Επιστήμονες στο Πανεπιστήμιο Rice και το Πανεπιστήμιο του Τέξας MDAnderson Κέντρο Καρκίνου έχουν προφίλ με επιτυχία πρωτεΐνη pathwaysfound να είναι διακριτικό σε ασθενείς με λευχαιμία με ιδιαίτερη παραλλαγές της νόσου. Η έρευνά τους αφορούσε την δημιουργία μιας νέας computationalapproach για τον εντοπισμό πολύπλοκα δίκτυα στη σηματοδότηση πρωτεΐνης. Theyreported έργο τους αυτό το μήνα στο περιοδικό Πρωτεϊνωματική. Με τη νέα μέθοδό τους, ρύζι bioengineer Amina Qutub, MD Andersonclinician και επιστήμονας Στίβεν Kornblau και μεταπτυχιακούς Ράις studentHeather Υόρκης ανέλυσε αξίζει περισσότερο από μια δεκαετία των δεδομένων. Theyidentified μοτίβα στην έκφραση πρωτεϊνών 203 μελετήθηκε incells της οξείας μυελοειδούς λευχαιμίας (AML) ασθενείς και βρέθηκε περίπου 700 ζεύγη πρωτεΐνης (από amongthousands των δυνατοτήτων) εμπλέκεται σε τέτοια δίκτυα.

Ο στόχος είναι να τελειοποιήσουν θεραπεία για τους ασθενείς, είπε Qutub. Αν it’spossible να γνωρίζουν την πρωτεΐνη μονοπάτια ιδιαίτερης λευχαιμίας typesof σηματοδότησης, είπε, στη συνέχεια, τα φάρμακα μπορεί να βρεθεί – ή σχεδιάζονται – totarget την ασθένεια με το φράξιμο αυτών των οδών. «Λευχαιμία δεν είναι απλώς μια ασθένεια», δήλωσε ο Qutub, ο οποίος παρευρέθηκε Riceas ένα προπτυχιακό και σήμερα είναι επίκουρος καθηγητής ofbioengineering βασίζεται στο BioScience Έρευνας Συνεργατική Ράις. «Είναι πολλές, πολλές ασθένειες συγκεντρωμένων σε μία κατηγορία. Δεν μπορείτε να χρησιμοποιήσετε asledgehammer προσέγγιση για την αντιμετωπίσουμε, αν και αυτό είναι ό, τι clinicianshave έχουν κάνει. » «Μια Phillips επικεφαλής κατσαβίδι κάνει μεγάλη, αν έχετε ένα σταυρό onyour κεφαλή της βίδας», δήλωσε ο Kornblau.

«δεν λειτουργεί πολύ καλά ifyou’ve πήρε μια υποδοχή. Οι εταιρείες έχουν φάρμακα που θα μπορούσε να λειτουργήσει gangbustersin ένα μικρό ποσοστό των ασθενών, αλλά αν έχετε μελετήσει ένα largeaggregate, δεν μοιάζει με ένα πολύ ενεργό παράγοντα. Ιδανικά , αν itworks σε 5 τοις εκατό των ασθενών και μπορείτε να τα ξεχωρίσω μπροστά oftime, να τους βάλει στο σωστό φάρμακο και τα ανταλλακτικά τους άλλους 95 percentfrom να πάρει ένα φάρμακο που δεν πρόκειται να τους βοηθήσει. » Δεν είναι ασυνήθιστο για τους ασθενείς με λευχαιμία να πάει σε ύφεση, Qutubsaid, αλλά οι περισσότεροι υποστούν υποτροπή μέσα σε δύο χρόνια. «Προσπαθούμε tofigure τι είναι τόσο διαφορετικό για αυτούς τους ασθενείς, και εάν Wecan ενισχύσουν τη θεραπεία τους.

Ο μόνος τρόπος που ξέρουμε να το κάνουμε αυτό είναι tofigure από την πρωτεΐνη υπογραφή.» Οι πρωτεΐνες είναι τα workhorses του κυττάρου. Δημιουργήθηκε από blueprintsstored στο DNA, περνούν χημικά σήματα από το ένα στο άλλο withinstructions ακριβώς για κάθε δραστηριότητα ένα κύτταρο είναι ικανό. Butwhen βασική κωδικοποίηση τους είναι κωδικοποιημένο, μπορούν εξίσου εύκολα causea κύτταρο σε αυτοκαταστροφή. Qutub παρομοίασε πρωτεΐνη μονοπάτια στην κυκλοφορία της πόλης σηματοδότησης.

«Youmight πάρετε το τρένο, οδηγούν αυτοκίνητο, με τα πόδια ή να πάρετε ένα ποδήλατο, buteventually θα πάρει στη θέση σας», είπε. «Σε ασθενείς με καρκίνο, μονοπάτια πρωτεΐνη φαίνεται να ακολουθούν τα πρότυπα Στην normalcells, υπάρχουν κυρίαρχο μονοπάτια, και ενώ μπορεί να έχετε thesame μονοπάτια στα καρκινικά κύτταρα, θα μπορούσαν επίσης να έχουν alternateroutes -.. Και να τους, σε διάφορους βαθμούς» Συγκεκριμένες διαδρομές πρωτεΐνες χρησιμοποιούν για να περάσουν τα σήματα μπορεί να είναι το κλειδί todetermining το είδος τους, γι ‘αυτό άξιζε τη διερεύνηση treasuretrove των δεδομένων που είχε συγκεντρωθεί από ασθενείς MD Anderson, είπε Qutub. Το έργο ξεκίνησε με μια τυχαία συνάντηση με Qutub και Kornblau σε aconference στο Κολοράντο στην υποξία.

«Ο Steve είπε,« Είσαι workingwith μαθηματική μοντελοποίηση της υποξικής απάντηση. Έχω ένα patientset νομίζω ότι μπορεί να σας ενδιαφέρει σε. » Αυτό είναι το πώς ξεκίνησε, andit μας πήρε κάτω από ένα πολύ διαφορετικό δρόμο, χρησιμοποιώντας το μηχάνημα-learningalgorithms και στατιστικές τεχνικές που δεν ήταν μέρος της έρευνας mycore, αλλά έχουν γίνει πλέον αναπόσπαστο τόσο αυτό το έργο andother έρευνα στο εργαστήριο «, δήλωσε ο Qutub. Ο Παγκόσμιος Οργανισμός Υγείας είχε χαρακτηριστεί ασθενείς AML bycertain κυττάρου φαινοτύπων, Qutub είπε, «αλλά πολύ λίγο είχαν doneat το επίπεδο της πρωτεΐνης. Κλινικής συνεργάτες μας είχε startedgenetic και πρωτεομική μελέτες λίγο πίσω και προσδιόρισε recurrentpatterns της έκφρασης της πρωτεΐνης, μερικά από τα οποία συνδέθηκαν withrecurrent χρωμοσωμικές αλλαγές, όπως «inv (16),« η αναστροφή ofchromosome 16, ή «t (8? 21),«. που είναι το ανάστροφο των 8 και 21chromosomes » Βρίσκονται σε περίπου 15 τοις εκατό των ασθενών withAML, είπε.

«Οι ασθενείς με αυτές τις δύο χρωμοσωμικές αλλαγές ανταποκρίνονται πιο favorablyto τρέχουσα θεραπεία AML,» Kornblau είπε, «και τα γονίδια από κάθε ofthese γενετικές ανωμαλίες που εμπλέκονται στο ίδιο συγκρότημα transcriptionfactor, δημιουργώντας μια μηχανιστική σύνδεση. Όμως, παρά thismechanistic σύνδεσμο, διαφέρουν σε ορισμένα κλινικά χαρακτηριστικά andoutcome. » δεδομένων Kornblau ήταν ακριβώς ό, τι χρειάζεται Qutub και την ομάδα της. Theytargeted inv (16) και t (8? 21) για να μάθετε ποια μονοπάτια πρωτεΐνη werecommon και στις δύο αυτές κατηγορίες κυτταρογενετική, τι θα μπορούσε να explaintheir αυξημένη ανταπόκριση και ποιες αλλαγές ήταν μοναδική για eachthat μπορεί να εξηγήσει τις κλινικές διαφορές τους. Από την μάζα ofdata – πάνω από 20.000 πιθανά ζεύγη πρωτεϊνών – βρήκαν that678 ζεύγη σχετίζονται με inv (16) και t (8? 21) έχουν significantlydifferent σύγκριση με τα φυσιολογικά κύτταρα. «Υπάρχουν κάποιες γενετικούς δείκτες που σίγουρα σχετίζονται witha πρόγνωση της λευχαιμίας», δήλωσε ο Qutub.

«Και άλλα πράγματα που μπορεί να causeleukemia – οξεία μυελογενή ιδίως -. Ίσως ακόμη chemotherapyitself Ο τρόπος ασθενείς με καρκίνο θεραπεία μπορεί να είναι causingmutations και με τη σειρά της ενεργοποιεί λευχαιμικά απάντηση.» Με αναλυτική μέθοδος τους δοκιμασμένη, Qutub και teamcan της τώρα στατιστικά της ομάδας ασθενείς που παρουσιάζουν οδούς particularprotein από την ηλικία, το φύλο, τις θεραπείες και άλλα κριτήρια, andthen ρίξουμε μια πιο προσεκτική ματιά σε πρωτεΐνη μονοπάτια στο μυελό των οστών που προέρχονται από αρχέγονα κύτταρα σηματοδότησης, ένας ύποπτος σε ασθενείς που υποτροπιάζουν ακόμα και μετά από δεκαετίες ofremission. «Πιστεύουμε ότι κάτι πρέπει να είναι μοναδικό για τα βλαστικά κύτταρα», είπε. Το βασικό πρόβλημα με όλους τους καρκίνους, συμπεριλαμβανομένης της λευχαιμίας, είναι theirplasticity, είπε.

«Ο καρκίνος έχει πολλούς τρόπους για να πάρει για να thesame προορισμό. Μπορείτε να δοκιμάσετε ένα φάρμακο, και ο καρκίνος πηγαίνει tocircumvent σας και να πάει ένα διαφορετικό τρόπο. Αυτό που προσπαθώ να πω είναι,» Εδώ είναι όλες τους δυνατούς τρόπους, «γι ‘αυτό μπορεί να αρχίσει να στοχεύσετε theintersections. » Επιπλέον Αναφορές Αναφορές.

Είμαι ένας εμπειρογνώμονας από dimmableledlight-bulbs.com, ενώ παρέχει την ποιότητα των προϊόντων, όπως τα LED Par Λάμπα Κατασκευαστής, LED τόπου λάμπα, LED Σπίτι Λαμπτήρες, και πολλά άλλα.