Αφηρημένο

Ιστορικό και στοχεύει

Τα microRNAs (miRNAs) είναι γνωστά για τη λειτουργία τους ως μεταφραστικές ρυθμιστικές του καταστολέα όγκων ή ογκογονίδια. Οι πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου (SNPs) σε σχετικές miRNAs γονίδια έχει αποδειχθεί ότι επηρεάζουν την ρυθμιστική ικανότητα των miRNAs και συνδέθηκαν με καρκίνο του στομάχου (GC) και προκαρκινικές γαστρικό συνθήκες. Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να αξιολογηθούν οι πιθανές συσχετίσεις μεταξύ miRNA που σχετίζονται με τους πολυμορφισμούς του γονιδίου (

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

και

miR-608

) και η παρουσία του GC ή υψηλού κινδύνου ατροφική γαστρίτιδα (HRAG) σε ευρωπαϊκό πληθυσμό.

Μέθοδοι

Gene πολυμορφισμοί αναλύθηκαν σε 995 άτομα (έλεγχοι: n = 351? GC: n = 363? HRAG: n = 281) της Ευρωπαϊκής καταγωγής.

MiR-27α

T & gt? C (rs895819),

miR-146a

G & gt? C (rs2910164),

miR-196a-2

C & gt? T (rs11614913),

miR-492

G & gt? C (rs2289030) και

miR-608

C & gt?. G (rs4919510) SNPs γονότυπος με RT-PCR

Αποτελέσματα

Συνολικά, SNPs των miRNAs ήταν που δεν συνδέονται με την παρουσία του GC ή HRAG. Παρατηρήσαμε μια τάση για

miR-196a-2

CT γονότυπο να σχετίζεται με υψηλότερο κίνδυνο GC σε σύγκριση με CC γονότυπο, ωστόσο, η διαφορά δεν έφτασε το προσαρμοσμένο

P-τιμή

(αναλογία πιθανοτήτων (OR) – 1,46, 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) 01.03 – 02.07,

P

= 0,032).

MiR-608

GG γονότυπο ήταν πιο συχνή σε GC, σε σύγκριση με τους μάρτυρες (OR -2,34, 95% CI 1.8 έως 5.4), αλλά η σημασία παρέμεινε περιθωριακή (

P

= 0,029). Μια παρόμοια τάση παρατηρήθηκε σε ένα υπολειπόμενο πρότυπο για

miR-608

, όπου CC + CG vs σύγκριση GG γονότυπο έδειξαν μια τάση για αυξημένο κίνδυνο GC με ή 2,44 (95% CI 1.14 – 5.22,

P

= 0,021). Οι γονότυποι και αλληλόμορφα του

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

και

miR-608

SNPs είχαν παρόμοια κατανομή μεταξύ των ιστολογικών υποτύπων του GC και δεν συνδέεται με την παρουσία διάχυτης ή εντερικού τύπου GC.

Συμπεράσματα

πολυμορφισμών του γονιδίου της

miR -27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

,

miR-492a

και

miR-608

δεν συνδέθηκαν με την παρουσία HRAG, GC ή διαφορετικές ιστολογικές υποτύπους της GC στην Ευρωπαϊκή θέματα

Παράθεση:. KUPČINSKAS J, WEX Τ, Link A, Leja Μ, Bruzaite Ι, Steponaitiene R, et al. (2014) Gene πολυμορφισμοί των microRNAs στο

Helicobacter pylori

Επαγόμενου υψηλού κινδύνου ατροφική γαστρίτιδα και γαστρικό καρκίνο. PLoS ONE 9 (1): e87467. doi: 10.1371 /journal.pone.0087467

Επιμέλεια: Masaru Katoh, Εθνικό Κέντρο Καρκίνου, Ιαπωνία

Ελήφθη: 14 Σεπτεμβρίου του 2013? Αποδεκτές: 26 Δεκεμβρίου, 2013? Δημοσιεύθηκε: 27, Ιαν, 2014

Copyright: © 2014 KUPČINSKAS et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (Αρ VP1-3.1-Α MM-07-Κ-01-156) και εν μέρει από μια επιχορήγηση από το BMBF (BMBF-0315905D) στο πλαίσιο του ERA-NET PathoGenoMics. Η πρόσληψη των ασθενών στη Λετονία υποστηρίχθηκε εν μέρει από το έργο του Ευρωπαϊκού Ταμείου Περιφερειακής Ανάπτυξης (Νο 2010/0302 /2DP /2.1.1.1.0 /10 /APIA /VIAA /158). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Παρά τη μείωση εμφάνισης του γαστρικού καρκίνου (GC) στις περισσότερες ανεπτυγμένες χώρες, GC αντιπροσώπευαν συνολικά 989.600 νέα κρούσματα και 738.000 θανάτους το 2008 σε όλο τον κόσμο [1].

Helicobacter pylori

(

H. Pylori

) λοίμωξη σε γαστρικό βλεννογόνο μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη του ατροφικής γαστρίτιδας (AG) και εντερικής μεταπλασίας (IM) και είναι ένας παράγοντας καρδινάλιος κινδύνου για την ανάπτυξη του GC [2]. Παρ ‘όλα αυτά, η ανάπτυξη των αδενοκαρκίνωμα στομάχου δεν μπορεί να εξηγηθεί από την παρουσία του

H. pylori

μόνο. Τα Συνεργιστικά αποτελέσματα της περιβαλλοντικής, υποδοχής, θρεπτική και βακτηριακών παραγόντων πιστεύεται ότι προκαλούν γαστρική καρκινογένεση, ωστόσο, οι μηχανισμοί και η αλληλεπίδραση δεν είναι επαρκώς κατανοητές [3]. Ένας αριθμός γονιδίων αλλοιώσεις έχουν εμπλακεί σε γαστρικό καρκινογένεση, αλλά κανένα από αυτά δεν έχει ακόμη μεταφερθεί στην καθημερινή κλινική πρακτική, λόγω της έλλειψης δύναμης σύνδεσης [4]. Πρόσφατα στοιχεία υποδεικνύουν μια πιθανή επίδραση των πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) των γονιδίων microRNA που σχετίζονται με (miRNAs) για τον κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του [5].

miRNAs είναι μόνο ~ 22 bp μακρύ, και λόγω της μοναδικής του βιογένεση είναι ιδιαίτερα σταθερές σε διαφορετικούς ιστούς ή δείγματα, καθιστώντας τα ελκυστικό στόχο στον τομέα της έρευνας βιοδείκτη [6], [7]. Ένας αυξανόμενος αριθμός των λειτουργικών μελέτες δείχνουν ότι miRNAs μπορούν να συμμετέχουν σε διάφορα στάδια της γαστρικής καρκινογένεσης [8]. Αυτή η συμφωνία αντικατοπτρίζεται επίσης στην miRNA profiling μελέτες που αποκάλυψε συγκεκριμένες μεταβολές στο πρότυπο έκφρασης στο βλεννογόνο των ασθενών με GC. Επιπλέον, οι αλλαγές έκφρασης miRNA είναι ήδη ανιχνεύσιμη σε πρώιμα στάδια της γαστρικής καρκινογένεσης συμπεριλαμβανομένης

H. pylori

που προκαλείται AG [8].

Βελτίωση της κατανόησης του λειτουργικού ρόλου των miRNAs έχει ανοίξει ένα νέο Capitel στην έρευνα πολυμορφισμό του γονιδίου του καρκίνου [7], [9]. Ενιαία miRNA είναι σε θέση να στοχεύουν πολλαπλά γονίδια? Ως εκ τούτου, η σημασία των SNPs σε γονιδιακή αλληλουχία miRNA μπορεί ενδεχομένως να συνδέεται με αξιοσημείωτη μεταβολές στη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης και τροποποίηση του κινδύνου για την ανάπτυξη ορισμένων ανθρώπινων ασθενειών, συμπεριλαμβανομένων GC [8]. Διάφορες μελέτες έχουν δείξει ότι ορισμένες SNPs του miRNA γονιδίων που κωδικοποιούν μπορούν να τροποποιήσουν την έκφραση miRNA ή λειτουργικό ρόλο της και με αυτόν τον τρόπο να επηρεάσουν τον κίνδυνο ανάπτυξης ή εξέλιξης [10] του καρκίνου, [11]. Αυξανόμενος αριθμός μελετών ασθενών-μαρτύρων έχουν δείξει συσχέτιση μεταξύ των πολυμορφισμών των γονιδίων που κωδικοποιούν miRNAs και τον κίνδυνο των διαφόρων κακοηθειών [5]. πολυμορφισμών του γονιδίου πέντε γονίδια miRNA που σχετίζονται,

miR-27a

T & gt? C (rs895819),

miR-146a

G & gt? C (rs2910164),

miR-196a-2

C & gt? T (rs11614913),

miR-492

G & gt? C (rs2289030) και

miR-608

C & gt? G (rs4919510), έχουν επιλεγεί για την παρούσα μελέτη, λόγω της προηγουμένως πρότεινε συνεργασία με τους κινδύνους του καρκίνου [5], [12] – [14]

Η ανωτέρω miRNAs έχουν εμπλακεί σε διάφορες πορείες σχετίζονται με τον καρκίνο.. Liu et al. έδειξε ότι

miR-27a

είναι up-ρυθμίζεται σε GC και λειτουργεί ως ογκογονίδιο στοχεύοντας prohibitin [15]. SNP του

miR-27a

(rs895819) συμβάλλει στην ευαισθησία GC μέσα που επηρεάζουν την έκφραση του

miR-27a

και στοχεύει γονίδιο δακτύλου ψευδαργύρου και το domain ΤΔΕ που περιέχει 10 (

ZBTB10

) [16].

MiR-146a

φάνηκε να διαμορφώνει

H. pylori

επάγεται φλεγμονώδης αντίδραση σε ανθρώπινο γαστρικό επιθηλιακά κύτταρα με τη στόχευση IL-1 που συνδέεται κινάση 1 (

IRAK1

) και TNF υποδοχέα που συνδέονται παράγοντα 6 (

TRAF6

) [17]. Επιπλέον,

miR-146a

SNP (rs2910164) έχει συσχετισθεί με την AG στα ιαπωνικά θέματα [18]. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει παρεκκλίνουσα υπερέκφραση του

miR-196a-2

και επακόλουθη προς τα κάτω ρύθμιση του p27 (kip1) σε GC [16]. Μια άλλη μελέτη έδειξε ότι το γονίδιο πολυμορφισμός του

miR-196a-2

(rs11614913) συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο για GC [19], [20], ενώ μια μελέτη από Ahn et al. (2012) δεν μπόρεσε να επιβεβαιώσει αυτή τη συσχέτιση, αλλά αυτό το SNP συνδέεται με την επιβίωση σε ασθενείς με GC [21].

MiR-492

ταυτοποιήθηκε να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην εξέλιξη των κακοήθων όγκων εμβρυϊκών ηπατικών [22] και απορυθμίζεται σε καρκίνο του παχέος εντέρου σε σύγκριση με την κανονική βλεννογόνο του παχέος εντέρου [23]. Μια έκθεση στην κινεζική πληθυσμού έδειξε ότι το SNP του

miR-608

(rs4919510) μπορεί να επηρεάσει HER2-θετικό κίνδυνο καρκίνου του μαστού και του πολλαπλασιασμού των όγκων [14].

Οι περισσότερες από τις σήμερα δημοσιευμένες μελέτες του γονότυπου των σχετικών στα γονίδια miRNA σε GC έγιναν μόνο στις ασιατικές θέματα, περιορίζονται από μικρά μεγέθη δειγμάτων και η έκθεση εν μέρει αντικρουόμενα αποτελέσματα. Επιπλέον, πολύ λίγες μελέτες έχουν ασχοληθεί προηγουμένως ο ρόλος αυτών των miRNA σχετίζονται SNPs σε προκαρκινικές γαστρικές συνθήκες. Με βάση τα στοιχεία που παρέχονται παραπάνω, θα πραγματοποιηθεί συστηματική ανάλυση του γονότυπου για

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

ΜΙΚ 492

και

miR-608

SNPs σε ασθενείς με GC, υψηλού κινδύνου ατροφική γαστρίτιδα και ελέγχους, χρησιμοποιώντας τρεις ομάδες ασθενών από τη Γερμανία, τη Λιθουανία και τη Λετονία ευρωπαϊκής καταγωγής.

Μέθοδοι

Ηθική δήλωση

Η μελέτη εγκρίθηκε από τις επιτροπές Δεοντολογίας του Πανεπιστήμιο του Μαγδεμβούργου, Πανεπιστήμιο της Λιθουανίας Επιστημών Υγείας και της Κεντρικής ιατρική επιτροπή Δεοντολογίας της Λετονίας. Όλοι οι ασθενείς έχουν υπογράψει ένα έντυπο συγκατάθεσης για συμμετοχή στη μελέτη.

πληθυσμός Μελέτη

Θέματα που περιλαμβάνονται στη μελέτη προέρχονται από προηγούμενες έρευνες μας προγράμματα για SNPs σε GC και προκαρκινικές γαστρικό συνθήκες [24] , [25]. Οι ασθενείς και οι έλεγχοι προσλήφθηκαν κατά τη διάρκεια των ετών 2005-2012 σε τρία κέντρα γαστρεντερολογίας στη Γερμανία (Τμήμα Γαστρεντερολογίας, ηπατολογίας και Λοιμωδών Νοσημάτων, Πανεπιστήμιο Otto-von-Guericke, Magdeburg) Λιθουανία (Τμήμα Γαστρεντερολογίας, της Λιθουανίας Πανεπιστήμιο Επιστημών Υγείας, Kaunas) και τη Λετονία (Ρίγα Ανατολή Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο και Digestive Diseases Κέντρο GASTRO), Ρίγα. Ασθενείς με HRAG και οι έλεγχοι είχαν συμπεριληφθεί από τις εξωνοσοκομειακή τμήματα, οι οποίοι παραπέμφθηκαν για γαστροσκόπηση λόγω της δυσπεψίας συμπτώματα. Τα κριτήρια ένταξης των HRAG και οι έλεγχοι δεν είναι ιστορικό κακοήθειας, γαστρεντερικής νόσου ή χειρουργική επέμβαση. ασθενείς GC είχαν ιστολογική επιβεβαίωση του γαστρικού αδενοκαρκινώματος και είχαν προσληφθεί από την εξωνοσοκομειακή και σταθερές τμήματα. Συνολικά, 995 άτομα, για τα οποία το υλικό με την κατάλληλη ποιότητα του DNA ήταν διαθέσιμο (351 έλεγχοι, 281 και 363 HRAG GC), συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη. Υπήρχαν 310 άτομα από τη γερμανική ομάδα (63 έλεγχοι, 106 GC και 141 HRAG), 340 άτομα από την λετονική ομάδα (142 έλεγχοι, 139 GC και 59 HRAG) και 345 άτομα από την ομάδα της Λιθουανίας (146 έλεγχοι, 118 GC και 81 HRAG). Όλοι οι ασθενείς ήταν ευρωπαϊκής καταγωγής.

Η ιστολογική ανάλυση και

H. pylori

κατάσταση

Λεπτομερής ιστολογική αξιολόγηση του γαστρικού βλεννογόνου πραγματοποιήθηκε σε ελέγχους και ομάδες HRAG σύμφωνα με την τροποποιημένη ταξινόμηση Σύδνεϋ [26]. HRAG ορίστηκε ως παν-γαστρίτιδα (παρόμοια φλεγμονώδη αποτελέσματα σε άντρο και corpus), σώμα-κυρίαρχο γαστρίτιδα με ή χωρίς την παρουσία γαστρικού ατροφία, και IM είτε σε άντρο ή του σώματος του στομάχου [27].

Η. pylori

κατάσταση προσδιορίστηκε με δοκιμή για την αντι

H. pylori

αντισωμάτων IgG σε ορούς. Η ιστολογική υποτύπου του GC διεξήχθη σύμφωνα με την κατάταξη Lauren στην εντερική και διάχυτη-τύπους [28].

εξαγωγή DNA και του γονότυπου

Το γονιδιακό DNA από το γερμανικό όμιλο εκχυλίζεται από μονοπύρηνα κύτταρα περιφερικού αίματος χρησιμοποιώντας το κιτ αίματος QIAamp DNA (Qiagen, Hilden, Germany) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Γονιδιακού DNA από δείγματα της Λιθουανίας και της Λετονίας ομάδες εκχυλίζεται χρησιμοποιώντας μέθοδο εκχύλισης φαινόλης-χλωροφορμίου από μονοπύρηνα κύτταρα περιφερικού αίματος. δείγματα DNA φυλάχθηκαν στους -20 ° C μέχρι την ανάλυση. SNPs του

miR-27a

C & gt? G (rs895819),

miR-146a

C & gt? G (rs2910164),

miR-196a-2

C & gt? T (rs11614913 ),

miR-492

C & gt? G (rs2289030) και

miR-608

C & gt? G (rs4919510) ήταν ο γονότυπος χρησιμοποιώντας προσχεδιασμένες δοκιμασίες TaqMan® με 7500 ™ σε πραγματικό χρόνο ανακυκλωτή, σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή (Life Technologies, CA, USA). αναθέσεις γονότυπο επιβεβαιώθηκαν με το χέρι από τον οπτικό έλεγχο με το λογισμικό SDS 2.0.5 συμβατό με το σύστημα TaqMan®.

γονοτυπικός έλεγχος ποιότητας

διαδικασίες ποιοτικού ελέγχου εφαρμόστηκαν σε όλη του γονότυπου των δειγμάτων. Μετά γονοτυπική, επιλέχθηκαν περίπου 10% των δειγμάτων σε κάθε ομάδα γονότυπου για επαναλαμβανόμενη ανάλυση με ποσοστό 100% συμφωνία. Αμφίβολη δείγματα είχαν τριπλή επαναλαμβανόμενη ανάλυση. Όλα τα μέρη που εμπλέκονται στην γονοτυπική δεν γνώριζαν την υπόθεση ή τον έλεγχο κατάστασης των δειγμάτων. Τα δείγματα που απέτυχαν να γονότυπο καταγράφηκαν ως απροσδιόριστο

Η στατιστική ανάλυση

Όλα τα άτομα ταξινομήθηκαν σε τρεις ομάδες μελέτης:. Ελέγχους (n = 351), HRAG (n = 281), GC (n = 363). Ηλικία εμφανίζεται ως μέσες τιμές και τυπικές αποκλίσεις, και συγκρίθηκε με χρήση ANOVA και t-test unpaired Student. Κατηγορικά δεδομένα (π.χ. φύλο,

H pylori λοίμωξη

, ιστολογικών υποτύπων GC, την κατανομή των γονότυπων ή αλληλόμορφα.) Παρουσιάζονται ως συχνότητες? συγκρίσεις έγιναν με τη χρήση του Chi-square τεστ.

την ποιοτική αξιολόγηση και στατιστική ανάλυση των δεδομένων γονοτυπική πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας plink έκδοση λογισμικού 1.07 [29]. Τα άτομα με περισσότερο από το 10% λείπει γονότυπους και SNPs με ένα τηλεφώνημα-ποσοστό κάτω του 90% ή απόκλιση από Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) στους ελέγχους (

P

& lt? 0,05) αποκλείστηκαν από περαιτέρω ανάλυση. Το μέσο επιτόκιο του γονότυπου σε όλα τα δείγματα ήταν 99,6%. Οι διαφορές στις συχνότητες αλληλόμορφο μεταξύ των περιπτώσεων και οι έλεγχοι υπολογίστηκαν στο συνδυασμό της Γερμανίας, της Λιθουανίας και της Λετονίας δείγμα της μελέτης, χρησιμοποιώντας τη δοκιμή Breslow-Day για ετερογένεια της ΕΑΠ. Μόνο ένας SNP (

miR-608

C & gt? G rs4919510) έδειξε ετερογένεια των ΕΑΠ μεταξύ των τριών ομάδων μελέτης GC (

P

BD & lt? 0,05) και, ως εκ τούτου, η χώρα γέννηση συμπεριλήφθηκε ως συμμεταβλητή σε περαιτέρω ανάλυση. Σύνδεσης μεταξύ HRAG και GC με τους πολυμορφισμούς του γονιδίου υπολογίστηκε χρησιμοποιώντας ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης με προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο και τη χώρα γέννησης με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (CI). Οι σχετικοί κίνδυνοι για μεταλλάξεις μελετήθηκαν χρησιμοποιώντας υποτελούς και κυρίαρχο μοντέλο που οδήγησε σε μια σύγκριση μεταξύ άγριου τύπου + ετερόζυγο εναντίον ομόζυγο και άγριου τύπου

vs.

Ετερόζυγο + ομόζυγο, αντίστοιχα. Για την προσαρμογή για πολλαπλές δοκιμές θα υπολογίζεται ένα διορθωμένο όριο σημαντικότητας α = 0.01 (0.05 /5).

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των θεμάτων

Τα χαρακτηριστικά του ελέγχου, GC και οι ομάδες HRAG παρουσιάζονται στον πίνακα 1. σύμφωνα με την ηλικία της πραγματικής ζωής, θέματα διέφερε σημαντικά ανάλογα με την ηλικία και την κατανομή του φύλου μεταξύ των ομάδων. Όπως ήταν αναμενόμενο, τα αρσενικά αντιπροσώπευε 63,6% στην ομάδα GC, ενώ στις ομάδες ελέγχου και HRAG αυτό το φύλο αποτελούσε 26.8% και 37.7%, αντίστοιχα. Οι μάρτυρες ήταν σημαντικά νεότεροι από ομάδα HRAG (3 έτη) και την ομάδα GC (5 έτη). 52,6% των ασθενών που ήταν θετικοί για

H. pylori

στην ομάδα GC, ωστόσο, σε περίπου 27% των ατόμων στην ομάδα GC

H. δεν θα μπορούσε να επιτευχθεί pylori

κατάσταση IgG. Πάνω από 47% των ατόμων στην ομάδα ελέγχου και 42,7% στην ομάδα HRAG ήταν

H. pylori

θετική. Η ιστολογική κατάταξη για τις διάχυτες και εντερικό GC τύπους ανακτήθηκε για το 62,0% των ασθενών GC (Πίνακας 1).

Η

Σύλλογοι των miRNA SNPs και τον κίνδυνο GC και HRAG

διανομής γονότυπου για όλους πέντε πολυμορφισμοί στη μελέτη ήταν παρόμοια με εκείνα που αναμένονται για Hardy-Weinberg ισορροπίας: rs895819 (p = 0.94)? rs2910164 (ρ = 0,44)? rs11614913 (ρ = 0,95)? rs2289030 (ρ = 0,44)? rs4919510 (p = 0.39). Γονότυπος και αλληλόμορφου κατανομές για

miR-27a

C & gt? G (rs895819),

miR-146a

C & gt? G (rs2910164),

miR-196a-2

C & gt? T (rs11614913),

miR-492

C & gt? G (rs2289030) και

miR-608

C & gt? πολυμορφισμοί (rs4919510) του γονιδίου G σε GC και ομάδες μελέτης HRAG παρουσιάζονται στον πίνακα 2. δεν σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν για τις ασθένειες των υπό μελέτη μετά από διόρθωση για πολλαπλές δοκιμές. Παρατηρήσαμε μια τάση για

miR-196a-2

CT γονότυπο να σχετίζεται με υψηλότερο κίνδυνο GC σε σύγκριση με CC γονότυπο, ωστόσο, η διαφορά δεν έφθασε το αναπροσαρμοσμένο όριο σημαντικότητας (Ή – 1,46, 95% CI 01/03 έως 02/07,

P

= 0,032).

MiR-608

GG γονότυπο ήταν οριακά σχετίζεται με υψηλότερο κίνδυνο GC σε σύγκριση με CC γονότυπο (Ή – 2.34, 95% CI 01/08 έως 05/04,

P

= 0,029). Μια παρόμοια τάση παρατηρήθηκε σε ένα υπολειπόμενο πρότυπο για

miR-608

, όπου CC + CG vs σύγκριση GG γονότυπο οδήγησε σε μια Ή – 2,44 (95% CI 1.14 – 5.22), (

P

= 0.021).

Η

Σύλλογοι των miRNA SNPs και του κινδύνου των εντερικών και διάχυτη τύπου GC

miR-27α

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

και

miR-608

ενώσεις SNP δοκιμάστηκαν με δύο ιστολογικών τύπων GC (διάχυτη ή εντερική τύπου GC). Οι γονότυπος και οι συχνότητες των αλληλομόρφων ομάδες μελέτης παρουσιάζονται στον Πίνακα 3. Κυρίαρχο μοντέλο για

miR-27a

έδειξαν μια τάση για αλληλόμορφο Τ εναντίον C να συνδέεται με υψηλότερο κίνδυνο διάχυσης τύπου GC (Ή – 2.07 , 95% CI 1,13 έως 3,79,

P

= 0,018).

MiR-196-Α2

SNP έδειξαν μια τάση προς μειωμένο κίνδυνο εντερικών τύπου GC στο υπολειπόμενο μοντέλο (CC + CT έναντι ΤΤ), ωστόσο, η ισχύς ένωση δεν ήταν στατιστικά σημαντική (OR – 0,47, 95 % CI 0,20 έως 1,08,

P

= 0.077). Παρόμοια παρατήρηση έγινε σε ένα κυρίαρχο μοντέλο για

miR-492

SNP (Ή – 1,95, 95% CI 1,01 – 3,75), όπου GG εναντίον σύγκριση GC οδήγησε σε αυξημένο κίνδυνο διάχυτης τύπου GC, ωστόσο η

P

αξία δεν έφτασε απαιτούμενο επίπεδο σημαντικότητας (

P

= 0,046). Όλες οι άλλες συγκρίσεις μεταξύ ελέγχου και διάχυτη ή ομάδες GC εντερικού τύπου δεν αποκάλυψε σημαντικές ενώσεις ή τάσεις για πέντε SNPs των miRNAs.

Η

Συζήτηση

Στην παρούσα μελέτη πραγματοποιήθηκε μια ανάλυση του γονότυπου για

miR-27a

(rs895819),

miR-146a

(rs2910164),

miR-196a-2

(rs11614913),

miR-492

(rs2289030) και

miR-608

(rs4919510) πολυμορφισμών του γονιδίου σε μια μελέτη ελέγχου υπόθεση συμπεριλαμβανομένων 351 έλεγχοι, 281 HRAG και 363 ασθενείς GC από τρεις ευρωπαϊκές ομάδες μελέτης. Αυτές οι πολυμορφισμοί έχουν συσχετιστεί με τον κίνδυνο της GC ή συνολικών κινδύνων του καρκίνου? Ωστόσο, ανέφερε δεδομένων είναι εν μέρει αντικρουόμενες ή βασίζονται σε λίγες μόνο μελέτες που σχετίζονται με ασιατικές ομάδες. Παρά τις κάποιες μικρές διαφορές, τα αποτελέσματά μας δεν υποστηρίζουν τη σχέση μεταξύ

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

ΜΙΚ 492

και

miR-608

πολυμορφισμών των γονιδίων και η παρουσία του GC ή HRAG. Επιπλέον, δεν θα μπορούσαμε να βρούμε μια συσχέτιση μεταξύ SNPs των miRNAs και την παρουσία διαφορετικών ιστολογικών υποτύπων του GC. Δεδομένου ότι miRNAs έχουν αποδειχθεί ότι έχουν βαθιά επίδραση στο γαστρικό καρκινογένεση [8], περιμέναμε ότι αυτές οι πολυμορφισμοί θα μπορούσε να τροποποιήσει τον κίνδυνο GC ή προδρόμων της. Για την καλύτερη γνώση μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη που διερεύνησε τις συσχετίσεις μεταξύ αυτών των πολυμορφισμών miRNA και τον κίνδυνο της GC ή HRAG σε άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής. Περισσότερο από αυτό, SNPs του

miR-492

(rs2289030) και

miR-608

(rs4919510) δεν έχουν μελετηθεί σε σχέση με GC ή προκαρκινικές γαστρικό συνθήκες στο παρελθόν.

πολυμορφισμό του γονιδίου του miR-27a είναι σήμερα ένα από τα πιο μελετημένα SNPs σε μελέτες ασθενών-μαρτύρων που σχετίζονται με τον καρκίνο. Περιμέναμε ότι οι μεταφορείς της C αλληλόμορφο για

miR-27a

SNP θα μπορούσαν να έχουν μειωμένο κίνδυνο GC όπως έχει προταθεί από ορισμένους ερευνητικές ομάδες. Μια κινεζική μελέτη ασθενών-μαρτύρων, συμπεριλαμβανομένων 311 ασθενών GC και 425 του καρκίνου χωρίς ελέγχους διαπιστώθηκε ότι έλασσον αλληλόμορφο C του rs895819 στο

miR-27a

μείωσε σημαντικά τον κίνδυνο της GC με ή – 0,77 [30]. Μια άλλη μελέτη έδειξε σημαντικά αυξημένο κίνδυνο GC (Ή – 1,48) για

miR-27a

SNP και την περαιτέρω λειτουργική αναλύσεις έδειξαν ότι παραλλαγή γονότυπους μπορεί να ευθύνονται για την αυξημένη

miR-27a επίπεδα

και μειωμένη

ZBTB10

επίπεδα mRNA [16]. Σε αντίθεση, μια μελέτη συμπεριλαμβανομένων 2.380 συμμετεχόντων με διάφορες αλλοιώσεις του στομάχου δεν βρήκε αυξημένο κίνδυνο γαστρικού IM ή δυσπλασία για rs895819 [12]. Μια μετα-ανάλυση που συνοψίζει τα συμπεράσματα των διαφόρων μελετών ασθενών-μαρτύρων έδειξε ότι rs895819 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου στα λευκά, αλλά όχι σε Ασιάτες [31]. Τα αποτελέσματα της μελέτης μας δεν υποστηρίζουν την πιθανή προστατευτική επίδραση της C αλληλόμορφο για ανάπτυξη GC στην ευρωπαϊκή υποκείμενα. Η μελέτη μας είναι η πρώτη η οποία αξιολόγησε το ρόλο του

miR-27a

rs895819 στο GC και HRAG σε άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής, όμως, δεν υπάρχουν σημαντικές ενώσεις έχουν παρατηρηθεί.

Λαμβάνοντας υπόψη τα υπάρχοντα στοιχεία σχετικά με

miR-146a

SNP (rs2910164) για την ανάπτυξη του καρκίνου θέλαμε να εκτιμηθεί η πιθανή συσχέτιση στην ομάδα μας των ασθενών με GC και HRAG. Song et al. διαπίστωσε ότι οι μεταφορείς ΚΕ του rs2910164 είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο ΔΥ (ή – 1,42) και δυσπλασία (Ή – 1,54) σε σύγκριση με τους μεταφορείς GG [12]. Μια παρόμοια παρατήρηση έγινε σε μια άλλη μελέτη όπου

παρατηρήθηκε συνδυασμένο αποτέλεσμα των miR-146a

(rs2910164) G /G και TLR4 SNP για τον αυξημένο κίνδυνο σοβαρής AG μεταξύ των ιαπωνικών ατόμων [18]. Ένα έγγραφο από Okubo et al. [32] ανέφεραν ότι η μεταφορά του rs2910164 CC γονότυπο συσχετίστηκε με σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο GC, σε σύγκριση με άτομα μη-καρκίνου (OR – 1.30). Μια μετα-ανάλυση από τον Wang et al. [33] στο

miR-146a

rs2910164, συμπεριλαμβανομένων 19 μελέτες ασθενών-μαρτύρων διαπιστώθηκε ότι rs2910164 συνδεόταν με αυξημένη ευαισθησία του καρκίνου σε Ασιάτες με συνολική Ή – 1,18, αλλά η ίδια μετα-ανάλυση καλεί σε περαιτέρω καλά σχεδιασμένες μελέτες με μεγάλο μέγεθος του δείγματος για την περαιτέρω ταυτοποίηση των κινδύνων. Τα αποτελέσματα της μελέτης ασθενών-μαρτύρων μας δεν αποκαλύπτουν μια σημαντική συσχέτιση μεταξύ rs2910164 και του κινδύνου GC ή HRAG

MiR-196a-2

C & gt?. Τ SNP (rs11614913) είναι ένα της καλύτερα μελετημένα miRNA SNPs σε σχέση με διάφορες κακοήθειες. Μια έκθεση από τον Wang et al. (2013) έδειξε ότι το CC γονότυπο συσχετίστηκε με σημαντικά μειωμένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (OR – 0,78) σε σύγκριση με τα CT και τους γονότυπους ΤΤ σε μια μελέτη μεγάλου περίπτωση ελέγχου [33]. Μια μετα-ανάλυση από τον Wang et al. (2013) διαπίστωσε σημαντικά αυξημένο κίνδυνο GC, αλλά η συσχέτιση παρατηρήθηκε μόνο σε σύγκριση ομοζυγώτες. Αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι rs11614913 πολυμορφισμός συνδέεται σημαντικά με συνολικό κίνδυνο εμφάνισης γαστρεντερικών καρκίνων [34]. Okubo et al. [32] δεν κατάφερε να βρει τον σύνδεσμο για αυτό το SNP και GC, ωστόσο, στην rs11614913 μελέτη τους συνδέθηκε με το βαθμό του

H. pylori

επαγόμενη διείσδυση μονοπύρηνων κυττάρων. Είναι ενδιαφέρον, μια άλλη μετα-ανάλυση για το ίδιο SNP δεν καθορίζουν τη σχέση μεταξύ rs11614913 και ανάπτυξης GC [35]. Τα αποτελέσματα της μελέτης μας είναι σύμφωνες με την ολοκλήρωση του τελευταίου μετα-ανάλυση, καθώς δεν παρατηρούμε σημαντική συσχέτιση μεταξύ SNP του

miR-196a-2

και GC κίνδυνο.

Ο πολυμορφισμός του

miR-492

(rs2289030) υποτίθεται να μεσολαβήσει κίνδυνο καρκίνου, αλλά τα δεδομένα σχετικά με τις πιθανές ενώσεις για αυτό το SNP και του κινδύνου καρκίνου είναι ακόμα λιγοστές. Μια μελέτη από τον Yoon et al. (2012) δεν κατάφερε να βρει τη σύνδεση μεταξύ SNP του

miR-492

και τον κίνδυνο ή την επιβίωση σε ασθενείς με μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα [36]. Μια άλλη μελέτη για καρκίνο του παχέος εντέρου έδειξε ότι η επιβίωση χωρίς εξέλιξη των ασθενών με το συνδυασμό

miR-492

CG και GG γονότυπο ήταν σημαντικά χειρότερη από εκείνη των ασθενών με το

miR-492

CC γονότυπο [13]. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι η rs2289030 του

miR-492

δεν συνδεόταν με την παρουσία του GC ή HRAG. Για την καλύτερη δυνατή γνώση μας αυτή είναι η πρώτη μελέτη που εξετάζει τη σχέση μεταξύ του

miR-492

SNP και προκαρκινικές γαστρικό συνθήκες ή GC και, ως εκ τούτου, καμία σύγκριση των δεδομένων μας, μπορεί να γίνει.

SNP της

miR-608

(rs4919510) δεν έχει μελετηθεί σε σχέση με GC κινδύνους στο παρελθόν. Η μελέτη μας είναι η πρώτη που αναφέρει μηδενική συσχέτιση μεταξύ αυτού του πολυμορφισμού και του κινδύνου GC ή προκαρκινικές γαστρικό συνθήκες. Σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος rs4919510 ήταν σημαντικά συνδεδεμένη με υποτροπής του καρκίνου και του θανάτου [37]. Μια άλλη μελέτη ασθενών-μαρτύρων σε ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου δεν βρήκε συσχέτιση με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, αλλά τα αποτελέσματά τους έδειξαν ότι GG γονότυπος σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο θανάτου σε λευκό πληθυσμό και μειωμένο κίνδυνο θανάτου σε Αφροαμερικανών [38]. Περαιτέρω μεγαλύτερες μελέτες κλίμακας θα μπορούσε να καθορίσει το ρόλο

miR-608

rs4919510 SNP στο γαστρικό και άλλες κακοήθειες.

Εντερική και διάχυτη-τύπους GC έχει αποδειχθεί ότι έχουν διαφορετικές παθογενετικών οδών [3]. Μερικές μελέτες έχουν διαπιστώσει ότι οι πολυμορφισμοί miRNA μπορεί να έχει διαφορετικά αποτελέσματα για ιστολογική υποτύπους του GC. Μετά διαστρωμάτωσης των ασθενών στην εντερική και διάχυτη τύπου ομάδων GC,

miR-499

rs3746444 φάνηκε να επηρεάζει τον κίνδυνο της διάχυτης τύπου GC στην κορεατική πληθυσμού [21]. Αν και ο αριθμός των ατόμων εντός εντερικών και ομάδες GC διάχυτου τύπου δεν ήταν πολύ υψηλή στη μελέτη μας, διεξήχθη ανάλυση συγκρίνοντας αυτές τις δύο διακριτές ιστολογικών τύπων GC. Συνολικά,

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

και

miR-608

SNPs δεν συνδέεται με την παρουσία διαφόρων ιστολογικών υπότυπων του GC. Παρά το γεγονός ότι ορισμένες τάσεις που περιγράφονται στην ενότητα αποτελέσματα έχουν παρατηρηθεί μεταξύ του ιστολογική υποομάδα του GC, τις διαφορές στην γονότυπο και αλληλόμορφο συχνότητες δεν φθάνουν τα απαιτούμενα επίπεδα σημαντικότητας.

Τα αποτελέσματα της μελέτης μας υποστηρίζουν σαφώς τη σημασία της προσεκτικής αξιολόγησης των πολυμορφισμών του γονιδίου σε διαφορετικές εθνοτικές ομάδες. Προηγουμένως πρότεινε miRNA που σχετίζονται με SNPs δεν έδειξαν σημαντικές διαφορές που σχετίζονται με GC σε ευρωπαϊκό πληθυσμό μας. Παρ ‘όλα αυτά, μπορούμε να παραδεχτούμε ότι υπάρχουν αρκετοί περιορισμοί που σχετίζονται με το σχεδιασμό της μελέτης μας. Υπήρχαν διαφορές κατανομή μεταξύ των φύλων μεταξύ GC, HRAG και ομάδες ελέγχου? Ωστόσο, κατά την εκτέλεση στατιστικής ανάλυσης που περιλαμβάνεται μεταξύ των φύλων ως συμμεταβλητή, ελαχιστοποιώντας έτσι την πιθανή επίδραση του φύλου για την έκβαση των αποτελεσμάτων μας. Εδώ σε αυτή τη μελέτη επικεντρώθηκε σε ιστολογικές μεταβολές παρά την παρουσία του

H. πυλωρού

? Ως εκ τούτου, πρόσθετες δοκιμές εκτός από αντισώματα IgG ορού για την ανίχνευση αυτό το βακτήριο δεν είχαν εφαρμοστεί. Επιπλέον, είναι γνωστό ότι η χρόνια ατροφική γαστρίτιδα προκαλείται από

H. pylori

λοίμωξη. Εμείς δεν προσαρμόσει ή για

H. pylori

αντισώματα IgG,

CagA

ή

VacA

κατάσταση, επειδή η πληροφορία αυτή δεν ήταν διαθέσιμη για όλα τα θέματα. Εμείς δεν θα μπορούσε να εκτελέσει την ανάλυση σύνδεσης για SNPs των miRNAs σε σχέση με την επιβίωση των ασθενών με GC, καθώς οι πληροφορίες ήταν διαθέσιμες μόνο για ένα μικρό ποσοστό των ατόμων. Λόγω τον ίδιο λόγο επίσης, δεν εκτελέσει την ανάλυση σύμφωνα με την ανατομική θέση του στο στομάχι (εγγύς εναντίον άπω). Σε αυτή τη μελέτη πραγματοποιήθηκε αποκλειστικά ανάλυση πολυμορφισμού γονιδίου χωρίς την αντιμετώπιση των διαφορών έκφρασης miRNA σε καρκινικούς και μη καρκινικούς ιστούς και, ως εκ τούτου, δεν μπορούμε να υποθέσουμε εάν αυτές οι πολυμορφισμοί μπορούσε να έχει ένα λειτουργικό ρόλο. Περαιτέρω μελέτες θα πρέπει να αξιολογήσει το ρόλο των SNPs για τα επίπεδα miRNA στον ιστό GC και αξιολόγηση των πιθανών γονιδίων στόχων σε λειτουργικές μελέτες. Ο αριθμός των ατόμων εντός των υποομάδων στη μελέτη μας εντερικής και διάχυτη τύπου ομάδων GC είναι σχετικά μικρό και θα μπορούσε να underpowered για την ανίχνευση ειδικών ενώσεων. Βρήκαμε κάποιες διαφορές για το miR-196a-2 και miR-608 SNPs μεταξύ των ομάδων με το

P

& lt? 0,05? Ωστόσο, πιστεύουμε ότι δεν μπορούμε να αναφέρω μια σημαντική συσχέτιση, αφού δεν έφτασε μας προσαρμόζεται

P

αξία. Οι πολλαπλές συγκρίσεις για τις δοκιμές γενετικής σύνδεσης έχουν εφαρμοστεί στο παρόν έγγραφο και πιστεύουμε ότι θα πρέπει να χρησιμοποιήσετε το προσαρμοσμένο

P

αξία για τη σύνταξη των συμπερασμάτων.

Συμπεράσματα

δείχνει μελέτη μας ότι οι πολυμορφισμοί του γονιδίου του

miR-27a

,

miR-146a

,

miR-196a-2

,

miR-492

και

miR -608

δεν συνδέονται με τον κίνδυνο της GC και HRAG σε άτομα ευρωπαϊκής καταγωγής. Αυτοί οι SNPs δεν εμφανίζονται ως πιθανοί βιοδείκτες για την αναγνώριση ατόμων με αυξημένο κίνδυνο για GC.

Ευχαριστίες

Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε Λίνα Baldauskiene για την εξαιρετική βοήθεια με πειράματα προσδιορισμού του γονότυπου στο εργαστήριο.