Αφηρημένο

Ιστορικό

γονίδια επιδιόρθωσης του DNA (π.χ.: Pigmentosum ξηροδερμίας ομάδας D, XPD ) μπορεί να επηρεάσει την ικανότητα των κωδικοποιημένων ενζύμων επιδιόρθωσης του DNA για να απομακρύνει αποτελεσματικά τα προϊόντα προσθήκης DNA ή βλάβες, που μπορεί να οδηγήσει σε αυξημένο κίνδυνο καρκίνου. Η σχέση μεταξύ πολυμορφισμών του γονιδίου XPD και την ευαισθησία του καρκίνου του προστάτη (PCA) ήταν ασυνεπής σε προηγούμενες μελέτες.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Μια μετα-ανάλυση που βασίζεται στις 9 ανεξάρτητες μελέτες ασθενών-μαρτύρων που αφορούν 3165 ασθενείς του προστάτη και 3539 υγιείς μάρτυρες για

XPD Gln751Lys

SNP (μοναδικού νουκλεοτιδίου πολυμορφισμός) και 2555 περιπτώσεις και 3182 ελέγχους για

Asn312Asp

SNP εκτελέστηκε για την αντιμετώπιση αυτού του συνδέσμου. Εν τω μεταξύ, ο λόγος πιθανοτήτων (OR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση αυτής της σχέσης. Η στατιστική ανάλυση έγινε με STATA10.0. Καμία σημαντική συσχέτιση βρέθηκε μεταξύ του

XPD Gln751Lys

SNP και τον κίνδυνο του προστάτη. Από την άλλη πλευρά, στην ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνότητα, ενώσεις παρατηρήθηκαν σε χώρες της Ασίας (π.χ.

Αδη

εναντίον

Asp

:. OR = 1.34, 95% CI = 1,16 – 1,55?

Αδη /Αδη + Αδη /Asp

εναντίον

Asp /Asp

: OR = 1,23, 95% CI = 1,07 – 1,42) και της Αφρικής (π.χ.

Αδη

εναντίον.

Asp

: OR = 1,31, 95% CI = 1,01 – 1,70?

Αδη /Αδη

εναντίον

Asp /Asp

: OR = 1.71, 95% CI = 1,03 -7.10) πληθυσμούς για

Asn312Asp

SNP. Επιπλέον, παρόμοιες ενώσεις ανιχνεύθηκαν σε ελέγχους μελετών νοσοκομείο με βάση το? η συχνότητα των

Αδη /Αδη

γονότυπο σε πρώιμο στάδιο του προστάτη των ανδρών ήταν ελάχιστα υψηλότερα από εκείνα που σε προχωρημένο στάδιο προστάτη των ανδρών (OR = 1,45, 95% CI = 1,00 – 2,11).

συμπέρασμα /Σημασία

έρευνες μας δείχνουν ότι

XPD Asn312Asp

SNP όχι το

Gln751Lys

SNP, ίσως κακώς αυξήσει προστάτη κινδύνου σε Ασιάτες και Αφρικανούς, άλλωστε, αυτό SNPs μπορεί να συνδεθεί με το στάδιο του όγκου του προστάτη. Περαιτέρω μελέτες που βασίζονται σε μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος και αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος θα πρέπει να διεξάγονται για τον προσδιορισμό του ρόλου των πολυμορφισμών του γονιδίου XPD στον προστάτη του κινδύνου

Παράθεση:. Mi Υ, Zhang L, Feng Ν, Wu S, μπορείτε X, Shao Η, et al. (2012) Επίδραση της Κοινής Δύο Pigmentosum ξηροδερμίας Ομάδα D (XPD) Gene πολυμορφισμοί σε κίνδυνο καρκίνου του προστάτη. PLoS ONE 7 (9): e44756. doi: 10.1371 /journal.pone.0044756

Επιμέλεια: Kin Mang Lau, Η κινεζική Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 14 Απρ 2012? Αποδεκτές: 6, Αύγ του 2012? Δημοσιεύθηκε: 21, Σεπτεμβρίου 2012

Copyright: © Mi et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από το Ίδρυμα Φύση Επιστήμη της επαρχίας Jiangsu (NO. BK2010577) και το πρόγραμμα Εξαιρετική Ιατρική Ακαδημαϊκή Leader επαρχίας Jiangsu (RC201178). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του προστάτη (PCA) είναι ο πιο κοινός καρκίνος στους άνδρες μη δερματολογική στην Ευρώπη και τις ΗΠΑ, και η έκτη κύρια αιτία του καρκίνου που σχετίζονται-θανάτων, αντιπροσωπεύοντας το 14% (903, 500) του συνόλου των νέων διάγνωση περιπτώσεων καρκίνου και 6% (258, 400) ολόκληρων θανάτων από καρκίνο στους άνδρες το 2008 [1]. Παρά την υψηλή συχνότητα και η νοσηρότητα της, η αιτιολογία του προστάτη παραμένει σε μεγάλο βαθμό άγνωστη, μόνο η ηλικία, την εθνικότητα, τη διατροφή και το οικογενειακό ιστορικό είναι εγκατεστημένοι παράγοντες κινδύνου. Είναι καλά τεκμηριωμένο ότι γενετικός παράγοντας διαδραματίζουν επίσης σημαντικό ρόλο στην παθογένεση του προστάτη [2], [3].

Διάφορα αλλοιώσεις του DNA μπορεί να προκληθεί από την έκθεση σε περιβαλλοντικούς και ενδογενείς καρκινογόνες ουσίες, συμπεριλαμβανομένων των υπεριώδους ακτινοβολίας (UV) , ο καπνός του τσιγάρου, διατροφικούς παράγοντες, αντιδραστικά είδη οξυγόνου, και καρκινογόνες ουσίες. Οι περισσότερες από αυτές τροποποιήσεις, αν δεν επισκευαστεί, μπορεί να οδηγήσει σε γενετική αστάθεια, μεταλλαξογένεση και κυτταρικό θάνατο. Επειδή οδούς επιδιόρθωσης του DNA (DRP) παίζουν κρίσιμο ρόλο στη διατήρηση της γονιδιωματική ακεραιότητα σε γενικές και εξειδικευμένες λειτουργίες των κυττάρων καθώς και στην πρόληψη της καρκινογένεσης, ως εκ τούτου η αποστασία αυτών των γονιδίων σε DRP μπορεί να οδηγήσει σε highter ευαισθησία σε πολλαπλές καρκίνους [4 ], [5].

υπάρχει μια σειρά από DRP, κάθε υπεύθυνος για την επισκευή έναν διαφορετικό τύπο βλάβης του DNA. επισκευή βάσης εκτομή (BER) αφαιρεί απλές τροποποιήσεις βάσεων, συμπεριλαμβανομένων των single-σπασίματα, οξειδωτική βλάβη του DNA, και η αλκυλίωση και nonbulky προσαγωγές [6]. επισκευή νουκλεοτιδίων εκτομή (NER) αφαιρεί μεγαλύτερες βλάβες, που συχνά προκύπτουν από περιβαλλοντικές ζημίες, συμπεριλαμβανομένης της UV ακτινοβολίας και των εξωτερικών καρκινογόνες ουσίες [7]. Αλκυλοτρανσφερασών αντίστροφη απευθείας βλάβη του DNA με τη μεταφορά αλκυλομάδες από κατεστραμμένα DNA πάνω στο ένζυμο τρανσφεράσης [8]. Οι διπλής έλικας του DNA διαλείμματα επισκευαστεί μέσω μηχανισμών, συμπεριλαμβανομένου του ομόλογου ανασυνδυασμού οδού επιδιόρθωσης [9]. Παραλλαγές αλληλουχίας σε γονίδια επιδιόρθωσης του DNA επίσης πιστεύεται ότι ρυθμίζουν την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA και, συνεπώς, μπορεί να σχετίζεται με αλλαγμένη κίνδυνο καρκίνου [10].

Η ομάδα Pigmentosum ξηροδερμίας D (XPD) γονίδιο που κωδικοποιεί για την πρωτεΐνη NER βρίσκεται στο χρωμόσωμα 19q 13.3. Αποτελείται από 23 εξώνια και εκτείνεται σε περίπου 54.000 ζεύγη βάσεων [11], [12]. Το γονίδιο XPD, επίσης γνωστή ως επισκευή εκτομή εγκάρσιας συμπληρώνοντας επισκευή τρωκτικών ανεπάρκειας ομάδα 2 (ERCC2), είναι σημαντική για το περιβάλλον που προκαλείται από τον καρκίνο [13]. XPD είναι ένα ένζυμο στο μονοπάτι NER που αφαιρεί ορισμένες DNA διασταυρούμενων δεσμών, UV φωτο-αλλοιώσεις, και ογκώδη χημικές ενώσεις προσθήκης [14]. Μεταλλάξεις στο γονίδιο XPD μπορεί να εμποδίσει εντελώς το άνοιγμα του DNA και τη διπλή τομή, τα βήματα που οδηγούν στην επισκευή των προϊόντων προσθήκης DNA [15].

Δύο κοινά μη συνώνυμες πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNP) στην περιοχή κωδικοποίησης του το γονίδιο XPD έχουν εντοπιστεί: α

G → A

υποκατάσταση προκαλεί εξόνιο 10 το κωδικόνιο

312 Asp

να ανταλλαγούν για

Αδη

(

Asp312Asn

,

D312N

,

G23592A

, rs1799793) και ένα

A → C

υποκατάσταση προκαλεί εξόνιο 23 το κωδικόνιο

751 Lys

να αντικατασταθεί για

Gln

(

Lys751Gln

,

L751Q

,

A35931C

, rs13181) [16], [17]. Αυτά τα δύο πολυμορφισμών που σχετίζονται με μικρότερη χωρητικότητα επιδιόρθωση του DNA και ένα υψηλότερο επίπεδο προϊόντων προσθήκης DNA [17], [18].

Αρκετές επιδημιολογικές μελέτες έχουν εξετάσει τις ενώσεις μεταξύ SNPs σε γονίδια επιδιόρθωσης του DNA, ως επί το πλείστον μη συνώνυμες SNPs σε γονίδιο XPD με πιθανούς λειτουργική σημασία και τον κίνδυνο προστάτη [19] – [26]. Ωστόσο, τα αποτελέσματα ήταν ασυνεπής σε αυτές τις μελέτες οφείλεται εν μέρει σε διαφορετικούς πληθυσμούς μελέτης, περίπτωση διαπίστωσης, είτε λόγω του μικρού μεγέθους του δείγματος της κάθε μελέτης και, συνεπώς, η δυνατότητα για ψευδώς θετικά ευρήματα, καθώς και περιορισμένη ισχύ για την ανίχνευση μέτρια ενώσεις. Ο στόχος της μελέτης μας ήταν να εξεταστούν οι συσχετίσεις μεταξύ των δύο πολυμορφισμών XPD και τον κίνδυνο της PCA σε μεγαλύτερα δείγματα από μετα-ανάλυση.

Υλικά και Μέθοδοι

στρατηγική αναζήτησης

Ψάξαμε οι βάσεις δεδομένων Pubmed και Embase για όλα τα άρθρα σχετικά με τη σχέση μεταξύ XPD δύο πολυμορφισμών (

Asn312Asp

και

Gln751Lys

) και προστάτη κίνδυνο έως και 20 Μαρτίου 2012. οι ιατρικές θεματικές επικεφαλίδες και τις λέξεις κλειδιά που χρησιμοποιούνται για την αναζήτηση ήταν «XPD ή ERCC2 ή pigmentosum ξηροδερμίας ομάδα D ή επισκευή εκτομή εγκάρσιας συμπληρώνοντας την επισκευή των τρωκτικών ανεπάρκειας ομάδα 2», και «ο καρκίνος του προστάτη ή του όγκου», και «πολυμορφισμό ή παραλλαγή». Η ηλεκτρονική αναζήτηση συμπληρώθηκε με τον έλεγχο λίστες αναφοράς από τις προσδιοριζόμενες άρθρα και σχόλια για πρόσθετες αρχικές εκθέσεις. Όλοι οι μελέτες πρέπει να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: (1) μελέτη σχεδιάστηκε χρησιμοποιώντας τη μεθοδολογία της μελέτης ασθενών-μαρτύρων? (2) η σχέση μεταξύ

XPD Asn312Asp

και /ή

Gln751Lys

πολυμορφισμούς και τον κίνδυνο του προστάτη, εξερευνήθηκε? (3) περιπτώσεις με καρκινώματα διαγνώστηκαν με ιστοπαθολογική. Τα κύρια κριτήρια αποκλεισμού ήταν: (1) εις διπλούν δεδομένων, (2) αφηρημένα, σχόλια, κριτική και εκδοτική, και (3) δεν υπάρχουν επαρκή στοιχεία που αναφέρθηκαν. Όλες οι μελέτες δημοσιεύτηκαν στην αγγλική γλώσσα.

Δεδομένα αφαίρεσης

Δύο από τους συγγραφείς (Dai, Peng) εξάγονται όλα τα δεδομένα ανεξάρτητα, πληρούσε τα κριτήρια επιλογής, και κατέληξαν σε συμφωνία για όλα τα θέματα. Σε περίπτωση διαφωνίας, το ένα τρίτο συγγραφέα (Zhang) αξιολόγησε τα άρθρα. Τα ακόλουθα στοιχεία συλλέχθηκαν: πρώτο συγγραφέα επώνυμο, έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, την εθνικότητα, την πηγή του ελέγχου (νοσοκομείο-based, ΗΒ και βάσει πληθυσμού, PB) και Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) του ελέγχου, ο συνολικός αριθμός και τον γονότυπο, διανομές σε περιπτώσεις /ελέγχους και τη μέθοδο προσδιορισμού του γονότυπου. Για τις μελέτες που συμπεριέλαβαν άτομα από διαφορετικές εθνότητες, τα δεδομένα εξάγονται ξεχωριστά και κατηγοριοποιούνται ως Καυκάσιους, Ασιάτες και Αφρικανοί. Agalliu et al. [25] ανέφερε ότι προστάτη διαγιγνώσκονται με τις περιφερειακές ή μακρινό στάδιο είχαν σχέση με τους άνδρες με εντοπισμένο στάδιο κατά τη διάγνωση για το στάδιο του καρκίνου. Ωστόσο, Mandal et al. [26] ανέφεραν ότι το στάδιο του όγκου διαιρέθηκε σε μετάσταση στα οστά (+) και τη μετάσταση στα οστά κανένας (-). Στην παρούσα μελέτη μας, χαρακτήρισε το στάδιο του όγκου σε «πρώιμο στάδιο» [τοπική σκηνή ή των οστών καμία μετάσταση (-)] και «προχωρημένο στάδιο» [περιφερειακό /μακρινό στάδιο ή μετάσταση στα οστά (+)]. Σε σχέση με το σκορ Gleason αναλύσεις, υποθέσεις ομαδοποιήθηκαν σε εκείνους με σκορ Gleason 2-7 (≤7), και εκείνων με σκορ Gleason 7-10 (≥7) κατά τη διάγνωση.

Η στατιστική ανάλυση

Η ισχύς της σύνδεσης μεταξύ των XPD δύο πολυμορφισμούς και τον κίνδυνο του προστάτη μετρήθηκε με αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (ΠΙ). Συγκεντρωτικά ΕΑΠ ελήφθησαν από συνδυασμό μεμονωμένων μελετών σε σύγκριση ετεροζυγώτες (

Gln /Gln

εναντίον

Gln /Lys

για

751

SNP,

Αδη /Αδη

vs.

Αδη /Asp

για

312

SNP), η σύγκριση ομοζυγώτες (

Gln /Gln

εναντίον

Lys /Lys

για

751

SNP,

Αδη /Αδη

εναντίον

Asp /Asp

για

312

SNP), κυρίαρχα και υπολειπόμενο μοντέλα (

Gln /Gln

+

Gln /Lys

εναντίον

Lys /Lys

και

Gln /Gln

εναντίον

Gln /Lys

+

Lys /Lys

για

751

SNP,

Αδη /Αδη

+

Αδη /Asp

εναντίον

Asp /Όπως

p και

Αδη /Αδη

εναντίον

Αδη /Asp

+

Asp /Asp

για

312

SNP) και σύγκριση αλληλομόρφων (

Gln vs.Lys

για

751

SNP,

Αδη

εναντίον

Asp

για

312

SNP), αντίστοιχα. Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών ελέγχθηκε με τη χρήση του Chisquare βάση

Q

στατιστική και θεωρούνται στατιστικά σημαντικές σε

P

& lt? 0.05 [27]. Όταν

P

& gt? 0,05, η συγκεντρωτική Ή κάθε μελέτης υπολογίστηκε με βάση το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (η μέθοδος Mantel-Haenszel, οι οποίες βάρη τις μελέτες κατά το αντίστροφο της διακύμανσης των εκτιμήσεων)? Αλλιώς, το μοντέλο τυχαίων δράσεων (η μέθοδος Dersimonian και Laird) χρησιμοποιήθηκε [28], [29]. Η σημασία των συγκεντρωμένων Ή καθορίστηκε από το

Z

-test, και

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική. Η αποχώρηση των συχνοτήτων της XPD πολυμορφισμών από την προσδοκία κάτω HWE εκτιμήθηκε από το chi-square test στους ελέγχους και

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε ως σημαντική ανισορροπία. προκατάληψη δημοσίευση διαγνώστηκε με γραμμική μέθοδο παλινδρόμησης και χοάνη οικόπεδο Egger του. Η

P

-τιμή μικρότερη από 0.05 σε γραμμική παλινδρόμηση Egger έδειξε την παρουσία πιθανή προκατάληψη δημοσίευση [30], [31]. Όλες οι στατιστικές δοκιμασίες για αυτό το μετα-ανάλυση έγιναν με STATA λογισμικό, έκδοση 10.0 (STATA Corp., College Station, TX, USA), και όλες οι δοκιμές ήταν δύο όψεων.

Αποτελέσματα

μελέτες χαρακτηριστικά

Ένα σύνολο από 29 άρθρα που επιτυγχάνεται με την αναζήτηση βιβλιογραφίας από το Pubmed και Embase, χρησιμοποιώντας διαφορετικούς συνδυασμούς των βασικών όρων. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, εννέα επιλέξιμες μελέτες ανακτήθηκαν για λεπτομερή αξιολόγηση. Αποκλείσαμε 20 μελέτες: 12 ήταν αναδιπλασιάζω, ένα είδος προϊόντος ήταν κριτική, 3 χαρτιά ήταν για τους άλλους τύπους καρκίνου (καρκίνος των ωοθηκών, του παχέος αδένωμα και μη-μελάνωμα καρκίνος του δέρματος), δύο δεν σχετίζονται με case-control μελετών και τελευταίο άρθρο ήταν περίπου SNP-SNP δεν αλληλεπιδράσεις για την ενιαία πολυμορφισμού SNP. Τέλος, εντοπίστηκαν 8 άρθρα (9 μελέτες ασθενών-μαρτύρων, 3165 περιπτώσεις και 3539 ελέγχους) για

Gln751Lys

πολυμορφισμό και 6 άρθρα (7 μελέτες ασθενών-μαρτύρων, 2555 περιπτώσεις και 3182 ελέγχους) για

Asn312Asp

πολυμορφισμός να αξιολογηθεί η συσχέτιση με τον κίνδυνο για την PCA, αντίστοιχα (Πίνακας S1). Η κατανομή των γονότυπων μεταξύ των ελέγχων ήταν σύμφωνο με HWE σε όλες τις μελέτες, εκτός από δύο [16], [19]. Για τη λύπη μας, σε όλες περιλαμβάνονται μελέτες, η διατροφή και το οικογενειακό ιστορικό του προστάτη δεν είχαν καθοριστεί. Με την εξαίρεση των δύο μελετών (Gao et al και λεβάντα κ.ά.), η ηλικία μεταξύ ασθενών και μαρτύρων ήταν συμφωνημένα. πληθυσμό ελέγχου, συμπεριλαμβανομένων όλων των αποτελείτο από συμμετέχοντες στη μελέτη με μια κανονική δακτυλική εξέταση (DRE) και του προστάτη ορού ειδικού προστατικού αντιγόνου (PSA) τιμές των & lt? 4 ng /ml, καθώς και παλιές συμφωνημένα άνδρες, δεν οικογενειακό ιστορικό καρκίνου και όχι προηγούμενο ιστορικό καρκίνου . Rybicki et al. [16] ανέφερε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων ότι το 90% ήταν Καυκάσιοι, 9% ήταν Αφρο-Αμερικανοί, και μόνο το 1% ήταν Ασιάτες ή ισπανόφωνοι, επιλέξαμε τα κυρίως Καυκάσιους στη μετα μας. Για τον πολυμορφισμό Gln751Lys, τρεις μελέτες είχαν διεξαχθεί σε Καυκάσιους, τέσσερις σε Ασιάτες, δύο μελέτες για τους Αφρικανούς. Δύο μελέτες ήταν ΗΒ? οι άλλοι ήταν PB. Για τον πολυμορφισμό Asn312Asp, υπήρχαν 3 μελέτες σχετικά με Καυκάσιους, 2 για τους Αφρικανούς και 2 περίπου Ασιάτες? τρεις μελέτησε προήλθε από ΗΒ και 4 από το PB. Δύο μελέτες [25], [26] refered στο σύστημα βαθμολόγησης Gleason και το στάδιο των κλινικών όγκου (Πίνακας 1). Οι μέθοδοι καθορισμού γονοτύπου περιλαμβάνεται PCR-FLIP (αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης και τα περιοριστικά μήκους θραύσματος πολυμορφισμού), ΑΒΙ SNPlex (Applied Biosystems SNPlex ™ σύστημα Γονοτυποποίηση), ARM-PCR (ενίσχυση πυρίμαχα μετάλλαξη-ειδική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης) και MALDI-TOF-MS (μήτρα -assisted χρόνος ιονισμού εκρόφησης λέιζερ της φασματομετρίας μάζας πτήσης).

η

η ποσοτική σύνθεση

Τα αποτελέσματα της συνολικής μετα-ανάλυση δεν δείχνουν καμία συσχέτιση μεταξύ των δύο XPD (

Asn312Asp /Gln751Lys

) πολυμορφισμών και την ευαισθησία του προστάτη για όλες τις γενετικές μοντέλα (π.χ.: ομοζυγώτες σύγκριση: OR = 0,99 /1,48, 95% CI = 0,86 – 1,14 /0,90-2.43,

P

heterpgeneity = 0.681 /0.000,

P

= 0,926 /0,118? κυρίαρχο μοντέλο: OR = 1,00 /1,04, 95% CI = 0.95-1.04 /0,99-1.09,

P

heterpgeneity = 0,955 /0,064,

P

= 0.887 /0.159? αλληλομόρφων σύγκριση: OR = 1,00 /1,20, 95% CI = 0,95-1,05 /0,99-1.46,

P

heterpgeneity = 0.769 /0.001,

P

= 0,899 /0,068, αντίστοιχα) (Πίνακας S2). Μετά τον αποκλεισμό δύο μελέτες δεν συμφωνεί με HWE, η συνολική συσχέτιση δεν άλλαξε. Δεν βρήκαμε κανένα σημαντικό αποτέλεσμα όταν στρωματοποιημένη τις μελέτες από την εθνικότητα και την πηγή των ελέγχων μεταξύ

Gln751Lys

πολυμορφισμό και τον κίνδυνο του προστάτη.

Για

Asn312Asp

πολυμορφισμό, όταν στρωματοποιημένη σύμφωνα με την εθνικότητα, σημαντικά αυξημένο ενώσεις βρέθηκαν σε Ασιάτες (π.χ.:

Αδη εναντίον Asp

: OR = 1.34, 95% CI = 1,16 – 1,55,

P

heterpgeneity = 0,619 ,

P

= 0.000?

Αδη /Αδη

εναντίον

Asp /Asp

: OR = 1.77, 95% CI = 1,29 – 2,42,

P

heterpgeneity = 0,415,

P

= 0.000 και

Αδη /Αδη

+

Αδη /Asp

εναντίον

Asp /Asp

: Ή = 1.23, 95% CI = 1,07 – 1,42,

P

heterpgeneity = 0,096,

P

= 0,005) και Αφρικανοί (

Αδη

εναντίον

asp

: OR = 1,31, 95% CI = 1,01 – 1,70,

P

heterpgeneity = 0.885,

P

= 0,046?

Αδη /Αδη

εναντίον του

Asp /Asp

: OR = 1.71, 95% CI = 01.03 έως 07.10,

P

heterpgeneity = 0,617,

P

= 0,043 και

Αδη /Αδη

εναντίον

Αδη /Asp

+

Asp /Asp

: OR = 2,63, 95% CI = 1,00 – 6,89,

P

heterpgeneity = 0.609,

P

= 0.050). Παρόμοιες σχέσεις αναφέρθηκαν στο ΗΒ πηγή του ελέγχου υποομάδα (Πίνακας S2).

Είναι ενδιαφέρον ότι, σε σύγκριση με το

Αδη /Asp

+

Asp /Asp

γονότυπους, προστάτη περιπτώσεις με

Αδη /Αδη

γονότυπο έδειξε ελάχιστα υψηλότερο ποσοστό αξία στην ομάδα πρώιμο στάδιο, αλλά όχι σε προχωρημένο στάδιο ομάδας (OR = 1,45, 95% CI = 1,00 – 2,11,

P

heterpgeneity = 0,732,

P

= 0,052) (Πίνακας 1). Για τη λύπη μας, καμία σχέση δεν βρέθηκε μεταξύ των

Gln751Lys

SNP και Gleason σκοράρει ή το στάδιο του όγκου του προστάτη, επίσης, μεταξύ των

Asn312Asp

SNP και το σκορ Gleason του προστάτη (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

ανάλυση ευαισθησίας και προκατάληψη διάγνωση

Χρησιμοποιούμε ανάλυση ευαισθησίας για να προσδιοριστεί εάν η τροποποίηση των κριτηρίων ένταξης της μετα-ανάλυσης επηρέασαν τα τελικά αποτελέσματα. Τέλος, καμία άλλη μεμονωμένη μελέτη επηρέασε την περίληψη ή ποιοτικά όπως προκύπτει από την ανάλυση ευαισθησίας (τα στοιχεία δεν δείχνουν). δοκιμή του Egger του έγινε για να αποκτήσετε πρόσβαση στην προκατάληψη δημοσίευση της λογοτεχνίας, η οποία χρησιμοποιείται για να παρέχει στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη συμμετρίας. Τελικά, τα αποτελέσματα δεν δείχνουν καμία ένδειξη για μεροληψία δημοσίευσης (Πίνακας S3).

Συζήτηση

Η ταυτοποίηση των SNPs που επηρεάζουν τη λειτουργία του γονιδίου ή έκφραση και να συμβάλλουν στην ευπάθεια του προστάτη, είναι σημαντικό να βοηθήσει στην πρόβλεψη ατομικές και πληθυσμού υψηλού κινδύνου και να κατανοήσουν την παθογένεια του προστάτη. Rybicki et al. πρώτη βρέθηκε XPD δύο κοινών πολυμορφισμών να σχετίζεται με τον κίνδυνο του προστάτη σε έναν Καυκάσιο πληθυσμό το 2004 [16]. Μετά από αυτό, αρκετοί ερευνητές αναπαραχθεί το έργο του σε διαφορετικούς πληθυσμούς. Ωστόσο, τα αποτελέσματα παρέμειναν σύγχυση, ακόμη και εντός του ίδιου πληθυσμού. Μετα-ανάλυση είναι ένα μέσο για την αύξηση της αποτελεσματικό μέγεθος δείγματος υπό διερεύνηση μέσω της συγκέντρωσης των δεδομένων από μεμονωμένες μελέτες σύνδεσης, ενισχύοντας έτσι τη στατιστική ισχύ της ανάλυσης για την εκτίμηση των γενετικών επιπτώσεων [32]. Οι δύο πολυμορφισμοί XPD έχουν συσχετιστεί με τον κίνδυνο καρκίνου κεφαλής και τραχήλου [33], καρκίνο του οισοφάγου [34], ο καρκίνος του πνεύμονα [35] και του καρκίνου του μαστού [36]. Ωστόσο, η σχέση μεταξύ αυτών των δύο πολυμορφισμών και την ευαισθησία του προστάτη είναι ακαθόριστη. Στην παρούσα μελέτη μας, αναλύσαμε τις συσχετίσεις μεταξύ XPD δύο SNPs (

Asn312Asp /Gln751Lys

) και τον κίνδυνο του προστάτη με τη χρήση της μεθόδου μετα να πάρετε ένα ισχυρό συμπέρασμα. Ο πιθανός ρόλος της XPD δύο πολυμορφισμούς ως καθοριστικός παράγοντας του προστάτη κινδύνου διερευνήθηκε σε ένα δείγμα 6752 ατόμων (3165 περιπτώσεις και 3539 ελέγχους για

Gln751Lys

και 2555 περιπτώσεις και 3182 ελέγχους για

Asn312Asp

) από εννέα δημοσιευμένες μελέτες ασθενών-μαρτύρων.

Μικρή είναι γνωρίζουμε με βεβαιότητα σχετικά με το υποκείμενο μηχανισμό αυτής της σύνδεσης. Το γονίδιο XPD έχει χαρτογραφηθεί στο χρωμόσωμα 19q13.3. Εκτείνεται σε πάνω από 20 kb, περιέχει 23 εξόνια και κωδικοποιεί την πρωτεΐνη 761 αμινοξέων. Η πρωτεΐνη XPD, αφενός, κατέχει τόσο μονής έλικος DNA εξαρτώμενη ΑΤΡάση και δραστηριότητες ελικάση DNA 5′-3 ‘, η οποία είναι απαραίτητη για NER μονοπάτι και μεταγραφή? Από την άλλη πλευρά, είναι απολύτως απαραίτητη για την αποτελεσματική ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA, η οποία είναι απαραίτητη για τη διατήρηση της γενετικής σταθερότητας και σχετίζεται με την ευαισθησία του καρκίνου όταν ανίκανος [13], [37]. Δύο κοινά SNPs στο γονίδιο XPD είναι σε ανισορροπία σύνδεσης, και μεταλλαγμένους φαινοτύπους τους έχουν δείξει ότι σχετίζονται με την ικανότητα επιδιόρθωσης του DNA χαμηλότερη [18], το οποίο σημαίνει ότι αυτά τα SNPs μπορούν να συμβάλλουν στην καρκινογένεση και μπορεί να είναι ως παράγοντες κινδύνου για την ανάπτυξη καρκίνου. Πολλές επιδημιολογικές μελέτες έχουν διερευνήσει τη σχέση μεταξύ των δύο πολυμορφισμών XPD και του προστάτη, αλλά τα αποτελέσματα ήταν ασαφή. Bau et al. [19] ανέφεραν μια 1.81 φορές αυξημένο κίνδυνο προστάτη σε άτομα που φέρουν τουλάχιστον 1 αλληλόμορφο γονίδιο μεταλλάξεων για το

Asn312Asp

ή

Gln751Lys

πολυμορφισμό. Παρομοίως, Rybicki et al. [16] ανέφερε επίσης μια μικρή αύξηση σε προστάτη του κινδύνου (OR 1.16 και 1.14) σε άτομα εάν είναι φορείς του σπανιότερη παραλλαγή γονότυπο (

312Asn /Αδη

ή

751Gln /Gln

, αντίστοιχα ). Λεβάντα et al. [24] βρήκαν ότι τα άτομα που διαθέτουν τουλάχιστον μία XPD 312 Asn αλληλόμορφο είχε μια κατά 1,3 έως 8,6 φορές μεγαλύτερο κίνδυνο προστάτη σε σύγκριση με εκείνους με τη

312 Asp /Asp

γονότυπο, ωστόσο, δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές στις συχνότητες αλληλόμορφο μεταξύ των περιπτώσεων και ελέγχων για

Gln751Lys

πολυμορφισμό. Η μελέτη μας έδειξε παρόμοια παρατήρηση με λεβάντα et al. [24] και Mandal et al. [26].

Στην παρούσα μελέτη, δεν παρατηρήθηκε σημαντική συσχέτιση βρέθηκε κάτω από οποιοδήποτε γενετικό μοντέλο στη συνολική ανάλυση. Ωστόσο, στην στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, σημαντικά αυξημένα ενώσεις ανιχνεύθηκαν μεταξύ

XPD Asn312Asp

δεν

Gln751Lys

πολυμορφισμού και του προστάτη μεταξύ των ασιατικών και αφρικανικών πληθυσμών. Πρέπει να υπάρχουν ορισμένοι παράγοντες που θα μπορούσαν να συμβάλουν σε αυτή την διαφορά. Πρώτον, πολλαπλά γονίδια και περιβαλλοντικών παραγόντων μπορεί να οδηγήσει σε σχηματισμό PCa. Δεύτερον, η εθνικότητα μπορεί να σχετίζεται με προστάτη συχνότητα. Για παράδειγμα, η PCA είναι η πιο κοινή μη-δερματική κακοήθεια και η δεύτερη κύρια αιτία θνησιμότητας από καρκίνο στις δυτικές άνδρες. Σε αντίθεση με τις τάσεις των δυτικών χωρών, οι επίπτωσης και θνησιμότητας αυξάνονται σε πολλές /χώρες της Ασίας και της Κεντρικής και Ανατολικής Ευρώπης, όπως η Ιαπωνία, η Κίνα και η Πολωνία, γεγονός που υποδηλώνει μια ολοένα και πιο δυτικότροπες τρόπο ζωής σε αυτές τις περιοχές [38], [39]. Τέλος, ο χρόνος προκατάληψη υστέρηση και η μεροληψία δημοσίευση μπορεί επίσης να παίζουν ρόλο σε αυτό το μετα-ανάλυση.

Όλοι γνωρίζουμε ότι το σύστημα βαθμολόγησης σκορ Gleason έχει αντέξει στη δοκιμασία του χρόνου ως προγνωστικός δείκτης του προστάτη αποτέλεσμα. Επιπλέον, το στάδιο του όγκου του προστάτη είναι κεντρικής σημασίας για τη διαχείριση, επειδή συμβάλλει τόσο στην πρόβλεψη πρόγνωση και τον σχεδιασμό της θεραπείας. Στην παρούσα μελέτη, η συχνότητα των περιπτώσεων προστάτη πραγματοποιείται

312Asn /Αδη

γονότυπο σε περιπτώσεις πρώιμο στάδιο ήταν περισσότερο υψηλότερο σε σχέση με προχωρημένες περιπτώσεις στάδιο, επιπλέον,

Αδη /Αδη

γονότυπος σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο προστάτη, ως εκ τούτου, είχαμε προβλέψει

312Asn /Αδη

γονότυπο θα μπορούσε να μας βοηθήσει ελάχιστα για τον εντοπισμό του προστάτη και να αξιολογεί την πρόγνωση της. Καμία σχέση δεν ανιχνεύθηκε ανάμεσα κλινικά χαρακτηριστικά του προστάτη και

Gln751Lys

SNP.

Αν και, έχουμε θέσει σημαντικές προσπάθειες και πόρους σε δοκιμές πιθανή συσχέτιση μεταξύ πολυμορφισμών XPD και τον κίνδυνο του προστάτη, εξακολουθούν να υπάρχουν ορισμένοι περιορισμοί κληρονόμησε από τις δημοσιευμένες μελέτες. Πρώτον, παρόλο που συλλέξαμε όλα τα επιλέξιμα μελέτες, το μέγεθος του δείγματος των περιλαμβάνονται μελέτες δεν ήταν αρκετά μεγάλη, πράγμα που θα μπορούσε να αυξήσει την likehood του τύπου Ι και τύπου ΙΙ λάθη. Ως εκ τούτου, υπήρχε έλλειψη στατιστικής ισχύος για να αξιολογηθεί καλύτερα η σχέση μεταξύ πολυμορφισμών XPD και τον κίνδυνο του προστάτη, ειδικά στην ανάλυση μίας υποομάδας με βάση την εθνικότητα. αλληλεπιδράσεις Δεύτερον, το γονίδιο-γονίδιο και το γονίδιο-περιβάλλοντος δεν αναλύθηκαν. Είναι πιθανό ότι οι συγκεκριμένες περιβαλλοντικές και παράγοντες του τρόπου ζωής μπορεί να τροποποιήσει αυτές τις συσχετίσεις μεταξύ των πολυμορφισμών των γονιδίων και του προστάτη. Ως εκ τούτου, είναι απαραίτητο να αξιολογηθούν οι ρόλοι κάποιων ειδικών περιβαλλοντικών παραγόντων και του τρόπου ζωής, όπως η διατροφή, η κατανάλωση αλκοόλ και το κάπνισμα και η οικογένειά του καρκίνου ιστορία. Τρίτον, δύο μελέτες refered στο σκορ Gleason για

Gln751Lys

και επίσης δύο μελέτες σχετικά με το στάδιο του όγκου περίπου

Asn312Asp

, ο αριθμός των οποίων ήταν μικρή, περαιτέρω μελέτες θα πρέπει να αυξήσει τις σχέσεις αυτές για μεγέθυνση της μετέπειτα μετα -ανάλυση. Τέταρτον, χαρακτήρισε το στάδιο του όγκου σε «πρώιμο στάδιο» [τοπική σκηνή ή των οστών καμία μετάσταση (-)] και «προχωρημένο στάδιο» [περιφερειακό /μακρινό στάδιο ή οστικών μεταστάσεων (+)], ωστόσο, τα κριτήρια της επιλογής του ασθενούς σε αυτές δύο μελέτες δεν ήταν αρκετά συγκλίνουσες. Παρά αυτά, μας μετα-ανάλυση είχε επίσης τρία πλεονεκτήματα. Πρώτον, σημαντικό αριθμό περιπτώσεων και ελέγχων συνενώθηκαν από διάφορες μελέτες, οι οποίες αυξήθηκαν σημαντικά στατιστική ισχύ της ανάλυσης. Δεύτερον, η ποιότητα των μελετών ασθενών-μαρτύρων που περιλαμβάνονται στη σημερινή μετα-ανάλυση ήταν ικανοποιητική με βάση τα κριτήρια επιλογής μας. Τρίτον, οι ομάδες ελέγχου ήταν όλοι υγιείς ανθρώπους.

Εν κατακλείδι, το παρόν ανάλυση έδειξε ότι

XPD Asn312Asp

δεν

Gln751Lys

πολυμορφισμός μπορεί να συμβάλει στη γενετική προδιάθεση για αυξημένο κίνδυνο PCA σε Αφρικανούς και Ασιάτες. Επιπλέον,

XPD Asn312Asp

πολυμορφισμός σχετίζεται με προστάτη πρόγνωση ή /και το αποτέλεσμα. Μεγάλες πληθυσμιακές μελέτες που απαιτούνται για να εκτελεστεί να διευκρινίσει πιθανοί ρόλοι των πολυμορφισμών XPD στην αιτιολογία και κλινικά χαρακτηριστικά του προστάτη.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1. χαρακτηριστικά

Μελέτη από δημοσιευμένες μελέτες σχετικά με τη σχέση μεταξύ γονίδιο XPD δύο πολυμορφισμών και προστάτη

doi:. 10.1371 /journal.pone.0044756.s001

(DOC)

Πίνακας S2.

Total και στρωματοποιημένη ανάλυση XPD γονιδίου δύο πολυμορφισμών για προστάτη

doi:. 10.1371 /journal.pone.0044756.s002

(DOC)

Πίνακα S3. δοκιμές

Δημοσίευση προκατάληψη (οικόπεδο χοάνη Egger για δοκιμή προκατάληψη δημοσίευση) για γονιδιακή XPD δύο πολυμορφισμούς

doi:. 10.1371 /journal.pone.0044756.s003

(DOC)