Abstract

Βλεννίνης MUC4, η οποία κωδικοποιείται από το

MUC4

γονίδιο, διαδραματίζει σημαντικό ρόλο στον επιθηλιακό πολλαπλασιασμό και διαφοροποίηση των κυττάρων. Παρεκκλίνουσα

MUC4

υπερέκφραση συνδέεται με επεμβατική πολλαπλασιασμό του όγκου και κακή έκβαση στα επιθηλιακά καρκίνους. Συλλογικά, τα υπάρχοντα στοιχεία δείχνουν ότι

MUC4

διαθέτει λειτουργίες όγκου-υποκινητή. Σε αυτή τη μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων του 1048 περιστατικό πνεύμονα περιπτώσεις καρκίνου και 1.048 ηλικία και το φύλο συχνότητα ταιριαστό καρκίνο χωρίς ελέγχους σε ένα κινεζικό πληθυσμό να διερευνήσει το ρόλο του

MUC4

πολυμορφισμό του γονιδίου στον πνεύμονα αιτιολογία του καρκίνου. Εμείς εντοπίστηκαν εννέα SNPs που σχετίζονταν σημαντικά με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα (

P

= 0,0425 για rs863582,

0,0333

για rs842226,

0,0294

για rs842225,

0,0010

για rs2550236,

0,0149

για rs2688515,

0,0191

για rs 2641773,

0,0058

για rs3096337,

0,0077

για rs859769, και em

0,0059

για rs842461 σε ένα μοντέλο πρόσθετο). Συνεπής με αυτά τα αποτελέσματα ανάλυσης μονής τόπου, οι αναλύσεις απλότυπος αποκάλυψαν αρνητικές επιπτώσεις της απλότυπος «GGC» του rs3096337, rs859769 και rs842461 για τον καρκίνο του πνεύμονα. Τόσο ο απλότυπος και diplotype «CTGAGC» της rs863582, rs842226, rs2550236, rs842225 και rs2688515 είχε αρνητικές συνέπειες για τον καρκίνο του πνεύμονα, η οποία είναι επίσης συνεπής με την ανάλυση single-τόπο. Επιπλέον, παρατηρήσαμε στατιστικά σημαντικές αλληλεπιδράσεις για rs863582 και rs842461 σε βαρείς καπνιστές. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι

MUC4

πολυμορφισμών των γονιδίων και την αλληλεπίδρασή τους με το κάπνισμα μπορεί να συμβάλλει στην αιτιολογία του καρκίνου του πνεύμονα.

Παράθεση: Zhang Ζ, Wang J, Ο J, Zheng Ζ, Zeng Χ, Zhang C, et al. (2013) γενετικές παραλλαγές στο

MUC4

Gene συνδέονται με καρκίνο του πνεύμονα κινδύνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό. PLoS ONE 8 (10): e77723. doi: 10.1371 /journal.pone.0077723

Επιμέλεια: Xiaoping Miao, Huazhong Πανεπιστήμιο Επιστήμης και Τεχνολογίας, η Κίνα

Ελήφθη: 19, Αυγούστου του 2013? Αποδεκτές: 3 Σεπ 2013? Δημοσιεύθηκε: 21 Οκτώβρη 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81070043, 81071917, 81173112, 81170052, 81220108001), οι Κινέζοι Κεντρικής κυβέρνησης Βασικά Ερευνητικά Έργα των 973 επιδοτήσεων (2009CB522107), ένα Changjiang μελετητές και καινοτομίας Research Team σε επιχορήγηση Πανεπιστήμιο (IRT0961) , μια επιχορήγηση του Ιδρύματος Γκουανγκντόνγκ Φυσικών Επιστημών ομάδα (1035101200300000), το Τμήμα Guangdong της Επιστήμης και Τεχνολογίας της Κίνας (2009B050700041, 2010B031600301), η επαρχία Γκουανγκντόνγκ πανεπιστήμια και Κολέγια του ποταμού Περλ Μελετητής κεφαλαιοποιητικό σύστημα (2008) η Κίνα, ένα Τμήμα Γκουανγκντόνγκ Παιδείας επιχορήγηση για έρευνα (cxzd1025), και ένα τμήμα Guangzhou Παιδείας Yangcheng Υποτροφιών (10A058S, 12A001S). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του πνεύμονα είναι ο πιο συχνός καρκίνος στον κόσμο και αντιπροσώπευαν το 13% (1,6 εκατομμύρια ευρώ) του συνόλου των περιπτώσεων και το 18% (1,4 εκατομμύρια) των θανάτων από καρκίνο το 2008 [1]. Στην Κίνα, τα ποσοστά εμφάνισης και θνησιμότητας του καρκίνου του πνεύμονα έχει αυξηθεί ραγδαία τα τελευταία [2] δεκαετίες, και τώρα είναι η κύρια αιτία θνησιμότητας από καρκίνο? το μέσο ποσοστό επιβίωσης 5 ετών είναι C0.3860.32590.2899

0.0116

0.0315

0.9022

99.953q29rs842226195478861167Intron 21C G0.4380.38670.3474

0.0091

0.0513

0.6684

97.85rs255023619552232142573Intron 1G & gt? A0.1640.33270.2974

0,0152

0,1144

0,9966

97.52rs26885151955274715150Intron 1Α & gt? G0.4520.36720.3244

0,0036

0,0223

0,9952

99.33rs2641773195528226755Intron 1Α & gt? C0.4520.37160.3298

0,0048

0.0171

0,9857

98.90rs30963371955333325106Intron 1Α & gt? G0.1850.30870.2634

0,0012

0,0081

0,6992

100.0rs8597691955344131081Intron 1T & gt? G0.4150.34590.3004

0,0016

0,0059

0,8740

99.81rs8424611955356141201Intron 1Α & gt?. C0.1700.30970.2643

0,0012

0,0048

0,8830

99.67Table 1. γονότυπου

MUC4

SNPs

ένα SNP θέση στην NCBI dbSNP (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP, πρόσβαση 09/09/2012)

β MAF και από τις δύο βάσεις δεδομένων HapMap και dbSNP, η MAF με έντονα στοιχεία είναι από τη βάση δεδομένων HapMap ( Κινέζων Χαν)

γ

P

αξία για τη διαφορά στο αλληλόμορφο κατανομές μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων

δ δημιουργούνται από 10.000 μεταθέσεις

e Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE)

P

τιμή στην ομάδα ελέγχου CSV Λήψη CSV

Οι ακριβείς θέσεις SNP που παρατίθενται στον πίνακα 1. Δύο μπλοκ απλότυπος (έγχρωμο) ορίστηκαν από το πρόγραμμα Haploview χρησιμοποιώντας την προσέγγιση που περιγράφεται από τον Gabriel et al.

[34] με τις προεπιλεγμένες ρυθμίσεις (το 95% CI για μια ισχυρή LD ήταν ελάχιστη για την ανώτερη 0,98 και χαμηλό 0,7 και μέγιστη για μια ισχυρή ανασυνδυασμού του 0,9, και ένα κλάσμα των ισχυρών LD στο ενημερωτικό συγκρίσεις ήταν τουλάχιστον 0,95) . Ο αριθμός rs (κορυφή, από δεξιά προς τα αριστερά) αντιστοιχεί στο όνομα SNP, και οι αριθμοί σε τετράγωνα είναι ‘τιμές (