Αφηρημένο

Σκοπός

Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να χτίσει ένα μοριακό προγνωστικό μοντέλο που βασίζεται σε γονίδιο υπογραφές για ασθενείς με πλήρη εκτομή ηπατικών μεταστάσεων από καρκίνο του παχέος εντέρου (mCRC).

Μέθοδοι

Χρησιμοποιώντας το γονίδιο τσιπ Illumina HumanHT-12, αναλύθηκαν RNA δείγματα από τις ηπατικές μεταστάσεις των 96 ασθενών που υποβλήθηκαν σε R0 εκτομή ήπατος. Οι ασθενείς τυχαιοποιήθηκαν σε εκπαίδευση (n = 60) και τη δοκιμή (n = 36) σετ. Τα γονίδια που σχετίζονται με συγκεκριμένες ασθένειες επιβίωση (DSS) και το ήπαρ-ελεύθερη υποτροπής επιβίωση (LRFS) εντοπίστηκαν από Cox-παλινδρόμησης και επέλεξε να κατασκευάσει ένα σκορ μοριακή κινδύνου (MRS) χρησιμοποιώντας τη μέθοδο εποπτευόμενη αρχή συστατικό στο σύνολο εκπαίδευσης. Η MRS στη συνέχεια αξιολογήθηκε στην ανεξάρτητη σειρά δοκιμών.

Αποτελέσματα

Δεκαεννέα και επιλέχθηκαν 115 γονίδια για την κατασκευή του MRS για DSS και LRFS, αντίστοιχα. Κάθε MRS επικυρώθηκε στο σύνολο τεστ? 3-ετή επιτόκια DSS /LRFS ήταν 42/32% και 79/80% για τους ασθενείς με υψηλή και χαμηλή MRS, αντίστοιχα (

σ

= 0,007 για το DSS και p = 0,046 για LRFS). Σε ένα πολυπαραγοντικό μοντέλο που ελέγχει για μια προηγουμένως επικυρωθεί βαθμολογία κλινικού κινδύνου (CRS), η MRS παρέμεινε ένα σημαντικό προγνωστικό παράγοντα του DSS (

σ

= 0.001) και LRFS (

σ

= 0,03). Όταν συνδυάστηκαν CRS και MRS, οι ασθενείς υφίστανται καλύτερα με 3-ετή επιτόκια DSS /LRFS 90/89% στην ομάδα χαμηλού κινδύνου (και οι δύο βαθμολογίες κίνδυνο χαμηλή) vs 42/26% στην ομάδα υψηλού κινδύνου (και οι δύο βαθμολογίες των κινδύνων υψηλή), αντίστοιχα (

σ

= 0,002 /0,004 για DSS /LRFS).

Συμπέρασμα

MRS βασίζεται σε προφίλ γονιδιακής έκφρασης έχει υψηλή προγνωστική αξία και είναι ανεξάρτητη από CRS . Το εύρημα αυτό παρέχει μια πιθανή στρατηγική για την καλύτερη κινδύνου διαστρωμάτωση των ασθενών με ηπατική MCRC

Παράθεση:. Ito Η, Μο Q, Τσιν L-X, Viale Α, Maithel SK, τσάι AV, et al. (2013) Gene προφίλ έκφρασης προβλέψει με ακρίβεια Αποτελέσματα Μετά την εκτομή ήπατος σε ασθενείς με μεταστατικό καρκίνο του παχέος εντέρου. PLoS ONE 8 (12): e81680. doi: 10.1371 /journal.pone.0081680

Επιμέλεια: Noriko Gotoh, Ινστιτούτο Ιατρικών Επιστημών, Πανεπιστήμιο του Τόκιο, Ιαπωνία

Ελήφθη: 11, Ιούλ, 2013? Αποδεκτές: 15 του Οκτώβρη του 2013? Δημοσιεύθηκε: 10 Δεκεμβρίου, 2013

Copyright: © 2013 Ito et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Κατά τη διάρκεια των δύο τελευταίων δεκαετιών, η διαχείριση των μεταστατικών καρκίνου του παχέος εντέρου (mCRC) περιορίζεται στο συκώτι έχει αλλάξει δραματικά. Βελτιώσεις στη συστηματική και περιφερειακές χημειοθεραπεία, καθώς και η χειρουργική τεχνολογία επέτρεψε μια αύξηση του αριθμού των ασθενών να είναι υποψήφιοι για εκτομή με θεραπευτική πρόθεση. [1] εκτομή ήπατος έχει γίνει αποδεκτή ως η πιο αποτελεσματική θεραπεία για χειρουργήσιμη MCRC απομονωθεί στο ήπαρ με τεκμηριωμένη ποσοστά επιβίωσης 5 ετών έως και 58% για καλά επιλεγμένους ασθενείς. [2] – [4] Ωστόσο, ακόμη και με πλήρη εκτομή, η πλειονότητα των ασθενών αναπτύσσουν υποτροπή, συνήθως εντός του ήπατος υπόλοιπο, και ένα υψηλό ποσοστό της ομάδας αυτής πεθαίνει μέσα σε 2-3 έτη. [5], [6] Ως εκ τούτου, ακριβή διαστρωμάτωση κινδύνου είναι απαραίτητη για τη βελτιστοποίηση ατομική λήψη αποφάσεων στην επιλογή της χειρουργικής επέμβασης, και τη χρήση βοηθητικού θεραπειών.

Πολλαπλές προγνωστικά συστήματα βαθμολόγησης έχουν προταθεί χρησιμοποιώντας κλινικά κριτήρια για τη διαστρωμάτωση του κινδύνου υποτροπής και του καρκίνου που σχετίζονται με το θάνατο μετά από εκτομή ήπατος σε ασθενείς με mCRC. [3], [7] – [10] Ωστόσο, τα περισσότερα συστήματα βασίζονται σε ενιαίο θεσμικό χαρακτήρα και ως εκ τούτου, γεμάτη με προκατάληψη που σχετίζονται με τις τοπικές συνήθειες παραπομπής, η επιλογή των ασθενών και θεραπευτικές προσεγγίσεις. Πράγματι, τα συστήματα βαθμολόγησης των κλινικών κίνδυνος δεν έχουν προβλεφθεί σταθερά αποτελέσματα όταν δοκιμάζεται σε όλη ιδρυμάτων [3], και γενικά δεν προβλέψει το αποτέλεσμα αρκετά καλά για να πραγματοποιήσει την κλινική πρακτική.

Γονιδιακή τεχνολογία μικροσυστοιχιών επιτρέπει ολοκληρωμένη ανάλυση των προφίλ γονιδιακής έκφρασης των όγκων , και τέτοια «υπογραφές γονίδιο» έχουν τη δυνατότητα να είναι πιο ακριβείς και συνεπείς βιολογικών δεικτών για την πρόβλεψη των αποτελεσμάτων. Μελέτες έχουν δείξει ότι οι ειδικές υπογραφές γονίδιο μπορεί να είναι ισχυρό δείκτες για την πρόβλεψη μακροπρόθεσμα αποτελέσματα μετά την θεραπεία για διάφορες καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του μαστού [11] – [13], του πνεύμονα [14], [15], του παχέος εντέρου [12], [16], [17] και του ήπατος. [18] Μέχρι σήμερα, δεν υπάρχουν διαθέσιμα στοιχεία σχετικά με τα προφίλ γονιδιακής έκφρασης σε ασθενείς με εκτομή MCRC στο ήπαρ.

Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να αξιολογηθεί προφίλ γονιδιακής έκφρασης σε εκτομή MCRC απομονωθεί στο ήπαρ προκειμένου να αναπτύξει μια πιο ισχυρή και ακριβή προγνωστικό βιοδείκτη που αντανακλά τη βιολογία του όγκου να προβλέψει μακροπρόθεσμα αποτελέσματα.

Μέθοδοι

δείγματα ασθενών και Εκχύλιση RNA

Αυτή η μελέτη εγκρίθηκε από το Memorial Sloan-Kettering, (MSKCC) Institutional Review Board (IRB). Όλοι οι ασθενείς που παρέχονται γραπτές συγκαταθέσεις για την προμήθεια ιστών και χρήση τους για ερευνητικούς σκοπούς. Φρέσκο-κατεψυγμένα δείγματα όγκου των MCRC σε εκτομή δείγματα ήπατος λήφθηκαν από το νομαρχιακό τράπεζα ιστών μας σε ένα ξεχωριστό IRB εγκεκριμένο πρωτόκολλο συγκομιδής ιστού. Όλα τα αρχειοθετημένα μεταστατικούς όγκους στην τράπεζα ιστών συλλέχθηκαν κατά το χρόνο της χειρουργικής επέμβασης από ασθενείς οι οποίοι υποβλήθηκαν σε εκτομή ήπατος στο ίδρυμά μας. Η κλινική πληροφορίες για τις αντίστοιχες ασθενείς συμπεριλαμβανομένων των δημογραφικών στοιχείων, παθολογικά ευρήματα και το στάδιο, περιεγχειρητική θεραπεία και τα δεδομένα παρακολούθησης λήφθηκε από μια μελλοντικά διατηρείται ηπατική βάση δεδομένων εκτομή και συμπληρώνεται από την ιατρική εξέταση ρεκόρ.

προσέγγιση των συγγραφέων με ηπατική εκτομή για μεταστατικό ορθοκολικό καρκίνο έχει περιγραφεί προηγουμένως. [2], [6], [8] Σε γενικές γραμμές, οι ασθενείς υποβλήθηκαν σε λειτουργία όταν ένα θεραπευτικό όφελος θεωρήθηκε πιθανή και θεραπεία όλων των ασθενειών ήταν τεχνικά εφικτό. Η προεγχειρητική απεικόνιση περιλαμβάνεται αυξημένης αντίθεσης υπολογιστικής τομογραφίας του θώρακα, την κοιλιακή χώρα και την πύελο με επιπλέον απεικόνιση πραγματοποιείται κατά την κρίση του θεράποντος ιατρού. Κολονοσκόπηση πραγματοποιήθηκε εντός 1 έτους από εκτομή ήπατος. Οι αποφάσεις σχετικά με τη χρήση της ηπατικής αρτηριακής έγχυσης (ΕΑΒ), ανοσοενισχυτικό και /ή νεο-επικουρική συστηματική χημειοθεραπεία έγιναν σε ατομική βάση, σε συνδυασμό με διαβούλευση ογκολόγων. [19] Οι ασθενείς παρακολουθήθηκαν με περιοδικές κλινικές αξιολογήσεις, τα επίπεδα CEA στον ορό και αξονική τομογραφία του θώρακα /κοιλιάς /λεκάνης.

Η μονάδα μας έχει ήδη δημοσιεύσει μια βαθμολογία κλινικού κινδύνου (CRS) με τη χρήση προεγχειρητικής μεταβλητές σε μια προσπάθεια να διαστρωμάτωση ασθενείς από την άποψη της επιβίωσης μετά από ηπατική εκτομή για MCRC. [8] Οι παράγοντες που περιλαμβάνουν το CRS περιλαμβάνουν 1) την κατάσταση των λεμφαδένων του πρωτογενούς όγκου, 2) νόσος διάστημα χωρίς (& lt? 12 μηνών ή ≥12 μήνες), 3) το επίπεδο CEA στον ορό πριν από την εκτομή ήπατος (& gt? 200 ng /ml ή ≤200 ng /ml), 4) αριθμός ηπατικών όγκων (1 ή & gt? 1) και 5) το μέγεθος του όγκου (≤5 cm ή & gt? 5 cm). Οι ασθενείς που λαμβάνουν 1 πόντο για κάθε δυσμενή παράγοντα, και το CRS αντιπροσωπεύει το άθροισμα. Οι ασθενείς στη συνέχεια χωρίστηκαν σε δύο ομάδες:. Υψηλού κινδύνου (CRS≥3) και χαμηλού κινδύνου (ΣΣΕ & lt? 3)

Τα τελικά σημεία της μελέτης ήταν συγκεκριμένες ασθένειες επιβίωσης (DSS), η συνολική επιβίωση χωρίς υποτροπή (RFS) και το συκώτι επιβίωσης χωρίς υποτροπή (LRFS). DSS μετρήθηκε από τη στιγμή της εκτομή ήπατος σε θάνατο ή την τελευταία παρακολούθηση. RFS και LRFS μετρήθηκαν από τη στιγμή της εκτομή ήπατος στο χρόνο, όταν 1

ου υποτροπή και το συκώτι υποτροπή εντοπίστηκε, αντίστοιχα.

Από το 2000 έως τον Αύγουστο του 2007, συνολικά 446 δείγματα από ασθενείς οι οποίοι υποβλήθηκαν σε εκτομή ήπατος για MCRC είχαν κλίση. Οι ασθενείς με εξωηπατική μετάσταση, εκείνοι που υποβλήθηκαν περιθώριο θετική εκτομή, εκείνοι με τα ελλείποντα CRS σκοράρει δεδομένων και εκείνων χωρίς επαρκή παρακολούθηση αποκλείστηκαν. Μετά από αυτές τις εξαιρέσεις, αξιολογήθηκαν κατεψυγμένα τμήματα των 307 Οκτώβριος-ενσωματωμένα δείγματα. Μετά την ιστολογική επαλήθευση υπό χρώση αιματοξυλίνης και ηωσίνης, 187 από αυτούς βρέθηκαν να έχουν τουλάχιστον 70% βιώσιμα κύτταρα όγκου. Αυτές κατεψυγμένα δείγματα ιστού macrodissected από την επιλεγμένη περιοχή του μπλοκ ΥΧΕ και RNA εκχυλίστηκε χρησιμοποιώντας αντιδραστήριο ΤΚΙζοΙ (Invitrogen, Carlsbad, CA), όπως συνιστάται από τον κατασκευαστή. Η ποιότητα του RNA από αυτά τα 187 δείγματα στην συνέχεια αναλύθηκαν με ένα 2100 Bioanalyzer (Agilent Technology, Palo Alto, CA), και 96 από αυτά βρέθηκαν να είναι βέλτιστη ποιότητα για ανάλυση μικροσυστοιχιών με αριθμό ακεραιότητα RNA (RNI) ≥7.

Microarray Analysis

Εκχυλίσματα ολικού RNA μεταγράφηκε αντίστροφα με μια προηγουμένως δημοσιευμένη μέθοδο [20] και το προκύπτον δωρεάν μήτρα DNA εφαρμόστηκε σε ανάλυση γονιδιακής έκφρασης. Τα cDNA στόχος υβριδοποιήθηκαν σε Illumina HumanHT-12 Gene Chip περιέχουν συνολικά 47.231 σχολιασμένα συνόλων ανιχνευτών γονιδίων (Illumina, San Diego, CA). Συστοιχίες σαρώθηκαν με τη χρήση τυποποιημένων Ilumina πρωτόκολλα και σαρωτές. δεδομένων των μικροσυστοιχιών είναι διαθέσιμα στη βάση δεδομένων ArrayExpress (www.ebi.ac.uk/arrayexpress) υπό τον αριθμό πρόσβασης E-mtab-1951. Η έκφραση ανεπεξέργαστα δεδομένα αναλύθηκαν με τη χρήση R στατιστικό λογισμικό, το οποίο είναι διαθέσιμο στο Διαδίκτυο, στη https://cran.r-project.org/.

Στατιστικές Μέθοδοι

Οι ασθενείς τυχαιοποιήθηκαν σε η εκπαίδευση και τη δοκιμή θέτει σε αναλογία 2:01. Τα δεδομένα από το σύνολο εκπαίδευσης ομάδα χρησιμοποιήθηκε για να επιλέξετε προγνωστικών γονιδίων και να κατασκευάσει τα αποτελέσματα μοριακών κινδύνου (MRS), καθώς και τα δεδομένα από το σύνολο δοκιμής ομάδα χρησιμοποιήθηκε για την επικύρωση της.

Τα δεδομένα μικροσυστοιχιών ήταν log2 μεταμορφώνεται και ποσοστημόριο ομαλοποιηθεί. [21] Η μέθοδος εποπτεύεται κύρια συστατικά χρησιμοποιήθηκε για την ταυτοποίηση προγνωστικών υπογραφές γονίδιο όπως περιγράφηκε προηγουμένως. [22] Εν συντομία, πρώτον, οι μονοπαραγοντική συντελεστές παλινδρόμησης για κάθε γονίδιο που συνδέεται με συγκεκριμένα αποτελέσματα (DSS, RFS, ή LRFS) στα δεδομένα εκπαίδευσης υπολογίστηκαν με τη χρήση του μοντέλου Cox proportional κινδύνων [23]. Δεύτερον, τα γονίδια που σχετίζονται σημαντικά με την έκβαση (

ρ

& lt? 0.001) κατατάχθηκαν κατά σειρά συντελεστή παλινδρόμησης τους και τα κορυφαία γονίδια με τον συντελεστή για την τιμή κατωφλίου επελέγησαν ως «κύριο συστατικό». Η οριακή τιμή υπολογίστηκε και καθορίστηκε με τη χρήση διασταυρωμένης επικύρωσης. Τρίτον, η πρώτη κύρια συνιστώσα χρησιμοποιήθηκε για τη δημιουργία των MRS, η οποία ορίστηκε ως η γραμμικός συνδυασμός των σταθμισμένων σήματα έκφρασης με συντελεστή παλινδρόμησης του Cox τυποποιημένη ως το βάρος.

Οι ασθενείς στο σύνολο εκπαίδευσης ομάδα ταξινομήθηκαν σε μια ομάδα υψηλού και χαμηλού κινδύνου με βάση τη μέση τιμή του MRS. Το μεσαίο MRS επιλέχθηκε ως το κατώτατο όριο, προκειμένου να εξαλειφθεί η επίδραση των ακραίων τιμών στο σύνολο εκπαίδευσης και να έχουν ίσο αριθμό των ασθενών στις υψηλές και χαμηλές ομάδες κινδύνου. Επιβίωση πιθανότητες εκτιμήθηκαν χρησιμοποιώντας τη μέθοδο των Kaplan και Meier [24] και σε σχέση με τη χρήση του τεστ log-rank. Αξίζει να σημειωθεί ότι, παρόλο που προσπάθησε να κατασκευάσει μια MRS για DSS, RFS και LRFS, δεν θα μπορούσαμε να υπολογίσει επαρκώς προγνωστική MRS για την RFS. Ως εκ τούτου, η υποβληθείσα ανάλυση επικεντρώθηκε στην DSS και LRFS.

Όπως και ορισμένοι ασθενείς με mCRC πέθανε από εξω-ηπατικής επανάληψης, η περίπτωση του ήπατος υποτροπής και ειδική για τον καρκίνο θάνατος μπορεί να ανταγωνίζονται μεταξύ τους. Για να αξιολογηθεί η επίδραση θανάτου από καρκίνο του ήπατος χωρίς υποτροπή σε ανάλυση γονιδίων για το ήπαρ-ειδική επανάληψη, γονίδια που σχετίζονται με το ήπαρ-υποτροπή αξιολογήθηκαν από δύο αναλυτικές μέθοδοι? Ανάλυση ανταγωνιστικών κινδύνων στους οποίους ειδική για τον καρκίνο του θανάτου θεωρήθηκε ως ανταγωνιστικές κινδύνου και ανάλυση Cox παλινδρόμησης στην οποία θεωρήθηκε ως λογοκρισία. [25].

Για την επικύρωση των μοντέλων MRS εκτιμήσαμε τη διάκριση των DSS και LRFS από το MRS όταν εφαρμόζεται στο σύνολο της δοκιμής ομάδα. Η MRS και η οριακή τιμή που προέρχεται από το σύνολο εκπαίδευσης ομάδα δεν επανεκτιμάται, αλλά εφαρμόζονται άμεσα στο σύνολο της δοκιμής. Διακρίσεις προσδιορίστηκε ποσοτικά χρησιμοποιώντας την αντιστοιχία-δείκτη. [26] Συμφωνία δείκτες κυμαίνονται από 0 έως 1, με τιμή 1 δείχνει ότι το μοντέλο διακρίσεις τέλεια μεταξύ των ασθενών με υψηλότερα και χαμηλότερα κίνδυνο θανάτου (ή επανάληψης), και μια αξίας 0,5 υποδεικνύοντας ότι η προβλεπτική ικανότητα του μοντέλου είναι δεν είναι καλύτερη από τύχη και μόνο. Η στατιστική σχέση μεταξύ του MRS και CRS αξιολογήθηκε χρησιμοποιώντας πολυπαραγοντική ανάλυση Cox παλινδρόμησης. Το Σχήμα 1 περιγράφει την πειραματική ροή της μελέτης.

Ενενήντα έξι δείγματα επιλέχθηκαν από νομαρχιακό τράπεζα ιστών μας. Οι ασθενείς τυχαιοποιήθηκαν στο σύνολο εκπαίδευσης και εξέτασης καθορίζονται από 2:01. Η μοριακή σκορ κατασκευάστηκε με βάση τα δεδομένα στο σύνολο εκπαίδευσης ομάδα και επικυρωθεί χρησιμοποιώντας τα δεδομένα στο σύνολο της δοκιμής ομάδα.

Η

Η σύγκριση των κατηγορικών μεταβλητών πραγματοποιήθηκε με τη χρήση Fisher exact test, και παρουσιάστηκαν συνεχείς μεταβλητές ως μέσες τιμές ± τυπικό σφάλμα (SE) εκτός αν αναφέρεται διαφορετικά, και σε σύγκριση με τη χρήση ενός δύο δειγμάτων

t-τεστ

. Ένα 2-sided

σ

αξία & lt?. 0.05 θεωρήθηκε σημαντική

Αποτελέσματα

δημογραφικά στοιχεία του ασθενούς και του Δείκτη Κλινική Κινδύνου (CRS)

Από τα 96 ασθενών που συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη, 37 (39%) είχαν μια CRS ≥3. Εξήντα εννέα ασθενείς (72%) έλαβαν χημειοθεραπεία πριν από την εκτομή ήπατος και 79 (82%) έλαβαν επικουρική χημειοθεραπεία (45 συστηματική χημειοθεραπεία μόνη της, 34 συνδυασμό των συστημικών και των περιφερειακών χημειοθεραπεία με ΕΑΒ). Η μέση παρακολούθηση ήταν 30 μήνες (εύρος, 2-108 μήνες) για όλους τους ασθενείς και 39 μήνες (εύρος, 2-108 μήνες) για τους επιζώντες. Κατά τη διάρκεια της περιόδου της μελέτης, 66 ασθενείς (69%) ανέπτυξαν τυχόν επανάληψη και 45 (47%) ανέπτυξαν ήπατος υποτροπή. Το ήπαρ ήταν η περιοχή 1

ης υποτροπής για τους 29 ασθενείς, ενώ εξωηπατικό περιοχές ήταν το πρώτο site της υποτροπής σε 37 ασθενείς. Τριάντα εννέα ασθενείς (41%) πέθαναν από καρκίνο, 33 από τους οποίους (85%) πέθαναν με τεκμηριωμένες υποτροπή στο απομεινάρι ήπαρ. Τα δημογραφικά στοιχεία του ασθενούς, τα χαρακτηριστικά του όγκου, βαθμολογία κλινικού κινδύνου, το είδος των επικουρική χημειοθεραπεία και ποσοστό συμβαμάτων (θάνατος του καρκίνου, συνολικά υποτροπή ή ηπατική υποτροπή κατά τη διάρκεια της περιόδου της μελέτης) δεν διέφερε σημαντικά μεταξύ των ασθενών στην εκπαίδευση και σύνολα δοκιμών (Πίνακας 1).

η

η επιλογή των γονιδίων που σχετίζονται με DSS /LRFS και Κατασκευή του Δείκτη κινδύνου Μοριακής (MRS)

Αναλύσαμε πρώτα τα δεδομένα γονιδιακής έκφρασης των ασθενών στο σύνολο εκπαίδευσης αξιοποιώντας την εποπτευόμενη αρχή συστατικό μέθοδος. Δεκαεννέα και 115 μεταγραφές γονίδιο επιλέχθηκαν ως προγνωστικά σχετική για DSS και LRFS, αντίστοιχα. Δώδεκα από τους 19 γονίδια (65%) για DSS επελέγησαν επίσης μεταξύ των γονιδίων για LRFS. Οι κατάλογοι των γονιδίων που παρατίθενται στον Πίνακα S1. Δεν μπορέσαμε να επιλέξετε γονίδια και να υπολογίσει ένα χρήσιμο μοριακή υπογραφή για τη συνολική επανάληψη (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Από το ήπαρ υποτροπής και θανάτου από καρκίνο είναι δυνητικά ανταγωνιστικά τελικά σημεία, αξιολογήσαμε τα γονίδια που σχετίζονται με το ήπαρ ειδικά στην επανάληψη χρησιμοποιώντας δύο διαφορετικές αναλύσεις? Ανάλυση ανταγωνιστικών κινδύνων και ανάλυση Cox παλινδρόμησης. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 2, οι δύο ομάδες

p-τιμές

για κάθε γονίδιο υπολογίστηκαν από αυτές τις δύο μεθόδους ήταν πολύ παρόμοια (συντελεστής συσχέτισης Peason [CC] = 0,97). Το εύρημα αυτό έδειξε ότι η ανταγωνιστική επίδραση του θανάτου από καρκίνο του ήπατος χωρίς υποτροπή στην ανάλυση γονιδίων για LRFS ήταν αμελητέα και, ως εκ τούτου υπολογίσαμε το MRS για LRFS βασίζονται στην ίδια ανάλυση που χρησιμοποιείται για τον υπολογισμό του MRS για DSS.

Κάθε κουκίδα αντιπροσωπεύει

σ

-τιμές για το γονίδιο και στις δύο αναλύσεις.

η

MRS είχαν υπολογίζεται στη συνέχεια και οι ασθενείς έχουν χαρακτηρισθεί ως υψηλού ή χαμηλού κινδύνου για την θανάτου από καρκίνο του ήπατος και υποτροπή, αντίστοιχα. Μεταξύ των 60 ασθενών στο σετ εκπαίδευσης, οι ασθενείς στην ομάδα υψηλού κινδύνου είχαν σημαντικά μικρότερη DSS και LRFS σε σύγκριση με εκείνες στην ομάδα χαμηλού κινδύνου (DSS: διάμεση τιμή 44 μήνες vs δεν έφτασε, και τα ποσοστά DSS 3 ετών, 52% vs 90%,

σ

& lt? 0.001, LRFS: διάμεση τιμή 12 μήνες vs δεν έφτασε, και τα ποσοστά LRFS 3 ετών, 23% έναντι 86%,

σ

& lt? 0.001, Εικόνα 3Α) .

Α. Οι εκτιμήσεις των Kaplan-Meier του DSS (αριστερό πάνελ) και LRFS (δεξιά πλευρά) για τους ασθενείς σε ομάδες υψηλού κινδύνου και χαμηλού κινδύνου μεταξύ του συνόλου εκπαίδευσης κοόρτης (n = 60) εκτιμήσεις Β Kaplan-Meier του DSS (αριστερό πάνελ) και LRFS (δεξιά πλευρά) για τους ασθενείς υψηλού κινδύνου και χαμηλού κινδύνου ομάδες μεταξύ των σετ δοκιμών ομάδα? Αξίζει να σημειωθεί ότι οι τιμές κατωφλίου για τη διάκριση η ομάδα υψηλού κινδύνου και χαμηλού κινδύνου ήταν το ίδιο όπως χρησιμοποιείται στην ανάλυση για το σύνολο της κατάρτισης ομάδα.

Η

Επικύρωση MRS χρήση ανεξάρτητων δοκιμών Cohort

Μια ανεξάρτητη σειρά δοκιμών των ασθενών χρησιμοποιήθηκε για την επικύρωση της απόδοσης του MRS ως προγνωστικός δείκτης για την θανάτου από καρκίνο του ήπατος και υποτροπής. Οι ενώσεις κλινικοπαθολογοανατομικών μεταβλητών με υψηλού και χαμηλού κινδύνου υπογραφές τόσο η εκπαίδευση και η δοκιμασία σύνολα συνοψίζονται στον πίνακα 2. Δεν υπήρχε συσχέτιση μεταξύ MRS, CRS, τη χρήση χημειοθεραπείας πριν ή μετά από εκτομή ήπατος ή περιφερειακά χημειοθεραπεία με τη χρήση της ΕΑΒ, εκτός από τα στατιστικά οριακή συσχέτιση μεταξύ MRS και CRS για LRFS (

σ

= 0,054). Οι ασθενείς στη δοκιμή που με υψηλό MRS είχε μικρότερη DSS και LRFS σε σύγκριση με εκείνους στην ομάδα χαμηλού κινδύνου (DSS: διάμεση τιμή 28 μήνες έναντι δεν έφτασε, και τα ποσοστά DSS 3 ετών, 42% έναντι 79%,

p

= 0,007, LRFS: διάμεση τιμή 19 μήνες έναντι δεν έφτασε, και τα ποσοστά LDFS 3 ετών, 32% έναντι 80%,

σ

= 0,046, αντίστοιχα, Σχήμα 3Β)

Οι δείκτες συμφωνία του MRS ως συνεχής μεταβλητή για DSS και LRFS στην ανάλυση του συνόλου δοκιμής ομάδα ήταν 0,71 και 0,70, ενώ εκείνες της CRS για το DSS και LRFS ήταν 0,65 και 0,66. Η MRSS απέδωσαν καλύτερα σε διακρίσεις ασθενείς υψηλού και χαμηλού κινδύνου τόσο DSS και LRFS σε σύγκριση με το CRS. Επιπλέον, στην πολυπαραγοντική ανάλυση Cox παλινδρόμησης, συμπεριλαμβανομένων τόσο MRS και CRS, MRS παρέμεινε ανεξάρτητη και σημαντικό προγνωστικό παράγοντα DSS και LRFS, υποδεικνύοντας ότι η MRS παρέχεται επιπλέον προγνωστικές πληροφορίες κατά τη διάρκεια της CRS. (Πίνακας 3).

Η

Συνδυασμός MRS και CRS Αποτελεί ένα καλύτερο προγνωστικό δείκτη

Δεδομένου ότι η MRS φάνηκε να παρέχει πρόσθετες προγνωστικές πληροφορίες για DSS και LRFS, ανεξάρτητα από το CRS, αξιολογήσαμε πόσο καλά ο συνδυασμός αυτών των δύο βαθμολογιών διακρίσεις αποτελέσματα. Χωρίσαμε τους ασθενείς, με βάση τις ΣΣΕ και MRS, σε τρεις ομάδες: υψηλού κινδύνου (CRS και MRS τόσο υψηλή), χαμηλού κινδύνου (CRS και MRS τόσο χαμηλά), και ενδιάμεσο κίνδυνο, (εκείνους που δεν ταιριάζουν σε αυτές τις δύο ομάδες) . Με βάση αυτή την διαστρωμάτωση, οι καμπύλες επιβίωσης για DSS και LRFS για τις τρεις αυτές ομάδες ήταν σαφώς διαχωρισμένα στις αναλύσεις τόσο της κατάρτισης και ομάδες δοκιμών. Για τους ασθενείς κατάρτισης κοόρτης (n = 60), οι 3-ετή επιτόκια DSS /LRFS ήταν 91/85% στην ομάδα χαμηλού κινδύνου, ενώ ήταν 81/60% και 29/13% στην ομάδα ενδιάμεσου και υψηλού κινδύνου, αντίστοιχα (

σ

& lt? 0,001 για DSS και

σ

& lt? 0,001 για LRFS). Για τους ασθενείς της δοκιμής ομάδα (Ν = 36), οι 3-ετή επιτόκια DSS /LRFS ήταν 90/89% στην ομάδα χαμηλού κινδύνου, ενώ ήταν 51/42% και 42/26% στην ομάδα ενδιάμεσου και υψηλού κινδύνου, αντίστοιχα (

σ

= 0,002 για το DDS και

p = 0,004

για LRFS). Όταν το ίδιο καθεστώς διαστρωμάτωση κινδύνου εφαρμόζεται σε ολόκληρη την ομάδα, οι ασθενείς στην ομάδα χαμηλού κινδύνου είχαν σημαντικά μεγαλύτερη DSS και LRFS σε σύγκριση με εκείνες του ενδιάμεσου κινδύνου και ομάδες υψηλού κινδύνου: DSS? διάμεσος, δεν έφτασε vs 60 μηνών έναντι 28 μήνες και επιτόκιο DSS 3 ετών, το 90% vs 70% έναντι 34% (

σ

& lt? 0.001), LRFS? διάμεση NR vs 40 μηνών έναντι 7 μήνες, και τα ποσοστά LRFS 3 ετών, 86% vs 54% έναντι 10% (

σ

& lt? 0,001) για τους ασθενείς σε υψηλή, ενδιάμεση και χαμηλή ομάδες κινδύνου, αντίστοιχα (Σχήμα 4).

Α. Kaplan-Meier εκτιμήσεις των DSS (αριστερό πάνελ) και LRFS (δεξιά πλευρά) για τους ασθενείς στις υψηλές, ενδιάμεσων και χαμηλής ομάδες κινδύνου μεταξύ του συνόλου εκπαίδευσης κοόρτης (n = 60) εκτιμήσεις Β Kaplan-Meier του DSS (αριστερό πάνελ) και LRFS (δεξιά πλευρά) για τους ασθενείς στην υψηλή, ενδιάμεση και χαμηλή ομάδα κινδύνου μεταξύ του συνόλου δοκιμής ομάδα (Ν = 36) εκτιμήσεις Γ Kaplan-Meier του DSS (αριστερό πάνελ) και LRFS (δεξιά πλευρά) για τους ασθενείς με υψηλή , ενδιάμεσα και σούπερ-ομάδα χαμηλού κινδύνου μεταξύ ολόκληρη την ομάδα (Ν = 96).

η

Συζήτηση

Αν και ομοιόμορφα χαρακτηριστεί ως ασθένεια Stage IV από την παραδοσιακή ΤΝΜ σταδιοποίηση, ηπατική MCRC είναι ένα ετερογενής νόσος με μεταβλητή απόκριση στη θεραπεία και μεταβλητή μακροπρόθεσμα αποτελέσματα. Μετά την πλήρη εκτομή, τα ποσοστά ίασης 10 χρόνο είναι περίπου 20%, ωστόσο, από 20 έως 30% των ασθενών που πεθαίνουν από τη νόσο τους εντός 2 ετών. [2], [27] Παρά το γεγονός ότι έχουν αναπτυχθεί πολλά συστήματα διαστρωμάτωση κινδύνου με βάση κλινικοπαθολογοανατομικές παράγοντες, κανένας δεν ήταν σε θέση να τους ασθενείς του κινδύνου διαστρωμάτωση αρκετά αρκετά για να καθοδηγήσουν αποφάσεις για τη θεραπεία και οι περισσότεροι δεν είναι συνεπείς όταν δοκιμάζεται σε διάφορα ιδρύματα. [3] Επιπλέον, η πρόβλεψη των προτύπων υποτροπής ήταν φτωχή και αυτή η ικανότητα θα μπορούσε να έχει σημαντικές συνέπειες για τις στρατηγικές επικουρική θεραπεία. Είναι σαφές ότι χρειαζόμαστε καλύτερη προγνωστικά εργαλεία που μπορούν να επηρεάσουν τις αποφάσεις της θεραπείας.

Στην παρούσα μελέτη, εξετάσαμε τις παγκόσμιες προφίλ γονιδιακής έκφρασης των ηπατικών MCRC σε ασθενείς που υποβλήθηκαν σε μια δυνητικά θεραπευτική εκτομή ήπατος και κατασκευαστεί MRSS να προβλέψουμε μακροπρόθεσμα αποτελέσματα μετά την επέμβαση. Η MRSS επικυρώθηκαν να είναι σε θέση να προβλέψει ανεξάρτητα DSS και LRFS. Είναι σημαντικό, αυτή η προγνωστική ικανότητα ήταν ανεξάρτητη από τις καλύτερες κλινικές προγνωστικό μας, το CRS. Όταν το MRS χρησιμοποιήθηκε σε συνδυασμό με την CRS, ήμασταν σε θέση να προσδιορίσει υποομάδες ασθενών με εξαιρετικά υψηλή και χαμηλή κινδύνου για ηπατική υποτροπής και θανάτου. Τα ευρήματά μας δείχνουν ένα μεγάλο δυναμικό για τη γονιδιακή υπογραφές ως οδηγός για την εξατομικευμένη θεραπεία για τους ασθενείς με δυνητικά χειρουργήσιμη ήπατος MCRC.

Μία από τις μεγαλύτερες προκλήσεις στην εφαρμογή συστημάτων κλινική σταδιοποίηση για χειρουργήσιμη ηπατική MCRC είναι μια μεγάλη και αυξανόμενη κλινική ετερογένεια δεδομένου ότι οι νέες και πιο αποτελεσματικές χημειοθεραπεία έχει αναπτυχθεί. Πρόσφατη αύξηση της χρήσης αποτελεσματικών χημειοθεραπεία έχει επεκτείνει την ένδειξη για χειρουργική θεραπεία και να γίνει πιο ασθενείς δυνητικά επιλέξιμες για εκτομή. Ως αποτέλεσμα, η πρόσθετη ετερογένεια των υποβάθρων θεραπεία έχει προσθέσει στην πολυπλοκότητα αυτού του πληθυσμού ασθενών περαιτέρω περιορισμό της ευρείας εφαρμογής και προγνωστική δύναμη του κλινικοπαθολογοανατομικές μεταβλητών. Azye et al απέδειξαν πρόσφατα μια σημαντική διαφορά στην προβλεπτική ικανότητα των διαφόρων συστημάτων κλινικής βαθμολόγησης κινδύνου για τους ασθενείς με mCRC που έκανε και δεν λαμβάνουν χημειοθεραπεία πριν από την εκτομή ήπατος. Επιπλέον, στους ασθενείς που έλαβαν χημειοθεραπεία πριν από την εκτομή τα κλινικά συστήματα βαθμολόγησης κινδύνου ήταν πιο ακριβής, όταν μετριέται μετά από την ανταπόκριση στη θεραπεία λογιστικοποιήθηκε. [28] Αυτή η παρατήρηση υπογραμμίζει επίσης τους περιορισμούς των συστημάτων κλινικής σταδιοποίησης στη σημερινή εποχή.

Παρά το γεγονός ότι το 75% των ασθενών μας έλαβε διάφορα σχήματα χημειοθεραπείας ως πρόσθετο ή εισαγωγική θεραπεία, η CRS έχει αποδειχθεί ότι είναι ένα λογικά ακριβής πρόβλεψης θανάτου από καρκίνο του ήπατος και της υποτροπής (δείκτες αντιστοιχία 0,65 και 0,66, αντίστοιχα). Το εύρημα αυτό είναι συνεπές με προηγουμένως αναφερθεί αποτελέσματα από το θεσμικό μας όργανο. [2], [6], [8] Ωστόσο, η CRS είναι ατελής για κλινική χρήση ως οδηγός για την εξατομίκευση της θεραπείας για ασθενείς με χειρουργικά εξαιρέσιμων ηπατική MCRC. Κατ ‘αρχάς, η προβλεπτική ικανότητα του ΣΣΕ δεν προβλέπει σταθερά αποτελέσματα σε παρόμοιες πληθυσμούς ασθενών σε διαφορετικά ιδρύματα. Για παράδειγμα, Zakaria, et al ανέφεραν ένα πολύ χαμηλότερο δείκτη αντιστοιχίας (0,56) για CRS μας, όταν εφαρμόστηκε σε ομάδα τους ασθενείς στη Mayo Clinic. [3] Δεύτερον και πιο σημαντικό, η διαφορά στα αποτελέσματα για τους ασθενείς με υψηλές και χαμηλές ΗΣΚ δεν είναι αρκετά μεγάλη για να επηρεάζει την κλινική διαχείριση. Για παράδειγμα, η μέση επιβίωση των ασθενών με υψηλή CRS σε αυτή τη μελέτη ήταν 38 μήνες, γεγονός που καθιστά δύσκολο να συστήσει κατά εκτομή για αυτούς τους ασθενείς. Ως εκ τούτου, στόχος μας ήταν να εντοπίσει μια γενετική βιοδεικτών που θα μπορούσαν να προσδιορίσουν ασθενείς με τέτοια ευνοϊκή ή κακή έκβαση ότι οι κλινικές αποφάσεις θα μπορούσε να καταστεί? αποφεύγοντας μάταιη χειρουργική επέμβαση ή εκτέλεση χειρουργική επέμβαση σε ασθενείς με εμφανώς κακή κλινικά χαρακτηριστικά.

Παγκόσμια γονιδιακής έκφρασης σε MCRC θα δώσει πιθανότατα βαθύτερη γνώση της υποκείμενης βιολογίας και κλινική συμπεριφορά των συγκεκριμένων ασθενών. Φαίνεται επίσης πιθανό ότι αυτή η γενετική προφίλ θα δώσει τελικά προγνωστικοί υπογραφές που μπορεί να υπαγορεύσει συγκεκριμένες θεραπευτικές αγωγές με βάση την ανώτερη πρόβλεψη αποτελέσματος. Δεν είναι έκπληξη το γεγονός ότι η κ μας, βασίζονται στη γονιδιακή προφίλ, ήταν ένα ισχυρό και ανεξάρτητο προγνωστικό εργαλείο για μοτίβα του θανάτου και επανεμφάνισης του καρκίνου που σχετίζονται με. Ένα πολύ σημαντικό εύρημα αυτής της μελέτης ήταν ότι υπήρχε μια σημαντική διαφορά σε επίπεδο κινδύνου-διαστρωμάτωση από CRS και MRS και ότι αυτές οι προγνωστικοί βαθμολογίες ανεξάρτητα πρόβλεψης βασίζεται σε μια πολυπαραγοντική ανάλυση. Για παράδειγμα, μεταξύ των ασθενών που έχουν χαρακτηρισθεί ως υψηλού κινδύνου για καρκίνο του θανάτου της κας, περισσότερο από το ήμισυ (53%) από αυτούς δεν έχουν ταξινομηθεί ως χαμηλού κινδύνου από CRS (& lt? 3). Το εύρημα αυτό υποδηλώνει ότι ο συνδυασμός κλινικών και μοριακών προγνωστικών εργαλείων μπορεί να είναι η πιο ισχυρή μέθοδος πρόβλεψης των αποτελεσμάτων και επηρεάζουν τις αποφάσεις θεραπείες για τους ασθενείς με χειρουργικά εξαιρέσιμων ηπατική MCRC.

Εκτός από την ειδική για τον καρκίνο του θανάτου, τη συνολική και την επανάληψη του ήπατος επιλέχθηκε ως ένα από τα ακραία σημεία της αποτυχίας της θεραπείας στην παρούσα μελέτη. δεν μπορούσε να καθοριστεί ακριβής προγνωστικός δείκτης της συνολικής RFS. Αν και ο λόγος για τον οποίο ένα γονίδιο υπογραφή απέτυχε να σχετίζεται με τη συνολική επανάληψη δεν είναι σαφής, μια πιθανή εξήγηση είναι ανακρίβεια στη διάγνωση εξωηπατικών υποτροπής, ιδιαίτερα σε λεμφαδένες. Tsunoda et al. αναφερθεί μόνο το 75% της ακρίβειας στη διάγνωση του λεμφαδένα μετάστασης του καρκίνου του παχέος εντέρου με PET /CT. [29] Θα πρέπει να σημειωθεί ότι σε αυτή τη μελέτη, η επανάληψη ορίστηκε με βάση μελέτες απεικόνισης και ιστολογική επιβεβαίωση δεν ήταν αναγκαία ελήφθη. Παρά το γεγονός ότι η ΕΑΒ χημειοθεραπεία είναι γνωστό για τη μείωση του ήπατος υποτροπής μετά την ηπατεκτομή για MCRC [19], [30], δεν έχει γίνει παγκοσμίως αποδεκτό λόγω της δυσκολίας στη διαχείριση αυτής της θεραπείας και τις ανησυχίες σχετικά με τη χολή τοξικότητα. [31] Η ακριβής πρόβλεψη του ήπατος ειδικά υποτροπής θα ήταν χρήσιμο να επιλέξετε τους ασθενείς είναι πιθανότερο να ωφεληθούν από την επικουρική περιφερειακών θεραπείες, όπως η χημειοθεραπεία ΕΑΒ. Σε αυτή τη μελέτη, το ένα τρίτο των ασθενών μας έλαβε ΕΑΒ χημειοθεραπεία ως επικουρική θεραπεία. Ωστόσο, το κλάσμα των ασθενών που έλαβαν χημειοθεραπεία ΕΑΒ δεν ήταν υψηλότερη στην ομάδα με υψηλή MRS για το ήπαρ υποτροπή από ό, τι εκείνο με χαμηλή MRS. Όπως συνέβη και για DSS, το CRS και MRS ήταν ανεξάρτητες μεταξύ τους στην ικανότητά τους να προβλέψουν το ήπαρ υποτροπής και ήταν ισχυρή σε συνδυασμό με την πρόβλεψη αυτή εκδήλωση.

MRS παρέχει επιπλέον προγνωστικές πληροφορίες κατά τη διάρκεια της CRS και ο συνδυασμός των δύο αυτών βελτιώνει σημαντικά τη διαστρωμάτωση του κινδύνου μετά από εκτομή ήπατος. Μεταξύ ολόκληρη την ομάδα, το 90% των ασθενών που ταξινομούνται ως υψηλού κινδύνου τόσο από CRS και MRS αναπτύχθηκε συκώτι υποτροπή και περισσότερο από το 65% πέθαναν μέσα σε 3 χρόνια, ενώ πάνω από το 85% εκείνων που ταξινομούνται χαμηλού κινδύνου τόσο από CRS και MRS ήταν ήπατος επανάληψης ελεύθερο και το 90% ήταν ζωντανοί στα 3 χρόνια. Ο προσδιορισμός και η περαιτέρω επικύρωση αυτών των υψηλής και χαμηλής ομάδες υψηλού κινδύνου θα μπορούσε να οδηγήσει στην εξέταση της εξατομικευμένης θεραπείας για τους ασθενείς αυτούς. Για παράδειγμα, μη-operative προσεγγίσεις θα μπορούσαν να θεωρηθούν για τους ασθενείς υψηλού κινδύνου για πρόωρο θάνατο και επικουρική περιφερειακές στρατηγικές, όπως η ΕΑΒ χημειοθεραπεία θα μπορούσε να θεωρηθεί για τους ασθενείς που διατρέχουν υψηλό κίνδυνο ηπατικής υποτροπής. Αντίθετα, οι ασθενείς με χαμηλό κίνδυνο αποτυχίας θα μπορούσε να θεωρηθεί για τη χειρουργική επέμβαση και μόνο, χωρίς πρόσθετη χημειοθεραπεία. Υποψήφιοι αξιολόγηση της χρήσης αυτών των ισχυρών προγνωστικά στοιχεία σχετικά με την επιλογή των ασθενών για νέες θεραπευτικές προσεγγίσεις είναι δικαιολογημένη.

Τα γονίδια που συνιστούν οι βαθμολογίες του κινδύνου επιλέχθηκαν σε ένα καθαρά στατιστικό τρόπο από την πισίνα των γονιδίων στη συστοιχία , και μια μηχανιστική ρόλο στον ορθοκολικό εξέλιξης του καρκίνου δεν έχει οριστεί για πολλούς. Ωστόσο, μερικά από τα επιλεγμένα γονίδια έχει αποδειχθεί ότι παίζουν ένα σημαντικό ρόλο στη βιολογία του καρκίνου. Για παράδειγμα,

FGFBP1

(αυξητικός παράγοντας των ινοβλαστών πρωτεΐνη 1 δεσμευτική) αναγνωρίστηκε ως ένα από τα γονίδια με τη μεγαλύτερη επίδραση τόσο DSS και LRFS. Αυτό το γονίδιο δειχθεί ότι παίζει έναν κρίσιμο ρόλο στην προώθηση της αγγειογένεσης των όγκων σε διάφορους καρκίνους συμπεριλαμβανομένου του ορθοκολικού. [32] Μία άλλη έξυπνη γονίδιο που ταυτοποιείται στην παρούσα μελέτη ήταν

BAG3

(BCL-2 σχετίζεται athanogene 3) το οποίο είναι γνωστό ότι έχει αντι-αποπτωτικά αποτελέσματα στα καρκινικά κύτταρα και να ενισχύσουν την αντίσταση στη χημειοθεραπεία. [33] Ο κατάλογος των πρόβλεψης γονιδίων έχουμε εντοπίσει μπορούν επίσης να παρέχουν διορατικότητα και την κατεύθυνση στην μελέτη της βιολογίας των χειρουργήσιμη μεταστατικό ορθοκολικό καρκίνο στο ήπαρ, καθώς και την παροχή δυναμικού νέους στόχους για θεραπευτική ανάπτυξη. Από την άλλη πλευρά, είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι αυτή η μελέτη δεν είχε σχεδιαστεί για να διερευνήσει σχετικές βιολογικές οδούς και ότι οι υπογραφές έκφραση δεν περιλαμβάνουν όλες τις σχετικές γενετικές γεγονότα για να εξηγήσει υποκείμενη βιολογία του όγκου.

Οι περιορισμοί της παρούσας μελέτης περιλαμβάνουν αναδρομική φύση της, μεροληψία της επιλογής των δειγμάτων όγκου και περιορισμένου μεγέθους του δείγματος. Λόγω των τεχνικών περιορισμών του γονιδίου τσιπ Illumina, θα μπορούσε να συμπεριληφθεί μόνο ασθενείς με κλίση κατεψυγμένο ιστό. Επιπλέον, ορισμένα από τα δείγματα ιστού με κακή ποιότητα RNA αποκλείστηκαν για την απόκτηση ακριβών δεδομένων. Στην πραγματικότητα, το 31% των ασθενών μας αποκλείστηκαν από τη μελέτη αυτή, επειδή ο όγκος δεν περιέχει αρκετά βιώσιμα κύτταρα για διαλογή ιστολογική εξέταση. Επιπλέον, οι όγκοι με ακτινολογική πλήρη ανταπόκριση στη χημειοθεραπεία δεν ήταν σε τράπεζα του όγκου μας. Ως εκ τούτου, προοπτική αξιολόγησης του MRS χρησιμοποιώντας ιστούς που λαμβάνονται πριν από την εισαγωγική χημειοθεραπεία είναι ένας σημαντικός παράγοντας. Ευτυχώς, νεότερη τεχνολογία που επιτρέπει γονιδιακό προφίλ του μερικώς υποβαθμισμένη δείγματα, όπως μονιμοποιηθεί με φορμαλίνη ιστού [18], [34] αναπτύσσεται και χρησιμοποιείται. Επιπλέον, η απόδοση των σημερινών τεχνολογιών συστοιχίας υβριδισμού που βασίζεται συνεχίζει να βελτιώνεται, ενώ το κόστος μειώνονται [33], [34]. Η γενετική ετερογένεια των πολλαπλών μεταστατικών όγκων μπορεί να είναι ένας άλλος περιορισμός αυτής της μελέτης. Η πλειονότητα των ασθενών είχαν πολλαπλούς όγκους, αλλά μόνο ένας όγκος ανά ασθενή αναλύθηκε. Δύο μελέτες αξιολόγησης των προφίλ γονιδιακής έκφρασης τόσο του πρωτογενούς καρκίνου του παχέος εντέρου και των αντίστοιχων ηπατική μετάσταση έδειξαν αξιοσημείωτα παρόμοια προφίλ έκφρασης των γονιδίων μεταξύ των πρωτογενών και μεταστατικών όγκων. [35], [36] Δεδομένης της ομοιότητας στο προφίλ γονιδίου μεταξύ πρωτογενούς και metastatatic όγκων, είναι πιθανό ότι η γονιδιακή έκφραση πολλαπλών ηπατικών μεταστάσεων σε έναν ασθενή είναι παρόμοια. Η χημειοθεραπεία πριν από την εκτομή ήπατος θεωρητικά θα μπορούσε να μεταβάλλει την έκφραση γονιδίων μεταστατικών όγκων.