Αφηρημένο

backgroud

Η XPG (ξηροδερμία τύπου pigmentosum G) Asp1104His και XPF ( ξηροδερμία τύπος pigmentosum πολυμορφισμοί F) Arg415Gln είχε εμπλακεί σε ευαισθησίας στον καρκίνο. Τα προηγούμενα δημοσιευμένα στοιχεία σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου παρέμεινε αμφιλεγόμενο.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Για να προκύψει μια πιο ακριβή εκτίμηση της σύνδεσης μεταξύ της XPG Asp1104His και XPF πολυμορφισμοί Arg415Gln και συνολικό κίνδυνο του καρκίνου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για να διερευνήσει τη σχέση μεταξύ της ευαισθησίας του καρκίνου και XPG Asp1104His (32.162 περιπτώσεις και 39.858 έλεγχοι από 66 μελέτες) και πολυμορφισμών XPF Arg415Gln (17.864 περιπτώσεις και 20.578 έλεγχοι από 32 μελέτες) σε διάφορες μοντέλα κληρονομιά. Χρησιμοποιήσαμε αναλογίες πιθανοτήτων με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% για την αξιολόγηση της αντοχής του συλλόγου. Συνολικά, σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου βρέθηκε όταν όλες οι μελέτες συγκεντρώθηκαν στη μετα-ανάλυση των XPG Asp1104His (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 1,00-1,10? Asp /εναντίον του Asp /ASP: OR = 1,06, 95% CI = 01.01 με 01.11). Στην περαιτέρω στρωματοποιημένη και αναλύσεις ευαισθησίας, σημαντικά μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα βρέθηκε για XPF Arg415Gln (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 0,82, 95% CI = 0,71 – 0,96? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 0.83, 95% CI = 0,71 – 0,97? προσθετικό μοντέλο: OR = 0.83, 95% CI = 0,72 – 0,95) και αυξήθηκαν σημαντικά άλλα τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου βρέθηκε ανάμεσα νοσοκομείο με βάση μελέτες για XPG Asp1104His (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,23, 95% CI = 1,02 – 1,49 ).

Συμπεράσματα /Σημασία

Εν ολίγοις, αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι XPF Arg415Gln πολυμορφισμός μπορεί να σχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα και XPG Asp1104His μπορεί να είναι ένας παράγοντας χαμηλού κινδύνου με διεισδυτικά σε ορισμένες ανάπτυξη καρκίνων. Και οι πρωτογενείς μελέτες μεγαλύτερης κλίμακας που απαιτούνται για την περαιτέρω αξιολόγηση της αλληλεπίδρασης των XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε συγκεκριμένους πληθυσμούς

Παράθεση:. Αυτός XF, Liu LR, Wei W, Liu Υ, Su J, Γουάνγκ SL, et al. (2014) σύνδεσης μεταξύ των XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμοί και του κινδύνου καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (5): e88490. doi: 10.1371 /journal.pone.0088490

Επιμέλεια: Reiner Albert Veitia, Institut Jacques Monod, Γαλλία

Ελήφθη: 25 του Σεπτέμβρη 2013? Αποδεκτές: 8, Ιανουαρίου του 2014? Δημοσιεύθηκε: May 6, 2014

Copyright: © 2014 Ο et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία χρηματοδότηση ή υποστήριξη στην έκθεση

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Τα συστήματα επιδιόρθωσης του DNA παίζουν κρίσιμο ρόλο στην προστασία των κυττάρων κατά. μεταλλάξεις και είναι απαραίτητα για τη διατήρηση της ακεραιότητας του γονιδιώματος. Ορισμένα κοινά γενετικών πολυμορφισμών εντός των γονιδίων που εμπλέκονται σε αποκρίσεις βλάβη του DNA μπορεί να συνεισφέρει στην ανάπτυξη του καρκίνου και να σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο της νόσου. Επειδή μειωμένη ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA μπορεί να προκαλέσει γενετική αστάθεια και την καρκινογένεση, έχουν γονίδια που εμπλέκονται στην επιδιόρθωση του DNA έχουν προταθεί ως γονίδια ευαισθησίας υποψήφιος του καρκίνου [1]. επισκευή νουκλεοτιδίων εκτομή (NER) αποτελεί ζωτικής σημασίας μηχανισμό επιδιόρθωσης του DNA, το οποίο εξουδετερώνει τις συνέπειες των μεταλλαξιογόνων έκθεση των κυττάρων [2]

Το μονοπάτι NER αποτελείται από & gt?. 30 πρωτεΐνες που εμπλέκονται στο DNA αναγνώριση ζημιών, τομή, DNA απολίνωση και την επανασύνθεση. Επτά XP (Pigmentosum ξηροδερμίας) ομάδες συμπλήρωσης έχουν ταυτοποιηθεί, από XPA να XPG, που αντιπροσωπεύουν τις δυσλειτουργίες πρωτεϊνών στο μηχανισμό NER [3]. Η XPG (Pigmentosum ξηροδερμίας τύπου G), ένα σημαντικό συστατικό του μονοπατιού NER, κωδικοποιεί μια ειδικής δομής ενδονουκλεάση κατάλυσης 3 ‘τομή και περιλαμβάνει την επακόλουθη 5’ τομή με ERCC1-XPF ετεροδιμερές [4], [5]. Έχει παρατηρηθεί ότι υπάρχει σχέση μεταξύ του SNP στο εξόνιο 15 (G3507C, Asp1104His) και την ευαισθησία του καρκίνου. ERCC4 /XPF (υποκατάσταση Arg-to-Gln στο κωδικόνιο 415 του εξονίου 8, rs1800067) σχηματίζει ένα σφιχτό σύμπλοκο με ERCC1 να χαράσσω 5 ‘προς τη θέση βλάβης που αναγνωρίζονται και να επισκευάζονται από NER [6]. Το γονίδιο XPF κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη η οποία, μαζί με ERCC1, δημιουργεί την «ενδονουκλεάση 5 [7].

Μέχρι σήμερα, ένας αριθμός μοριακών επιδημιολογικές μελέτες έχουν γίνει για να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ XPG Asp1104His και πολυμορφισμούς XPF Arg415Gln και τα διάφορα είδη των κινδύνων καρκίνου σε διαφορετικούς πληθυσμούς [8] – [83]. Ωστόσο, τα αποτελέσματα ήταν ασυνεπής ή ακόμη και αντιφατική, εν μέρει λόγω της πιθανής μικρή επίδραση του πολυμορφισμού στον κίνδυνο καρκίνου και του σχετικά μικρού μεγέθους του δείγματος σε κάθε ένα από δημοσιευμένη μελέτη. Επιπλέον, δύο πρόσφατες μετα-αναλύσεις έχουν μελετήσει τη σχέση μεταξύ XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln και τον κίνδυνο του καρκίνου. Ωστόσο, πολλές δημοσιευμένες μελέτες δεν περιελήφθησαν στις δύο πρόσφατες μετα-αναλύσεις [84], [85]. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια περιεκτική μετα-ανάλυση με τη συμπερίληψη των πιο πρόσφατων και των σχετικών άρθρων για τον εντοπισμό στατιστικά στοιχεία της σύνδεσης μεταξύ XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμών και των κινδύνων όλων των καρκίνων που έχουν ερευνηθεί. Μετα-ανάλυση είναι ένα εξαιρετικό εργαλείο για την συνοψίζει τις διάφορες μελέτες. Δεν μπορεί να ξεπεραστεί μόνο το πρόβλημα του μικρού μεγέθους και ανεπαρκή στατιστική δύναμη του γενετικές μελέτες των πολύπλοκων χαρακτηριστικών, αλλά επίσης μπορεί να παρέχει πιο αξιόπιστα αποτελέσματα από ό, τι ένα ενιαίο μελέτη ασθενών-μαρτύρων.

Υλικά και Μέθοδοι

Αναγνώριση και την επιλεξιμότητα των σχετικών μελετών

Μια πλήρης αναζήτηση βιβλιογραφίας πραγματοποιήθηκε με τη χρήση της βάσης δεδομένων PubMed και Medline για σχετικά άρθρα που δημοσιεύτηκαν (η τελευταία ενημέρωση της αναζήτησης ήταν 5 του Σεπτέμβρη του 2013) με τις ακόλουθες λέξεις-κλειδιά «XPG», » ERCC5 «,» XPF «,» ERCC4 «,» πολυμορφισμός «,» παραλλαγή «ή» Μετάλλαξη «, και» Καρκίνος «ή» καρκίνωμα «. Επιπλέον, μελέτες που προσδιορίζονται από μια χειροκίνητη αναζήτηση των καταλόγων αναφοράς κριτικές και ανακτώνται σπουδές. Συμπεριλάβαμε όλες τις μελέτες ασθενών-μαρτύρων και μελέτες κοόρτης που διερεύνησε τη σχέση μεταξύ XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμών και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου με δεδομένα γονότυπο. Όλες οι επιλέξιμες μελέτες ανακτήθηκαν και βιβλιογραφίες τους ελέγχθηκαν για άλλες σχετικές δημοσιεύσεις. Όταν το ίδιο δείγμα χρησιμοποιήθηκε σε πολλές εκδόσεις, μόνο η πιο ολοκληρωμένη μελέτη θεωρήθηκε για περαιτέρω ανάλυση.

Τα κριτήρια ένταξης

Τα περιλαμβάνονται μελέτες που απαιτούνται για να έχουν εκπληρώσει τα ακόλουθα κριτήρια :: (1) μόνο εξετάστηκαν οι μελέτες ασθενών-μαρτύρων ή ομάδα μελετών, (2) αξιολόγησε τις πολυμορφισμών XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln και τον κίνδυνο του καρκίνου, και (3) την κατανομή του γονότυπου των πολυμορφισμών στις περιπτώσεις και έλεγχοι που περιγράφονται στις λεπτομέρειες και τα αποτελέσματα εκφράστηκαν ως αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το αντίστοιχο διάστημα εμπιστοσύνης 95% (95% CI). Βασικούς λόγους για τον αποκλεισμό των μελετών ήταν ως εξής:. (1) όχι για έρευνα για τον καρκίνο, (2) μόνο του πληθυσμού περίπτωση, και (3) εις διπλούν της προηγούμενης δημοσίευσης

Δεδομένα εξόρυξη

Πληροφορίες ήταν προσεκτικά εξάγεται από όλες τις επιλέξιμες μελέτες ανεξάρτητα από δύο ερευνητές σύμφωνα με τα κριτήρια συμπερίληψης που αναφέρονται παραπάνω. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν από κάθε μελέτη: όνομα πρώτο συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, την πηγή των ελέγχων, το μέγεθος του δείγματος, και οι αριθμοί των περιπτώσεων και των ελέγχων στα γονότυπους XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln όποτε είναι δυνατόν. Εθνότητα κατηγοριοποιήθηκε ως «Καυκάσου», «Αφρικής», (συμπεριλαμβανομένων των Αφροαμερικανών) και «Ασίας.» Δύο μελέτες πραγματοποιήθηκαν με Ισπανικός εθνοτικές ομάδες. Όταν μία μελέτη δεν αναφέρει ποιες εθνικές ομάδες συμπεριλήφθηκε ή αν ήταν αδύνατο να διαχωρίσουμε τους συμμετέχοντες σύμφωνα με φαινότυπο, το δείγμα είχε ονομαστεί ως «μεικτό πληθυσμό.» Εν τω μεταξύ, μελέτες για τη διερεύνηση περισσότερα από ένα είδος καρκίνου μετρήθηκαν ως μεμονωμένα σετ δεδομένων μόνο σε αναλύσεις υποομάδων με βάση τον τύπο του καρκίνου. Εμείς δεν ορίζει ελάχιστο αριθμό ασθενών να περιληφθούν στην παρούσα μετα-ανάλυση. Στην περίπτωση των άρθρων που αναφέρονται διαφορετικές εθνοτικές ομάδες και διαφορετικές χώρες ή περιοχές, εμείς τους θεωρούνται διαφορετικά δείγματα μελέτης για κάθε κατηγορία που αναφέρθηκε παραπάνω.

Η στατιστική ανάλυση

Το αργό αναλογίες (ΕΑΠ) αποδόσεις μαζί με τα αντίστοιχα τους 95% ΚΠ χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ των πολυμορφισμών XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln και τον κίνδυνο του καρκίνου. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ πραγματοποιήθηκαν για συν-κυρίαρχο μοντέλο (XPG Asp1104His: Του /του έναντι Asp /Asp και Asp /του έναντι Asp /Asp, XPF Arg415Gln: Gln /Gln έναντι Arg /Arg και Arg /Gln έναντι Arg /Arg)? κυρίαρχο μοντέλο (XPG Asp1104His: Asp /His + Του /του έναντι Asp /Asp, XPF Arg415Gln: Arg /Gln + Gln /Gln έναντι Arg /Arg)? υπολειπόμενο μοντέλο (XPG Asp1104His: Του /του έναντι Asp /His + Asp /Asp, XPF Arg415Gln: Gln /Gln έναντι Arg /Arg Gln + /Arg)? και προσθετικό μοντέλο (XPG Asp1104His: His έναντι Asp, XPF Arg415Gln: Gln έναντι Arg), αντίστοιχα. Μεταξύ μελέτη ετερογένεια εκτιμήθηκε υπολογίζοντας

Q

-statistic (ετερογένεια θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική εάν

P

& lt? 0.10) [86] και ποσοτικά χρησιμοποιώντας το

2

αξία, μια αξία που περιγράφει το ποσοστό της μεταβολής σε όλες τις μελέτες που οφείλονται στην ετερογένεια παρά ευκαιρία, όπου

2

= 0% δηλώνει ότι δεν υπάρχει παρατηρούμενη ετερογένεια, με το 25% θεωρείται ως χαμηλής , 50% ως μέτρια και το 75% ως υψηλό [87]. Εάν τα αποτελέσματα δεν ήταν ετερογενή, τα ομαδοποιημένα ΙΑΠ υπολογίστηκαν από το μοντέλο σταθερής επίδραση (χρησιμοποιήσαμε το

Q

-statistic, το οποίο αντιπροσωπεύει το μέγεθος της ετερογένειας μεταξύ-μελέτες) [88]. Σε αντίθετη περίπτωση, ένα μοντέλο τυχαίας επίδρασης χρησιμοποιήθηκε (όταν η ετερογένεια μεταξύ των μελετών, ήταν σημαντική) [89]. Εκτός από την σύγκριση μεταξύ όλων των υποκειμένων, εκτελέσαμε επίσης διαστρωμάτωση αναλύσεις με βάση τον τύπο του καρκίνου (αν ένας τύπος καρκίνου του περιείχε λιγότερο από τρεις μεμονωμένες μελέτες, ήταν συνδυάζονται σε ομάδα «άλλους καρκίνους»), Επίσης, ο βαθμός στον οποίο ο συνδυασμένος κίνδυνος εκτίμηση θα μπορούσε να επηρεαστεί από μεμονωμένες μελέτες εκτιμήθηκε με διαδοχικά παραλείποντας κάθε μελέτη από τη μετα-ανάλυση (αφήστε-one-out ανάλυση ευαισθησίας). Η προσέγγιση αυτή θα συλλάβει επίσης την επίδραση από τα παλαιότερα ή πρώτη θετική μελέτη (πρώτο αποτέλεσμα της μελέτης). Επιπλέον, ανάλογα επίσης μελέτες σύμφωνα με το μέγεθος του δείγματος, και στη συνέχεια επαναλαμβάνεται αυτή μετα-ανάλυση. Το μέγεθος του δείγματος ταξινομήθηκε σύμφωνα με μια τουλάχιστον 200 συμμετέχοντες και εκείνων με λιγότερα από 200 συμμετέχοντες. Τα αναφέρω κριτήρια που περιγράφηκε προηγουμένως [90]. Τέλος, η ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε επίσης, εκτός από τις μελέτες των οποίων οι συχνότητες αλληλόμορφων σε ελέγχους παρουσίασαν σημαντική απόκλιση από την ισορροπία Hardy-Weinberg (HWE), δεδομένου ότι η απόκλιση μπορεί να υποδηλώνει μεροληψία. HWE υπολογίστηκε με βάση το τεστ καλοσύνη-of-fit, και απόκλιση θεωρήθηκε όταν

P

& lt? 0,05. οικόπεδα Begg του χωνιού [91] και τη δοκιμή γραμμικής παλινδρόμησης Egger του [92] χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση προκατάληψη δημοσίευση. Αν υπήρχε προκατάληψη δημοσίευση, η μέθοδος Duval και Tweedie μη παραμετρικά «τελειώματα και να συμπληρώσετε» χρησιμοποιήθηκε για να ρυθμίσετε για αυτό [93]. Μια ανάλυση μετα-παλινδρόμησης έγινε για τον εντοπισμό των κύριων πηγών μεταξύ μελέτες διακύμανση στα αποτελέσματα, με τη χρήση της καταγραφής των ΙΑΠ από κάθε μελέτη ως εξαρτημένες μεταβλητές, και τον τύπο του καρκίνου, την εθνικότητα, το μέγεθος του δείγματος, HWE, και η πηγή των ελέγχων καθώς οι πιθανές πηγές ετερογένειας. Όλοι οι υπολογισμοί πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του λογισμικού STATA έκδοση 10.0 (STATA Corporation, College Station, TX).

Αποτελέσματα

Επιλέξιμες μελέτες και βάσεις δεδομένων μετα-ανάλυση

Εικ. 1 απεικονίζει γραφικά το διάγραμμα ροής δίκη. Εντοπίστηκαν συνολικά 236 άρθρα σχετικά με XPG Asp1104His και XPF Arg415Gln πολυμορφισμών σε σχέση με τον καρκίνο. Μετά τη διαλογή τους τίτλους και περιλήψεις, 160 άρθρα εξαιρέθηκαν επειδή ήταν άρθρα ανασκόπησης, αναφορές περιστατικών, άλλα πολυμορφισμούς των CYP1A1, ή άσχετο με την παρούσα μελέτη. Επιπλέον, από αυτά τα δημοσιευμένα άρθρα, 4 δημοσιεύσεις [76] – [79] αποκλείστηκαν εξαιτίας των πληθυσμών τους επικαλύπτεται με ένα άλλο 3 περιλαμβάνονται μελέτες [40], [44], [68]. Πέντε δημοσιεύσεις [17], [20], [40], [41], [57], συμπεριλαμβανομένων των διαφόρων ομάδων-μαρτύρων θα πρέπει να θεωρούνται ως δύο ξεχωριστές μελέτες καθένα. Όπως συνοψίζεται στον Πίνακα 1, επιλέχθηκαν 72 δημοσιεύσεις με 98 μελέτες ασθενών-μαρτύρων μεταξύ των μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων 32.162 περιπτώσεις και 39.858 έλεγχοι για XPG Asp1104His (66 μελέτες από 62 δημοσιεύσεις) και 17.864 περιπτώσεις και 20.578 έλεγχοι για XPF Arg415Gln (32 μελέτες από τις 29 εκδόσεις). Μεταξύ αυτών των μελετών, για XPG Asp1104His, υπήρχαν 7 κύστη μελέτες για τον καρκίνο, 11 μελέτες για τον καρκίνο του μαστού, 7 μελέτες για τον καρκίνο του παχέος εντέρου, 5 καρκίνου κεφαλής και τραχήλου μελέτες, 7 μελέτες για τον καρκίνο του πνεύμονα, 4 μελέτες λέμφωμα μη Hodgkin, 3 μελέτες γλοίωμα, 8 μελάνωμα μελέτες, και 14 μελέτες με τους «άλλους καρκίνους». Υπήρχαν 10 μελέτες ο καρκίνος του μαστού, 3 μελέτες του καρκίνου του πνεύμονα, 4 καρκίνο κεφαλής και λαιμού μελέτες, 4 ορθοκολικό καρκίνο, 3 μελέτες γλοίωμα, και 8 μελέτες με τους «άλλους καρκίνους» για XPF Arg415Gln. Όλες οι περιπτώσεις ήταν παθολογικά επιβεβαιωθεί.

Η

XPG Asp1104His

Οι αξιολογήσεις του συνδέσμου XPG Asp1104His πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου φαίνεται στον Πίνακα 2. Συνολικά, αυξήθηκε σημαντικά κίνδυνο καρκίνου παρατηρήθηκε στο κυρίαρχο μοντέλο (OR = 1,05, 95% διάστημα εμπιστοσύνης [CI] = 1,00-1,10,

P

αξία των τεστ ετερογένειας [

P

h

] = 0.001,

I

2 = 40,4) και σε ASP /του έναντι Asp /Asp (OR = 1,06, 95% CI = 01.01 έως 01.11,

P

h & lt? 0.001,

I

2 = 43,3), όταν όλες οι επιλέξιμες μελέτες συγκεντρώθηκαν στη μετα-ανάλυση. Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε ανάλυση υποομάδας με βάση τον τύπο του καρκίνου. Καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε σε οποιονδήποτε τύπο καρκίνου, όπως ο καρκίνος του μαστού (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.01, 95% CI = 0,94 – 1,09,

P

h = 0,128,

I

2 = 33,8, υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0,95, 95% CI = 0,83 – 1,09,

P

h = 0.173,

I

2 = 28,6 ? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.00, 95% CI = 0,93 – 1,09,

P

h = 0,098,

I

2 = 37,8? του /του έναντι Asp /asp: OR = 0.99, 95% CI = 0,86 – 1,14,

P

h = 0,185,

I

2 = 27,2? asp /του έναντι asp /asp: OR = 1,02, 95% CI = 0,94 – 1,10,

P

h = 0,136,

I

2 = 32,8), ο καρκίνος του πνεύμονα (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,13 , 95% CI = 0,98 – 1,31,

P

h = 0,045,

I

2 = 53,4, υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0.93- 1.17,

P

h = 0,212,

I

2 = 28,4? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.08, 95% CI = 0,98 – 1,19,

P

h = 0.073,

I

2 = 48.0? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.15, 95% CI = 0,94 – 1,42,

P

h = 0,071,

I

2 = 48,3? Asp /του έναντι Asp /ASP: OR = 1,13, 95% CI = 0,98 – 1,31,

P

h = 0.077,

I

2 = 47,3), και ούτω καθεξής.

η

Εξετάσαμε περαιτέρω τη συσχέτιση του πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου XPG Asp1104His ανάλογα με τον τύπο του καρκίνου και η εθνικότητα (Πίνακας 3). Για τα δείγματα των Καυκάσιων, σημαντική συσχέτιση ήταν να βρεθεί μόνο σε καρκίνο κεφαλής και τραχήλου (Του /εναντίον του Asp /His + Asp /ASP: OR = 0,71, 95% CI = 0,51 – 0,97,

P

h = 0.271,

I

2 = 23,5%), αλλά όχι καρκίνο της ουροδόχου κύστης (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 0.99, 95% CI = 0,88 – 1,12,

P

h = 0,673,

I

2 = 0.0, υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0.84, 95% CI = 0,50 – 1,41,

P

h = 0,078,

I

2 = 56,0? προσθετικό μοντέλο: OR = 0,98, 95% CI = 0,89 – 1,08,

P

h = 0,433,

I

2 = 0.0? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 0.85, 95% CI = 0,51 – 1,42,

P

h = 0,090,

I

2 = 53,8? Asp /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.01, 95% CI = 0,89 – 1,15,

P

h = 0.688,

I

2 = 0.0 ), ο καρκίνος του μαστού (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.07, 95% CI = 0,92 – 1,24,

P

h = 0.065,

I

2 = 51,8, υπολειπόμενο μοντέλο : OR = 1.07, 95% CI = 0,86 – 1,32,

P

h = 0.221,

I

2 = 28,6? προσθετικό μοντέλο: OR = 1,03, 95% CI = 0.95-1.12,

P

h = 0.113,

I

2 = 43,8? Του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.08, 95% CI = 0,87 – 1,34,

P

h = 0,215,

I

2 = 29,3? Asp /του έναντι asp /asp: OR = 1.07, 95% CI = 0,91 – 1,26,

P

h = 0,048,

I

2 = 55,2), και ούτω καθεξής. Για τα δείγματα των Ασιατών, σημαντική συσχέτιση βρέθηκε στον καρκίνο του πνεύμονα (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.27, 95% CI = 1,06 – 1,51,

P

h = 0,133,

I

2 = 50,5%? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1,28, 95% CI = 1.02-1.60,

P

h = 0,516,

I

2 = 0,0%? προσθετικό μοντέλο: OR = 1,13, 95% CI = 01.02 με 01.26,

P

h = 0.130,

I

2 = 50,9%) .

η

επίσης εξετάσαμε τη συσχέτιση του πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου XPG Asp1104His ανάλογα με τον τύπο του καρκίνου και την πηγή των ελέγχων (Πίνακας 4). Για τις πληθυσμιακές μελέτες, δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση βρέθηκε μεταξύ XPG Asp1104His πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, σύμφωνα με τον τύπο του καρκίνου και την πηγή των ελέγχων. Για το νοσοκομείο με βάση μελέτες, στατιστικά σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ του καρκίνου του μαστού (υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0,71, 95% CI = 0,55 – 0,92,

P

h = 0,262,

I

2 = 24,9%? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 0.74, 95% CI = 0,55 – 0,98,

P

h = 0,213,

I

2 = 33,3%), ορθοκολικό καρκίνο (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.33, 95% CI = 1.15-1.55,

P

h = 0.188,

I

2 = 0,0%? προσθετικό μοντέλο: OR = 1,13, 95% CI = 01.02 έως 01.25,

P

h = 0,971,

I

2 = 0,0%) , και άλλο καρκίνο (του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.22, 95% CI = 1,01 – 1,47,

P

h = 0,322,

I

2 = 13,5%), αλλά δεν είναι ο καρκίνος του πνεύμονα (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.22, 95% CI = 0,91 – 1,63,

P

h = 0.030,

I

2 = 66,4, υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.15, 95% CI = 0,96 – 1,37,

P

h = 0,105,

I

2 = 51,1? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.13, 95% CI = 0,95 – 1,35,

P

h = 0,057,

I

2 = 60.1? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1,32, 95% CI = 0,95 – 1,85,

P

h = 0,095,

I

2 = 53,5? Asp /του έναντι asp /asp: OR = 1.21, 95% CI = 0,89 – 1,63,

P

h = 0.035,

I

2 = 65,2) και το κεφάλι και του καρκίνου του τραχήλου (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0,89 – 1,22,

P

h = 0,548,

I

2 = 0.0, υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0.88, 95% CI = 0,66 – 1,16,

P

h = 0,135,

I

2 = 50,1? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.00, 95% CI = 0,88 – 1,13,

P

h = 0,441,

I

2 = 0.0? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 0.90, 95% CI = 0,66 -1.22,

P

h = 0,115,

I

2 = 53,2? Asp /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.08, 95% CI = 0,91 – 1,27 ,

P

h = 0.591,

I

2 = 0.0), και ούτω καθεξής.

Η

Υπήρξε σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών για την κυρίαρχη σύγκριση μοντέλο (

P

h = 0,001), υπολειπόμενο σύγκριση μοντέλο (

P

h = 0,073), πρόσθετο σύγκριση μοντέλο (

P

h = 0,008), η σύγκριση μοντέλο ομοζυγώτες (

P

σύγκριση h = 0,012), και ετερόζυγο μοντέλο (

P

h & lt? 0.001). Στη συνέχεια, εκτιμήσαμε την πηγή της ετερογένειας από την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή των ελέγχων, HWE, και το μέγεθος του δείγματος. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το μέγεθος του δείγματος (υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,038), αλλά δεν είναι ο τύπος του καρκίνου (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,782? Υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,208 ? του /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,336? Asp /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,825? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,556) , την εθνότητα (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,298? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,119? του /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,066? Asp /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0.449? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,241), την πηγή των ελέγχων (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,433? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,821? του /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,634? Asp /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,358? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,429), και HWE (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,126? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0.660? του /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,272? Asp /του έναντι Asp /ASP:

P

= 0,123? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,217), συνέβαλε στη σημαντική ανομοιογένεια μεταξύ των μετα-ανάλυση. Εξετάζοντας τις συχνότητες γονοτύπου στους μάρτυρες, σημαντική απόκλιση από HWE ανιχνεύθηκε στα οκτώ μελέτες [10], [26], [43], [44], [45], [53], [80], [81]. Όταν αποκλείστηκαν αυτές οι μελέτες, τα αποτελέσματα άλλαξαν μεταξύ των συνολικά καρκίνου (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.03, 95% CI = 0,99-1,08), Ασιάτες του καρκίνου του πνεύμονα (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.15, 95% CI = 0,95 – 1,41? του /του έναντι Asp /ASP: OR = 1.20, 95% CI = 0,92 – 1,55? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.10, 95% CI = 0,96 – 1,25), και το νοσοκομείο με βάση τις μελέτες των άλλων καρκίνου (υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.23, 95% CI = 1,02 – 1,49? His /His έναντι Asp /ASP: OR = 1.20, 95% CI = 0,97 – 1,48), όπως φαίνεται στον πίνακα 5. Επιπλέον, όταν η μετα-ανάλυση διεξήχθη με εξαίρεση μελέτες με μικρά μεγέθη δείγματος, τα αποτελέσματα δεν άλλαξε μεταξύ των συνολικά μελέτες για τον καρκίνο και οποιαδήποτε ανάλυση υποομάδας, όπως φαίνεται στον πίνακα 6. Τέλος, μία μελέτη που εμπλέκονται στην μετα-ανάλυση διαγράφηκε κάθε φορά για να αντανακλούν την επιρροή των ατομικών δεδομένων που με συγκεντρωτική ΕΑΠ, τα αποτελέσματα άλλαξαν μεταξύ των Καυκασίων του καρκίνου κεφαλής και τραχήλου (υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0.75, 95% CI = 0,53 – 1,06), το νοσοκομείο με βάση τις μελέτες του καρκίνου του μαστού (υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.22, 95% CI = 0,98 -1.52? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 0.79, 95% CI = 0,51 – 1,24), το νοσοκομείο με βάση τις μελέτες του καρκίνου του παχέος εντέρου (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.15, 95% CI = 0,92 – 1,45? Προσθετικό μοντέλο: OR = 1,12 , 95% CI = 0,92 – 1,35).

η

Τόσο οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του έγιναν για να εκτιμηθεί η προκατάληψη δημοσίευση λογοτεχνίες. αποτελέσματα των δοκιμών του Egger του (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,245? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0.482? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0.581? ομοζυγώτες μοντέλο:

P

= 0.443? ετερόζυγο μοντέλο:.

P

= 0,148) και την πλοκή χοάνη Begg του (Σχήμα 2) πρότεινε κανένα στοιχείο της προκατάληψης δημοσίευση στην μετα-ανάλυση

η

. XPF Arg415Gln

οι αξιολογήσεις του συνδέσμου XPF Arg415Gln πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου φαίνεται στον πίνακα 2. Δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση μεταξύ XPF Arg415Gln πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, όταν όλες οι επιλέξιμες μελέτες συγκεντρώθηκαν στη μετα-ανάλυση (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0,93 – 1,15,

P

h & lt? 0.001,

I

2 = 62,6? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1,11 , 95% CI = 0,81 – 1,52,

P

h = 0,068,

I

2 = 30,5? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 0.94- 1.16,

P

h & lt? 0.001,

I

2 = 66,7? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.10, 95% CI = 0,79 – 1,54,

P

h = 0.035,

I

2 = 35,7? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 1,02, 95% CI = 0,91 – 1,14,

P

h & lt? 0.001,

I

2 = 62,5). Στη συνέχεια, πραγματοποιήθηκε ανάλυση υποομάδας με βάση τον τύπο του καρκίνου. Σημαντική συσχέτιση βρέθηκε μεταξύ καρκίνου του πνεύμονα (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 0,82, 95% CI = 0,71 – 0,96,

P

h = 0,104,

I

2 = 55,7 %? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 0.83, 95% CI = 0,71 – 0,97,

P

h = 0,132,

I

2 = 50,7% ? προσθετικό μοντέλο: OR = 0.83, 95% CI = 0,72 – 0,95,

P

h = 0.091,

I

2 = 58,4%), αλλά όχι τον καρκίνο του μαστού ( κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.03, 95% CI = 0,92 – 1,15,

P

h = 0,167,

I

2 = 30.2? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1,22, 95% CI = 0,82 – 1,83,

P

h = 0,017,

I

2 = 58,9? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.01, 95% CI = 0,83 – 1,22 ,

P

h = 0,034,

I

2 = 52,0? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.18, 95% CI = 0,76 – 1,83,

P

h = 0,007,

I

2 = 63.8? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 0.99, 95% CI = 0,87 – 1,12,

P

h = 0,277,

I

2 = 18,6), καρκίνου κεφαλής και τραχήλου (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0,88 – 1,23,

P

h = 0.359,

I

2 = 6.9? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.47, 95% CI = 0,72 – 2,98,

P

h = 0.364,

I

2 = 5.8? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 0,90 – 1,23,

P

h = 0.302,

I

2 = 17,7? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.48, 95% CI = 0,73 – 3,00,

P

h = 0,370,

I

2 = 4.5? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 1,02, 95% CI = 0,86 – 1,21,

P

h = 0,323,

I

2 = 13,9), και ούτω καθεξής.

Εξετάσαμε περαιτέρω τη συσχέτιση του πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου XPF Arg415Gln ανάλογα με τον τύπο του καρκίνου και την εθνικότητα (Πίνακας 3). Για τα δείγματα των Καυκάσιων, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση μεταξύ καρκίνου του μαστού (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.10, 95% CI = 0,96 – 1,25,

P

h = 0.396,

I

2 = 3.9? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 2.17, 95% CI = 0,68 – 6,88,

P

h = 0,022,

I

2 = 61,9 ? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.10, 95% CI = 0,89 – 1,35,

P

h = 0,094,

I

2 = 46,8? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 2.07, 95% CI = 0,56 – 7,62,

P

h = 0,008,

I

2 = 68,2? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 1.05, 95% CI = 0,89 – 1,23,

P

h = 0,522,

I

2 = 0.0), καρκίνου κεφαλής και τραχήλου (κυρίαρχο μοντέλο: Ή = 1.04, 95% CI = 0,88 – 1,23,

P

h = 0.359,

I

2 = 6.9? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.47, 95% CI = 0,72 – 2,98,

P

h = 0.364,

I

2 = 5.8? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 0,90 – 1,23,

P

h = 0.302,

I

2 = 17,7? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.48, 95% CI = 0,73 – 3,00,

P

h = 0,370,

I

2 = 4.5? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 1,02, 95% CI = 0,86 – 1,21,

P

h = 0,323,

I

2 = 13,9), και ούτω καθεξής.

επίσης εξετάσαμε τη συσχέτιση του πολυμορφισμού XPF Arg415Gln και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, σύμφωνα με τον τύπο του καρκίνου και πηγή των ελέγχων (Πίνακας 4). Για τις πληθυσμιακές μελέτες, δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση μεταξύ καρκίνου του μαστού (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,02, 95% CI = 0,90 – 1,16,

P

h = 0.158,

I

2 = 37,3? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 0,29 – 3,77,

P

h = 0,098,

I

2 = 49.0? προσθετικό μοντέλο: OR = 0,96, 95% CI = 0,77 – 1,20,

P

h = 0,069,

I

2 = 54,0? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.05, 95% CI = 0,29 – 3,81,

P

h = 0,093,

I

2 = 49,7? Arg /Arg Gln έναντι /Arg : OR = 1.00, 95% CI = 0,87 – 1,15,

P

h = 0,133,

I

2 = 43,2) και άλλο καρκίνο (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.03, 95% CI = 0,91 – 1,17,

P

h = 0,477,

I

2 = 0.0? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 1.48, 95% CI = 0,84 -2.60,

P

h = 0,354,

I

2 = 7.9? προσθετικό μοντέλο: OR = 1.05, 95% CI = 0,93 – 1,17,

P

h = 0.731,

I

2 = 0.0? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 1.48, 95% CI = 0,84 – 2,60,

P

h = 0,386,

I

2 = 1.2? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 1,02, 95% CI = 0.90-1.15,

P

h = 0.286,

I

2 = 20,2). Για το νοσοκομείο με βάση τις μελέτες, δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε επίσης μεταξύ του καρκίνου του μαστού (κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0,78 – 1,39,

P

h = 0,178,

2 = 38,9? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 3,66, 95% CI = 0,38 – 34,9,

P

h = 0,009,

I

2 = 78.7? προσθετικό μοντέλο: OR = 1,13, 95% CI = 0,73 – 1,73,

P

h = 0,054,

I

2 = 60,7? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 3.39, 95% CI = 0,26 – 43,9,

P

h = 0,003,

I

2 = 82,8? Arg /Arg Gln έναντι /Arg: OR = 0.92, 95% CI = 0,68 – 1,25,

P

h = 0,463,

I

2 = 0.0) και άλλο καρκίνο (κυρίαρχο μοντέλο: Ή = 0.79, 95% CI = 0,59 – 1,07,

P

h = 0.035,

I

2 = 70,1? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0.70, 95% CI = 0,39 – 1,25,

P

h = 0,341,

I

2 = 6.9? προσθετικό μοντέλο: OR = 0.80, 95% CI = 0,61 – 1,05,

P

h = 0,045,

I

2 = 67,7? Gln /Gln έναντι Arg /Arg: OR = 0.69, 95% CI = 0,38 – 1,24,

P

h = 0.347,

I

2 = 5.6? Arg /Arg Gln έναντι /Arg:. OR = 0.81, 95% CI = 0,59 – 1,10,

P

h = 0,033,

I

2 = 70,8)

Υπήρξε σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μελετών για την κυρίαρχη σύγκριση μοντέλο (

P

h & lt? 0.001), υπολειπόμενο σύγκριση μοντέλο (

P

h = 0,068) , προσθετικό μοντέλο σύγκρισης (

P

h & lt? 0.001), το μοντέλο ομοζυγώτες σύγκριση (

P

h = 0.035), και το μοντέλο ετερόζυγο σύγκρισης (

P

h & lt? 0.001). Στη συνέχεια, εκτιμήσαμε την πηγή της ετερογένειας από την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή των ελέγχων, HWE, και το μέγεθος του δείγματος. Ανάλυση μετα-παλινδρόμησης έδειξαν ότι HWE (Arg /Arg Gln έναντι /Arg:

P

& lt? 0.001? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0.001? κυρίαρχο μοντέλο:

P

& lt? 0.001) και την εθνικότητα (Gln /Gln έναντι Arg /Arg:

P

= 0.001? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0.001), αλλά όχι το είδος του καρκίνου (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0.446? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,344? Gln /Gln έναντι Arg /Arg:

P

= 0,314? Arg /Arg Gln έναντι /Arg:

P

= 0.694? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,456), την πηγή των ελέγχων (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0.710? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,218? Gln /Gln έναντι Arg /Arg:

P

= 0.221? Arg /Arg Gln έναντι /Arg:

P

= 0.558? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0.962), και μέγεθος του δείγματος (κυρίαρχο μοντέλο:

P

= 0,125? υπολειπόμενο μοντέλο:

P

= 0,255? Gln /Gln έναντι Arg /Arg:

P

= 0,076? Arg /Gln έναντι Arg /Arg:

P

= 0,252? προσθετικό μοντέλο:

P

= 0,153), συνέβαλε στη σημαντική ανομοιογένεια μεταξύ των μετα-ανάλυση. He et al. Hung et al. Zhu et al. Shi et al.