Αφηρημένο

Τα ενθαρρυντικά αποτελέσματα της αναπλαστικού λεμφώματος κινάσης αναστολείς (ΑΛΚ) έχουν αλλάξει τη σημασία της ALK συγχωνεύσεις σε διάφορους τύπους καρκίνου. Αυτές οι συγχωνεύσεις δεν είναι πια απλές ερευνητικών στόχων ή διαγνωστικών δεικτών, αλλά τώρα που συνδέονται άμεσα με το θεραπευτικό όφελος των ασθενών. Ωστόσο, τα περισσότερα διαθέσιμα ιστούς όγκων σε κλινικές ρυθμίσεις είναι σταθεροποιημένο με φορμαλίνη και εγκλεισμένα σε παραφίνη (FFPE), και αυτό περιορίζει σημαντικά λεπτομερής γενετικές μελέτες σε πολλές κλινικές περιπτώσεις. Παρά το γεγονός ότι πρόσφατες τεχνικές βελτιώσεις επέτρεψαν την ανάλυση κάποιων γνωστών μεταλλάξεων σε ιστούς FFPE, τον εντοπισμό άγνωστων γονιδίων σύντηξης με τη χρήση μόνο ιστούς FFPE εξακολουθεί να είναι δύσκολη. Έχουμε αναπτύξει ένα 5′-ταχείας ενίσχυσης των cDNA συστήματος βελτιστοποιημένη για ιστούς FFPE τελειώνει με βάση και αξιολογείται το σύστημα αυτό σε έναν ιστό του καρκίνου του πνεύμονα με το

ALK

αναδιάταξη και χωρίς τα 2 γνωστά συγχωνεύσεις ALK EML4-ALK και KIF5B-ALK . Με αυτό το σύστημα, ταυτοποιήσαμε επιτυχώς ένα νέο σύντηξης ALK, KLC1-ALK. Το αποτέλεσμα επιβεβαιώθηκε με ανάστροφης μεταγραφής-αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης και του φθορισμού

in situ υβριδισμού

. Στη συνέχεια, συνθέσαμε την υποθετική cDNA πλήρους μήκους του

KLC1-ALK

και κατέδειξε το δυναμικό μετασχηματισμού της κινάσης σύντηξης με δοκιμασίες χρησιμοποιώντας κύτταρα 3Τ3 ποντικού. Για το καλύτερο της γνώσης μας, KLC1-ALK είναι το πρώτο μυθιστόρημα ογκογόνο σύντηξης προσδιορίζονται με τη χρήση μόνο ιστούς FFPE. Η διαπίστωση αυτή θα διευρύνει τη δυνητική αξία του αρχειακού ιστών FFPE και παρέχουν περαιτέρω βιολογικές και κλινικές γνώσεις σχετικά με ALK-θετικό καρκίνο του πνεύμονα

Παράθεση:. Togashi Υ, σόδα Μ, Sakata S, Sugawara Ε, Χατάνο S, Asaka R , et al. (2012) KLC1-ALK: Ένα μυθιστόρημα Fusion στον καρκίνο του πνεύμονα ταυτοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας ένα φορμόλη-Σταθερή εμπεδωθεί με παραφίνη ιστών μόνο. PLoS ONE 7 (2): e31323. doi: 10.1371 /journal.pone.0031323

Επιμέλεια: Αντώνης W. Ι Lo, το Κινεζικό Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 17 Οκτ 2011? Αποδεκτές: 5 του Γενάρη 2012? Δημοσιεύθηκε: 8 Φεβρουαρίου 2012