PLoS One: Μετάλλαξη Ανάλυση της RAD51C και RAD51D Γονίδια σε υψηλού κινδύνου καρκίνου των ωοθηκών ασθενών και των οικογενειών από τις τσεχικές Republic


Αφηρημένο

Πρόσφατες μελέτες έχουν ανατεθεί ότι το

RAD51C

και

RAD51D

γονίδια, τα οποία κωδικοποιούν για τις βασικές πρωτεΐνες που εμπλέκονται σε ομόλογο ανασυνδυασμό, είναι ο καρκίνος (OC) γονιδίων ωοθηκών ευαισθησία που μπορεί να εξηγήσει γενετική κινδύνους σε ασθενείς υψηλού κινδύνου. Πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση μετάλλαξης σε 171 υψηλού κινδύνου

BRCA1

και

BRCA2

αρνητική OC ασθενείς, για να αξιολογηθεί η συχνότητα της κληρονομικής

RAD51C

και

RAD51D

παραλλαγές στην Τσεχική πληθυσμού. Η ανάλυση που εμπλέκονται άμεση αλληλούχιση, υψηλό σημείο τήξης ανάλυση και ανάλυση καθετήρας πολλαπλών απολίνωση-εξαρτώμενη. Έχουμε εντοπίσει δύο (1,2%) και τρεις (1,8%) αδρανοποίηση μεταλλάξεις βλαστικής σειράς και στα δύο αντίστοιχα γονίδια, δύο εκ των οποίων (c.379_380insG, p.P127Rfs * 28

RAD51C

και c.879delG, p.C294Vfs * 16

RAD51D

) ήταν μυθιστόρημα. Είναι ενδιαφέρον ότι, μια ενδεικτική οικογενειακό ιστορικό καρκίνου δεν ήταν παρούσα σε τέσσερις φορείς. Επιπλέον, οι ηλικίες στις διαγνώσεις OC σε συγκεκριμένους φορείς μετάλλαξης ήταν σημαντικά χαμηλότερες από αυτές που αναφέρθηκαν σε προηγούμενες μελέτες (τέσσερις φορείς ήταν ηλικίας μικρότερης των 45 ετών). Περαιτέρω, θα περιγραφεί επίσης σπάνιες παραλλαγές εσφαλμένου νοήματος, δύο στο

RAD51C

και ένα στο

RAD51D

της οποίας η κλινική σημασία θα πρέπει να επαληθευτεί. Περικοπή μεταλλάξεις και σπάνιες παραλλαγές παρερμηνεύσιμη εξακριβωθεί σε ασθενείς OC δεν ανιχνεύθηκαν σε 1226 δείγματα ελέγχου. Αν και η αθροιστική συχνότητα του

RAD51C

και

RAD51D

περικοπή μεταλλάξεις στους ασθενείς μας ήταν χαμηλότερη από εκείνη των

BRCA1

και

BRCA2

γονίδια, μπορεί εξηγήσει την ευαισθησία OC σε ποσοστό περίπου 3% των ασθενών OC υψηλού κινδύνου. Ως εκ τούτου, ένας

RAD51C

και

RAD51D

ανάλυση θα πρέπει να εφαρμοστεί στην ολοκληρωμένη δοκιμή πολλαπλών γονιδίων για ασθενείς OC υψηλού κινδύνου, συμπεριλαμβανομένης της πρόωρης έναρξης OC ασθενείς χωρίς οικογενειακό ιστορικό καρκίνου.

Παράθεση: JANATOVA Μ, Soukupova J, Stribrna J, Kleiblova P, Vocka Μ, Boudova P, et al. (2015) Μετάλλαξη Ανάλυση του

RAD51C

και

RAD51D

Γονίδια σε υψηλού κινδύνου καρκίνου των ωοθηκών ασθενών και των οικογενειών από την Τσεχική Δημοκρατία. PLoS ONE 10 (6): e0127711. doi: 10.1371 /journal.pone.0127711

Ακαδημαϊκό Επιμέλεια: Klaus Brusgaard Πανεπιστημίου Odense νοσοκομείο, Δανία

Ελήφθη: 23 Ιαν 2015? Αποδεκτές: 17 Απρ 2015? Δημοσιεύθηκε: 9 Ιούνη, 2015

Copyright: © 2015 JANATOVA et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από την εσωτερική Οργανισμός Grant, Υπουργείο Υγείας, την Τσεχική Δημοκρατία, NT13343, (https://www.mzcr.cz/Cizinci/) ? PP, Πανεπιστήμιο του Καρόλου στην Πράγα, PRVOUK-P27 /LF1 /1, (https://www.cuni.cz/UKEN-1.html)? MJ, Πανεπιστήμιο του Καρόλου στην Πράγα, SVV-UK 3362-2014, (https://www.cuni.cz/UKEN-1.html)? PB. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος των ωοθηκών (OC) είναι η πιο θανατηφόρα γυναικολογική κακοήθεια, αν και αντιπροσωπεύει μόνο το 3% των γυναικών καρκίνων σε όλο τον κόσμο. δυσμενή πρόγνωση του που σχετίζονται με ένα υψηλό ποσοστό του προχωρημένου σταδίου διάγνωση κατατάσσεται OC στην τέταρτη θέση μεταξύ των πιο κοινή μορφή καρκίνου που σχετίζονται με αιτία θανάτου στον γυναικείο πληθυσμό [1]. συχνότητα εμφάνισης της στην Τσεχική Δημοκρατία είναι 23 /100.000 άτομα και τα ποσά της θνησιμότητας σε 15 /100.000 άτομα [2].

Ο πιο σημαντικός παράγοντας κινδύνου είναι το οικογενειακό ιστορικό OC. Έχει υποτεθεί ότι η κληρονομική προδιάθεση αντιπροσωπεύει τουλάχιστον το 10% των περιπτώσεων του οργανωμένου εγκλήματος [3]. Ως εκ τούτου, η ταυτοποίηση της γυναίκας που μεταφέρουν τις παθογόνες μεταλλάξεις σε OC-ευαισθησία γονίδια είναι ένα σημαντικό έργο που επιτρέπει προσαρμοσμένες πρόληψη του οργανωμένου εγκλήματος σε πληθυσμό υψηλού κινδύνου. Η πλειονότητα των κληρονομικών OC (ΕΟΕ) περιπτώσεις συνδέονται επίσης με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του μαστού (BC) και τις πιο συχνές παθογόνων μεταλλάξεων στην κληρονομική του μαστού ή /και ωοθηκών (HBOC) οικογένειες καρκίνου επηρεάζει το

BRCA1

γονίδιο και σε μικρότερο βαθμό, και

BRCA2

[4]. Και τα δύο γονίδια παίζουν σημαντικό ρόλο στην επιδιόρθωση του DNA διπλό σκέλος διαλείμματα (DDSB). Πρόσφατα, επιπρόσθετα γονίδια έχουν περιγραφεί ως σχετίζονται με ΕΟΕ, μεταξύ των οποίων και το

RAD51

παράλογα

RAD51C

και

RAD51D

.

Τόσο κωδικό γονίδια για πρωτεΐνες που εμπλέκονται στη συντήρηση σταθερότητα γονιδιώματος και συμμετέχουν στο ομόλογο ανασυνδυασμό μεσολάβηση επισκευή DDSB [5,6]. Οι αρχικές μελέτες ανέφεραν το

RAD51C

γονίδιο (MIM: 602.774) ως ένα άλλο αναιμίας Fanconi (FA) γονίδιο που χαρακτηρίζεται ως

FANCO

επειδή διαλληλόμορφο μεταλλάξεις βλαστικής σειράς του βρέθηκαν σε ασθενή με αντίστοιχο FA-φαινότυπο στην ομάδα συμπληρωματικότητας O [7]. Η πρωτοποριακή εργασία του Meindl et al. έδειξε ότι

RAD51C

είναι ένα γονίδιο ευαισθησίας OC με συχνότητα μετάλλαξης του 1,3% σε ασθενείς HBOC [8]. Από τότε, περαιτέρω μελέτες έχουν αποδείξει το ρόλο του

RAD51C

γονιδίων στην ανάπτυξη του οργανωμένου εγκλήματος σε ποσοστό έως 2,5% των οικογενειών HBOC υψηλού κινδύνου [9,10,11,12] συμπεριλαμβανομένων των σπάνιων μεγάλων γονιδιωματικής αναδιατάξεις [13] .

Μια μελέτη από Loveday et al. ανέφερε ότι οι μεταλλάξεις βλαστικής σειράς στο

RAD51D

γονίδιο (MIM: 602954) προσδίδουν ευαισθησία σε OC στο 0,9% των οικογενειών HBOC (κυρίως με περισσότερες από μία περίπτωση OC) και εκτιμάται ότι το σχετικό κίνδυνο (RR) στο 6,3 για OC και 1,32 για την BC [14]. Αρκετές άλλες μελέτες έχουν επιβεβαιώσει το ρόλο της στην OC ευαισθησία [15,16,17,18]

Αν και μεμονωμένα σπάνια, καθώς όλα τα γονίδια μέτρια διεισδυτικότητα μπορεί να συμβάλει σε σημαντικό ποσοστό του κινδύνου OC.? Ωστόσο, οι συχνότητες τους ποικίλουν σε διαφορετικούς πληθυσμούς [19]. Ο σκοπός της μελέτης μας ήταν να προσδιοριστεί η συχνότητα των μεταλλάξεων βλαστικής σειράς στο

RAD51C

και

RAD51D

μεταξύ Τσεχίας ασθενείς OC υψηλού κινδύνου αρνητικά ελέγχονται για

BRCA1

και

BRCA2

μεταλλάξεις.

Μέθοδοι

ασθενείς

Εμείς ανέλυσε 171 δείγματα DNA (που λαμβάνεται από το περιφερικό αίμα) από το

BRCA1

και

BRCA2

ασθενείς αρνητική OC συλλέγονται σε ινστιτούτο μας μεταξύ 2000 και 2013. ανήκαν είτε μια οικογενειακή ομάδα (Ν = 62) ή μια ομάδα χωρίς οικογενειακό ιστορικό καρκίνου (Ν = 109? Πίνακας 1) [20]. Η ομάδα ελέγχου αποτελείτο από ανώνυμα δείγματα DNA που λαμβάνονται από 1.226 άτομα, συμπεριλαμβανομένων 756 μη καρκινικά άτομα και 470 αιμοδότες, όπως περιγράφηκε προηγουμένως [21,22].

Η

Όλοι οι ασθενείς και οι έλεγχοι ήταν της Κεντρικής Ευρωπαϊκής καταγωγής της τσεχικής καταγωγής από την περιοχή της Πράγας. Η μελέτη εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας του Γενικού Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου στην Πράγα και όλοι οι συμμετέχοντες έδωσαν την έγγραφη ενημερωμένη συγκατάθεση τους με τη χρήση των αποθηκευμένων δειγμάτων DNA /RNA για ερευνητικούς σκοπούς.

Μετάλλαξη ανάλυση

Όλες οι επιμέρους εξόνες κωδικοποίησης (με όρια ιντρονίου-εξονίου) χωρίζονται από μεγάλες ιντρονικές περιοχές στον

RAD51C

γονιδίου ενισχύθηκαν με PCR (οι εκκινητές που παρατίθενται στο S1 πίνακα) και αναλύθηκαν με μία υψηλής ανάλυσης λιώνουν (HRM) ανάλυση σε το Φως Cycler 480 (Roche) χρησιμοποιώντας ένα ΖΕΣΤΟ FirePol EvaGreen HRM Mix (Solis Βίοϋγηβ) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή.

Παραλλαγές σε δείγματα με μια παρεκκλίνουσα προφίλ τήξης επιβεβαιώθηκαν με άμεση αλληλούχιση από ξεχωριστές αντιδράσεις PCR χρησιμοποιώντας το BigDye v3.1 επί ABI3130 (Applied Biosystems).

Όλα κωδικεύοντα εξώνια (συμπεριλαμβανομένων των ορίων ιντρονίου-εξονίου) αυτή τη μορφή τεσσάρων εξονικές συστάδες ο

RAD51D

γονίδιο ενισχύθηκαν με PCR και αναλύθηκαν με άμεση αλληλούχιση (τα PCR και προσδιορισμό της αλληλουχίας εναρκτήρες που απαριθμούνται στο S1 πίνακα).

Όλα τα εξόνια με τις προσδιοριζόμενες μεταλλάξεις διαλέγονται σε 1226 δείγματα ελέγχου από μια HRM δείγματα ανάλυσης και παραλλαγής επιβεβαιώθηκαν με αλληλούχιση.

Ανίχνευση μεγάλη γενωμική αναδιατάξεις (LGRs)

Το κιτ P260-Α1 χρησιμοποιήθηκε για πολλαπλή ανάλυση απολίνωση-εξαρτώμενη ενίσχυση καθετήρα (MLPA) στο

RAD51C

σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή. Τα ενισχυμένα προϊόντα διαχωρίστηκαν σε ABI3130 και αναλύθηκαν με το λογισμικό MRC Coffalyser (MRC Holland). Το κιτ MLPA για

RAD51D

ανάλυση δεν ήταν διαθέσιμα από οποιονδήποτε προμηθευτή κατά τη στιγμή της ανάλυσης.

cDNA ανάλυση

Για να προσδιοριστεί η επίδραση των εσωνίων παραλλαγή c. 1026 + 5_1026 + 7delGTA συνοδευτικά σε εσώνια εξόνιο όριο στο

RAD51C

πραγματοποιήσαμε μια ανάλυση cDNA που βασίζεται. Το ολικό RNA που απομονώθηκε από φλεβικό αίμα μεταγράφηκε αντίστροφα στο cDNA χρησιμοποιώντας SuperScript III ανάστροφης μεταγραφάσης (Life Technologies) ακολουθώντας το πρωτόκολλο του κατασκευαστή. PCR θραύσμα που καλύπτει την περιοχή εμπλεκόμενα ενισχύθηκε (εκκινητές είναι σε S1 πίνακα). PCR προϊόν που περιέχει άγριου τύπου και παρεκκλίνουσα θραύσματα αλληλουχήθηκε προκειμένου να χαρακτηρίσει παρεκκλίνουσα παραλλαγή ματίσματος.

Στο silico

ανάλυση

Η παθογένεια των παραλλαγών παρερμηνεύσιμη αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας το SIFT , PolyPhen, Ευθυγράμμιση GVGD και CADD εργαλεία βαθμολογίας όπως περιγράφηκε προηγουμένως [21,22]. Συχνότητες προσδιορίζονται παραλλαγές διαπιστώθηκαν στο NHLBI exome Sequencing Έργου (ESP? Https://esp.gs.washington.edu/drupal/). Και 1000 γονιδιώματος (https://www.1000genomes.org/) βάσεις δεδομένων

Αποτελέσματα

οι παθογόνοι μεταλλάξεις που οδηγούν σε περικοπή των προϊόντων πρωτεΐνης εντοπίστηκαν σε πέντε από 171 (3%) ασθενείς OC υψηλού κινδύνου, δύο (1,2%) στο

RAD51C

και τρεις ( 1,8%) σε

RAD51D

(Πίνακας 2). Δύο παθογόνων αλλαγές ήταν μυθιστόρημα. Δεν LGR βρέθηκε στο

RAD51C

γονίδιο, αλλά δεν μπορούσε να αποκλείσει την παρουσία της LGRs στο

RAD51D

γονίδιο που δεν αναλύθηκε γιατί κιτ MLPA ήταν διαθέσιμο στην εποχή της ανάλυσης. Καμία από τις προσδιοριζόμενες μεταβολές βρέθηκε στα 1226 μάρτυρες μη-καρκίνου. Η ηλικία κατά τη διάγνωση και το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου σε φορείς των μεταλλάξεων »παρουσιάζονται στον Πίνακα 2.

Η

Ένα μυθιστόρημα c.379_380insG (p.P127Rfs * 28) παραλλαγή στο

RAD51C

βρέθηκε σε ένα νεαρό ασθενή OC ο οποίος πέθανε 12 μήνες μετά τη διάγνωση της βλεννώδες αδενοκαρκίνωμα. Ένα άλλο

RAD51C

περικοπή παραλλαγή ήταν συναρμογής επιτόπου μεταβολή, c.1026 + 5_1026 + 7delGTA, προσδιορίζονται σε έναν ασθενή που ανέπτυξε καρκίνο του ενδομητρίου επτά χρόνια μετά τη διάγνωση της ορώδες αδενοκαρκίνωμα των ωοθηκών. Ο παθογόνος δυνατότητες αυτής της μεταβολής αποδεικνύεται από την ανάλυση cDNA που αποκάλυψε παρεκκλίνουσα εξόνιο 8 πηδώντας, που είχε ως αποτέλεσμα μετατόπιση πλαισίου και πρόωρο τερματισμό του προϊόντος μετάφρασης (p.R322Sfs * 22? Σχήμα 1). Αυτή η παραλλαγή είχε προηγουμένως αναφερθεί μια φορά σε ένα στοιχείο ελέγχου και ενός ασθενούς, αντίστοιχα, με Loveday

κ.ά.

. και σε μια μελέτη από Golmard

et al

. [10,11].

Η ηλεκτροφόρηση (αριστερά) των προϊόντων PCR που έχουν ενισχυθεί με εκκινητές που βρίσκονται στο εξόνιο 5 και 3 ‘αλληλουχία UTR (S1 πίνακας) δείχνει δύο προϊόντα σε ένα ασθενή No.1273 σε σύγκριση με ένα άγριου ελέγχου (C) του δείγματος τύπου. Αλληλουχίας χρωματογράφημα του PCR προϊόντος του ασθενούς δείχνει την παρουσία έκτροπα συγκολλημένα mRNA με εξόνιο 8 παρακάμπτοντας

Η

Το μόνο περικοπή μετάλλαξη που περιγράφονται κατ ‘επανάληψη στη μελέτη μας ήταν c.694C & gt?. Τ (p.R232 *) σε

RAD51D

, βρέθηκαν σε δύο νεαρούς ασθενείς άσχετα OC με ορώδες αδενοκαρκίνωμα και χωρίς οικογενειακό ιστορικό καρκίνου. Όσο νωρίτερα διαγνωστεί ασθενής πέθανε από τη διάδοση OC 10 χρόνια μετά τη διάγνωση. Αυτή η παραλλαγή περιγράφηκε προηγουμένως σε ασθενείς ισπανικά και αμερικανικά HBOC [18,16]. Ένα μυθιστόρημα

RAD51D

μετάλλαξη, c.879delG (p.C294Vfs * 16), βρέθηκε σε έναν ασθενή με OC με μια κόρη που πάσχουν από π.Χ. και OC διπροσωπία.

Εκτός από την περικοπή παραλλαγές, εμείς βρέθηκαν τρεις σπάνιες παραλλαγές των εσφαλμένων διευθύνσεων (Πίνακας 2). Η c.641G & gt? Α (p.R214H) μετάλλαξη στο

RAD51C

πρόσφατα εντοπίστηκαν σε μια π.Χ. θηλυκό αφρικανικής καταγωγής [12] και περιγράφεται ως μια παραλλαγή χαμηλού κινδύνου με βάση το οικογενειακό ιστορικό της που είναι σε συμφωνία με προβλέψεις λογισμικού. Η δεύτερη σπάνια παραλλαγή παρερμηνεύσιμη c.947A & gt? G (p.H316R) ήταν μυθιστόρημα? Ωστόσο, και οι δύο αυτές αλλαγές στο

RAD51C

είχαν προβλεφθεί ως μη-παθογόνα. Το μόνο σπάνιες c.629C variant- & gt? T (p.A210V) -σε

RAD51D

περιγράφηκε προηγουμένως [18] και είχε προβλεφθεί ως παθογόνα (Πίνακας 2)

Άλλα ανιχνεύονται παραλλαγές σειράς. παρουσιάζονται σε dbSNP (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/) ή HGMD (https://portal.biobase-international.com/hgmd/pro/start.php) βάσεις δεδομένων, όπως οι πολυμορφισμοί που απαριθμούνται στον πίνακα S3.

Συζήτηση

Εντοπίσαμε βλαστική περικοπή μεταλλάξεις στο

RAD51C

και

RAD51D

γονίδια σε 1,2% και 1,8% που αναλύθηκαν υψηλής άτομα κίνδυνο, αντίστοιχα, το οποίο είναι σύμφωνο με προηγούμενες μελέτες [23,24]. Η μελέτη μας παρέχει περαιτέρω αποδείξεις ότι και τα δύο γονίδια που προσδίδουν μια περιορισμένη αλλά κλινικά αξιοσημείωτο ποσοστό της ευαισθησίας OC.

Πρώτα μελέτες ανέφεραν επιβλαβή περικοπή μεταλλάξεις στο

RAD51C

και

RAD51D

γονιδίων κατά κύριο λόγο σε οικογένειες HBOC με δύο ή περισσότερες περιπτώσεις OC [8,14]. Ωστόσο, βρήκαμε την πλειοψηφία (τέσσερις στους πέντε σαφώς επιβλαβείς μεταλλάξεις? Πίνακας 2) σε μια υποομάδα 109

BRCA1

και

BRCA2

ασθενείς αρνητική OC χωρίς π.Χ. ή OC οικογενειακό ιστορικό. Αυτό είναι σε συμφωνία με τις μεταγενέστερες μελέτες, οι οποίες προσδιορίζονται

RAD51C

και

RAD51D

μεταλλάξεις σε ένα μη επιλεγμένο πληθυσμό ασθενών OC [25,16]. Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι η πλήρης γενετικός έλεγχος του

RAD51C

και

RAD51D

γονιδίων σε ασθενείς OC δεν πρέπει να περιορίζεται μόνο σε ασθενείς OC υψηλού κινδύνου, με εμφανή οικογενειακό ιστορικό, καθώς και μια ανάλυση όλων των OC ασθενείς θα πρέπει να θεωρούνται ανεξάρτητα με την ιστορία και την ηλικία έναρξης της νόσου [26] καρκίνου οικογένεια.

Οι μέσες ηλικίες των OC εκδήλωση για τις γυναίκες με

RAD51C

και

RAD51D

μεταλλάξεις δημοσιευθεί σε προηγούμενες μελέτες ήταν 60 ετών για

RAD51C

(αναθεωρούνται στο [23]) και 56,6 χρόνια για

RAD51D

(S4 Πίνακας). Σοπίκ

et al

. πρότεινε την προληπτική χειρουργική επέμβαση για να καθυστερήσει έως ότου το φυσικό εμμηνόπαυση. Παρ ‘όλα αυτά, στη μελέτη μας, οι μέσες ηλικίες των OC εμφάνιση σε φορείς περικοπή παραλλαγές ήταν 26,0 χρόνια για

RAD51C

(25 και 27 ετών αντίστοιχα) και 48,7 χρόνια για

RAD51D

(37, 43 , και 66 ετών αντίστοιχα). Ενώ ένας μικρός αριθμός των φορέων μετάλλαξης θα μπορούσαν να επηρεάσουν αυτή την παρατήρηση, μπορούμε να υποθέσουμε ότι το γεγονός ότι τέσσερα από τα πέντε φορείς των παθογόνων μεταλλάξεων στο

RAD51C

και

RAD51D

γονίδια ήταν προεμμηνοπαυσιακές γυναίκες κάτω των 45 ετών θα μπορούσε να έχει κλινική σημασία. Ως εκ τούτου, περαιτέρω μελέτες των μεταφορέων σε δύο γονίδια που είναι απαραίτητα για την εκτίμηση των κλινικών συστάσεις για τη μείωση του κινδύνου των διμερών σαλπιγγοωοθηκεκτομή (RR-BSO) και μέχρι τότε, θα πρέπει να ληφθεί το νωρίτερο έναρξη της OC στην οικογένεια υπόψη. Πρόσφατα, Baker et al. αναφερθεί RR-BSO σε μια 39 ετών ασθενής θηλυκό π.Χ. μεταφέρουν

RAD51D

μετάλλαξη από οικογένεια με πολλούς π.Χ. (αλλά όχι OC) περιπτώσεις [24].

Στη μελέτη μας, ένα μόνο πρόγονο, που φέρουν το παθογόνο

RAD51C

μετάλλαξη, που εμφανίζεται οικογενειακό ιστορικό καρκίνου που περιλαμβάνονται OC και BC περιπτώσεις. Από προηγούμενες μελέτες ανέφεραν ότι δεν υπάρχει αυξημένος κίνδυνος π.Χ. για τους μεταφορείς, αργότερα μελέτες που περιγράφονται λίγες

RAD51C

και

RAD51D

περικοπή μεταλλάξεις π.Χ. μόνο οικογένειες [13,27,28,18,24]. Αν και αυτές οι μεταλλάξεις φαίνεται να είναι πολύ σπάνια σε ασθενείς π.Χ., είναι πιθανώς υπεύθυνο για ορισμένες προδιάθεση BC. Οι καταγωγές των φορέων μετάλλαξης περιλαμβάνουν άλλες περιπτώσεις καρκίνου (του ενδομητρίου, λευχαιμία, του θυρεοειδούς), του οποίου η συνεργασία με τις μεταλλάξεις θα πρέπει να αναλυθούν με περισσότερες λεπτομέρειες.

Εντοπίσαμε επίσης τρεις σπάνιες αλλαγές εσφαλμένου νοήματος και στα δύο γονίδια (Πίνακας 2, S2 Τραπέζι). Μόνο η c.629C & gt? T, p.A210V σπάνια παραλλαγή εσφαλμένου νοήματος στο

RAD51D

γονίδιο είχε προβλεφθεί να είναι επιβλαβή συνέπεια σε όλα τα εργαλεία που χρησιμοποιούνται πρόβλεψη λογισμικού. Ωστόσο, παθογένεια της δεν μπορεί να επιβεβαιωθεί χωρίς περαιτέρω διαχωρισμό ή /και λειτουργικές αναλύσεις. Δυστυχώς, δεν ήμασταν σε θέση να εκτελέσει μια ανάλυση συν-διαχωρισμού σε άλλη οικογένεια συγγενείς.

Η διεισδυτικότητα για μεταλλάξεις σε μέτρια γονίδια διεισδυτικότητα δεν είναι εύκολο να εκτιμηθεί [29]. Αρχικά, Meindl et al. ανέφερε πλήρη διαχωρισμό των

RAD51C

μεταλλάξεις σε οικογένειες HBOC [8]. Περαιτέρω μελέτες εκτιμάται ότι ο σχετικός κίνδυνος (RR) της OC για τους μεταφορείς μετάλλαξη στο

RAD51C

(RR = 5,9) και

RAD51D

(RR = 6,3) [10,14]. Pelttari

et al

. ανακάλυψε μια αναλογία πιθανοτήτων (OR) για τις φινλανδικές ιδρυτικές μεταλλάξεις σε κάθε γονίδιο σε ένα μη επιλεγμένο πληθυσμό να είναι 6.3 και 7.1, αντίστοιχα [30,15]. Αυτά τα στοιχεία υποδηλώνουν ότι ο κίνδυνος OC υπερβαίνει το όριο για τη μέτρια γονίδια διεισδυτικότητα στο

RAD51C

και

RAD51D

μεταλλάξεις φορείς και τα δύο γονίδια έχουν κλινική σημασία για τις διαγνωστικές δοκιμές και τα προληπτικά μέτρα για τους μεταφορείς που αφορούν τόσο OC και τη διαχείριση π.Χ.. Περαιτέρω μελέτες και μετα-αναλύσεις των δημοσιευμένων στοιχείων από διάφορους πληθυσμούς σε όλο τον κόσμο καλούνται να εκτιμηθεί η διεισδυτικότητα στο

RAD51C

και

RAD51D

φορείς μετάλλαξης πειστικά.

Η κλινική χρησιμότητα της ταυτοποίηση του

RAD51C

και

RAD51D

φορείς μετάλλαξης δεν περιορίζεται στην πρόβλεψη της μόνο την ευαισθησία του καρκίνου. Και οι δύο πρωτεΐνες που εμπλέκονται σε σηματοδότηση βλάβης του DNA και επιδιόρθωση DDSB λειτουργικά συνεργαζόμενο με BRCA1 και BRCA2 σε διαδικασίες ομόλογου ανασυνδυασμού (HR). Μια αποτυχία αυτής της οδού επισκευής που θα μπορούσε να αναμένεται σε ασθενείς με καρκίνο που μεταφέρουν βλαστική παθογόνων μεταλλάξεων στο

RAD51C

και

RAD51D

ευαισθητοποιεί τα καρκινικά κύτταρα με αναστολείς PARP? Ως εκ τούτου, οι ασθενείς που φέρουν βλαστική

RAD51C

και

RAD51D

μεταλλάξεις μπορούν να επωφεληθούν από αυτή τη θεραπεία [14].

Εν κατακλείδι, μπορούμε περιγράφεται μυθιστόρημα παθογόνων παραλλαγές στο

RAD51C

και

RAD51D

και έδειξε ότι περικοπή μεταλλάξεις σε δύο γονίδια θα μπορούσαν να βρεθούν σε 3% των ασθενών Τσεχίας OC υψηλού κινδύνου. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι η έναρξη της OC σε φορείς μετάλλαξης θα μπορούσε να είναι νεότεροι από ό, τι αναμενόταν. Προτείνουμε ότι η ανάλυση μετάλλαξης του

RAD51C

και

RAD51D

θα πρέπει να εφαρμοστεί στην ολοκληρωμένη δοκιμή πάνελ πολλαπλών γονιδίων σε ασθενείς OC υψηλού κινδύνου. Ωστόσο, περαιτέρω μελέτες σε διάφορους πληθυσμούς μπορεί να βοηθήσει να βελτιώσει τις εκτιμήσεις των κλινικών επιπτώσεων για φορείς μετάλλαξης βλαστικής σειράς και να επιτρέψει τον προσδιορισμό του κατάλληλου ελέγχου, παρακολούθησης, ή στρατηγικές πρόληψης.

Υποστήριξη Πληροφορίες

S1 πίνακα . . PCR ακολουθίες αστάρι

Περίληψη των εκκινητών PCR που χρησιμοποιούνται για τον προσδιορισμό αλληλουχίας, cDNA και HRM αναλύσεις

doi:. 10.1371 /journal.pone.0127711.s001

(DOCX)

S2 πίνακα.

Στο silico

πρόβλεψη για παραλλαγές απουσίας.

Πρόβλεψη ανάλυση καθορίζει τις σπάνιες παραλλαγές εσφαλμένου νοήματος στο

RAD51C

και

RAD51D

γονίδια και η συχνότητα αυτών των παραλλαγών σε αλληλούχιση exome . και 1000 γονιδιώματα έργα

doi: 10.1371 /journal.pone.0127711.s002

(DOCX)

S3 πίνακα.

RAD51C

και

RAD51D

ακολουθία παραλλαγές που περιγράφονται

Προηγουμένως αλλοιώσεις (πολυμορφισμοί, εσονικές παραλλαγές) που βρέθηκε στη μελέτη μας

doi:.. 10.1371 /journal.pone.0127711.s003

(DOCX)

S4 πίνακα. Χαρακτηριστικά των ασθενών που φέρουν

RAD51D

παθογόνο μετάλλαξη

Ηλικίες από την έναρξη των 21 ασθενών OC και 15 ασθενείς π.Χ. μεταφέρουν

RAD51D

μεταλλάξεις σε μελέτες που έχουν δημοσιευθεί μέχρι στιγμής

doi:.. 10.1371 /journal.pone.0127711.s004

(DOCX)

Ευχαριστίες

Αφιερωμένο στη μνήμη του συναδέλφου μας και φίλο, Petr Pohlreich, ο οποίος απεβίωσε όταν το χειρόγραφο είχε γραφτεί.

Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε Marie Epsteinova και Marketa Dostalova για την άριστη τεχνική υποστήριξη και τους ασθενείς τους και τις οικογένειές τους για τη συμβολή σε αυτή τη μελέτη.

You must be logged into post a comment.