Αφηρημένο

Ιστορικό

Ανθρώπινο οξογονανίνη γλυκοζυλάσης 1 (hOGG1) Επισκευή βάσης εκτομή (BER) οδός διαδραματίζει ζωτικό ρόλο στην επιδιόρθωση του DNA. Πολλές επιδημιολογικές μελέτες έχουν αξιολογήσει τη συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys και τον κίνδυνο του καρκίνου. Ωστόσο, τα αποτελέσματα αυτών των μελετών σχετικά με τη σύνδεση παραμένουν αντικρουόμενες. Για να προκύψει μια πιο ακριβή εκτίμηση του συλλόγου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Μια πλήρης αναζήτηση διεξήχθη για τον προσδιορισμό των επιλέξιμων μελέτες hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου . Χρησιμοποιήσαμε αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) για την αξιολόγηση της αντοχής του συλλόγου. Βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1,19, 95% CI = 01.09 έως 01.30,

P

& lt? 0.001? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser: OR = 1.16, 95% CI = 01.08 – 01.26,

P

& lt? 0.001). Επιπλέον, σε αναλύσεις υποομάδων ανάλογα με τον τύπο του καρκίνου, το ισχυρότερο σημαντική συσχέτιση μεταξύ hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού και του καρκίνου του πνεύμονα βρέθηκε ότι ο κίνδυνος (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1,29, 95% CI = 1,16 – 1,44,

P

& lt? 0.001? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser: OR = 1.22, 95% CI = 1,12 – 1,33,

P

& lt? 0.001). Οι σημαντικές επιδράσεις της hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού επί ορθοκολικού, μαστού, της ουροδόχου κύστεως, του προστάτη, του οισοφάγου, του γαστρικού καρκίνου και δεν ανιχνεύθηκαν. Επιπλέον, σε αναλύσεις υποομάδων από εθνότητες, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συνδέθηκε με συνολικό κίνδυνο καρκίνου σε Ασιάτες (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1.21, 95% CI = 1,10 – 1,33,

P

& lt? 0.001)

Συμπεράσματα

Αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι hOGG1 326Cys αλληλόμορφο θα μπορούσε να είναι ένας παράγοντας χαμηλού διεισδυτικό κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα

Αιτιολογική αναφορά..: Wei Β, Zhou Υ, Xu Z, Xi Β, Cheng Η Ruan J, et al. (2011) Η Επίδραση της hOGG1 Ser326Cys Πολυμορφισμός για τον Καρκίνο του κινδύνου: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 6 (11): e27545. doi: 10.1371 /journal.pone.0027545

Επιμέλεια: Deodutta Roy, Διεθνές Πανεπιστήμιο της Φλόριντα, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 1 του Ιούνη του 2011? Αποδεκτές: 18 του Οκτωβρίου του 2011? Δημοσιεύθηκε: 17 Νοεμβρίου, 2011

Copyright: © 2011 Wei et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

βλάβες στο DNA διαδραματίζει ζωτικό ρόλο στην καρκινογένεση [1 ], η οποία γενικά λαμβάνει χώρα μέσω διαφορετικών μηχανισμών, όπως υποπροϊόν του κανονικού κυτταρικού μεταβολισμού ή το αποτέλεσμα της έκθεσης σε βιολογικούς και περιβαλλοντικούς μεταλλαξιογόνες. βλάβη του DNA, αν δεν επισκευαστεί, θα μπορούσε να οδηγήσει σε απόπτωση ή μετάλλαξη, η οποία μπορεί να προκαλέσει την επαγωγή της καρκινογένεσης [1]. Προτείνεται ότι αντιδραστικά είδη οξυγόνου (ROS) θα μπορούσε να επάγει τις δύο αλλοιώσεις βάσης και ενιαία διαλείμματα κλώνου στο DNA [1]. Η 8-υδροξυ-2-δεσοξυγουανίνης (8-ΟΗ-dG) είναι μια σημαντική μορφή της βλάβης του DNA, το οποίο παράγεται από αντιδραστικές ελεύθερες ρίζες.

Η παρουσία του 8-ΟΗ-dG στο DNA πιστεύεται είναι μια σημαντική αιτία της G: C εις Τ: Α αμφιμετατροπή, διότι 8-ΟΗ-dG θα μπορούσαν να κατευθύνουν την ενσωμάτωση της αδενίνης καθώς και κυτοσίνη απέναντι της βλάβης [2]. Ετσι, 8-ΟΗ-dG είναι μια ιδιαίτερα μεταλλαξιογόνο βλάβης του DNA in vivo [3], [4], εκτός εάν είναι επισκευάζεται πριν την αντιγραφή του DNA. Η επιδιόρθωση του DNA ανθρώπινο ένζυμο γλυκοζυλάσης οξογονανίνη 1 (hOGG1) είναι μια γλυκοζυλάση ΟΝΑ /AP λυάση που έχει υποδειχθεί ότι παίζει σημαντικό ρόλο στην πρόληψη της καρκινογένεσης από την επισκευή οξειδωτική βλάβη του DNA [5]. Συγκεκριμένα, γλυκοζυλάση /AP λυάσης θα μπορούσε αποτελεσματικά καταλύουν την εκτομή και την απομάκρυνση των 8-ΟΗ-dG προϊόντα προσθήκης. HOGG1 μπορεί να διαδραματίσει ζωτικό ρόλο στη διατήρηση της ακεραιότητας του γονιδιώματος και την πρόληψη της ανάπτυξης του καρκίνου.

Οι γενετικές παραλλαγές στο γονίδιο hOGG1 όλο μελετηθεί για αυξημένο κίνδυνο καρκίνου λόγω των κρίσιμους ρόλους στη σταθεροποίηση της ακεραιότητας του γονιδιώματος. Το γονίδιο hOGG1 έχει κωδικόνιο 326 πολυμορφισμό (Ser326Cys, rs1052133), και Cys326 έχει χαμηλότερη ικανότητα να προλαμβάνει μεταλλαξογένεση με 8-ΟΗ-dG από Ser326 σε ανθρώπινα κύτταρα in vivo [5]. Μέχρι σήμερα, υπήρχαν τόσες πολλές αναφορές σχετικά με τη σύνδεση των hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού με τον κίνδυνο των διαφόρων μορφών καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του μαστού [6] – [18], του προστάτη [19] – [25], του παγκρέατος [26], [27], της ουροδόχου κύστης [28] – [34], της χοληδόχου κύστης [35] – [38], γαστρικό [39] – [49], του παχέος εντέρου [50] – [63], του οισοφάγου [64] – [68], του πνεύμονα [69] – [ ,,,0],85], καρκίνους του τραχήλου της μήτρας [86], [87], και ούτω καθεξής [88] -. [101]

μια μελέτη έδειξε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου (λόγος πιθανοτήτων : 2.3? 95% διάστημα εμπιστοσύνης: 1,1 – 5,0), ο κίνδυνος είναι υψηλότερος σε νεότερα άτομα [60]. Canbay et al [63] διαπίστωσε ότι hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου σε ένα τουρκικό πληθυσμό. Ωστόσο, άλλες μελέτες [53], [54], [59] δεν έδειξε την στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού Ser326Cys και του παχέος εντέρου. Πολυάριθμες μελέτες και συστηματικές προσεγγίσεις εξέτασαν το ρόλο του πολυμορφισμού Ser326Cys στην επιδεκτικότητα καρκίνου του πνεύμονα. Μία μετα-ανάλυση έδειξε ότι η συνολική αναλογία πιθανοτήτων του ομοζυγώτη για το αλληλόμορφο hOGG1 326Cys εναντίον εκείνων για το αλληλόμορφο hOGG1 326Ser ήταν 1,24 (95% διάστημα εμπιστοσύνης: 1,01 – 1,53), υποδηλώνοντας ότι η θέση είχε εμπλακεί σε επιδεκτικότητα σε καρκίνο του πνεύμονα [83 ]. Σε αντίθεση, μια άλλη μετα-ανάλυση αναφερθεί καμία σημαντική συσχέτιση [102]. Ορισμένες μελέτες [15], [16] έδειξε ότι ο πολυμορφισμός Ser326Cys δεν σχετίζονται με τον καρκίνο του μαστού. Ωστόσο, Sangrajrang et al [11] διαπίστωσε ότι οι γυναίκες της Ταϊλάνδης με την παραλλαγή αλληλόμορφου του hOGG1 ήταν πιθανό να έχουν αυξημένη ευαισθησία σε καρκίνο του μαστού. Επιπλέον, Chen et al [24] διαπίστωσε ότι hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμός σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου του προστάτη, ενώ Nock et al [22] δεν βρείτε την σημαντική συσχέτιση με το συνολικό πληθυσμό της μελέτης.

Στο σύνολό της, η αποτελέσματα για την ένωση μεταξύ hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου ήταν αντικρουόμενα και ασαφή. Για να προκύψει μια πιο ακριβή εκτίμηση του συλλόγου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελετών

PubMed (1956-30 τον Ιούλιο του 2011) και Embase (1947 – 30 Ιουλίου 2011) πραγματοποιήθηκε αναζήτηση της βάσης δεδομένων με χρήση των ακόλουθων όρων αναζήτησης: «οξογονανίνη γλυκοσυλάση 1, hOGG1 ή OGG1», «πολυμορφισμός ή παραλλαγή» και «καρκίνος, νεόπλασμα ή όγκου». Πρόσθετες μελέτες ταυτοποιήθηκαν από μια αναζήτηση στο χέρι των αναφορών των πρωτότυπων μελετών. Στην περίπτωση των μελετών με τα ίδια ή επικαλυπτόμενη δεδομένα, επιλέξαμε τις πιο πρόσφατες αυτές με τον μεγαλύτερο αριθμό ατόμων. Μελέτες που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση θα πρέπει να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: (α) αξιολόγηση η ένωση των hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου που δημοσιεύθηκε στην αγγλική γλώσσα, (β) χρησιμοποιούν ένα σχέδιο περίπτωση ελέγχου, (γ) να περιέχουν διαθέσιμη συχνότητα του γονότυπου, και (δ) η κατανομή των γονότυπων των ελέγχων ήταν σύμφωνη με Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE).

δεδομένα εξόρυξη

Δύο ερευνητές εξάγεται ανεξάρτητα τα δεδομένα και κατέληξαν σε συναίνεση σχετικά με όλα τα στοιχεία. Για κάθε μελέτη, τα ακόλουθα χαρακτηριστικά συλλέχθηκαν: επώνυμο του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, αριθμούς του γονότυπου ασθενών και μαρτύρων. Διαφορετικών εθνοτικών καταβάσεις ταξινομήθηκαν ως Καυκάσιους (τουλάχιστον το 80% των Καυκάσιων περιλαμβάνεται), Ασιάτες και Αφρικανοί. Εάν μια μελέτη δεν αναφέρει την εθνική απόγονος ή, αν δεν ήταν δυνατό να διαχωριστούν οι συμμετέχοντες σύμφωνα με την εν λόγω φαινότυπο, η ομάδα ανέφερε ονομάστηκε «μικτό εθνότητα». Επιπλέον, εάν μόνο ένας τύπος καρκίνου που περιλαμβάνονται σε μια μελέτη στο μετα-ανάλυση, αυτό συνδυάστηκε στην ομάδα «μικτή καρκίνος». Για τη μελέτη [49], συμπεριλαμβανομένων των θεμάτων των διαφόρων εθνοτικών ομάδων, τα δεδομένα εξάγονται ξεχωριστά για κάθε εθνοτική ομάδα όποτε αυτό είναι δυνατό. Επειδή οι μελέτες [19], [31], [56], [87], [103] παρέχονται μόνο τα στοιχεία των γονότυπων ως «Cys /Cys + Cys /Ser» και Ser /Ser χωρίς δεδομένων για άλλους γονότυπους, θα μπορούσαμε να μόνο τον υπολογισμό του ή για την κυρίαρχη γενετικό μοντέλο.

Η στατιστική ανάλυση

Η δύναμη της σχέσης μεταξύ hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου μετρήθηκε με αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% ( ΠΙ). Υπολογίσαμε πρώτα τους κινδύνους της Cys /Cys και Ser /Cys γονότυπους στον κίνδυνο του καρκίνου, σε σύγκριση με την άγριου τύπου Ser /Ser ομοζυγώτη, τότε αξιολογούνται οι κίνδυνοι «Cys /Ser Cys + /Cys vs. Ser /Ser» και «Cys /Ser Cys vs. /Cys + Ser /Ser» στη κίνδυνο του καρκίνου, υποθέτοντας κυρίαρχα και εκφυλιστικά αποτελέσματα της παραλλαγής Cys αλληλόμορφο, αντίστοιχα. ανάλυση των υποομάδων πραγματοποιήθηκε επίσης βασίζονται σε διαφορετικές εθνότητες, τους τύπους καρκίνου, την ηλικία, το φύλο και

Η ετερογένεια αξιολογήθηκε με ένα τεστ Q chi-square-βάση μεταξύ των μελετών (

P

& lt?. 0.10 θεωρήθηκε σημαντική) [104], [105]. Όταν η ανομοιογένεια ήταν παρόν, το μοντέλο τυχαίων επιδράσεων χρησιμοποιήθηκαν για τον υπολογισμό του συγκεντρωτικές Ή [106], ενώ το σταθερό μοντέλο επιπτώσεις χρησιμοποιήθηκε κατά την απουσία του [107]. Ανάλυση ευαισθησίας διεξήχθη για να αξιολογηθεί η σταθερότητα των αποτελεσμάτων.

Για την ομάδα ελέγχου της κάθε μελέτης, η συχνότητα αλληλόμορφων υπολογίστηκε, και οι παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys αξιολογήθηκαν για ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE ) με τη χρήση του chi-square test Pearson?

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική. οικόπεδα χωνί και δοκιμασία γραμμικής παλινδρόμησης Egger είχαν χρησιμοποιηθεί για να παρέχει τη διάγνωση της πιθανής μεροληψίας δημοσίευση [108]

Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες για αυτό το μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκαν με STATA (έκδοση 10.0?. Stata Corporation, College Station, TX ) και SPSS for Windows (έκδοση 11.0?. SPSS, Inc., Chicago, IL)

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Μελέτη

για την ευαισθησία του καρκίνου που σχετίζονται με hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμός, αντικείμενα ανακτήθηκαν με βάση τα κριτήρια αναζήτησης. διαδικασία επιλογής Μελέτη δείχθηκε στο Σχήμα 1. Μεταξύ αυτών, η κατανομή των γονότυπων στους ελέγχους δεν ήταν σύμφωνο με HWE σε 13 μελέτες, οι οποίες είχαν αποκλειστεί στην μετα-ανάλυση. 5 πρόσθετες μελέτες αποκλείστηκαν λόγω της αλληλεπικάλυψης των δεδομένων. Τέλος, συνολικά 91 μελέτες ασθενών-μαρτύρων που περιλαμβάνει 31.297 περιπτώσεις καρκίνου και 39.033 ελέγχους συμπεριλήφθηκαν στη μετα-ανάλυση. Τα χαρακτηριστικά του περιλαμβάνονται μελέτες συνοψίζονται στον Πίνακα S1. Υπήρχαν 42 μελέτες του Καυκάσου απογόνους και 35 μελέτες της Ασίας απογόνους. Καρκίνοι επιβεβαιώθηκαν ιστολογικά ή παθολογικά στις περισσότερες μελέτες. Υπήρχαν 14 μελέτες του ορθοκολικού καρκίνου, 19 μελέτες του καρκίνου του πνεύμονα, 12 μελέτες του καρκίνου του μαστού, 6 μελέτες του καρκίνου της ουροδόχου κύστης, 4 μελέτες του καρκίνου του προστάτη, 11 μελέτες του καρκίνου του στομάχου, 5 μελέτες του καρκίνου του οισοφάγου, 6 μελέτες του κεφαλιού και του λαιμού καρκίνο, 2 μελέτες του καρκίνου της χοληδόχου κύστης, και 2 μελέτες της ALL. Υπήρχαν 57 μελέτες, στις οποίες τα στοιχεία για την ηλικία των περιπτώσεων και ελέγχων καρκίνος παρουσιάστηκαν λεπτομερώς. Μεταξύ αυτών, τα θέματα ελέγχου της ίδιας ηλικίας χρησιμοποιήθηκαν σε 42 μελέτες, οι οποίες περιλαμβάνονται στην αναλύσεις υποομάδων ανάλογα με την ηλικία. 19 μελέτες, οι οποίες ανέφεραν συγκεκριμένα στοιχεία σύμφωνα με το φύλο, ήταν επιλέξιμες για αναλύσεις υποομάδων ανά φύλο. Επιπλέον, η κατανομή των γονότυπων των ελέγχων ήταν σύμφωνη με HWE σε όλες τις μελέτες (

P

& gt? 0,05).

Η

Η ποσοτική σύνθεση

Το αλληλόμορφο 326Cys συχνότητες των ελέγχων των διαφόρων εθνοτήτων υπολογίστηκαν. Η συχνότητα του αλληλόμορφου 326Cys ήταν 47,07% (95% CI = 43,39 – 50,75%) μεταξύ των ασιατικών ελέγχων, η οποία ήταν σημαντικά υψηλότερη από αυτή του Καυκάσου ελέγχου (23,62%? 95% CI = 20,43 – 26,81%,

P

& lt? 0.001?. Σχήμα S1)

Πραγματοποιήσαμε μία μετα-ανάλυση του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys συνολικά, και σε υποομάδες σύμφωνα με τους τύπους καρκίνου και εθνοτικές ομάδες με διάφορες γενετικές μοντέλα (Πίνακας S2). Συνολικά, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1,19, 95% CI = 01.09 έως 01.30,

P

& lt? 0.001? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser: OR = 1.16, 95% CI = 01.08 έως 01.26,

P

& lt? 0.001? Πίνακας S2, Εικόνα S2). Σε αναλύσεις υποομάδων από τύπους καρκίνου, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με τον καρκίνο του πνεύμονα (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1,29, 95% CI = 1,16 – 1,44,

P

& lt ? 0,001? Cys /Cys vs. Cys /Ser Ser + /Ser: OR = 1.22, 95% CI = 1,12 – 1,33,

P

& lt? 0,001? πίνακα S2, Σχήμα 2), αλλά όχι με ορθοκολικό , του μαστού, της ουροδόχου κύστεως, του προστάτη, και γαστρικό καρκίνο. Επιπλέον, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο του καρκίνου κεφαλής και τραχήλου (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1.71, 95% CI = 1,05 – 2,78,

P

= 0,03).

Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI. Η περιοχή των πλατειών αντανακλά το βάρος (αντίστροφο της διακύμανσης). Το διαμάντι εκπροσωπεί την περίληψη ή και 95% CI.

Η

Σε αναλύσεις υποομάδων από εθνότητες, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συνδέθηκε με συνολικό κίνδυνο καρκίνου στις ασιατικές πληθυσμού (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1.21, 95% CI = 1,10 – 1,33,

P

& lt? 0.001? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser: OR = 1.14, 95% CI = 01.03 – 01.26,

P

= 0,004? Cys /Cys + Cys /Ser εναντίον Ser /Ser: OR = 1.12, 95% CI = 01.05 – 01.19,

P

& lt? 0.001? Πίνακας S2). Σε αναλύσεις υποομάδων ανάλογα με την ηλικία, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συνδέθηκε με συνολικό κίνδυνο καρκίνου μεταξύ των περιπτώσεων καρκίνου (& lt? 60 ετών) και των περιπτώσεων καρκίνου (≥60 ετών), αντίστοιχα (Πίνακας S3). Επιπλέον, σε αναλύσεις υποομάδων ανά φύλο, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός Ser326Cys δεν σχετίστηκε με συνολικό κίνδυνο καρκίνου μεταξύ των γυναικών και των ανδρών, αντίστοιχα (Πίνακας S3).

Εθνότητα-ειδική επίδραση των hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού για τον κίνδυνο καρκίνου

Όταν τα δεδομένα αναλύθηκαν σε υποομάδες των θεμάτων στρωματοποιημένη κατά εθνότητες, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου μεταξύ των Ασιατών (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser: OR = 1.21, 95 % CI = 1,10 – 1,33,

P

& lt? 0.001? Πίνακας S2). Τα αποτελέσματα της λογιστικής παλινδρόμησης αναλύσεις έδειξαν κοινές επιδράσεις μεταξύ Ασιατών και hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού (

P

& lt? 0,01).

Δοκιμή της ετερογένειας

Η ετερογένεια υπολογίστηκε μεταξύ καθενός από οι μελέτες με τη χρήση της Q-test. Συνολικά, η σημαντική ετερογένεια βρέθηκε (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser:

P

ετερογένεια & lt? 0.001? Cys /Ser εναντίον Ser /Ser:

P

ετερογένεια & lt? 0.001? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser:

P

ετερογένεια & lt? 0.001? Cys /Cys + Cys /Ser εναντίον Ser /Ser:

P

ετερογένεια & lt? 0.001). Σε στρωματοποιημένη αναλύσεις από τύπους καρκίνου, δεν βρήκαμε τη σημαντική ετερογένεια του καρκίνου του πνεύμονα σε δύο γενετικά μοντέλα (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser:

P

ετερογένεια = 0,40? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser:

P

ετερογένεια = 0.40)

ανάλυση ευαισθησίας

Κατά την ανάλυση ευαισθησίας, η επιρροή της κάθε μελέτης σχετικά με την συγκεντρωτική. Ή εξετάστηκε με επανάληψη της μετα-ανάλυση ενώ παραλείπεται κάθε μελέτη, ένα κάθε φορά. Η διαδικασία αυτή επιβεβαίωσε την σταθερότητα του συνολικού αποτελέσματος (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Ωστόσο, στην υποομάδα από εθνότητες, οι αναλύσεις ευαισθησίας δείχνουν ότι η τιμή Ρ Ζ-τεστ για στατιστική σημαντικότητα της περίληψης Ή (Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser) μεταξύ των Καυκασίων είναι 0,06 όταν εξαίρεση μία μελέτη από Obtulowicz et al.

προκατάληψη δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger για διεξήχθησαν για να εκτιμηθεί η προκατάληψη δημοσίευση των λογοτεχνιών. Το σχήμα των οικοπέδων χοάνη δεν αποκάλυψε κανένα αποδεικτικό στοιχείο της πλοκής χοάνη ασυμμετρίας. δοκιμή Egger προέβλεπε περαιτέρω στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη συμμετρία (Cys /Cys εναντίον Ser /Ser:

P

= 0,28? Cys /Ser εναντίον Ser /Ser:

P

= 0,57? Cys /Cys εναντίον Cys /Ser + Ser /Ser:

P

= 0,20? Cys /Cys + Cys /Ser εναντίον Ser /Ser:

P

= 0,21). Τα αποτελέσματα δεν έδειξαν οποιαδήποτε ένδειξη σφάλματος εκ της δημοσίευσης.

Συζήτηση

Η hOGG1, η οποία γενικά εμπλέκονται στην επιδιόρθωση του DNA, έχει μελετηθεί εκτενώς για τη σχέση του με διάφορους τύπους καρκίνου, όπως μαστού [6] – [18], του προστάτη [19] – [25], παγκρεατικό [26], [27], της ουροδόχου κύστης [28] – [34], της χοληδόχου κύστης [35] – [38], γαστρικό [39] – [49], του παχέος εντέρου [50] – [63], του οισοφάγου [64] – [68], του πνεύμονα [69] – [85], του τραχήλου της μήτρας [86], [87], και ούτω καθεξής [88] – [101 ]. Προηγούμενο συμπεράσματα πολλών μελετών σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου hOGG1 Ser326Cys παραμένουν αντικρουόμενες και αντιφατικές. Τα αντικρουόμενα αποτελέσματα είναι πιθανόν λόγω του μικρού επίδραση του πολυμορφισμού Ser326Cys σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου ή την σχετικά χαμηλή στατιστική ισχύ των δημοσιευμένων μελετών. Ως εκ τούτου, αυτή η μετα-ανάλυση που απαιτείται για να παρέχει μια ποσοτική προσέγγιση για το συνδυασμό των διαφορετικών αποτελεσμάτων.

Η παρούσα μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων 31.297 περιπτώσεις καρκίνου και 39.033 έλεγχοι, διερεύνησε τη σχέση μεταξύ του πολυμορφισμού Ser326Cys και συνολικό κίνδυνο καρκίνου . Στη μετα-ανάλυση, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Σε αναλύσεις υποομάδων από τύπους καρκίνου, η σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα περαιτέρω ανιχνευθεί. Το αποτέλεσμα αυτό ήταν σύμφωνο με προηγούμενη μελέτη [109]. Επιπλέον, σε αναλύσεις υποομάδων από εθνότητες, βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός hOGG1 Ser326Cys συσχετίστηκε σημαντικά με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στον ασιατικό πληθυσμό. Ωστόσο, αναλύσεις ευαισθησίας πρότεινε ότι η σημαντική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού Ser326Cys και συνολικό κίνδυνο καρκίνου μεταξύ των Καυκασίων έλειπε πειστικά στοιχεία.

Η hOGG1 κωδικοποιεί μια γλυκοζυλάση DNA που πιστεύεται ότι εμπλέκονται στη βάση επισκευή εκτομή των οξειδωτικά κατεστραμμένων DNA [ ,,,0],110]. Η hOGG1 μπορούσε καταλύουν την διάσπαση του δεσμού γλυκοζιλικών μεταξύ της τροποποιημένης βάσης και το τμήμα σακχάρου, αφήνοντας μια αβασική απουρινική /απυριμιδινική θέση στο DNA? το προκύπτον απουρινική /απυριμιδινική θέση στη συνέχεια τέμνεται, και η επισκευή ολοκληρώνεται με διαδοχικές ενέργειες μιας φωσφοδιεστεράσης, ένα DNA πολυμεράση, και ένα DNA liagse [111] – [113]. Όσον αφορά τις σημαντικούς ρόλους του hOGG1 στην επιδιόρθωση του DNA, είναι βιολογικά εύλογο ότι hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμός μπορεί να ρυθμίζουν τον κίνδυνο καρκίνου. Αυτή η υπόθεση επιβεβαιώθηκε με τα δεδομένα μας. Επιπλέον, λόγω του σχετικά μικρού μεγέθους του δείγματος για καρκίνο κεφαλής και λαιμού, το αποτέλεσμα για καρκίνο κεφαλής και τραχήλου απαιτείται περαιτέρω επιβεβαίωση.

Δεν βρήκαμε ότι hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο καρκίνου σε Καυκάσιο πληθυσμό και άλλων τύπων καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του μαστού, του προστάτη, του παγκρέατος, της ουροδόχου κύστης, της χοληδόχου κύστης, γαστρικός, του παχέος εντέρου, και καρκίνο του οισοφάγου, που υποδηλώνει την επίδραση της γενετικής παραλλαγής μπορεί να καλυφθεί από την παρουσία άλλων ως-ακόμη αγνώστων γονιδίων συνάφεια που εμπλέκονται στην καρκινογένεση. Επιπλέον, βρήκαμε ότι η συχνότητα του αλληλομόρφου 326Cys ήταν 47,07% μεταξύ των ασιατικών ελέγχων, η οποία ήταν σημαντικά υψηλότερη από εκείνη του Καυκάσου ελέγχων (23.62%,

P

& lt? 0.001), η οποία μπορεί επίσης να επηρεάσει τους ρόλους της hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού στον κίνδυνο καρκίνου σε Ασιατών και Καυκάσιων.

πρέπει να αντιμετωπιστεί Αρκετές περιορισμούς της μετα-ανάλυσης. Κατ ‘αρχάς, περιορισμένα δεδομένα περιορίζεται αξιολόγηση μας την πιθανή αλληλεπίδραση γονιδίων-γονιδίου. Δεύτερον, δεν υπήρχαν αρκετά στοιχεία για την αφρικανική πληθυσμού σε αυτή την μετα-ανάλυση. Τρίτον, τα αποτελέσματά μας βασίστηκαν σε αδιόρθωτη αξιολόγηση. Προκειμένου να παρέχει μια πιο ακριβή εκτίμηση βάσει της ρύθμισης για συγχυτικούς παράγοντες, είναι καλά σχεδιασμένες μελέτες δικαιολογείται από τη λήψη πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες όπως το αλκοόλ και το κάπνισμα υπόψη.

Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση προσκόμισε αποδεικτικά στοιχεία της η συσχέτιση μεταξύ hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμού και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, υποστηρίζοντας την υπόθεση ότι hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμό θα μπορούσε να είναι ένας δείκτης χαμηλής διεισδυτικού ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Επιπλέον, εξελιγμένα αλληλεπίδραση γονιδίων-γονιδίου πρέπει να εξεταστεί σε μελλοντική ανάλυση, η οποία θα οδηγήσει μια καλύτερη, ολοκληρωμένη κατανόηση της σχέσης μεταξύ hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

συχνότητες των παραλλαγή αλληλομόρφων μεταξύ των ελέγχων στρωματοποιημένη κατά εθνότητες. Η «○» και «*» αντιπροσωπεύουν ακραία

doi:. 10.1371 /journal.pone.0027545.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Δάσος οικόπεδο συνολικού κινδύνου καρκίνου που σχετίζεται με hOGG1 Ser326Cys πολυμορφισμό (για Cys /Cys εναντίον Ser /Ser). Οι πλατείες και οι οριζόντιες γραμμές αντιστοιχούν στη μελέτη ειδικών OR και 95% CI. Η περιοχή των πλατειών αντανακλά το βάρος (αντίστροφο της διακύμανσης). Το διαμάντι εκπροσωπεί την περίληψη ή και 95% CI

doi:. 10.1371 /journal.pone.0027545.s002

(ΔΕΘ)

Πίνακα S1.

Χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται στο μετα-ανάλυση

doi:. 10.1371 /journal.pone.0027545.s003

(DOC)

Πίνακας S2.

Στρωματοποιημένη ανάλυση του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου του

doi:. 10.1371 /journal.pone.0027545.s004

(DOC)

Πίνακα S3.

Στρωματοποιημένη ανάλυση του πολυμορφισμού hOGG1 Ser326Cys σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου κατά ηλικία και φύλο

doi:. 10.1371 /journal.pone.0027545.s005

(DOC)