Αφηρημένο

Ιστορικό

Ο καρκίνος του προστάτη αποτελεί την κύρια αιτία της αρσενικό θανάτου σε όλο τον κόσμο. Μια πρόσφατη μελέτη σύνδεσης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) προσδιόρισε πέντε νέες θέσεις ευαισθησίας για τον καρκίνο του προστάτη στην ιαπωνική πληθυσμού. Η μελέτη αυτή είναι η αναπαραγωγή και πρόστιμο χάρτη την πιθανή συσχέτιση αυτών των πέντε τόπους με καρκίνο του προστάτη στον πληθυσμό κινεζικής Χαν.

Μέθοδοι

Στη Φάση Ι της μελέτης, ελέγξαμε τα πέντε μόνο νουκλεοτίδιο πολυμορφισμοί (SNPs), η οποία έδειξε την ισχυρότερη απόδειξη συνδέσμου στην αρχική GWAS στα ιαπωνικά. Το δείγμα της μελέτης αποτελείται από 1.169 Κινέζοι Χανς, που περιλαμβάνει 483 ασθενείς και 686 υγιείς μάρτυρες. Στη συνέχεια, στη φάση ΙΙ, συνοδευτικά SNPs των αναπαραχθούν με επιτυχία SNPs στη φάση Ι ήταν ο γονότυπος και δοκιμάστηκαν για συσχέτιση με καρκίνο του προστάτη σε πρόστιμο χάρτη αυτά τα σημαντικά σήματα συνδέσμου.

Αποτελέσματα

Εμείς αναπαραχθούν με επιτυχία τη σύνδεση του

rs13385191

(που βρίσκεται στο

C2orf43

γονίδιο,

P

= 8.60 × 10

-5),

rs12653946

(

P

= 1.33 × 10

-6),

rs1983891

(

FOXP4

,

P

= 6,22 × 10

-5), και

rs339331

(

GPRC6A /RFX6

,

P

= 1,42 × 10

-5) με καρκίνο του προστάτη. Η πιο σημαντική αναλογία πιθανοτήτων (OR) καταγράφηκε ως 1,41 (95% διάστημα εμπιστοσύνης 1,18 έως 1,68) για

rs12653946

.

Rs9600079

δεν έδειξαν σημαντική συσχέτιση (

P

= 8,07 × 10

-2) με καρκίνο του προστάτη σε αυτή τη μελέτη. Η μελέτη Φάσης ΙΙ εξευγενισμένα αυτά τα σήματα του συνεταιρίζεσθαι, και εντόπισε αρκετούς SNPs που δείχνει πιο σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του προστάτη από τα πολύ SNPs δοκιμαστεί στη Φάση Ι

Συμπεράσματα

Τα αποτελέσματά μας παρέχουν περαιτέρω υποστήριξη για σύνδεση της η

C2orf43

,

FOXP4

,

GPRC6A

και

RFX6

γονίδια με καρκίνο του προστάτη σε ασιατικούς πληθυσμούς της Ανατολικής. Η μελέτη αυτή χαρακτηρίζεται επίσης το μυθιστόρημα τόπους που αναφέρθηκαν στην αρχική GWAS με περισσότερες λεπτομέρειες. Περαιτέρω εργασία απαιτείται ακόμη για να καθορίσει τις λειτουργικές παραλλαγές και, τέλος, την αποσαφήνιση των βασικών βιολογικών μηχανισμών

Παράθεση:. Long Q-Z, Du Υ-F, Ding Χ-Υ, Λι Χ, Τραγούδι W-Β, Yang Y, et al. (2012) Η αναπαραγωγή και Καλών Χαρτογράφηση για την Ένωση η

C2orf43

,

FOXP4

,

GPRC6A

και

RFX6

γονίδια με τον καρκίνο του προστάτη στην κινεζική Πληθυσμός . PLoS ONE 7 (5): e37866. doi: 10.1371 /journal.pone.0037866

Επιμέλεια: Karl X. Chai, University of Central Florida, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 4 Ιανουαρίου, 2012? Αποδεκτές: 26 του Απρίλη 2012? Δημοσιεύθηκε: May 25, 2012 |

Copyright: © 2012 Long et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το ακόλουθο κείμενο: Εθνικό Ίδρυμα Επιστημών της Κίνας (αριθμός επιχορήγηση: 30900800, 30901500? URL: https://www.nsfc.gov.cn)? Επιστήμη και Τεχνολογία Πρόγραμμα Shaan-Xi επαρχία? Νέα Δάσκαλος Έναρξη Ταμείο της Xi’an Jiaotong University? οι Θεμελιωδών Κονδυλίων Έρευνας για τις Κεντρικές Πανεπιστήμια – Πρόγραμμα Καινοτομίας της Xi’an Jiaotong Πανεπιστημίου. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ο καρκίνος του προστάτη (MIM 176807) αποτελεί την κύρια αιτία της ανδρικής θανάτου στις δυτικές χώρες. Με τη μετάβαση στον τρόπο ζωής, έχει επίσης γίνει όλο και πιο διαδεδομένη στην Ασία. Είναι ευρέως αποδεκτό ότι η γενετική παίζει σημαντικό ρόλο στην ευαισθησία σε όλες σχεδόν τις ανθρώπινων καρκίνων. Τώρα, το γονιδίωμα-ευρεία μελέτη σύνδεσης (GWAS) έχει γίνει μια εφικτή, ισχυρή και αποτελεσματική προσέγγιση για την ταυτοποίηση νέων γονιδίων που διέπουν την ευαισθησία σε καρκίνους και άλλες πολύπλοκες ασθένειες.

Ένα πρόσφατα διεξήχθη GWAS για τον καρκίνο του προστάτη που προσδιορίζονται πέντε νέα ευπάθεια loci στον ιαπωνικό πληθυσμό [1]. Αυτοί οι τόποι δεν είχαν συσχετιστεί με τον καρκίνο του προστάτη πριν. Διερεύνηση σε διαφορετικούς πληθυσμούς από τις παραλλαγές που ανακαλύφθηκαν από GWASs μπορεί να συμβάλει σε μια πιο ολοκληρωμένη κατανόηση των γενετικών μηχανισμών του καρκίνου του προστάτη. Εδώ, αναφέρουμε τις προσπάθειες αντιγραφής μας στον πληθυσμό κινεζικής Χαν για την πιθανή συσχέτιση αυτών των πέντε τόπους με καρκίνο του προστάτη. Συγκεκριμένα, πέντε SNPs που έδειξε την ισχυρότερη απόδειξη ένωση αντίστοιχα στην τοποθεσία θέσεις τους στο αρχικό GWAS ήταν ο γονότυπος και ελέγχονται για πιθανή συσχέτιση με τον καρκίνο του προστάτη. Αυτή είναι η πρώτη μελέτη αναπαραγωγής σε αυτά τα πέντε νέα τόπους με καρκίνο του προστάτη στην κινεζική πληθυσμό. Επιπλέον, ως μια προσπάθεια να πρόστιμο χάρτη αναπαραγόμενων σημάτων συνεταιρίζεσθαι, είμαστε ο γονότυπος συνολικά άλλα 259 SNPs που περιλαμβάνει τις αναπαραχθούν με επιτυχία SNPs και ελέγχονται για τη σχέση τους με τον καρκίνο του προστάτη.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Η μελέτη εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας της Xi’an Jiaotong Πανεπιστημίου. Υπογεγραμμένα έγγραφα ενημερώνεται-συγκατάθεση ελήφθησαν από όλους τους συμμετέχοντες στη μελέτη.

Μελέτη Δείγμα

Το δείγμα της μελέτης αποτελούνταν από 483 ασθενείς και 686 υγιείς γεωγραφία και τους ελέγχους ίδιας ηλικίας. Οι ασθενείς είχαν προσληφθεί από την εντός και εξωτερικούς ασθενείς των συμμετεχόντων νοσοκομείων από το 2007 μέχρι σήμερα. Όλοι οι ασθενείς είχαν ανεξάρτητα και σταθερά διαγνωστεί από δύο ανώτερους ουρολόγους και ανώτερος παθολόγος βασίζεται σε ιατρικά αρχεία και παθολογικές αξιολόγηση της βιοψίας του προστάτη. Εμείς προτίμηση στρατολόγησαν ασθενείς οι οποίοι είχαν μια αυτο-αναφερόμενη οικογενειακό ιστορικό καρκίνου του προστάτη ή μια υψηλής ποιότητας σκορ Gleason (≥7) κατά τη στιγμή της διάγνωσης. Κάθε αντικείμενο μελέτης συμπληρώνεται σε δομημένη μορφή ερωτηματολογίου που καλύπτουν το οικογενειακό ιστορικό, το ιατρικό ιστορικό, η κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα, τη δομή διατροφή, κοινωνικοοικονομικοί παράγοντες, κ.λπ. Τα θέματα ελέγχου επιλέχθηκαν από μια αυξανόμενη βάση δεδομένων περιλαμβάνει περισσότερα από 3.000 τυχαία εγγραφεί άσχετα Κινέζων Χαν από Ξι «μια πόλη και τις γειτονικές της περιοχής. Τα άτομα με σοβαρές χρόνιες παθήσεις /εξαιρέθηκαν συνθήκες που μπορεί να έχουν πιθανή επίδραση στην ενδοκρινικό και το μεταβολισμό. Τα κριτήρια συμπερίληψης και αποκλεισμού έχουν περιγραφεί με λεπτομέρειες αλλού [2], [3]. Οι πιθανοί παράγοντες σύγχυσης, συμπεριλαμβανομένων μητρική θέση, η κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα, τη δομή διατροφή και κοινωνικοοικονομικούς παράγοντες, ήταν μέγιστη θεωρείται ότι ταιριάζουν με τις ομάδες ασθενών και τον έλεγχο.

SNP επιλογής και Γονοτυπικές

Στη Φάση Ι, επιλέξαμε τις πέντε SNPs που έδειξε την ισχυρότερη απόδειξη ένωση αντίστοιχα στην τοποθεσία θέσεις τους στο αρχικό GWAS. Όσο για τη φάση ΙΙ, οι SNP δείκτες επιλέχθηκαν με βάση μια ολοκληρωμένη εξέταση των: (1) την κάλυψη της ακολουθίας κωδικοποίησης και έως 300 kbp ανάντη του γονιδίου υπό έλεγχο? (2) την επικύρωση του SNP τόσο από dbSNP και HapMap βάσεις δεδομένων? (3) βαθμός ετεροζυγωτίας, δηλαδή, τα ανήλικα συχνότητα αλληλόμορφου ≥5%? (4) συμπερίληψη του SNP στο Affymetrix και Illumina SNP μάρκες. Αυτό είναι για την ευκολία της σύγκρισης των αποτελεσμάτων σύνδεσης μεταξύ αυτής της μελέτης και άλλοι.

Γενωμικό DNA εκχυλίστηκε από λευκοκύτταρα περιφερικού αίματος εφαρμόζοντας τυποποιημένα πρωτόκολλα. SNP γονοτυποποίηση διεξήχθη με μία μέθοδο επέκτασης εναύσματος με MALDI-TOF φασματομετρία μάζας σε ένα σύστημα MassARRAY όπως προτείνεται από τον κατασκευαστή (Sequenom, Inc., San Diego, CA). συχνότητες γονότυπος όλων των πέντε SNPs σε δύο ομάδες περίπτωση και ελέγχου δεν αποκλίνουν σημαντικά από την ισορροπία Hardy-Weinberg (

P

& gt? 0,05). Στη φάση ΙΙ, 66, 40 και 81 SNPs με επιτυχία ο γονότυπος και το παρελθόν της δοκιμής ισορροπία Hardy-Weinberg, αντίστοιχα, για τη τόπους γύρω από το

C2orf43

(χρωμόσωμα 2 ανοικτό πλαίσιο ανάγνωσης [MIM ​​613570]),

FOXP4

(Forkhead ασφαλείας P4 [MIM ​​608924]) και

GPRC6A /RFX6

(συζευγμένο με πρωτεΐνη Ο υποδοχέων, οικογένεια C, ομάδα 6, μέλος A [MIM ​​613572] και ρυθμιστικός παράγοντας Χ, 6 [MIM 612659]) γονίδια. Δεδομένου

rs12653946

δεν είχε χαρτογραφηθεί σε οποιοδήποτε γνωστό γονίδιο, 72 συνοδευτικά SNPs του

rs12653946

γονότυπος στη φάση ΙΙ.

Στατιστικές Αναλύσεις

Οι κατανομές γονότυπου των δοκιμαζόμενων SNPs μεταξύ υπόθεσης και τον έλεγχο των ομάδων αναλύθηκαν με μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης έλεγχο για την ηλικία και η κατανάλωση αλκοόλ ως συμπαράγοντες. Στο πλαίσιο της μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης, αναλογία πιθανοτήτων (OR) με τα αντίστοιχα διαστήματα εμπιστοσύνης 95% ήταν επίσης υπολογιστεί. Υιοθετήσαμε τη συντηρητική μέθοδο Bonferroni να λογοδοτήσουν για το πρόβλημα των πολλαπλών δοκιμών, αντίστοιχα, για τη μελέτη της Φάσης Ι και Φάσης ΙΙ. Επειδή πέντε SNPs δοκιμάστηκαν στη φάση αντιγραφής, το επίπεδο σημαντικότητας ορίστηκε ως 1.00 × 10

-2 (δηλαδή, 0.05 /5). Στη φάση ΙΙ, το επίπεδο σημαντικότητας για τη μελέτη ορίστηκε ως 1,93 × 10

-4 (δηλαδή, 0.05 /259)

Αξιοποιήσαμε σε απευθείας σύνδεση FASTSNP (http:. //fastsnp.ibms.sinica. edu.tw), προκειμένου να αναλύσει τις πιθανές λειτουργίες των εντοπιστούν SNPs. Η ανάλυση βασίζεται σε up-to-ενημερωμένες πληροφορίες που προέρχονται από 11 εξωτερικές βιοπληροφορικής βάσεις δεδομένων τη στιγμή του ερωτήματος [4].

Αποτελέσματα

Τα κλινικά χαρακτηριστικά των υποκειμένων των ασθενών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Η μέση ηλικία των ασθενών και ελέγχων ήταν 67.3 ± 6.9 και 66.3 ± 6.4, αντίστοιχα. Όλα τα άτομα της μελέτης είναι Κινέζων Χαν προσλαμβάνονται από την πόλη Xi’an και των γειτονικών της περιοχής. προηγούμενες μελέτες μας [2], [3] δεν ανίχνευσε σημαντική διαστρωμάτωση του πληθυσμού στο δείγμα βάσης δεδομένων της μελέτης, από την οποία αντλήθηκαν όλα τα θέματα ελέγχου της μελέτης αυτής. Μερικά ενδιαφέροντα χαρακτηριστικά των δειγμάτων υπόθεσης και του ελέγχου παρουσιάζονται στον Πίνακα 2.

Η

Τα αποτελέσματα της Φάσης Ι μελέτη παρέχει ενθαρρυντικά στοιχεία για τέσσερα από τα πέντε δοκιμαστεί SNPs ως αληθινή ευαισθησία τόπους του προστάτη Καρκίνος. Εμείς επιβεβαίωσε συνδέσμου

rs13385191

,

rs12653946

,

rs1983891

, και

rs339331

σε

P

= 8.60 × 10

-5, 1,33 × 10

-6, 6,22 × 10

-5, και 1,42 χ 10

-5, αντίστοιχα, με τα ίδια αλληλόμορφα υψηλού κινδύνου με εκείνα στο αρχικό GWAS στην ιαπωνική πληθυσμός. Τα χαρακτηριστικά των υπό μελέτη SNPs και τα αντίστοιχα αποτελέσματα της δοκιμής σύνδεσης στη φάση αντιγραφής έδειξε στον Πίνακα 3.

Η

Στη Φάση ΙΙ, βρήκαμε δύο SNPs που δείχνει ακόμη ισχυρότερη ένωση από τους αντιστοιχούν δύο SNPs δοκιμαστεί στη φάση Ι .

Rs16988102

αποκτήσει

P

αξία των 5,29 × 10

-5 σε σύγκριση με το

rs13385191

με

P

αξία των 8,60 × 10

-5.

Rs9489065

πήρε ένα

P

αξία των 1,40 × 10

-5, σε σύγκριση με το

rs339331

με ένα

P

αξία των 1,42 × 10

-5. Όταν μοντελοποίηση κοινού καρκίνο του προστάτη με το

rs16988102

και

rs13385191

, το OR (95% CI) αυξήθηκε στο 1,71 (1,47 – 1,96), σε σύγκριση με το OR 1,33 (1,11 – 1,58) κατά την εξέταση

rs13385191

μόνο. Όταν μοντελοποίηση κοινού τα τέσσερα SNPs που πήρε τα πιο σημαντικά σήματα σύνδεσης στις αντίστοιχες θέσεις τους, το OR (95% CI) αποδείχθηκε 2,06 (1,79 – 2,35). LD (ανισορροπίας σύνδεσης) δομή των δοκιμαζόμενων SNPs και τα αποτελέσματα των δοκιμών σύνδεσης της Φάσης ΙΙ για τις τέσσερις θέσεις γύρω από

rs13385191

,

rs12653946

,

rs1983891

, και

rs339331

παρουσιάζονται στο Σχήμα 1, 2, 3 και 4. ο χάρτης LD δημιουργήθηκε με τη χρήση του Haploview (Ινστιτούτο Broad, MA, USA) με βάση την D-Prime χρησιμοποιώντας τα δεδομένα γονότυπο της υπόθεσης και των ελέγχων στα η μελέτη φάσης ΙΙ.

η

η

Συζήτηση

Rs13385191

βρίσκεται στην περιοχή ιντρονίου του

C2orf43

γονίδιο, το οποίο κωδικοποιεί μια υποθετική πρωτεΐνη LOC60526. Η

C2orf43

γονίδιο είναι συντηρημένο μεταξύ των χιμπατζήδων, αγελάδα, ποντίκι, αρουραίο, το κοτόπουλο, το zebrafish, μύγα των φρούτων, τα κουνούπια, C.elegans, ίΗαΙΐαηα, και το ρύζι. Αυτό υποδηλώνει την ύπαρξη σημαντικών λειτουργικές παραλλαγές γύρω από την περιοχή του γονιδίου. Αξίζει να σημειωθεί ότι, η περιοχή του χρωμοσώματος 2p24 φιλοξενεί το

C2orf43

γονίδιο που συνδέεται με τον καρκίνο του προστάτη στην ευρωπαϊκή και αμερικανική πληθυσμού [5]. Αυτό είναι σύμφωνο με την ανιχνευθεί σύνδεση του

C2orf4

3 γονίδιο με τον καρκίνο του προστάτη σε αυτή τη μελέτη. αναλύσεις FASTSNP πρότεινε ότι

rs13385191

μπορεί να είναι μια τοποθεσία του εσωνίου ενισχυτή.

Rs1983891

αντιστοιχίζεται σε περιοχή ιντρονίου του

FOXP4

γονίδιο. Η

FOXP4

γονίδιο για πρώτη φορά ως παράγοντας μεταγραφής μυθιστόρημα forkhead [6]. FOXP4 ανήκει υποοικογένειας P της οικογένειας παράγοντα μεταγραφής κουτί forkhead (FOX). Forkhead παράγοντες μεταγραφής κουτί παίζουν σημαντικό ρόλο στη ρύθμιση της ιστών και κυτταρικό τύπο μεταγραφή γονιδίου. Πολλά μέλη της οικογένειας γονιδίων κουτί forkhead, συμπεριλαμβανομένων των μελών της υποοικογένειας Ρ, συμμετέχει στην ογκογένεση θηλαστικών [6]. Η

FOXP4

γονίδιο βρίσκεται στην περιοχή του χρωμοσώματος 6p21, η οποία περιοχή επίσης συνδέεται ποτέ με τον καρκίνο του προστάτη [5], [7].

Rs339331

κατοικεί κοντά σε δύο γονίδια,

GPRC6A

και

RFX6

. FASTSNP έδειξε ότι

rs339331

μπορεί να είναι μια θέση εσωνίων ενισχυτή του

GPRC6A

γονίδιο. Προστάτη δεν εκφράζει GPRC6A σε κανονικές συνθήκες [8]. Παρ ‘όλα αυτά, κατά τρόπο ενδιαφέροντα, GPRC6A εκφράζεται έντονα στα κύτταρα Leydig των όρχεων, και ποντίκια με ανεπάρκεια σε Gprc6a δείχνουν αρσενικό feminization και μεταβολική εκδήλωση της υψηλότερης κυκλοφορούν οιστραδιόλης και μειωμένα επίπεδα τεστοστερόνης. Αυτές οι δύο ορμόνες είναι κρίσιμη για την έναρξη και την πρόοδο του καρκίνου του προστάτη [9]. Ως άλλο αποδεικτικά στοιχεία για τη σημαντική συσχέτιση, GPRC6A είναι λειτουργικά σημαντική στη ρύθμιση μη γενωμική επιπτώσεις των ανδρογόνων σε πολλούς ιστούς [10].

Rs339331

κατοικεί στην περιοχή του χρωμοσώματος 6q22, η οποία βρέθηκε να είναι μια ευπάθεια τόπους του καρκίνου του προστάτη σε Whites ΗΠΑ [11].

Το

RFX6

γονίδιο κωδικοποιεί ένα μέλος της οικογένειας ρυθμιστικού παράγοντα Χ (RFX) μεταγραφικών παραγόντων [12]. Η κωδικοποιημένη δέσμευσης DNA RFX6 πρωτεΐνη παίζει σημαντικό ρόλο στην παθολογία της νεογνικής αιμοχρωμάτωση [13]. Σύλλογος του γονιδίου

HFE

(αιμοχρωμάτωση) με καρκίνο του προστάτη [14] υπογραμμίζουν την στιχομυθία μεταξύ παθολογία της αιμοχρωμάτωση και του καρκίνου του προστάτη.

Rs12653946

και

rs9600079

δεν αντιστοιχίζονται σε οποιοδήποτε γνωστό γονίδιο. Παρ ‘όλα αυτά, 5p15, ο τόπος που φιλοξενεί το

rs12653946

πολυμορφισμού, ήταν πάντα συνδεδεμένη με την επιθετικότητα του καρκίνου του προστάτη [15], [16]. Αυτό είναι σύμφωνα με τη ανιχνεύθηκε σύνδεση των

rs12653946

με καρκίνο του προστάτη σε αυτή τη μελέτη.

Πιθανές αιτίες για την αποτυχία της αντιγραφής για

rs9600079

μπορεί να περιλαμβάνει διαφορετικές εθνικές καταγωγές, η διαφορά σε κριτήρια επιλογής των συμμετεχόντων στη μελέτη, και /ή εθνική ετερογένεια της γενετικής μηχανισμών του καρκίνου του προστάτη.

στη Φάση ΙΙ της λεπτομερούς χαρτογράφησης για την αναπαραχθεί τόπους στη Φάση Ι,

rs16988102

και

rs9489065

πήρε πιο σημαντικές σήματα συσχέτιση με τον καρκίνο του προστάτη σε σχέση με τις γειτονικές τους SNPs αναπαραχθεί στη Φάση Ι η ένωση του

Rs16988102

με καρκίνο του προστάτη υποστηρίχθηκε επίσης από ισχυρές ενώσεις των πολλαπλών γύρω SNPs με καρκίνο του προστάτη.

Rs16988102

βρίσκεται στο 5 ‘πριν από το

C2orf43

γονίδιο. Η απόσταση μεταξύ του

rs16988102

και

rs13385191

είναι πάνω από 300 kb, το οποίο είναι πολύ μεγαλύτερο από ό, τι γενικά απόσταση LD. Έτσι, εμείς προτιμούμε να διεκδικήσει το

rs16988102

ως ένα τόπο κίνδυνο για καρκίνο του προστάτη ανεξάρτητου να

rs13385191

. Αυτό είναι σύμφωνα με τη σημαντικά αρθεί ή με την προσθήκη

rs16988102

στο μοντέλο κινδύνου καρκίνου του προστάτη, η οποία πήρε μόνο την παραλλαγή του

rs13385191

υπόψη.

Rs9489065

βρίσκεται στην περιοχή ιντρονίου του

RFX6

γονίδιο.

Rs9489065

και

rs339331

είναι ισχυρή LD (D ‘= 0,97), και τα σήματα σχέση τους με τον καρκίνο του προστάτη είναι σε μεγάλο βαθμό συγκριτικά. Αυτό σημαίνει ότι από τα

rs9489065

και

rs339331

είναι η αληθινή loci ευαισθησία, ή ότι τόσο οι δύο αυτές SNPs είναι ισχυρές LD με την αληθινή τόπους ευαισθησία. Αξίζει να σημειωθεί ότι, γύρω από το τόπους του

GPRC6A

και

RFX6

γονίδια, η SNPs σχετίζονται σημαντικά με τον καρκίνο του προστάτη περιορίστηκε στην περιοχή του

RFX6

γονίδιο, σε σύγκριση με ένα ευρύ διανομή συσχετίστηκε SNPs σε ολόκληρη την περιοχή των δύο αυτών γονιδίων στην αρχική GWAS. Αυτό υποδηλώνει το

RFX6

παραλλαγή γονιδίου μπορεί να είναι οι τόποι ευαισθησίας βασίζεται η παρατηρούμενη σήματος σύνδεση του

GPRC6A /RFX6

τόπους με καρκίνο του προστάτη σε αρχικό GWAS.

Στο αρχική GWAS, Τακάτα

et al.

απέτυχαν να αναπαράγουν ένωση 12 SNPs μεταξύ του συνόλου των δοκιμάζονται 31 SNPs οι οποίες σχετίζονται σημαντικά με τον καρκίνο του προστάτη στους ευρωπαϊκούς πληθυσμούς. Αυτό υπογράμμισε την γενετική ετερογένεια του καρκίνου του προστάτη μεταξύ των διαφορετικών εθνοτικών πληθυσμών. Σε αυτή τη μελέτη, τέσσερα μεταξύ των πέντε ελεγχθεί SNPs οι οποίες σχετίζονται σημαντικά με τον καρκίνο του προστάτη σε ιαπωνικά αντιγράφονται με επιτυχία σε πληθυσμό κινέζικα Χαν. Σε σύγκριση με την αναλογία αντιγραφή 12/31, η ραγδαία υψηλότερη αναλογία αναπαραγωγής 4/5 εγείρει την πιθανότητα παρόμοιων γενετικών παθολογίας του καρκίνου του προστάτη μεταξύ της Ιαπωνίας και της κινεζικής Χαν πληθυσμούς. Αυτό δεν είναι απροσδόκητο δοθεί η γενετική ομοιογένεια μεταξύ των κινεζικών και ιαπωνικών πληθυσμών [17].

Εν κατακλείδι, τα αποτελέσματά μας παρέχουν περαιτέρω ενδείξεις για σημαντική συσχέτιση των SNPs

rs13385191

,

rs12653946

,

rs1983891

, και

rs339331

με την ευαισθησία στον καρκίνο του προστάτη σε ασιατικούς πληθυσμούς της Ανατολικής. Τα σχετικά γονίδια,

C2orf43

,

FOXP4

,

GPRC6A

και

RFX6

, είναι εγγύηση για περαιτέρω προσπάθειες για να καθορίσουν τις λειτουργικές μεταβολές και τέλος να διευκρινίσει η γενετική μηχανισμός επιδεκτικότητας σε καρκίνο του προστάτη.