Αφηρημένο

αταξία-τηλαγγειεκτασία μεταλλαγμένα (ATM) είναι ένα Ser /Thr πρωτεϊνική κινάση που παίζει κρίσιμο ρόλο στην DNA βλάβη που προκαλείται από σηματοδότηση και την έναρξη της σηματοδότησης σημείου ελέγχου του κυτταρικού κύκλου σε απόκριση σε παράγοντες που βλάπτουν το DNA, όπως ιονίζουσα ακτινοβολία. Έχουμε αναφέρει προηγουμένως την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ με ανοσοϊστοχημεία (IHC) σε 16% του ανθρώπινου γαστρικού καρκίνου (GC) ιστού. Υποθέσαμε ότι

ATM

γονιδιακές μεταλλάξεις ιντρόνιο στόχο μικροδορυφόρων αστάθεια (MSI) προκαλεί απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ σε ένα υποσύνολο του GC. Μελετήσαμε μεταλλάξεις μονονουκλεοτιδίου στο ιντρόνιο του

ATM

γονίδιο, ATM IHC και MSI στο GC. Δέκα ανθρώπινη γαστρικού καρκίνου κυτταρικές γραμμές μελετήθηκαν για την

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη σε εσώνια, RT-PCR, απευθείας αλληλούχιση, και ανοσοϊστοχημεία. ιστούς GC 839 ασθενείς αναλύθηκαν για MSI και ΑΤΜ IHC. Μεταξύ αυτών, 604 περιπτώσεις αναλύθηκαν για την

ATM

μεταλλάξεις σε εσώνια προηγούμενες εξόνιο 6, το εξόνιο 10 και εξόνιο 20. Δύο ανθρώπινες κυτταρικές σειρές GC (SNU-1 και -638) έδειξε

ATM

ιντρόνιο μεταλλάξεις, διαγραφή σε RT-PCR και άμεση αλληλούχιση, και απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ με IHC. Οι συχνότητες των

ATM

μετάλλαξη, MSI και ΑΤΜ απώλεια πρωτεΐνης ήταν 12,9% (78/604), 9,2% (81/882) και 15,2% (134/839), αντίστοιχα. Ανάλυση των ενώσεων μεταξύ MSI, γονιδιακή μετάλλαξη ATM, και η απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ αποκάλυψε πολύ συνυπάρχουσα

ATM

γονίδιο μετατροπές και MSI.

ATM

μετάλλαξη ιντρόνιο και την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ανιχνεύθηκαν στο 69,3% (52/75) και 53,3% (40/75) των MSI θετική GC. MSI θετικότητα και η απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ήταν παρούσα σε 68.4% (52/76) και 48,7% (37/76) των GC με μετάλλαξη ιντρόνιο ΑΤΜ.

ATM

μετάλλαξη και η πρωτεΐνη ΑΤΜ απώλεια είχε τα χαρακτηριστικά του γήρατος, περιφερική θέση του όγκου, το μεγάλο μέγεθος του όγκου και ιστολογική εντερικό τύπο. Η μελέτη μας μπορεί να ερμηνευθεί ως ότι

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη στο ιντρόνιο θα μπορούσε να στοχεύσει η MSI και να οδηγήσει σε απώλεια της πρωτεΐνης ΑΤΜ σε μια επιλεγμένη ομάδα GC.

Παράθεση: Kim HS, Choi SI, Min HL, Κιμ MA, Kim WH (2013) Μετάλλαξη σε Ιντρονική επαναλήψεις του γονιδίου αταξίας-Τελαγγειεκτασίας Μεταλλαγμένα (ATM) και ΑΤΜ Πρωτεΐνη Απώλεια σε πρωτοπαθή καρκίνο του γαστρικού με αστάθεια μικροδορυφόρου . PLoS ONE 8 (12): e82769. doi: 10.1371 /journal.pone.0082769

Επιμέλεια: Hoguen Kim, Yonsei University College of Medicine, Δημοκρατίας της Κορέας

Ελήφθη: 21 Ιουλίου, 2013? Αποδεκτές: 27 του Οκτώβρη 2013? Δημοσιεύθηκε: 6 Δεκ 2013

Copyright: © 2013 Kim et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η έρευνα υποστηρίχθηκε από τη βασική επιστήμη ερευνητικό πρόγραμμα μέσω του Εθνικού Ιδρύματος Ερευνών της Κορέας (NRF), που χρηματοδοτείται από το Υπουργείο Επιστημών, των ΤΠΕ & amp? Μελλοντικό σχεδιασμό (NRF-2012R1A1A2004648). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

αταξία-τηλαγγειεκτασία μεταλλαγμένη (ATM) γονίδιο είναι ένα συστατικό της απόκρισης βλάβη του DNA (DDR) και ενεργοποιείται με διπλό διαλείμματα κλώνου DNA (DSBs), και σηματοδοτεί το σημείο ελέγχου του κυτταρικού κύκλου για να επιβραδύνει την διέλευση των κυττάρων μέσα από τον κύκλο για να διευκολύνει την επιδιόρθωση του DNA. Το γονίδιο εντοπίζεται στο χρωμόσωμα 11q22-23. Η

ATM

γονίδιο είναι πολύ μεγάλο, που εκτείνονται σε μια γονιδιωματική περιοχή 150 kb, που αποτελείται από 66 εξώνια με μια αλληλουχία κωδικοποίησης του 91668 bp.

ATM εμπλέκεται στις απαντήσεις σε DSBs που συμβαίνουν φυσιολογικά σε εξειδικευμένους τύπους κυττάρων, όπως γεννητικά κύτταρα και λεμφοκύτταρα. Η πρωτεΐνη ΑΤΜ βοηθά τα κύτταρα στην αναγνώριση καταστραφεί ή φθαρεί σκέλη του DNA. Η πρωτεΐνη ΑΤΜ συντονίζει την επιδιόρθωση του DNA ενεργοποιώντας ένζυμα που καθορίζουν τα σπασμένα σκέλη. Αποτελεσματική επισκευή των κατεστραμμένων κλώνων του DNA βοηθά στη διατήρηση της σταθερότητας των γενετικών πληροφοριών του κυττάρου [1].

απώλεια

ATM παρατηρήθηκε στο 16% των ιστών του ανθρώπου GC σε μια μεγάλη μελέτη κοόρτης [2]. Η απενεργοποίηση του

ATM

γονίδιο μπορεί να είναι ένα συχνό γεγονός στην ανάπτυξη του ανθρώπινου γαστρικού καρκίνου (GC)? Ωστόσο, τα γεγονότα που σχετίζονται με την απώλεια του

ATM

έκφραση σε GC δεν θα μπορούσε να εξηγηθεί από το χαμηλό επιπολασμό του

ATM

μετάλλαξη. Οι περισσότεροι από τους

ATM

μεταλλάξεις εντοπίστηκαν σε πρωτογενείς κυτταρικές σειρές GC και ιστών GC ήταν σημειακές μεταλλάξεις [3]. σύστημα

Η επισκευή αναντιστοιχία DNA (MMR) διορθώνει τα λάθη που μπορεί να προκύψουν κατά τη διάρκεια της αντιγραφής του DNA, ενώ ο ομόλογος ανασυνδυασμός και μη-ομόλογο τέλος ενώνει εμπλέκονται στην επιδιόρθωση του DNA DSB. Μεταλλάξεις σε γονίδια επιδιόρθωσης του DNA DSB όπως

ATM, MRE11, RAD50, NBS1

και

ATR

, οι υποτεθεί ότι παίζουν ένα ρόλο στην ανάπτυξη του γαστρεντερικού κακοηθειών με μία διαταραγμένη MMR λειτουργία. Σε όγκους παχέος εντέρου με μια διαταραγμένη σύστημα MMR, μεταλλάξεις εσωνίων επαναλήψεις μονονουκλεοτιδίου σε ποσοστό

ATM

και

MRE11

βρέθηκαν να οδηγήσει σε παρεκκλίνουσα ματίσματος, ακολουθούμενη από μειωμένη έκφραση της πρωτεΐνης άγριου-τύπου [4 ].

Περίπου το 10% των GC συνδέεται με μικροδορυφόρων αστάθεια (MSI). MSI αναφέρεται σε μεταβολές στον αριθμό των επαναλήψεων νουκλεοτιδίου σε μικροδορυφορικών περιοχών που βρίσκονται εντός των περιοχών κωδικοποίησης των γονιδίων, και οδηγεί σε μεταλλάξεις μετατόπισης πλαισίου. MSI έχει εντοπιστεί στην κωδικοποίηση περιοχές γνωστών γονιδίων στόχων, συμπεριλαμβανομένων πρωτεϊνών

TGF-βRII, IGFIIR, ΒΑΧ

[5-7], και

hRAD50

γονίδια [8]. Η

hRAD50, BLM

, και

BRACA1

γονίδια έχουν πολυ (Α) mononucleotide επαναλαμβάνει εντός των περιοχών κωδικοποίησης, το

hMSH6

έχει (C) 8 οδού, το

NBS1

έχει την (Α) 7 οδό, και το

ATM

έχει την (Τ) 7 οδού. Μεταλλάξεις μετατόπισης πλαισίου αυτών των γονιδίων με μεταβλητές συχνότητες έχουν αναφερθεί προηγουμένως [9-11].

Εκτός από την πληθώρα των μεταλλάξεων που συσσωρεύεται στο ουδέτερο μικροδορυφορικών ακολουθιών, το MSI παράγει επίσης μεταλλάξεις σε γονίδια του καρκίνου, δηλαδή, σε αυτά τα γονίδια που διαδραματίζουν ενεργό ρόλο στη διαδικασία πολλαπλών βημάτων της καρκινογένεσης. Αν και επαναλαμβανόμενες αλληλουχίες στην κωδικεύουσα περιοχή των γονιδίων είναι μικρότερο από το τυπικό loci μικροδορυφορικών χρησιμοποιούνται για χαρτογράφηση γονιδίου, η τάση τους να υποστούν αυθόρμητη σφάλματα ολίσθηση κατά τη διάρκεια της αντιγραφής του εξακολουθεί να είναι υψηλότερη από εκείνη των μη επαναληπτική αλληλουχιών. Μεταλλάξεις ενός εσωνίου επανάληψη έχουν αναφερθεί ότι προκαλούν διαταραχή της έκφρασης του

MRE11

γονίδιο [12,13]. Πολυπυριμιδινικής επανάληψη μεταλλάξεις στο

ATM

γονίδιο μπορεί να διαταράξει τη σωστή μάτισμα του mRNA [14]. Ωστόσο, δεν υπάρχει καμία απόδειξη ότι εισαγωγής /διαγραφής που εμφανίζονται σε αυτές τις μη-κωδικοποιητικές αλληλουχίες μονονουκλεοτιδίου επηρεάζει τη φυσιολογική λειτουργία της πρωτεΐνης ΑΤΜ σε MSI σχετίζονται GC. Σε ανθρώπινο ιστό GC με MSI, τη συχνότητα των

ATM

μετάλλαξη και η συνεργασία με την απώλεια της λειτουργίας της πρωτεΐνης δεν είναι απόλυτα κατανοητό. Έχουμε υποθέσει ότι οι αλλαγές μονονουκλεοτίδης οδού στο ιντρόνιο του

ATM

γονιδίου σχετίζεται με απώλεια της λειτουργίας της πρωτεΐνης ΑΤΜ σε GC με MSI.

Ερευνήσαμε μεταλλάξεις στο ιντρονική (T) 15 στο εσωτερικό της

ATM

παρεμβαλλόμενη αλληλουχία γονιδίου (IVS) που προηγείται εξόνιο 6, οι οποίες οδηγούν σε διαγραφή 22 bp του εξωνίου 6 σε ανθρώπινα κυτταρικές γραμμές γαστρικού καρκίνου . Στην παρούσα μελέτη, οι μεταλλάξεις του

ATM

γονίδιο μαζί με την παρουσία του MSI εξετάστηκαν σε ανθρώπινες κυτταρικές γραμμές και GC πρωτεύοντες ιστούς GC. Τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι το

ATM

γονιδιακής μετάλλαξης εσώνιο ήταν συχνή σε GC με MSI και συσχετίστηκε με την απώλεια της λειτουργίας των πρωτεϊνών ATM.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Αυτή η αναδρομική μελέτη διεξήχθη με τη χρήση των δειγμάτων πάνω από τα ράφια μετά την παθολογική διάγνωση, και όλα τα δείγματα ανώνυμα πριν από τη μελέτη. Η αναδρομική αυτή μελέτη εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο Institutional Review του Εθνικού Πανεπιστημίου της Σεούλ Νοσοκομείο (H-1010-065-336) με παραίτηση του εν επιγνώσει συναίνεση υπό την προϋπόθεση της ανωνυμίας.

κυτταρικές γραμμές και δείγματα ιστών

Δέκα ανθρώπινη γαστρικού καρκίνου κυτταρικών γραμμών SNU-1, SNU-5, SNU-16, SNU-216, SNU-484, SNU-601, SNU- 620, SNU-638, SNU-668 και SNU-719 ελήφθησαν από την κορεατική Κυτταρική Γραμμή Τράπεζα (Σεούλ, Κορέα). Όλες οι κυτταρικές γραμμές αναπτύχθηκαν σε RPMI1640 συμπληρωμένο με 10% εμβρυϊκό βόειο ορό (FBS? Hyclone, Lorgan, UT, USA) και αντιβιοτικά (100 U /mL πενικιλλίνη G και 100 μg /mL στρεπτομυκίνη) στους 37 ° C σε υγροποιημένη 5% CO

2 θερμοκοιτίδα. Μια κυτταρική σειρά διαφανειών συστοιχία ιστού από συγκομίζονται και σταθερές κυτταρικές σειρές ανθρώπινου GC ελήφθη για ανοσοϊστοχημεία (Superbiochips, Κορέα).

φορμόλη-σταθερό, έχει εμπεδωθεί με παραφίνη δείγματα ιστών GC από 839 ασθενείς που υποβλήθηκαν σε θεραπευτική γαστρεκτομή για πρωτοβάθμια γαστρικό θεραπεία του καρκίνου μεταξύ 1

ης Ιανουαρίου 2004 και 31

ης Δεκεμβρίου 2005 στο Εθνικό Πανεπιστήμιο της Σεούλ Νοσοκομείο συλλέχθηκαν. Οι ασθενείς που συμπεριελήφθησαν 577 άνδρες και 262 γυναίκες με μέσο όρο ηλικίας 57,6 έτη (εύρος: 4 έως 87 ετών). Πληροφορίες για την τοποθεσία του όγκου ελήφθη από 835 περιπτώσεις: ανώτερο ένα τρίτο σε 109, μεσαίο τρίτο το 323, χαμηλότερο τρίτο σε 383, και ολόκληρο το στομάχι σε 20 περιπτώσεις. Με βάση την ταξινόμηση Lauren, οι καρκίνοι ήταν ιστολογικά ταξινομούνται ως εντερική τύπου 381, διάχυτη τύπου 327, μικτός τύπος σε 123, και απροσδιόριστο σε 8 περιπτώσεις. Από τις 839 περιπτώσεις, 165 ήταν νωρίς GC και 674 είχαν προχωρήσει GC. Λεμφαδένα μετάσταση ήταν παρούσα σε 531 περιπτώσεις και απουσιάζει σε 308 περιπτώσεις. Διακόσια σαράντα πέντε ασθενείς διαγνώστηκαν ως σταδίου Ι, 254 ως το στάδιο ΙΙ, 291 ως το στάδιο ΙΙΙ, και 85 ως το στάδιο IV. Επικουρική χημειοθεραπεία μετά τη χειρουργική επέμβαση πραγματοποιήθηκε σε 533 ασθενείς, το οποίο περιλαμβάνει 32 ασθενείς στο στάδιο Ι, 153 στο στάδιο ΙΙ, 260 στο στάδιο ΙΙΙ, και 82 στο στάδιο IV. Η μέση διάρκεια παρακολούθησης ήταν 49,3 μήνες (εύρος: 0-85 μήνες). Τοπική υποτροπή παρατηρήθηκε σε 185 (21,0%), μακρινή μετάσταση σε 85 (9,6%), και θάνατο από οποιαδήποτε αιτία σε 289 έξω από 882 ασθενείς (32,8%). δεδομένων ασθενούς επιβίωσης, συμπεριλαμβανομένων των ημερομηνιών και των αιτιών θανάτου, ελήφθησαν από την κορεατική Κεντρικό Αρχείο Καρκίνου, Υπουργείο Υγείας και Πρόνοιας, την Κορέα. Πρότυπο ιστοπαθολογική εξέταση περιλαμβάνεται αξιολόγηση αυτού του τύπου καρκίνου και παθολογικές στάδιο του όγκου, σύμφωνα με τα κριτήρια που καθορίζονται από την 7η έκδοση του AJCC Σταδιοποίηση Εγχειρίδιο [15].

εξαγωγή DNA και MSI αποφασιστικότητα

Ιστός όγκου δείγματα σε γυάλινες πλάκες εξετάστηκαν κάτω από ένα μικροσκόπιο φωτός. Μια περιοχή του όγκου με την οποία το ποσοστό των κυττάρων του όγκου υπερέβαινε τουλάχιστον 50% όλων των κυττάρων στην περιοχή αυτή και μια συζευγμένη περιοχή του φυσιολογικού ιστού του βλεννογόνου που δεν περιέχουν κύτταρα όγκου σημαδεύτηκαν και αποξέσεις με μια λεπίδα μαχαιριού. Η ξύνεται ιστός συλλέχθηκε σε 1,5 μικροσωληνάρια mL που περιείχε 50 μL ρυθμιστικού διαλύματος λύσης ιστού (0,5% Tween 20 [Sigma, St Louis, ΜΟ], 100 mM Tris HCl ρυθμιστικό [ρΗ 7.6], 1 mM EDTA, και 20 μg πρωτεϊνάσης Κ [ ,,,0],Sigma]). Οι σωλήνες επωάστηκαν για 24 έως 48 ώρες στους 55 ° C μέχρις ότου το περιέχουν ιστό-ρυθμιστικό λύσης έγινε σαφές. Η πρωτεϊνάση Κ απενεργοποιήθηκε με επώαση στους 95 ° C για 10 λεπτά, και η εκχύλιση DNA αποθηκεύτηκε στους -20 ° C μέχρι τη χρήση. MSI αξιολογήθηκε κατά τόπους BAT25, BAT26, D2S123, D5S346, και D17S250. Οι όγκοι που ταξινομούνται ως MSI + όταν τουλάχιστον 2 (40%) των 5 μικροδορυφορικών δεικτών συνδέθηκαν με αλληλόμορφα του αλλαγμένο μέγεθος του DNA του όγκου σε σύγκριση με το DNA από μη καρκινικό ιστό.

Ανίχνευση μεταλλάξεων του

ATM

στο ιντρόνιο μονονουκλεοτίδιο επαναλαμβάνει

PCR ενίσχυση διεξήχθη σε 10 μΙ όγκο που περιέχει 1 μλ γενωμικού DNA, 5 pmol το καθένα από τα εμπρός και αντίστροφων εκκινητών, και 5 μL Premix. Τριάντα-τρεις κύκλους PCR εκτελέστηκαν με παράμετρο κύκλος 95 ° C για 30 sec, 30 sec σε μία θερμοκρασία ανόπτησης κατάλληλες για κάθε ζεύγος εκκινητή και 65 ° C για 1 λεπτό, που ακολουθείται από 10 επέκταση λεπτά στους 72 ° C.

Διακύμανση μονονουκλεοτιδίου επανάληψης στο em> ATM

γονίδιο

Ανίχνευση έκτροπου ματίσματος σε

ATM

η

Ολικό RNA (2.5 μ§) από την ανθρώπινη γαστρικού καρκίνου κυτταρικές γραμμές παρασκευάστηκαν με ΤπζοΙ αντιδραστήριο (GIBCO-BRL) χρησιμοποιήθηκε για τη σύνθεση πρώτου κλώνου cDNA με Superscript II Reverse Transcriptase (GIBCO-BRL) και ολιγο-ά (Τ)

12-18 εκκινητή. Ένα κλάσμα του μίγματος της αντίδρασης ενισχύθηκε με PCR για να συνθέσει διάφορα τμήματα του cDNA ΑΤΜ.

ενίσχυση PCR εκτελέστηκε σε όγκο 20 μL που περιέχει 1 μΐ αντίστροφης-μεταγράφεται cDNA, 5 pmol κάθε ένα από τα εμπρός και αντίστροφους εκκινητές, και 10 μί Προμίγματα. Τριάντα-πέντε κύκλοι PCR πραγματοποιήθηκαν με παράμετρο κύκλος 95 ° C για 30 sec, 30 sec σε μία θερμοκρασία ανόπτησης κατάλληλες για κάθε ζεύγος εκκινητή και 72 ° C για 1 λεπτό, που ακολουθείται από 10 λεπτά επέκταση στους 72 ° C. Τα προϊόντα PCR ηλεκτροφορήθηκαν σε πήκτωμα αγαρόζης 2% που περιέχει βρωμιούχο αιθίδιο και κατέστησαν ορατά υπό υπεριώδες φως. β-ακτίνη χρησιμοποιήθηκε ως εσωτερικό πρότυπο.

Τρία ζεύγη εκκινητών RT-PCR προέρχονται από

ATM

αλληλουχίες (GenBank NM_000051) που χρησιμοποιήθηκαν ήταν Ρ-TGGTGCTATTTACGGAGCTG και R-TTCGAAAGTTGACAGCCAAA για την ανίχνευση μεταγραφές του εξονίου 5-7 (μέγεθος προϊόντος: 347 bp), F-TCCCTTGCAAAAGGAAGAAA και R-TACTGGTGGTCAGTGCCAAA για εξόνιο (μέγεθος προϊόντος: 504 bp) 9-11, και F-TGGAGAAGAGTACCCCTTGC και R-GATTGACTCTGCAGCCAACA για το εξόνιο 19-22 (μέγεθος προϊόντος: 415 bp ).

ανάλυση Sequencing

Ο προσδιορισμός αλληλουχίας διεξήχθη με την μέθοδο διδεοξυ τερματισμού αλυσίδας χρησιμοποιώντας κιτ αλληλούχισης DNA (Applied Biosystems) και το ΑΒΙ PRISM 310 Genetic Analyzer. Τα ενισχυμένα προϊόντα της PCR καθαρίστηκαν ενζυματικώς χρησιμοποιώντας ένα κιτ presequencing (Amersham Life Science, Cleveland, ΟΗ, USA), σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή, και στη συνέχεια αλληλουχήθηκαν απευθείας χρησιμοποιώντας τη μέθοδο τερματισμού BigDye (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Οι αντιδράσεις προσδιορισμού αλληλουχίας τρέχτηκαν σε έναν ΑΒΙ 3100 αυτοματοποιημένο αλληλουχητή (Applied Biosystems, Biosystems, Foster City, CA, USA) και τα δεδομένα που λαμβάνονται αναλύθηκαν με τη χρήση ανάλυσης αλληλουχίας DNA 3.7 λογισμικό (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Τα νέα δεδομένα που έχει κατατεθεί στην GenBank (αριθμός ένταξης: KF704396)

Η ανοσοϊστοχημεία

Εκπρόσωπος τμήματα όγκου-μπλοκ και τμήματα array κυτταρική γραμμή πάχους 4-μm αποπαραφινοποιήθηκαν και ενυδατώνεται σε βαθμολογούνται. αλκοόλ. Το αντιγόνο ανάκτηση επετεύχθη με πίεση -cooking τα δείγματα σε 0,01 mol ρυθμιστικό διάλυμα κιτρικού /L για 5 λεπτά. Το μονοκλωνικό αντίσωμα κουνελιού (κλώνος Y170 ελήφθη από Epitomics, Burlingame, CA, USA) χρησιμοποιήθηκε για ανοσοϊστοχημεία. ATM χρωματίστηκε στον πυρήνα της κανονικής γαστρικό βλεννογόνο, στρωματικά κύτταρα, και λεμφοκύτταρα. Ένταση βαθμολογήθηκε ως 0 (απόλυτα αρνητική), ± (διφορούμενο χρώση, σήμα παρατηρήθηκαν μόνο σε μικροσκόπιο υψηλής ισχύος με × 40 προσοφθάλμιο), + /3 (ασθενές θετικό), ++ /3 (μέτρια θετική) και +++ /3 (έντονα θετικές, σχεδόν ίσο με λεμφοκύτταρα και ουδετερόφιλα). Τα κριτήρια για αρνητική περιπτώσεις ορίστηκαν ως λιγότερο από το 10% των κυττάρων χρωματίστηκαν ως ασθενώς θετικό (+ /3) ή υψηλότερη ένταση, δηλαδή, περισσότερο από το 90% των κυττάρων που δείχνουν εντελώς αρνητικό (μηδέν) ή αμφίβολα χρώσης (±) [2 ].

Η στατιστική ανάλυση

Το πακέτο SPSS 15.0 χρησιμοποιήθηκε για στατιστικές αναλύσεις. χρησιμοποιήθηκαν Chi-square test και Cox μοντέλο αναλογικού κινδύνου. Όλες οι p-τιμές είναι δύο όψεων και Ρ τιμές & lt?. 0.05 θεωρήθηκαν σημαντικές για τις στατιστικές μεθόδους σε αυτή τη μελέτη

Αποτελέσματα

Η μετάλλαξη σε εσονικές επαναλήψεις μονονουκλεοτίδης του γονιδίου ΑΤΜ σε ανθρώπινο γαστρικό καρκινικές κυτταρικές σειρές

Μεταξύ 10 ανθρώπινη γαστρικού καρκίνου κυτταρικές σειρές, SNU-1 και SNU-638 χαρακτηρίστηκαν ως MSI θετική,

ATM

μεταλλάξεις γονιδίων θετικών και ΑΤΜ απώλεια από την IHC. Σε SNU-1 και SNU-638, 22 βάσεων διαγραφή ζεύγους εξονίου 6 ανιχνεύθηκε με RT-PCR και επιβεβαιώθηκε σε επόμενες ανάλυση αλληλουχίας (Σχήμα 1). SNU-5, SNU-16, SNU-484, SNU-601, SNU-620, SNU-668, και SNU-719 ήταν MSI αρνητικά και είχε άγριου τύπου

ATM

γονίδιο. Αν και SNU-216 ήταν MSI αρνητική, έτρεφε μεταλλάξεις στο

ATM

γονίδιο, και είχε ισχυρή έκφραση ΑΤΜ ανιχνεύεται με IHC (Πίνακας 1).

(Α) BAT26 (μπλε) και BAT25 (πράσινο) παρουσίασαν σταθερό μοτίβο στο SNU-5 (επάνω) και ασταθές μοτίβο σε SNU-1 (κάτω). (Β) ΑΤΜ γονίδιο PCR προϊόντα inintervening ακολουθία (IVS6) (πορτοκαλί), IVS10 (μπλε), IVS20 (πράσινο) έδειξε κανονική διάρκεια σε SNU-5 (επάνω) και συντόμευση σε SNU-1 (κάτω). (Γ) RT-PCR του

ATM

εξόνιο 6, το εξόνιο 10 και εξόνιο 20 σε κυτταρικές γραμμές γαστρικού καρκίνου. SNU-1 και 638 παρουσίασαν 22-bp απαλοιφή στο εξόνιο 6. (D) Άμεση αλληλούχιση του IVS 6. SNU-5 έχει κανονική σειρά και SNU-1 έχει 22 διαγραφή σε υπογραμμισμένες αλληλουχίες. (Ε) Η ανοσοϊστοχημεία πρωτεΐνης ΑΤΜ σε γαστρικό κυτταρικές σειρές καρκίνου. Αρνητική σε SNU-1, διφορούμενο σε SNU-638, ήπια θετική SNU-16 και ισχυρή θετική SNU-5. (F) Σχηματική αναπαράσταση ενός 22-bp διαγραφή του εξονίου 6 του

ATM

(882del22).

Η MSI

Η

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη του εσωνίου μονονουκλεοτιδίου επαναλαμβάνει

ATM

αλληλουχίας

Η

ATM

RT-PCR

Η ATM IHC

Η νυχτερίδα 26

Bat 25

IVS 6

IVS 10

IVS 20

εξόνιο 6

εξόνιο 10

εξόνιο 20

εξόνιο 6

εξόνιο 10

εξόνιο 20

Η SNU-1 +++++ 22-bp delnono22-bp delnonoNegativeSNU-5 —– nonononononoPositiveSNU-16 —– ndndndnononoPositiveSNU-216 – +++ nononono nonoPositiveSNU-484—–ndndndnononoPositiveSNU-601—–ndndndnononoPositiveSNU-620—–ndndndnononoPositiveSNU-638+++++22-bp delnono22-bp del nonoNegativeSNU-668 —– ndndndnononoPositiveSNU-719 —– ndndndnononoPositiveTable 1. Μικροδορυφορικοί κατάσταση αστάθειας και

ATM

προφίλ του γονιδίου της ανθρώπινης κυτταρικές γραμμές γαστρικού καρκίνου.

IVS, παρεμβαλλόμενη αλληλουχία ? IHC, ανοσοϊστοχημεία. CSV Λήψη CSV

Η μετάλλαξη σε επαναλήψεις ιντρόνιο μονονουκλεοτίδης του

ATM

γονιδίων και αστάθειας του μικροδορυφορικού DNA σε γαστρικό ιστό καρκίνου

Η συχνότητα των εσωνίων μετάλλαξη στο

ATM

γονίδιο προσδιορίστηκε ως 12,9% (78/604). Η συχνότητα του

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη ήταν 9,3% (50/540) στο ιντρόνιο που προηγείται IVS 6? 11,0% (59/534) στο ιντρόνιο που προηγείται IVS 10 και 8,8% (46/523) στο ιντρόνιο που προηγείται IVS 20? Μεταξύ αυτών, IVS 6 και IVS 10 επικαλύπτονται σε 39, 10 και IVS IVS 20 σε 35, 10 και IVS IVS 20 σε 34, 6 IVS, IVS 10 και IVS 20 σε 31 περιπτώσεις (Πίνακας 2). Οι συχνότητες της MSI θετικότητας ήταν 9,2% (81/882) και η απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ήταν 15,2% (134/839) στη μελέτη μας του GC. Σε 596 περιπτώσεις, οι ενώσεις μεταξύ των MSI (Σχήμα 2Α), τη μετάλλαξη γονιδίων ATM (Σχήμα 2Β), και απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ (Σχήμα 3) αναλύθηκαν.

ATM

μετάλλαξη ιντρόνιο και την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ανιχνεύθηκαν στο 69,3% (52/75) και 53,3% (40/75) των MSI θετική GC. MSI θετικότητα και η απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ήταν παρούσα σε 68.4% (52/76) και 48,7% (37/76) των GC με μετάλλαξη ιντρόνιο ΑΤΜ. MSI θετικότητα και μετάλλαξης ιντρονίου ATM ανιχνεύθηκαν στο 35,7% (40/112) και 33,0% (37/112) των GC με απώλεια πρωτεΐνη ΑΤΜ (Πίνακας 3). Η συχνότητα των αποτελεσμάτων ATM IHC έδειξαν σημαντικά μεγαλύτερη απώλεια ATM σε μια υποομάδα της MSI θετική και

ATM

μετάλλαξη θετική GC (Εικόνα 4Α). Τριάντα τρεις από τις 596 περιπτώσεις (5,5%) έχουν τα και τα τρία μοριακά χαρακτηριστικά (Εικόνα 4Β).

Τοποθεσία

Επαναλήψεις (άγριου τύπου)

μετάλλαξη Intron στο GC

Intron μετάλλαξη στο MSI θετική GC

Intron μετάλλαξη στο ΑΤΜ IHC αρνητική GC

em

ATM

IVS 6 (Τ)

1550/540 (9,3%) 42/50 (84,0%) 29/111 (26,1%)

ATM

IVS 10 (Τ)

1559/534 (11,0%) 47/59 (78,7%) 29/111 (26,1%)

ATM

IVS 20 (Τ)

1546 /523 (8,8%) 34/46 (73,9%) 22/107 (20,6%)

ATM

IVS 6 ή IVS 10 ή IVS 20 (Τ)

1578/604 (12,9%) 53/76 (69,7%) 37/112 (33,0%) Πίνακας 2. Incidencies του

ATM

γονίδιο ιντρόνιο μετάλλαξη των γαστρικών καρκίνων (GC)

IVS, παρεμβαλλόμενη αλληλουχία.? MSI, μικροδορυφόρων αστάθεια? IHC, ανοσοϊστοχημεία. CSV Λήψη CSV

Κάτω λωρίδα έδειξε αστάθεια στην BAT26 (μπλε) και BAT25 (πράσινο). (Β) Κάτω λωρίδα έδειξε μετάλλαξη στο παρεμβαλλόμενη αλληλουχία 6 (IVS6) (μπλε).

Η

(α) αρνητική. (Β) Αμφίβολο (+/-). (C) Ασθενής θετικός (1 + ~ 2 +). (D) Ισχυρή θετική (3+).

Η

Η

ATM IHC

Η MSI

ATM

μετάλλαξη

Ν

Αρνητική

Θετική

NegativeNegative49768 (13,7%) 429 (86,3%) Positive244 (16,7%) 20 (83,3%) Subtotal52172 (13,8%) 449 (86,2%) PositiveNegative237 (30,4%) 16 (69,6%) Positive5233 (63,5%) 19 (36,5%) Subtotal7540 (53,3%) 35 (46,7%) Negative52075 (14,4%) 445 (85,6%) Positive7637 (48,7%) 39 (51,3%) Total596112 (18,8%) 484 (81,2%) Πίνακας 3. Συχνότητα έκφραση της πρωτεΐνης ΑΤΜ σε υποομάδες σύμφωνα με μικροδορυφορικού αστάθεια (MSI) κατάσταση και

ATM

ιντρόνιο μετάλλαξη.

CSV Λήψη CSV

(Α) συχνότητες της απώλειας πρωτεΐνης ΑΤΜ με ανοσοϊστοχημεία σε γαστρική καρκίνο υποομάδες με βάση την κατάσταση MSI και

ATM

μετάλλαξη ιντρόνιο. διάγραμμα (Β) Βεν δείχνει τον αριθμό των γαστρικών περιπτώσεων καρκίνου με επικάλυψη μοριακά χαρακτηριστικά μεταξύ των υψηλού επιπέδου αστάθειας μικροδορυφορικού (MSI-H),

ATM

ιντρόνιο μετάλλαξη και ΑΤΜ απώλεια πρωτεΐνης.

Η

κλινικοπαθολογικοί συσχετίσεις των

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη στο GC

ασθενών GC με

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη σχετίζεται με την ηλικία, το μεγάλο μέγεθος του όγκου, περιφερική θέση, εντερικό τύπο, βαθύτερη εισβολή, και χαμηλότερο ποσοστό υποτροπής. ασθενείς GC με αρνητικό ATM IHC συσχετίστηκαν με την ηλικία, το μεγάλο μέγεθος του όγκου, και έως μετρίως διαφοροποιημένων τύπου, και εντερική είδος της ταξινόμησης της Lauren (Πίνακας S1). Chi-square test

ATM

κατάσταση μετάλλαξης του γονιδίου ΑΤΜ IHC αρνητικές και θετικές ομάδες με κλινικοπαθολογική μεταβλητές έγινε. Στην αρνητική ομάδα ATM IHC, μετάλλαξη

ATM

θετική GC συνδέθηκαν με το γήρας (P = 0,032) και άπω θέση (P = 0,045). Στην θετική ομάδα ATM IHC,

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη σχετίζεται με καλά ή μετρίως διαφοροποιημένων τύπο του GC (P = 0,022) (Πίνακας S1).

Επιβίωση ανάλυση

Η Cox μοντέλο αναλογικών κινδύνων χρησιμοποιείται και στις δύο μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική δοκιμές. Μονοπαραγοντική ανάλυση παλινδρόμησης Cox για τη συνολική επιβίωση και την επιβίωση χωρίς ασθένεια παρουσίασαν σημαντική προγνωστική αξία ορισμένων εγκατεστημένος προγνωστικών παραγόντων όπως λεμφαδένα μετάσταση, το βάθος του όγκου, και την ταξινόμηση των ιστολογικός τύπος της Lauren. Η ομάδα των ασθενών που έλαβαν επικουρική chemotherpy είχαν σημαντικά υψηλό σχετικό κίνδυνο για τη συνολική (OS) και απαλλαγμένα από ασθένειες επιβίωση (DFS) (P & lt? 0,001, σχετικός κίνδυνος = 3,82 [95,0% CI, 2,81 – 5,18] για το OS και η P & lt? 0,001, σχετικός κίνδυνος = 5,63 [95,0% CI, 3,69 – 8,58] για DFS). Ωστόσο, δεν υπάρχουν σημαντικές τάσεις του σχετικού κινδύνου (RR) παρατηρήθηκε για

ATM

ιντρόνιο μετάλλαξη, απώλεια MSI, ή ΑΤΜ IHC. Η πολυπαραγοντική ανάλυση χρησιμοποιώντας τις μεταβλητές του βάθους του όγκου, την κατάσταση των λεμφαδένων, ταξινόμηση των ιστολογικός τύπος Lauren, η επικουρική χημειοθεραπεία,

ATM

μετάλλαξη ιντρόνιο, και η έκφραση της πρωτεΐνης ΑΤΜ έγινε. ATM μετάλλαξη ιντρόνιο έχει μικρότερο σχετικό κίνδυνο με οριακή σημασία για τη συνολική επιβίωση (P = 0,05, σχετικός κίνδυνος = 0,60, [95,0% CI 0,36 – 1,00]) (Πίνακας 4).

Η Συνολική επιβίωση

Η ελεύθερη νόσου επιβίωση

Η

Η σχετικός κίνδυνος

95,0% CI

P αξίας

Ν

Η Σχετική κινδύνου

95,0% CI

P αξίας

Ν

προχωρημένο γαστρικό Cancer8.263.00-22.750.005965.051.81-14.130.00544Lymph κόμβου τύπου positive6.663.47-12.770.005963.201.58-6.480.00544Diffuse histology1.431.06 -1.940.025961.611.09-2.360.02544Adjuvant chemotherapy0.990.57-1.730.985962.171.00-4.720.05544

ATM

ιντρόνιο mutation0.600.36-1.000.055960.560.29-1.080.08544ATM loss1.190.82-1.730 πρωτεΐνη .355961.100.67-1.810.70544Table ανάλυση παλινδρόμησης 4. η πολυπαραγοντική Cox.

CSV Λήψη CSV

Συζήτηση

Τα αποτελέσματα μας έδειξαν ότι οι μεταλλάξεις της επανάληψης ιντρόνιο στο

ATM

γονίδιο να οδηγήσει σε παρεκκλίνουσα μάτισμα, που οδηγεί σε διαγραφή 22 bp και πρωτεΐνη απώλεια έκφρασης ΑΤΜ στο κελί GC γραμμές. Αυτά τα αποτελέσματα είναι σύμφωνα με την προηγούμενη έκθεση [13] όσον αφορά τον εντοπισμό ενός ελαττώματος ματίσματος στο

MRE11

πρόδρομος μεταγραφής που συνδέεται με μεταλλάξεις από ένα πολυ (Τ) 11 επανάληψης εντός παρεμβαλλόμενη αλληλουχία 4 (IVS-4), αποκλειστικά σε MMR με ανεπάρκεια καρκινικές κυτταρικές γραμμές και πρωτογενείς όγκους. Τα αποτελέσματα μας αποκάλυψαν ότι η απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ στο GC συσχετίζονται σημαντικά με την παρουσία του ιντρονική μετάλλαξη γονιδίων στο

ATM

.

Σε ασθενείς αταξία-τελαγγειεκτασία, 70% -90% των

ATM

μεταλλάξεις είναι ανοησίες, μετατόπισης πλαισίου, ή μάτισμα μεταλλάξεις που περικόψει την πρωτεΐνη [16]. Σύμφωνα με τις κοσμικές βάσεις δεδομένων (https://www.sanger.ac.uk/cosmic), μεταλλάξεις σε περιοχές κωδικοποίησης του

ATM

γονίδιο ανιχνεύθηκαν στο 5% (433 από 9249) των διαφόρων μορφών καρκίνου. Μεταξύ αυτών ο καρκίνος του στομάχου έδειξε μετάλλαξη μόνο στο 1,35% (1 από 74). Παρά το γεγονός ότι

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη στο GC αναφέρθηκε προηγουμένως [3,9], περιεκτική εξήγηση περιορίζεται από τη χαμηλή συχνότητα της μετάλλαξης και σχετικά υψηλή συχνότητα εμφάνισης λειτουργικής απώλειας των ΑΤΜ [2]. Στη μελέτη μας, περίπου το 70% της MSI θετική GC έδειξε σημαντική

ATM

γονίδιο ιντρονική μετάλλαξη που σχετίζεται με την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ. Τα αποτελέσματα μας υποστηρίζουν σθεναρά ότι η ιντρονική μετάλλαξη του

ATM

με υποκείμενη MSI είναι ένας από τους κύριους μηχανισμούς της απώλειας ΑΤΜ στην ανθρώπινη GC. ATM απώλεια οφείλεται σε ανώμαλο συγκόλληση που σχετίζονται με εσονικές βράχυνση στην MSI θετικές κυτταρικές σειρές καρκίνο του παχέος εντέρου. Ejima et al. αναζήτηση

ATM

μεταλλάξεις γονιδίων χρησιμοποιώντας 62 ζεύγη των ολιγονουκλεοτιδίων εκκινητών, που αντιστοιχεί στην περιοχή που κυμαίνονται από εξόνιο 4 έως εξώνιο 65 του

ATM

και συνοδευτικά εσώνια του. Συντόμευση του εκτάσεις μονονουκλεοτιδίου του

ATM

εσώνια αντιπροσώπευαν το 34 (87%) του 39 εσονικές αλλαγές. Τριάντα ένα από αυτά βρέθηκαν στις 5 κυτταρικές σειρές παχέος εντέρου-όγκου που έχει MSI (LS180, HCT15, HCT116, SW48, και LoVo). Έδειξαν επίσης χαμηλή έκφραση πρωτεΐνης ΑΤΜ σε MSI θετικό καρκίνο του παχέος εντέρου κυτταρικές γραμμές [14]. Η έκφραση ΑΤΜ μειώνεται σημαντικά σε πολλές καρκινώματα του μαστού, και δεν βρήκε καμία

ATM

μετάλλαξη στο εν λόγω κυτταρική γραμμή [17]. Αυτό δείχνει τα διαφορετικά χαρακτηριστικά των

ATM

μεταβολές γονιδίου μεταξύ του γαστρεντερικού και του μαστού.

Εκτός από μεταλλάξεις, ογκοκατασταλτικά γονίδια μπορεί να αδρανοποιηθεί με μεθυλίωση υπολειμμάτων κυτοσίνης εντός CpG νησίδες που βρίσκονται στην υποστηρικτής πολλών γονιδίων.

ATM

γονίδιο είναι ένα νέο στόχο για επιγενετικές σίγηση μέσω ακατάλληλη μεθυλίωση της περιοχής του εγγύς υποκινητή συσχετίζεται με αυξημένη ραδιοευαισθησία και χαμηλή έκφραση της πρωτεΐνης σε ένα ανθρώπινο ορθοκολικό κυτταρική γραμμή όγκου [18] και γλοιώματος κυτταρική σειρά ανθρώπινου [18]. χωρίς

ATM

γονιδιακών μεταλλάξεων.

Η MSI στόχευση του

ATM

γονίδιο αντιπροσωπεύει μια σύνδεση μεταξύ της MSI και επιδιόρθωση του DNA στο GC. Αρκετές μελέτες δείχνουν ότι η λειτουργική απώλεια των ΑΤΜ αυξάνεται σε MSI και την ανθρώπινη

ATM

γονίδιο είναι ένα σημαντικό στόχο για αδρανοποίηση σε MSI κυτταρικές γραμμές θετικές GC και τους ιστούς [19,20]. Ο λόγος για εντυπωσιακά υψηλή συχνότητα εμφάνισης

ATM

γονίδιο ιντρόνιο μετάλλαξη σε MSI θετικά GC μπορεί να οφείλεται στις επαναλήψεις μονονουκλεοτιδίου (Τ) 15, και ένα μήκος 13 νουκλεοτιδίων ή περισσότερο ήταν ιδιαίτερα επιρρεπή σε αυτό στοχευμένες συντόμευση [14 ]. Η συχνότητα των

ATM

γονίδιο μετάλλαξη μετατόπισης πλαισίου (Τ) 7 στο εξόνιο 6 ακολουθία κωδικοποίησης σε MSI θετική GC αναφέρθηκε ότι είναι μόνο 6% (2/36) [8], η οποία είναι πολύ χαμηλότερη από την παρατήρηση μας.

Έχει αναφερθεί ότι η ανεπάρκεια ATM ευαισθητοποιεί τα κύτταρα προς τις ανασταλτικές της ανάπτυξης επιδράσεις του αναστολέα PARP, olaparib, σε γαστρικό καρκινικά κύτταρα με μειωμένη

ATM

έκφραση [21]. Οι αναστολείς της πολυμεράσης πολυ (ADP-ριβόζη) αξιολογούνται επί του παρόντος σε κλινικές δοκιμές έναντι μίας ποικιλίας καρκίνων, συμπεριλαμβανομένων καρκινώματος κόλου [22]. Σε GC, ανεπάρκεια ΑΤΜ είναι γνωστό ότι είναι ένας προγνωστικός δείκτης της απάντηση στην αναστολέα PARP [23-25]. Ένας δείκτης του ομόλογου ανασυνδυασμού, Rad 51, είναι γνωστό ότι είναι προγνωστική δείκτης της εισαγωγικής anthracylcine χημειοθεραπείας με βάση στον καρκίνο του μαστού [26], καθώς και του αναστολέα PARP σε GC [24].

Τα αποτελέσματα μας έδειξαν ότι ΑΤΜ η απώλεια της πρωτεΐνης δεν είναι μια επιθετική παράγοντα GC, παρόλο που είναι σημαντικά συνδέεται με δυσμενείς τάσεις της ΥΕ στο MSI αρνητική GC. Αυτό μπορεί να συγκριθεί με άλλες μελέτες που αναφέρουν την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ως ανεπιθύμητη προγνωστικό παράγοντα [20]. Στις μελέτες μας,

ATM

μετάλλαξη και ΑΤΜ αρνητικές GC είχε ξεχωριστή κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά? Ωστόσο, αυτή η ομάδα δεν παρουσίασε καμία διαφορά επιβίωση με τους άλλους. Σε MSI αρνητική ομάδα, HR της GC με την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ ήταν ιδιαίτερα υψηλό, ωστόσο, MSI θετική ομάδα, ΥΕ σε GC με την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ δεν ήταν σημαντική. Αυτό δείχνει ότι η MSI είναι μια πιθανή μοριακό παράγοντα που επηρεάζει τη βιολογική συμπεριφορά του GC. Έτσι, η μελέτη μας υποστηρίζει ότι η κατάσταση της MSI θα μπορούσαν να επηρεάσουν την ευαισθησία στην αναστολέα PARP επηρεάζοντας την κατάσταση έκφρασης της πρωτεΐνης ανταπόκρισης βλάβη του DNA μέσω μονονουκλεοτιδίου επαναλαμβάνει αλλαγές.

Εν ολίγοις,

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη σε GC είναι 12,9% και 33,0% του GC με

ATM

γονιδιακή μετάλλαξη σχετίζεται με την απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ. MSI θετική GC έδειξε

ATM

μετάλλαξη στο 69,7%. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι το αποτέλεσμα της απώλειας ΑΤΜ και ευαισθησία σε χημειοθεραπευτική ένωση, olaparib, μπορεί να κατανοηθεί καλύτερα αν οι υποθέσεις στρωματοποιημένη με βάση

ATM

κατάσταση μετάλλαξης του γονιδίου ή MSI.

Συμπεράσματα

Η μελέτη μας αποκάλυψε

ATM

γονιδιακής μετάλλαξης ιντρόνιο είναι παρούσα στο 69% της MSI θετική GC και το 49% των

ATM

ιντρόνιο μετάλλαξη συνδέεται με απώλεια πρωτεΐνης ΑΤΜ. Αυτά δείχνουν ότι το

ATM

γονιδιακής μετάλλαξης ιντρόνιο στόχο μικροδορυφόρων αστάθεια συνδέεται με την απώλεια της πρωτεΐνης ΑΤΜ σε ένα υποσύνολο του ανθρώπινου γαστρικού καρκίνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

κλινικοπαθολογικοί συσχετίσεις του γαστρικού καρκινώματος με τη μετάλλαξη του γονιδίου ΑΤΜ και η έκφραση της πρωτεΐνης ΑΤΜ.

doi: 10.1371 /journal.pone.0082769.s001

(DOCX)