Αφηρημένο

Στόχοι

Εμείς ως στόχο να καθορίσει τις ενώσεις των γενετικών πολυμορφισμοί της επισκευής εκτομή ομάδα cross-συμπλήρωση 1 (

ERCC1

) rs11615, ομάδα pigmentosum ξηροδερμίας D (

XPD

/

ERCC2)

rs13181, X-ray σταυρό επισκευής ομάδα που συμπληρώνει 1 (

ΧΚΧΧ1

) rs25487,

XRCC3

rs1799794, και του μαστού ευαισθησία του καρκίνου του γονιδίου 1 (

BRCA1

) rs1799966 από την οδό επιδιόρθωσης του DNA και ανθεκτικότητα σε πολλά φάρμακα 1 (

MDR1 /ABCB1

) rs1045642 με ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία και την επιβίωση των μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) σε ένα κινεζικό πληθυσμό.

Υλικά και Μέθοδοι

ένα σύνολο 352 NSCLC ασθενείς εντάχθηκαν για την αξιολόγηση των ενώσεων των έξι SNPs με ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία και η συνολική επιβίωση. Λογιστικών παλινδρομήσεων εφαρμόστηκαν για τη δοκιμή των ενώσεων των γενετικών πολυμορφισμών με την ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία σε 161 ασθενών με προχωρημένο NSCLC. Συνολική επιβίωση αναλύθηκε σε 161 προηγμένες και 156 ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Kaplan-Meier με δοκιμασία log-rank, αντίστοιχα. Η πολυπαραγοντική Cox μοντέλο αναλογικών κινδύνων διεξήχθη για να προσδιορίσει τους παράγοντες που σχετίζονται ανεξάρτητα με NSCLC πρόγνωση.

Αποτελέσματα

BRCA1

rs1799966 έλασσον αλληλόμορφο C (TC + ​​CC

vs.

TT, OR = 0,402, 95% CI = 0,204 – 0,794, p = 0,008) και

MDR1 /ABCB1

rs1045642 έλασσον αλληλόμορφο Α (GA + ΑΑ

vs.

GG, Ή = 0,478, 95% CI = 0,244 – 0,934, p = 0.030) σχετίστηκαν με καλύτερη ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία σε ασθενείς με προχωρημένο NSCLC. Οι αναλύσεις επιβίωσης έδειξε ότι το

BRCA1

rs1799966 TC + CC γονότυπους συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο θανάτου (HR = 0,617, 95% CI = 0,402 – 0,948, p = 0,028) σε ασθενείς με προχωρημένο NSCLC, και η ένωση ήταν εξακολουθεί να είναι σημαντική μετά την προσαρμογή ως προς συμπαράγοντες. Η πολυπαραγοντική Cox ανάλυση παλινδρόμησης έδειξε ότι

ERCC1

rs11615 ΑΑ γονότυπο (

P

= 0,020) και το κάπνισμα (p = 0,037) συσχετίστηκαν με αυξημένο κίνδυνο θανάτου σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC μετά την επέμβαση.

Συμπεράσματα

Οι πολυμορφισμοί των γονιδίων στην οδό επιδιόρθωσης του DNA και

MDR1

θα μπορούσε να συμβάλει στην αντιμετώπιση χημειοθεραπεία και την επιβίωση των ασθενών με NSCLC

Παράθεση:. Du Υ, Su Τ, Zhao L, Tan Χ, Chang W, Zhang H, et al. (2014) Ενώσεις των πολυμορφισμών στα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA και MDR1 Gene με χημειοθεραπεία απόκρισης και την επιβίωση των μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα. PLoS ONE 9 (6): e99843. doi: 10.1371 /journal.pone.0099843

Επιμέλεια: Xiaoping Miao, MOE Βασικά Εργαστήριο Περιβάλλοντος και Υγείας, τη Σχολή Δημόσιας Υγείας, Tongji Medical College, Huazhong Πανεπιστήμιο Επιστήμης και Τεχνολογίας, η Κίνα

Ελήφθη: 17 Απριλίου 2014? Αποδεκτές: 19 Μαΐου, 2014? Δημοσιεύθηκε: 16 Ιουνίου, 2014

Copyright: © 2014 Du et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:. Η συγγραφείς επιβεβαιώνουν ότι όλα τα δεδομένα που διέπουν τα ευρήματα είναι πλήρως διαθέσιμα χωρίς περιορισμούς. Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. Η μελέτη αυτή χρηματοδοτήθηκε από το βασικό έργο της Σαγκάης Επιστήμης και επιχορήγηση Επιτροπή Τεχνολογίας (06DZ19503 στο Γ Cao) και το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας ( 81025015 έως Γ Cao). Οι οργανισμοί χρηματοδότησης είχαν κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

εισαγωγή

Ο καρκίνος του πνεύμονα είναι μία από τις κύριες αιτίες των θανάτων από καρκίνο σε όλο τον κόσμο [1]. καρκίνο του πνεύμονα μη μικρών κυττάρων (NSCLC) είναι η πιο κοινή υποτύπου και αντιπροσωπεύει το 85% όλων των καρκίνων του πνεύμονα. Οι περισσότεροι ασθενείς με NSCLC βρίσκονται σε αναπτυγμένες προχωρημένο στάδιο του όγκου κατά τη διάγνωση και να χάσει την ευκαιρία της χειρουργικής εκτομής [2]. Με βάση την πλατίνα συνδυασμένη χημειοθεραπεία είναι μια τυπική θεραπεία για προχωρημένο NSCLC. Ωστόσο, η έκβαση και η επιβίωση των προηγμένων NSCLC είναι γενικά κακή, με ποσοστό επιβίωσης 5 ετών μόνο περίπου 15%. Επιπλέον, το ποσοστό επιβίωσης των προηγμένων NSCLC ποικίλλει σημαντικά σε διαφορετικούς πληθυσμούς με διαφορετικές γενετικό υπόβαθρο [3], [4]. Επιπλέον, η θεραπευτική αποτελεσματικότητα των αγωγών με βάση την πλατίνα επηρεάστηκε από την αντίσταση του φαρμάκου. Πιθανοί μηχανισμοί της χημειοαντίσταση περιλαμβάνουν μεταβολές στην εκροή φαρμάκου ή εισροή, την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA, και άλλες κυτταρικές οδούς που απαιτούνται για την απάντηση στην καταστροφή του DNA. Για ασθενείς με πρώιμη NSCLC στάδιο που μπορεί να αποκοπεί χειρουργικά, η μακροπρόθεσμη πρόγνωση δεν είναι ικανοποιητική και το ποσοστό επιβίωσης 5 ετών μετά την επέμβαση είναι μικρότερη από 50% [5]. Το αποτέλεσμα της πρώιμο στάδιο ασθενείς με NSCLC που λαμβάνουν χειρουργική θεραπεία είναι επίσης στενά με την ατομική γενετικά χαρακτηριστικά, καθώς τα επίπεδα διακύμανσης και έκφραση ορισμένων γονιδίων μπορεί να επηρεάσει την απόκριση επιβίωσης και επικουρική χημειοθεραπεία [6], [7]. Γενετική ανάλυση διακύμανσης στις υποψήφιες οδούς έχει δείξει ότι το γενετικό υπόβαθρο ενός ατόμου παίζει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη της νόσου, η ανταπόκριση της θεραπείας, και την επιβίωση. Για παράδειγμα, οι ασθενείς με εντελώς εκτομή NSCLC και αρνητική έκφραση της επισκευής εκτομή ομάδα εγκάρσια συμπληρώσεως 1 (ERCC1) πρωτεΐνης σε όγκους επωφεληθούν περισσότερο από ανοσοενισχυτικό σισπλατίνη χημειοθεραπεία με βάση από εκείνους με ERCC1 θετική έκφραση [8]. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι η όγκο-κόμβος-μετάσταση (TNM) σύστημα σταδιοποίησης, την ηλικία, την κατάσταση απόδοσης και η απώλεια βάρους που σχετίζεται με NSCLC πρόγνωση? Ωστόσο, οι πρόβλεψης αρμοδιότητες αυτών των παραγόντων δεν είναι οι βέλτιστες. Ως εκ τούτου, είναι ζωτικής σημασίας για τον εντοπισμό νέων βιοδεικτών που μπορούν να βελτιώσουν την προγνωστική και προβλεπτική ακρίβεια εκτίμησης για να βοηθήσει τις αναπτυσσόμενες εξατομικευμένη θεραπεία του καρκίνου και τον ασθενή προσαρμοσμένων χημειοθεραπεία, και τελικά επίτευξη καλύτερων αποτελεσμάτων για τους ασθενείς με NSCLC.

ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA (ΛΔΚ) είναι ένα δίκοπο μαχαίρι στην αιτιολογία και τη θεραπεία του καρκίνου. Ελαττώματα στο σύστημα επιδιόρθωσης του DNA αυξάνουν δραματικά τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου [9]. Από την άλλη πλευρά, ο μηχανισμός επιδιόρθωσης του DNA μπορεί να μειώσει την θεραπευτική αποτελεσματικότητα της χημειοθεραπείας, επιτρέποντας τα καρκινικά κύτταρα για να καθορίσει βλάβες DNA που προκαλείται από αυτούς τους παράγοντες [10]. επιδιόρθωση του DNA περιλαμβάνει τον συντονισμό πολλών γονιδίων σε τέσσερις κύριες οδούς επιδιόρθωσης του DNA, τα οποία είναι νουκλεοτίδιο επιδιόρθωση εκτομής (NER), επιδιόρθωση βάσης εκτομή (ΚΑΚ), διπλό σκέλος επισκευής διάλειμμα (DSBR), και αναντιστοιχία επισκευή (MMR) μονοπάτια. Ενιαία πολυμορφισμοί (SNPs) σε γονίδια επιδιόρθωσης του DNA μπορεί να ρυθμίζουν την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA μέσω επηρεάζουν την έκφραση ή δραστηριότητες πρωτεΐνης, και ως εκ τούτου επηρεάζουν τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [11] – [13]. πολυμορφισμών του γονιδίου επιδιόρθωσης DNA μπορεί να σχετίζεται με τον κίνδυνο και την πρόγνωση του NSCLC. Pigmentosum ξηροδερμίας ομάδα D (

XPD

/

ERCC2)

πολυμορφισμός μπορεί να αλλάξει την δευτερεύουσα δομή του mRNA [14]? και SNP στην εγκάρσια επισκευή ακτίνων Χ ομάδα 1 συμπληρώνει (

ΧΚΧΧ1

) γονίδιο 5 ‘αμετάφραστη περιοχή (UTR) ενισχύσει σε μεγάλο βαθμό δέσμευσης trans-ενεργοποιητή Sp1 στοιχείο, ως εκ τούτου μειώνοντας δραστηριότητα προαγωγέα και μειώνοντας την έκφραση της πρωτεΐνης [15]. Επιπλέον, πολυμορφισμοί στα γονίδια αυτά μπορεί επίσης να είναι δυναμικό προγνωστικούς δείκτες για την ανταπόκριση χημειοθεραπεία και η συνολική επιβίωση των ασθενών με NSCLC [16] – [19].

Πολλαπλές αντοχή στα φάρμακα 1 (

MDR1

, επίσης, γνωστή ως

ABCB1

) γονίδιο κωδικοποιεί P-γλυκοπρωτεΐνης (P-gp), μια διαμεμβρανική μεταφορέα που ανήκουν στην ATP-δεσμευτική οικογένεια κασέτα, η οποία μπορεί να αντλήσει από ενδοκυτταρικά χημειοθεραπευτικά και να προκαλέσει ανθεκτικότητα σε πολλά φάρμακα.

MDR1 /ABCB1

C3435T (rs1045642) πολυμορφισμός σχετίζεται με το επίπεδο έκφρασης και λειτουργίας των MDR1 [20], έτσι μπορεί να επηρεάσει τις απαντήσεις σε αντικαρκινική θεραπεία των ναρκωτικών.

Σε αυτή τη μελέτη, έχουμε επιλέξει έξι μελετήσει προηγουμένως SNPs, που βρίσκεται είτε στην κωδικοποίηση περιοχές ή στις ρυθμιστικές περιοχές των γονιδίων, συμπεριλαμβανομένων των

ERCC1

rs11615,

XPD /ERCC2

rs13181 και την ευαισθησία του καρκίνου του μαστού γονίδιο 1 (

BRCA1 πρωτεΐνη

) rs1799966 από την οδό NER?

ΧΚΧΧ1

rs25487 από την οδό ΚΑΚ,

XRCC3

rs1799794 από την οδό DSBR, καθώς και

MDR1 /ABCB1

rs1045642 (Πίνακας S1). Ερευνήσαμε πρώτα τις συσχετίσεις μεταξύ αυτών των SNPs και η ανταπόκριση χημειοθεραπεία σε ασθενείς με προχωρημένο NSCLC, στη συνέχεια, αξιολογούνται οι σχέσεις τους με την επιβίωση των ασθενών με NSCLC που έλαβαν χειρουργική θεραπεία ή τη χημειοθεραπεία.

Υλικά και Μέθοδοι

Πληθυσμός μελέτης

Οι συμμετέχοντες είχαν προσληφθεί σε Changhai Νοσοκομείο του Β Στρατιωτικό Ιατρικό Πανεπιστήμιο. Ένα σύνολο 352 ασθενών πρωτοβάθμιας NSCLC διαγιγνώσκονται από Ιούλιος 1997 έως Οκτώβριος 2008 είχαν εγγραφεί (Σύνολο δεδομένων S1). Όλοι οι ασθενείς είχαν ιστοπαθολογικά επιβεβαιώνεται ως NSCLC. Κλινικές και ιστοπαθολογικές δεδομένα των ασθενών που προέρχονται από τα ιατρικά αρχεία τους. Όλοι οι ασθενείς ήταν εθνοτικής Κινέζων Χαν προέλευσης. Το πρωτόκολλο της μελέτης προσαρμόστηκε στις ηθικές οδηγίες της Διακήρυξης του Ελσίνκι (2000), και εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο Institutional Review αυτού του πανεπιστημίου. Όλοι οι συμμετέχοντες παρείχαν έγγραφη συγκατάθεση.

Παρακολούθηση

Η συλλογή δεδομένων και

Από τους 352 ασθενείς με NSCLC, 161 (45,7%) ασθενείς με προχωρημένο NSCLC έλαβαν αξιολογήθηκαν με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία. Εκτός από σισπλατίνη (DDP) ή καρβοπλατίνη (CBP), χημειοθεραπευτικά σχήματα περιλαμβάνονται επίσης γεμσιταβίνη (GEM), πακλιταξέλη (ΦΠΑ), docetaxel (DOC), βινορελβίνη (NVB), ή πεμετρεξίδη δινάτριο (ΡΕΜ). δόσεις του φαρμάκου ήταν: DDP 75 mg /m

2 την ημέρα 1? περιοχή CBP κάτω από την καμπύλη (AUC) = 5-6 g την ημέρα 1? GEM 1250 mg /m

2 κατά τις ημέρες 1 και 8? ΦΟΡΟΣ 135~175 mg /m

2 την ημέρα 1 σε 3 ώρες? DOC 75 mg /m

2 την ημέρα 1 σε 1 ώρα? NVB 25 mg /m

2 κατά τις ημέρες 1 και 8? PEM 500 mg /m

2 την ημέρα 1. Όλα τα φάρμακα χορηγήθηκαν με ενδοφλέβια έγχυση κάθε 3-4 εβδομάδες για έναν κύκλο θεραπείας. Η απόκριση όγκου εκτιμήθηκε μετά από 2 κύκλους θεραπείας, σύμφωνα με τα Κριτήρια Αξιολόγησης απόκρισης σε συμπαγείς όγκους [21]. Οι απαντήσεις ταξινομήθηκαν σε πλήρη ανταπόκριση (CR), μερική απόκριση (PR), σταθερή νόσος (SD) ή προοδευτική ασθένεια (PD). Οι ασθενείς με CR, PR ή SD ορίστηκαν ως «ασθενείς με κλινικό όφελος», και οι ασθενείς με PD ορίστηκαν ως «ασθενείς χωρίς κλινικό όφελος» [22].

Συνέχεια ξεκίνησε δύο μήνες μετά την οριστική διάγνωση. Παρακολούθηση πραγματοποιήθηκε μέσω τηλεφώνου ή πρόσωπο με πρόσωπο συνέντευξη στο τμήμα εξωτερικών ασθενών σε διάστημα 3 μηνών, σύμφωνα με το πρότυπο επιδημιολογικές διαδικασία μας. Διάμεση περίοδο παρακολούθησης ήταν 20,8 μήνες (εύρος: 1,0 έως 178,6 μήνες).

Γονοτυπικές

Το γονιδιακό DNA εξήχθη από περιφερικό αίμα χρησιμοποιώντας κιτ εκχύλισης QIAmp DNA (QIAGEN, Hilden, Γερμανία). SNPs ήταν ο γονότυπος με φθορίζοντα ανιχνευτή πραγματικού χρόνου ποσοτική PCR (qPCR) σε LightCycler

TM480 (Roche, Βασιλεία, Ελβετία). Εκκινητές και ανιχνευτές (Taqman ή μικρής αύλακας [MGB]) σχεδιάστηκαν και συντέθηκαν από GeneCore βιοτεχνολογίες (Σαγκάη, Κίνα). Οι αλληλουχίες των εκκινητών και ανιχνευτών είναι διαθέσιμοι στον Πίνακα S1. Κάθε μίγμα αντιδράσεως περιείχε 0,2 μmol /L εκκινητών, 0,2 μmol /L ανιχνευτών, 0.1 μg-0,5 μg καθαρισμένου πρότυπα στο Πρόμιγμα Ex Taq σύστημα αντίδρασης (Takara, Dalian, Κίνα). Οι αντιδράσεις προγραμματίστηκαν στους 95 ° C για 10 s και ακολουθείται από 40 κύκλους των 95 ° C για 10 s και 60 ° C για 30 s. Όλα τα δείγματα με επιτυχία ο γονότυπος (Σύνολο δεδομένων S1). Για τον έλεγχο της ποιότητας, 5% δείγματα επιλέχθηκαν τυχαία και άμεσα αλληλουχία, και ελήφθησαν 100% τα ίδια αποτελέσματα.

Η στατιστική ανάλυση

λογιστική ανάλυση παλινδρόμησης διεξήχθη για να αποκτήσετε αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και τους διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (95% ΚΠ) για τις σχέσεις των γενετικών πολυμορφισμών με την απάντηση χημειοθεραπεία σε 161 ασθενείς με προχωρημένο NSCLC. Η συνολική επιβίωση (OS) αναλύθηκε χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Kaplan-Meier σε 161 προηγμένες και 156 ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC ξεχωριστά. δοκιμασία log-rank χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση των καμπυλών επιβίωσης. Εμπρός σταδιακή πολυπαραγοντική Cox μοντέλο αναλογικού κινδύνου (

P

καταχώρηση = 0.05,

P

απομάκρυνση = 0,10) διεξήχθη για τον προσδιορισμό των παραγόντων που συμβάλλουν ανεξάρτητα σε NSCLC πρόγνωση και την εκτίμηση της αναλογίες κινδύνου (HR) και 95% ΚΠ τους. Περαιτέρω αναλύσεις υποομάδων διαστρωμάτωση με ιστολογία, το κάπνισμα, Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) κατάσταση απόδοσης, και το στάδιο διεξήχθησαν επίσης. Συμμεταβλητές προσαρμόστηκαν για να ληφθούν ώρες και αντιστοιχεί το 95% ΠΙ σε αναλύσεις υποομάδων. Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες ήταν δύο όψεων και διεξάγεται με τη χρήση του στατιστικού προγράμματος για Κοινωνικές Επιστήμες (SPSS 16.0 για Windows, SPSS, Chicago, IL).

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική

Αποτελέσματα

Τα χαρακτηριστικά των ασθενών

Τα δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά των ασθενών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. . από τις 352 περιπτώσεις NSCLC, 156 (44,3%) ήταν ασθενείς πρώιμο στάδιο που υποβλήθηκαν σε χειρουργική θεραπεία, 161 (45,7%) ήταν ασθενείς με προχωρημένο σε ανεγχείρητο στάδιο και έλαβε με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία, 10 (2,8%) των ασθενών αρνήθηκε οποιαδήποτε θεραπεία για τη προσωπικούς λόγους, και 25 (7,1%) ασθενείς έχασε από την παρακολούθηση μετά την πρώτη θεραπεία σε Changhai Νοσοκομείο. Οι περισσότεροι ασθενείς (120/156, 76,9%) πρώιμο στάδιο NSCLC οι οποίοι υποβλήθηκαν σε χειρουργική επέμβαση έλαβαν προεγχειρητική ή μετεγχειρητική επικουρική χημειοθεραπεία. ασθενείς με προχωρημένο NSCLC είχαν περισσότερες πιθανότητες να λάβουν θεραπεία με ακτινοβολία σε σύγκριση με τους ασθενείς πρώιμο στάδιο (44,1%

vs

20,5%, p & lt?. 0.0001). Άλλα δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά ήταν παρόμοια μεταξύ πρώιμο στάδιο και ασθενείς με προχωρημένο NSCLC (p & gt? 0,05 για όλους). Πίνακας S2 παρουσίασε τις κατανομές γονότυπου αυτών των έξι SNPs σε διαφορετικές κατηγορίες των ασθενών με NSCLC.

Η

Σύλλογοι των SNPs με ανταπόκριση χημειοθεραπεία

Από τις 161 ασθενών με προχωρημένο NSCLC που έλαβαν αξιολογήθηκαν πλατίνη χημειοθεραπεία με βάση, ο αριθμός των ασθενών με CR, PR, SD ή PD ήταν 0, 44, 65 και 52, αντίστοιχα. Το συνολικό κλινικό όφελος (CR + PR + SD) ποσοστό ήταν 67,7% (109/161).

BRCA1

rs1799966,

MDR1 ABCB1

rs1045642 /και κλινικό στάδιο συσχετίστηκε σημαντικά με τον κλινικό όφελος (Πίνακας 2). Οι ασθενείς που φέρουν

BRCA1

έλασσον αλληλόμορφο C (TC + ​​CC) είχαν σημαντικά περισσότερες πιθανότητες επίτευξης κλινικό όφελος από τους ασθενείς που φέρουν rs1799966 ΤΤ γονότυπο (75,2%

vs.

55,0%, OR = 0.402 , 95% CI = 0,204 – 0,794, p = 0,008). Ομοίως, οι ασθενείς που φέρουν

MDR1 /ABCB1

rs1045642 έλασσον αλληλόμορφο Α (GA + AA) είχαν περισσότερες κλινικό όφελος από ασθενείς που φέρουν rs1045642 GG γονότυπο (74,5%

vs.

58,2%, OR = 0,478, 95% CI = 0,244 – 0,934, p = 0,030). Επιπλέον, οι ασθενείς με κλινικό στάδιο IV είχαν σημαντικά λιγότερες πιθανότητες να επιτευχθεί κλινικό όφελος από ό, τι τα άτομα με κλινικό στάδιο ΙΙΙ (61,3%

vs.

80,0%, OR = 2.523, 95% CI = 1,171 – 5,437, p = 0,016). Επιπλέον, οι ενώσεις εξακολούθησε να είναι σημαντική στην πολυπαραγοντική ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης, η οποία πρότεινε ότι

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs.

ΤΤ),

MDR1 /ABCB1

rs1045642 (GA + ΑΑ

vs

GG.) και κλινικό στάδιο ήταν ανεξάρτητοι παράγοντες που επηρεάζουν την ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία (

BRCA1

rs1799966 (IV

vs

III.): προσαρμογή OR = 0.410 , 95% CI = 0,203 – 0,831, ρυθμίζεται p = 0,013?

MDR1 /ABCB1

rs1045642: προσαρμογή OR = 0.488, 95% CI = 0,242 – 0,984, ρυθμίζεται p = 0,045? κλινικό στάδιο: προσαρμογή OR = 2.698 , 95% CI = 1,214 – 5,996, ρυθμίζεται p = 0,015). Δεν σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν μεταξύ των άλλων τεσσάρων SNPs (

ERCC1

rs11615,

XPD /ERCC2

rs13181,

ΧΚΧΧ1

rs25487,

XRCC3

rs1799794) ή άλλα χαρακτηριστικά (ηλικία, φύλο, ιστολογία, σχήματα χημειοθεραπείας, την κατάσταση απόδοσης, το κάπνισμα, και ακτινοθεραπεία) και κλινικό όφελος (p & gt? 0,05 για όλους).

Η

Σύλλογοι των SNPs με λειτουργικό σύστημα των ασθενών με προχωρημένο NSCLC

η μονοπαραγοντική ανάλυση χρησιμοποιώντας καμπύλες Kaplan-Meier και log-rank τεστ έδειξαν ότι

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs.

γονότυπους ΤΤ), ακτινοθεραπεία (ποτέ

vs.

ποτέ), και το κάπνισμα (ποτέ

vs.

ποτέ) ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο λειτουργικό σύστημα των ασθενών με προχωρημένο NSCLC με τιμές log-rank ρ = 0.042, 0.049, και 0,042, αντίστοιχα (Εικ. 1). Η σταδιακή πολυμεταβλητή ανάλυση Cox έδειξε ότι

BRCA1

rs1799966 (TC + ​​CC

vs

TT:. HR = 0,617, 95% CI = 0,402 – 0,948, p = 0,028), ακτινοθεραπεία (ποτέ

vs

ποτέ:. HR = 0,611, 95% CI = 0,396 – 0,944, p = 0,027), και το κάπνισμα (ποτέ

vs

ποτέ:. HR = 0,574, 95% CI = 0,373 -0.882, p = 0.011), προέβλεψε ανεξάρτητα ευνοϊκή επιβίωση των ασθενών με προχωρημένο NSCLC. Δεν σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν μεταξύ των άλλων SNPs ή άλλα χαρακτηριστικά και το λειτουργικό σύστημα (log-rank p & gt? 0,05 για όλους).

(Α) η θεραπεία

BRCA1

rs1799966, (Β) ακτινοβολία, ( Γ) το κάπνισμα.

η

Εξετάσαμε περαιτέρω την ένωση του

BRCA1

rs1799966 με την επιβίωση σε αναλύσεις υποομάδων με την κατηγοριοποίηση των ασθενών σύμφωνα με την ιστολογία, το κάπνισμα, την κατάσταση απόδοσης ECOG, και το στάδιο . Με ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα, εκείνοι καπνίσει ποτέ, εκείνοι με κατάσταση απόδοσης κατά ECOG 1, ή εκείνοι στο στάδιο ΙΙΙ,

BRCA1

rs1799966 TC + CC γονότυπους προέβλεψε μεγαλύτερη OS από το γονότυπο ΤΤ (log-rank p & lt? 0,05 για όλους) (Εικ. 2). Μετά από προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, την ιστολογία, στάδιο, την κατάσταση απόδοσης ECOG, το κάπνισμα, και η θεραπεία ακτινοβολίας στο μοντέλο Cox,

BRCA1

rs1799966 TC + CC γονότυπους συσχετίστηκαν με χαμηλότερο κίνδυνο θανάτου σε ασθενείς με πλακώδες καρκίνωμα (HR = 0,324, 95% CI = 0,137 – 0,765, p = 0,010), οι ασθενείς που κάπνιζαν ποτέ (HR = 0,406, 95% CI = 0,221 – 0,743, p = 0,004), ή εκείνων με κατάσταση απόδοσης κατά ECOG 1 ( HR = 0,563, 95% CI = 0,353 – 0,898, p = 0,016).

(Α) πλακώδες καρκίνωμα ομάδα, (Β) ποτέ κατάστασης = 1 ομάδα καπνιστές ομάδα, (C) απόδοσης ECOG, (D ) το στάδιο της ομάδας III. Αριθμός στην παρένθεση, ο αριθμός των θανάτων /αριθμός περιπτώσεων.

Η

Σύλλογοι των SNPs με μετεγχειρητική OS σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC

ERCC1

rs11615 και το κάπνισμα κατάσταση ήταν στατιστικά σημαντική συσχέτιση με λειτουργικό σύστημα των ασθενών πρώιμο στάδιο NSCLC (log-rank p = 0,009 και 0,013, αντίστοιχα) (Εικ. 3). Στη σταδιακή πολυμεταβλητή ανάλυση Cox, οι ασθενείς με

ERCC1

rs11615 ΑΑ γονότυπο είχαν αυξημένο κίνδυνο θανάτου (θάνατοι /περιπτώσεις: 5/9 για AA

vs

44/147 για GG + GA. , HR = 3,087, 95% CI = 1,197 – 7,961, p = 0,020,). Το κάπνισμα συσχετίστηκε επίσης με χειρότερη επιβίωση (θάνατοι /περιπτώσεις:. 30/76 για πάντα καπνιστές

vs

19/80 για μη καπνιστές, HR = 1,896, 95% CI = 1,040 – 3,455, p = 0,037). Δεν παρατηρήσαμε καμία στατιστικά σημαντική συσχέτιση των άλλων SNPs ή άλλα χαρακτηριστικά με το λειτουργικό σύστημα (log-rank p & gt? 0,05 για όλους)

(Α)

ERCC1

rs11615, το κάπνισμα (Β). .

η

Περαιτέρω διαστρωμάτωση αναλύσεις σε ασθενείς πρώιμο στάδιο NSCLC έδειξε ότι

ERCC1

rs11615 ΑΑ γονότυπο προέβλεπαν σημαντική φτωχότερη OS από GG + GA γονότυπων σε ασθενείς με ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα (log-rank p = 0,004), εκείνους που κάπνιζαν ποτέ (log-rank p = 0,018), τα άτομα με κατάσταση απόδοσης κατά ECOG 1 (log-rank p = 0,007), ή εκείνων που δεν λάμβαναν θεραπεία με ακτινοβολία (log-rank p & lt? 0.001) (Εικ. 4). Μετά από προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, την ιστολογία, στάδιο, την κατάσταση απόδοσης ECOG, το κάπνισμα, την ακτινοθεραπεία και επικουρική χημειοθεραπεία στο μοντέλο Cox,

ERCC1

rs11615 ΑΑ γονότυπο προέβλεψε υψηλότερο κίνδυνο θανάτου σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα (HR = 6,633, 95% CI = 1,184 έως 37,164, p = 0,031), εκείνους που κάπνιζαν ποτέ (HR = 3,324, 95% CI = 1,040 έως 10,627, p = 0,043), τα άτομα με κατάσταση απόδοσης κατά ECOG 1 ( HR = 2,835, 95% CI = 1,063 – 7,560, p = 0,037), ή εκείνων που δεν λάμβαναν θεραπεία με ακτινοβολία (HR = 5,381, 95% CI = 1,857 έως 15,593, p = 0,002).

(Α) πλακώδες καρκίνωμα ομάδα, (Β) ποτέ ομάδα καπνιστές, κατάσταση = 1 ομάδα (C) απόδοσης ECOG, (D) δεν λαμβάνουν ομάδα ακτινοθεραπεία. Αριθμός στην παρένθεση, ο αριθμός των θανάτων /αριθμός περιπτώσεων.

Η

Συζήτηση

Στην παρούσα μελέτη, αξιολογήσαμε τις σχέσεις μεταξύ των έξι SNPs με ανταπόκριση χημειοθεραπεία και την επιβίωση των NSCLC σε ένα κινεζικό πληθυσμό Han . Παρατηρήσαμε ότι το έλασσον αλληλόμορφο C του

BRCA1

rs1799966 από την οδό DSBR συσχετίστηκε με καλύτερη ανταπόκριση στη θεραπεία και μεγαλύτερη επιβίωση ασθενών με προχωρημένο NSCLC υποβλήθηκαν με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία. Επιπλέον, έλασσον αλληλόμορφο Α του

MDR1 /ABCB1

rs1045642 συσχετίστηκε σημαντικά με κλινικό όφελος της χημειοθεραπείας σε ασθενείς με προχωρημένο NSCLC. Για ασθενείς με ΜΜΚΠ νωρίς, φορείς του

ERCC1

rs11615 ΑΑ γονότυπο είχαν αυξημένο κίνδυνο θανάτου.

BRCA1

γονίδιο ανήκει στο σύστημα NER [23], η οποία είναι η σημαντικό σύστημα επισκευής που μειώνει την πλατίνα που προκαλείται από βλάβη του DNA.

BRCA1

περιλαμβάνει πολλές δραστηριότητες, συμπεριλαμβανομένων ομόλογο ανασυνδυασμό, μη ομόλογο τέλος ενώνει, και την επισκευή ασυμφωνία [24]. πρωτεΐνη BRCA1 είναι μία πυρηνική φωσφοπρωτεϊνη με πολλαπλούς ρόλους όχι μόνο στην επιδιόρθωση της βλάβης του DNA, αλλά και σε σημείο ελέγχου του κυτταρικού κύκλου ή μηχανήματα κυτταρικό θάνατο [24], [25].

In vitro

μελέτες έχουν αναφέρει ότι BRCA1 μπορεί να ρυθμίσει τη χημειοθεραπεία ευαισθησία παράγοντα? για παράδειγμα, η απουσία του BRCA1 προκαλεί υψηλή ευαισθησία στη σισπλατίνη [24]. έκφραση BRCA1 είναι ένας αξιόπιστος δείκτης της χημειοαντίσταση σε ασθενείς με NSCLC που λαμβάνουν θεραπεία με παράγοντες που προκαλούν βλάβη στο DNA, όπως η πλατίνα [26] – [28]. Οι ασθενείς με χαμηλότερη έκφραση BRCA1 έχουν καλύτερη επιβίωση με βάση την πλατίνα εισαγωγική χημειοθεραπεία [26] – [28], η οποία επιβεβαιώνεται και από μια πρόσφατη μετα-ανάλυση [29]. Γενετικοί πολυμορφισμοί μπορούν να επηρεάσουν την έκφραση της πρωτεΐνης, τη δομή, και /ή λειτουργία? Ωστόσο, προηγούμενες μελέτες έχουν σπάνια διερευνώνται οι συσχετίσεις μεταξύ των

BRCA1

πολυμορφισμών με NSCLC επιβίωση. Μία μελέτη σε μια κορεατική πληθυσμό αναφερθεί καμία συσχέτιση μεταξύ της

BRCA1

rs1799966 και την επιβίωση NSCLC? Ωστόσο, κατάφερε να βρει

BRCA1

απλότυπος ΑΣΣΑ (rs1799966-rs8176199-rs8067269-rs2070833) προέβλεψε μικρότερη επιβίωση μεταξύ των ασθενών με προχωρημένο NSCLC που λαμβάνουν με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία [18]. Στην ανάλυσή μας, παρατηρήσαμε

BRCA1

rs1799966 έλασσον αλληλόμορφο C συσχετίστηκε με καλύτερη ανταπόκριση χημειοθεραπεία και πλέον επιβίωση ασθενών με προχωρημένο NSCLC. rs1799966 είναι ένα nonsynonymous SNP στην κωδικοποιητική περιοχή του COOH-τερματικό πεδίο, το οποίο αποκαλείται ΒΑΟΤ, η οποία είναι απαραίτητη για ομόλογο ανασυνδυασμό στην επιδιόρθωση του DNA διπλής έλικας διαλείμματα [30]. Η αλλαγή αμινοξέος από προλίνη σε λευκίνη στη θέση 871 του rs799917 οδηγεί σε μια μη συντηρητική αλλαγή των μοναδικών δομικών ιδιοτήτων της πρωτεΐνης BRCA1. Επιπλέον, αυτό το SNP είναι σε ανισορροπία σύνδεσης με rs799917, η οποία βρίσκεται στη μέση ενός έντονα διατηρημένη περιοχή του

BRCA1

γονίδιο [31].

ERCC1 είναι ένα άλλο σημαντικό ένζυμο στον NER μονοπάτι της επιδιόρθωσης του DNA, και είναι υπεύθυνο για την «τομή 5 φθαρμένων DNA [32]. Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι η έκφραση ERCC1 σχετίζεται με κλινικό όφελος με βάση την πλατίνα χημειοθεραπεία [5], [8], [33], [34], και θα μπορούσε να χρησιμοποιηθεί ως βιολογικός δείκτης για την αγωγή NSCLC. Η παραλλαγή γονότυπο στην

ERCC1

πολυμορφισμοί μπορεί να καταστρέψει ή να τροποποιήσει τις λειτουργίες επισκευής, ενδεχομένως μέσω της αλλαγής των επιπέδων έκφρασης. rs11615 είναι ένα συνώνυμο SNP που βρίσκεται στο κωδικόνιο 118 του

ERCC1

γονίδιο, το οποίο κωδικοποιεί τα ασπαραγίνες αμινοξέων. Η παραλλαγή αλληλόμορφο rs11615 μπορεί να οδηγεί σε μεταβολή του επιπέδου του mRNA [35]. Μελέτες που πραγματοποιήθηκαν σε διαφορετικούς πληθυσμούς έδειξαν ότι ο GG γονότυπος του

ERCC1

rs11615 σχετίστηκε με καλύτερη επιβίωση σε προχωρημένο NSCLC ασθενή [36], [37]. Αντίθετα, μια μελέτη που διεξήχθη στην Ιαπωνία δεν κατάφερε να βρει σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ των

ERCC1

rs11615 και την επιβίωση [38]. Επιπλέον, μια μετα-ανάλυση 17 μελετών, συμπεριλαμβανομένων δεν μπορούσε να επιβεβαιώσει τη σύνδεση των

ERCC1

rs11615 με την επιβίωση, ούτε στις συνολικές ούτε εθνοτικών στρωματοποιημένη αναλύσεις [39]. Τα αντιφατικά αποτελέσματα προηγούμενων μελετών μπορεί να οφείλεται σε εθνοτικές διαφορές, το στάδιο της νόσου, και /ή θεραπευτική παραλλαγές. Λίγες μελέτες διερευνήθηκε ποτέ τη σχέση μεταξύ rs11615 και την επιβίωση της πρώιμο στάδιο NSCLC. Στην παρούσα μελέτη, διαπιστώσαμε ότι η ΑΑ γονότυπος rs11615 συνδέθηκε με φτωχότερες OS σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC. Μια σημαντική μετα-ανάλυση κατέληξε στο συμπέρασμα ότι η υψηλή ERCC1 συσχετίστηκε με σημαντικά χειρότερη OS σε ασθενείς με πλατίνα που έλαβαν NSCLC [40]. Αυτές οι αποδείξεις δείχνουν ότι ο γονότυπος παραλλαγή αλληλόμορφου (ΑΑ) της rs11615 σχετίζεται με υψηλή έκφραση του ERCC1. Ωστόσο, τα αποτελέσματα της θεραπείας με ακτινοβολία είναι πολύπλοκες. Ένα ποσοστό των ασθενών με NSCLC πρώιμο στάδιο μας (32/156, 20,5%) έλαβαν θεραπεία με ακτινοβολία, έτσι δεν μπορούμε να αποκλείσουμε την πιθανή επίδραση της θεραπείας με ακτινοβολία για τη σύνδεση των

ERCC1

rs11615 με την επιβίωση.

Ένας λόγος αποτυχίας της θεραπείας σε ασθενείς με καρκίνο είναι αντοχή φαρμάκου, η οποία μπορεί να επηρεάζεται από παράγοντες που επηρεάζουν την εκροή και εισροή χημειοθεραπευτικών διαμέσου της κυτταρικής μεμβράνης. MDR1 /ABCB1 είναι υπεύθυνη για την εκροή των πολλών χημειοθεραπευτικών μέσω της κυτταρικής μεμβράνης με υδρόλυση του ΑΤΡ [41]. rs1045642 έχει ένα G & gt? Μια αλλαγή στη θέση του cDNA 3435 στο εξόνιο 26 και παίζει ένα ρόλο στη λειτουργία της P-gp [20]. Ωστόσο, τα αποτελέσματα από τις μελέτες του

MDR1 /ABCB1

rs1045642 και με βάση την πλατίνα απάντηση χημειοθεραπεία του NSCLC είναι ασυνεπής σε διαφορετικούς πληθυσμούς [36], [42]. Οι πρόσφατες μετα-αναλύσεις επιβεβαίωσαν αυτό το SNP συνδέθηκε με ανταπόκριση χημειοθεραπεία σε συνολική και ασιατικούς πληθυσμούς [39], [43]. Ωστόσο, λάβαμε αντίθετα αποτελέσματα από τα ευρήματα μετα-ανάλυση, που δείχνει

MDR1 /ABCB1

φορείς παραλλαγή αλληλόμορφου είχε περισσότερο κλινικά οφέλη της χημειοθεραπείας. Η διαφορά μπορεί ενδεχομένως να εξηγηθεί από πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες όπως η ακτινοθεραπεία.

Δεν αποτελεί έκπληξη, το κάπνισμα σχετίστηκε με NSCLC πρόγνωση σε δύο ασθενείς με πρώιμο και προχωρημένο στάδιο. Το κάπνισμα προκαλεί διαταραχή της αναπνευστικής λειτουργίας, και είναι το καθιερωμένο παράγοντα κινδύνου εμφάνισης NSCLC και κακή πρόγνωση. Το κάπνισμα μπορεί να προκαλέσει βλάβες του DNA, όπως ενώσεις προσθήκης DNA και διπλό σκέλος βλάβες διάλειμμα DNA [44]. Μπορεί επίσης να επηρεάσει τη λειτουργία επιδιόρθωσης του DNA, επηρεάζοντας έτσι σημαντικά την έκβαση των ασθενών.

Η παρούσα μελέτη έχει αρκετούς περιορισμούς. Πρώτα είναι το σχετικά μικρό μέγεθος του δείγματος και ένα σύντομο χρονικό διάστημα παρακολούθησης, ειδικά σε αναλύσεις υποομάδων, ως εκ τούτου, θέτοντας το ζήτημα των ψευδώς θετικών ευρημάτων. Τα αποτελέσματά μας δεν ήταν στατιστικά σημαντική μετά από διόρθωση για πολλαπλές συγκρίσεις, και τα ευρήματα αυτά πρέπει να αξιολογηθούν περαιτέρω. Δεύτερον, συλλέξαμε δεδομένα OS αντί συγκεκριμένες ασθένειες επιβίωση, δεδομένου ότι είναι δύσκολο να επιβεβαιωθεί η πραγματική αιτία θανάτου σε ορισμένους ασθενείς. Τρίτον, θα επιλεγεί μόνο περιορισμένος αριθμός των SNPs που βασίζονται σε λειτουργίες τους, ενώ άλλοι πολυμορφισμοί στα γονίδια αυτά μπορεί να επηρεάσουν NSCLC απάντηση χημειοθεραπεία και πρόγνωση. Τελευταία, NSCLC είναι μια ετερογενή ομάδα νεοπλασμάτων, και πολλαπλοί μηχανισμοί μπορούν να καθορίσουν την ανταπόκριση και την πρόγνωση, ήμασταν σε θέση να αντιπροσωπεύουν όλους τους παράγοντες στην παρούσα ανάλυση.

Για να ολοκληρώσω, μελέτη παρείχε περαιτέρω αποδείξεις μας ότι οι πολυμορφισμοί στο DNA γονίδια οδού επισκευή και

MDR1

γονίδιο θα μπορούσε να επηρεάσει την ανταπόκριση στη θεραπεία και την επιβίωση των ασθενών με NSCLC. Οι μηχανισμοί του πώς οι διαφορές στις νουκλεοτιδικές αλληλουχίες SNP ή δίδυμες επαναλήψεις μπορεί να επηρεάσουν τη μεταγραφή γονιδίων παραμένουν σε μεγάλο βαθμό ασαφής. Περαιτέρω μελέτες μεγάλης κλίμακας που απαιτούνται για να φωτιστούν οι λειτουργίες και οι μηχανισμοί που μπορούν να βοηθήσουν στη βελτίωση των αποτελεσμάτων των ασθενών με NSCLC.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1.

πολυμορφισμός πληροφορίες, εκκινητές και ανιχνευτές για γονοτυπική

doi:. 10.1371 /journal.pone.0099843.s001

(DOC)

Πίνακας S2.

γονότυπου κατανομές των SNPs σε ασθενείς με NSCLC

doi:. 10.1371 /journal.pone.0099843.s002

(DOC)

Σύνολο δεδομένων S1.

doi: 10.1371 /journal.pone.0099843.s003

(XLS)