Αφηρημένο

Ιστορικό

Ο καρκίνος του προστάτη (ΚΓΠ) είναι μία από τις πιο σημαντικές αιτίες θανάτου από καρκίνο στις δυτικές χώρες. Αν και η ανίχνευση της ΚΓΠ σε πρώιμο ιάσιμη φάση είναι ιδιαίτερα επιθυμητή, οι πραγματικές μεθόδους διαλογής παρόντες περιορισμοί και οι νέες μοριακές προσεγγίσεις που απαιτούνται. Ανάλυση γονιδιακής έκφρασης αυξάνει τις γνώσεις μας για τη βιολογία της ΚΓΠ και μπορεί να καταστήσει τα νέα μοριακά εργαλεία, αλλά ο προσδιορισμός της ακριβούς βιοδεικτών για αξιόπιστη μοριακή διάγνωση είναι μια πραγματική πρόκληση. Περιγράφουμε εδώ τη διαγνωστική ισχύ ενός νέου 8-γονίδια υπογραφής: αποκαρβοξυλάση της ορνιθίνης (

ODC

), αποκαρβοξυλάση της ορνιθίνης antizyme (

OAZ

), αδενοσυλομεθειονινικής αποκαρβοξυλάση (

AdoMetDC

) , σπερμιδίνη /σπερμίνη Ν (1) ακετυλοτρανσφεράσης (

SSAT

), ιστόνη Η3 (

Η3

), ειδικό γονίδιο διακοπή της ανάπτυξης (

GAS 1

), αφυδρογονάση 3-φωσφορικής αφυδρογονάση (

GAPDH

) και clusterin (

CLU

) σε όγκο ανίχνευση /ταξινόμηση των ανθρώπινων Κεφ.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Η 8-γονιδίου υπογραφή ανιχνεύθηκε με ανάδρομης μεταγραφής πραγματικού χρόνου ποσοτική PCR (RT-qPCR) σε κατεψυγμένα προστάτη χειρουργικά δείγματα που λαμβάνονται από 41 ασθενείς με διάγνωση ΚΓΠ και συνιστάται να υποβληθούν σε ριζική προστατεκτομή (RP). Δεν θεραπεία δόθηκε στους ασθενείς ανά πάσα στιγμή πριν από την RP. Η βιο-τράπεζα που χρησιμοποιούνται για τη μελέτη αποτελούνταν από 66 δείγματα: 44 ήταν καλοήθεις κεφαλαιοποίησης ζεύγη από τον ίδιο ασθενή. Τριάντα-πέντε ταξινομήθηκαν ως καλοήθεις και 31, όπως ΚΓΠ μετά το τελικό παθολογική εξέταση. Μόνο μοριακά δεδομένα χρησιμοποιήθηκαν για την ταξινόμηση των δειγμάτων. Το πλησιέστερο Γείτονας (ΝΝ) ταξινομητή χρησιμοποιήθηκε για να κάνουν διακρίσεις καπάκι από καλοήθη ιστό. Επικύρωση των τελικών αποτελεσμάτων αποκτήθηκε με τη διαδικασία αντεπικύρωση 10 φορές. CaP σε σχέση με καλοήθη δείγματα διακρίσεις με (80 ± 5)% ακρίβεια, (81 ± 6)% ευαισθησία και (78 ± 7)% ειδικότητα. Η μέθοδος που ταξινομούνται επίσης ορθά το 71% των ασθενών με Gleason σκορ & lt? 7 έναντι ≥7, ένα σημαντικό προγνωστικό παράγοντα της τελικής έκβασης

Συμπεράσματα /Σημασία

Η μέθοδος έδειξε μεγάλη ευαισθησία σε μια συλλογή των δειγμάτων. στην οποία ένα σημαντικό μέρος του συνόλου (13/31, ίση με 42%) θεωρήθηκε CaP με βάση που έχει λιγότερο από 15% των καρκινικών κυττάρων. Αυτό το αποτέλεσμα υποστηρίζει την ιδέα της «επίδρασης πεδίου του καρκίνου», στην οποία τα μετασχηματισμένα κύτταρα εκτείνονται πέραν μορφολογικά εμφανής όγκου. Η μέθοδος μοριακής διάγνωσης που περιγράφεται εδώ είναι αντικειμενική και λιγότερο υποβάλλονται σε ανθρώπινο λάθος. Αν και απαιτούνται περαιτέρω επιβεβαιώσεις απαιτείται, η μέθοδος αυτή κατέχουν τη δυνατότητα να ενισχυθεί η συμβατική διάγνωση

Παράθεση:. Rizzi F, Belloni L, Crafa P, Lazzaretti Μ, Remondini D, Ferretti S, et al. (2008) ένα νέο γονίδιο Υπογραφή Μοριακής Διάγνωσης του ανθρώπινου καρκίνου του προστάτη με RT-qPCR. PLoS ONE 3 (10): e3617. doi: 10.1371 /journal.pone.0003617

Συντάκτης: Andrew Vickers, Memorial Sloan-Kettering,, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 3, Ιούν 2008? Αποδεκτές: 2 Οκτώβρη του 2008? Δημοσιεύθηκε: 31, Οκτ, 2008

Copyright: © 2008 Rizzi et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Επιχορήγηση Συμβόλαιο χορηγοί: Genprofiler Srl, Μπολζάνο, Ιταλία? FIL 2005 και FIL 2006, το Πανεπιστήμιο της Πάρμα, Ιταλία? Istituto Nazionale Biostrutture e Biosistemi (INBB), Roma, Ιταλία

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος του προστάτη (ΚΓΠ) πιστεύεται ότι για να γίνει η πιο σημαντική αιτία θανάτου από καρκίνο στις δυτικές χώρες στο εγγύς μέλλον, λόγω εμφάνισης της αυξάνεται ραγδαία με την ηλικία. Από πρόγνωση είναι γενικά δυσμενές όταν ασθένεια δεν είναι πλέον όργανο-περιορισμένο, η ανίχνευση της ΚΓΠ σε πρώιμο ιάσιμη φάση είναι ιδιαίτερα επιθυμητή, αλλά, δυστυχώς, διαθέσιμες μεθόδους, όπως η παρούσα περιορισμούς του ορού του ειδικού προστατικού αντιγόνου (PSA) [1]. Η διάγνωση της ΚΓΠ είναι συμβατικά λαμβάνεται με βιοψία κορεσμού του προστάτη και μορφολογική εξέταση των τμημάτων ιστού. Αυτή η μέθοδος είναι αξιόπιστη, αλλά απαιτεί προσεκτική κατάρτιση. Παρ ‘όλα αυτά, μπορεί να συμβεί δυσαρμονίες ενδο- και δια-παρατηρητή. Κατ ‘αρχήν, μοριακή διάγνωση θα είναι πιο αντικειμενική και, ελπίζουμε, πολύ λιγότερο υποβάλλονται σε ανθρώπινο λάθος, εάν λαμβάνονται με αξιόπιστες μεθόδους. Όμως, η ιδανική μέθοδος θα πρέπει επίσης να είναι γρήγορη, τυποποιημένη και οικονομικά βολικό. Τέτοιο επίτευγμα είναι πράγματι δυνατό στη θεωρία, αλλά τα αποτελέσματα δημοσιεύονται δεν είναι εντελώς ικανοποιητική ακόμη, και επειδή συνήθως βασίζονται σε μια συμβατική προσέγγιση με εκμεταλλεύεται μια ενιαία μοριακής προγνωστικός σημαντικά πάνω ή προς τα κάτω-ρυθμίζονται στο δείγμα καρκίνου σε σχέση με καλοήθη ελέγχου. Ένα σημαντικό εμπόδιο για την επίτευξη του στόχου αυτού είναι ότι τα μοριακά γεγονότα που προκαλούν CAP εμφάνιση και την εξέλιξη απέχουν ακόμη πολύ από το να είναι εντελώς αποκάλυψε: πολύ λίγα καλά γνωστά ογκογονίδια ή όγκου-καταστολείς έχουν σαφώς συνδεθεί με την ογκογένεση του προστάτη, και για το λόγο αυτό ΚΓΠ είναι εξακολουθεί να θεωρείται ένα φευγαλέα ασθένεια. Ως εκ τούτου, οι νέες μοριακές προσεγγίσεις για την έγκαιρη εξέταση και διάγνωση χρειάζονται επειγόντως.

ανάλυση γονιδιακής έκφρασης χρησιμοποιήθηκε πρόσφατα για να αυξήσουμε τις γνώσεις μας για τη βιολογία του Cap [2]. Οι υπογραφές του γονιδίου σε επίπεδο RNA προσδιορίζεται και χρησιμοποιείται συχνά ως παράγοντες πρόβλεψης για τη μοντελοποίηση κλινικά σχετικές πληροφορίες (π.χ. πρόγνωση, ο χρόνος επιβίωσης, την ευαισθησία σε φάρμακα, κλπ). Για το σκοπό αυτό, τα τελικά συμπεράσματα σχετικά με την δύναμη ταξινόμηση της υπογραφής γονιδίου μελετήθηκαν εκλέγονται αποκλειστικά επί τη βάσει των μοριακών δεδομένων που λαμβάνονται στο μεταγραφικό επίπεδο χρησιμοποιώντας μεθόδους όπως μικροσυστοιχιών DNA ή RT-PCR q. Με ανάλυση κηλίδος Northern, έχουμε εντοπίσει προηγουμένως 8 πληροφοριακά γονίδια των οποίων η έκφραση αλλάζει με βάση την παρουσία του καλύμματος κακοήθειας σε ανθρώπους [3]. Σε μια μελέτη παρακολούθησης 5 ετών, δείξαμε επίσης ότι τα επίπεδα έκφρασης αυτού του πίνακα των γονιδίων συσχετίζονται έντονα με τη διαφοροποίηση και την τελική έκβαση (πρόγνωση) των ασθενών Κεφ. Αυτό το αποτέλεσμα ελήφθη με συνδυασμό μοριακών δεδομένων με πρότυπες κλινικές πληροφορίες [4]. Αλλά στο μυαλό μας η πραγματική πρόκληση ήταν να ανιχνεύσει πώμα με τη βοήθεια μοριακών εργαλείων και μόνο. Αν και η μελέτη του ειδικά αλλοιωμένη έκφραση γονιδίου κατά την διάρκεια CaP ογκογένεση είναι ένα δύσκολο έργο, οι επιστημονικές πληροφορίες που τελικά θα ληφθούν είναι ένα σημαντικό ανταμοιβή, που οδηγεί σε μια καλύτερη κατανόηση της μοριακής βάσης της νόσου, η οποία μπορεί να οδηγήσει σε καλύτερες μεθόδους για διάγνωση και θεραπεία. Αυτό είναι ιδιαίτερα σημαντικό κατά την εξέταση της ετερογένειας της ΚΓΠ και τη μεταβλητότητα της κλινικής εξέλιξης, με ορισμένοι ασθενείς παρουσιάζουν αργό ρυθμό ανάπτυξης νωχελικός όγκους και άλλους ασθενείς που έχουν μια ασθένεια που είναι ταχέως εξελισσόμενη.

Η υπογραφή που έχουμε εντοπίσει είναι από 4 μεταβολικά που σχετίζονται με τα γονίδια,

ODC

,

OAZ

,

AdoMetDC

,

SSAT

, τα ρυθμιστικά γονίδια του μεταβολισμού πολυαμίνης, 2 γονίδια που σχετίζονται μέχρι την πρόοδο του κυτταρικού κύκλου,

Η3

και

GAS 1

, ειδικούς δείκτες S- και G

0-φάσεων, αντίστοιχα [5], [6],

GAPDH

, ένα ένζυμο του γλυκολυτικά οδού, και

CLU

μια αινιγματική πρωτεΐνες των οποίων η βιολογική ρόλος είναι ακόμα ένα θέμα συζήτησης.

CLU

, επίσης γνωστή ως

SGP-2

,

TRPM-2

ή

apoJ

, είναι πολύ υπερ-εκφράζεται κατά τη διάρκεια υποστροφή του αδένα του προστάτη και την αναδιαμόρφωση [7], [8]. Αν και υπάρχει μια γενική συναίνεση σχετικά με τη συμμετοχή των CLU στη ρύθμιση του κυτταρικού θανάτου, ειδικός ρόλος της στην αποπτωτική διαδικασία εξακολουθεί να είναι αμφιλεγόμενη, καθώς επίσης και στο μετασχηματισμό των κυττάρων. Πιο συγκεκριμένα, το επίπεδο της έκφρασης και της ρύθμισης κατά τη διάρκεια CaP εμφάνιση και την εξέλιξη συζητείται [9], [10]. Η καλύτερη κατανόηση του θέματος αυτού έχει ιδιαίτερη σημασία όχι μόνο λόγω των παραπάνω σκέψεων, αλλά και γιατί μια κλινική δοκιμή με στόχο τη φίμωση

CLU

γονιδίου από ολιγονουκλεοτίδια αντίθετης φοράς σε ασθενείς καπάκι είναι επί του παρόντος σε εξέλιξη [11]. Ως Μάλιστα, εμείς και άλλοι έχουν βρει ότι

CLU

ρυθμίζεται προς τα κάτω κατά τη διάρκεια της εξέλιξης CaP [12] – [15], υποδηλώνοντας ότι θα μπορούσε να λειτουργήσει ως παράγοντας καταστολής όγκων [16], [ ,,,0],17].

Όσον αφορά την υπογραφή γονίδιο που περιγράφεται εδώ, όλα τα γονίδια που μελετήθηκαν έχουν δείξει προηγουμένως σχετίζονται αυστηρά μετατοπίσεις στην συν-έκφραση κατά την διάρκεια της εξέλιξης CaP [3]. Συγκεκριμένη τροποποίηση της μεταγραφής των ρυθμιστικών ενζύμων του μεταβολισμού των πολυαμινών κατά τη διάρκεια της εξέλιξης της ΚΓΠ έχει επίσης επικυρωθεί από μετα-ανάλυση των μικροσυστοιχιών [18]. Στο μοντέλο ποντίκια TRAMP εξέλιξης της ΚΓΠ, η γονιδιακή υπογραφή μας και μόνο, όπως καθορίζεται από RT-qPCR, εκτός από διακρίσεις καπάκι από καλοήθη ιστό, προέβλεψε επίσης ατομική ανταπόκριση στη θεραπεία με πράσινο τσάι κατεχίνες (ΓΟΠ) [19]. Οι άλλες επιμέρους γονίδια σήμανσης βρεθεί αποδεδειγμένης εγκυρότητας σε αυτόν τον τομέα, όπως α-μεθυλακυλοσυνένζυμο συνενζύμου Α ρακεμάση (

AMACR

) [20], [21] ή του καρκίνου του προστάτη αντιγόνο 3 (

DD3 /PCA3

) [22], αλλά αυτή τη στιγμή δεν υπάρχει σχέση μεταξύ του επιπέδου έκφρασης της PCA3 και του όγκου βαθμού ή στάσης βρέθηκε ακόμα. γονίδιο υπογραφή μας είναι κατασκευασμένα από πληροφοριακά γονίδια μερικά από τα οποία είναι καλά γνωστό ότι παίζει σημαντικό ρόλο στη φυσιολογία των κυττάρων του προστάτη, όπως τα γονίδια που κωδικοποιούν για ρυθμιστικές πρωτεΐνες του μεταβολισμού πολυαμίνης [23] και

CLU

[7] .

Ο σκοπός της μελέτης μας ήταν να δείξουμε ότι η γονιδιακή υπογραφή μας και μόνο ενισχύει την ευαισθησία και την ιδιαιτερότητα της μοριακής διάγνωσης του καπακιού σε σχέση με την αναγνώριση μόνο δείκτη. Χρησιμοποιήσαμε ιστοπαθολογική ταξινόμηση των πάγιων ιστών δείγματα ως τελική αναφορά, όπως συνήθως γίνεται σε παρόμοιες περιπτώσεις [24], [25]. Το μοντέλο 8-γονιδίου ανιχνεύθηκε με RT-qPCR σε κατεψυγμένα δείγματα ιστού που λαμβάνονται σε ριζική προστατεκτομή (RP). Ταξινόμηση των δειγμάτων ιστού (δηλαδή παρουσία ή απουσία του όγκου) Διεξήχθη χωρίς άλλες παθολογικές ή κλινικά δεδομένα. Επιπλέον, μοριακά δεδομένα χρησιμοποιήθηκαν για υπο-ταξινόμηση των δειγμάτων ιστού σε σχέση με σκορ Gleason, την ηλικία και το συνολικό PSA του ασθενούς σε RP ορού.

Για την κατάταξη δείγμα χρησιμοποιήσαμε το πλησιέστερο Γείτονας (ΝΝ) ταξινομητή, ένα στατιστική πολυπαραγοντική ανάλυση εργαλείο γνωστό για την εκτέλεση και ειδικά για την ταξινόμηση του καρκίνου σε σύγκριση με άλλες μεθόδους. Για την επικύρωση της απόδοσης ταξινόμησης, χρησιμοποιήσαμε το 10 φορές σταυρό διαδικασία επικύρωσης, επαναλαμβάνεται 100 φορές με διαφορετικούς υπο-δειγματοληψίες προκειμένου να εκτιμηθεί η μέση απόδοση της υπογραφής και το διάστημα εμπιστοσύνης (τα αποτελέσματα εκφράζονται ως μέση τιμή ± διάστημα εμπιστοσύνης 95%, που αντιστοιχεί περίπου στο 2 τυπικές αποκλίσεις).

Αποτελέσματα

Ο ιστός δείγματα βιο-τράπεζα

Η βιο-τράπεζα αποτελείται από μια συλλογή από 66 ανθρώπινα δείγματα, βλέπε πίνακα 1, βάσει των κριτηρίων επιλεξιμότητας μας για τη μελέτη: i) παθολογική ένδειξη παρουσίας ή της απουσίας του Cap στο κατεψυγμένο προ- και μετα-RNA τμήματα? ii) καλοήθη δείγματα χωρίς ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία προστάτη (ΡΙΝ) βλάβες ή εισβολή όγκου, λαμβάνονται πολύ μακριά (δηλαδή σε διαφορετικές περιοχές του προστάτη, ιδανικά στο controlateral εξάντα) από τη νεοπλασματική αλλοίωση? iii) δείγματα CaP που έχει περιεκτικότητα σε καρκινικό κύτταρο που καλύπτουν τουλάχιστον το 5% του συνόλου της περιοχής τμήμα? iv) καλή απόδοση και υψηλή ποιότητα της προετοιμασίας του RNA. Μεταξύ αυτών, 44 δείγματα ήταν Cap-καλοήθεις ζεύγη δειγμάτων που λαμβάνονται από τον ίδιο ασθενή. Thirthy πέντε δείγματα χαρακτηρίζονται ως καλοήθεις από τον παθολογοανατόμο, ενώ 31 ήταν CaP

Η

Πώς να πάρει μοριακών και μορφολογικών στοιχείων από το ίδιο δείγμα ιστού:. Το «σάντουιτς» μέθοδο

Για να επιτευχθεί η άμεση σύγκριση μεταξύ των μοριακών δεδομένων και παθολογική ταξινόμηση έχουμε αναπτύξει μια μέθοδο «σάντουιτς» (βλέπε Εικόνα 1 και Μέθοδοι: προστάτη ιστών δείγματα Συλλογή και χειρισμός). Εκχύλιση RNA απέδωσαν κατά μέσο όρο 50-60 μg ολικού RNA από 20 mg του ανθρώπινου ιστού του προστάτη. Η ποσότητα του συνολικού RNA που ελήφθη ήταν αρκετά υψηλή για να ελέγξει άμεσα την ποιότητα του παρασκευάσματος με φασματοφωτομετρία, που ακολουθείται από συμβατική ηλεκτροφόρηση. Μόνο καλής ποιότητας RNA χρησιμοποιήθηκε για την ανάλυση RT-qPCR. Οκτώ πληροφοριακά γονίδια συν 2 οικονόμοι αναλύθηκαν ξεκινώντας από το ίδιο δείγμα RNA.

Η

RT-PCR q και ανάλυση δεδομένων

Σχετική ποσοτικοποίηση των γονιδίων στόχων πραγματοποιήθηκε με τον γνωστό ΥΠΟΛΟΙΠΟ εργαλείο λογισμικού [26]. Αλλαγές στο επίπεδο της έκφρασης των 7 από τους 8 πληροφοριακά γονίδια σε CaP Versus καλοήθη ιστό δεν έφθασε στατιστική σημασία (δεν φαίνεται), ενώ

CLU

ήταν σημαντικά ρυθμισμένη προς τα κάτω σε CaP (ρ & lt? 0,05). Στο Σχήμα 2, η σχετική έκφραση γονιδίου της υπογραφής που λαμβάνεται με το

Μέθοδος 2 ∧-ΔΔCT αναφέρεται ως συνάρτηση του RP τελικό σκορ Gleason. Είναι ενδιαφέρον,

CLU

είναι σημαντικά και αντίστροφα (p & lt? 0,01) με το σκορ Gleason του όγκου: δηλαδή χαμηλότερα επίπεδα έκφρασης του

CLU

βρέθηκαν στο υψηλότερο Gleason σκορ δείγματα. Στον Πίνακα 2 παρουσιάζονται τα τελικά αποτελέσματα της κατάταξης σύμφωνα με τον πλησιέστερο Γείτονας (ΝΝ) ταξινομητή σε συνδυασμό με την επικύρωση 10 φορές σταυρό. Αν και η ανάλυση ΥΠΟΛΟΙΠΟ έδειξε ότι μόνο οι αλλαγές στο

CLU

έκφραση ήταν στατιστικά σημαντικές, NN ταξινόμησης + 10 φορές επικύρωση σταυρό πραγματοποιήθηκε με δεδομένα ΔΟΙ αποκάλυψε μια πολύ καλή απόδοση, σε αυτή την διάκριση του καπακιού σε σχέση με καλοήθη δείγματα ήταν που λαμβάνεται με συνδυασμό 7 γονιδίων (

Η3, GAS 1, SSAT, CLU, AdoMetDC, OAZ, ODC

), χρησιμοποιώντας 3 γείτονες και την απόσταση συσχέτιση που βασίζεται. Η κατάταξη αυτή είναι στατιστικά σημαντική

* τιμή p & lt?. 0.01 (t-test). Λευκές ράβδοι = σκορ Gleason & lt? 7? Γκρι μπάρες = Gleason score≥7. Οι μπάρες σφάλματος αντιπροσωπεύουν το τυπικό σφάλμα του μέσου όρου.

Η

Σε αυτό το έργο που πληρώσαμε τη μέγιστη προσοχή για να επιτευχθεί η βέλτιστη δυνατή ποιότητα της δειγματοληψίας ιστών και το χαρακτηρισμό (Σχήμα 1). Αυτό είναι απολύτως απαραίτητο δίνει την υψηλή ετερογένεια του δείγματος καρκίνου του προστάτη. Ο συνδυασμός ενός «εύρωστο» και ευρέως δοκιμασμένη προσέγγιση για τη στατιστική ανάλυση των δεδομένων με το δείγμα υψηλής ποιότητας δειγματοληψίας μας επέτρεψε να ληφθεί η τελική επικυρωμένη αποτέλεσμα με ένα σύνολο δεδομένων των 66 δειγμάτων.

Η αντιστοιχία μεταξύ του χαρακτηρισμού γονιδίων υπογραφή μας και τελική παθολογική ταξινόμηση (ΚΓΠ έναντι καλοήθης) που λαμβάνεται από τον παθολογοανατόμο ήταν (80 ± 5)%, με ευαισθησία (81 ± 6)% και ειδικότητα (78 ± 7)%. Δείγματα ιστού που έχουν ταξινομηθεί εσφαλμένα από το μοριακό μέθοδο, σε σχέση με την παθολογική ταξινόμηση, υποδεικνύονται στον Πίνακα 1 (bold). Παρατηρούμε ότι σε αυτή την περίπτωση μια άδεια-one-out cross επικύρωσης έχει θεωρηθεί, αφού με τις Ν-φορές διαδικασία εσφαλμένων ταξινομήσεων των μεμονωμένων δειγμάτων μπορεί να διαφέρουν σε κάθε υλοποίηση. Με τον ίδιο συνδυασμό των γονιδίων μας σωστά υπο-ταξινομείται 84% των δειγμάτων όγκου σε σχέση με την ηλικία του ασθενούς, το 71% σε σχέση με την τελική RP Gleason σκορ και 42% σε σχέση με το PSA πριν RP (Πίνακας 2). Η ίδια η υπογραφή δεν αποδίδουν καλά για την κατάταξη σε σχέση με TNM στάσης.

Inter-εργαστηριακή μεθοδολογία επικύρωσης

Ένα δεύτερο εργαστήριο που συμμετέχει σε μια δια-εργαστήριο μεθοδολογία επικύρωσης. Κάθε δείγμα ιστού αναλύθηκε ξεχωριστά, προσδιορισμούς ήταν εις διπλούν φρεατίων και κάθε πείραμα να τρέξει για 6 φορές σε δύο ανεξάρτητα εργαστήρια, με Ct γραμμή που στην ίδια τιμή. Inter-εργαστηριακή διακύμανση ήταν μικρότερη από 1 κύκλο για κάθε μεμονωμένο προσδιορισμό. (Τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Τέτοια μεταβλητότητα δεν επηρέασε σημαντικά την τελική κατάταξη.

τόσο λίγο όσο 1 mg ιστού καρκίνου εντός 20 mg καλοηθών δείγμα ανιχνεύθηκε

Όπως φαίνεται στον Πίνακα 1, η ποσότητα του καρκινικού ιστού ήταν μόνο 5% σε 7/31 δείγματα (ίσο με το 22,5% του συνόλου των δειγμάτων? 6/7 έχουν ταξινομηθεί σωστά), και λιγότερο από 15% σε 13/31 δείγματα (ίσο με το 42% του συνόλου των δειγμάτων? 10/13 ήταν σωστά ταξινομούνται). Ως εκ τούτου, η σχετική συνιστώσα του καρκίνου ιστό αντιπροσώπευαν μόνο περίπου 1-3 mg ιστού από mg συνολικά 20. Ο Πίνακας 1 παρέχει μια πλήρη λίστα των κλινικών περιπτώσεων από τα οποία προέρχεται το καθένα δείγμα ιστού, που περιλαμβάνει επίσης τα κλινικά δεδομένα, ταξινόμηση από τον παθολογοανατόμο και τοις εκατό των καρκινικών κυττάρων που υπάρχουν στο δείγμα, που εκφράζεται ως μια μέση τιμή ανάμεσα στο πριν και το μετά τμήματα RNA (βλέπε Εικόνα 1)

Συζήτηση

αναγνώριση των νέων και ακριβών μοριακοί βιοδείκτες:. η πρόκληση

η ταυτοποίηση νέων και ακριβή βιοδεικτών για αξιόπιστη μοριακή διάγνωση του Cap είναι μια πραγματική πρόκληση. Προηγούμενες μελέτες με μικροσυστοιχίες DNA εντόπισαν μοριακό υπογραφές που συσχετίζονται σημαντικά με καπάκι εξέλιξη [27] ή τη διαβάθμιση [28], που οδηγεί στην αναγνώριση των ενημερωτικών γονιδίων (μερικές φορές με άγνωστες λειτουργίες) που εξακολουθούν να αναμένουν περαιτέρω μελέτες για την κατανόηση του ρόλου τους στην Καπ πρόοδο [ ,,,0],29]. Άλλες επιτυχείς μελέτες οδήγησαν στη μοριακή διάγνωση του πώματος, αλλά βασίζονταν μόνο σε λίγες επιλεγμένες, καρκίνος-ειδικών γονιδίων. PCA3 είναι η καλύτερη ενιαία προγνωστικός δείκτης της ΚΓΠ: είναι πολύ συγκεκριμένες, αλλά η ευαισθησία είναι σχετικά χαμηλή [30]. Επιπλέον, η ευαισθησία δεν βελτιωθεί ακόμη και όταν προστέθηκαν δύο ακόμα γονίδια του προστάτη που σχετίζονται με [24], [25].

Μια νέα και αξιόπιστη μέθοδος βασίζεται σε μια ισχυρή προσέγγιση

Το έργο μας παρέχει μια αξιόπιστη μέθοδος για την μοριακή διάγνωση του καλύμματος που εκμεταλλεύεται μια σχετικά απλή μέθοδο. Το μοντέλο 7-γονίδιο εδώ παρουσιάζεται βασίζεται στον προσδιορισμό των γονιδίων τα οποία είναι γνωστό ότι εκφράζονται σε καλοήθη και καρκινικού ιστού, και υποβλήθηκε σε υψηλής ατομική διακύμανση. Ως εκ τούτου, η καινοτομία της προσέγγισής μας συνίσταται στην επίτευξη αποτελεσματικής μοριακή ταξινόμηση του καπακιού σε σχέση με την τελική παθολογική διάγνωση χωρίς τη χρήση γονιδίων τα οποία είναι ειδικά πολύ πάνω ή προς τα κάτω-ρυθμίζονται σε καλοήθεις έναντι καρκινικό ιστό. Στην πραγματικότητα, η εργασία μας βασίζεται στην ανίχνευση και την ανάλυση της έκφρασης των γονιδίων που είναι για μεγάλο χρονικό διάστημα ήταν γνωστό ότι εκφράζονται φυσιολογικά καθώς και απαραίτητη για την βιολογία των κυττάρων του προστάτη. Για παράδειγμα, οι αλειφατικές πολυαμίνες παράγεται σε πολύ υψηλά επίπεδα από τα επιθηλιακά κύτταρα του προστάτη και στη συνέχεια απελευθερώνεται σε υγρό του προστάτη σε mM ποσότητες [31] – [33], αν και ο ακριβής ρόλος αυτών των ενώσεων είναι ακόμα άγνωστη. Ανίχνευση των πολυαμινών στα ούρα είχε ήδη επιχειρήσει πριν από πολύ καιρό για τη διάγνωση του Cap [34].

Για να επιτευχθεί μια αξιόπιστη ανίχνευση του γονιδίου υπογραφή μας σε δείγματα καρκινικού ιστού και να εφαρμόσει την πρακτική χρήση έπρεπε να αντιμετωπιστούν διάφορα τεχνικά ζητήματα. Όταν δεν υπάρχει ειδικό ειδικού εργαλείου ή οργάνου, η ανάπτυξη μιας διαδικασίας «σάντουιτς» ήταν αναγκαία για την απόκτηση μορφολογικά και μοριακά δεδομένα από τα ίδια δείγματα ιστών (Σχήμα 1).

Στατιστική ανάλυση

σε προηγούμενες δημοσιεύσεις, που εργάζονται με τόσο των ζώων [14] και την ανθρώπινη [3], [4] μοντέλα CaP έχουμε αποδείξει αυστηρά σχετικές μετατοπίσεις στην έκφραση όλων των γονιδίων που μελετήθηκαν. Παρ ‘όλα αυτά, η ανάλυση ΥΠΟΛΟΙΠΟ έδειξε ότι η σχετική έκφραση των γονιδίων 7 εκτός CLU δεν ήταν στατιστικά σημαντική σε κακοήθεια. Αυτό ήταν κάπως απροσδόκητο. Η δυσκολία της ακολουθεί μια μοριακή προσέγγιση στην ΚΑΠ διάγνωση στον πραγματικό κλινικό περιβάλλον είναι προφανής. Αλλά το αποτέλεσμα αυτό εξηγείται από το γεγονός ότι η έκφραση των γονιδίων πολυαμίνης είναι γνωστό ότι χαρακτηρίζονται από υψηλή ατομική διακύμανση των δειγμάτων ιστού που αναλύθηκαν. Παρ ‘όλα αυτά, αυτό δεν θέτει σε κίνδυνο την ανάλυσή μας, επειδή η μοριακή ταξινόμηση των δειγμάτων ιστού εδώ παρουσιάζονται λαμβάνει υπόψη το σύνολο του γονιδίου υπογραφή, ανιχνεύοντας μια σημαντική διαφορά σε ολόκληρο το προφίλ γονιδιακής έκφρασης ανεξάρτητα από επιμέρους διακυμάνσεις. Το τελικό αποτέλεσμα είναι ότι η ολοκληρωμένη πρότυπο έκφρασης είναι σημαντικά διαφορετική στο Cap έναντι καλοήθη ελέγχους. Αυτή η νέα προσέγγιση υπήρξε επιτυχής χρησιμοποιώντας τον ταξινομητή NN, μια στατιστική μέθοδο που είναι γνωστή για την εκτέλεση και ειδικά για την ταξινόμηση του καρκίνου, ακόμη και σε σύγκριση με άλλες πιο εξελιγμένες μεθόδους [35], [36]. NN είναι μια μη-παραμετρική μέθοδος που ανήκει στην κατηγορία των «εύρωστη» ταξινομητές [37]. NN είναι γνωστό για να καταστήσει μια καλή απόδοση, όπου το όριο μεταξύ των δύο κατηγοριών να υφίστανται διακρίσεις δεν είναι σαφή από την γεωμετρική άποψη. Αυτή η κατάσταση συμβαίνει συχνά σε κλινικές μελέτες στις οποίες μεμονωμένες παραλλαγές μπορεί να είναι πολύ υψηλότερο σε σύγκριση με εργαστηριακά δείγματα που λαμβάνονται από το

in vitro

πειράματα, παρέχοντας «ασαφή» τα όρια που μπορεί να προκύψει από σύνθετα προφίλ γονιδιακής έκφρασης. NN δεν είναι σχεδόν λογικό να περιορίζεται η δειγματοληψία από τις κατηγορίες που πρέπει να υφίστανται διακρίσεις λόγω του πολύ περιορισμένου αριθμού παραμέτρων (δηλαδή, η επιλογή της συνάρτησης απόστασης και ο αριθμός των γειτόνων). Παρ ‘όλα αυτά, ΝΝ καθιστά πολύ καλές επιδόσεις ταξινόμησης και σε σύγκριση με άλλα πολυπαραμετρική πολύ γνωστή ταξινομητές όπως Νευρωνικά Δίκτυα ή Support Vector Machines, οι μέθοδοι που επιτυγχάνουν βέλτιστη απόδοση μόνο όταν μεγάλα σύνολα δεδομένων είναι διαθέσιμα.

Μέχρι σήμερα, η καλύτερη προσέγγιση για την επίτευξη μια τελική αξιολόγηση για την απόδοση ακόμη και μια «ισχυρή» στατιστικό ταξινομητή όπως NN είναι να επαναχρησιμοποιήσουν τα δεδομένα που συλλέγονται τόσο για την εκπαίδευση και την επικύρωση της επιλεγμένης ταξινομητή: η διαδικασία αυτή συνήθως αναφέρεται ως σταυρό επικύρωση (και περιγράφεται σε πολλά » κλασική «στατιστική βιβλία [37]). Στο Ν-φορές σταυρό επικύρωσης, το σύνολο δεδομένων είναι τυχαία χωρίζεται σε Ν μέρη και κάθε μέρος χρησιμοποιείται ως ένα σύνολο επικύρωσης χρησιμοποιώντας το άλλο ως σύνολο εκπαίδευσης. Υπό αυτές τις συνθήκες εργασίας η απόδοση ταξινομητής διαφέρει για κάθε τυχαία υλοποίηση. Εφαρμόσαμε τη διαδικασία αυτή τόσο με ένα 5-φορές (δεν φαίνεται) και μια 10-πλάσια επικύρωση σταυρό, και ελήφθησαν παρόμοια παραστάσεις. Λόγω των ανωτέρω, το αποτέλεσμα που προκύπτει από NN + 10 φορές σταυρό διαδικασία επικύρωσης μπορεί να θεωρηθεί ως πολύ αξιόπιστα ακόμη και με ένα σύνολο δεδομένων μικρού μεγέθους. Η ίδια στατιστική προσέγγιση έχει χρησιμοποιηθεί ήδη για την ανάλυση και την επικύρωση των υπογραφών γονιδιακής έκφρασης σε έρευνα για τον καρκίνο [38], [39].

Υπό αυτές τις συνθήκες, η καλύτερη απόδοση ταξινόμησης λήφθηκε με ένα μοντέλο 7-γονιδίου (

Η3

,

GAS 1

,

SSAT

,

CLU

,

AdoMetDC

,

OAZ

και

ODC

). Η συμφωνία μεταξύ της μοριακής και της τελικής κατάταξης παθολογική είχε ακρίβεια (80 ± 5)% με ευαισθησία (81 ± 6)% και ειδικότητα (78 ± 7)%. Αυτό το αποτέλεσμα δείχνει ότι η διάγνωση της ΚΓΠ μοριακά δεδομένα είναι η μόνη εφικτή

Το γονίδιο υπογραφή ανιχνεύει πολύ λίγα καρκινικά κύτταρα:. Το πεδίο του καρκίνου αποτέλεσμα

Αξίζει να σημειωθεί ότι, η μέθοδος μας έδειξε μια πολύ υψηλή ευαισθησία που εργάζονται σε μια συλλογή από δείγματα ιστών CaP στην οποία ένα σημαντικό μέρος του συνόλου, δηλαδή 7/31, θεωρήθηκαν καπάκι στη βάση του έχει μόνο το 5% των καρκινικών κυττάρων. Αυτό αντιπροσωπεύει μόνο το 1 mg ιστού του καρκίνου που υπάρχει σε ένα σύνολο 20 mg. Μία λογική συνέπεια αυτού του αποτελέσματος είναι ότι μοριακά γεγονότα ανιχνεύονται σε προ-κακοήθη ιστό ή σε ιστούς παρακείμενα στον καρκίνο έχουν παράσχει διαγνωστικές πληροφορίες, υποστηρίζοντας την υπόθεση ότι μία μοριακή προσέγγιση για CaP διάγνωση θα ήταν μία πιο ευαίσθητη και ισχυρό εργαλείο από μορφολογική εξέταση. Αυτό το αποτέλεσμα είναι σύμφωνο με το «φαινόμενο πεδίο του καρκίνου», όπως υπέθεσε πρόσφατα. Σύμφωνα με αυτή την ιδέα, τα μετασχηματισμένα κύτταρα εκτείνονται πέρα ​​από μορφολογικά εμφανής όγκου. Αυτά τα γεγονότα θα προηγούνται ανάπτυξη κακοήθειας, επειδή η κανονική εμφανίζονται ιστό προστάτη μπορεί να υποστεί γενετικές αλλαγές σε απόκριση σε, ή σε αναμονή, ο καρκίνος μορφολογικές [40]. Πρόσφατα, οι επιδράσεις πεδίο με βάση επιγενετικές γεγονότα [41], μετατροπές πυρηνικής μήτρας [42], ανδρογόνων ανοσοδραστικότητα του υποδοχέα στο στρώμα που περιβάλλει τον καρκίνο βλάβη [43] έχουν ανακαλυφθεί. Χρησιμοποιώντας μικροδιατάξεις ολιγονουκλεοτιδίων, ένα άλλο επιβεβαίωση προέρχεται από μια μελέτη στην οποία τα προφίλ έκφρασης του πρωτογενούς καρκίνου του προστάτη, παρακείμενο φυσιολογικό ιστό και φυσιολογικό ιστό από όγκο δωρεάν δότες συγκρίθηκαν [44]. Αυτό το σενάριο ενισχύουν την απαίτηση για την αντικειμενική μοριακών βιολογικών δεικτών της επιθετικής φαινοτύπου για την επίλυση των αβεβαιοτήτων όσον αφορά την ταυτοποίηση των πρόδρομων αλλοιώσεων που είναι πιο πιθανό να εξελιχθεί σε διηθητικό και μεταστατικό καρκίνο του προστάτη. Η πιο πιθανή εξήγηση για την εσφαλμένη κατάταξη μεταξύ των μοριακών και μορφολογικών στοιχείων που λαμβάνονται στη μελέτη μας είναι ότι πολύ νωρίς μοριακές αλλαγές μπορεί να προηγείται αλλοίωση της μορφολογίας, και ως εκ τούτου οι όροι αυτοί δεν θα επικαλύπτονται (ή να σχετίζεται με) την παθολογική απόκριση. Μοριακές αλλαγές προηγούμενες αλλαγές στο φαινότυπο θα ανιχνεύονταν από το μοριακό μέθοδο για τη διάγνωση, αυξάνοντας την ευαισθησία του και εξηγεί γιατί 7 δείγματα (Πίνακας 1, μαύρα στοιχεία) έχουν θεωρηθεί ως ο καρκίνος με τη μέθοδο γονίδιο υπογραφή, ενώ η παθολογική ταξινόμηση ήταν καλοήθης. Από αυτή την άποψη, υψηλότερη ευαισθησία της μεθόδου θα οδηγούσε σε μείωση του αριθμού των δειγμάτων που πρέπει να ληφθούν, με σαφές πλεονέκτημα για τον ασθενή. Είναι γνωστό ότι η ευαισθησία του βιοψίας είναι ένα δυνητικό πρόβλημα, που εξηγεί γιατί ο κορεσμός βιοψίες πρέπει να λαμβάνονται από ασθενείς. Η διαδικασία της κορεσμό του προστάτη με βιοψίες ανάλογα με τον όγκο να διατηρηθεί σταθερή πυκνότητα σχολαστικά αναπτύχθηκε προκειμένου να βελτιωθεί ποσοστό ανίχνευσης καπάκι, και βιοψίες προστάτη είναι όλο και πιο συχνά καθίσταται βιοψίες κορεσμού [45]. βιοψία κορεσμού μπορεί να θεωρηθεί για τους ασθενείς που διατρέχουν κίνδυνο του καρκίνου που είναι πρόθυμοι να δεχτούν τις παρενέργειες, αλλά είναι γνωστό ότι μπορεί να ανιχνευθεί κλινικά ασήμαντες καρκίνων [46].

Από την άλλη πλευρά, η ίδια λογική θα μπορούσε επίσης να εξηγήσει το αντίθετο αποτέλεσμα. Στην πραγματικότητα, η σχέση μεταξύ μορφολογικών αλλοιώσεων (δηλαδή HG-PIN) και την κλινική καπάκι είναι ακόμα ένα θέμα συζήτησης [47], [48]. Επίσης ΡΙΝ παριστάνει ένα «φαινόμενο πεδίο» με δυνατότητα εξέλιξης του καρκίνου, αλλά μπορεί να μην εμπλέκεται άμεσα στην ή δεν μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη του διηθητικού καρκίνου του προστάτη [49]. Ως εκ τούτου, μπορούμε να υποθέσουμε ότι ορισμένες αλλαγές στη μορφολογία μπορεί να μην υποχρεωτική να συνδεθούν με κλινικά σχετικό μετασχηματισμό των κυττάρων. Έτσι, τα δείγματα που ταξινομούνται ως καλοήθεις από το μοριακό εργαλείο, αλλά ο καρκίνος αντίθετα από τον παθολογοανατόμο, λόγω μεταβολής της μορφολογίας (5/31, Πίνακας 1, μαύρα πλάγια), μπορεί στην πραγματικότητα να είναι διαφορετική μορφολογικές οντότητες ή κλινικά νωχελικός βλάβες, πιθανώς υποβάλλεται σε παλινδρόμηση, επειδή περιβάλλεται από αντίδραση του ιστού. Αν ναι, αυτό το υλικό δεν θα είναι σημαντικές από κλινική άποψη, αλλά σαφώς διακρινόμενη σε μοριακή βάση από την επιθετική νόσο, αν και δεν έχουμε καμία οριστική απόδειξη γι ‘αυτό αυτή τη στιγμή.

clusterin και του καρκίνου του προστάτη

CLU

κλωνοποιήθηκε, την αλληλουχία και ταυτοποιήθηκε ως η μείζων γονίδιο ρυθμίζεται προς τα πάνω κατά τη διάρκεια της μαζικής επαγωγή της απόπτωσης και παλινδρόμησης του προστάτη που προκαλείται από ανδρογόνα εξάντληση [7] ή χορήγηση Finasteride [50] και η βιταμίνη D αναλόγων [51], [52]. Η γλυκοζυλιωμένη, εξωκυττάρια μορφή της CLU παράγεται σε υψηλά βασικό επίπεδο από τα κύτταρα του προστάτη και εκκρίνεται στο υγρό του προστάτη, αν και ο ρόλος της στην αναπαραγωγή εξακολουθεί να προβληματίζει τους ερευνητές [53].

Οι συγγραφείς έχουν προτείνει ότι η CLU θα μπορούσε να υπερ-εκφράζεται σε κύτταρα που επιβιώνουν της απόπτωσης, και όχι σε κύτταρα καταδικασμένη να πεθάνει. Έτσι, ένα κυτταροπροστατευτικό ρόλος για CLU έχει προταθεί [54]. Η συζήτηση για το θέμα αυτό εξακολουθεί να είναι ορθάνοιχτη. Έχει αποδειχθεί πρόσφατα ότι διαφορετικές μορφές πρωτεΐνης μπορεί να προέρχεται από το ίδιο γονίδιο με ακόμα άγνωστη [8] μηχανισμούς. ΤΟΡ-βήτα και θεραπεία με ακτίνες Χ επάγουν μία ακρωτηριασμένη μορφή του CLU που εντοπίζεται στον πυρήνα [55] – [58]. Πιστεύεται ότι διαφορετικές μορφές CLU έχουν διαφορετικούς ρόλους σε ανθρώπινα κύτταρα [8], επίσης ανάλογα με υπο-κυτταρικό εντοπισμό τους. Δομικές πληροφορίες σχετικά με αυτές τις μορφές πρωτεΐνης είναι ακόμα λιγοστές. Στοιχεία σχετικά με την πιθανή εμπλοκή του

CLU

στο μετασχηματισμό και την ανάπτυξη του όγκου είναι ακόμα ασαφείς ή αντιφατικές στη βιβλιογραφία.

Η ανάλυση ΥΠΟΛΟΙΠΟ σχετική έκφραση αποδειχθεί (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται) ότι η ρύθμιση προς τα κάτω της

CLU

σε Cap δείγματα είναι στατιστικά σημαντική (p = 0,023). Αυτό είναι συνεπές με τα προηγούμενα αποτελέσματα μας [3], [13]. Αν και το συγκεκριμένο ζήτημα του κατά πόσον CLU είναι πάνω ή προς τα κάτω-ρυθμίζονται στο καπάκι είναι ακόμα αμφιλεγόμενη [3], [13], [15], [59] – [61], επιβεβαιωτικά στοιχεία που υποστηρίζουν την υπόθεσή μας ότι η CLU δεν είναι μόνο προς τα κάτω -regulated στο καπάκι, αλλά και με τον πιο καρκίνων, μπορεί εύκολα να ανακτηθεί από το Oncomine ιστοσελίδα που συλλέγει δεδομένα από περισσότερες από 20.000 ανεξάρτητων πειραμάτων μικροσυστοιχιών (https://www.oncomine.org). Έχουμε προηγουμένως προταθεί ότι CLU θα μπορούσε να είναι μια δυνητική ογκοκατασταλτικού γονιδίου [51] που ενεργεί μέσα από την πυρηνική μορφή της nCLU [57], [63], [64].

Πιθανές προγνωστική αξία της μεθόδου

Έχουμε ήδη διαπιστώσει ότι ενημερωτική γονίδια μας έχουν προγνωστική αξία [3], [4]. Είναι γνωστό ότι η βαθμολογία Gleason είναι η καλύτερη ενιαία προγνωστικός δείκτης του Cap πρόγνωση [65], αλλά η πρόβλεψη της έκβασης στην περιοχή 6-7 σκορ, το οποίο περιλαμβάνει την πιο κλινικών περιπτώσεων, δεν είναι ικανοποιητική [65]. Είχαμε 28/41 των ασθενών σε αυτές τις συνθήκες σε μας βιο-bank (Πίνακας 1). Δυστυχώς αυτή η ανάλυση, όπως έγινε πριν από [4], απαιτεί τα οριστικά στοιχεία αποτέλεσμα για το σύνολο ομάδα των ασθενών, και έτσι τουλάχιστον μία μελέτη παρακολούθησης 5 ετών θα είναι απαραίτητο όπως έγινε στο παρελθόν [4]. Είμαστε ενθαρρύνονται να ακολουθήσουν αυτή τη δυνατότητα, επειδή ενημερωτικό γονίδιά μας έχουν ήδη βρεθεί προγνωστική αξία όχι μόνο στην ανθρώπινη CaP [4], αλλά και στο μοντέλο ποντικών TRAMP. Αυτά τα ζώα υποβλήθηκαν σε αγωγή με πράσινο τσάι κατεχίνες (ΓΟΠ) για την αναστολή της εξέλιξης CaP [19]. Σε αυτό το πειραματικό μοντέλο, η γονιδιακή υπογραφή μας ήταν σε θέση να διακρίνει αποτελεσματικά CaP δείγματα ιστού της TRAMP ποντίκια ανταποκρίνονται στη θεραπεία ΓΟΠ από εκείνους που δεν αποκρίνονται, ως εκ τούτου, γεγονός που υποδηλώνει ότι η βιολογική συμπεριφορά του καπακιού μπορεί να είναι επιτυχία διερευνηθεί επίσης σε ανθρώπους με την ίδια προσέγγιση.

Στον πίνακα 2 φαίνεται επίσης ότι ο συνδυασμός των 7 γονιδίων (

H3

,

GAS 1

,

H3

,

SSAT

,

CLU

,

AdoMetDC

,

OAZ

,

ODC

) ταξινόμησε σωστά το 84% των δειγμάτων καρκίνου σε σχέση με την ηλικία του ασθενούς, το 71% σε σχέση με RP Gleason σκοράρει και 42% σε σχέση με το PSA. Λανθασμένη ταξινόμηση σε σχέση με PSA πράγματι αναμενόμενο, επειδή το PSA δεν είναι ένας όγκος του προστάτη, αλλά, πιο σωστά, ένα προστατικό ιστό ειδικός δείκτης. Ως Μάλιστα, επίσης PSA τιμές cut-off και τα ποσοστά ανίχνευσης ΚΓΠ εξακολουθεί να αποτελεί θέμα συζήτησης [1]. Αντ ‘αυτού, έχουμε μια πολύ καλή απόδοση για την ταξινόμηση της ηλικίας και το σκορ Gleason, τόσο που χρησιμοποιείται ευρέως για την κλινική διαχείριση των ασθενών, με Gleason σκορ να είναι ο καλύτερος προγνωστικός δείκτης [65]. Επίσης, τα αποτελέσματα αυτά υποδεικνύουν έντονα ότι η προσέγγισή μας ανιχνεύει σημαντικές βιολογικές εκδηλώσεις που συμβαίνουν κατά τη διάρκεια του μετασχηματισμού του προστάτη των κυττάρων και την εξέλιξη του καρκίνου.

Για τους παραπάνω λόγους θα είναι θεμελιώδους σημασίας για να συνεχίσει τη μελέτη αυτή με τη συλλογή δεδομένων κλινική παρακολούθηση, με [26].