Αφηρημένο

Το

MDM2

πρωτο-ογκογονίδιο διαδραματίζει καίριο ρόλο στην κεντρική κυτταρικές διεργασίες όπως τον έλεγχο της ανάπτυξης και της απόπτωση, και ο τόπος του γονιδίου συχνά ενισχύεται σε σαρκώματα. Δύο πολυμορφισμοί βρίσκονται στην Ρ2 MDM2 προαγωγού έχει αποδειχθεί ότι επηρεάζουν τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Ένας από αυτούς τους πολυμορφισμούς (SNP309T & gt? G? Rs2279744) διευκολύνει Sp1 δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής στον προαγωγό και σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου. Σε αντίθεση, SNP285G & gt? C (rs117039649), που βρίσκεται 24 bp ανοδικά του rs2279744, και σε πλήρη ανισορροπία σύνδεσης με το αλληλόμορφο SNP309G, μειώνει Sp1 στρατολόγηση και μειώνει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Έτσι, λεπτή ρύθμιση της έκφρασης MDM2 έχει αποδειχθεί ότι είναι ιδιαίτερα σημαντικό σε σχέση με την καρκινογένεση. Αξιολογήσαμε τις πιθανές λειτουργικές επιπτώσεις της τρίτης

MDM2

Ρ2 προαγωγό πολυμορφισμός (SNP344T & gt? Α? Rs1196333) που βρίσκεται στο αλληλόμορφο SNP309T. Ενώ

in silico

αναλύσεις έδειξαν SNP344A να διαμορφώνει TFAP2A, SPIB και μεταγραφικού παράγοντα ΑΡ1 δεσμευτική, βρήκαμε καμία επίδραση της κατάστασης SNP344 στα επίπεδα έκφρασης MDM2. Η εκτίμηση της συχνότητας των SNP344A σε υγιείς Καυκάσιους (n = 2.954) και οι ασθενείς που πάσχουν από ωοθηκών (n = 1927), του μαστού (n = 1.271), του ενδομητρίου (n = 895) ή ο καρκίνος του προστάτη (n = 641), ανιχνεύσαμε καμία σημαντική διαφορά στην κατανομή αυτού του πολυμορφισμού μεταξύ οποιωνδήποτε από αυτές τις μορφές καρκίνου και υγιείς μάρτυρες (6,1% σε υγιείς ελέγχους, και 4,9%, 5,0%, 5,4% και 7,2% στις ομάδες του καρκίνου, αντίστοιχα). Εν κατακλείδι, τα ευρήματά μας παρέχουν καμία απόδειξη που δείχνει ότι SNP344A μπορεί να επηρεάσει τη μεταγραφή MDM2 ή κίνδυνο καρκίνου

Παράθεση:. Knappskog S, Gansmo LB, Romundstad P, Bjørnslett Μ, Trovik J, Sommerfelt-Pettersen J, et al. (2012)

MDM2

Ανάδοχος SNP344T & gt? Α (rs1196333) Κατάσταση δεν επηρεάζουν τον κίνδυνο καρκίνου. PLoS ONE 7 (4): e36263. doi: 10.1371 /journal.pone.0036263

Επιμέλεια: Klaus Roemer, Πανεπιστήμιο του Saarland, Γερμανία

Ελήφθη: 20 του Φεβρουαρίου, 2012? Αποδεκτές: 4 Απρίλη 2012? Δημοσιεύθηκε: 30 Απριλίου 2012 |

Copyright: © 2012 Knappskog et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το νορβηγικό Αντικαρκινική Εταιρεία και η νορβηγική Υγειονομικής Περιφέρειας Δυτικής. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Το διπλό Minute 2 ομόλογο ποντίκι (MDM2) αποτελεί βασικό ρυθμιστή της p53 καθώς και τη λειτουργία της πρωτεΐνης ρετινοβλάστωμα [1], [2], [3]. Έτσι, αυξημένα επίπεδα της πρωτεΐνης MDM2 λόγω

MDM2

γονιδιακή ενίσχυση ή άλλοι μηχανισμοί έχουν θεωρηθεί ως εναλλακτική λύση για

ΤΡ53

μεταλλάξεις μειώνεται λειτουργία ρ53 σε πολλούς ανθρώπινους καρκίνους [2], [4], . [5], [6], [7]

το 2004, η ομάδα Α Levine ανακάλυψε ένα πολυμορφισμό SNP309T & gt? G (rs2279744) στο

MDM2

εσονικές υποκινητή P2 [8] . SNP309G ενισχύει

MDM2

επίπεδα έκφρασης αυξάνοντας Sp1 μεταγραφικού παράγοντα δέσμευσης και στη συνέχεια φαίνεται να σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο και σε νεαρή ηλικία κατά τη διάγνωση διαφόρων κακοηθειών [8], [9], [10].

Αν και μεταγενέστερες μελέτες έχουν επιβεβαιώσει τη σύνδεση μεταξύ SNP309G και τον κίνδυνο πολλαπλών μορφών καρκίνου, η επίδραση αυτού του SNP φαίνεται να διαφέρουν μεταξύ των εθνοτικών ομάδων: Έτσι, ενώ οι περισσότερες μελέτες που πραγματοποιήθηκαν σε χώρες της Ασίας ή καταγωγής Ασκενάζι πληθυσμούς αναφέρει την παραλλαγή SNP309G να . να ενισχύσει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου πολλές μελέτες που διεξήχθησαν σε Καυκάσιους πληθυσμούς απέτυχαν να αναπαράγουν ένα παρόμοιο αποτέλεσμα [11], [12]

Πρόσφατα, αναφέρθηκε μια δεύτερη πολυμορφισμός, SNP285G & gt? C (rs117039649), που βρίσκεται 24 ζεύγη βάσεων από SNP309 στο

MDM2

υποκινητή Ρ2. Το αλληλόμορφο παραλλαγή SNP285C παρατηρείται μεταξύ μόνο Καυκάσιους, το οποίο αποτελεί μια ξεχωριστή SNP285C /309G απλότυπος αντιπροσωπεύοντας περίπου το 12% των αλληλόμορφων SNP309G [13]. SNP285C ανταγωνίζεται το αποτέλεσμα του με μείωση SNP309G Sp1 δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής αντοχή στο

MDM2

προαγωγέα και σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο για καρκίνο του μαστού, των ωοθηκών και του ενδομητρίου [13], [14].

στο σύνολό τους, τα δεδομένα από τις μελέτες για SNP309 και SNP285 υποδεικνύουν έντονα μικρορύθμιση

MDM2

δραστηριότητα Ρ2 προαγωγό να έχουν σημασία για τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Συνεπώς, είναι ενδιαφέρον να αναζητήσετε πρόσθετες παραλλαγές στο

MDM2

υποκινητή που μπορεί να συμβάλει στην αλλαγμένη κίνδυνο καρκίνου

SNP344T & gt?. Α (rs1196333), που βρίσκεται 35 ζεύγη βάσεων καθοδικά του SNP309, ήταν εντοπίστηκαν αρχικά από Bond et al [8] σε 4 από 50 υγιή άτομα. Εδώ, σας παρουσιάζουμε την πρώτη έκθεση για την αξιολόγηση των επιπτώσεων της κατάστασης SNP344 στην έκφραση MDM2, καθώς και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε μεγάλους πληθυσμούς. Έτσι, έχουμε εξετάσει τις επιπτώσεις της σχετικά με τον κίνδυνο των ωοθηκών, του μαστού, του ενδομητρίου και του καρκίνου του προστάτη, και μελέτησε τις ίδιες ομάδες ασθενών για τους οποίους τα προφίλ κινδύνου που συνδέονται με SNP309T & gt? G και SNP285G & gt? C έχουν προηγουμένως αναλυθεί λεπτομερώς [13], [14].

Υλικά και Μέθοδοι

MDM2

η SNP344 υποστηρικτής ελέγχου κατάστασης

Μια περιοχή του

MDM2

Ρ2 προαγωγό που περιέχει SNP344 (καθώς και SNP285 και SNP309) προηγουμένως ενισχύθηκε με PCR, η αλληλουχία και αναλύθηκαν για SNP285 και το καθεστώς SNP309 [13], [14]. Εδώ, τα ίχνη αυτά ακολουθία αναλύθηκαν για την κατάσταση SNP344.

Στο silico

προβλέψεις

Οι προβλέψεις των πιθανών θέσεων δέσμευσης μεταγραφής στο

MDM2

υποστηρικτής επηρεάζονται από κατάσταση SNP344 διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων JASPAR στο https://jaspar.genereg.net [15]. ακολουθίες εισόδου για τις προβλέψεις ήταν

tgcctgtcgggtca

για την SNP344T-αλληλόμορφο και

tgcctgacgggtca

για την SNP344A-αλληλόμορφο. Προφίλ κατώφλι βαθμολογίας τέθηκαν στο 80% (προεπιλεγμένες ρυθμίσεις).

έκφραση MDM2 ανάλυση

Το συνολικό RNA εξήχθη από τα λευκά κύτταρα του αίματος που λαμβάνεται από 215 νεαρούς άνδρες ως μέρος μιας εξέτασης ρουτίνας κατά τη διάρκεια της υποχρεωτικής στράτευσης στην το Ναυτικό [13] χρησιμοποιώντας το αντιδραστήριο ΤπζοΙ (τεχνολογίες Life) σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή, και διαλύθηκε σε επεξεργασμένο με DEPC αναπτυξιακής δυσπλασίας του ισχίου

2O.

σύνθεση Single cDNA κλώνου πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας 500 ng ολικού RNA, ολίγο-άΤ – και τυχαία εξαμερών εκκινητών (Sigma) με Transcriptor ανάστροφης μεταγραφάσης (Roche) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Μετά RT-PCR το cDNA αραιώθηκε 1:10 σε αναπτυξιακής δυσπλασίας του ισχίου

2O.

Ποσοτική PCRs για τα συνολικά επίπεδα έκφρασης MDM2, MDM2 υποκινητής 2 ειδική έκφραση και RPLP2 (εσωτερική αναφορά) διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας Υδρόλυση ανιχνευτές ( TIB MOLBIOL) σε ένα όργανο Ligthcycler 480 (Roche). Οι ακόλουθοι εκκινητές χρησιμοποιήθηκαν: MDM2_F? aacatgtacctactgatggtgc, MDM2_R? cagggtctcttgttccgaagc, MDM2_TM? 6FAM-aaccacctcacagattcc-μπάρμπεκιου, MDM2P2_S? gcgattggagggtagacctgt, MDM2P2_R: ggtattgcacatttgcctggat, MDM2P2_TM? 6FAM-agtggcgtgcgtccgtgcc-μπάρμπεκιου, RPLP2_F? gaccggctcaacaaggttat, RPLP2_A? ccccaccagcaggtacac και RPLP2_TM? 6FAM-agctgaatggaaaaaacattgaagacgtc-μπάρμπεκιου. Εκτελέστηκαν ενισχύσεις σε όγκο αντίδρασης 10 μΙ με τη χρήση του κιτ Probes κύριο LigthCycler® 480 (Roche) με 0,5 μΜ του προς τα εμπρός και αντίστροφο εκκινητή, 0125 μΜ από κάθε ανιχνευτή υδρόλυσης και 3 cDNA μλ. Οι συνθήκες θερμικού κύκλου ήταν: 5 min αρχική μετουσίωση στους 95 ° C, πριν από 45 κύκλους στους 95 ° C για 10 s και στους 55 ° C για 20 s, και ένα τελικό στάδιο ψύξης στους 40 ° C για 10 s. Σχετικές συγκεντρώσεις ΜΌΜ2 mRNA υπολογίστηκαν με βάση το διοικούμενο πρότυπες καμπύλες και κανονικοποίηση σε επίπεδα RPLP2 mRNA στα ίδια δείγματα. Το νερό που περιλαμβάνονται σε κάθε τρέξει ως αρνητικός έλεγχος και όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν εις τριπλούν τρεξίματα.

Υγιεινή Καυκάσου ελέγχους

Η κατανομή των

MDM2

SNP344 μεταξύ των ασθενών με καρκίνο συγκρίθηκε με 2954 Norwegian υγιείς μάρτυρες. Οι έλεγχοι έχουν περιγραφεί λεπτομερώς προηγουμένως [13], [14].

αφροαμερικάνων άτομα

DNA από αφροαμερικάνων άτομα (n = 50) αγοράστηκε από Coriell Ινστιτούτο Ιατρικής Έρευνας ( Cat # HD50AA).

οι ασθενείς με καρκίνο

ωοθηκών (n = 1.927), του μαστού (n = 1.271), του ενδομητρίου (n = 895) και ασθενείς με καρκίνο του προστάτη (n = 641) ήταν από την ομάδες ασθενών που είχαν προηγουμένως αναλυθεί για

MDM2

SNP285 και SNP309 [13], [14].

Εκτιμήσεις

Ηθική

Συλλογή και χρήση των δειγμάτων από ασθενείς με καρκίνο και των υγιών μαρτύρων , καθώς και ο έλεγχος για την έκφραση αναλύσεις, εγκρίθηκε από τις Περιφερειακές Ηθική επιτροπές της Δυτικής Νορβηγίας (Haukeland Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο), Κεντρική Νορβηγία (νορβηγικό Πανεπιστήμιο Επιστήμης και Τεχνολογίας), και τη Νοτιοανατολική Νορβηγία (Όσλο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Radiumhospitalet? Norwegian δείγματα) και τα Ηθικά επιτροπές Ιατρικής του Ιατρικού Κέντρου του Πανεπιστημίου του Leiden, Leiden, Ολλανδία, και το Erasmus MC-Daniel den Hoed Κέντρο Καρκίνου του Ρότερνταμ, Ολλανδία (ολλανδικά δείγματα). Όλοι οι συμμετέχοντες έδωσαν γραπτή συγκατάθεση.

Η στατιστική ανάλυση

Τα επίπεδα έκφρασης της MDM2 μεταξύ των ατόμων με διαφορετικούς γονότυπους των SNP344 συγκρίθηκαν χρησιμοποιώντας το τεστ κατάταξης Mann-Whitney. Μεταξύ των ατόμων για τα οποία η έκφραση ΜΌΜ2 αναλύθηκε (n = 215), ένα έφερε το γονότυπο SNP344AA. Για στατιστικούς υπολογισμούς, το άτομο αυτό συμπεριλήφθηκε στην ομάδα SNP344TA και σε σύγκριση με την ομάδα SNP344TT.

πιθανές διαφορές στην κατανομή των SNP344 μεταξύ ασθενών με καρκίνο και των υγιών μαρτύρων, καθώς και μεταξύ των υποομάδων της κάθε μορφής καρκίνο αξιολογήθηκαν με ποσοστά πιθανοτήτων (OR) και από το Fischer exact test. Οι ΕΑΠ δίνονται με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (CI).

Πιθανές διαφορές στην ηλικία έναρξης της νόσου μεταξύ των ασθενών που αξιολογήθηκαν από δοκιμές κατάταξης Kruskal-Wallis.

Η επιβίωση αξιολογήθηκε με Kaplan- Meier αναλύσεις, όπου οι διαφορετικές ομάδες ασθενών συγκρίθηκαν χρησιμοποιώντας το τεστ log rank? θανάτους για λόγους άλλους εκτός από τον καρκίνο του μαστού είχαν λογοκριθεί.

Όλες οι p-τιμές είναι δύο όψεων, και p-τιμές εκτιμάται από Fischer ακριβή τεστ είναι αθροιστικές. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του SPSS /PASW (έκδοση 15.0.1 και 17) πακέτο λογισμικού

Αποτελέσματα

SNP344:. Απλότυπου κατάστασης και των εθνοτικών

διανομή

SNP344 (rs1196333 ) βρίσκεται μέσα στο

MDM2

Ρ2 προαγωγό, 344 bps κατάντη του εξονίου 1 (Σχήμα 1). Μεταξύ 2954 υγιείς νορβηγικές ελέγχους, παρατηρήσαμε την SNP344A-παραλλαγή σε 181 άτομα (6,1%). Ένα άτομο έφερε το ομόζυγο γονότυπο SNP344AA, ενώ 180 ήταν ετερόζυγα (SNP344TA? Πίνακας 1). Έτσι, ο ανήλικος συχνότητα αλληλόμορφο ήταν 3,1%, και η κατανομή των γονότυπων ήταν σύμφωνα με την ισορροπία Hardy-Weinberg.

(Α) Ο προαγωγός βρίσκεται ανάμεσα εξόνιο 1 και 2 του

MDM2

γονιδίων και λιμάνια SNP285 (rs117039649), SNP309 (rs2279744) και SNP344 (1.196.333). (Β) αντιπροσωπευτικό χρωματογράφημα αλληλούχισης από ένα άτομο ετερόζυγο για SNP344 (αλληλουχία έδειξε η αντίστροφη συμπληρωματική με τον κλώνο νοήματος).

Η

Αξιοσημείωτα, παρατηρήσαμε την SNP344A-παραλλαγή μόνο μεταξύ των ατόμων που φέρουν το SNP309TT ή TG γονότυπο, ισχυρά υποδεικνύοντας SNP344A να βρίσκεται στην SNP309T-αλληλόμορφο, καθιστώντας μια ξεχωριστή SNP309T /344Α απλότυπος (ρ & lt? 1 × 10

-10). Περαιτέρω, δεδομένου ότι SNP285C βρίσκεται στην SNP309G-αλληλόμορφο, μπορεί κανείς να συμπεράνει ότι η SNP344A υπάρχουν μόνο στον απλότυπο SNP285G /309T /344Α.

Σε μια σειρά αφρικανικών Αμερικανών (n = 50), βρήκαμε 17 (34 %) άτομα στο λιμάνι SNP344A (ένα ομόζυγο και 16 ετερόζυγο). Αυτή η συχνότητα ήταν σημαντικά υψηλότερη σε σύγκριση με τη συχνότητα που παρατηρείται μεταξύ των Καυκάσιων (ρ & lt? 0.001). Αξίζει να σημειωθεί ότι, η κατανομή των SNP344 μεταξύ των αφρικανικών Αμερικανών ήταν σύμφωνη με τα περιορισμένα δεδομένα σχετικά με αυτό το SNP παρουσιάζονται στη βάση δεδομένων Ensembl. Όσο για τους Καυκάσιους, βρήκαμε την SNP344A-αλληλόμορφο μόνο μεταξύ των αφρικανικών Αμερικανών που φιλοξενεί το SNP309T-αλληλόμορφο.

Επίδραση της κατάστασης SNP344 στις δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής

Για να αξιολογηθεί ο πιθανός αντίκτυπος της κατάστασης SNP344 επί δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής, εκτελέσαμε

in silico

αναλύσεις χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων JASPAR [15], η πρόβλεψη δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής στο SNP344T και Α-αλληλόμορφα. Χρησιμοποιώντας το SNP344T-αλληλόμορφο αλληλουχία «φυσικού τύπου» και ένα όριο βαθμολογίας προφίλ του 80% (προεπιλεγμένες ρυθμίσεις) κατά την αναζήτηση της βάσης δεδομένων, δύο θέσεων σύνδεσης παράγοντα μεταγραφής ταυτοποιήθηκαν συμπεριλαμβανομένης της θέσης του SNP344: μία θέση σύνδεσης για TFAP2A και ένα για SPIB (Πίνακας 2). Όταν αντικαθιστώντας το SNP344T με την Α-παραλλαγή, η προβλεπόμενη δύναμη πρόσδεσης του TFAP2A ήταν ελαφρώς αυξημένη, ενώ η θέση για την SPIB διαταράχθηκε. Επιπλέον, η εισαγωγή του Α δημιουργείται μία νέα θέση δέσμευσης για ΑΡ1. Έτσι, η αποτελεσματικότητα της μεταγραφής από τον Α-αλληλόμορφο, σε σύγκριση με το Τ-αλληλόμορφο, θα μπορούσε είτε να μειωθούν λόγω μιας διαταράσσεται θέση SPIB ή αυξηθεί λόγω της ενισχυμένης δέσμευσης του TFAP2A και μία νέα θέση ΑΡ1.

Η

επίπεδα SNP344 κατάσταση και MDM2 έκφραση

για να εκτιμηθεί ο πιθανός αντίκτυπος των SNP344 γονότυπου στην έκφραση MDM2, αναλύσαμε τα επίπεδα ΜΌΜ2 mRNA σε λευκοκύτταρα από μια υποομάδα 215 υγιείς νέους άνδρες με qPCR. Καμία διαφορά στο επίπεδο έκφρασης MDM2 μεταξύ των ατόμων που φιλοξενεί το SNP344AA (n = 1), 344TA (n = 10) ή 344TT (n = 204) γονότυπους καταγράφηκε (p & gt? 0.5 Εικόνα 2Α)

Box-οικόπεδα. εκπροσωπούν μετατραπεί καταγραφής σχετικά επίπεδα του συνολικού mRNA MDM2 (Α) και Ρ2 προαγωγό ειδικό mRNA (Β) σε άτομα που φέρουν το γονότυπο SNP344TT έναντι των γονότυπους τΑ και ΑΑ.

η

Δεδομένου ότι η SNP344A-παραλλαγή κατοικεί στο αναλύσεις SNP309T αλληλόμορφο, πραγματοποιήσαμε ξεχωριστή υπο-ομάδας περιορίζεται σε άτομα που φέρουν το SNP309TG (n = 101) ή 309TT (n = 75) γονότυπο. Δεν παρατηρήθηκε διαφορά στο επίπεδο έκφρασης ΜΌΜ2 που σχετίζονται με την κατάσταση SNP344 καταγράφηκε σε οποιαδήποτε από αυτές τις υποομάδες (ρ & gt? 0,4)

Δεδομένου ότι μπορεί κανείς να υποθέσει ότι η κατάσταση SNP344 επηρεάζει μόνο την έκφραση ΜΌΜ2 από Ρ2 προαγωγό, στο οποίο το SNP είναι εντοπισμένη, και ότι το αποτέλεσμα αυτής της SNP μπορεί να καλυφθεί σε προσδιορισμούς ανάλυση των συνολικών επιπέδων έκφρασης MDM2, εκτελέσαμε παρόμοια πειράματα qPCR όπως περιγράφηκε παραπάνω, αλλά συγκεκριμένα για mRNA που προέρχονται από Ρ2 προαγωγέα. Καμία συσχέτιση μεταξύ της κατάστασης SNP344 και Ρ2 προαγωγό ειδική έκφραση παρατηρήθηκε (p & gt? 0,5).

Κατάσταση SNP344 και του καρκίνου

κινδύνου

Για να αξιολογήσει τις πιθανές επιπτώσεις της κατάστασης SNP344 στον κίνδυνο καρκίνου, εμείς συγκριθεί η συχνότητα του SNP344 παραλλαγών μεταξύ των ωοθηκών (n = 1927), του μαστού (n = 1.271), του ενδομητρίου (n = 895) και ασθενείς με καρκίνο του προστάτη (n = 641) σε υγιείς μάρτυρες (n = 2.954). Τα αποτελέσματα συνοψίζονται στον Πίνακα 1. Βρήκαμε σημαντικές διαφορές μεταξύ της συχνότητας του SNP344A σε οποιαδήποτε από τις αναλύθηκαν ομάδων του καρκίνου και των υγιών μαρτύρων.

Δεδομένου ότι SNP344A συνδέθηκε με την SNP309T-αλληλόμορφο, όπως περιγράφεται παραπάνω , τα άτομα που φέρουν το γονότυπο SNP309GG μπορεί να λογοκρίνεται ως μη κατατοπιστική σε σχέση με την επίδραση της SNP344. Ως εκ τούτου, αξιολόγησε τον αντίκτυπο της SNP344 στον κίνδυνο καρκίνου μεταξύ των ατόμων που φιλοξενούν SNP309T-αλληλόμορφο μόνο (SNP309TG ή ΤΤ γονότυπο? Πίνακας 3). Εμείς δεν βρήκε καμία συσχέτιση μεταξύ της κατάστασης SNP344 και οποιαδήποτε από τις μορφές καρκίνου ανάλυση των μεταφορέων SNP309TG και 309TT ξεχωριστά ή σε συνδυασμό (Σχήμα 3).

οικόπεδο Forrest δείχνει την επίδραση της SNP344A σχετικά με τον κίνδυνο των ωοθηκών, του μαστού, του ενδομητρίου και καρκίνος του προστάτη, σε σύγκριση με υγιείς μάρτυρες, μεταξύ των ατόμων που φέρουν το γονότυπο SNP309TG (Α), ο γονότυπος SNP309TT (Β) και οι γονότυποι TG και ΤΤ σε συνδυασμό (C).

η

SNP344 κατάσταση και κλινικές παραμέτρους

Εμείς αξιολογούνται περαιτέρω τις πιθανές επιπτώσεις της κατάστασης SNP344 σε αρκετές κλινικές παραμέτρους μεταξύ των ασθενών που περιλαμβάνονται στις συγκρίσεις περίπτωση-ελέγχου που περιγράφονται παραπάνω.

τα στοιχεία για την ηλικία έναρξης της νόσου ήταν διαθέσιμες για όλα ενδομητρίου (n = 895) και ασθενείς με καρκίνο του προστάτη (n = 641) καθώς επίσης και μεγάλες υπο-ομάδες του μαστού (n = 1.173) και σε ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών (n = 761). Εμείς δεν βρήκε καμία επίδραση της SNP344-κατάσταση με την ηλικία έναρξης είτε από τις τέσσερις μορφές καρκίνου κατά τη σύγκριση των συνολικών ομάδες ασθενών για κάθε μορφή καρκίνου ή υποομάδες κατανεμημένες ανάλογα με SNP309-κατάσταση (όλα τα p-τιμές & gt? 0,15).

Μεταξύ των ασθενών με καρκίνο του μαστού που αναλύθηκαν, πολλοί ήταν εγγεγραμμένοι σε προοπτικές μελέτες με στόχο τον εντοπισμό γενετικών μηχανισμών αντίστασης στη χημειοθεραπεία? n = 106 από δύο μελέτες αξιολόγησης είτε δοξορουβικίνη μονοθεραπεία ή ένα συνδυασμό σχημάτων 5-φθοριοουρακίλη /μιτομυκίνη [16], [17], ενώ n = 201 ελήφθησαν από μια μελέτη randomizing μεταξύ epirubicin και με μονοθεραπεία με paclitaxel [18], [19]. Έτσι, για αυτούς τους ασθενείς που είχαν λεπτομερή αρχεία για την αντικειμενική ανταπόκριση στη θεραπεία στην νεοεπικουρική. κατάσταση SNP344 δεν επηρέασε απάντηση είτε φάρμακα που βλάπτουν το DNA (δοξορουβικίνη, μιτομυκίνη) ή άξονα δηλητήριο (πακλιταξέλη? p & gt? 0,1 για όλες τις συγκρίσεις) σε αυτές τις μελέτες, αν και το συμπέρασμα εδώ μπορεί να είναι αβέβαιο, λόγω του περιορισμένου αριθμού των SNP344A-αλληλόμορφα παρατηρούνται. Η πιθανή επίδραση της κατάστασης SNP344 σε ελεύθερη υποτροπής ή συνολική επιβίωση θα μπορούσε να αξιολογηθεί σε αυτές τις μελέτες, λόγω του περιορισμένου αριθμού των ατόμων που φιλοξενεί το 344Α-αλληλόμορφο.

Σε μια προηγούμενη μελέτη, βρήκαμε κατάσταση MDM2 SNP285 να συσχετίζονται στο στάδιο στο ενδομητρίου καρκινώματα [14]. Εδώ, δεν υπάρχει συσχέτιση μεταξύ σταδίου ΦΥΓΩ και την κατάσταση SNP344 καταγράφηκε. (Όλες οι τιμές p & gt? 0,3).

Συζήτηση

MDM2 είναι ένας σημαντικός παράγοντας που ρυθμίζει την κυτταρική ομοιόσταση μέσω της στενής αλληλεπίδρασης με πρωτεΐνες όπως η p53, pRB και E2F1. Έτσι, MDM2 ελέγχει έχουν διαδικασίες όπως διακοπή αύξησης, απόπτωση και γήρανση, και ενίσχυση γονιδίου MDM2 και ενισχυμένη μετάφραση παρατηρηθεί σε πολλές μορφές όγκων [2], [4], [5], [6], [7].

η σημασία της έκφρασης MDM2 στην πρόληψη ανάπτυξης καρκίνου υπογραμμίζεται περαιτέρω από το εύρημα ότι το

MDM2

υποκινητή Ρ2 SNPs 285 και 309 και τα δύο διαμορφώνουν δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής και επηρεάζουν τον κίνδυνο πολλών μορφών καρκίνου [8], [11], [13], [14]. Ενώ ο ακριβής μηχανισμός για την έναρξη της μεταγραφής από το

MDM2

Ρ2 προαγωγού δεν είναι γνωστό, αυτός ο προαγωγός ενεργοποιείται σε απόκριση σε κυτταρικό στρες, και εκτός από Sp1, Ρ2 τρέφει θέσεις σύνδεσης για πολλούς παράγοντες μεταγραφής συμπεριλαμβανομένης ρ53, ο υποδοχέα οιστρογόνου, ΑΡ1 [8], [14], καθώς και διάφορα άλλα (πρόβλεψη από τη βάση δεδομένων JASPAR? δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

SNP344T & gt? Α είναι το τρίτο

MDM2

προαγωγό Ρ2 πολυμορφισμό . Αντίθετες SNP285C, το οποίο βρίσκεται στο αλληλόμορφο SNP309G, SNP344A κατοικεί στο αλληλόμορφο SNP309T. Εδώ, θα πραγματοποιηθεί

in silico

δύναμη δέσμευσης του μεταγραφικού παράγοντα πρόβλεψης αξιολόγηση και προσδιορίζεται η επίδραση της κατάστασης SNP344 στα επίπεδα μεταγραφής MDM2 στα λεμφοκύτταρα. Ενώ SNP344 βρέθηκε να επηρεάζουν τη σύνδεση των παραγόντων μεταγραφής TFAP2A, SPIB και ΑΡ1, καμία επίδραση της κατάστασης SNP344 για MDM2 μεταγραφή καταγράφηκε. Είναι σημαντικό ότι, η αξιολόγηση της κατανομής ενός SNP344 σε μια μεγάλη ομάδα υγιών ατόμων και μεταξύ των ασθενών που πάσχουν από ωοθηκών, του μαστού, του ενδομητρίου και του καρκίνου του προστάτη, εμείς δεν ανίχνευσε διαφορές σε σχέση με τη διανομή SNP344 μεταξύ υγιών ατόμων και ασθενών με καρκίνο. Ενώ η μελέτη μας περιελάμβανε έναν περιορισμένο αριθμό μορφών καρκίνου, για τρεις από αυτούς τους καρκίνους (μαστού, ωοθηκών τέλος ενδομήτριο) η παραλλαγή SNP285C έχει προηγουμένως δειχθεί ότι επηρεάζουν ατομικός κίνδυνος κατά τον ίδιο καταγωγής πληθυσμού [13], [14]. Έτσι, αυτές οι κακοήθειες αποτελούν κατάλληλες μορφές καρκίνου ώστε να εντοπίζονται τυχόν πιθανές επιπτώσεις της κατάστασης SNP344 στον κίνδυνο της νόσου

Αντιθέσεις η SNP285G & gt?. C πολυμορφισμός που ανιχνεύεται μεταξύ των Καυκασίων μόνο [13], SNP344A, παρόμοια με SNP309G, φαίνεται να είναι ένα αρχαίο πολυμορφισμός που είναι επίσης παρούσα στους Αφρικανούς. Είναι ενδιαφέρον ότι, η κατανομή της παραλλαγής αλληλόμορφου SNP309G, αλλά και SNP344A, φαίνεται να ποικίλλει μεταξύ των διαφόρων εθνοτικών ομάδων. Ενώ η συχνότητα του αλληλόμορφου SNP309G κυμαίνεται από -10% σε Αφρικανούς να -40% στους Καυκάσιους και -50% στους Ασιάτες [12], η συχνότητα του αλληλόμορφου SNP344A είναι περίπου 18% σε Αφρικανούς, αλλά 3% μόνο σε Καυκάσιους. Αυτή η διαφορά στην εθνική κατανομή, σε συνδυασμό με την ταχεία εξάπλωση των νέων πολυμορφισμού SNP285C μεταξύ των Καυκασίων [20], δείχνει ότι και οι τρεις

MDM2

πολυμορφισμοί Ρ2 προαγωγός μπορεί να υπόκειται σε εξελικτική επιλογή κάτω από διαφορετικές συνθήκες διαβίωσης. Έτσι, περαιτέρω έρευνες διαλεύκανση πιθανές επιπτώσεις της SNP344 σε βιολογική λειτουργία, εκτός από τις μορφές καρκίνου που αναφέρονται εδώ μπορεί να είναι δικαιολογημένη.

Ευχαριστίες

Οι περισσότερες από τις εργασίες που εκτελούνται στο Mohn Cancer Research Laboratory. Ευχαριστούμε Beryl Leirvaag, Elise de Faveri, Gjertrud Τ Iversen, Nhat Kim Duong και Hildegunn Helle για τεχνική βοήθεια. Ευχαριστούμε επίσης την ιατρική υπηρεσία, Βασιλικό Νορβηγικό Ναυτικό και την ιατρική υπηρεσία νορβηγική Άμυνας για τη διευκόλυνση της συλλογής δειγμάτων. Οι κλινικοί ερευνητές στη νορβηγική Breast Cancer Ομάδα δίκη NBCG VI είναι όπλο Anker, Τμήμα Ογκολογίας, Haukeland Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο? Bjorn Østenstad, Τμήμα Ογκολογίας, Ullevaal Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο? Steinar Lundgren, Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο St.Olav του? Terje Risberg, Τμήμα Ογκολογίας, Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Βόρειας Νορβηγίας? και Ingvil Mjaaland, Τμήμα Αιματολογίας και Ογκολογίας, Stavanger Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο.