης εμφανίζονται στον Πίνακα S3.

Η

Χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται διπλό σταυρό-επικύρωσης, η μέση ακρίβεια μειώθηκαν σε 65 και 63%, χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσος και Γραμμική Διαχωριστική Ανάλυση, αντίστοιχα (Πίνακας 6).

Δεδομένου ότι η επαναλαμβανόμενη διπλό σταυρό-επικύρωση είναι μια πολύ πιο αυστηρή τεχνική της διασταυρωμένης επικύρωσης από επαναλαμβάνεται 10 φορές διασταυρωμένης επικύρωσης, η μείωση στην απόδοση της δοκιμής ήταν αναμενόμενη. Με ένα Monte Carlo τυχαία μετάθεση των ετικετών κατηγορίας, οι μέσες ακρίβεια μειώθηκε στο 50%, χρησιμοποιώντας και τις δύο τεχνικές μοντελοποίησης. Ως εκ τούτου, η ταξινόμηση των δειγμάτων βασίζεται στην παρουσία ή απουσία των πτητικών οργανικών ενώσεων είναι κάπως καλύτερη από ό, τι μπορεί να αναμένεται μόνο από την τύχη. Το τελικό σύνολο χαρακτηριστικών επιλέγονται και χρησιμοποιούνται για την ανάπτυξη ταξινομητές τόσο γραμμική ανάλυση Διαχωριστική Fisher και δέντρο αποφάσεων Τυχαία Δάσος Breiman του, περιλαμβάνονται 2,6-διμεθυλο-7-οκτεν-2-όλη, πεντανάλη, 3-οκτανόνη, και 2-οκτανόνη. Εκτός από πεντανάλη, όλες αυτές οι ενώσεις ήταν ρυθμισμένα προς τα κάτω ή /και λιγότερο συχνά στα δείγματα ούρων από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη. Η κατάταξη των ασθενών σε καρκίνο και τον έλεγχο των ομάδων με βάση αυτά τα χαρακτηριστικά σε συνδυασμό με τα επίπεδα του PSA συνοψίζονται στους Πίνακες 7 και 8.

Η

Χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται 10 φορές διασταυρωμένης επικύρωσης, οι ασθενείς θα μπορούσαν να είναι ταξινομούνται σε καρκίνο του προστάτη και του καρκίνου-ελεύθερες ομάδες με μέση ακρίβεια 74% και 65%, χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσος και Γραμμική διακριτική ανάλυση, αντίστοιχα. Με ένα Monte Carlo τυχαία μετάθεση των ετικετών κατηγορίας, οι μέσες ακρίβεια μειώθηκε στο 56% και 48%, χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσος και Γραμμική διακριτική ανάλυση, αντίστοιχα. Ως εκ τούτου, τα αποτελέσματα που προέκυψαν από τα δύο καθεστώτα διασταυρωμένης επικύρωσης ήταν ανώτερα από αυτά που θα μπορούσε να αναμένεται από την τύχη. Χρησιμοποιώντας επαναλαμβάνεται διπλό σταυρό-επικύρωση, οι ασθενείς θα μπορούσαν να ταξινομηθούν με μέση ακρίβεια 71% και 65%, χρησιμοποιώντας Τυχαία Δάσος και Γραμμική διακριτική ανάλυση τεχνικές ταξινόμησης, αντίστοιχα. Σχήμα 2 παρουσιάζει τον δέκτη καμπύλης για την επαναλαμβανόμενη ανάλυση διπλή χιαστί επικύρωση. Το Monte Carlo τυχαία μετάθεση των ετικετών κατηγορίας μείωσε τη διαγνωστική απόδοση των μοντέλων ώστε να αποκτήσουμε μέση ακρίβεια της δοκιμής του 51 και του 50% με τυχαία δάσος και γραμμική διακριτική ανάλυση, αντίστοιχα. Αυτές οι τελευταίες Μόντε Κάρλο Ακρίβεια ευθυγραμμίσει με την αναμενόμενη ακρίβεια ταξινόμησης του 52% στο πλαίσιο της συμφωνίας ευκαιρία με σταθερές οριακή συχνότητες και υποδεικνύουν ότι το ποσοστό κατάταξη στα αυθεντικά μοντέλα (71% και 65%) δεν είναι ένα τεχνούργημα της διαδικασίας ανάπτυξης υποδειγμάτων.

Συζήτηση

για πρώτη φορά, τα προφίλ VOC του ουροποιητικού υπερκείμενου χώρου μελετήθηκαν από τους άνδρες με υποψία καρκίνου του προστάτη ερευνήθηκε από TRUS καθοδηγούμενη βιοψία με βελόνα του προστάτη για να επιβεβαιώσει ή να αποκλείσει, η διάγνωση του καρκίνου του προστάτη. Ο στόχος της παρούσας αναφερθεί εργασίας ήταν να εκτιμηθεί εάν τα προφίλ VOC από υπερκείμενης φάσης των ούρων μπορεί να βοηθήσει να συμπληρώσει τις τρέχουσες κλινικές δοκιμές για να βελτιωθεί η διαστρωμάτωση των ανθρώπων που κινδυνεύουν από καρκίνο του προστάτη και, ως εκ τούτου, να συμβάλει στη μείωση του αριθμού των ασθενών που υποβάλλονται σε περιττές βιοψία με βελόνα.

έχουν περιορισμένες μελέτες φασματομετρίας μάζας που δημοσιεύθηκε στις πτητικές αναλύσεις ούρων για την ανίχνευση του καρκίνου του προστάτη. Σε μια πιλοτική μελέτη από την ομάδα μας αξιολόγησε τα προφίλ VOC των ούρων από 24 ασυμπτωματική άνδρες και 13 άνδρες με καρκίνο του προστάτη [48]. 21 VOCs βρέθηκε να σχετίζεται θετικά με τα ούρα από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη. συντελεστές ομοιότητας υπολογίστηκαν για κάθε ένα από τα δείγματα με βάση την παρουσία ή απουσία των ενώσεων αυτών και στις δύο ομάδες. Όταν εφαρμόζεται σε μια πολυμεταβλητή κανόνα διακριτική ανάλυση, αυτοί οι συντελεστές ομοιότητας που επιτρέπεται για διάκριση των περιπτώσεων με 92,3% ευαισθησία και 96,3% ειδικότητα. Αν και πολλά υποσχόμενη, ότι η μελέτη ήταν πολύ μικρό για να εξαχθούν ασφαλή συμπεράσματα και τη χρήση των ασυμπτωματικών ανδρών ως μάρτυρες σήμαινε ότι έκανε λίγα για να αντιμετωπίσει μία από τις παρούσες κλινικές προκλήσεις της διακρίσεως των ασθενών με καρκίνο του προστάτη από εκείνους με μη κακοήθεις ουρολογικές προβλήματα που συχνά να οδηγήσει σε αυξημένα επίπεδα PSA? στην προηγούμενη μελέτη μόνο ένας από τους ελέγχους έχουν αυξηθεί PSA.

Peng

et al

., 2010 δοκιμάζονται οι εκπνεόμενο προφίλ VOC των υγιών μαρτύρων (n = 22) και σε ασθενείς με πνευμονική ( n = 30), του μαστού (n = 22), ορθοκολικό (n = 26), και καρκίνο του προστάτη (n = 18) [49]. Οι συγγραφείς βρήκαν ότι το τολουόλιο, το 2-αμινο-5-ισοπροπυλο-8-μεθυλο-1-azulenecarbonitrile, ρ-ξυλόλιο, και 2,2-διμεθυλο-δεκανίου έδειξε καμία επικάλυψη σε αφθονία μεταξύ των υγιών μαρτύρων και ασθενών με καρκίνο του προστάτη. Ωστόσο, εξαιρούνται οι ενώσεις παρουσιάζουν σε & lt? 80% και των δύο καρκίνου και ελέγχου των ομάδων από την ανάλυση. Αυτό είναι πιθανό να έχουν ως αποτέλεσμα την απώλεια των ενώσεων με καλύτερη διακριτική δύναμη από ό, τι εκείνες που αναφέρθηκαν παραπάνω η οποία έδωσε αφορμή για να κλείσει clusters στην ένωση αφθονία μεταξύ του καρκίνου του προστάτη και των ομάδων ελέγχου. Επιπλέον, Peng

et al

. χρησιμοποιείται ένα σχετικά μικρό μέγεθος μελέτη και συγκρίθηκαν καρκινικές ομάδες με υγιείς περιπτώσεις, οι οποίες δεν είναι κατάλληλοι έλεγχοι. Μια μελέτη που δημοσιεύθηκε στο περιοδικό Nature προκαλέσει σημαντικό ενδιαφέρον στο μόριο σαρκοσίνη ως πιθανό βιοδείκτη των επιθετικών καρκίνων του προστάτη [23]. Σημαντικά υψηλότερα επίπεδα σαρκοσίνης αναφέρθηκαν στις δύο ιζήματα ούρα και τα υπερκείμενα από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη βιοψία-θετικό (

n

= 44) σε σύγκριση με βιοψία-αρνητικούς ελέγχους (

n

= 51). Ωστόσο, η διαγνωστική αξία των σαρκοσίνης ήταν μέτρια με ένα συνολικό εμβαδόν κάτω από την καμπύλη (AUC) του δέκτη που λειτουργεί χαρακτηριστικό (ROC) καμπύλη του 0,71 για ιζήματα ούρων και 0,67 για τα υπερκείμενα. Περαιτέρω μελέτες που εξετάζουν την επικύρωση αυτού του έργου αποδεικνύεται απογοητευτικό [24-26]. Για τον προσδιορισμό των περιορισμένων δυνατοτήτων της σαρκοσίνης, Wu και συν-εργαζομένων πήγε για να διερευνήσει άλλες μεταβολομική δεικτών στα ούρα από 20 ασθενείς με καρκίνο του προστάτη, 8 ασθενείς με καλοήθη υπερτροφία του προστάτη, και 20 υγιείς άνδρες [26]. Χρησιμοποίησαν υποβοηθούμενη από μικροκύματα παραγωγοποίηση πριν από την ανάλυση GC /MS για τον εντοπισμό του υψηλότερου μοριακού βάρους ενώσεις, όπως αμινοξέα, οργανικά οξέα, υδατάνθρακες και λιπαρά οξέα. Υψηλότερα επίπεδα των οργανικών οξέων: διυδροξυβουτανοϊκό οξύ και xylonic οξύ και χαμηλότερα επίπεδα της πυριμιδίνης και οι υδατάνθρακες: ξυλοπυρανόζη και ριβοφουρανοσίδη παρατηρήθηκαν στην ομάδα καρκίνου του προστάτη. Ένα διαγνωστικό μοντέλο, με βάση αυτές τις 5 μεταβολίτες δείκτη, ανέφεραν μια τιμή AUC του 0,825 της καμπύλης ROC. Και πάλι ο κύριος περιορισμός αυτής της εργασίας είναι η έλλειψη επαρκών και κατάλληλων ελέγχων. Μεγάλο απαιτείται περαιτέρω εργασία σε μεγάλες, πολυκεντρικές μελέτες από ανεξάρτητες ερευνητικές ομάδες, αν ισχυρή βιοδείκτες για τον καρκίνο του προστάτη είναι ποτέ να βρεθεί υπόψη οι προηγούμενες αποτυχίες να επιβεβαιώσει αρχικά «πολλά υποσχόμενη» βιοδείκτες, με PSA και σαρκοσίνη είναι χαρακτηριστικά παραδείγματα. Στην πραγματικότητα, η πλειονότητα των νέων βιολογικών δεικτών που αναφέρονται στη βιβλιογραφία δεν πληρούν το επόμενο εμπόδιο για την επικύρωση των δυνατοτήτων τους για τη διάγνωση ή τη διαχείριση του καρκίνου. . Prensner

et al

, αναφέρονται πέντε συνηθέστεροι λόγοι για αυτό: την έλλειψη μιας ισχυρής πρωτόκολλο δοκιμής για την επαναληψιμότητα, μια μεροληπτική σύγκριση των ομάδων στη μελέτη (υπόθεση σε σχέση με τους ελέγχους), απροσδιόριστη ή ακατάλληλη κλινική ρόλο του βιοδείκτη , στατιστικά μικρής ισχύος μέγεθος μελέτης, και ακατάλληλη στατιστική ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων πάνω από την τοποθέτηση των δεδομένων [50]. Μέχρι αποτελέσματα μπορούν να επικυρωθούν σε ξεχωριστές δίκες, κατάλληλο διασταυρωμένης επικύρωσης της στατιστικής ανάλυσης θα πρέπει να εφαρμοστεί ως μια προληπτική προσέγγιση για την εκτίμηση της προγνωστικής ακρίβειας (και ως εκ τούτου εγκυρότητα) των βιοδεικτών (ες) σε νέα κρούσματα προέρχονται από τις ίδιες ομάδες ασθενών. Rosenberg

et al

., Έχουν εισαγάγει την εφαρμογή ενός διπλού συστήματος διασταυρωμένης επικύρωσης στην πρωτεομική δεδομένων από ανθρώπινο προστάτη και του παχέος εντέρου όγκων [51]. Σε αυτήν την τρέχουσα μελέτη, τα μοντέλα ταξινόμησης επικυρώθηκαν με τη χρήση επαναλαμβάνεται και επαναλαμβάνεται διπλό σταυρό-επικύρωσης. Παρ ‘όλα αυτά, τα αποτελέσματα που αναφέρονται εδώ θα πρέπει να εξακολουθούν να αντιμετωπίζονται με προσοχή δίνεται αυτή είναι μια μικρή μελέτη που θα μπορούσε να επηρεαστεί από τυχαία ή μη τυχαία παραλλαγές και συγχυτικούς παράγοντες. Το μοντέλο VOC βασίστηκε στην παρουσία ή απουσία τεσσάρων πτητικές ενώσεις: 2,6-διμεθυλο-7-οκτεν-2-όλης, πεντανάλη, 3-οκτανόνη, και 2-οκτανόνη. Εκτός από πεντανάλη, όλες αυτές οι ενώσεις ήταν ρυθμισμένα προς τα κάτω ή /και λιγότερο συχνά στα δείγματα ούρων από ασθενείς με καρκίνο του προστάτη. Η παραγωγή αλδεϋδών έχει συνδεθεί με τον καρκίνο και φλεγμονώδεις καταστάσεις μέσω της υπερβολικής παραγωγής δραστικών ειδών οξυγόνου (ROS) είναι γνωστό ότι επάγουν την υπεροξείδωση των λιπιδίων [52]. Αυτό μπορεί να εξηγήσει την υψηλότερη επίπτωση πεντανάλη ανιχνεύθηκε στα δείγματα ούρων ασθενών με καρκίνο του προστάτη. Σε συμφωνία με τα ευρήματά μας, άλλα μεταβολομική μελέτες έχουν επίσης συχνά παρατηρείται μια τάση μείωσης της παραγωγής (κάτω ρύθμιση) ορισμένων μεταβολιτών σε ομάδες καρκίνου σε σύγκριση με τις ομάδες ελέγχου [53, 54]. Μια πιθανή εξήγηση για την τάση αυτή μπορεί να είναι ότι τα καρκινικά κύτταρα χρησιμοποιούν μερικά από αυτούς τους μεταβολίτες να ανταποκριθεί στις απαιτήσεις για αυξημένη κατανάλωση ενέργειας και τη μετατροπή αυτών των ενώσεων προς άλλες ουσίες που δεν μπορούσε να ανιχνευθεί με GC /MS. S2 πίνακας παραθέτει όλες τις ενώσεις που βρέθηκαν που προσθέτει στις γνώσεις μας για ενώσεις που βρίσκονται στα καθίσταται βασικό ούρων από ουρολογικά ελέγχους και ασθενείς με καρκίνο. Αυτό θα είναι χρήσιμο για συγκρίσεις με άλλες μελέτες μέτρηση πτητικών ουσιών από τα ούρα.

Τα αποτελέσματα αναφέρουμε εδώ σχετικά με τις διακρίσεις δυνατότητες των πτητικών οργανικών ενώσεων στα ούρα είναι κάπως ασαφή, αλλά αντικατοπτρίζουν τα ευρήματα των άλλων ομάδων που έχουν δοκιμαστεί δυναμικό βιοδείκτες στην ούρων και αίματος (PCA3 [55], multiplex βιοδείκτες RNA ούρα βάση [56], και ο δείκτης της υγείας του προστάτη βασίζεται στην PSA και των παραγώγων του [-2] proPSA και% fPSA [57, 58]) για τη διάκριση των ασθενών με καρκίνο του προστάτη από τους ελέγχους. Είναι πολύ σημαντικό ότι οι ομάδες της μελέτης αντικατοπτρίζουν με ακρίβεια την ειδική πληθυσμό ασθενών για τον οποίο η δοκιμή βιοδείκτης προορίζεται. Ως εκ τούτου, έχουμε προσληφθεί έλεγχοι από την κλινική ουρολογίας την ημέρα της βιοψίας του προστάτη τους, που ήταν υπό παρακολούθηση για συμπτώματα ύποπτα καρκίνου του προστάτη. Πράγματι, όλοι οι ασθενείς σε αυτή τη μελέτη είχαν είτε αυξημένα επίπεδα PSA ή μη φυσιολογικά ευρήματα σε μια δακτυλική εξέταση. Με βάση τα επίπεδα του PSA μόνο, οι ασθενείς θα μπορούσαν να ταξινομηθούν με μέση ακρίβεια 61% και 63% με τη χρήση ραδιοσυχνοτήτων και LDA τεχνικές ταξινόμησης, αντίστοιχα, με επαναλαμβανόμενες διπλή χιαστί επικύρωση. Είναι κλινικά δύσκολο να διαφοροποιήσει αυτά τα μη-καρκινικές ασθενών με ουρολογικά συμπτώματα από εκείνους με καρκίνο του προστάτη. Ήταν επίσης δύσκολο να γίνει διάκριση μεταξύ των δύο αυτών ομάδων με βάση την ουρική ΠΟΕ, καθώς αυτό έδωσε παρόμοια αποτελέσματα κατάταξης με εκείνη που λαμβάνεται με τα επίπεδα PSA. Με βάση την παρουσία ή απουσία τεσσάρων ενώσεων, δείγμα ούρων ταξινομήθηκαν με μέση ακρίβειες του 65% και 63%, με τη χρήση RF και τεχνικές ταξινόμησης LDA, αντίστοιχα, με επαναλαμβανόμενες διπλό διασταυρούμενης επικύρωσης. Συνδυάζοντας τα επίπεδα PSA με ουρική πτητικών οργανικών ενώσεων, έδωσε μόνο μια οριακή βελτίωση στην κατάταξη των ασθενών, αναφέρουν μέση ακρίβεια 71% και 65%, χρησιμοποιώντας τεχνικές ταξινόμησης LDA RF και, αντίστοιχα, με επαναλαμβανόμενες διπλή χιαστί επικύρωση.

Αυτά δύο τεχνικές επιλέχθηκαν λόγω του συμπληρωματικού χαρακτήρα τους, δηλαδή LDA είναι ένα ενιαίο ταξινομητής που χρησιμοποιεί ένα γραμμικό όριο απόφασης και έχει την αρετή της απλότητας, όταν λειτουργεί, ενώ, σε αντίθεση, η Τυχαία Δάσος είναι ένα ισχυρό σύνολο προσέγγιση, η οποία μπορεί να κάνει καλά, όταν πολύπλοκες αλληλεπιδράσεις μπορεί να απαιτούνται για την απόκτηση καλή προγνωστική ακρίβεια. Σε αυτήν την τρέχουσα μελέτη, τα μοντέλα ταξινόμησης επικυρώθηκαν με τη χρήση επαναλαμβάνεται και επαναλαμβάνεται διπλό σταυρό-επικύρωσης. Επαναλαμβανόμενες διπλή χιαστί επικύρωση (rdCV) είναι μια συστηματική διαδικασία η οποία κατ ‘επανάληψη χωρίζει τυχαία τα δεδομένα σε ένα δείγμα βαθμονόμησης για την ανάπτυξη του μοντέλου και σε ένα δείγμα προπύργιο για την αξιολόγηση μοντέλο, και παρέχει μια ρεαλιστική εκτίμηση της ακρίβειας μοντέλο, όταν εφαρμόζεται σε νέες παρατηρήσεις που προέρχονται από το ίδια ομοιογενή πληθυσμό. Παρ ‘όλα αυτά, τα αποτελέσματα που αναφέρονται εδώ θα πρέπει να εξακολουθούν να αντιμετωπίζονται με προσοχή δίνεται αυτή είναι μια μικρή μελέτη η οποία δεν μπορεί να συλλάβει επαρκώς την ποικιλομορφία στον πληθυσμό και οι οποίες μπορεί να υπόκειται σε παράγοντες σύγχυσης.

Μια multiplatform μέθοδος που συνδυάζει πτητικών αναλύσεις με αναλύσεις των μη πτητικών ενώσεων (χρησιμοποιώντας φασματοσκοπία πυρηνικού μαγνητικού συντονισμού ή υγρή χρωματογραφία υψηλής απόδοσης προσεγγίσεις που βασίζονται /φασματομετρία μάζας) θα συμβάλει στην επίτευξη μια πιο ολοκληρωμένη κατανόηση των μεταβολικών χαρακτηριστικών του καρκίνου του προστάτη και μπορεί να συμβάλει στην αποσαφήνιση των μεταβολικών οδών που συνδέονται με επιθετικές μορφές του καρκίνου. Τα τρέχοντα δεδομένα δείχνουν ότι αναλύσεις VOC μπορούν να χρησιμοποιηθούν επιπλέον δοκιμές PSA στην εύρεση ασθενείς με καρκίνο του προστάτη. Μελλοντικές εργασίες θα πρέπει να εξετάσει μεθόδους για βελτιστοποίηση των αποτελεσμάτων και να εξερευνήσετε άλλα μέσα άντλησης πτητικών οργανικών ενώσεων από τα δείγματα ούρων, όπως παραγώγων.

Ένας περιορισμός αυτής της μελέτης ήταν ότι τα δείγματα ούρων λήφθηκαν σε διαφορετικές ώρες της ημέρας, ως εκ τούτου, ποικίλλουν σε συγκέντρωση. Η συλλογή των ούρων πρώτο πέρασμα θα έχουν ελαχιστοποιήσει την αραίωση των ούρων και των διαφορών στη συγκέντρωση στα ούρα μεταξύ των συμμετεχόντων της μελέτης, ωστόσο αυτό θα πρέπει παρεμποδίζεται η συλλογή των δειγμάτων επίσης. Μελλοντικές μελέτες αυτού του είδους θα πρέπει να κάνουν προσπάθεια για να μετρήσουν τα επίπεδα της ουρικής κρεατινίνης ή της ωσμωτικότητας των ούρων για τον προσδιορισμό του βαθμού αραίωσης των ούρων. Αυτό μπορεί να βοηθήσει να καθορίσει ένα αποδεκτό εύρος των συγκεντρώσεων των ούρων για την ανάλυση των πτητικών οργανικών ενώσεων υπερκείμενου χώρου ή να παρέχει ένα μέσο για τη διόρθωση για την αραίωση των ούρων.

Είναι επίσης σημαντικό να σημειωθεί ότι το αποτέλεσμα της βιοψίας δεν μπορεί να αποκλείσει την παρουσία του καρκίνου του προστάτη εντελώς σε αυτούς τους ασθενείς, αλλά μπορεί μόνο να επιβεβαιώσει ότι δεν υπήρχε καρκίνος που βρέθηκαν στα δείγματα ιστού που ελήφθησαν. Ως εκ τούτου, η πιθανότητα παραμένει ότι κάποιοι ασθενείς είχαν λανθασμένα χαρακτηριστεί ως αρνητικά για τον καρκίνο του προστάτη και αυτό θα μπορούσε να επηρεαστεί αρνητικά από την διαγνωστική ικανότητα των μοντέλων.

ερευνητικών βιοδεικτών συνήθως επικεντρώνεται στην έγκαιρη διάγνωση της νόσου, αλλά έχει υποστηριχθεί ότι , για τον καρκίνο του προστάτη, η μεγαλύτερη ανεκπλήρωτες κλινική ανάγκη είναι να διακρίνει χαμηλού κινδύνου ή αργή ανάπτυξη καρκίνων από τις επιθετικές αυτές [50]. Ο προσδιορισμός και η επικύρωση των προγνωστικών και πρόβλεψης βιοδείκτες θα συμβάλει στη μείωση των περιττών παρεμβάσεων που μπορεί να προκαλέσει περισσότερο κακό παρά καλό, παρακολουθεί την πρόοδο κατά τη διάρκεια της «προσεκτικής αναμονής» και στόχο της θεραπείας για τους ασθενείς που έχουν τις περισσότερες πιθανότητες να ωφεληθούν [50]. πρέπει να είναι πιο εργασίες που έχουν αναληφθεί για να οδηγήσει σε μια βελτιωμένη μέθοδο για την ταυτοποίηση επιθετικούς όγκους εκεί. Μια πολύ μεγαλύτερη μελέτη δικαιολογείται να διερευνήσει αυτό.

Συμπέρασμα

ασθενείς

Ουρολογία με αυξημένα επίπεδα PSA θα υποβληθούν κανονικά TRUS καθοδηγούμενη βελόνα βιοψίας του προστάτη για να επιβεβαιώσει ή να αποκλείσει τη διάγνωση του καρκίνου του προστάτη. Στον πληθυσμό που μελετήθηκε, η κατάταξη των ασθενών με δοκιμών VOC ούρα ήταν συγκρίσιμη με τις δοκιμές επίπεδο PSA. Συνδυάζοντας τα επίπεδα PSA με ουρική πτητικών οργανικών ενώσεων οδήγησε σε οριακή βελτίωση στην απόδοση της δοκιμής. Τα αποτελέσματα αυτά είναι ενθαρρυντικά και δείχνουν ότι υπάρχουν και άλλες μεταβολομική λεωφόρους που αξίζει να εξεταστούν που θα μπορούσε να συμβάλει στη βελτίωση της διαστρωμάτωσης των ανδρών που κινδυνεύουν από καρκίνο του προστάτη που απαιτούν παρακολούθηση.