Αφηρημένο

χρωμόσωμα 8q24 συνήθως ενισχύεται σε πολλούς τύπους καρκίνου, ιδιαίτερα του καρκίνου του πνεύμονα. Οι πολυμορφισμοί σε αυτή την περιοχή που σχετίζεται με κίνδυνο διαφορετικών καρκίνων. Για να διερευνήσουν τη σχέση μεταξύ των τριών πολυμορφισμούς μονών νουκλεοτιδίων (SNPs) (rs1447295, rs16901979 και rs6983267) στο 8q24 και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη ένωση σε δύο Κινέζων Χαν πληθυσμούς: ένας πληθυσμός ήταν από την επαρχία Zhejiang (576 ασθενείς περίπτωση και 576 ελέγχου θέματα), ενώ η άλλη ήταν από την επαρχία Fujian (576 ασθενείς περίπτωση και 576 άτομα ελέγχου). Βρήκαμε ότι rs6983267 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα και στους δύο πληθυσμούς. Σε σύγκριση με το γονότυπο ΤΤ, ο γονότυπος GG σχετίστηκε με μια σημαντική 1.555 φορές αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) 1,218 έως 1,986,

P

= 4.0 × 10

-4 ]. Η επίδραση αυτή ήταν πιο έντονη σε μη καπνιστές [αναλογία πιθανοτήτων (OR) = 2.366, 95% CI 1,605 έως 3,488,

P

= 1.4 × 10

-5]. Αναλύσεις στρωματοποιημένη με ιστολογία αποκάλυψε ότι rs6983267 GG γονότυπος ήταν πιο σχετίζεται με ασθενείς με άλλους ιστολογικών τύπων (OR = 3.012, 95% CI 1,675 έως 5,417,

P

= 2.3 × 10

-4). Η ΑΑ γονότυπος του rs1447295 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο για αδενοκαρκίνωμα σε σύγκριση με το γονότυπο CC (OR = 2.260, 95% CI 1,174 έως 4,353,

P

= 0,015). Επιπλέον, ο GG γονότυπος του rs6983267 συσχετίστηκε με χειρότερη επιβίωση στον πληθυσμό Zhejiang (αναλογία κινδύνου (HR) = 1.646, 95% CI 1,099 έως 2,464,

P

= 0,016). Καμία σχέση δεν παρατηρήθηκε για rs16901979. Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι οι γενετικές παραλλαγές στο 8q24 μπορεί να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου του πνεύμονα

Παράθεση:. Zhang Χ, Τσεν Q, Εκείνος C, ο Μάο W, Zhang L, Xu Χ, et al. (2012) Οι πολυμορφισμοί στο 8q24 συνδέονται με καρκίνο του πνεύμονα Κινδύνου και Επιβίωση στην Κινέζων Χαν. PLoS ONE 7 (7): e41930. doi: 10.1371 /journal.pone.0041930

Επιμέλεια: Τζωρτζίνα Λ Κρατήστε, Πανεπιστήμιο του Αμπερντίν, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: May 10, 2012? Αποδεκτές: 29 του Ιουνίου, 2012? Δημοσιεύθηκε: 27, Ιουλίου 2012

Copyright: © 2012 Zhang et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορήγηση από την Επιστήμη και την Τεχνολογία Οργανισμός Taizhou (111ky07-7). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του πνεύμονα εξακολουθεί να είναι η κύρια αιτία θανάτου από καρκίνο σχετίζονται τόσο στους άνδρες όσο και τις γυναίκες σε όλο τον κόσμο. Στην Κίνα, ο καρκίνος του πνεύμονα αντιπροσώπευαν 536.407 νέες περιπτώσεις καρκίνου και 475.768 θανάτους καταχωρήθηκε το 2005 [1]. Τις τελευταίες δεκαετίες, τα ποσοστά επίπτωσης και θνησιμότητας του καρκίνου του πνεύμονα έχουν σημαντικά αυξηθεί λόγω της γήρανσης του πληθυσμού και η συνεχής αύξηση της κατανάλωσης καπνού στην Κίνα [1], [2], [3], [4]. Αν και το κάπνισμα είναι η κύρια αιτία του καρκίνου του πνεύμονα και συμβάλλει σε περισσότερο από 80% των περιπτώσεων [5], μόνο ένα μικρό κλάσμα των καπνιστών να αναπτύξουν καρκίνο του πνεύμονα. Αυτό το εύρημα υποδεικνύει ότι οι γενετικοί παράγοντες επηρεάζουν επίσης τον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα. Αν και έχουν γίνει προσπάθειες για τον εντοπισμό των γενετικών παραγόντων για τον καρκίνο του πνεύμονα, οι τρέχουσες γνώσεις για να εκτιμήσει τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα παραμένει περιορισμένη.

Πρόσφατα, μερικές μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) έχουν βρει ότι παραλλαγές στο χρωμόσωμα 8q24 είναι συνδεδεμένα με τον κίνδυνο πολλών μορφών καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του μαστού, του προστάτη, της ουροδόχου κύστης, του παχέος εντέρου, και καρκίνους των ωοθηκών, μεταξύ πολλών πληθυσμών μελέτη [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12 ], [13], [14], [15], [16], [17]. Επιπλέον, οι παραλλαγές επί 8q24 έχουν βρεθεί να σχετίζονται με την ευαισθησία σε ανώτερο γαστρεντερικό καρκίνο [18], [19], [20], οστεοσάρκωμα [21], τον καρκίνο του θυρεοειδούς [22], [23], [24], και ο καρκίνος του εγκεφάλου [25]. Αυτή η περιοχή εκτείνεται περίπου 600 kb και θεωρείται ως ένα γονίδιο-φτωχή περιοχή, με σχετικά λίγους προβλέψει γονιδίων, συμπεριλαμβανομένων DQ486513, CB104826, και DQ515897, καθώς και ψευδογονιδίου POU5F1P1. Το πρωτο-ογκογονίδιο v-myc ογκογονίδιο ιού μυελοκυτομάτωσης ομόλογο (γρίπης) (MYC) έχει προσδιοριστεί να είναι το γονίδιο σχετίζεται με τον καρκίνο βρίσκεται πλησιέστερα προς την περιοχή που σχετίζεται με τον καρκίνο σε GWAS. Οι μεταγραφικοί ενισχυτές σε αυτή την περιοχή έχει αποδειχθεί ότι αλληλεπιδρά φυσικά με τον υποκινητή MYC [26], [27] και ενδεχομένως να επηρεαστούν από τις παραλλαγές που σχετίζεται με καρκίνο [28].

Τρία παρακείμενα γονιδιωματικής μπλοκ (περιοχές 1-3 ) επί 8q24 έχουν συσχετιστεί με τον κίνδυνο καρκίνου του προστάτη [29]. Οι πιο σημαντικές πολυμορφισμοί μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) rs1447295 στην περιοχή 1, rs16901979 στην περιοχή 2, και rs6983267 στην περιοχή 3 [29]. Αυτές οι SNPs και επιπλέον 8q24 παραλλαγές έχουν επικυρωθεί από μεταγενέστερες μελέτες σύνδεσης. Επιπλέον, αυτές οι SNPs έχουν βρεθεί να συνδέονται με άλλες μορφές καρκίνου [8], [9], [18], [19], [20], [21], [30]. Δεδομένου ότι η 8q24 χρωμοσωμική περιοχή συνήθως ενισχύεται σε ιστούς καρκίνου του πνεύμονα [31], [32], [33], [34], γενετικές παραλλαγές επί 8q24 μπορεί να σχετίζεται με την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Επιπλέον, SNPs στο 8q24 μπορεί να επηρεάσει τα επίπεδα έκφρασης των σχετιζόμενων με τον καρκίνο γονίδια [26], [27], [35], τα οποία πιστεύεται ότι παίζουν ρόλους στην καρκινογένεση του καρκίνου του πνεύμονα. Στην παρούσα μελέτη, έχουμε επιλέξει ένα SNP από κάθε περιοχή για να αξιολογηθεί η πιθανή συσχέτιση αυτών των SNPs με καρκίνο του πνεύμονα στην Κινέζων Χαν.

Αποτελέσματα

χαρακτηριστικά του πληθυσμού

Τα χαρακτηριστικά των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα και θέματα ελέγχου που συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη συνοψίζονται στον πίνακα 1. Περισσότεροι άνδρες από τις γυναίκες είχαν συμπεριληφθεί μεταξύ των ασθενών περίπτωση και τα θέματα ελέγχου, αλλά οι διαφορές φύλου μεταξύ αυτών των ομάδων δεν ήταν σημαντική (

P

& gt ? 0.05), υποδηλώνοντας επαρκή ταίριασμα τους. Η μέση ηλικία του πληθυσμού ήταν 58,2 χρόνια, και δεν υπάρχει σημαντική διαφορά στην ηλικία βρέθηκε μεταξύ των ελέγχων και των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα (

P

& gt? 0,05). Ιστολογικός τύπος του καρκίνου του πνεύμονα μεταξύ των δύο ομάδων ασθενών δεν διέφεραν σημαντικά (

P

& gt? 0.05), αλλά διαπιστώθηκαν σημαντικές διαφορές στο στάδιο και βαθμό (όλα

P

& lt? 0.05).

ανάλυση Σύλλογος rs1447295, rs16901979 και rs6983267 στο 8q24

Οι κατανομές γονότυπου των SNPs rs1447295, rs16901979 και rs6983267 ήταν σε ισορροπία Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) και στις δύο περιπτώσεις και ελέγχους. Στο σύνολο ελέγχου, η συχνότητα του GG γονότυπου rs6983267 ήταν σημαντικά υψηλότερη σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα (24,9%) από ό, τι στην ομάδα ελέγχου (20,5%) (Πίνακας 2). Ο γονότυπος GG συνδέθηκε με ένα μέτρια αυξημένο κίνδυνο [αναλογία πιθανοτήτων (OR) = 1.532, 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) 1,090 έως 2,153,

P

= 0.014]. Ομοίως, στο σύνολο επικύρωσης, ο γονότυπος rs6983267 GG σχετίστηκε με αύξηση 1.591 φορές του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα (

P

= 0,010). Αν και δεν είναι στατιστικά σημαντική, ο γονότυπος rs6983267 GT αύξησε επίσης τον κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων (

P

= 0,062). Ωστόσο, δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές μεταξύ των δύο υπόλοιπων SNPs (rs1447295 και rs16901979) και ο καρκίνος του πνεύμονα και στους δύο πληθυσμούς. Η τελική συγκεντρωτική ανάλυση έδειξε ότι ο γονότυπος rs6983267 GG (OR = 1.555, 95% CI = 1,218 – 1,986,

P

= 4.0 × 10

-4) και GT γονότυπο (OR = 1.311, 95% CI = 1,066 – 1,613,

P

= 0.01) σχετίστηκαν με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Αφού οι γονότυποι GG και GT συνδυάστηκαν, η διαφορά παρέμενε στατιστικά σημαντική (OR = 1.386, 95% CI = 1,141 – 1,684,

P

= 0,001). Επιπλέον, οι ενώσεις παρέμεινε σημαντική ακόμα και μετά τη διόρθωση Bonferroni (δηλαδή,

P

& lt? 0.05 /3 = 0,0167).

Η

Οι αναλύσεις στρωματοποιημένη με ιστολογία χρησιμοποιώντας συγκεντρωτικά σύνολα ασθενών-μαρτύρων έδειξε ότι ο rs1447295 ΑΑ γονότυπο καθώς και η GG rs6983267 και γονοτύπων GT συνδέθηκαν με ένα ασθενές αλλά σημαντική αύξηση στον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος προσαρμοστεί για την ηλικία, το φύλο και την κατάσταση καπνίσματος (OR = 2.260, 95% CI 1,174 έως 4,353,

P

= 0,015? OR = 1.330, 95% CI 1,003 έως 1,763,

P

= 0,048? OR = 1.327, 95% CI 1,049 έως 1,679,

P

= 0,018, αντίστοιχα) (Πίνακας 3). Ο γονότυπος rs6983267 GG σχετίστηκε με τον κίνδυνο ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα (OR = 1.775, 95%

CI

1,201 έως 2,625,

P

= 0,004). Επιπλέον, τα άτομα με το GG rs6983267 ή GT γονότυπο ήταν σε σημαντικά αυξημένο κίνδυνο άλλους τύπους καρκίνου του πνεύμονα (OR = 3.012, 95% CI 1,675 έως 5,417,

P

= 2.3 × 10

-4 ? OR = 1.986, 95% CI 1,157 έως 3,408,

P

= 0,013, αντίστοιχα), συμπεριλαμβανομένων των αδενοχοληδωτό καρκίνωμα και αδιαφοροποίητο καρκίνωμα. Ωστόσο, καμία συσχέτιση δεν παρατηρήθηκε για rs16901979.

Η

Εξετάσαμε περαιτέρω τη συσχέτιση μεταξύ των τριών SNPs και τον καρκίνο του πνεύμονα στρωματοποιημένη από το κάπνισμα συμπεριφορά σε όλα τα άτομα (Πίνακας 4). Ο γονότυπος rs6983267 GG ήταν σημαντικά σχετίζεται με υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε μη καπνιστές, αλλά καμία συσχέτιση παρατηρήθηκε σε πρώην και νυν καπνιστές. Επιπλέον, υπήρχε μια μικρή αλλά σημαντική διαφορά στη συχνότητα των rs6983267 GT γονότυπο μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων στην τρέχουσα καπνιστές (OR = 1.446, 95% CI 1,032 έως 2,027,

P

= 0,032). Ωστόσο, δεν υπήρξε σημαντική αλληλεπίδραση μεταξύ του καπνίσματος και της γονότυπου στο ευαισθησίας στον καρκίνο του πνεύμονα. Δεδομένου ότι ο αριθμός των πρώην καπνιστών σε αυτή τη μελέτη ήταν μικρή και η συχνότητα του γονότυπου rs1447295 ΑΑ ήταν χαμηλή, συνδυάσαμε τις ομάδες ΑΑ και AC γονότυπο σε ένα. Logistic ανάλυση αποκάλυψε ότι η ΑΑ και AC συνδυασμό είχαν χαμηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σχέση με το γονότυπο CC (OR = 0.478, 95% CI 0,254 έως 0,898,

P

= 0,022). Καμία άλλη σημαντική συσχέτιση παρατηρήθηκε μεταξύ rs16901979 και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, στρωματοποιημένη από το κάπνισμα.

Η

Σύλλογος rs1447295, rs16901979 και rs6983267 με την επιβίωση

Όλοι οι ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα είχαν συμπεριληφθεί στην ανάλυση επιβίωσης. Για rs6983267, μια ένωση με την επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα παρατηρήθηκε στον πληθυσμό Zhejiang. Τα άτομα με το γονότυπο GG είχαν διάμεσος χρόνος επιβίωσης (MST) του 17,6 μήνες, εκείνοι με το γονότυπο GT είχε MST 18,6 μήνες, ενώ εκείνοι με το γονότυπο ΤΤ είχε MST 24,4 μήνες (δοκιμασία log-rank,

P

= 0,036) (Σχήμα 1Α). Στο μοντέλο αναλογικού κινδύνου του Cox, βρήκαμε ότι η αναλογία κινδύνου (HR) ήταν σημαντικά υψηλότερη για τα άτομα με το γονότυπο GG σε σύγκριση με εκείνους με το γονότυπο ΤΤ μετά την προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, την κατάσταση, το στάδιο του όγκου, ιστολογία και ιστολογικές Βαθμός (από το κάπνισμα HR = 1,646, 95% CI 1,099 έως 2,464,

P

= 0,016) (Πίνακας 5). Η επιβίωση ήταν κακή, ιδίως για τους ασθενείς με σταδίου ΙΙΙ ή IV του όγκου (HR = 1,993, 95% CI 1,128 έως 3,521,

P

= 0,018) (Εικόνα 1Β). Καμία άλλη SNP βρέθηκε να σχετίζεται με την επιβίωση. Καμία συσχέτιση με την επιβίωση του πληθυσμού Fujian παρατηρήθηκε

Α:. Όλοι οι ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα. Β:. Ασθενείς με σταδίου ΙΙΙ-IV όγκοι

Η

Συζήτηση

Στην παρούσα μελέτη, εξετάσαμε αν SNPs στο χρωμόσωμα 8q24 που σχετίζονται με την ευαισθησία στο στήθος, του προστάτη, της ουροδόχου κύστης , του παχέος εντέρου, του θυρεοειδούς, και καρκίνους των ωοθηκών [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [15], [16 ], [23] συνδέονται επίσης με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε Κινέζων Χαν πληθυσμούς. Βρήκαμε ότι η GG γονότυπο του rs6983267 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα και μειωμένη επιβίωση σε Κινέζους Χαν.

8q24 εκτροπή είναι ένα συχνό γεγονός στον καρκίνο του πνεύμονα [31], [32], [33] , [34]. MYC, εντοπισμένη στο 8q24.1, είναι μια καλά εδραιωμένη ογκογονίδιο που εμπλέκονται στην κυτταρική ανάπτυξη, πολλαπλασιασμό, διαφοροποίηση και απόπτωση. Η απορρύθμιση υπερέκφραση MYC είναι υπεύθυνο για ένα ευρύ φάσμα των ανθρώπινων καρκίνων. Η rs6983267 βρίσκεται 335 kb ανοδικά από το γονίδιο MYC. Πρόσφατες μελέτες έχουν δείξει ότι rs6983267 χάρτες με τον παράγοντα μεταγραφής 7-σαν 2 (TCF7L2) μοτίβο και μορφές αλληλεπιδράσεις μεγάλου βεληνεκούς με MYC [27], [36]. Σε σύγκριση με το Τ αλληλόμορφο του rs6983267, το αλληλόμορφο G έχει αναφερθεί ότι έχει ισχυρότερη σύνδεση in vitro και in vivo TCF7L2 και για την ενίσχυση της Wnt δραστηριότητα [36], [37]. Επιπλέον, πολλές μελέτες έχουν δείξει ότι ο GG γονότυπος του rs6983267 συνδέεται με σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο πολλών μορφών καρκίνου [9], [30], [38]. Park et al. [20] ανέφεραν καμία συσχέτιση μεταξύ rs6983267 (OR = 1,02,

P

= 0.80) και ο καρκίνος του πνεύμονα, αλλά διαπίστωσε ότι ο γονότυπος GG αυξάνει τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε όλο καπνιστές (OR = 1,45,

P

= 0.024). Wokolorczyk et al. [38] εξέτασαν 738 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 1910 άτομα ελέγχου και διαπίστωσε ότι ο γονότυπος rs6983267 GG δεν συσχετίστηκε σημαντικά με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε σύγκριση με το γονότυπο TT (OR = 0,98,

P

= 0.9). Ωστόσο, η συσχέτιση αυτή δεν έχει αξιολογηθεί στα κινέζικα. Στην παρούσα μελέτη, εξετάσαμε τρεις SNPs (rs1447295, rs16901979 και rs6983267) και διαπίστωσε ότι μόνο rs6983267 συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε Κινέζους Χαν. Αυτά τα ευρήματα ήταν διαφορετική από τις προηγούμενες μελέτες στις οποίες δεν υπήρχαν σημαντικές συσχετίσεις μεταξύ rs6983267 και του καρκίνου του πνεύμονα [20], [38]. Δεδομένου ότι η επίδραση ενός γονιδίου ευαισθησίας χαμηλού διεισδυτικότητα για τον κίνδυνο της νόσου μπορεί να τροποποιηθεί από άλλα γονίδια, καθώς και από περιβαλλοντικούς παράγοντες, οι εθνοτικές διαφορές στο γενετικό υπόβαθρο και διαφορετικούς παράγοντες κινδύνου μπορούν να εξηγήσουν, σε κάποιο βαθμό, τα αντιφατικά αποτελέσματα. Επιπλέον, rs6983267 ήταν περισσότερο σημαντική συσχέτιση με άλλους ιστολογικούς τύπους καρκίνου του πνεύμονα, που ακολουθείται από καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων, και ασθενώς αλλά σημαντικά με αδενοκαρκίνωμα. Αυτά τα αποτελέσματα έδειξαν ότι διαφορετικοί μηχανισμοί μπορούν να υπάρχουν στη μοριακή παθογένεση των διαφόρων ιστολογικών τύπων καρκίνου του πνεύμονα.

Η έκθεση σε καρκινογόνα του καπνού μπορεί να προκαλέσει σοβαρή βλάβη του DNA και έτσι προάγουν τον σχηματισμό όγκου. Σε αυτή τη μελέτη, διαπιστώσαμε ότι ο αυξημένος κίνδυνος καρκίνου του πνεύμονα με rs6983267 GG γονότυπο ήταν εντονότερη μεταξύ των μη καπνιστών, ενώ δεν υπάρχουν σημαντικές συσχετίσεις βρέθηκαν σε τρεχουσών και πρώην καπνιστές. Μια πιθανή εξήγηση για αυτό είναι ότι ποτέ καπνιστές μπορεί να είναι πιο πιθανό να έχουν εκτεθεί σε άγνωστους παράγοντες κινδύνου που συνδέονται με τον καρκίνο του πνεύμονα, όπως περιβαλλοντικούς ρύπους. μπορεί να υπάρχουν διάφοροι μηχανισμοί καρκινογένεσης μεταξύ ποτέ και τρεχουσών /αποτελούσαν παλαιότερα καπνιστές. Το αποτέλεσμά μας είναι διαφορετική από την προηγούμενη μελέτη, στην οποία rs6983267 GG ήταν ένας παράγοντας κινδύνου ποτέ καπνιστής [20]. Διαφορετικούς πληθυσμούς μελέτης και αναλυτικές προσεγγίσεις θα μπορούσαν να ευθύνονται για τα αντιφατικά αποτελέσματα. Επιπλέον, βρήκαμε μια σημαντική συσχέτιση της Α αλληλόμορφο του rs1447295 με χαμηλό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου των πνευμόνων στους πρώην καπνιστές. Ωστόσο, Park et al βρήκαν ότι αυτό το αλληλόμορφο συσχετίστηκε με υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του ήπατος σε ολοένα καπνιστές [20]. Δεδομένου ότι ο αριθμός των πρώην καπνιστών στον πληθυσμό αυτό ήταν πολύ μικρό για μια μελέτη σύνδεσης-μαρτύρων, τα ευρήματά μας σχετικά με το Α αλληλόμορφο του rs1447295 είναι πιθανότατα ψευδώς θετικά λόγω των πολλαπλών συγκρίσεων. Προσοχή θα πρέπει να χρησιμοποιείται για την ερμηνεία αυτού του αποτελέσματος, ακόμη και αν είναι στατιστικά σημαντική. Περαιτέρω μελέτες με μεγαλύτερο αριθμό ατόμων που απαιτούνται για να επιβεβαιώσουν αυτά τα ευρήματα.

ενίσχυση MYC έχει δειχθεί ότι συσχετίζεται με κακή πρόγνωση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα [31], [32], [34]. Δεδομένου ότι οι rs6983267 αλληλόμορφο κινδύνου G έχει αποδειχθεί ότι έχουν μια ισχυρότερη συγγένεια προς TCF7L2 και μπορεί να επάγουν την έκφραση ενισχυμένη MYC [27], [36], rs6983267 μπορεί να σχετίζεται με την επιβίωση σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα. Σε αυτή τη μελέτη, βρήκαμε ότι rs6983267 GG γονότυπο συσχετίστηκε με αξιοσημείωτα χειρότερη επιβίωση στον πληθυσμό Zhejiang. Αυτή η επίδραση ήταν πιο έντονη σε ασθενείς με σταδίου ΙΙΙ ή IV του όγκου. Αυτό το αποτέλεσμα είναι σύμφωνο με τις λειτουργικές συνέπειες αυτού του πολυμορφισμού. Αντίθετα, δεν διαπιστώθηκε καμία συσχέτιση μεταξύ rs6983267 και την επιβίωση του πληθυσμού Fujian. Μέρος αυτής της ανισότητας μπορεί να εξηγηθεί από τις διακριτές ποσοστά στάδιο της νόσου και ιστολογική βαθμού, καθώς και τις διαφορετικές προσεγγίσεις που χρησιμοποιήθηκαν. Τσιτσέκ et al. εξέτασε 393 ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου και δεν βρήκε καμία συσχέτιση μεταξύ rs6983267 και την επιβίωση [39]. Ωστόσο, Dai et al. εξέτασε 170 ασθενείς με καρκίνο του παχέος εντέρου και διαπίστωσε ότι Τ αλληλίου συσχετίστηκε με χειρότερη επιβίωση [40]. Αυτά τα αποτελέσματα υποδηλώνουν ότι μπορεί να υπάρχουν ένα πιο πολύπλοκο ή ογκο-ειδική σχέση. Καθώς η μελέτη μας περιορίστηκε σε Κινέζων Χαν με καρκίνο του πνεύμονα, τα αποτελέσματα μπορεί να μην είναι γενικά σε άλλες εθνικότητες. Επιπλέον, το μέγεθος του δείγματος για ανάλυση επιβίωσης ήταν σχετικά μικρό, προτρέποντας έτσι προσεκτική ερμηνεία των αποτελεσμάτων μας. Περαιτέρω έρευνα σε μια μεγαλύτερη ομάδα πληθυσμού είναι αναγκαίο να αποσαφηνιστεί η σχέση αυτή.

Εν ολίγοις, τα ευρήματα της μελέτης μας δείχνουν ότι η SNPs στο 8q24 σχετίζονται με την ευαισθησία στον καρκίνο του πνεύμονα σε Κινέζους Χαν. Επιπλέον, rs6983267 γονότυπο GG συσχετίστηκε με κακή επιβίωση στον πληθυσμό Zhejiang. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη που διερεύνησε πιθανές συσχετίσεις μεταξύ των SNPs στο 8q24 και τον καρκίνο του πνεύμονα σε πληθυσμό από την Ανατολική Κίνα. Επιπρόσθετες μεγάλες μελέτες δικαιολογείται να βελτιώσει την κατανόησή μας για τις εισφορές των γενετικών παραγόντων για τον καρκίνο του πνεύμονα.

Υλικά και Μέθοδοι

Θέματα

Σε αυτή τη μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη σύνδεσης σε δύο ανεξάρτητα σύνολα υποκειμένων. Το σύνολο δοκιμής περιελάμβανε 548 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 556 άτομα ελέγχου. Οι ασθενείς υπόθεση είχε μια διάγνωση του καρκίνου του πνεύμονα επιβεβαίωσε την ιστολογία και προσλήφθηκαν από Taizhou Κεντρικό Νοσοκομείο, Zhejiang, μεταξύ του 2003 και του 2010. Τα θέματα ελέγχου χωρίς καρκίνο ήταν οι επισκέπτες του νοσοκομείου που ήρθαν στην κλινική εξέταση υγείας για ένα ετήσιο check-up μεταξύ 2007 και 2010. Το σύνολο επικύρωσης αποτελούνταν από 453 ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα και 507 άτομα ελέγχου από την επαρχία Fujian. Οι ασθενείς περίπτωση ήταν διαδοχικοί ασθενείς με ιστολογικά επιβεβαιωμένο καρκίνο του πνεύμονα είναι εγγεγραμμένοι από Fuzhou Πνευμονική Νοσοκομείο μεταξύ 2008 και 2010. Ο έλεγχος άτομα ήταν χωρίς καρκίνο άτομα που επιλέγονται από μια ομάδα υγιών εθελοντών που επισκέφθηκαν το νοσοκομείο κατά τη διάρκεια της περιόδου 2008-2010. Επιδημιολογικά δεδομένα συλλέχθηκαν από εκπαιδευμένους ερευνητές οι οποίοι δεν γνώριζαν τις εργασίες της ομάδας, χρησιμοποιώντας ένα ειδικό τυποποιημένο ερωτηματολόγιο για να λάβει λεπτομερείς πληροφορίες σχετικά με τους συμμετέχοντες δημογραφικούς παράγοντες, τις προσωπικές συνήθειες, το ιατρικό ιστορικό, το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, καθώς και την ιστορία της επαγγελματικής και περιβαλλοντικής έκθεσης . Τα άτομα της μελέτης ταξινομήθηκαν σε τρεις ομάδες ανάλογα με το κάπνισμα τους. Ποτέ καπνιστές ήταν εκείνοι που δήλωσαν ότι είχαν καπνίσει λιγότερα από 100 τσιγάρα στη ζωή τους και δεν ήταν σε τρέχουσες καπνιστές. Οι καπνιστές είχαν ταξινομηθεί σε πρώην καπνιστές και νυν καπνιστές. Ο πρώην καπνιστές ήταν αυτοί που ανέφεραν ότι κάπνιζαν τουλάχιστον 100 τσιγάρα κατά τη διάρκεια της ζωής τους και δεν ήταν τρέχουσα καπνιστές, ενώ τρέχουσα καπνιστές ήταν αυτοί που ανέφεραν ότι είχαν ακόμα το κάπνισμα κατά τη στιγμή της διάγνωσης του καρκίνου του πνεύμονα τους. Τα άτομα που είναι γνωστό ότι έχουν ένα οικογενειακό ιστορικό καρκίνου, ιστορικό οποιουδήποτε καρκίνου εκτός από τον καρκίνο του πνεύμονα, ή μετάσταση καρκίνου από άλλες ή άγνωστες προελεύσεις αποκλείστηκαν. Τα άτομα της ομάδας ελέγχου ήταν η συχνότητα ταιριάζει με τους ασθενείς περίπτωση με βάση το φύλο και την ηλικία (± 5 έτη). Όλοι οι ασθενείς υπόθεση και άτομα της ομάδας ελέγχου ήταν άσχετες εθνικής Κινέζων Χαν. Αυτή η μελέτη εγκρίθηκε από τις επιτροπές δεοντολογίας των Taizhou Κεντρικό Νοσοκομείο και Fuzhou Πνευμονική Νοσοκομείο, και γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους συμμετέχοντες πριν από την είσοδο στη μελέτη.

τελικό σημείο μας ήταν η συνολική επιβίωση από την αρχική ιστολογική διάγνωση. Οι ασθενείς που ήταν ζωντανοί ή χαθεί κατά την παρακολούθηση είχαν λογοκριθεί από την ημερομηνία της τελευταίας επαφής. Εκείνοι που πέθαναν από άλλα αίτια περικόπηκαν κατά την ημερομηνία του θανάτου τους. Επιπλέον, οι ασθενείς που έχασαν την παρακολούθηση κατά το πρώτο έτος εξαιρέθηκαν από την ανάλυση.

Γονοτυπικές

Τα δείγματα αίματος συλλέχθηκαν από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη. Γονιδιωματικό ϋΝΑ εξήχθη χρησιμοποιώντας το Universal Genomic DNA Extraction Kit Εκδοχή 3.0 (Takara, Dalian, Κίνα) σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή, και τα δείγματα του DNA φυλάχθηκαν στους -20 ° C.

Έχουμε επιλέξει την ισχυρότερη μονού συνδέσμου SNPs από κάθε χρωμοσωμική περιοχή: rs1447295 από την περιοχή 1, rs16901979 από την περιοχή 2, και rs6983267 από την περιοχή 3. γονοτυπικός διεξήχθη με αντίδραση ανίχνευσης αντίδραση απολίνωσης-αλύσου πολυμεράσης (PCR-LDR) μέθοδο. Εκκινητές σχεδιάστηκαν από το λογισμικό του Primer 3 (https://frodo.wi.mit.edu/primer3/input.htm). Τα τρία ζεύγη εκκινητών είναι ως εξής: 1) rs1447295: 5′-GCCTACGCCTACTCCTGGTCT-3 ‘(προς τα εμπρός) και 5′-CTCCCAGATTTTCCCATACCC-3′ (αντίστροφο)? 2) rs16901979: 5’-AGTGTGGGGTCTTTGTTGTGG-3 ‘(προς τα εμπρός) και 5′-CAGCAGTCTCCCTGTCTTTGG-3′ (αντίστροφο)? 3) rs6983267: 5’-ATGAAGGCGTCGTCCAAATGA -3 ‘(προς τα εμπρός) και 5′-TTGGCTGGCACTGTCTGTATA -3’ (reverse). Οι αντιδράσεις ενίσχυσης διεξήχθησαν σε έναν τελικό όγκο αντίδρασης 15 μL που περιέχει 0,3 mmol /L από κάθε τριφωσφορικό δεοξυνουκλεοζίτη, 10 mmol /L Tris-HCl, 50 mmol /L ΚΟΙ, 2 mmol /L MgCl2, 20% διάλυμα Q (Qiagen, Hilden, Germany), 0,16 μmol /L του κάθε εκκινητή, 10 ng γονιδιωματικό ϋΝΑ, και 1 U Taq (Takara, Dalian, Κίνα). Οι παράμετροι κυκλοποίησης ήταν: 94 ° C για 3 λεπτά, ακολουθούμενη από 10 κύκλους των 94 ° C για 30 s, 64 ° C για 30 s με ένα C μείωση 0,5 ° από τη θερμοκρασία ανόπτησης ανά κύκλο και 72 ° C για 30 s, που ακολουθείται από 30 κύκλους των 94 ° C για 30 s, 59 ° C για 30 s και 72 ° C για 30 s, και ένα τελικό στάδιο επέκτασης στους 72 ° C για 5 λεπτά. Μετά την ενίσχυση, τα προϊόντα PCR επωάσθηκαν με 2 U γαρίδας αλκαλική phosophatase (Fermentas, Βίλνιους, Λιθουανία) και 4 U εξωνουκλεάσης Ι (Fermentas, Βίλνιους, Λιθουανία) στους 37 ° C για 1 ώρα, και στη συνέχεια μετουσιώθηκαν στους 95 ° C για 10 λεπτά .

Οι εκκινητές LDR ήταν: 1) rs1447295: 5′-GTGCCATTGGGGAGGTATGTAAAAA-3 ‘(ένα συγκεκριμένο εκκινητή), 5′-TTTGTGCCATTGGGGAGGTATGTAAAAC-3′ (ειδικό εναρκτήρα C) και 5′-GTGCTATGGAAAAAAAGCAACAGGA-FAM-3 «(κοινή FAM σημασμένο 3′-άκρο εκκινητή)? 2) rs16901979: 5’-TTTTTGTTAATGATTTAGCATTACTTATA-3 ‘(ένα συγκεκριμένο εκκινητή), 5′-TTTTTTTTGTTAATGATTTAGCATTACTTATC-3′ (ειδικό εναρκτήρα C) και 5’-TCTGGCAAATGGTATTTTTGAGATATTT-FAM-3 ‘(κοινή FAM σημασμένο 3′-άκρο εκκινητή)? 3) rs6983267: 5’-TTTTTTTTTCCTTTGAGCTCAGCAGATGAAAGG-3 ‘(ειδικό εναρκτήρα G), 5′-TTTTTTTTTTTTCCTTTGAGCTCAGCAGATGAAAGT-3′ (ειδικό εναρκτήρα Τ) και 5’-CACTGAGAAAAGTACAAAGAATTTTTTTTTTT-FAM-3 ‘(κοινή FAM σημασμένο 3’-άκρο εκκινητή). Ένα μίγμα που περιέχει 7,5 pmol του κάθε κοινή FAM εκκινητή σημασμένο LDR φωσφορυλιώθηκε σε 15 μλ μίγματος αντίδρασης κινάσης που περιέχει 1 χ Τ4 ρυθμιστικό λιγάσης και 10 U Τ4 κινάσης (Takara, Dalian, Κίνα). Το μίγμα επωάστηκε στους 37 ° C για 1 ώρα, ακολουθούμενο από 10 min στους 65 ° C και αποθήκευση στους 4 ° C. LDRs διεξήχθησαν σε έναν τελικό όγκο 20 μL, συμπεριλαμβανομένων 9 μί καθορισθέντος προϊόντος PCR, 1 × Taq DNA λιγκάσης ρυθμιστικού διαλύματος, 250 fmol του κάθε εκκινητή LDR, 8 U Taq DNA λιγάση (New England Biolabs, Beverly, Mass, USA). Οι παράμετροι LDR ήταν ως ακολούθως: 30 κύκλοι των 30 s στους 94 ° C και 4 λεπτά στους 55 ° C. Τα προϊόντα LDR αναλύθηκαν σε ΑΒΙ 3730 αναλυτή DNA (Applied Biosystems, CA, USA).

ενενήντα έξι τυχαία επιλεγμένα δείγματα επαναξιολογηθεί με προσδιορισμό της αλληλουχίας του DNA για να επιβεβαιωθεί η ακρίβεια της μεθόδου προσδιορισμού του γονότυπου αντίδραση ανίχνευσης PCR-απολίνωση, το αποτελέσματα του οποίου ήταν σύμφωνα με τους γονότυπους που προσδιορίζονται από την άμεση αλληλούχιση. Επιπλέον, 96 τυχαία επιλεγμένα δείγματα γονότυπος εις διπλούν και έδωσε τα ίδια αποτελέσματα (100% αναπαραγωγιμότητα).

Η στατιστική ανάλυση

Τα μέσα ποσοτικές μεταβλητές συγκρίθηκαν με τη χρήση του Student

t

δοκιμή. ακριβής Chi-square τεστ του Fisher χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση κατηγορικών μεταβλητών μεταξύ των ασθενών περίπτωση και θέματα ελέγχου. HWE υπολογίστηκε από το Chi-square τεστ καλής προσαρμογής και στις δύο ομάδες ασθενών και τον έλεγχο. Διόρθωση για πολλαπλές δοκιμές διεξήχθη με τη χρήση της μεθόδου Bonferroni. Για την αξιολόγηση της σχέσης μεταξύ 3 SNPs και τον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα, οι ΕΑΠ και 95% τους ΚΠ εκτιμήθηκαν με πολυπαραγοντική ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης, προσαρμοσμένο ανάλογα με την ηλικία, το φύλο και την κατάσταση καπνίσματος, να αξιολογήσει τη σχέση μεταξύ κάθε μία από τις τρεις SNPs και ο κίνδυνος του καρκίνου του πνεύμονα. Ανάλυση επιβίωσης πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Kaplan-Meier με δοκιμασία log-rank. Cox μοντέλα αναλογικών κινδύνων χρησιμοποιήθηκαν επίσης για την προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα, το στάδιο του όγκου, ιστολογία και ιστολογική βαθμού.

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική. Όλες οι δοκιμασίες ήταν δύο όψεων, και όλοι οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με το λογισμικό SPSS 17.0 πακέτο λογισμικού (SPSS Inc, Chicago, USA).