PLoS One: Η σύνδεσης μεταξύ RAD23B Ala249Val Πολυμορφισμός και καρκίνος Ευαισθησία: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση


Αφηρημένο

Ιστορικό

Μια σειρά από μελέτες έχουν διερευνήσει τις ενώσεις της γενετικής ποικιλομορφίας σε

RAD23B

Ala249Val (rs1805329 C & gt? T) με την ευαισθησία του καρκίνου? Ωστόσο, τα ευρήματα είναι ασυνεπής. Πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για να αποκτήσουν μια πιο ακριβή εκτίμηση της σχέσης.

Μέθοδος

Ψάξαμε λογοτεχνίες από PubMed, Embase και Web of Science. αναλογίες Συγκεντρωτικά πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) υπολογίστηκαν για να εκτιμηθεί η σχέση μεταξύ Ala249Val πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 23 μελετών που αποτελείται από 10837 περιπτώσεις και 13971 έλεγχοι που περιλαμβάνονται στην παρούσα μετα-ανάλυση. Συνολικά, υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν μεταξύ

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου (Val /Val εναντίον Ala /Ala: OR = 0.97, 95% CI = 0,75-1,25? Ala /Val εναντίον Ala /Ala : OR = 1.08, 95% CI = 0,96 – 1,22? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0,93, 95% CI = 0,76 – 1,14 και κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.07, 95% CI = 0,94 – 1,20). Δεν βρέθηκε καμία στατιστικά σημαντική συσχέτιση με την περαιτέρω διαστρωμάτωση αναλύσεις με βάση τον τύπο του καρκίνου, την εθνότητα και την πηγή του ελέγχου.

Συμπεράσματα

Παρά ορισμένους περιορισμούς, αυτή η μετα-ανάλυση δείχνει ότι είναι απίθανο ότι η

RAD23B

249Val /Val πολυμορφισμός μπορεί να συμβάλει στην ευαισθησία του κάθε ατόμου στον κίνδυνο καρκίνου. Ωστόσο, περαιτέρω προηγμένη σχεδιασμένες μελέτες με μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος και διαφορετικές εθνότητες πρέπει να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματά μας

Παράθεση:. Li Ζ, Zhang Υ, Ying Χ, Τραγούδι J, Zhang R, Li Ζ, et al. (2014) Ο Σύνδεσμος μεταξύ

RAD23B

Ala249Val Πολυμορφισμός και καρκίνος Ευαισθησία: Στοιχεία από μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (3): e91922. doi: 10.1371 /journal.pone.0091922

Επιμέλεια: Arthur J. Lustig, Tulane University Κέντρο Επιστημών Υγείας, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 1 Σεπτέμβρη του 2013? Αποδεκτές: 18 Φεβρουαρίου 2014? Δημοσιεύθηκε: 18 Μαρτίου, 2014

Copyright: © 2014 Li et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος είναι μία από τις κύριες αιτίες θανάτου στις αναπτυγμένες οικονομικά χώρες, καθώς και τις αναπτυσσόμενες χώρες. Η παγκόσμια επιβάρυνση του καρκίνου συνεχίζει να αυξάνεται [1]. βλάβη στο DNA είναι ιδιαίτερα χρήσιμο για όλες τις πτυχές της ογκολογίας. Οι περισσότερες μεταλλάξεις και μεγάλων γονιδιωματικών μεταβολών (διαγραφές, μεταθέσεις, απώλεια ετεροζυγωτίας, και ενισχύσεις) που είναι συναφείς με τον καρκίνο προέρχεται από τραυματισμό του DNA [2]. Υπάρχουν τέσσερις σημαντικές οδούς επιδιόρθωσης του DNA σε κύτταρα θηλαστικών, στα οποία επισκευή νουκλεοτιδίου εκτομή (NER) οδός είναι η πιο ποικίλα και καλά μελετημένο σύστημα επιδιόρθωσης DNA [3], [4]. Η οδός NER παίζει σημαντικό ρόλο στην επιδιόρθωση των βλαβών ογκώδη, όπως διμερή πυριμιδίνης, φωτο-προϊόντων, μεγαλύτερη χημική προϊόντα προσθήκης και διασυνδέσεις, καθώς επίσης και για τη διατήρηση της σταθερότητας των γονιδιωματικών [4]. Υπάρχουν τουλάχιστον τέσσερα βήματα της αντίδρασης (αναγνώριση βλάβες στο DNA, τομή των κατεστραμμένων DNA, την επισκευή του διάκενα DNA, DNA απολίνωση) και διάφορα βασικά ένζυμα (XPC-RAD23B, CSB, XPA και XPF-ERCC1, κλπ) που συμμετέχουν στην NER μονοπάτι [4] – [6]. Πολυμορφισμοί σε γονίδια που σχετίζονται με μονοπάτι NER μπορεί να μεταβάλει την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και επίσης να παίζουν ρόλο στην καρκινογένεση [7]. Για παράδειγμα, η Lys939Gln και Ala499Val καθώς και οι τέχνασμα (ΑΤ) πολυμορφισμοί διαγραφής /εισαγωγής του

XPC

γονίδιο ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο συνολικό κίνδυνο καρκίνου του [8], [9]. Η XPC δεσμεύεται με RAD23B, και σχηματίζει το σύμπλοκο XPC-RAD23B, η οποία παίζει σημαντικό ρόλο στο κατεστραμμένο αναγνώριση του DNA και την έναρξη επιδιόρθωση του DNA στην οδό NER [10].

RAD23B

γονίδιο, που ονομάζεται επίσης

HR23B

ή

HHR23B

, βρίσκεται στο χρωμόσωμα 9q31.2. Υπάρχουν τουλάχιστον 1102 ανέφεραν πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) στο

RAD23B

γονιδίου περιοχής (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP).

RAD23B

Ala249Val (rs1805329 C & gt? Τ) είναι ένα από τα σημαντικά πολυμορφισμών και κωδικοποιεί πρωτεΐνη που εμπλέκεται στην αναγνώριση της βλάβης του DNA, τα οποία επηρεάζουν την ευαισθησία του καρκίνου σε άτομα [11]. Μια σειρά από μελέτες έχουν επικεντρωθεί σχετικά με τη σύνδεση μεταξύ

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμό και τον κίνδυνο Caner [12] – [31], αλλά τα συμπεράσματα εξακολουθούν να είναι ασυνεπής. Οι πιθανοί λόγοι μπορεί να είναι η μικρή επίδραση του πολυμορφισμού στον κίνδυνο καρκίνου και του σχετικά μικρού μεγέθους του δείγματος σε κάθε δημοσιευμένη μελέτη. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση που συνδυάζει τις σχετικές δημοσιευμένες μελέτες για να σχεδιάσετε μια ακριβέστερη εκτίμηση του συλλόγου.

Υλικά και Μέθοδοι

στρατηγική αναζήτησης

Εμείς συστηματικά αναζήτηση PubMed , Embase και Web of Science, χρησιμοποιώντας τους όρους αναζήτησης: «

RAD23B

ή

HR23B

ή

HHR23B

«, «πολυμορφισμός ή παραλλαγή ή παραλλαγή» και «καρκίνο ή καρκίνωμα ή όγκου «(η τελευταία έρευνα ενημερώθηκε στις 2 Νοεμβρίου 2013). Όλα Αναζητήθηκε μελέτες ανακτήθηκαν, και οι αναφορές τους, επίσης ελέγχθηκαν για άλλες σχετικές δημοσιεύσεις. άρθρα ανασκόπησης και βιβλιογραφίες άλλων συναφών μελετών που εντοπίστηκαν ήταν έψαξε το χέρι για να αποκτήσει πρόσθετες επιλέξιμες μελέτες. συμπεριλήφθηκαν μόνο οι δημοσιεύσεις στα αγγλικά με πλήρες κείμενο διαθέσιμο. Αν το ίδιο πληθυσμό ασθενών χρησιμοποιήθηκε σε πολλές εκδόσεις, μόνο η πιο πρόσφατη μελέτη που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση

Τα κριτήρια ένταξης και αποκλεισμού

Η συμπερίληψη κριτήρια έχουν ως εξής:. (Α) αξιολόγηση της συσχέτισης μεταξύ

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμό και τον κίνδυνο του καρκίνου, (β) περίπτωση ελέγχου σχεδιασμένες μελέτες, (γ) επαρκή στοιχεία που παρέχονται για την εκτίμηση των λόγων πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ).

Τα κριτήρια αποκλεισμού ήταν τα εξής: (1) σχεδιασμό της μελέτης, τα άτομα υπόθεση μόνο ή μη-καρκίνου μόνο μελέτες? (2) εις διπλούν από μια προηγουμένως δημοσιευμένη μελέτη? (3) απόκλιση από Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) σε ελέγχους χωρίς περαιτέρω απόδειξη των άλλων πολυμορφισμών του

RAD23B

γονίδιο ή άλλα γονίδια.

Δεδομένα εξόρυξη

Δύο από τα συγγραφείς (Zhenjun Li και Yan Zhang) εξάγεται ανεξάρτητα τις πληροφορίες από όλες τις επιλέξιμες δημοσιεύματα σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης. Όταν οι δύο συγγραφείς είχαν μια διαφωνία για τυχόν στοιχεία όπως η πηγή των ελέγχων, την εθνικότητα και το κ.λπ., αποφασίστηκε από τη συζήτηση μεταξύ τους. Εάν δεν μπορεί να επιτευχθεί συναίνεση, θα πρέπει να ζητείται η γνώμη άλλος συγγραφέας για την επίλυση της διαφοράς και η πλειοψηφία των ψήφων που έκανε μια τελική απόφαση. Τα ακόλουθα δεδομένα συλλέχθηκαν από κάθε μελέτη: Επώνυμο συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, τον τύπο του καρκίνου, την πηγή των ελέγχων, η μέθοδος του γονότυπου, ο συνολικός αριθμός των υποθέσεων και ελέγχων, καθώς και τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων με Ala /Ala, Ala /Val και Val /Val γονότυπους για το

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμός, αντίστοιχα. Διαφορετικών εθνοτήτων είχαν χαρακτηριστεί ως Καυκάσου, της Ασίας, Latino, της Αφρικής και περισσότερες από μία εθνότητα. Πηγή των ελέγχων στρωματοποιήθηκαν με τον πληθυσμό με βάση και νοσοκομείο. τύπος Καρκίνος περαιτέρω κατηγοριοποιούνται ως αναπνευστική οδό, την πεπτική οδό, του ουροποιητικού συστήματος, του μαστού, του εγκεφάλου και άλλων καρκίνο. Εμείς δεν ορίζει ελάχιστο αριθμό ασθενών να συμπεριλάβει στην μας μετα-ανάλυση.

Στατιστικές μέθοδοι

Χρησιμοποιήσαμε το chi-square test καλοσύνη-of-fit για HWE αξιολόγηση για κάθε μελέτη, και

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε ως απόκλιση από HWE. Αργού ΕΑΠ με ​​τους αντιστοιχεί το 95% ΚΠ χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση του βαθμού συσχέτισης μεταξύ του

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ πραγματοποιήθηκαν σε ομόζυγη μοντέλο (Val /Val εναντίον Ala /Ala), ετερόζυγο μοντέλο (Ala /Val εναντίον Ala /Ala), υπολειπόμενο μοντέλο (Val /Val εναντίον Ala /Ala + Ala /Val), και κυρίαρχο μοντέλο (Ala /Val + Val /Val εναντίον Ala /Ala), αντίστοιχα. Chi-square-based Q-test χρησιμοποιήθηκε για να ελέγξετε την παραδοχή ετερογένεια.

P

τιμές μεγαλύτερες από 0,1 για την Q-τεστ δείχνουν έλλειψη ετερογένεια μεταξύ των μελετών, ως εκ τούτου, χρησιμοποιήσαμε το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (η μέθοδος Mantel-Haenszel) για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων Ή εκτίμηση της κάθε μελέτης [ ,,,0],32]. Σε αντίθετη περίπτωση, το μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Dersimonian και Laird) χρησιμοποιήθηκε [33]. Πραγματοποιήσαμε αναλύσεις υποομάδων από μεταβλητές του τύπου καρκίνου, την εθνικότητα και την πηγή των ελέγχων. Ανάλυση ευαισθησίας διεξήχθη για να εκτιμηθεί η ακρίβεια και η σταθερότητα των αποτελεσμάτων. Πιθανή προκατάληψη δημοσίευση εκτιμήθηκε από το οικόπεδο χοάνη, στην οποία το τυπικό σφάλμα του log (OR) της κάθε μελέτης συναρτήσει του log (ή). Ένα ασύμμετρο οικόπεδο υποδηλώνει μια πιθανή προκατάληψη δημοσίευση. οικόπεδο χοάνη ασυμμετρία εκτιμήθηκε με τη μέθοδο της γραμμικής παλινδρόμησης δοκιμής Egger, η προσέγγιση γραμμική παλινδρόμηση για να μετρήσει χοάνη οικόπεδο ασυμμετρία στο φυσικό λογάριθμο κλίμακα των ΙΑΠ. Η σημασία της τομής προσδιορίστηκε με την δοκιμή t προτείνεται από Egger (

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική) [34]. Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες διεξήχθησαν με STATA έκδοση 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX). Όλα

P

τιμές ήταν δύο όψεων, και

P

& lt?. 0.05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά Μελέτη

Εντοπίσαμε 43 δυνητικά σχετικές δημοσιεύσεις μετά από διεξοδική εξέταση της βιβλιογραφίας από τους προαναφερθέντες βάσεις δεδομένων. Μετά την αξιολόγηση των εκδόσεων σύμφωνα με τα κριτήρια συμπερίληψης /αποκλεισμού, 20 από τις 43 δημοσιεύσεις πληρούσαν τα κριτήρια συμπερίληψης /αποκλεισμού και συμπεριλήφθηκαν στην τελική ανάλυση (Σχήμα 1) [12] – [31]. Μία δημοσίευση αποκλείστηκε για αυτό επικεντρώνεται στην προφορική προκαρκινικές αλλοιώσεις, οι οποίες δεν μπορούν να χαρακτηριστούν ως καρκίνο [35]. Ένας άλλος ένας [36] αποκλείστηκε για επικάλυψη δεδομένων με μια προηγούμενη μελέτη [19]. Τα υπόλοιπα 21 δημοσιεύσεις δεν ήταν μελετών συσχέτισης. Ως αποτέλεσμα, ένα σύνολο 20 δημοσιεύσεων συμπεριλαμβανομένων 10.837 περιπτώσεις και 13.971 έλεγχοι χρησιμοποιήθηκαν στην μετα-ανάλυση. Για τις δημοσιεύσεις αποτελέσματα για περισσότερες από μία εθνική ομάδα [15] ή τον τύπο του καρκίνου [27] αναφορά, τα αποτελέσματα αναλύθηκαν και αναφέρονται χωριστά. Ως εκ τούτου, 20 δημοσιεύσεις έχουν αναφερθεί ως 23 μελέτες. Ο Πίνακας 1 συνοψίζει τις μελέτες που εντοπίστηκαν και τα κύρια χαρακτηριστικά τους. Τα μεγέθη των δειγμάτων κυμαίνονταν από 61 να 1267 για τις περιπτώσεις, καθώς και από 111 να 2405 για τους ελέγχους, στην οποία τέσσερις μελέτες επικεντρώθηκαν με τον τύπο του καρκίνου του αναπνευστικού συστήματος, τον καρκίνο του πεπτικού συστήματος, καρκίνο του ουροποιητικού συστήματος, όγκου του εγκεφάλου, καθώς και άλλους καρκίνους, και τρεις για τον καρκίνο του μαστού. Υπήρχαν 17 μελέτες σχετικά με Καυκάσιους, τρεις μελέτες των Ασιατών, δύο μελέτες Λατίνοι, μια μελέτη των Αφρικανών, και ένα με περισσότερες από μία εθνότητα, αντίστοιχα. Περιπτώσεις επιβεβαιώθηκαν από ιστολογικά για 12 μελέτες και έλεγχοι συμφωνημένα για το φύλο και την ηλικία για 13 μελέτες. Από τις 23 μελέτες που περιλαμβάνονται στην τελική μας ανάλυση, οι 11 ήταν βασισμένη στον πληθυσμό, 12 ήταν νοσοκομείο. Η κατανομή των γονότυπων στους ελέγχους δεν αποκλίνουν από HWE, εκτός από τρεις μελέτες [17], [23], [24]. Υπό το πρίσμα της κατανομής των γονότυπων για άλλα γονίδια επιδιόρθωσης του DNA των ελέγχων ήταν σύμφωνη με HWE, έτσι ώστε να συμπεριληφθούν αυτές τις τρεις μελέτες σε τελική ανάλυση μας για να διευρύνει το μέγεθος του δείγματος μας και να ελαχιστοποιηθεί η μεροληψία της επιλογής.

Η

μετα-ανάλυση των αποτελεσμάτων

Τα κύρια αποτελέσματα αυτής της μετα-ανάλυσης παρουσιάζονται στον πίνακα 2 και Σχήμα 2. Συνολικά, υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν μεταξύ

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου όταν όλες οι μελέτες συγκεντρώθηκαν στη μετα-ανάλυση (Val /Val εναντίον Ala /Ala: OR = 0.97, 95% CI = 0,75-1,25? Ala /Val εναντίον Ala /Ala: OR = 1.08, 95% CI = 0,96 -1.22? υπολειπόμενο μοντέλο: OR = 0,93, 95% CI = 0,76 – 1,14 και κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1.07, 95% CI = 0,94 – 1,20). Δεν σημαντικές συσχετίσεις παρατηρήθηκαν όταν διαστρωμάτωση του τύπου καρκίνου, την εθνότητα και την πηγή των ελέγχων.

Για κάθε μελέτη, οι εκτιμήσεις των ΕΑΠ και των αντίστοιχων 95% ΠΙ χαράχθηκαν με ένα κουτί και μια οριζόντια γραμμή. Το σύμβολο γεμάτο διαμάντια δείχνει συγκεντρωτικά Ή και το αντίστοιχο 95% CI της.

Η

Ανάλυση ευαισθησίας

διαγράφεται μία μόνο μελέτη συμμετείχαν στη μετα-ανάλυση σε ένα χρόνο για να σκεφτούμε ο αντίκτυπος των ατομικών δεδομένων που με τα συγκεντρωτικά ΕΑΠ, καθώς και οι αντίστοιχες συγχωνευμένες ΕΑΠ δεν μεταβλήθηκαν σημαντικά (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται), υποδεικνύοντας ότι τα αποτελέσματά μας ήταν στατιστικά ισχυρή.

προκατάληψη Δημοσίευση

χρησιμοποιήσαμε οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger για να εκτιμήσει την προκατάληψη δημοσίευση των λογοτεχνιών. Το σχήμα του οικοπέδου χοάνη αποκάλυψαν κάποια στοιχεία προφανή ασυμμετρία και βρήκαμε μία μελέτη μπορεί να οδηγήσει σε προκατάληψη δημοσίευση [30]. Ως εκ τούτου, δοκιμή του Egger χρησιμοποιήθηκε για την παροχή περαιτέρω στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη συμμετρίας. Εμείς δεν βρήκε κανένα αποδεικτικό στοιχείο από τη δημοσίευσή μεροληψίας από τα αποτελέσματα μετά από αυτή η μελέτη είχε αποκλειστεί (

P = 0,426

για Val /Val εναντίον Ala /Ala?

P

= 0,071 για Ala /Val εναντίον Ala /Ala?

P = 0,458

για υπολειπόμενο μοντέλο?. και

P = 0,087

για κυρίαρχο μοντέλο, αντιστοίχως)

Συζήτηση

που εκτελούνται αυτή τη μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων 10.837 περιπτώσεις και 13.971 ελέγχους για να εκτιμηθεί η σχέση μεταξύ

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Δεν βρήκαμε καμία σημαντική σχέση μεταξύ αυτού του πολυμορφισμού και το συνολικό κίνδυνο καρκίνου. Αν και οι ακριβείς μηχανισμοί για το πώς

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμός επηρεάζει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε μοριακό επίπεδο παραμένει άγνωστη, η καθιερωμένη γνώση σχετικά με τις δομικές και βιολογικές λειτουργίες του

RAD23B

γονίδιο μπορεί να συνεπάγεται τη δυνητική επίδραση της αυτός ο πολυμορφισμός.

RAD23B

γονίδιο βρίσκεται στο χρωμόσωμα 9q31.2. Η πρωτεΐνη που κωδικοποιείται από

RAD23B

είναι ένα από τα δύο ανθρώπινα ομόλογα του

Saccharomyces cerevisiae Rad23

. RAD23B και πρωτεΐνες XPC δεσμεύονται για να σχηματίσουν ένα ετεροδιμερικό subcomplex XPC-RAD23B [6], [37], το οποίο παίζει καθοριστικό ρόλο στην αναγνώριση της βλάβης του DNA στο NER παγκόσμια οδού επιδιόρθωσης γονιδίωμα. Έχει αποδειχθεί ότι οι πολυμορφισμοί των γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA μπορεί να οδηγήσει σε μεταβολή της ικανότητας επιδιόρθωσης του DNA, διαδοχικά συμβάλλουν στην ευπάθεια του καρκίνου [38]. Ως εκ τούτου, οι παραλλαγές δύο γονιδίων μπορεί να αλληλεπιδρούν για να εμποδίσουν NER και να αυξήσει τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου [7].

Κατά την ανάλυση υποομάδας με βάση τις εθνότητες και την πηγή των ελέγχων, δεν βρήκαμε καμία στατιστική σημασία. Η πιθανή αιτία για τη σύνδεση ανακαλύφθηκε στη μελέτη δεν μπορεί να αναπαραχθεί σε ολόκληρη όλων των εθνοτικών ομάδων μπορεί να αποδοθεί στη διαφορά εθνότητα που μπορεί να εκθέσει σε διαφορετικό περιβάλλον, καθώς και διατροφικές διαφορά. Ορισμένα από τα ευρήματα μπορεί να οφείλεται στην τύχη, διότι μελέτες με μικρό μέγεθος του δείγματος ενδέχεται να έχουν ανεπαρκή στατιστική ισχύ για να ανιχνεύσει μια μικρή επίπτωση [39]. Λαμβάνοντας υπόψη τις περιορισμένες μελέτες και οι αριθμοί του πληθυσμού της κάθε εθνότητας που περιλαμβάνονται στη μετα-ανάλυση, τα αποτελέσματά μας θα πρέπει να ερμηνεύονται με προσοχή.

Βρήκαμε επίσης δύο πρόσφατες μετα-αναλύσεις που επικεντρώνονται στο συνολικό κίνδυνο του καρκίνου και

XPC

γονίδιο πολυμορφισμών [8], [9]. Το XPC μπορεί να δεσμευτεί με RAD23B να σχηματιστεί το σύμπλοκο XPC-RAD23B η οποία διαδραματίζει σημαντικό ρόλο σε περίπτωση βλάβης αναγνώριση του DNA [10]. He et al. [8] διαπίστωσε ότι το

XPC

Lys939Gln πολυμορφισμού συσχετίστηκε σημαντικά με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου από 62 μελέτες με συνολικά 25.708 περιπτώσεις καρκίνου και 30.432 ελέγχους, βρήκαν επίσης ο πολυμορφισμός Ala499Val συνδέθηκε με το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου με αποδείξεις από 34 μελέτες που περιελάμβαναν 14.877 περιπτώσεις και 17.888 ελέγχους. Ομοίως, Dai et al. [9] διαπίστωσε επίσης η

XPC

PAT + /+ φορείς μπορεί να έχουν αυξημένο συνολικό κίνδυνο καρκίνου από 32 δημοσιεύσεις με 10214 περιπτώσεις και 11302 ελέγχων. Ωστόσο, στην παρούσα μελέτη, δεν βρήκαμε καμία απόδειξη για τη σύνδεση μεταξύ των

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμό και το συνολικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, η οποία μπορεί να οφείλεται σε αυτού του πολυμορφισμού εκθέτοντας ένα αδύναμο ή σχεδόν καμία επίδραση στον κίνδυνο του καρκίνου. Carcinogenesis είναι μια σύνθετη διαδικασία, και των διαφόρων τύπων καρκίνου μπορεί να έχουν διαφορετικούς μηχανισμούς. Επιπλέον, είναι πιθανό ότι το μέγεθος του δείγματος για κάθε δεδομένο καρκίνου δεν είναι επαρκής για την ανίχνευση κάθε ένωση.

Το κάπνισμα είναι ένας από τους παράγοντες κινδύνου για τον καρκίνο του πνεύμονα, καθώς και άλλους καρκίνους, όπως ο καρκίνος της ουροδόχου κύστης [40 ], [41]. Ο καπνός του τσιγάρου περιέχει τουλάχιστον 55 καρκινογόνες ουσίες που μπορεί να δημιουργήσει δραστικά είδη οξυγόνου και διαδοχικά να οδηγήσει σε μεταλλάξεις [42]. Οι καρκινογόνες ουσίες μπορούν να αλληλεπιδρούν με το ανθρώπινο DNA και προκαλούν βλάβες του DNA, και αν αφεθεί επιδιορθώθηκε, όπως βλάβες του DNA μπορούν να προκαλέσουν μεταλλάξεις και να ξεκινήσει ογκογένεση [43]. Yin et al. [44] διαπιστώθηκε ότι τα βαρέα τσιγάρα οι καπνιστές μπορεί να έχουν αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του πνεύμονα. μπορεί να απαιτείται η έκθεση σε ορισμένους περιβαλλοντικούς παράγοντες για την ανίχνευση της σύνδεσης των πολυμορφισμών επιδιόρθωση του DNA και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Πολλά περιορισμούς αυτής της μετα-ανάλυσης θα πρέπει να αντιμετωπιστούν. Κατ ‘αρχάς, οι αριθμοί για κάθε τύπο του καρκίνου και τα μεγέθη των δειγμάτων ήταν σχετικά μικρό, με πιθανή ανεπαρκή στατιστική ισχύ για να διερευνήσει την πραγματική ένωση? Δεύτερον, τα αποτελέσματά μας βασίστηκαν σε αδιόρθωτη εκτιμήσεις, ενώ μια πιο ακριβή ανάλυση πρέπει να διενεργείται εάν ανεπεξέργαστα δεδομένα από κάθε μελέτη ήταν διαθέσιμα. Αυτό θα επιτρέψει την προσαρμογή με άλλα συν-παραλλαγές όπως η ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα, το καθεστώς πόσιμο, BMI, λοίμωξη από τον ιό, περιβαλλοντικούς παράγοντες, και άλλα στον τρόπο ζωής. Επιπλέον, συμπεριλάβαμε μόνο τα άρθρα που έχουν γραφτεί στα αγγλικά, τα οποία μπορούν εν δυνάμει χάσετε κάποια άρθρα.

Εν κατακλείδι, αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι

RAD23B

Ala249 Val πολυμορφισμός που δεν συνδέονται με την ευαισθησία του καρκίνου. Ωστόσο, οι αλληλεπιδράσεις των παραλλαγών γονιδίων και περιβαλλοντικών παραγόντων κινδύνου, όπως το κάπνισμα, το ποτό, τη μόλυνση, και η έκθεση στον ήλιο θα πρέπει επίσης να λαμβάνονται υπόψη στην ανάλυση. Τέτοιες μελέτες, συμπεριλαμβανομένων περισσότερων δειγμάτων με διαφορετικές εθνότητες, τους περιβαλλοντικούς παράγοντες, και επαρκή βιολογικά στοιχεία για τις λειτουργίες SNP μπορεί να οδηγήσει σε μια καλύτερη, ολοκληρωμένη κατανόηση της σύνδεσης μεταξύ της

RAD23B

Ala249Val πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0091922.s001

(DOC)

You must be logged into post a comment.