Αφηρημένο

Ιστορικό

φωσφατάση και tensin ομόλογο (

ΡΤΕΝ

) είναι μια εδραιωμένη ογκοκατασταλτικό γονίδιο. Πρόσφατα, αυξάνοντας τις μελέτες διερευνήθηκε η σχέση μεταξύ

PTEN

IVS4 πολυμορφισμός (rs3830675) και του κινδύνου των διαφόρων τύπων καρκίνου. Ωστόσο, τα αποτελέσματα από τις μεμονωμένες μελέτες ήταν αμφιλεγόμενες. Ο στόχος αυτής της μετα-ανάλυσης ήταν να διευκρινίσει εάν

PTEN

IVS4 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Μέθοδοι

Βάσεις δεδομένων, συμπεριλαμβανομένων PubMed, Web της γνώσης και της κινεζικής Εθνικής Γνώσης υποδομής (CNKI) συστηματικά έψαξε να εντοπίζουν δυνητικά επιλέξιμες λογοτεχνίες. αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% τους (CI) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των

PTEN

IVS4 πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου.

Αποτελέσματα

συνολικά επτά μελέτες ασθενών-μαρτύρων τελικά περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση. Η συγκεντρωτική ανάλυση έδειξε ότι τα άτομα με

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (OR = 1,45, 95% CI = 1,19 – 1,76, P & lt? 0.001) και υπο-ομάδα των πεπτικών καρκίνος οδού (OR = 1.67, 95% CI = 01.28 έως 02.18, Ρ & lt? 0.001) σε σύγκριση με (+ /+) το γονότυπο. Η ανάλυση αποκάλυψε ότι αλληλόμορφο (-) αλληλόμορφο ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (OR = 1.30, 95% CI = 1.12-1.50, P = 0,001) και την υποομάδα του καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.42, 95% CI = 1,16 -1,74, Ρ = 0,001) σε σύγκριση με (+) αλληλόμορφο. Καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ

PTEN

IVS4 (+/-) γονότυπου και του κινδύνου καρκίνου

Συμπέρασμα

PTEN

IVS4 (-. /- ) γονότυπος ήταν σημαντικά σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου ειδικά για τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος σε σύγκριση με (+ /+) το γονότυπο. Το (-) αλληλόμορφο του

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδίως του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα σε σύγκριση με το (+) αλληλόμορφο. Το μοντέλο υπολειπόμενο αποτέλεσμα και κυρίαρχο μοντέλο αποτέλεσμα έδειξε επίσης στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ των

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδίως του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα. Περαιτέρω μεγάλης κλίμακας και καλά σχεδιασμένες μελέτες που αφορούν διαφορετικές εθνότητες ακόμη απαιτούνται για να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση

Παράθεση:. Sun L, Liu J, Yuan Q, Xing C, Yuan Υ (2014) σύνδεσης μεταξύ

PTEN

Gene IVS4 Πολυμορφισμός και του κινδύνου καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (6): e98851. doi: 10.1371 /journal.pone.0098851

Επιμέλεια: Aamir Ahmad, Wayne State University School of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 1 Γενάρη 2014? Δεκτές: 7 Μαΐου 2014? Δημοσιεύθηκε: 5 Ιουνίου του 2014

Copyright: © 2014 Sun et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίζεται από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Πρόγραμμα βασικής Έρευνας της Κίνας (973 Πρόγραμμα Αναφοράς 2010CB529304), τις επιχορηγήσεις του Προγράμματος Επιστήμης και Τεχνολογίας της επαρχίας Liaoning (Ref No.2011225002) και τις επιδοτήσεις του Προγράμματος Επιστήμης και Τεχνολογίας της επαρχίας Liaoning ( Κωδικός Αναφοράς 2012225016). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η παγκόσμια άχθους του καρκίνου συνεχίζει να αυξάνει σε μεγάλο βαθμό με περίπου 12,7 εκατομμύρια περιπτώσεις καρκίνου και 7,6 εκατομμύρια θάνατοι από καρκίνο κάθε χρόνο σε όλο τον κόσμο [1]. Carcinogenesis είναι ένα πολυ-βήμα και πολύπλοκη διαδικασία επηρεάζεται από διάφορους περιβαλλοντικούς και γενετικούς παράγοντες. Οι αναδυόμενες απόδειξη έχει αποδείξει ότι πολυμορφισμό του γονιδίου παίζει σημαντικό ρόλο στην διαφορά των επιμέρους ευαισθησίες σε καρκίνο [2]. Προσδιορισμός των πολυμορφισμό του γονιδίου που σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου θα ωφελήσει σε μεγάλο βαθμό την έγκαιρη πρόληψη και τη θεραπεία για τον καρκίνο.

φωσφατάση και tensin ομόλογο (

PTEN

), μια καθιερωμένη ογκοκατασταλτικό γονίδιο, είναι χαρτογραφήθηκε στο χρωμόσωμα 10q23.3.

PTEN

γονίδιο εκτείνεται σε 105 kb, συμπεριλαμβανομένων εννέα εξόνια και οκτώ εσώνια. Το 403 αμινοξέων πρωτεΐνη ΡΤΕΝ είναι μια διπλή φωσφατάση, που δρουν σε δύο τοποθεσίες σερίνης-θρεονίνης και τυροσίνης [3]. ΡΤΕΝ πρωτεΐνη περιέχει τρία μέρη: ένα Ν-τερματικό φωσφατάση καταλυτική περιοχή, μια Ο-τελική περιοχή C2 και 50 αμινοξέων Ο-τερματική ουρά η οποία περιλαμβάνει ένα μοτίβο δέσμευσης PDZ και θέσεις φωσφορυλίωσης CK2 [4]. ΡΤΕΝ εμπλέκεται στη ρύθμιση της κυτταρικής ανάπτυξης, πολλαπλασιασμού και απόπτωσης σε οδούς μεταγωγής σήματος και συμμετέχει στον έλεγχο του κυτταρικού κύκλου [5], [6]. Από την πρώτη κλώνος του το 1997, σωματικά

ΡΤΕΝ

μεταλλάξεις έχουν αναφερθεί ευρέως σε διάφορους τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του προστάτη, καρκίνου του μαστού, καρκίνου του ενδομητρίου και ούτω καθεξής [7] – [9]. Τα τελευταία χρόνια, έχει δοθεί μεγάλη προσοχή στην βλαστική πολυμορφισμός του

PTEN

γονίδιο.

ΡΤΕΝ

πολυμορφισμοί έχουν αναφερθεί ότι εμπλέκονται σε πολλαπλές καρκίνους, όπως ο καρκίνος του μαστού [10], [11], γαστρικού καρκίνου [12] και του παχέος εντέρου [13].

PTEN

IVS4 πολυμορφισμός (rs3830675) με ATCTT εισαγωγής στο 109 bp καθοδικά του εξονίου 4 στο ιντρόνιο 4 ήταν ένα από τα κοινά

PTEN

πολυμορφισμούς. Πιο πρόσφατα, η αύξηση μελέτες διερευνήθηκε η σχέση μεταξύ

ΡΤΕΝ

IVS4 πολυμορφισμό (rs3830675) και του κινδύνου των διαφόρων τύπων καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του μαστού [11], [14], ορθοκολικό καρκίνο [13], γαστρικού καρκίνου [12] , [15], καρκίνο του οισοφάγου [16] και του καρκίνου του προστάτη [17]. Ωστόσο, τα αποτελέσματα από μεμονωμένες μελέτες ήταν ασαφή. Για παράδειγμα, Canbay et al. πρότεινε ότι

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπος σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του παχέος εντέρου [13]? αλλά ο George et al. ανέφερε ότι δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση μεταξύ

PTEN

IVS4 πολυμορφισμό και την ευαισθησία στον καρκίνο του προστάτη [17].

Μέχρι τώρα, δεν υπάρχει μετα-ανάλυση έχει πραγματοποιηθεί για να διερευνήσουν τη σύνδεση των

PTEN

πολυμορφισμός IVS4 (rs3830675) με την ευαισθησία στον καρκίνο. Να διερευνήσει κατά πόσον

PTEN

IVS4 πολυμορφισμός (rs3830675) συσχετίστηκε με τους κινδύνους του καρκίνου και των συγκεκριμένων υποτύπων καρκίνου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για τη σύνδεση μεταξύ των

PTEN

IVS4 πολυμορφισμός (rs3830675) και του καρκίνου κινδύνου στην παρούσα μελέτη.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελετών

Ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων Web of Science, PubMed και Υποδομών Εθνική κινεζική Γνώσης (CNKI) ήταν συστηματικά αναζήτηση χρησιμοποιώντας διαφορετικούς συνδυασμούς των όρων αναζήτησης, συμπεριλαμβανομένων «φωσφατάσης και tensin ομόλογο /ΡΤΕΝ», «πολυμορφισμός /μετάλλαξης /παραλλαγή» και «καρκίνος /νεόπλασμα /κακοήθεια». Οι αντίστοιχες κινεζικές όρους αναζήτησης χρησιμοποιήθηκαν κατά την αναζήτηση κινεζική βάση δεδομένων. Παραπομπές που αναφέρονται σε κάθε περιλαμβάνονται λογοτεχνίες ήταν περαιτέρω αναζήτηση με το χέρι για τον εντοπισμό δυνητικών διαθέσιμες μελέτες. Εάν οι πληροφορίες που παρέχονται στη βιβλιογραφία δεν ήταν αρκούντως σαφής, ο συγγραφέας ήρθε σε επαφή για περισσότερες ανεπεξέργαστα δεδομένα. Όταν η επικάλυψη δεδομένων υπάρχει, μόνο η μελέτη με πληρέστερες πληροφορίες εγκρίθηκε. Η τελευταία ημερομηνία αναζήτησης ήταν 12 Νοεμβρίου, 2013.

ένταξης και αποκλεισμού Κριτήρια

Όλες οι περιλαμβάνονται μελέτες πρέπει να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: μελέτη ασθενών-μαρτύρων? μελέτες σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ του

PTEN

γονίδιο IVS4 πολυμορφισμός (rs3830675) και του κινδύνου καρκίνου? μελέτες που δημοσιεύθηκαν στα αγγλικά ή στα κινέζικα? μελέτες με επαρκή πρωτογενή δεδομένα για την εκτίμηση των λόγων πιθανοτήτων (OR) και το διάστημα εμπιστοσύνης 95% τους (CI). Οι κύριοι λόγοι για αποκλεισμό ήταν: διπλότυπων δεδομένων? αξιολογήσεις? που δεν σχετίζονται με τον καρκίνο ή ειδική πολυμορφισμού? πειράματα σε ζώα? δεν έχει σχεδιαστεί περίπτωση ελέγχου? Δεν ανεπεξέργαστα δεδομένα ακόμα και μετά από επικοινωνία με τον συγγραφέα.

Data Extraction

Δύο συγγραφείς (Liping Ήλιο και Jingwei Liu) ανεξάρτητα εξάγονται τα δεδομένα από τις μελέτες που περιλαμβάνονται. Τα παρακάτω στοιχεία προέρχονται από κάθε μελέτη ξεχωριστά: ο πρώτος συγγραφέας, έτος δημοσίευσης, την εθνικότητα του πληθυσμού της μελέτης, το είδος του καρκίνου, τους αριθμούς του κάθε γονότυπου στις περιπτώσεις και τους ελέγχους, οι μέθοδοι προσδιορισμού του γονότυπου για

PTEN

γονίδιο IVS4 πολυμορφισμός, πηγή ελέγχους. Η σύγκρουση επιλύθηκε μετά από συζήτηση και συναίνεση επιτεύχθηκε τελικά για όλα τα εξαγόμενα δεδομένα

Στατιστική Ανάλυση

Όλες οι στατιστική ανάλυση έγινε με το λογισμικό Stata (έκδοση 11.0?. StataCorp, College Station, ΤΧ). ΕΑΠ και το 95% CI τους χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των

PTEN

πολυμορφισμό του γονιδίου και του καρκίνου του κινδύνου. Ρ τιμή & lt? 0,05 θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική. Ετερογένεια εκτιμήθηκε με Ι-τετράγωνο (Ι

2) την αξία και τη χρήση Q στατιστική (P & lt? 0.10 υποδηλώνει σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών) [18]. Όταν ετερογένεια μεταξύ των μελετών δεν ήταν σημαντική, ένα μοντέλο σταθερών επιδράσεων χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Mantel-Haenszel [19] χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων ΕΑΠ. Σε αντίθετη περίπτωση, ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων χρήση Dersimonian και η μέθοδος Laird [20] έγινε. ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε για να εξερευνήσετε ετερογένεια όταν αναφέρθηκε σημαντική ετερογένεια. αναλύσεις υποομάδων έγιναν για να διερευνήσει τις επιπτώσεις της εθνότητας, του τύπου του καρκίνου και την πηγή των ελέγχων. Επιπλέον, η προκατάληψη δημοσίευση αξιολογήθηκαν ποιοτικά εκτελώντας οικόπεδα χοάνη και αξιολογούνται ποσοτικά με δοκιμασία Begg του [21] και τη δοκιμή Egger του [22], αντίστοιχα. P τιμή & lt? 0.1 για Begg και δοκιμές Egger υποδηλώνει σημαντική προκατάληψη δημοσίευση

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά Μελέτη

Αυτή η μετα-ανάλυση οργανώθηκε με βάση τη δήλωση PRISMA (PRISMA Checklist).. Συνολικά 492 λογοτεχνίες ελήφθησαν από ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων μετά την απομάκρυνση εις διπλούν. Μετά την εξέταση των τίτλων και των περιλήψεων, 468 άρθρα εξαιρέθηκαν κυρίως λόγω κανένα ενδιαφέρον, αξιολογήσεις, πειράματα σε ζώα ή όχι για τον καρκίνο. Στη συνέχεια, οι άφησε 24 δημοσιεύσεις αξιολογήθηκαν περαιτέρω για την επιλεξιμότητα. Δεκαεπτά λογοτεχνίες αφαιρέθηκαν επειδή δεν στα αγγλικά ή στα κινέζικα, όχι ανεπεξέργαστα δεδομένα, δεν είναι case-control που έχουν σχεδιαστεί ή όχι σχετικά με IVS4 πολυμορφισμό. Τέλος, επτά άρθρα πλήρους κειμένου με την επιλεξιμότητα συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα μετα-ανάλυση. Η λεπτομερής διάγραμμα ροής της επιλογής μελέτη φαίνεται στο Σχήμα 1.

Η

Τα αρχικά χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση συνοψίζονται στον Πίνακα 1. Όλες οι συμπεριλαμβάνονται μελέτες ασθενών-μαρτύρων δημοσιεύθηκαν στην αγγλικά ή κινέζικα 2001-2013, συνολικά αποτελείται από 1831 περιπτώσεις και 2767 ελέγχους. Οι εθνικότητες των μελετηθεί πληθυσμούς που καλύπτονται τουρκικά, κινέζικα και της Αμερικής. Η μέθοδος

ΡΤΕΝ

IVS4 πολυμορφισμού σε κάθε μελέτη ήταν όλα ανιχνεύθηκε με αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης-πολυμορφισμό μήκους θραύσματος περιορισμού (PCR-RFLP). Οι μελέτησαν τύπους καρκίνου των δημοσιεύσεων αποτελούνταν από καρκίνο του μαστού, ορθοκολικό καρκίνο, γαστρικό καρκίνο, καρκίνο του οισοφάγου και του καρκίνου του προστάτη. τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του οισοφάγου, καρκίνο του στομάχου και του παχέος εντέρου εντάχθηκαν όπως ο καρκίνος του πεπτικού συστήματος κατά την εκτέλεση ανάλυση υποομάδας με βάση τον τύπο καρκίνου.

Η

Ποσοτική Σύνθεση Δεδομένων

Τα αποτελέσματα της ποσοτικής σύνθεσης τα δεδομένα που συνοψίζονται στον πίνακα 2. τα άτομα με

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (OR = 1,45, 95% CI = 1,19 – 1,76, P & lt? 0.001, Εικόνα 2) σε σύγκριση με (+ /+) το γονότυπο. Για την ανάλυση υποομάδας σύμφωνα με τον τύπο του καρκίνου,

ΡΤΕΝ

IVS4 (- /-) γονότυπου παρατηρήθηκε ότι σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.67, 95% CI = 01.28 έως 02.18, Ρ & lt? 0.001 ), αλλά καμία σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του μαστού (OR = 1,27, 95% CI = 0,79 – 2,04, P = 0,318) ή του καρκίνου του προστάτη (OR = 1,20, 95% CI = 0,83 – 1,73, P = 0,342). Όσο για διαφορετικές εθνότητες, φορείς του

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου στα τουρκικά και κινεζικά, αλλά όχι σε αμερικανικό πληθυσμό. Στην ανάλυση υποομάδας με βάση την πηγή του ελέγχου, αυξημένος κίνδυνος καρκίνου παρατηρήθηκε στον πληθυσμό με βάση το υποομάδα αντί νοσοκομείο με βάση υποομάδα.

Η

Τα άτομα με

PTEN

IVS4 ( +/-) γονότυπος δεν συσχετίστηκαν σημαντικά με κίνδυνο καρκίνου (OR = 1.10, 95% CI = 0,84 – 1,43, Ρ = 0.484, Εικόνα 3) συγκριτικά με (+ /+) το γονότυπο. Ωστόσο, η ανάλυση υποομάδας με βάση διαφορετικό τύπο του καρκίνου έδειξαν ότι

ΡΤΕΝ

IVS4 (+/-) γονότυπο ήταν σημαντικά σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.33, 95% CI = 1,05 – 1,68, Ρ = 0,016)? ενώ καμία τέτοια συσχέτιση ανιχνεύθηκε σε υποομάδες του καρκίνου του μαστού ή καρκίνου του προστάτη. Επιπλέον, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε σε διάφορες υπο-ομάδα με βάση τις εθνότητες. Ήταν αξίζει να σημειωθεί ότι η ανάλυση υποομάδων του πληθυσμού με βάση το (PB) και το νοσοκομείο με βάση (HB) αποδεικνύεται αμφιλεγόμενη αποτελέσματα (PB: OR = 1,31, 95% CI = 1,07 – 1,59, P = 0,007? HB: OR = 0,63, 95 % CI = 0,41 – 0,96, P = 0,033), η οποία πρότεινε ότι η επιλογή των ελέγχων θα μπορούσαν να επηρεάσουν το αποτέλεσμα της σχέσης μεταξύ

PTEN

IVS4 (+/-) γονότυπου και του καρκίνου του κινδύνου.

Το μοντέλο υπολειπόμενο αποτέλεσμα και κυρίαρχο μοντέλο αποτέλεσμα έδειξε επίσης στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ των

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (- /- εναντίον (- /+ και + /+): OR = 1.56, 95% CI = 01.19 με 02.05, Ρ = 0.001, Εικόνα S2? (- /+ και – /-) έναντι (+ /+): OR = 1.26, 95% CI = 1,06 – 1,49, Ρ = 0.008, Εικόνα S3) ειδικά για τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος (- /- vs. (- /+ και + /+): OR = 1.70, 95% CI = 1,16 – 2,49, Ρ = 0,007? (- /+ και – /- .) έναντι (+ /+): OR = 1.45, 95% CI = 1,16 – 1,81, P = 0,001)

Η ανάλυση αποκάλυψε ότι το αλληλόμορφο (-) αλληλόμορφο του

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (OR = 1.30, 95% CI = 1.12-1.50, P = 0.001, Εικόνα 4) και του καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.42, 95% CI = 1,16 – 1,74, P = 0,001) σε σύγκριση με (+) αλληλόμορφο. Καμία τέτοια σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε υποομάδες του καρκίνου του μαστού ή καρκίνου του προστάτη. Σε στρωματοποιημένη ανάλυση σύμφωνα με τις διαφορετικές εθνότητες, αυξάνεται σταθερά κίνδυνος καρκίνου για

PTEN

IVS4 (-). Αλληλόμορφο παρατηρήθηκε στα τουρκικά και κινεζικά πληθυσμούς, αλλά καμία σημαντική σχέση βρέθηκε στην αμερικανική

Η

ετερογένεια Test, Ανάλυση ευαισθησίας και Δημοσίευση Bias

σε σύγκριση

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου με (+ /+) το γονότυπο, δεν υπάρχει σημαντική ετερογένεια παρατηρήθηκε στη συνολική ανάλυση και όλο το αναλύσεις υποομάδων. Ως εκ τούτου, το μοντέλο fix-αποτελέσματος εγκρίθηκε. Σε αρκετές από τις συγκρίσεις

ΡΤΕΝ

IVS4 (+/-) γονότυπο με το μοντέλο (+ /+) και γονότυπο αλληλόμορφο ανάλυση, τυχαία-αποτελέσματος χρησιμοποιήθηκαν λόγω σημαντική ετερογένεια (Πίνακας 2). ανάλυση ευαισθησίας διενεργήθηκε εν συνεχεία για την ανίχνευση της επίδρασης των επιμέρους μελέτη σχετικά με την συγκεντρωτική εκτίμηση παραλείποντας μια μελέτη από τη συγκεντρωτική ανάλυση κάθε φορά. Ο αποκλεισμός κάθε μεμονωμένη μελέτη δεν άλλαξε σημαντικά η συγκεντρωτική Ή (εικόνα δεν φαίνεται), γεγονός που υποδηλώνει ότι τα αποτελέσματα της μετα-ανάλυσης ήταν ισχυρή.

δοκιμή του Begg και δοκιμή Egger είχαν πραγματοποιηθεί για την αξιολόγηση η προκατάληψη δημοσίευση των μελετών ποσοτικά. Οι λεπτομερείς πληροφορίες για τη δοκιμή προκατάληψη δημοσίευση αυτή παρουσιάζεται στον Πίνακα 3. Σημαντικές προκατάληψη δημοσίευση παρατηρήθηκαν στην ανάλυση αλληλόμορφο και υποτελούς ανάλυση μοντέλο επίδραση του

PTEN

γονίδιο IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό. Εκτός αυτού, οικόπεδο χοάνη που ποιοτικά αξιολόγησε την προκατάληψη δημοσίευση της σύνδεσης μεταξύ

PTEN

IVS4 (- /-). Γονότυπου και του καρκίνου του κινδύνου που παρουσιάζονται στο Σχήμα S1

Η

Συζήτηση

Τα αποτελέσματα των προηγούμενων μελετών που αφορούν τη σχέση του

PTEN

γονίδιο IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου να αποδειχθεί αμφιλεγόμενη [11] – [17]. Για την καλύτερη γνώση μας, αυτή ήταν η πρώτη μετα-ανάλυση διερευνά το ρόλο του

PTEN

IVS4 πολυμορφισμό στην καρκινογένεση. Με την εκτέλεση της τρέχουσας μετα-ανάλυση, προτείναμε ότι

ΡΤΕΝ

IVS4 (- /-) γονότυπου και του (-) αλληλόμορφο συσχετίζονταν σημαντικά με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου ειδικά για τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος, αντίστοιχα. Ωστόσο, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ

PTEN

IVS4 (+/-) γονότυπου και του κινδύνου εμφάνισης καρκίνου.

Μετά την πρώτη αναγνώρισή του ως ογκοκατασταλτικό γονίδιο, το 1997, τον ρόλο του

PTEN

γονιδίων στην καρκινογένεση έχει προσελκύσει ιδιαίτερο ενδιαφέρον. Οι Σωματικές μεταλλάξεις έχουν ανιχνευθεί σε μία ποικιλία καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του μαστού, του προστάτη, το μελάνωμα και του ενδομητρίου [23], καθιστώντας το ένα από τα πιο συχνά μεταλλαγμένο καταστολείς όγκων. Επιπλέον, βλαστικής γραμμής μεταλλάξεις

ΡΤΕΝ

προδιαθέτουν τους μεταφορείς να αναπτύξουν τη νόσο του Cowden και το σύνδρομο Bannayan-Ζοηβηβ [24], [25]. Πρόσφατα, η συσχέτιση μεταξύ πολυμορφισμών του

ΡΤΕΝ

γονίδιο και τον κίνδυνο του καρκίνου έχει διερευνηθεί σε διάφορους τύπους καρκίνου. Ένα από τα πιο συχνά μελετηθεί πολυμορφισμού ήταν

PTEN

γονίδιο IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός στο ιντρόνιο 4. Ως επιμέρους μελέτες έδειξαν αντιφατικά αποτελέσματα, πραγματοποιήσαμε την παρούσα μετα-ανάλυση για τη διαλεύκανση ο ακριβής ρόλος του

PTEN

γονίδιο IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός στην καρκινογένεση

με την εκτέλεση της τρέχουσας μετα-ανάλυση, βρήκαμε ότι

PTEN

IVS4. (- /-) γονότυπου συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (OR = 1.45) και υποομάδα του καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.67) σε σύγκριση με (+ /+) γονότυπο? καμία σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ (- /-) γονότυπου και τους κινδύνους του καρκίνου του μαστού ή καρκίνου του προστάτη. Το μοντέλο υπολειπόμενο αποτέλεσμα και κυρίαρχο μοντέλο επίδραση έδειξαν επίσης σημαντική συσχέτιση μεταξύ

ΡΤΕΝ

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του (- /- vs. (- /+ και + /+): ή = 1,56? ( – /+ και – /-) έναντι (+ /+): ή = 1,26) ειδικά για τον καρκίνο του πεπτικού σωλήνα. Ομοίως, (-) αλληλόμορφο του

ΡΤΕΝ

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός επίσης σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου (OR = 1,30) και του καρκίνου του πεπτικού συστήματος (OR = 1.42) σε σύγκριση με (+) αλληλόμορφο? καμία τέτοια σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε υποομάδες του καρκίνου του μαστού ή καρκίνου του προστάτη. Διαφορετικά ο καρκίνος έχει διακριτούς μηχανισμούς της έναρξης και εξέλιξης, η προφανής διαφορετικό αποτέλεσμα των διαφορετικών υποτύπων καρκίνου σε αυτό το μετα-ανάλυση έδειξε ότι

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός θα μπορούσε να προσδώσει αλλαγμένη κινδύνους σε διάφορους τύπους καρκίνου. Η συνεπή συσχέτιση μεταξύ

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός και τον κίνδυνο του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα σε διαφορετικά γενετικά μοντέλα πρότειναν ότι

PTEN

θα μπορούσε να έχει συγκεκριμένο ρόλο στην καρκινογένεση του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα, η οποία απαιτεί περαιτέρω μελέτες για τη διερεύνηση. Όσο για διαφορετικές εθνότητες,

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου και (-) αλληλόμορφο συνδέονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου και στα δύο τουρκικά και κινεζικά, αλλά όχι στην αμερικανική. Αν και παρατηρήθηκαν διαφορετικές οργανώσεις σε χώρες της Ασίας και του Καυκάσου, το συμπέρασμα βασίζεται σε διαφορετικές εθνότητες θα πρέπει να γίνει με προσοχή, λόγω του περιορισμένου αριθμού μελέτη για τους Καυκάσιους. Επιπλέον, ετερόζυγη (+/-) γονότυπος δεν συνδέεται σημαντικά με αλλαγμένο τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, σύμφωνα με συγκεντρωτική εκτίμηση σε αυτό το μετα-ανάλυση.

Ο ρόλος των

PTEN

ως ογκοκατασταλτικό έχει έχουν εδραιωθεί. ΡΤΕΝ ανταγωνίζεται τη /μονοπάτι σηματοδότησης AKT φωσφοϊνοσιτόλης-3-κινάσης και καταστέλλει την κυτταρική επιβίωση, καθώς και τον πολλαπλασιασμό των κυττάρων, έτσι διασφαλίσεις σημαντικές κυτταρικές μηχανημάτων κατά την ογκογένεση [26]. Εκτός αυτού, ΡΤΕΝ ελέγχει μία ποικιλία βιολογικών διαδικασιών συμπεριλαμβανομένων του κυτταρικού πολλαπλασιασμού, της ανάπτυξης, της μετανάστευσης και του θανάτου [27]. Προηγούμενες έρευνες σχετικά με

PTEN

πολυμορφισμούς επικεντρώθηκε κυρίως στην περιοχή εξόνιο του

PTEN

γονίδιο. Πολύ πρόσφατα, το ιντρόνιο πολυμορφισμός του

PTEN

επέστησε την ολοένα και μεγαλύτερη προσοχή. Αν και τα εσώνια είχαν αρχικά πιστεύεται ότι είναι μη λειτουργική, διότι δεν κωδικοποιούν πρωτεΐνες, έχει προταθεί ότι μερικές από αυτές τις αλληλουχίες έχουν τις ζωτικές του λειτουργίες. [28] Μερικά εσώνια μπορεί να ρυθμίζει την έκφραση του γονιδίου [29] ενώ άλλοι αυτοί θα μπορούσαν να υποστούν περαιτέρω επεξεργασία μετά το μάτισμα για να δημιουργήσει μη κωδικοποιητική μόρια RNA [30]. Σημαντικές περιοχές ιντρονίου με πολυμορφισμό θα μπορούσε να διαταράξει τη διαδικασία ματίσματος κατά τη διάρκεια της μεταγραφής. Η

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός μπορεί να οδηγήσει σε λάθος μάτισμα ή μπορεί να είναι από ανισορροπία σύνδεσης με μια άλλη θέση για να επηρεάσουν την έκφραση και τη λειτουργία του

PTEN

. Η εναλλαγή του

ΡΤΕΝ

έκφραση θα αλλάξει αναπόφευκτα το ρόλο του

ΡΤΕΝ

στη διατήρηση της σταθερότητας γονιδιώματος και απώλεια της λειτουργίας αυτού του ογκοκατασταλτικού μπορούσε επομένως οδηγεί σε καρκινογένεση. Παρά το γεγονός ότι η προαναφερθείσα πιθανός μηχανισμός μπορεί να εξηγήσει εν μέρει την παρατηρούμενη συσχέτιση μεταξύ

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό και ευαισθησίες του καρκίνου, σπάνια λειτουργική μελέτη έχει διεξαχθεί και ο ακριβής μηχανισμός παραμένει σε μεγάλο βαθμό απατηλό. Μελλοντικές λειτουργικές μελέτες χρειάζονται ακόμη να διευκρινιστεί η ακριβής μηχανισμός του ρόλου του

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός στην καρκινογένεση.

Αρκετές οι περιορισμοί θα πρέπει να αναγνωριστεί σε αυτό το μετα-ανάλυση κατά την ερμηνεία των αποτελεσμάτων . Πρώτον, το μέγεθος του δείγματος αυτής της μετα-ανάλυσης δεν ήταν αρκετά μεγάλο, ιδίως για αναλύσεις υποομάδων. Δεύτερον, μόνο οι μελέτες που δημοσιεύονται στα αγγλικά ή στα κινέζικα συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση, η οποία θα μπορούσε να προκαλέσει μεροληψία δημοσίευση. Τρίτον, οι εθνικότητες των περισσότερων μελετών ήταν ασιατικούς πληθυσμούς με μόνο μία μελέτη που πραγματοποιήθηκε σε Καυκάσιους, η οποία αξίζει περαιτέρω επιβεβαιώσεις σε άλλες εθνικότητες. Τέλος, επειδή άλλα σημαντικά στοιχεία όπως το φύλο, η ηλικία, το οικογενειακό ιστορικό και τον κίνδυνο το περιβάλλον παράγοντες δεν ήταν διαθέσιμα, δεν θα μπορούσαμε να ληφθούν αποτελέσματα με προσαρμογές από άλλους συν-μεταβλητές.

Συμπέρασμα

Για να είναι κατέληξε στο συμπέρασμα, αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι

PTEN

IVS4 (- /-) γονότυπου συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδίως του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα σε σύγκριση με το (+ /+) το γονότυπο. Το (-) αλληλόμορφο του

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδίως του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα σε σύγκριση με το (+) αλληλόμορφο. Το μοντέλο υπολειπόμενο αποτέλεσμα και κυρίαρχο μοντέλο αποτέλεσμα έδειξε επίσης στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ των

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμός και αυξημένο κίνδυνο καρκίνου, ιδίως του καρκίνου του πεπτικού σωλήνα. Περαιτέρω μεγάλης κλίμακας και καλά σχεδιασμένες μελέτες που αφορούν διαφορετικές εθνότητες ακόμη απαιτούνται για να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα της μας μετα-ανάλυση.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Εικόνα S1.

Χωνί οικόπεδο για μελέτες συσχέτισης

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (- /- έναντι + /+)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0098851.s001

(ΔΕΘ)

Εικόνα S2.

Χωνί οικόπεδο για μελέτες συσχέτισης

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου (- /- έναντι [- /+ και + /+])

doi:. 10.1371 /περιοδικό .pone.0098851.s002

(ΔΕΘ)

Εικόνα S3.

Χωνί οικόπεδο για μελέτες συσχέτισης

PTEN

IVS4 (rs3830675) πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου ([- /- και – /+] έναντι + /+)

doi:. 10.1371 /περιοδικό .pone.0098851.s003

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0098851.s004

(DOC)