Αφηρημένο

Ο καρκίνος του παγκρέατος είναι η κύρια αιτία θανάτου από στερεά κακοήθειες σε όλο τον κόσμο. Επί του παρόντος, gemcitabine είναι το μόνο φάρμακο εγκριθεί για τη θεραπεία του καρκίνου του παγκρέατος. Ανάπτυξη νέων θεραπευτικά φάρμακα για τη νόσο αυτή είναι, ως εκ τούτου, επιτακτική ανάγκη. Το έργο C-Χάρτης προσέφερε έναν πλούτο των δεδομένων γονιδιακής έκφρασης που μπορεί να εξορυχθεί για την επανατοποθέτηση των ναρκωτικών, μια πολλά υποσχόμενη προσέγγιση για την νέα ανακάλυψη φαρμάκων. Τυπικά, ένα φάρμακο θεωρείται δυνητικά χρήσιμες για τη θεραπεία μιας νόσου, εάν το προφίλ γονιδιακής έκφρασης απόκλιση που προκαλείται από φάρμακα συσχετίζεται αρνητικά με τα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια στην ασθένεια-στόχο. Ωστόσο, πολλές από τις δυνητικά χρήσιμα φάρμακα (PUDs) που προσδιορίζονται από το γονίδιο προφίλ έκφρασης συσχετισμός είναι πιθανό ψευδώς θετικά επειδή, σε C-MAP, τα καλλιεργημένα κυτταρικές γραμμές στις οποίες εφαρμόζεται δεν προέρχονται από νοσούντες ιστούς το φάρμακο. Για να λυθεί αυτό το πρόβλημα, έχουμε αναπτύξει μια συνδυασμένη προσέγγιση για την πρόβλεψη υποψήφια φάρμακα για την θεραπεία του καρκίνου του παγκρέατος. Εμείς εντοπίστηκε για πρώτη φορά PUDs για τον καρκίνο του παγκρέατος με τη χρήση συσχέτιση της έκφρασης C-Map-με βάση το γονίδιο αναλύσεις. Στη συνέχεια εφαρμόζεται ένα αλγόριθμο (Met-express) για να προβλέψει το κλειδί του καρκίνου του παγκρέατος (KPC) ένζυμα που εμπλέκονται στο μεταβολισμό του καρκίνου του παγκρέατος. Τέλος, έχουμε επιλέξει τους υποψηφίους από τις PUDs απαιτώντας ότι οι στόχοι τους είναι ένζυμα KPC ή τα υποστρώματα /προϊόντα των ενζύμων KPC. Χρησιμοποιώντας αυτήν την συνδυασμένη προσέγγιση, είχαμε προβλέψει επτά υποψήφια φάρμακα για τη θεραπεία του καρκίνου του παγκρέατος, τρία από τα οποία υποστηρίζονται από τη λογοτεχνία αποδεικτικά στοιχεία, και τρία πειραματικά επικυρωμένη να είναι ανασταλτική για παγκρεατικό καρκίνο celllines

Παράθεση:. Ma Υ, Χου J , Ζανγκ Ν, Dong Χ, Li Υ, Yang Β, et al. (2016) Πρόβλεψη των υποψήφιων φαρμάκων για την αντιμετώπιση του καρκίνου του παγκρέατος με τη χρήση μια συνδυασμένη προσέγγιση. PLoS ONE 11 (2): e0149896. doi: 10.1371 /journal.pone.0149896

Επιμέλεια: Aamir Ahmad, Πανεπιστήμιο της Νότιας Αλαμπάμα Mitchell Ινστιτούτο Καρκίνου, Ηνωμένες Πολιτείες