You must be logged into post a comment.
Αφηρημένο
Ιστορικό
Τα microRNAs (miRNAs) ρυθμίζουν αρνητικά την 3 ‘μη μεταφραζόμενη περιοχή (3’-UTR) των γονιδίων που κωδικοποιούν καταστέλλοντας μετάφραση ή εξευτελιστική mRNA, και δρουν ως ογκογονίδια ή καταστολείς των όγκων. Πρόσφατα, αρκετές μελέτες εξέτασαν τη σχέση μεταξύ των προ-miR-27a rs895819 πολυμορφισμό και τους κινδύνους των διαφόρων μορφών καρκίνου, αλλά τα αποτελέσματα ήταν ασυνεπής.
Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα
Είμαστε σε μια μετα-ανάλυση από 13 μελέτες που περιλάμβαναν 6501 περιπτώσεις καρκίνου και 7571 ελέγχους για την αντιμετώπιση αυτού του συνδέσμου. Συνολικά, αυτό το μετα-ανάλυση έδειξε ότι η προ-miR-27a rs895819 A /G πολυμορφισμός δεν έχει στατιστικά που σχετίζονται με καρκίνους του κινδύνου σε όλα τα γενετικά μοντέλα. Στην στρωματοποιημένη ανάλυση ανά τύπους καρκίνου, σε σύγκριση με την προγονική Α αλληλόμορφο, τα άτομα με την παραλλαγή G αλληλόμορφο συνδέθηκε με συνέπεια με μειωμένη κινδύνους του καρκίνου του μαστού (OR = 0.92, 95% CI = 0.85-0.99), ο καρκίνος των νεφρικών κυττάρων (OR = 0.81, 95% CI = 0,67 – 0,97) και ρινοφαρυγγικού καρκίνου (OR = 0,84, 95% CI = 0,72 – 0,97). Αντιστρόφως, τα άτομα με την ετεροζυγώτη AG συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού συστήματος σε σύγκριση με ΑΑ γονότυπο (AG έναντι ΑΑ: OR = 1.16, 95% CI = 1,01 – 1,32). Στο στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, η προ-miR-27a rs895819 πολυμορφισμού έδειξαν στατιστικά σημαντική συσχέτιση με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου σε Καυκάσιους (G εναντίον Α αλληλόμορφο: OR = 0.90, 95% CI = 0,83 – 0,97? AG εναντίον ΑΑ: OR = 0,84, 95% CI = 0,75 – 0,94? AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 0.85, 95% CI = 0,76 – 0,94), αλλά όχι σε Ασιάτες
Συμπέρασμα /Σημασία
Αυτή η μετα-ανάλυση υποδεικνύει ότι η προ-miR-27a rs895819 πολυμορφισμός μπορεί να συνεισφέρει στα ευαισθησίες κάποιου ειδικού τύπου καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του μαστού, ο καρκίνος των νεφρικών κυττάρων, ρινοφαρυγγικό καρκίνο και τους καρκίνους του πεπτικού συστήματος, καθώς και οι ευαισθησίες των καρκίνων σε Καυκάσιους σε κάποιο βαθμό
Παράθεση:. Xu Q, Ο Cy, Liu Jw, Yuan Υ (2013) προ-miR-27a rs895819A /G πολυμορφισμοί στον Καρκίνο: μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (6): e65208. doi: 10.1371 /journal.pone.0065208
Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής
Ελήφθη: 25 Δεκέμβρη, 2012? Αποδεκτές: 23 Απρίλη του 2013? Δημοσιεύθηκε: 7 του Ιουνίου 2013
Copyright: © 2013 Xu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται
Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίζεται από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Key Πρόγραμμα βασικής Έρευνας της Κίνας (973 Πρόγραμμα Ref No. 2010CB529304, https://www.973.gov.cn/Default_3.aspx), το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Ref Νο 31200968 , https://www.nsfc.gov.cn/Portal0/default152.htm), και το Έργο Επιστήμης Τεχνολογίας στην επαρχία Liaoning (Ref Νο 2011225002, https://kjjh.lninfo.gov.cn/). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου
Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα
Εισαγωγή
τα microRNAs (miRNAs) είναι RNAs που είναι 18-23 νουκλεοτίδια που συμμετέχουν στην ρύθμιση της μεταγραφής ευκαρυωτικών γονιδίων [1], η οποία σχετίζεται με μετα-μεταγραφική τροποποιήσεις που οδηγούν σε αποδόμηση του mRNA ή την μεταφραστική καταστολή των στοχευόμενων γονιδίων [2]. Τα γονίδια miRNA μεταγράφονται σε μία μορφή RNA φουρκέτας σχήματος ονομάζεται PRI-miRNA [3], που υποβάλλεται σε επεξεργασία από μία ενδονουκλεάση, Drosha, για να σχηματιστεί ένα προ-miRNA που είναι μακράς 60-70 νουκλεοτίδια [4]. Τα προ-miRNAs διασπαστεί με μία ενδονουκλεάση, Dicer, για να σχηματιστεί το ώριμο miRNA, το οποίο λειτουργεί ως ρυθμιστής γονίδιο [5]. Η διακύμανση του ιδιωτικού, προ-, και ωριμάζουν miRNA μέσω φυσιολογικών διεργασιών μπορεί να προκαλέσει την εμφάνιση και την ανάπτυξη ενός όγκου.
Οι
miRNAs που μεταγράφεται από ένα γονίδιο ιντρονίου και /ή διαγονιδιακή περιοχή. υπάρχουν πολυμορφισμοί στην πρωτοβάθμια, προ και ώριμα γονίδια miRNA που μπορεί δυνητικά να επηρεάσουν την επεξεργασία της ωρίμανσης miRNAs, που επηρεάζουν σε μεγάλο βαθμό τη λειτουργία των miRNAs [6]. Η πρώτη έρευνα επικεντρώθηκε σε pre-miRNA πολυμορφισμούς προβληθεί 323 πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) σε 227 γονίδια miRNA σύμφωνα με βιοπληροφορικής από Duan et al. [6]. Από τότε, οι μελετητές όλα επικεντρώθηκε σε 3 περιοχές SNP στον τομέα της σύνδεσης μεταξύ miRNA πολυμορφισμό και καρκίνους, HSA-προ-miR-146a rs2910164, HSA-προ-miR-196a2 rs11614913, και HSA-miR-499 rs374644, και αρκετές μετα αναλύσεις ανέφεραν ότι αυτά τα 3 sites σχετίστηκαν με τους κινδύνους του καρκίνου [7] – [16]. Το miR-27a rs895819 A /G πολυμορφισμός βρίσκεται στο βρόχο του προ-miRNA, και η διακύμανση από το Α έως G θα μπορούσε να προκαλέσει μια αλλαγή στην ελάχιστη ελεύθερη ενέργεια (MFE). Επομένως, αυτή η SNP μπορεί να επηρεάσει τη λειτουργία του miRNA σε κάποιο βαθμό. Ωστόσο, τα αποτελέσματα όσον αφορά την σύνδεσή της με τον κίνδυνο καρκίνου είναι αντικρουόμενα. Η πλειοψηφία των μελετών ανέφεραν ότι το αλληλόμορφο παραλλαγή θα μπορούσε να μειώσει τον κίνδυνο καρκίνου [17] – [19], αλλά μερικές μελέτες ανέφεραν διαφορετικές απόψεις. Μερικές μελέτες ανέφεραν ότι η σχέση μεταξύ του G αλληλόμορφο και ο καρκίνος του κινδύνου παραλλαγή ήταν ασήμαντο? Αυτές οι μελέτες αρνήθηκε τον προστατευτικό ρόλο του αλληλόμορφου G [20] – [22]. Επιπλέον, ορισμένες μελέτες ανέφεραν ότι η παραλλαγή G αλληλόμορφο ήταν ένα αλληλόμορφο κινδύνου. Για παράδειγμα, 2 μελέτες χρησιμοποιώντας δείγματα από την ίδια ήπειρο ανέλυσε τα γονότυπους AG και GG για τον κίνδυνο του καρκίνου του στομάχου και σε σύγκριση με τον κίνδυνο ότι για το γονότυπο ΑΑ άγριου τύπου. Μια μελέτη διαπίστωσε ότι οι γονότυποι AG και GG αυξάνει τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου [23], και η άλλη μελέτη διαπίστωσε το αντίθετο αποτέλεσμα [24]. Ως εκ τούτου, εξακολουθεί να απαιτείται η ολοκληρωμένη ανάλυση που ενσωματώνει όλες τις μεμονωμένες μελέτες. Για την ενίσχυση της αποτελεσματικότητας των μετα-ανάλυση σχετικά με τον κίνδυνο καρκίνου και να διερευνήσει κατά πόσον αυτός ο πολυμορφισμός rs895819 συνδέθηκε με το γαστρικό κίνδυνο καρκίνου, μια αδημοσίευτη μελέτη ασθενών-μαρτύρων σε καρκίνο του στομάχου, που διεξήχθη από Qian Xu et al στον όγκο Αιτιολογία και Screening Τμήμα Cancer Institute και της Γενικής Χειρουργικής στην Πρώτη συνδεδεμένες νοσοκομείο της Κίνας Ιατρικό Πανεπιστήμιο, Shenyang, Κίνα συλλέχθηκαν. Συνολικά, 13 σύνολα δεδομένων αποτελείτο από 6.501 περιπτώσεις με καρκίνους και 7571 μάρτυρες συμπεριλήφθηκαν στην μελέτη μας. Τα στοιχεία αυτά πρέπει να συνδυαστούν για να επεκτείνει την κατανόησή μας για το rs895819 SNP προ-miR-27a, η οποία μπορεί να παρέχουν κάποια στοιχεία για τη μελλοντική έρευνα. Έτσι, σε αυτή τη μελέτη διεξήγαγε μια μετα-ανάλυση για να συνδυάσει όλες τις διαθέσιμες μελέτες και να επικυρώσει το αν το miR-27a A /G πολυμορφισμός συμβάλλει στους κινδύνους του καρκίνου.
Μέθοδοι
Δημοσίευση Αναζήτηση
Μια συστηματική βιβλιογραφική έρευνα πραγματοποιήθηκε για όλα τα άρθρα σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ των προ-miR-27a rs895819 πολυμορφισμού και του καρκίνου κινδυνεύει μέχρι και 15 Μαρτίου 2013. η PubMed βάσεις δεδομένων, κινεζική Εθνική Υποδομή Γνώσης (CNKI) και Web of Science χρησιμοποιήθηκαν ταυτόχρονα. Χρησιμοποιήθηκαν οι ακόλουθες λέξεις-κλειδιά: «miR-27a», «καρκίνος /καρκίνωμα /όγκου /νεόπλασμα», «rs895819» και «πολυμορφισμός» από δύο ανεξάρτητους ερευνητές Qian Xu και Cai-Yun He. Όλες οι μελέτες πληρούσαν τα ακόλουθα κριτήρια: (1) μελέτη ασθενών-μαρτύρων? (2) η συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού και του καρκίνου κινδύνους miR-27a εξερευνήθηκε? και (3) η συχνότητα του γονότυπου ήταν διαθέσιμο. Τα κύρια κριτήρια αποκλεισμού ήταν: (1) εις διπλούν δεδομένα, (2) τη μελέτη μόνο για δείγματα καρκίνου ή για προκαρκινική ασθένεια σε σύγκριση με την ομάδα ελέγχου, και (3), τα υποκείμενα στην ομάδα ελέγχου ήταν άτομα υψηλού κινδύνου με κάποιες γονιδιακές μεταλλάξεις
Data Extraction
Δύο από τους συγγραφείς (Qian Xu και Cai-Yun He) εξάγονται όλα τα δεδομένα ανεξάρτητα, πληρούσε τα κριτήρια επιλογής, και κατέληξαν σε συμφωνία για όλα τα θέματα. Τα ακόλουθα στοιχεία συλλέχθηκαν: πρώτο συγγραφέα όνομα, έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου, τη γλώσσα, τη μέθοδο προσδιορισμού του γονότυπου, την πηγή των ομάδων ελέγχου (πληθυσμό, ή το νοσοκομείο-based), και ο συνολικός αριθμός των υποθέσεων και των ελέγχων, και κατανομές γονότυπου στις περιπτώσεις και τους ελέγχους. Εν τω μεταξύ, έχουμε κατηγοριοποιούνται καρκίνο του στομάχου, του παχέος εντέρου και καρκίνο του ήπατος σε «καρκίνο του πεπτικού σωλήνα» για την στρωματοποιημένη ανάλυση.
Στατιστικά
Πρώτον, οι συχνότητες γονοτύπου του miR-27a πολυμορφισμό για Hardy-Weinberg ισορροπίας (HWE) αξιολογήθηκαν από το Chi-square test στους ελέγχους και
P
& lt? 0,05 θεωρήθηκε ως σημαντική ανισορροπία. Η δύναμη της σύνδεσης μεταξύ των πολυμορφισμού και του καρκίνου κινδύνους miR-27a εκτιμήθηκε με αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ). Στατιστική ετερογένεια μεταξύ των μελετών ελέγχθηκε από Chi δοκιμή Q πλατεία με βάση και I
2 [25]. Ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντικά όταν
P
& lt? 0,10 παρατηρήθηκε σε δοκιμή Q, και εγώ
2 χρησιμοποιήθηκε για να προκριθεί διακύμανση Ή αποδίδεται στην ετερογένεια. Όταν υπάρχει ανομοιογένεια, ένα μοντέλο τυχαίας επίπτωση βάσει Dersimonian και Laird η μέθοδος χρησιμοποιήθηκε για να υπολογίζεται η συγκεντρωτική Ή κάθε μελέτης [26]? Αλλιώς, ένα μοντέλο σταθερής επίδραση με βάση την μέθοδο Mantel-Haenszel χρησιμοποιήθηκε [27]. Σε γενικές γραμμές, αξιολογήσαμε την πρώτη τους κινδύνους μεταξύ G αλληλόμορφο και του καρκίνου κινδύνους σε σχέση με το ότι για ένα αλληλόμορφο στο μοντέλο συνεπικρατούν (AG έναντι ΑΑ, GG έναντι ΑΑ), κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG έναντι ΑΑ) και υπολειπόμενη μοντέλο (ΦΕΚ έναντι AG /ΑΑ), και η σύγκριση αλληλικές (G έναντι Α). Πραγματοποιήσαμε επίσης διαστρωμάτωση αναλύσεις σχετικά με τον τύπο του καρκίνου (χωρίζεται σε καρκίνο του πεπτικού συστήματος, ο καρκίνος του μαστού, ο καρκίνος του ρινοφαρυγγικού και καρκίνο νεφρικών κυττάρων) και η εθνικότητα (Ασίας και του Καυκάσου). Μετα-παλινδρόμησης περαιτέρω την ανίχνευση της πηγής της ετερογένειας. Η μεταξύ μελέτες διακύμανσης (τ
2) χρησιμοποιήθηκε για την ποσοτικοποίηση του βαθμού ετερογένεια μεταξύ των μελετών και το ποσοστό της τ
2 χρησιμοποιήθηκε για να περιγράψει την έκταση της ετερογένειας εξήγησε [28]. μέθοδος βαθμό συσχέτισης του Begg χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθεί στατιστικά δημοσίευση προκατάληψη [29] (
P
& lt? 0,10 θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική). Όλες οι αναλύσεις έγιναν με τη χρήση του λογισμικού STATA, έκδοση 11.0 (STATA Corp., College Station, TX, USA), και όλες οι δοκιμές ήταν δύο όψεων.
Αποτελέσματα
Χαρακτηριστικά των Μελετών
Ένα σύνολο 20 άρθρα βρέθηκαν από την αναζήτηση βιβλιογραφίας από το PubMed, CNKI και Web of Science [17] – [24], [30] – [41], χρησιμοποιώντας διαφορετικούς συνδυασμούς των βασικών όρων. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, αποκλείσαμε εννέα μελέτες (μία ήταν μελέτη λειτουργία [34], το ένα ήταν αναδιπλασιάζω δεδομένα και έδειξε πρόβλημα τεχνική [33], τα δύο δεν μελετήθηκαν για τον πολυμορφισμό rs895819 [31], [35], το ένα είναι υπόθεση -Μόνο μελέτη [32], δύο δεν είχε ειδική περίπτωση ή ελέγχων [17], [36], και τα δύο ήταν μετα-αναλύσεις για την rs895819 SNP [30], [41]). Επιπλέον, η ερευνητική ομάδα μας παρέχεται αυτή την μετα-ανάλυση με μια σειρά από αδημοσίευτα στοιχεία σχετικά με τη σχέση μεταξύ rs895819 πολυμορφισμού και του γαστρικού τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Κατά συνέπεια, συνολικά 13 μελέτες ασθενών-μαρτύρων που εξάγεται από 11 άρθρα και μια σειρά από αδημοσίευτα στοιχεία μας που πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης μας συμπεριλήφθηκαν στην τελική μετα-ανάλυση [18] – [24], [37] – [40], που αποτελούνταν από 6501 περιπτώσεις καρκίνου και 7571 χωρίς καρκίνο ελέγχους. Το χαρακτηριστικό της κάθε περιλαμβάνεται μελέτη παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Από τις συμμετείχαν 13 μελέτες, όλα ήταν συμφωνημένα για την ηλικία, το φύλο, εκτός από 4 μελέτες για τον καρκίνο του μαστού που δεν χρειάζεται να ταιριάζει με το φύλο? 10 μελέτες διερευνήθηκε σε Ασιάτες και οι άλλες 3 μελέτες διερευνήθηκε σε Καυκάσιους? ελέγχους σε 7 μελέτες νοσοκομείο με βάση και τους ελέγχους των άλλων μελετών ήταν βασισμένες στον πληθυσμό ή μεικτά μαθήματα? μέθοδοι καθορισμού γονοτύπου περιλαμβάνεται PCR-RFLP (3 μελέτες), TaqMan (3 μελέτες), μόνο επέκταση PCR-based βάσης (5 μελέτες) και PCR-άμεση αλληλούχιση (2 μελέτες). 11 από 13 μελέτες που ελέγχθηκαν γονότυπους για τον έλεγχο της ποιότητας. κατανομή γονότυπο των ελέγχων σε όλες τις μελέτες ήταν συνεπής με την ισορροπία Hardy-Weinberg.
Η
Σύνθεση Ποσοτική
Πρώτον, όλα τα επιλέξιμα μελέτες συγκεντρώθηκαν για να εκτιμηθεί η δύναμη συνδέσμου mir -27a rs895819 πολυμορφισμό με το συνολικό κίνδυνο όλων των τύπων καρκίνου. Δεν παρατηρήθηκε στατιστικά σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα (Πίνακας 2). Πραγματοποιήσαμε περαιτέρω ανάλυση διαστρωμάτωσης που βασίζεται σε διαφορετικούς τύπους καρκίνου και διαφορετικές εθνότητες (Πίνακας 2).
Η
Κατά την ανάλυση στρωματοποίησης του τύπου του καρκίνου, η παραλλαγή G αλληλόμορφο παρατηρήθηκε ότι σχετίζεται στατιστικά με μειωμένο κίνδυνο καρκίνο του μαστού (OR = 0,92, 95% CI = 0.85-0.99). Δεδομένου ότι μόνο μία μελέτη διεξήχθη σε καρκίνο των νεφρικών κυττάρων ή ρινοφαρυγγικής του καρκίνου [19], [38], η συγκεντρωτική ή δεν μπορούσε να εκτιμηθεί με αυτούς τους δύο τύπους καρκίνου. Βασισμένο σε μία μελέτη, παρατηρήσαμε ότι οι AG ετεροζυγώτες και AG /GG γονότυπους συνδέθηκαν με συνέπεια μειωμένο κίνδυνο καρκίνου των νεφρών (AG έναντι ΑΑ: OR = 0.70, 95% CI = 0,55 – 0,89? AG /GG εναντίον ΑΑ : OR = 0.72, 95% CI = 0,57 – 0,90) και ρινοφαρυγγικού καρκίνου (AG έναντι ΑΑ: OR = 0.79, 95% CI = 0,65 – 0,96? AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 0.79, 95% CI = 0,66 -0,95) σε σύγκριση με το γονότυπο ΑΑ άγριου τύπου. Επιπλέον, το αλληλόμορφο G ήταν στατιστικά συσχετίζονται με μειωμένη κινδύνους καρκίνου των νεφρών (OR = 0.81, 95% CI = 0,67 – 0,97) και ρινοφαρυγγικού καρκίνου (OR = 0.84, 95% CI = 0,72 – 0,97) σε σύγκριση με το Α αλληλόμορφο . Αυτές οι παρατηρήσεις υπαινίχθηκε μια αντίστροφη συσχέτιση της G αλληλόμορφο με τους κινδύνους αυτών των τύπων όγκων. Παρ ‘όλα αυτά, η σύγκριση των AG έναντι ΑΑ στο πεπτικό υποομάδα του καρκίνου του σωλήνα έδειξε ένα αντίθετο αποτέλεσμα. Ο γονότυπος AG συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού σωλήνα. (AG έναντι ΑΑ γονότυπο: OR = 1.16, 95% CI = 1,01 – 1,32)
Κατά την ανάλυση διαστρωμάτωση της εθνικότητας, σε σύγκριση με το προγονική γονότυπο ΑΑ, οι AG ετεροζυγώτες και AG /GG γονότυπους συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου σε Καυκάσιους υποομάδα (AG έναντι ΑΑ: OR = 0.84, 95% CI = 0,75 – 0,94? AG /GG εναντίον ΑΑ: OR = 0.85, 95% CI = 0,76 – 0,94), αλλά όχι σε Ασιάτες υποομάδα. Παρατηρήσαμε την ίδια ένωση στη σύγκριση αλληλομόρφων (G αλληλόμορφο εναντίον Α αλληλόμορφο: OR = 0.90, 95% CI = 0,83 – 0,97).
Η ετερογένεια
Η ετερογένεια σε κάθε υποομάδα παρουσιάστηκε στον πίνακα 2. Ένα μέρος συγκρίσεις έδειξαν μικρή ή μέτρια ετερογένειας μεταξύ των μελετών. Εμείς στη συνέχεια διεξήχθησαν αναλύσεις ευαισθησίας για να εξερευνήσετε την επιρροή ατομική μελέτη σχετικά με τα συγκεντρωτικά αποτελέσματα από την άρση μια μελέτη σε έναν χρόνο από την συγκεντρωτική ανάλυση (Πίνακας S1). Τα αποτελέσματα έδειξαν καμία ατομική μελέτη επηρεάζονται τα κοινά ή σημαντικά. Ερευνήσαμε, ως εκ τούτου περαιτέρω την πηγή της ετερογένειας με βάση τον τύπο του καρκίνου, την εθνικότητα, τη γλώσσα, και η μέθοδος του γονότυπου με μετα-παλινδρόμησης σε σύγκριση αλληλομόρφων (G vs Α). αποτελέσματα μετα-παλινδρόμησης αποκάλυψε ότι ο τύπος του καρκίνου (
P
= 0.023), αλλά όχι την εθνικότητα (
P
= 0,452), τη γλώσσα (
P
= 0,347), ή τη μέθοδο του γονότυπου (
P = 0,100
) συνέβαλαν στην πηγή της ετερογένειας. Επιπλέον, ο τύπος του καρκίνου θα μπορούσε να εξηγηθεί 85,29% της μεταξύ των μελετών διακύμανσης (τ
2).
Δημοσίευση Bias
Κατάταξη συσχέτιση Begg είχε διεξαχθεί για την αξιολόγηση προκατάληψη δημοσίευση. Σε σύγκριση AG έναντι ΑΑ και κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG έναντι ΑΑ), παρατηρήθηκε μια μικρή προκατάληψη δημοσίευση (AG έναντι ΑΑ:
P
= 0,020? AG /GG έναντι ΑΑ:
P
= 0,088, αντίστοιχα, πίνακας 3), υπονοώντας πιθανή προκατάληψη δημοσίευση οφείλεται σε μια γλώσσα προκατάληψη, διογκωμένες εκτιμήσεις από μια ελαττωματική μεθοδολογικό σχεδιασμό σε μικρότερες μελέτες, και /ή μη δημοσίευση των μικρών δοκιμές με αντίθετα αποτελέσματα.
Συζήτηση
miR-27a, το οποίο βρίσκεται σε μία διαγονιδιακή περιοχή του χρωμοσώματος 19 (chr19:13947254-13947331), είχε επάνω ρυθμισμένη έκφραση σε πολλούς όγκους [42] και θεωρήθηκε να είναι μια oncomir [43] – [45]. Χρησιμοποιώντας την αλυσιδωτή αντίδραση μονόκλωνου διαμορφωτικού πολυμορφισμού-πολυμεράσης (PCR-SSCP) Tomiyasu Arisawa ανακαλύφθηκε το 2007 ότι υπήρχε πολυμορφισμός στην πλευρική περιοχή του γονιδίου miR-27a, και η παραλλαγή G συχνότητα αλληλόμορφου έφθασε 34,6% [36]. Κατά το ίδιο έτος, Ranhui Duan et al. απασχολείται μια βιοπληροφορικής μέθοδο για τη διαλογή 323 SNPs, και τόνισε τη σημασία αυτής της rs895819 SNP λόγω της θέσης του στην ακολουθία προ-miRNA [6]. Από τότε, αρκετές μελέτες αυτού του SNP προέκυψαν διαδοχικά. Το 2010, Tair Kontorovich et al., Χρησιμοποιώντας ένα Sequenom MassARRAY, προβλήθηκε 42 SNPs miRNA που σχετίζονται και διαπίστωσε ότι AG ετεροζυγώτες της rs895819 miR-27a είχαν χαμηλότερο κίνδυνο για καρκίνο του μαστού /ωοθηκών μεταξύ Εβραίων γυναικών [17]. Στο σχεδόν την ίδια στιγμή, Rongxi Yang et al. χρησιμοποίησε μια μέθοδο αλληλουχίας να παρατηρήσουμε ότι η παραλλαγή G αλληλόμορφο μειώθηκε σημαντικά οικογενή κίνδυνο καρκίνου του μαστού σε ένα γερμανικό πληθυσμό [18]. Μετά από αυτό, προτάθηκε ότι οι γονότυποι AG και GG είχαν μειωμένη νεφρική κίνδυνο καρκίνου των κυττάρων σε ένα κινεζικό πληθυσμό σε σύγκριση με το γονότυπο ΑΑ άγριου τύπου [19]. Ωστόσο, ορισμένες μελέτες έχουν διαφορετικές απόψεις? μερικές μελέτες θεωρείται η σχέση μεταξύ της παραλλαγής G αλληλόμορφο και τον κίνδυνο του όγκου να είναι ασήμαντη [20] – [22]. Επιπλέον, ορισμένοι ερευνητές θεωρούν ότι η παραλλαγή G αλληλόμορφο ήταν ένα αλληλόμορφο κινδύνου. Δύο ασυνεπής μελέτες διερευνήθηκε η κίνδυνο γαστρικού καρκίνου χρησιμοποιώντας δείγματα από την ίδια χώρα. Qingmin Sun et al. διαπίστωσε ότι οι γονότυποι AG και GG συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του στομάχου και αυξημένο επίπεδο έκφρασης του miR-27a [23], αλλά Yuan Zhou παρατηρείται το αντίθετο αποτέλεσμα [24].
Σύμφωνα με την μετα μας -την ανάλυση, A → παραλλαγή G σε miR-27a ιστοσελίδα rs895819 πολυμορφισμός δεν ασκούν σημαντική γενετική επίδραση στον κίνδυνο καρκίνου στη συνολική ανάλυση (Πίνακας 2). Πραγματοποιήσαμε περαιτέρω ανάλυση διαστρωμάτωση με βάση τον τύπο του καρκίνου και την εθνικότητα. Σε μαστού ανάλυση του καρκίνου υποομάδας ενσωμάτωση 4 μελέτες, τα άτομα που μεταφέρουν το G αλληλόμορφο της rs895819 αποδειχθεί μειωμένο κίνδυνο καρκίνου. Επιπλέον, μια μελέτη για τον καρκίνο των νεφρικών κυττάρων [19] και μία μελέτη σχετικά με ρινοφαρυγγικό καρκίνο [38] δεν μπορούν να ενσωματωθούν σε άλλους τύπους καρκίνου και έτσι αναλύθηκαν ξεχωριστά ως ενιαίο τύπο καρκίνου σε αυτό το μετα-ανάλυση. Για τον καρκίνο των νεφρών και τον καρκίνο του ρινοφαρυγγικού, του συνεταιρίζεσθαι αναλύσεις σύμφωνα με το μοντέλο συνεπικρατούν (AG έναντι ΑΑ), κυρίαρχο μοντέλο (AG /GG έναντι ΑΑ) και σύγκριση αλληλομόρφων (G εναντίον Α) υποστηρίζει σταθερά ότι αυτός ο πολυμορφισμός σχετιζόταν με μειωμένη κινδύνων και των δύο μορφών καρκίνου . Η μικρή διαφορά των ΕΑΠ και 95% CI μεταξύ μας μετα-ανάλυση και πρωτότυπες μελέτες τους ήταν πιθανόν να οφείλεται σε μη διαθέσιμα πρωτογενή δεδομένα για τη ρύθμιση άλλων παραγόντων. Όλα αυτά τα ευρήματα έδειξαν ότι αυτός ο πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με μειωμένη κινδύνους συγκεκριμένων καρκίνων συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του μαστού, καρκίνωμα νεφρικών κυττάρων και ρινοφαρυγγικού καρκινώματος.
Σε ανάλυση υποομάδων του καρκίνου του πεπτικού συστήματος, ωστόσο, παρατηρήθηκε ότι AG γονότυπο συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου. Όσο για την ενιαία αρχική μελέτη, η Sun et al ‘s [23] ανέφεραν μια στατιστικά θετική συσχέτιση του πολυμορφισμού rs895819 με γαστρικό κίνδυνο καρκίνου? τέσσερις μελέτες [23], [37], [38] (Qian Xu, 2013
*) έδειξε ότι αυτός ο πολυμορφισμός έτεινε να σχετίζεται θετικά με υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού σωλήνα, αν και δεν ήταν στατιστικά σημαντική. Σε αυτή την μετα-ανάλυση, που ενσωματώνονται και να αξιολογούνται τα διαθέσιμα δεδομένα αυτού του πολυμορφισμού με το πεπτικό τον κίνδυνο καρκίνου του συστήματος, η οποία μπορεί να αποδείξει ένα σχετικά σταθερό αποτέλεσμα. Η διαφορά του συλλόγου αυτού του πολυμορφισμού με διάφορους καρκίνους μπορεί να προκύψει από διακριτές κυτταρικές προέλευσης και παθογενετικών μηχανισμών των διαφόρων μορφών καρκίνου.
Για να διευκρινιστεί καλύτερα η συσχέτιση αυτού του πολυμορφισμού με καρκίνο του πεπτικού σωλήνα, προσθέσαμε μια σειρά αδημοσίευτων δεδομένων η οποία ήταν μια μελέτη ελέγχου περιστατικών που περιλάμβανε 222 γαστρικό περιπτώσεις καρκίνου και 305 ασθενείς με επιφανειακή γαστρίτιδα ως μάρτυρες στα κινέζικα. Η ομάδα ελέγχου περιείχε συμμετέχοντες από ένα πρόγραμμα ελέγχου υγείας για γαστρικό προσυμπτωματικό έλεγχο του καρκίνου στην Zhuanghe περιοχή της επαρχίας Liaoning, η Κίνα και οι ασθενείς που υποβλήθηκαν σε γαστροσκοπική εξέταση στην Πρώτη συνδεδεμένες νοσοκομείο της Κίνας Ιατρικό Πανεπιστήμιο, Shenyang, Liaoning Province, Κίνα. Όλα τα 527 άτομα διαγνώστηκαν ανεξάρτητα από δύο καθηγητικών παθολόγους. Με την ενσωμάτωση του παρόντος-που δημοσιεύθηκε στις 6 μελέτες και πρόσφατα αδημοσίευτα δεδομένα μας βρήκαμε για πρώτη φορά ότι αυτός ο πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος, η οποία είναι επίσης μία από τις διαφορές μεταξύ μας μετα-ανάλυσης και προηγουμένως δημοσιευθεί μετα-αναλύσεις. Επιπλέον, λαμβάνοντας υπόψη το σχετικά προφανή ετερογένεια που παρατηρείται σε αυτή την μετα-ανάλυση, ακόμη και μετά τη χρησιμοποίηση αναλύσεων ευαισθησίας και αναλύσεις υποομάδων, θα πραγματοποιηθεί μετα-παλινδρόμησης για να διερευνήσουν περαιτέρω την πηγή της ετερογένειας. Είναι ενδιαφέρον ότι, τα αποτελέσματα της μετα-παλινδρόμησης έδειξε την ετερογένεια προέκυψε κυρίως από διάφορα είδη καρκίνου και αυτό διακύμανση μπορούσε να εξηγήσει την πλειονότητα της ετερογένειας προέλευσης. Ως εκ τούτου, δεν θα πρέπει να αγνοηθεί οι διαφορετικές επιδράσεις αυτού του πολυμορφισμού σε διάφορες μορφές καρκίνου και οι συγκεκριμένες επιπτώσεις της στην διαφορετικούς τύπους καρκίνου δικαιολογείται να διευκρινιστεί σε μελλοντικές έρευνες.
Θα πρέπει επίσης να σημειωθεί Περιορισμοί της μελέτης αυτής. Πρώτον, συγκέντρωσε τα δεδομένα με τη χρήση μη προσαρμοσμένες πληροφορίες, ενώ μια πιο ακριβή ανάλυση θα μπορούσε να διενεργηθεί εάν λεπτομερείς πληροφορίες των αρχικών δεδομένων είναι διαθέσιμα. Δεύτερον, η έλλειψη των αρχικών δεδομένων των αναθεωρηθεί μελέτες περιορίζονται περαιτέρω αξιολόγηση μας των πιθανών αλληλεπιδράσεων, συμπεριλαμβανομένων των αλληλεπιδράσεων μεταξύ διαφορετικών γονιδίων και μεταξύ παραγόντων των γονιδίων και του περιβάλλοντος. Τρίτον, μόνο αγγλικά και κινέζικα έγγραφα και αδημοσίευτη μελέτη μας συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση, ενώ οι εκθέσεις που γράφτηκαν σε άλλες γλώσσες και άλλα αδημοσίευτα στοιχεία ή εν εξελίξει μελέτες δεν ήταν διαθέσιμα, τα οποία μπορεί να προκαλέσουν ορισμένες προκαταλήψεις δημοσίευση μας μετα-ανάλυση. Η τελευταία αλλά δεν το λιγότερο, το συγκεντρωμένο μέγεθος του δείγματος ήταν σχετικά περιορισμένη σε αυτό το μετα-ανάλυση. Ως εκ τούτου, αυτή η μετα-ανάλυση θα μπορούσε μόνο προκαταρκτικά εκτιμήσει τη σύνδεση των rs895819 πολυμορφισμού με σήμερα-που αναφέρθηκαν καρκίνους. Οι περισσότερες μελέτες που απαιτούνται ακόμη για να πάρετε μια πιο αξιόπιστο αποτέλεσμα.
Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι το G αλληλόμορφο του miR-27a rs895819 πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού, ο καρκίνος των νεφρικών κυττάρων και ρινοφαρυγγικό καρκίνο, καθώς επίσης και ένα μειωμένο κίνδυνο καρκίνου σε Καυκάσιους και AG ετεροζυγώτη μπορεί να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού σωλήνα. Για την επιβεβαίωση των ευρημάτων μας, είναι επιπλέον καλά σχεδιασμένες μελέτες σε διαφορετικές πληθυσμιακές ομάδες και λειτουργικές μελέτες σχετικά με αυτό το SNP απαιτείται.
Υποστήριξη Πληροφορίες
Πίνακα S1.
ΕΑΠ (95% CI) της ανάλυσης ευαισθησίας
doi:. 10.1371 /journal.pone.0065208.s001
(DOC)
Πίνακας S2.
Λίστα ελέγχου αυτής της μετα-ανάλυσης
doi:. 10.1371 /journal.pone.0065208.s002
(DOC)
You must be logged into post a comment.