Αφηρημένο

Ιστορικό

Κίνδυνος μη Hodgkin λέμφωμα (NHL) είναι υψηλότερη μεταξύ των ατόμων με οικογενειακό ιστορικό ή προηγούμενη διάγνωση άλλων καρκίνων. μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) έχουν προτείνει ότι μερικές παραλλαγές γενετική προδιάθεση που σχετίζεται με πολλαπλές σύνθετων χαρακτηριστικών (πλειοτροπίας).

Στόχος

Ερευνήσαμε κατά πόσο κοινό κίνδυνο παραλλαγών που εντοπίζονται στον καρκίνο GWAS μπορούν επίσης να να αυξήσει τον κίνδυνο ανάπτυξης NHL ως το πρώτο πρωτοπαθή καρκίνο.

Μέθοδοι

ως μέρος της Αρχιτεκτονικής πληθυσμού που χρησιμοποιεί Γονιδιωματική και Επιδημιολογίας (PAGE) κοινοπραξία, 113 παραλλαγές κίνδυνο καρκίνου αναλύθηκαν σε 1.441 περιπτώσεις NHL και 24.183 έλεγχοι από τρεις μελέτες (BioVU, Πολυεθνική Cohort Study, Πρωτοβουλία για την Υγεία των Γυναικών) για την ένωσή τους με τον κίνδυνο της συνολικής NHL και κοινών υποτύπων [διάχυτο μεγάλο λέμφωμα Β-κυττάρων (DLBCL), οζώδες λέμφωμα (FL), χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία ή μικρό λεμφοκυτταρικό λέμφωμα (ΧΛΛ /SLL)] χρησιμοποιώντας ένα πρόσθετο γενετικό μοντέλο προσαρμοσμένο για την ηλικία, το φύλο και την εθνικότητα. Μελέτη-συγκεκριμένα αποτελέσματα για κάθε παραλλαγή ήταν μετα-αναλύθηκαν σε όλες τις μελέτες.

Αποτελέσματα

Η ανάλυση του NHL υποτύπου ειδικών GWAS SNPs και τη συνολική NHL πρότεινε μια κοινή γενετική προδιάθεση μεταξύ FL και DLBCL, ιδιαίτερα συμμετοχή παραλλαγές στο συγκρότημα περιοχή μείζονος ιστοσυμβατότητας (rs6457327 στο 6p21.33: FL OR = 1.29,

σ

= 0,013? DLBCL OR = 1.23,

σ

= 0,013? NHL OR = 1,22,

σ

= 5,9 × E-05). Στην ανάλυση πλειοτροπίας, έξι παραλλαγές του κινδύνου για άλλες μορφές καρκίνου συσχετίστηκαν με NHL κινδύνου, συμπεριλαμβανομένων των παραλλαγών για πνευμόνων (rs401681 στο

TERT

: Ή ανά αλληλόμορφο C = 0.89,

σ

= 3.7 × E -03? rs4975616 στο

TERT

: Ή ανά Ένα αλληλόμορφο = 0.90,

σ

= 0,01? rs3131379 στο

MSH5

: Ή ανά Τ αλληλόμορφου = 1.16,

p

= 0,03), προστάτη (rs7679673 στο

TET2

: Ή ανά αλληλόμορφο C = 0.89,

σ

= 5,7 × E-03? rs10993994 στο

MSMB

: Ή ανά Τ αλληλόμορφου = 1,09,

σ

= 0,04), και του μαστού (rs3817198 στο

LSP1

: Ή ανά C αλληλόμορφο = 1.12,

σ

= 0,01) καρκίνους , αλλά καμία από αυτές τις ενώσεις παρέμεινε σημαντική μετά από διόρθωση πολλαπλά τεστ

Συμπέρασμα

Αυτή η μελέτη δεν υποστηρίζει ισχυρή πλειοτροπικές επιδράσεις της μη-NHL παραλλαγές κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου στο NHL αιτιολογία.? Ωστόσο, οι μεγαλύτερες μελέτες δικαιολογείται

Παράθεση:. Lim U, Kocarnik JM, ο Μπους WS, Matise TC, Caberto C, Πάρκο SL, et al. (2014) πλειοτροπίας του Καρκίνου Ευαισθησίας Παραλλαγές για τον κίνδυνο μη-Hodgkin λεμφώματος: η κοινοπραξία PAGE. PLoS ONE 9 (3): e89791. doi: 10.1371 /journal.pone.0089791

Επιμέλεια: Ludmila Prokunina-Olsson, Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου, Εθνικό Ινστιτούτο Υγείας, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 20 Ιούλη 2013? Αποδεκτές: 27η Ιανουαρίου του 2014? Δημοσιεύθηκε: 5 Μαρτίου, 2014

Copyright: © 2014 Lim et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Ο πληθυσμός αρχιτεκτονική Χρησιμοποιώντας Γονιδιωματική και Επιδημιολογίας (PAGE) το πρόγραμμα χρηματοδοτείται από το Εθνικό Ανθρώπινου Γονιδιώματος Ίδρυμα Ερευνών (NHGRI), που υποστηρίζεται από U01HG004803 (τσίτι), U01HG004798 (EAGLE), U01HG004802 (MEC), U01HG004790 (WHI), και U01HG004801 (Συντονιστικό Κέντρο) , και τα αντίστοιχα συμπληρώματα NHGRI ARRA τους. Ο πλήρης κατάλογος των μελών η σελίδα μπορεί να βρεθεί στο https://www.pagestudy.org. Τα στοιχεία και τα υλικά που περιλαμβάνονται στην παρούσα έκθεση είναι αποτέλεσμα της συνεργασίας μεταξύ των ακόλουθων μελετών: Η «Επιδημιολογικές Αρχιτεκτονική για τα γονίδια συνδέονται με το περιβάλλον (EAGLE)» χρηματοδοτείται μέσω του προγράμματος NHGRI PAGE (U01HG004798-01 και NHGRI ARRA συμπλήρωμα του). υπηρεσίες γονοτυπική για επιλεγμένες SNPs NHANES III παρουσιάζονται εδώ δόθηκαν επίσης από το Πανεπιστήμιο Johns Hopkins βάσει του ομοσπονδιακού αριθμό σύμβασης (N01-HV-48195) από NHLBI. Οι συμμετέχοντες στη μελέτη προέρχονται από το Εθνικό Σύστημα Υγείας και Χωρομετρίας Διατροφή Εξέταση (NHANES), και αυτές οι μελέτες που υποστηρίζονται από τα Κέντρα Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων. Το σύνολο των δεδομένων που χρησιμοποιούνται για τις αναλύσεις που περιγράφονται ελήφθησαν από BioVU Vanderbilt University Medical Center, η οποία υποστηρίζεται από τη θεσμική χρηματοδότηση και από το Vanderbilt CTSA χορηγήσει UL1 TR000445 από NCATS /ΝΙΗ. Η μελέτη Πολυεθνική Cohort (MEC) χαρακτηρισμός των επιδημιολογικών αρχιτεκτονικής χρηματοδοτείται μέσω του προγράμματος NHGRI PAGE (U01HG004802 και NHGRI ARRA συμπλήρωμα του). Η μελέτη MEC χρηματοδοτείται από το Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου (R37CA54281, R01 CA63, P01CA33619, U01CA136792 και U01CA98758). Η χρηματοδότηση υποστήριξη για την «Επιδημιολογία των θεωρούμενων γενετικές παραλλαγές: Πρωτοβουλία για την Υγεία των Γυναικών» Η μελέτη παρέχεται μέσω του προγράμματος ΣΕΛΙΔΑ NHGRI (U01HG004790 και NHGRI ARRA συμπλήρωμα του). Το WHI πρόγραμμα χρηματοδοτείται από το Εθνικό Ινστιτούτο Καρδιάς, Πνευμόνων και Αίματος? ΝΙΗ? και αμερικανικό υπουργείο Υγείας και Ανθρωπίνων Υπηρεσιών μέσω συμβάσεων N01WH22110, 24152, 32100-2, 32105 με 6, 32108 με 9, 32111-13, 32115, 32118 – 32119, 32122, 42107 έως 26, 42129 – 32 και 44221. Α πλήρη λίστα των WHI ερευνητές μπορούν να βρεθούν στο: https://www.whiscience.org/publications/WHI_investigators_shortlist.pdf. Πρόσθετη υποστήριξη για το Δρ Kocarnik δόθηκε από R25CA94880 από NCI. Βοήθεια με την εναρμόνιση φαινότυπο, την επιλογή SNP και σχολιασμό, καθαρισμός δεδομένων, διαχείριση δεδομένων, την ένταξη και τη διάδοση, και τον γενικό συντονισμό της μελέτης που παρέχονται από τον PAGE Συντονιστικό Κέντρο (U01HG004801-01 και NHGRI ARRA συμπλήρωμα του). Το Εθνικό Ινστιτούτο Ψυχικής Υγείας συμβάλλει επίσης στην υποστήριξη για το Συντονιστικό Κέντρο. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, η συλλογή και ανάλυση δεδομένων, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

μη-Hodgkin λέμφωμα (NHL) είναι η έκτη πιο κοινή μορφή καρκίνου περιστατικό στις ΗΠΑ [1]. Παρά το γεγονός ότι η ανοσοκαταστολή, αυτοάνοσες διαταραχές και ορισμένων μολυσματικών παραγόντων έχουν αναγνωριστεί ως ισχυρό παράγοντες κινδύνου για NHL, κοινά χαρακτηριστικά ξενιστή είναι επίσης πιθανό να εμπλέκονται στην αιτιολογία του NHL [2]. Κίνδυνος NHL έχει αναφερθεί ότι είναι μεγαλύτερη μεταξύ των ατόμων με πρώτου βαθμού οικογενειακό ιστορικό των αιμοποιητικών καρκίνων [3]. NHL είναι επίσης ένα κοινό δεύτερο πρωτοπαθή καρκίνο μεταξύ των επιζώντων του ενήλικα λευχαιμία, καρκίνο του λάρυγγα /φαρυγγική, καρκίνωμα νεφρικών κυττάρων και μελάνωμα, υποδηλώνοντας κοινή γενετική ή /και το περιβάλλον αιτιολογία, αν και είναι δύσκολο να αποκλειστεί μια θεραπευτική επίδραση από την πρώτη του καρκίνου [4 ] – [6]. Στην αναζήτηση για τον κοινόχρηστο γενετική βάση της νόσου, μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) έχουν ανακαλύψει μια σειρά από παραλλαγές του κινδύνου που επιδεικνύουν οι ενώσεις με δύο ή περισσότερες σύνθετων χαρακτηριστικών (πλειοτροπίας) [7]. Μια συστηματική ανασκόπηση του Καταλόγου ΗΠΑ Εθνικό ανθρώπινο γονιδίωμα Ινστιτούτο Ερευνών (NHGRI) έκδοσης GWAS ανέφερε ότι 16,9% των γονιδίων και 4,6% των πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) στον κατάλογο έχουν δείξει τέτοια πλειοτροπικές ενώσεις [8], [9]. Η αναλογία των πλειοτροπικές παραλλαγών ήταν υψηλότερο από το αναμενόμενο από την τύχη και ήταν ιδιαίτερα υψηλή μεταξύ παραλλαγών κίνδυνο καρκίνου, καθώς επίσης και μεταξύ των παραλλαγών που σχετίζονται με αλλοιωμένη ανοσία και το μεταβολικό σύνδρομο. Έτσι, γενετικές παραλλαγές που εμπλέκονται στον καρκίνο που σχετίζονται με οδούς μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου του πολλαπλών τύπων [10], συμπεριλαμβανομένων NHL. Ένα καλό παράδειγμα είναι οι πολλαπλές ενώσεις ιστοσελίδα του καρκίνου που αναφέρθηκαν για τις παραλλαγές στο 8q24 [10], [11], μια περιοχή όπου κάποιοι λεμφικών κακοηθειών παρουσιάζουν επίσης μετατοπίσεις και μια κοινή ευαισθησία SNP [12] – [15].

στην παρούσα μελέτη, εξετάσαμε αν αποδεδειγμένα κίνδυνος παραλλαγών που εντοπίζονται σε δημοσιευμένες GWAS των 17 κοινών καρκίνων του παρόντος πλειοτροπική ενώσεις με τον κίνδυνο μη Hodgkin λεμφώματος και ιστολογικών υποτύπων του σε τρεις καλώς χαρακτηρισμένα μελέτες, ως μέρος της Αρχιτεκτονικής πληθυσμού που χρησιμοποιεί Γονιδιωματική και Επιδημιολογίας (PAGE) κοινοπραξία [16]. Εμείς διερευνηθεί επίσης κατά πόσον οι παραλλαγές που προσδιορίζονται για ειδικούς υποτύπους NHL συνδέονται επίσης με το συνολικό κίνδυνο NHL, και αν τυχόν τέτοιες ενώσεις διαφέρουν μεταξύ των εθνοτικών ομάδων.

Υλικά και Μέθοδοι

Μελέτη των πληθυσμών

Η κοινοπραξία ΣΕΛΙΔΑ ιδρύθηκε το 2008 από το αμερικανικό Εθνικό Ινστιτούτο Ανθρώπινου Γονιδιώματος Έρευνα για τη διερεύνηση καλά αναπαραχθεί γενετικές παραλλαγές για πολύπλοκες ασθένειες σε αρκετές μεγάλες, εθνοτική πολυμορφία μελέτες (https://www.pagestudy.org) [16]. Τρεις μελέτες ΣΕΛΙΔΑ συμμετείχαν σε αυτή την ανάλυση:. Biorepository του Πανεπιστημίου Vanderbilt (BioVU), η Cohort Study Πολυεθνική (MEC) και η Πρωτοβουλία για την Υγεία των Γυναικών (WHI)

BioVU είναι μια μελέτη στο Πανεπιστήμιο Vanderbilt Ιατρικό Κέντρο ότι οι συνδέσεις de-εντοπίστηκαν ηλεκτρονικά ιατρικά αρχεία (EMR) σε DNA βιοτράπεζα [17], [18]. Από ~130,000 συμμετέχοντες BioVU, πάνω από 6.098 περιπτώσεις καρκίνου εντοπίστηκαν 2.009 έως 2.011 μέσω σύνδεσης με το μητρώο του νοσοκομείου του όγκου ή την αναζήτηση των διαγνωστικών κωδικών στο EMR. Φυλή /εθνικότητα καταγράφηκε από το προσωπικό του νοσοκομείου στο EMR (λευκό, αφροαμερικάνων, Λατίνος ή ασιατική αμερικανική) και επιβεβαιώθηκε με τη χρήση κύριες συνιστώσες ανάλυση καταγωγή-πληροφοριακοί δείκτες (AIMS). Οι έλεγχοι περιελάμβαναν 9.152 ασθενείς BioVU χωρίς προηγούμενη ή επικρατούσα διαγνώσεις καρκίνου (εκτός από τον καρκίνο του δέρματος μη-μελάνωμα) και με παρόμοιο δηλωθέντα φυλή /εθνικότητα και την ηλικία σε κλινική επίσκεψη (εντός 5 ετών) και των περιπτώσεων καρκίνου. Το MEC είναι μια βασισμένη στον πληθυσμό τους υποψήφιους ομάδα πάνω από 215.000 άνδρες και γυναίκες στη Χαβάη και το Λος Άντζελες, ηλικίας 45-75 ετών κατά την πρόσληψη και κυρίως των πέντε καταγωγές (λευκό, αφροαμερικάνων, Latino, Ιαπωνικά αμερικανικά ή Native Χαβάης) [19] , [20]. Περιστατικό περιπτώσεις καρκίνου στο MEC εντοπίστηκαν από τη σύνδεση με τα μητρώα SEER όγκου Χαβάη και την Καλιφόρνια, από το 1993 μέχρι τον Οκτώβριο του 2010. Το WHI είναι μια προοπτική μελέτη κοόρτης διερεύνηση της υγείας μετεμμηνοπαυσιακών γυναικών στις ΗΠΑ [21]. Συνολικά 161.838 γυναίκες ηλικίας 50-79 και των διαφόρων φυλή /εθνοτικές ομάδες (λευκό, αφροαμερικάνων, Latino, της Ασίας /Ειρηνικού Islander ή Ινδιάνος) είχαν προσληφθεί από 40 κλινικά κέντρα σε όλες τις ΗΠΑ στο 1993-1998 για τρεις κλινικές δοκιμές και μια μελέτη παρατήρησης. Ιατρικό ιστορικό, συμπεριλαμβανομένων συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου, ενημερώνεται σε ετήσια βάση μέσω ταχυδρομείου ή /και τηλεφώνου ερωτηματολόγια και επιβεβαιώθηκε από ιατρικά αρχεία και παθολογικές αναφορές [22]. Η τρέχουσα WHI ανάλυση περιλαμβάνει NHL περιπτώσεις που εντοπίστηκαν μέχρι τον Αύγουστο του 2009. Όλες οι μελέτες εγκρίθηκαν από Institutional Review Boards στις αντίστοιχες περιοχές μελέτης τους: το Διοικητικό Συμβούλιο του Vanderbilt κριτική για BioVU, το Πρόγραμμα Ανθρώπινου Σπουδών στο Πανεπιστήμιο της Χαβάης και το Γραφείο για την Προστασία της Έρευνας θέματα στο Πανεπιστήμιο της Νότιας Καλιφόρνιας για την MEC, και το Διοικητικό συμβούλιο Institutional Review Έρευνας Καρκίνου Fred Hutchinson Κέντρο WHI. Όλοι οι συμμετέχοντες του MEC και WHI κατόπιν γραπτής συγκατάθεσης κατόπιν ενημέρωσης. Όλοι οι συμμετέχοντες BioVU υπέγραψε «συναίνεση στη θεραπεία», ενημερώνοντάς τους ότι ανώνυμων γενετικών πληροφοριών από απορριπτόμενο αίμα τους, μαζί με αποχαρακτηριστούν πληροφορίες EMR, θα χρησιμοποιηθούν για την έρευνα και τους δόθηκε η επιλογή να ελέγξετε ένα «opt-out «το πλαίσιο εάν μειώνεται να συμμετάσχουν [17].

Η επιλογή των υποθέσεων και έλεγχοι

Εμείς περιορίζεται ανάλυσή μας για τις περιπτώσεις NHL και τους ελέγχους χωρίς προηγούμενη καρκίνο (εκτός από τον καρκίνο του δέρματος μη-μελάνωμα), προκειμένου την αξιολόγηση της γενετικής πλειοτροπίας χωρίς τη δυνατότητα σύγχυσης με την προηγούμενη καρκίνους ή θεραπείες για τον κίνδυνο μη Hodgkin λεμφώματος. MEC καθορισμένες περιπτώσεις NHL με βάση την τρέχουσα κατάταξη της Παγκόσμιας Οργάνωσης Υγείας που θεωρείται χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία (ΧΛΛ) ως μια διαφορετική παρουσίαση της ίδιας της νόσου, όπως μικρό λεμφοκυτταρικό λέμφωμα (SLL) [23], [24]. BioVU και WHI ορίζεται NHL με βάση την ταξινόμηση SEER και δεν περιλαμβάνουν ΧΛΛ. πληροφορίες ιστολογία με βάση τη Διεθνή Ταξινόμηση των Νόσων-Ογκολογίας (ICD-O3) ήταν διαθέσιμα σε BioVU [25] και MEC [19] μέσω της σύνδεσης με τα μητρώα του όγκου και στην WHI [26] μέσω της συστηματικής μορφολογία κωδικοποίηση των ιατρικών πληροφοριών ρεκόρ για την ταξινόμηση από τις τρεις πιο κοινές υποτύπους NHL: διάχυτο από μεγάλα Β-κύτταρα λέμφωμα (DLBCL? 9678 – 9680, 9684, 9689, 9699), οζώδες λέμφωμα (FL? 9.690 με 9.691, 9695, 9698) και CLL (9823) /SLL (9670 ) [24]. DLBCL δεν διαπιστώθηκε σε BioVU οφείλεται σε μια ιεράρχηση των πιο κοινών καρκίνων σε αναλύσεις τους σελίδα. Για την τρέχουσα ανάλυση NHL, και οι τρεις μελέτες που περιλαμβάνονται ελέγχων που ταιριάζουν με τις περιπτώσεις των κοινών καρκίνων που ερευνώνται στην κοινοπραξία PAGE (μαστού, του παχέος εντέρου, των ωοθηκών και του προστάτη και μελάνωμα σε όλες τις μελέτες, και καρκίνων του ενδομητρίου και των πνευμόνων, και NHL σε MEC και WHI). Η αντιστοίχιση πραγματοποιήθηκε με τη χρήση ταιριάζουν συχνότητα με βάση την ηλικία κατά τη διάγνωση ή κλινική επίσκεψη (+/- 5 έτη), το φύλο και η φυλή /εθνικότητα σε BioVU? και ατομικές ταιριάζουν για κάθε περίπτωση με βάση την ηλικία κατά την είσοδο ομάδα (+/- 5 έτη), το φύλο και η φυλή /εθνικότητα στο MEC? και την ηλικία κατά την ένταξη (+/- 3 ετών), την ημερομηνία εγγραφής (+/- 365 ημέρες), φυλή /εθνικότητα, και τα χέρια τυχαιοποίηση (μελέτη παρατήρησης ή εκχώρηση κλινική δοκιμή σε θεραπεία ορμονικής υποκατάστασης, τροποποίηση της διατροφής, ή ασβεστίου /συμπλήρωμα βιταμίνης D ) στην WHI. WHI περιλαμβάνονται επίσης πρόσθετους ελέγχους επιλέγονται από άλλες γενετικές μελέτες με βάση τη διαθεσιμότητα των βιοδεικτών.

Biospecimen Συλλογή, SNP επιλογής, και Γονοτυπικές

BioVU εξήγαγε DNA από απορριπτόμενο δείγματα ολικού αίματος για τους ασθενείς που, ως μέρος ρουτίνας κλινικών δοκιμών [17]. Στο MEC, το DNA των περιπτώσεων NHL εξήχθη από την προ-διαγνωστικά δείγματα που περιλαμβάνονται στο υποψήφιους αποθετήριο αίμα της πάνω από 67.000 συμμετέχοντες ομάδα συναρμολογούνται κατά την περίοδο 2001-2006. δείγματα DNA για τους ελέγχους ήταν είτε από τον υποψήφιο αποθετήριο αίματος ή από μελέτες ασθενών-μαρτύρων του μαστού, του παχέος εντέρου και καρκίνοι του προστάτη [20], [27]. Η κατανομή των καθιερωμένων παραγόντων κινδύνου καρκίνου στην biospecimen υπο-ομάδα ήταν παρόμοια με αυτή σε ολόκληρη την ομάδα MEC. δείγματα DNA σε WHI εξήχθησαν από την προ-διαγνωστικής αίματος που συλλέγονται κατά τη στιγμή της εγγραφής.

επιλέχθηκαν συνολικά 113 SNPs και ο γονότυπος από μία ή περισσότερες από τις τρεις μελέτες ΣΕΛΙΔΑ βασίζεται σε σημαντικές συσχετίσεις γονιδιώματος επίπεδο (

σ

& lt? 5,0 × E-08) [28] στον καρκίνο GWAS λογοτεχνίας κατά τη στιγμή του σχεδιασμού της μελέτης (Μάρτιος 2010). Αυτά τα μη-NHL καρκίνος SNPs περιλαμβάνεται παραλλαγές του κινδύνου για την ουροδόχο κύστη, εγκέφαλο (γλοίωμα), του μαστού, του παχέος εντέρου, του οισοφάγου, του πνεύμονα, του ρινοφαρυγγικού, νευροβλάστωμα, των ωοθηκών, του παγκρέατος, οξεία λεμφοβλαστική λευχαιμία, προστάτη, του δέρματος (βασικοκυτταρικό καρκίνωμα, μελάνωμα), όρχεων φύτρο κυττάρων, και του θυρεοειδή. Το NHL SNPs, η οποία περιελάμβανε μια παραλλαγή του κινδύνου για οζώδες λέμφωμα (FL) [29], [30] και 8 παραλλαγές για τη χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία (ΧΛΛ) [15], [30], [31], θεωρήθηκαν μόνο σε ενώσεις με NHL και εξαιρέθηκαν από την ανάλυση πλειοτροπίας. Όλα τα δείγματα επιπλέον ο γονότυπος για τους προγόνους ενημερωτικό δείκτες (AIMS) περιγράφεται από Kosoy et al. [32] BioVU χρησιμοποιείται iPlex Gold Sequenom, σε συνδυασμό με MassARRAY MALDI-TOF MS ανίχνευση και BeadXpress Illumina με μια προσαρμοσμένη δοκιμασία προσδιορισμού του γονότυπου GoldenGate. MEC χρησιμοποιήθηκαν αναλύσεις του γονότυπου Applied Biosystems Taqman SNP στο OpenArray και τις 7900HT Real-Time PCR πλατφόρμες. WHI χρησιμοποιείται Illumina BeadXpress με τον προσδιορισμό του γονότυπου Veracode GoldenGate. Όλες οι τοποθεσίες που χρησιμοποιούνται τυφλά εις διπλούν ελέγχων. Δείγματα με χαμηλό συνολικό ποσοστό κλήσεων (& lt? 90% των SNPs) αποκλείστηκαν. SNPs είχαν αποκλεισθεί με βάση την απόκλιση από την εθνικότητα ειδικά Hardy-Weinberg ισορροπίας (p & lt? 0.01), τα χαμηλά ποσοστά κλήσης (& lt? 95%) ή χαμηλά ποσοστά συμφωνία – φάσμα των ελάχιστων κυμάνθηκε μεταξύ 96,5 και 99% στις μελέτες. Εκτός από τις ειδικές για το χώρο του ποιοτικού ελέγχου, όπως παραπάνω, όλες οι τοποθεσίες μελέτη ΣΕΛΙΔΑ γονότυπος τα ίδια 360 δείγματα DNA από το Διεθνές HapMap Έργου με εξαιρετικές τιμές συμφωνία με τα δημοσιευμένα στοιχεία γονότυπο [16]. Μετά από αυτές τις αυστηρές διαδικασίες ποιοτικού ελέγχου, 1.441 περιπτώσεις NHL (BioVU, n = 293? MEC, n = 372? WHI, n = 776) και 24.183 έλεγχοι (BioVU, n = 9002? MEC, n = 9091? WHI, n = 6.090 ) συμπεριλήφθηκαν στην παρούσα ανάλυση.

Στατιστική ανάλυση

Άνευ όρων ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιήθηκε σε κάθε μελέτη για να εκτιμηθεί η σύνδεση των παραλλαγών κινδύνου καρκίνου και NHL κινδύνου αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και 95 % διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ). Για κάθε παραλλαγή κίνδυνο καρκίνου, το αλληλόμορφο που αύξησε τον κίνδυνο καρκίνου στην αρχική έκθεση διαμορφώθηκε κατά το αλληλόμορφο χαμηλού κινδύνου. Έτσι, ΕΑΠ για NHL αναμένεται να είναι & gt? 1, εάν η ένωση ήταν στην ίδια κατεύθυνση με αυτή που βρέθηκε στη μελέτη του καρκίνου GWAS. Κάθε διαλληλικός SNP κωδικοποιήθηκε ως συνεχή μεταβλητή (0, 1 ή 2 για τον αριθμό των αλληλίων κινδύνου). Η άνευ όρων μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης προσαρμόστηκε για την ηλικία, το φύλο και τη φυλή /εθνικότητα. Υπολειπόμενη συγχυτική δράση από τη φυλή /εθνικότητα εξετάστηκε με επιπλέον προσαρμογή για τις κύριες συνιστώσες του γενετική καταγωγή (τρία κορυφαία στην BioVU και WHI και τέσσερις κορυφαίες στο MEC). τροποποίηση επίδραση από το φύλο εκτιμήθηκε με ένα τεστ Wald των όρων πολλαπλής προϊόν του φύλου και της συνεχούς μεταβλητής SNP στο BioVU και MEC (WHI περιλαμβάνει μόνο γυναίκες). Ανομοιογένεια σε όλη τη φυλή /εθνοτικές ομάδες δοκιμάστηκε παρομοίως χρησιμοποιώντας μια δοκιμασία Wald στο MEC, για τις περιπτώσεις των μη λευκών εθνοτικές ομάδες ήταν διαθέσιμα σε σημαντικούς αριθμούς. Επίσης, η ετερογένεια των ενώσεων SNP-καρκίνου σε όλη την κοινή υποτύπους NHL (DLBCL, FL, ΧΛΛ /SLL) εξετάστηκε στο MEC, όπου όλοι οι υπότυποι διαπιστώθηκαν, εκτελώντας polytomous λογιστικής παλινδρόμησης χρησιμοποιώντας κοινούς ελέγχους. Μια βαθμολόγηση κινδύνου υπολογίστηκε για να εξετάσει το συνδυασμένο αποτέλεσμα των 53 παραλλαγές του καρκίνου που ο γονότυπος και στις τρεις μελέτες, αθροίζοντας τον αριθμό των αλληλομόρφων κινδύνου (0, 1 ή 2 για κάθε SNP) σε άτομα σε όλη SNPs. Για άτομα με ελλείποντα γονότυπους για οποιαδήποτε από τις 53 παραλλαγές, που λείπουν γονότυπους υπολογίστηκαν χρησιμοποιώντας τις συχνότητες αλληλομόρφων μεταξύ των ελέγχων του ίδιου εθνικότητα σε κάθε μελέτη. Η βαθμολόγηση κινδύνου εξετάστηκε τόσο ως συνεχής και κατηγορική μεταβλητή (χρησιμοποιώντας τεταρτημόριο σημεία κοπής με βάση την κατανομή μεταξύ των ελέγχων). Για να συνοψίσουμε τα αποτελέσματα από τις τρεις μελέτες, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για κάθε παραλλαγή και για το σκορ μεταβλητή κινδύνου σταθερού αποτελέσματα μοντέλων που χρησιμοποιούν μέταλλα [33]. Ετερογένεια μεταξύ των μελετών αξιολογήθηκε με τη χρήση Q στατιστική Cochran του. Οι αναλύσεις έγιναν αρχικά με σημασία θεωρούνται σε

σ

& lt? 0,05 (δύο όψεων). Για τον έλεγχο για την εν δυνάμει φουσκωμένα σφάλμα τύπου 1 λόγω των πολλαπλών συγκρίσεων, χρησιμοποιήθηκε η διόρθωση Bonferroni (

σ

= 0,05 /113 = 4.42E-04) για να καθοριστεί το στατιστικό όριο σημασία για τα αποτελέσματα.

Αποτελέσματα

τα χαρακτηριστικά των περιπτώσεων NHL και τους ελέγχους σε BioVU, MEC και WHI μελέτες παρουσιάζονται στον πίνακα 1. η μέση ηλικία των περιπτώσεων NHL και των ελέγχων ήταν η υψηλότερη στο MEC, που ακολουθείται από WHI και BioVU, και οι δύο BioVU και MEC είχε μια ελαφρώς υψηλότερη εκπροσώπηση των ανδρών πάνω στις γυναίκες. Περιπτώσεις στις BioVU και WHI ήταν κυρίως λευκοί, ενώ MEC είχε πιο ομοιόμορφη κατανομή των τεσσάρων εθνοτικών ομάδων.

Η

Ερευνήσαμε πρώτους εννέα προηγουμένως δημοσιευθεί παραλλαγές κινδύνου GWAS για συγκεκριμένους υποτύπους NHL (ένα για FL και 8 για CLL ) για μια ένωση με συνολικό κίνδυνο NHL για να ελέγξετε για μια κοινή γενετική προδιάθεση. Η ένωση που αναφέρθηκαν για FL με rs6457327, σε 6p21.33, το μείζον σύμπλεγμα ιστοσυμβατότητας περιοχή (MHC), αναπαράγονται στα δεδομένα μας για FL [περιληπτική ή ανά αλληλόμορφο C

vs.

Α = 1,29 (1,05 – 1,57) ,

σ

= 0,013? Το σχήμα 1 (α), ο Πίνακας S1 σε File S1] και παρατηρήθηκε επίσης για DLBCL [OR = 1,23 (1,04 – 1,44),

σ

= 0.013] και τη συνολική NHL [OR = 1,22 (1,11 – 1,34) ,

σ

= 5.92E-05? Σχήμα 1 (β)], αλλά όχι για CLL /SLL [OR = 1,05 (0,81 – 1,36),

σ

= 0.73]. Όταν η μετα-ανάλυση στη συνολική NHL περιοριζόταν σε MEC και WHI, θεωρώντας ότι BioVU δεν περιλαμβάνουν DLBCL, τη σύνδεση με τη δημοσιευμένη παραλλαγή κίνδυνο FL παρέμεινε η ίδια [OR = 1,22 (1,11 – 1,33),

p

= 5.92E-05]. Στο MEC, όπου εξετάστηκαν όλες οι κύριες υποκατηγορίες, συμπεριλαμβανομένων των CLL, η OR για τη σύνδεση των αλληλόμορφο C του rs6457327 με FL δεν διέφερε από την αντίστοιχη ή για DLBCL (

p-het.

Από polytomous παλινδρόμησης = 0,61), CLL /SLL (

p-het

. = 0,23) ή άλλων υποτύπων (

p-het

. = 0,73). Κάναμε παρατηρούμε ετερογένεια στην ένωση για την παραλλαγή FL κινδύνου (rs6457327) και τη συνολική NHL σε χώρους μελέτης (Cochran Q = 6,58?.

p-Het

= 0,01), η οποία καταργούνται όταν η ανάλυση περιορίστηκε σε λευκά μόνο [σχήμα 1 (c)? Ή για αλληλόμορφο C του rs6457327 = 1,30 (1,16 – 1,47),

σ

= 8.83E-06? Cochran Q = 0.05,

p-het

. = 0.82], αν και η αλληλεπίδραση μεταξύ της παραλλαγής και η φυλή /εθνικότητα δεν ήταν σημαντική στο MEC (

p-int

. = 0,10). Μεταξύ των οκτώ παραλλαγές κινδύνου GWAS για CLL, μια παραλλαγή αναπαραχθούν στα δεδομένα μας για CLL /SLL [ή ανά αλληλόμορφο G της rs17483466 στο

ACOXL /BCL2L11

= 1.57 (01.17 – 02.11),

p

= 0.0027] και παρέμεινε σημαντική μετά από διόρθωση Bonferroni (

σ

& lt? 0.0063? πίνακα S1 στο S1 αρχείου). Καμία από τις παραλλαγές CLL συσχετίστηκαν με συνολικό κίνδυνο NHL (

σ

& gt? 0,05? Δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Για παράδειγμα, στο MEC, η ένωση των rs17483466 με ΧΛΛ /SLL διέφερε σημαντικά από εκείνη με FL (

p-het

. Από polytomous παλινδρόμηση = 0,03), DLBCL (

p-het

. = 0.02) και άλλοι (

p-het

. = 0.01).

(α) οζώδες λέμφωμα, (β) τη συνολική NHL, και (γ) τη συνολική NHL μεταξύ των λευκών μόνο. ​​

από τις 113 παραλλαγές κινδύνου GWAS για καρκίνους, εκτός από NHL που εξετάστηκαν στο PAGE, 53 SNPs ήταν ο γονότυπος και στις τρεις μελέτες, και οι άλλες 60 παραλλαγές δακτυλογραφημένα σε ένα ή δύο μελέτες (Πίνακας S2 σε S1 αρχείο). Έξι από τους 53 SNPs έδειξε ονομαστική ενώσεις με τον κίνδυνο της συνολικής NHL, συμπεριλαμβανομένων τριών κίνδυνο παραλλαγών που είχε αρχικά προσδιοριστεί για τον καρκίνο του πνεύμονα, δύο παραλλαγές κινδύνων που έχουν εντοπιστεί για τον καρκίνο του προστάτη και παραλλαγή ενός κινδύνου για καρκίνο του μαστού (Πίνακας 2). Καμία από αυτές τις ενώσεις παρέμεινε σημαντική μετά από πολλαπλές διόρθωσης δοκιμής (δηλαδή,

σ

& gt? 4.4E-04 για 113 SNPs). Δύο παραλλαγές του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα στο

TERT

περιοχή (rs401681, ή ανά αλληλόμορφο C = 0,89 (0,82 – 0,96),

σ

= 0,0037? Rs4975616, ή ανά αλληλόμορφο Α = 0,90 (0,83 -0,97),

σ

= 0,010), καθώς και η παραλλαγή του κινδύνου καρκίνου του προστάτη (rs7679673 στο

TET2

? Ή ανά αλληλόμορφο C = 0,89 (0,82-0,97),

p

= 0.0057), συσχετίστηκαν με μειωμένο κίνδυνο της συνολικής NHL. Οι δύο

TERT

παραλλαγές ήταν σε ανισορροπία σύνδεσης (LD) μεταξύ των λευκών (R

2 = 0,84) και ιθαγενείς της Χαβάης (R

2 = 0,79), αλλά σε μικρότερο βαθμό σε άλλες εθνοτικές ομάδες (R

2 = 0,53 για Αφροαμερικανοί? 0,47 για Λατίνοι, 0,30 για τους Ιάπωνες Αμερικανοί). Η παραλλαγή της ευαισθησίας του καρκίνου του μαστού rs3817198 στο

LSP1

[ή ανά αλληλόμορφο C = 1,12 (01.03 – 01.22),

σ

= 0.011], οι rs3131379 καρκίνο του πνεύμονα SNP στην περιοχή του MHC στο χρωμόσωμα 6 (6p21.33) [ή ανά αλληλόμορφο Τ = 1,16 (1,01 – 1,33),

σ

= 0.030] και η παραλλαγή του καρκίνου του προστάτη rs10993994 στο

MSMB

[ή ανά αλληλόμορφο Τ = 1.09 ( 01/01 – 01/18),

σ

= 0.036] το κάθε ένα σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο συνολικής NHL. Οι ενώσεις για τις έξι παραλλαγές παραπάνω δεν διέφερε σημαντικά μεταξύ των περιοχών μελέτης, με εξαίρεση rs401681 (

TERT

), η οποία έδειξε μια ισχυρότερη αντίστροφη συσχέτιση με BioVU και MEC από ό, τι στην WHI (Cochran Q = 6.26,

ρ-het

= 0,04?. Πίνακας 2). Αυτά τα 6 παραλλαγές έδειξαν τα ίδια ή παρόμοια περίληψη ΕΑΠ, όταν η ανάλυση περιορίστηκε σε MEC και WHI, όπου η ολική NHL περιλαμβάνονται DLBCL, με 4 παραλλαγές που δείχνουν ονομαστική σημασία (μη προσαρμοσμένες

σ

& lt? 0,05? Δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Από τις άλλες 60 παραλλαγές γονότυπος μόνο σε δύο μελέτες ή μιας ενιαίας μελέτης, 7 SNPs έδειξε μέτρια ενώσεις (μη προσαρμοσμένες

σ

& lt? 0,05? Δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Ειδικότερα, ένα οισοφάγου παραλλαγή του καρκίνου (rs1229984 στο

ADH1B

) διατίθεται σε MEC και WHI έδειξε μια αντίστροφη συσχέτιση με NHL κίνδυνο [ή ανά αλληλόμορφο C = 0,77 (0,66 – 0,90),

p

= 4.4E-04].

Η

Η ανάλυση πλειοτροπίας για συγκεκριμένους υποτύπους NHL διεξήχθη σε όλα τα καρκίνο μη-NHL GWAS SNPs (n = 113) (Πίνακας S3 στο S1 αρχείου). Κανένα από τα υποτύπου-συγκεκριμένες ενώσεις ήταν σημαντική μετά από διόρθωση Bonferroni (δηλαδή,

σ

& gt? 0,05 /113 = 4.4E-04 για 113 δοκιμές σε κάθε υπότυπο). Η πιο σημαντική συσχέτιση για οζώδες λέμφωμα ήταν με μια παραλλαγή του κινδύνου του καρκίνου του μαστού [rs11249433 στο

EMBP1

: συνοπτική ή ανά αλληλόμορφο C = 1,29 (1,08 – 1,54),

σ

= 0.0095]. Για CLL /SLL, η πιο σημαντική σχέση ήταν με μια παραλλαγή του κινδύνου καρκίνου του προστάτη [rs2735839 στο

KLK3-KLK2

: Ή ανά αλληλόμορφο G = 1.51 (01.10 – 02.07),

σ

= 0.0099 ]. Οι ενώσεις της συνολικής NHL που περιγράφεται παραπάνω (Πίνακας 2) με τις παραλλαγές του κινδύνου για καρκίνο του πνεύμονα (rs3131379 στο

MSH5

) και του καρκίνου του προστάτη (rs7679673 στο

TET2

) φαίνεται να οφείλεται σε ενώσεις τους με τον κίνδυνο της DLBCL υποτύπου [ή ανά αλληλόμορφο Τ στο rs3131379 = 1.41 (1.10-1.80),

σ

= 0,0061? Ή ανά αλληλόμορφο C σε rs7679673 = 0,83 (0,71 – 0,98),

σ

= 0.030].

Η βαθμολογία επικινδυνότητας με βάση την 53 μη-NHL καρκίνο SNPs δεν ήταν σχετίζεται σημαντικά με τον κίνδυνο της συνολικής NHL ή υποτύπους, είτε ως συνεχής μεταβλητή (Πίνακας 3) ή χωρισμένα σε τεταρτημόρια (

σ

& gt? 0,05? δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Δεν υπήρχε σημαντική ετερογένεια σε οποιαδήποτε από τις ενώσεις για μεμονωμένες SNPs ή τη βαθμολόγηση κινδύνου από το σεξ, ή από την εθνική ομάδα (

σ

& gt? 0,05? δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Η

συζήτηση

αύξηση στοιχεία υποστηρίζουν την πλειοτροπική συμμετοχή του κοινού παραλλαγές γενετικού κινδύνου σε πολλές ασθένειες ή σύνθετα χαρακτηριστικά. Έτσι, εξετάσαμε ένα σημαντικό αριθμό παραλλαγών κινδύνου που προσδιορίζονται στο GWAS κοινών καρκίνων σε σχέση με τη συνολική και υποτύπου-ειδικό κίνδυνο του NHL. Η ανάλυσή μας επεκτάθηκε με τη σύνδεση της παραλλαγής κίνδυνο FL για τη συνολική NHL και του υποτύπου DLBCL Συγκεκριμένα, όπως αναφέρεται σε προηγούμενες μελέτες για κοινή αιτιολογία [34] – [36]. Οι παραλλαγές κινδύνου ΧΛΛ δεν επεκταθεί και σε άλλες υποκατηγορίες ή NHL συνολικά, αναφέροντας την υποτύπου-εξειδίκευση των παραλλαγών ΧΛΛ. Για τους μη-NHL παραλλαγές του καρκίνου, βρήκαμε καμία πειστική απόδειξη πλειοτροπίας, μόνο με αδύναμες τις προτάσεις που του ειδικού κινδύνου παραλλαγές για πνεύμονα, του προστάτη και του καρκίνου του μαστού μπορεί επίσης να συνδέεται με τον κίνδυνο ανάπτυξης πρώτο πρωτεύον περιστατικό NHL μεταξύ εκείνων χωρίς ιστορικό των άλλων καρκίνους ή πριν θεραπείες για τον καρκίνο.

τα αποτελέσματα των τριών από τις έξι μη-NHL GWAS των παραλλαγών ονομαστικά συνδέονται με NHL (rs401681, rs7679673, rs4975616) ήταν στην αντίθετη κατεύθυνση σε σχέση με τις αρχικές εκθέσεις. Αυτές οι παραλλαγές έδειξαν συσχέτιση με αυξημένο κίνδυνο του πνεύμονα και του προστάτη στα αρχικά εκθέσεις, αλλά χαμηλότερο κίνδυνο NHL στη μελέτη μας. Αυτό μπορεί να είναι ένα τυχαίο εύρημα, δεδομένου ότι καμία από τις ενώσεις παρέμεινε σημαντική μετά από διόρθωση για πολλαπλές δοκιμές, αν και έχουν τέτοια αποτελέσματα σε αντίθετες κατευθύνσεις για διαφορετικούς τύπους καρκίνου έχει αποδειχθεί στο παρελθόν στο

TERT

περιοχή και rs401681 SNP ιδίως [ ,,,0],37]. Μια παραλλαγή του καρκίνου του προστάτη (rs7679673 στο

TET2

) ήταν ειδικά σχετίζεται με χαμηλότερο κίνδυνο DLBCL.

Ένα από τα άλλα τρία ονομαστικά θετικές συσχετίσεις για τη συνολική NHL βρέθηκε με ένα SNP καρκίνο του μαστού σε η περιοχή κωδικοποίησης για ένα λεμφοκύτταρο-ειδική πρωτεΐνη (rs3817198 σε

LSP1

). Αυτό το γονίδιο κωδικοποιεί μία ενδοκυτταρική F-ακτίνης δεσμευτική πρωτεΐνη η οποία εκφράζεται σε ενδοθήλιο και διάφορα αιμοποιητικά κύτταρα (λεμφοκύτταρα, ουδετερόφιλα, μακροφάγα) [38]. Ως εκ τούτου, αυτή η πρωτεΐνη μπορεί να εμπλέκεται στην lymphomagenesis μέσω της ρύθμισης των λεμφοκυττάρων κινητικότητα και μετανάστευση, όπως αποδεικνύεται από μια ένωση μιας άλλης παραλλαγής σε

LSP1

(rs2089910) με NHL σε μια μελέτη μιας ανοσολογικής και φλεγμονή πάνελ SNP [39].

μια άλλη μη σημαντική θετική συσχέτιση για NHL, ειδικά με DLBCL, ήταν με μια παραλλαγή ευαισθησίας στον καρκίνο του πνεύμονα, rs3131379, στο

MSH5

ή

mutS ομόλογο 5

, ένα γονίδιο που εμπλέκεται στην οδό του DNA επιδιόρθωσης αταίριαστων βάσεων [40]. Αυτή η παραλλαγή είναι επίσης βρίσκεται κοντά στο μείζον σύμπλεγμα ιστοσυμβατότητας (MHC ή ανθρώπινο αντιγόνο λευκοκυττάρων, HLA) περιοχή στο χρωμόσωμα 6 (6p21.33), όπως είναι η παραλλαγή GWAS για FL (rs6457327), και έχει συσχετιστεί με τον κίνδυνο συστημικό λύκο ερυθηματώδης σε GWAS [41]. Τα ευρήματά μας στο

MSH5

και

MHC

παραλλαγές δείχνουν πιθανή συμμετοχή των παραλλαγών μέσα ή κοντά σε αυτό το εξαιρετικά διατηρημένη ανοσοποιητικό-ρυθμιστική περιοχή στην αιτιολογία του NHL (συμπεριλαμβανομένων των FL και DLBCL), εκτός από την εκείνη του καρκίνου του πνεύμονα.

Αυτή η μελέτη ένθετα σε τρεις μεγάλες μελέτες με καλά χαρακτηρισμένων φαινοτύπων και παθολογία-επιβεβαιώθηκε ιστολογικά πληροφοριών για την ταξινόμηση στον υπότυπο. Ωστόσο, παρά το σημαντικό αριθμό των περιπτώσεων NHL περιλαμβάνονται, είχαμε περιορισμένη ισχύ, εν μέρει, πιθανότατα λόγω της ανομοιογένειας του NHL. Επίσης, μόνο ένα υποσύνολο του συνόλου των παραλλαγών καρκίνου γονότυπος και στις τρεις μελέτες PAGE για την ανάλυση NHL. Οι αναλύσεις μας δεν παρέχουν σαφείς ενδείξεις ότι αυτές οι κοινές καρκίνο γενετική προδιάθεση τόποι μπορεί να διαδραματίσει έναν ρόλο στις αιτιολογίες του NHL. Μια πιο συστηματική προσέγγιση σε μεγαλύτερες συγκεντρωτικές αναλύσεις των συγκεκριμένων υποτύπων, με τα μεγαλύτερα πάνελ SNP, είναι δικαιολογημένη σε μελλοντική έρευνα.

Υποστήριξη Πληροφορίες

αρχεία S1.

Βάθρα. Πίνακας S1. Σύνδεσης μεταξύ ιδρύθηκε παραλλαγές κινδύνου GWAS για οζώδες λέμφωμα (FL) και για τη χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία (ΧΛΛ) με τον κίνδυνο αυτών των υποτύπων του μη-Hodgkin λέμφωμα (NHL). Πίνακας S2. Λίστα των 113 κίνδυνο καρκίνου GWAS με βάση τις εναλλακτικές προσφορές που εξετάζονται για πλειοτροπίας στο NHL στον ΣΕΛΙΔΑ? οι 53 SNPs που αναφέρονται ως ο γονότυπος και στις τρεις μελέτες συμπεριλήφθηκαν στην ανάλυση βαθμολογίας κινδύνου. Πίνακας S3. Πλειοτροπική σύνδεση των επιλεγμένων ευαισθησίας καρκίνο παραλλαγές με τον κίνδυνο των κοινών υποτύπων μη-Hodgkin λέμφωμα (NHL)

doi:. 10.1371 /journal.pone.0089791.s001

(DOC)

Ευχαριστίες

Οι συγγραφείς ευχαριστήσω τους WHI ερευνητές και προσωπικό για την αφοσίωσή τους, καθώς και τους συμμετέχοντες της μελέτης για την κατασκευή δυνατόν το πρόγραμμα. Στη σελίδα κοινοπραξία ευχαριστεί το προσωπικό και τους συμμετέχοντες όλων των μελετών PAGE για τη σημαντική συμβολή τους. Οι συγγραφείς, επίσης, αναγνωρίζουν με ευγνωμοσύνη τη συμβολή της Julia Higashio και Rasheeda Williams στην αρχική σελίδα του Συντονιστικού Κέντρου και του Δρ Kylee Spencer στο Πανεπιστήμιο της Χαϊδελβέργης. Αποποίηση ευθυνών: Τα περιεχόμενα του παρόντος εγγράφου είναι αποκλειστική ευθύνη των συγγραφέων και δεν αντιπροσωπεύουν απαραίτητα τις επίσημες απόψεις του ΝΙΗ. Τα ευρήματα και τα συμπεράσματα σε αυτή την έκθεση είναι αυτές των συγγραφέων και δεν αντιπροσωπεύουν απαραίτητα τις απόψεις των Κέντρων Ελέγχου και Πρόληψης Νοσημάτων.