Αφηρημένο

Ιστορικό

Αυτή η μελέτη διεξήχθη για να διερευνήσει εάν ένα πάνελ οκτώ γενετικών πολυμορφισμών μπορεί να προβλέψει την πρόγνωση των ασθενών με πρώιμο στάδιο μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC) μετά τη χειρουργική εκτομή.

Υλικά και Μέθοδοι

Έχουμε επιλέξει οκτώ πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) που έχουν συσχετιστεί με την πρόγνωση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα μετά από χειρουργική επέμβαση σε προηγούμενες μελέτες μας. Συνολικά 814 ασθενείς με πρώιμο στάδιο NSCLC που υποβλήθηκαν σε θεραπευτική χειρουργική εκτομή είχαν εγγραφεί. Η σύνδεση των οκτώ SNPs με τη συνολική επιβίωση (OS) και την ελεύθερη νόσου επιβίωση (DFS) αναλύθηκε.

Αποτελέσματα

Οι οκτώ SNPs (

CD3EAP

rs967591,

TNFRSF10B

rs1047266,

ΑΚΤ1

rs3803300,

C3

rs2287845,

HOMER2

rs1256428,

GNB2L1

rs3756585,

ADAMTSL3

rs11259927, και

CD3D

rs3181259) ήταν σημαντικά σχετίζεται με το OS ή /και DFS. Συνδυάζοντας αυτά τα οκτώ SNPs, σχεδιάσαμε ένα προγνωστικό δείκτη για να προβλέψει την πρόγνωση των ασθενών. Σύμφωνα με σχετικό κίνδυνο θανάτου, μια τιμή σκορ είχε εκχωρηθεί σε κάθε γονότυπο του SNPs. Ένα χειρότερη πρόγνωση αντιστοιχεί στην υψηλότερη τιμή του σκορ, και το άθροισμα των τιμών των αποτελεσμάτων οκτώ SNPs ορίζεται το προγνωστικό δείκτη του ασθενούς. Όταν κατηγοριοποιούνται οι ασθενείς σε δύο ομάδες με βάση την προγνωστική δείκτη, ομάδα υψηλού κινδύνου ήταν σημαντικά σχετίζεται με χειρότερη OS και DFS σε σύγκριση με ομάδα χαμηλού κινδύνου (AHR για το OS = 2,21, 95% CI = 1,69 – 2,88,

P

= 8,0 x 10

-9, και AHR για DFS = 1.58, 95% CI = 1,29 – 1,94,

P

= 1,0 x 10

-5).

Συμπεράσματα

Πρόγνωσης δείκτης με οκτώ γενετικών πολυμορφισμών μπορεί να είναι χρήσιμη για την πρόγνωση των ασθενών με χειρουργικά NSCLC

Παράθεση:. Lee SY, Choi JE, Jeon ΕΣ, Choi YY, Lee WK, Lee EB et al. (2015) Ένας πίνακας του γενετικού πολυμορφισμού για την Πρόβλεψη πρόγνωση σε ασθενείς με πρώιμα στάδια μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα μετά από χειρουργική εκτομή. PLoS ONE 10 (10): e0140216. doi: 10.1371 /journal.pone.0140216

Επιμέλεια: Renato Franco, Istituto dei Tumori Fondazione Pascale, Ιταλία

Ελήφθη: 11 Ιούν του 2015? Αποδεκτές: 23 Σεπτεμβρίου, 2015? Δημοσιεύθηκε: 13 Οκτωβρίου 2015

Copyright: © 2015 Lee et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. το έργο υποστηρίχθηκε από R &? προγράμματος D της MKE /Keit (10040393, ανάπτυξη και εμπορευματοποίηση των μοριακών διαγνωστικών τεχνολογιών για τον καρκίνο του πνεύμονα μέσω κλινικών επικύρωση), http : //www.keit.re.kr/. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του πνεύμονα, ειδικά για μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), είναι η κύρια αιτία των θανάτων από καρκίνο σε όλο τον κόσμο, με μέσο ποσοστό επιβίωσης 5 ετών 16% [1]. Παρά το γεγονός ότι η χειρουργική επέμβαση είναι η καλύτερη μέθοδος θεραπείας για μια πιθανή θεραπεία στα πρώιμα στάδια του NSCLC, ένα μεγάλο ποσοστό των ασθενών που πεθαίνουν από υποτροπή της νόσου. Το ποσοστό επιβίωσης 5 ετών ασθενείς που υποβάλλονται σε θεραπευτική χειρουργική επέμβαση είναι 73%, 58%, 46%, και 36% για την παθολογική στάδια ΙΑ, ΙΒ, ΙΙΑ και ΙΙΒ, αντίστοιχα [2]. Το παθολογικό στάδιο είναι το πιο σημαντικό προγνωστικό παράγοντα της πρόγνωσης μετά από χειρουργική εκτομή του NSCLC. Ωστόσο, οι ασθενείς με την ίδια παθολογική στάδιο έχουν μια διαφορετική κίνδυνο υποτροπής και θανάτου [2]. Ως εκ τούτου, η έρευνα επικεντρώνεται σε προγνωστικούς βιοδείκτες για την ακριβέστερη πρόγνωση των ασθενών μετά την επέμβαση [3]. Δεδομένου ότι η αποτελεσματική χημειοθεραπεία πρόσθετο είναι διαθέσιμη [4, 5], βιοδείκτες για την πρόβλεψη υποτροπής και πρόγνωση μετά από χειρουργική επέμβαση για καρκίνο του πνεύμονα είναι ακόμη πιο σημαντική, διότι μπορεί να βοηθήσουν στην επιλογή των υποομάδων των ασθενών που θα επωφεληθούν από την επικουρική θεραπεία.

γενετικοί πολυμορφισμοί έχουν ερευνηθεί για τις προγνωστικές /προγνωστική βιοδείκτες για να καθοδηγήσει θεραπευτικές αποφάσεις σε καρκίνους, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα [6-8]. Για παράδειγμα, ασθενείς με προχωρημένο καρκίνο του πνεύμονα μπορεί να έχει καλύτερα αποτελέσματα από ορισμένες χημειοθεραπευτικές αγωγές ανάλογα με τις συγκεκριμένες γονότυπους. Εναλλακτικά, οι ασθενείς με ορισμένες γονότυπους μπορεί να έχουν υψηλότερο κίνδυνο κακή πρόγνωση μετά θεραπευτική εκτομή, και με αυτόν τον τρόπο μπορούν να επωφεληθούν από επικουρική χημειοθεραπεία. Κατά τη διάρκεια των τελευταίων ετών, η έρευνα μας έχει επικεντρωθεί στην πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου (SNP) για προγνωστικούς βιοδείκτες σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα που υποβλήθηκαν σε θεραπευτική χειρουργική εκτομή. Έχουμε βρει έναν αριθμό SNPs σε γονίδια δυνητικά εμπλέκονται στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου να συνδέεται με την πρόγνωση των ασθενών με πρώιμο στάδιο NSCLC μετά την επέμβαση [9-15].

Carcinogenesis είναι μια διαδικασία πολλών σταδίων η οποία χαρακτηρίζεται από τη συσσώρευση πολλαπλών γενετικών και επιγενετικών αλλαγών, η οποία οδηγεί σε μεταβολές στην κυτταρική φυσιολογία που υπαγορεύουν συλλογικά κακοήθη ανάπτυξη: αυτάρκεια των σημάτων ανάπτυξης, έλλειψη ευαισθησίας σε σήματα αναστολής της ανάπτυξης, της φοροδιαφυγής απόπτωσης, απεριόριστες δυναμικό αντιγραφής, υπέστη αγγειογένεση, και ιστών εισβολή και μετάσταση [16]. Έτσι, είναι απίθανο ότι οποιαδήποτε ενιαία πολυμορφισμός θα έχουν δραματικές επιπτώσεις στα αποτελέσματα της επιβίωσης. Η συνδυασμένη ανάλυση μιας σειράς πολυμορφισμών στο σχετίζονται με τον καρκίνο γονίδια μπορεί να ενισχύσει τις επιδράσεις των μεμονωμένων πολυμορφισμών και να ενισχύσουν προβλεπτική ισχύ τους, επειδή μπορεί να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο σε ορισμένα στάδια της καρκινογένεσης, συλλογικά συνθέτουν τα χαρακτηριστικά του καρκίνου. Σε αυτή τη μελέτη, αξιολογήσαμε τη σύνδεση ενός πάνελ οκτώ γενετικών πολυμορφισμών από προηγούμενες μελέτες μας που ενδεχομένως εμπλέκονται στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου, με την πρόγνωση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα μετά από χειρουργική επέμβαση με την εισαγωγή ενός προγνωστικό δείκτη χρησιμοποιώντας αυτές τις οκτώ SNPs σε συνδυασμός.

Υλικά και Μέθοδοι

πληθυσμούς Μελέτη

Γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους ασθενείς πριν την χειρουργική επέμβαση σε κάθε ένα από τα συμμετέχοντα ιδρύματα και ερευνητικά πρωτόκολλο εγκρίθηκε από το θεσμικό συμβούλια αναθεώρηση του Kyungpook Εθνικού Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου (KNUH), Seoul National University Hospital (SNUH), και Εθνικό Πανεπιστήμιο της Σεούλ Bundang Νοσοκομείο (SNUBH). Οκτακοσίων δεκατέσσερις ασθενείς με παθολογική στάδια Ι, ΙΙ ή ΙΙΙΑ (μικρο-επεμβατική Ν2) ΜΜΚΠ που υποβλήθηκαν σε θεραπευτική χειρουργική εκτομή είχαν εγγραφεί. Μεταξύ των 814 ασθενών, 334 περιπτώσεις ελήφθησαν από την KNUH, 307 περιπτώσεις από SNUH, και 173 περιπτώσεις από SNUBH. Όλοι οι ασθενείς που περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη ήταν εθνική Κορεάτες. Κανένας από τους ασθενείς έλαβαν χημειοθεραπεία ή ακτινοθεραπεία πριν από την επέμβαση. Η παθολογική σταδιοποίηση των όγκων προσδιορίστηκε σύμφωνα με το Διεθνές Σύστημα Σταδιοποίηση καρκίνου του πνεύμονα [2].

Η επιλογή των SNPs και γονοτυπική

Έχουμε επιλέξει οκτώ SNPs από προηγούμενες μελέτες μας βρέθηκε να σχετίζεται με την πρόγνωση των ασθενών με πρώιμο στάδιο NSCLC μετά την επέμβαση. Πέντε SNPs (CD3e μόριο, έψιλον πρωτεΐνη που συνδέεται με [

CD3EAP

] rs967591G & gt? Α? Όγκων υπεροικογένεια των υποδοχέων του παράγοντα νέκρωσης, μέλος 10b [

TNFRSF10B

] rs1047266C & gt? Τ? Και ν-ΑΚΤ ιογενή θυμώματος ποντικού ογκογονίδιο ομόλογο 1 [

ΑΚΤ1

] rs3803300A & gt? G? συμπληρωματικό συστατικό 3 [

C3

] rs2287845T & gt? C? και πρωτεΐνη δέσμευσης νουκλεοτιδίου γουανίνης, βήτα πολυπεπτίδιο 2-όπως 1 [

GNB2L1

] rs3756585T & gt? επιλέχθηκαν G) από τις δημοσιευμένες εργασίες μας σύμφωνα με συνάρτηση δυναμικού και η σημασία [9-11, 15]. Άλλες τρεις SNPs (Όμηρος πρωτεΐνη ομόλογο 2 [

HOMER2

] rs1256428A & gt? G? Α αποσυνθετίνη-όπως και μεταλλοπρωτεάση τομέα με τον τύπο θρομβοσπονδίνης 1-σαν 3 [

ADAMTSL3

] rs11259927C & gt? Τ? Και CD3d μόριο, δέλτα (CD3-ΤΟΚ Complex) [

CD3D

] rs3181259T & gt? C) συμπεριλήφθηκαν επίσης, αν και δεν έχει ακόμη δημοσιευθεί. Η

HOMER2

rs1256428A & gt? G και

ADAMTSL3

rs11259927C & gt? T σχετίζονταν σημαντικά με την πρόγνωση του καρκίνου του πνεύμονα μετά από χειρουργική επέμβαση, μεταξύ (258 δυνητικά λειτουργική) SNPs σε 15q25 περιοχή που έχει χαρακτηριστεί ως ένα πνεύμονα θέση ευαισθησίας του καρκίνου στο γονιδίωμα μελέτες συσχέτισης μεγάλη.

CD3D

rs3181259T & gt? C ταυτοποιήθηκε στη μελέτη μας ερευνά την SNPs σε γονίδια που κωδικοποιούν συστάδας διαφοροποιήσεως 3 (CD3) υπομονάδες του υποδοχέα των Τ-κυττάρων (TCR), το οποίο είναι ζωτικής σημασίας για την ανάπτυξη των Τ-κυττάρων και παίζει ένα σημαντικό ρόλο στην αναγνώριση αντιγόνων συμπεριλαμβανομένων αντιγόνων όγκων. Μεταξύ των τεσσάρων SNPs στο

CD3D

και

CD3e

υποστηρικτές, μόνο

CD3D

rs381259T & gt? C έδειξε να είναι προγνωστική της πρόγνωσης του καρκίνου του πνεύμονα. Στην παρούσα μελέτη, πέντε SNPs (

CD3EAP

rs967591G & gt? Α,

TNFRSF10B

rs1047266C & gt? Τ,

ΑΚΤ1

rs3803300A & gt? G,

C3

rs2287845T & gt? C, και

GNB2L1

rs3756585T & gt? G) ελέγχθηκαν σε μία αύξηση του αριθμού των ασθενών σε σύγκριση με την αρχική τους μελέτες που περιλαμβάνονται 811, 310, 310, 792 και 792 αντίστοιχα [9-11, 15]. Τα άλλα τρία αδημοσίευτα SNPs ταυτοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας τον ίδιο πληθυσμό της παρούσας μελέτης ασθενούς. Γονοτυπική πραγματοποιήθηκε με τη χρήση MassARRAY SEQUENOM του

® δοκιμασία iPlex (SEQUENOM Inc., San Diego, CA) ή μια δοκιμασία πολυμορφισμού μήκους θραυσμάτων εκ περιορισμού. Το SNP αριθμούς αναγνώρισης, αλλαγή βάσης, δευτερεύουσες συχνότητες αλληλόμορφο και τιμή p για την ισορροπία Hardy-Weinberg, και log-rank

P

τιμές για τη συνολική επιβίωση (OS) και απαλλαγμένα από ασθένειες επιβίωση (DFS) από τα οκτώ SNPs φαίνονται στον πίνακα S1.

Στατιστική ανάλυση

οι διαφορές στην κατανομή των γονότυπων σύμφωνα με τις κλινικοπαθολογική παράγοντες των ασθενών συγκρίθηκαν χρησιμοποιώντας χ

2 δοκιμές. OS μετρήθηκε από την ημέρα της χειρουργικής επέμβασης, μέχρι την ημερομηνία του θανάτου από οποιαδήποτε αιτία ή από την ημερομηνία της τελευταίας παρακολούθησης. DFS υπολογίστηκε από την ημέρα της χειρουργικής επέμβασης έως την υποτροπή ή θάνατο. Οι εκτιμήσεις επιβίωσης υπολογίστηκαν χρησιμοποιώντας τη μέθοδο Kaplan-Meier. Οι διαφορές στο λειτουργικό σύστημα και DFS σε διάφορους γονότυπους συγκρίθηκαν χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία log-rank. αναλογίες κινδύνου (HR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) εκτιμήθηκαν χρησιμοποιώντας πολυπαραγοντική αναλογικών κινδύνων κατά Cox μοντέλα, με προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα, η ιστολογία του όγκου, παθολογική στάδιο, και επικουρική χημειοθεραπεία. Σχεδιάσαμε ένα προγνωστικό δείκτη για την πρόβλεψη της πρόγνωσης των ασθενών χρησιμοποιώντας ένα συνδυασμό οκτώ SNPs. Σύμφωνα με σχετικό κίνδυνο θανάτου, μια τιμή σκορ είχε εκχωρηθεί σε κάθε γονότυπο του SNPs. Ένα χειρότερη πρόγνωση αντιστοιχεί στην υψηλότερη τιμή του σκορ: στο μοντέλο πρόσθετης ύλης, 1 ανατέθηκε για τους χαμηλού κινδύνου, 2 για το ενδιάμεσο κίνδυνο, και 3 για την υψηλή γονότυπο κινδύνου? στις κυρίαρχες και υπολειπόμενες μοντέλα, 1 για χαμηλού κινδύνου, και 3 για το γονότυπο υψηλού κινδύνου. Το άθροισμα των αξιών βαθμολογίας των οκτώ SNPs ορίζεται το προγνωστικό δείκτη του κάθε ασθενούς, η οποία κυμάνθηκε 8-20. Χρησιμοποιώντας 15 ως τιμή αποκοπής, ταξινομήσαμε τους ασθενείς με τη μεγαλύτερη προσέγγιση τριτημόριο του προγνωστικού δείκτη σε μια ομάδα υψηλού κινδύνου. Στη συνέχεια, σε σύγκριση με το λειτουργικό σύστημα και DFS μεταξύ του υψηλού (προγνωστικός δείκτης ≥15) και χαμηλής (προγνωστικός δείκτης & lt? 15) ομάδες κινδύνου. Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του Συστήματος Στατιστικής Ανάλυσης για Windows, έκδοση 9.2 (SAS Institute, Cary, NC, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής).

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά ασθενών και κλινικά προγνωστικά

Η κλινική και παθολογικών χαρακτηριστικών των ασθενών και τη σύνδεση με το OS και DFS παρουσιάζονται στον πίνακα 1. Μετά την μονοπαραγοντική ανάλυση, την ηλικία (log-rank

P

[

P

LR] για το OS = 3.0 x 10

-5 και

P

LR για DFS = 0,01) και παθολογικές στάδιο (

P

LR για το OS = 7,0 x 10

-7 και

P

LR για DFS = 4.0 x 10

-12) ήταν σημαντικά σχετίζονται με το λειτουργικό σύστημα και DFS. Φύλο (

P

L-R για το OS = 0,005) και το κάπνισμα κατάσταση (

P

L-R για το OS = 0.04) σχετίστηκαν με το OS. Όγκου ιστολογία συνδέθηκε με DFS (

P

LR για DFS = 0.04).

Η

Σύλλογοι μεταξύ SNPs και την επιβίωση αποτελέσματα

Οι 8 SNPs (

CD3EAP

rs967591,

TNFRSF10B

rs1047266,

ΑΚΤ1

rs3803300,

C3

rs2287845,

HOMER2

rs1256428,

GNB2L1

rs3756585,

ADAMTSL3

rs11259927, και

CD3D

rs3181259) βρέθηκαν να σχετίζονται σημαντικά με το OS ή /και DFS (Πίνακας 2 και S1 Σχήμα), όταν προσαρμοστεί για την ηλικία, το φύλο, το κάπνισμα , ιστολογία του όγκου, την παθολογική στάδιο. Προσαρμοσμένη HRs (AHRS) για το OS και DFS ήταν 1,68 και 1,32 (

P

= 1,0 x 10

-4 και 0.01) για

CD3EAP

rs967591 κάτω υπολειπόμενο μοντέλο, 1.77 και 1.62 (

P

= 0.006 και 0.004) για

TNFRSF10B

rs1047266 κάτω υπολειπόμενο μοντέλο, 1,35 και 1,17 (

P

= 0.03 και 0.14) για

ΑΚΤ1

rs3803300 σύμφωνα με κυρίαρχο μοντέλο, 1.44 και 1.39 (

P

= 0.004 και 0.006) για

C3

rs2287845 υπό προσθετικό μοντέλο, 1.25 και 1.11 (

P

= 0.02 και 0.15) για

HOMER2

rs1256428 υπό προσθετικό μοντέλο, 1.33 και 1.15 (

P

= 0,004 και 0,08) για

GNB2L1

rs3756585 υπό προσθετικό μοντέλο, 1.52 και 1.35 (

P

= 0,006 και 0,02) για

ADAMTSL3

rs11259927 κάτω υπολειπόμενο μοντέλο, και 1,45 και 1,24 (

P

= 0,006 και 0,05) για

CD3D

rs3181259 κάτω υπολειπόμενο μοντέλο, αντίστοιχα.

η

η συνδυασμένη ανάλυση των πολλαπλών SNPs

Πραγματοποιήσαμε μια διερευνητική ανάλυση ερευνά τις συνδυασμένες επιπτώσεις των οκτώ SNPs σε OS και DFS. Σχεδιάσαμε μια προγνωστική δείκτη, όπως περιγράφεται στην ενότητα Στατιστική ανάλυση. Όταν κατηγοριοποιούνται οι ασθενείς σε υψηλό (προγνωστικός δείκτης ≥ 15) και χαμηλό (προγνωστικός δείκτης & lt? 15) ομάδα υψηλού κινδύνου, οι ασθενείς υψηλού κινδύνου ήταν σημαντικά σχετίζεται με χειρότερη OS και DFS σε σύγκριση με ομάδα χαμηλού κινδύνου σε πολύ υψηλότερη στατιστική σημασία σε σύγκριση με τις μεμονωμένες ανάλυση SNP (AHR για το OS = 2,21, 95% CI = 1,69 – 2,88,

P

= 8,0 x 10

-9, και AHR για DFS = 1.58, 95% CI = 1,29 – 1,94,

P

= 1,0 x 10

-5, Πίνακας 3 και Σχήμα 1).

η

P

τιμές στο πολυπαραγοντικό μοντέλο αναλογικών κινδύνων Cox.

Συζήτηση

Αυτή η μελέτη διεξήχθη για να διερευνηθεί αν μια ομάδα οκτώ γενετικών πολυμορφισμών θα μπορούσε να προβλέψει την πρόγνωση των ασθενών με πρώιμο στάδιο NSCLC μετά από χειρουργική εκτομή. Έχουμε επιλέξει οκτώ SNPs που συνδέεται με την πρόγνωση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα μετά από χειρουργική επέμβαση από προηγούμενες μελέτες μας, και αξιολογήθηκαν εκείνες SNPs σε 814 ασθενείς. Οι οκτώ SNPs (

CD3EAP

rs967591,

TNFRSF10B

rs1047266,

ΑΚΤ1

rs3803300,

C3

rs2287845,

HOMER2

rs1256428,

GNB2L1

rs3756585,

ADAMTSL3

rs11259927, και

CD3D

rs3181259) ήταν σημαντικά σχετίζεται με το OS ή /και DFS. Συνδυάζοντας αυτά τα οκτώ SNPs, σχεδιάσαμε ένα προγνωστικό δείκτη για να προβλέψει την πρόγνωση των ασθενών. Μετά την κατηγοριοποίηση των ασθενών σε ομάδες υψηλού και χαμηλού κινδύνου από την προγνωστική δείκτη, βρήκαμε η ομάδα υψηλού κινδύνου ήταν σημαντικά σχετίζεται με χειρότερη OS και DFS από την ομάδα χαμηλού κινδύνου. Συνδυασμένη ανάλυση με τη χρήση του προγνωστικού δείκτη είχε μια πολύ καλύτερη ανάλυση για την πρόβλεψη της πρόγνωσης των ασθενών σε σύγκριση με ατομική SNP ανάλυση. Η προγνωστική δείκτης χρήση αυτών των οκτώ γενετικών πολυμορφισμών μπορεί να είναι χρήσιμη για τον εντοπισμό των ασθενών που διατρέχουν υψηλότερο κίνδυνο υποτροπής της νόσου και του θανάτου μετά από χειρουργική εκτομή του NSCLC, και με τον τρόπο αυτό να συμβάλει στην επιλογή των ασθενών για επικουρική χημειοθεραπεία.

Το πιο σημαντικό εύρημα της η παρούσα μελέτη είναι ότι η προγνωστική δείκτης που βασίζεται σε οκτώ γενετικών πολυμορφισμών μπορεί να οδηγήσει σε σημαντικά καλύτερη πρόβλεψη της επιβίωσης σε σύγκριση με ατομική ανάλυση SNP σε πρώιμο στάδιο NSCLC μετά την επέμβαση. Δεδομένου ότι η καρκινογένεση είναι μια διαδικασία πολλαπλών βημάτων που χαρακτηρίζεται από τη συσσώρευση πολλαπλών γενετικών και επιγενετικών αλλαγών που καθορίζουν συλλογικά κακοήθη φαινότυπο, είναι απίθανο ότι οποιαδήποτε ενιαία πολυμορφισμός θα μπορούσε να είναι ένα ισχυρό προγνωστικό παράγοντα έκβαση επιβίωσης. Επιπλέον, χρησιμοποιώντας έναν σχετικά μεγάλο αριθμό ασθενών, έχουμε εν μέρει αναπαραχθούν προηγούμενες μελέτες μας των επιμέρους SNPs και σύνδεσης επιβίωση του ασθενούς. Λειτουργικές συνέπειες της SNPs από προηγούμενες μελέτες μας εξακολουθεί να στηρίζει την αληθοφάνεια των σημερινών αποτελεσμάτων.

Το

CD3EAP

κωδικοποιεί μια νουκλεοπρωτεΐνη, και είναι τοποθετημένη σε ένα αντι-νόημα προσανατολισμό, και επικαλύπτει ,

ERCC1

. Αν και η βιολογική λειτουργία του CD3EAP είναι ασαφής, η πρωτεΐνη μπορεί να είναι ένα μέλος του συμπλέγματος Ι μεταγραφή RNA πολυμεράση που συνθέτουν προδρόμους ριβοσωμικό RNA, ενοχοποιώντας έτσι CD3EAP στον πολλαπλασιασμό των κυττάρων [17]. Επιπλέον, CD3EAP ισομορφή 2 αλληλεπιδρά με το μόριο υπομονάδας CD3 έψιλον του συμπλόκου TCR-CD3. Σε προηγούμενη μελέτη μας, λειτουργική ανάλυση έδειξε ότι το κληρονόμησε rs967591G & gt? Ένα επηρεάζει

CD3EAP

έκφραση [9]. TNFRSF10B (DR5) είναι ένα από τα TNFSF10 (TRAIL) υποδοχείς και ξεκινά TRAIL-μεσολαβούμενη απόπτωση. DR5 εκφράζεται σε μια ποικιλία καρκίνων, συμπεριλαμβανομένων των NSCLC, και η έκφρασή του έχει συνδεθεί με τα αποτελέσματα επιβίωσης σε πολλούς τύπους καρκίνου [18-20]. ΑΚΤ παίζει ένα κεντρικό ρόλο στην φωσφατιδυλινοσιτόλης 3-κινάσης (ΡΙ3Κ)-σχετικές οδό σηματοδότησης, που ρυθμίζουν την κυτταρική επιβίωση, τον πολλαπλασιασμό, και αντι-απόπτωση [21, 22]. Επιπλέον, ΑΚΤ εμπλέκεται στη ρύθμιση της αγγειογένεσης και της μετάστασης, δύο σημαντικές διεργασίες στην ανάπτυξη και την πρόοδο του καρκίνου [23, 24]. Ανωμάλως ενεργοποιούνται έκφραση ΑΚΤ έχει αναφερθεί και που συνδέονται με την πρόγνωση των ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα [22, 25, 26].

Το σύστημα του συμπληρώματος έχει έναν σημαντικό ρόλο στην έμφυτη και προσαρμοστική ανοσία. Η

C3

πρωτεΐνη είναι κεντρικής σημασίας για την ενεργοποίηση όλων των τριών πορειών συμπληρώματος, την κλασική, εναλλακτική λύση, και μαννόζη δεσμευτική λεκτίνη οδών [27, 28]. Έχει αναφερθεί ότι το σύστημα συμπληρώματος ενεργοποιείται σε διάφορους τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα [28-30]. Παρά το γεγονός ότι τα συμπληρώματα έχουν σκεφτεί να συμμετάσχουν στο ανοσολογικής εναντίον όγκων [28], υπάρχουν αυξανόμενες ενδείξεις που συμπληρώνει παίζουν ογκογόνο ρόλο στην ογκογένεση [31, 32]. Homer οικογένεια πρωτεΐνες είναι γνωστές ως μετα-συναπτική πρωτεΐνες προσαρμογέα που αλληλεπιδρούν με διάφορες πρωτεΐνες, όπως μεταβοτροπικών υποδοχέων γλουταμικού, ινοσιτόλη 1,4,5-τριφωσφορική υποδοχείς και ρυθμίζουν το Ca2 + οδό σηματοδότησης σε νευρώνες [33]. HOMER2 αλληλεπιδρά με το C-τερματική περιοχή του MYO18B, ένα γονίδιο καταστολής όγκων υποψήφιος που εμπλέκονται στην παθογένεση των ανθρώπινων καρκίνων, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα [33]. Έχει αναφερθεί ότι το γονίδιο MYO18B είναι hemizygously διαγράφεται σε 60% και μεταλλαγμένο στο 15% των καρκίνων του πνεύμονα, και ότι η μειωμένη έκφραση του MYO18B, που συχνά συνοδεύεται από υποκινητή μεθυλίωσης του DNA και απακετυλίωση ιστόνης, παρατηρήθηκε στο 70% των καρκίνων του πνεύμονα [34, 35]. Έχει αναφερθεί ότι η συνέκφραση του HOMER2 με MYO18B ενίσχυσε την ικανότητα του MYO18B να καταστέλλει την ανεξάρτητη από προσκόλληση ανάπτυξη μιας ανθρώπινης κυτταρικής σειράς καρκίνου του πνεύμονα, υποδεικνύοντας ότι HOMER2 και MYO18B συνεργάζονται καταστολή όγκου [33].

GNB2L1

, ψευδώνυμο

RACK1

, ανήκει σε μια οικογένεια πρωτεϊνών WD40 που περιλαμβάνει τη β υπομονάδα της G-πρωτεϊνών. Ως πρωτεΐνη ικρίωμα, GNB2L1 αλληλεπιδρά με μόρια σηματοδότησης όπως κυκλικό ΑΜΡ-ειδικής φωσφοδιεστεράσης 4D ισομορφή 5 (PDE4D5), την οικογένεια SRC των κινασών τυροσίνης, και ιντεγκρίνες β, καθώς και PKC, και έτσι παίζει κεντρικό ρόλο σε ένα ευρύ φάσμα του βιολογικές αποκρίσεις, συμπεριλαμβανομένης της κυτταρικής ανάπτυξης, προσκόλληση και τη μετανάστευση [36-38]. Μελέτες έχουν δείξει ότι GNB2L1 παίζει σημαντικό ρόλο στην εξέλιξη του καρκίνου και ότι η έκφρασή του ρυθμίζεται προς τα πάνω κατά τη διάρκεια της αγγειογένεσης σε ορισμένους τύπους καρκίνων, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα [39-41]. Επιπλέον,

GNB2L1

υπερ-έκφραση έχει συσχετιστεί με φτωχή κλινική έκβαση των ασθενών με καρκίνο [41, 42]. Σύμφωνα με τα αδημοσίευτα δεδομένα μας,

vitro

δοκιμασία σε δοκιμασία προαγωγού και ηλεκτροφορητική κινητικότητα μετατόπισης (EMSA) αποκάλυψε ότι η rs3756585 Τ-to-G αλλαγή αυξημένη δέσμευσης παράγοντα μεταγραφής και δραστικότητα προαγωγέα του

GNB2L1

.

ADAMTSL3

κωδικοποιεί μια εκκρίνεται γλυκοπρωτεΐνη με ισχυρή ομοιότητα με τα μέλη των ADAMTS (ένα αποσυνθετίνη και μεταλλοπρωτεϊνασών με θρομβοσπονδίνη μοτίβο) οικογένεια. Η οικογένεια ADAMTS έχει εμπλακεί σε διάφορες ανθρώπινες βιολογικές διαδικασίες (κανονική ή παθολογική), συμπεριλαμβανομένων της δομής του συνδετικού ιστού, του καρκίνου, της πήξης, αρθρίτιδα, αγγειογένεση και τη μετανάστευση των κυττάρων [43]. Εμπλέκονται σε διαδικασίες σχετίζονται με τον καρκίνο όπως ο πολλαπλασιασμός (π.χ. η διάσπαση των επιθηλιακών αυξητικού παράγοντα (EGF) προδρόμους πρωτεΐνη σήματος οικογένειας, συμπεριλαμβανομένων των EGF και την ανάπτυξη του όγκου παράγοντα-α), απόπτωση, αγγειογένεση, και την καταστροφή των συστατικών της εξωκυττάριας μήτρα, οι οποίες διευκολύνουν την εισβολή και τη μετάσταση [44]. ADAMTS-όπως πρωτεΐνες, συμπεριλαμβανομένων ADAMTSL3, έλλειψη πρωτεολυτική δραστικότητα χαρακτηριστική για ADAMTS οικογένεια πρωτεϊνών, αλλά φαίνεται να έχουν σημαντικό ρυθμιστικούς ρόλους στην εξωκυτταρική μήτρα [43]. Πρόσφατα, οι συχνές μεταλλάξεις σε

ADAMTSL3

έχουν ταυτοποιηθεί πρόσφατα στην ορθοκολικό καρκίνο [45]. Τ-κύτταρα παίζουν σημαντικό ρόλο στην ανοσοαπόκριση. Το TCR είναι υπεύθυνη για την αναγνώριση των αντιγόνων συμπεριλαμβανομένων αντιγόνων όγκων συνδεδεμένο με μείζον σύμπλεγμα ιστοσυμβατότητας (MHC). TCR σύμπλοκα περιέχουν ένα ετεροδιμερές ΤΟΡ και τέσσερις υπομονάδες CD3: CD3-γάμμα, δέλτα, -ε και -zeta. Το συγκρότημα CD3 είναι ζωτικής σημασίας για την ανάπτυξη των κυττάρων Τ, καθώς και τη λειτουργία των κυττάρων Τ [46]. Συσσωρευμένα αποδείξεις δείχνουν ότι τα κύτταρα του ανοσοποιητικού παίζουν σημαντικούς ρόλους στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου του ανάλογα με τον τρόπο τους της διαφοροποίησης και σηματοδότηση κυτοκίνης στο μικροπεριβάλλον του όγκου. CD8 + κυτταροτοξικά Τ λεμφοκύτταρα, CD4 + Τ βοηθητικά (ΤΗ) 1 κύτταρα και φυσικά φονικά κύτταρα (ΝΚ) λειτουργούν ως μείζων κύτταρα κατά του όγκου τελεστή, ενώ τα κύτταρα CD4 + ΤΗ2, μυελοειδή προερχόμενα κατασταλτικών κυττάρων (MDSCs) φαίνεται ότι για την προώθηση της προόδου όγκου [47].

σε αυτή τη μελέτη, δείξαμε ότι προγνωστικό δείκτη που βασίζεται σε οκτώ γενετικών πολυμορφισμών ήταν ένας ανεξάρτητος προγνωστικός παράγοντας για την επιβίωση των ασθενών με NSCLC μετά την επέμβαση. Η προγνωστική δείκτης μπορεί να βοηθήσει στην πρόβλεψη προγνώσεις ασθενών με μεγαλύτερη ακρίβεια, όταν χρησιμοποιείται εκτός από παθολογικές στάδιο, η πιο ισχυρή προγνωστικός δείκτης πρόγνωσης μετά από χειρουργική εκτομή του NSCLC, ως εκ τούτου είναι ιδιαίτερα χρήσιμα για την επιλογή ασθενών οι οποίοι μπορούν να επωφεληθούν από επικουρική χημειοθεραπεία. Επειδή η τρέχουσα μελέτη αναπαραχθεί μερικώς προηγούμενες μελέτες μας, για τη σύνδεση μεταξύ των οκτώ SNPs και την επιβίωση του ασθενούς χρησιμοποιώντας έναν σχετικά μεγάλο αριθμό ασθενών, μειωμένη πιθανότητα ψευδώς θετικών ενώσεων αναμένεται. Ωστόσο, ο προγνωστικός δείκτης πρέπει να δοκιμαστεί περαιτέρω σε μελλοντικές προοπτικές μελέτες συμπεριλαμβανομένων των κλινικών δοκιμών. Επιπλέον, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να κατανοήσουν τους ρόλους αυτών των γονιδίων στον καρκίνο του πνεύμονα και να διευκρινιστεί η σχέση μεταξύ της SNPs και την πρόγνωση.

Εν κατακλείδι, η παρούσα μελέτη δείχνει ότι μια ομάδα οκτώ SNPs θα μπορούσε να είναι χρήσιμο να εντοπισμό ασθενών με υψηλότερο κίνδυνο υποτροπής της νόσου και του θανάτου μετά από χειρουργική εκτομή του NSCLC, και με τον τρόπο αυτό να συμβάλει στην επιλογή των ασθενών για επικουρική χημειοθεραπεία. Περαιτέρω μελέτες απαιτούνται για να επιβεβαιώσουν την εγκυρότητα αυτών των SNPs σε άλλες πληθυσμιακές ομάδες.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1. Περίληψη των επιλεγμένων και ο γονότυπος SNPs και τα αποτελέσματα επιβίωσης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0140216.s001

(DOCX)

S1 Εικ. Kaplan-Meier για τη συνολική επιβίωση και την ελεύθερη νόσου επιβίωση, σύμφωνα με γονότυπους

CD3EAP

rs967591G & gt?. Α, Α)?

TNFRSF10B

rs1047266 C & gt? Τ, Β)?

ΑΚΤ1

rs3803300 A & gt? G, C)?

C3

rs2287845T & gt? C, D)?

HOMER2

rs1256428 G & gt? Α, Ε)?

GNB2L1

rs3756585 Τ & gt? G, F)?

ADAMTSL3

rs11259927 C & gt? T, G)? και

CD3D

rs3181259 C & gt? T, H).

P

τιμές από δοκιμασία log-rank

doi:. 10.1371 /journal.pone.0140216.s002

(PPTX)

Ευχαριστίες

Αυτή η μελέτη είναι υποστηρίζονται από το R &? προγράμματος D της MKE /Keit (10040393, ανάπτυξη και εμπορευματοποίηση των μοριακών διαγνωστικών τεχνολογιών για τον καρκίνο του πνεύμονα μέσω κλινικών επικύρωση)

.