Αφηρημένο

Ιστορικό

Η οικογενής συστατικό εκτιμάται ότι αντιπροσωπεύουν περίπου το 10% του καρκίνου των ωοθηκών. Ωστόσο, ο τρόπος κληρονομικότητας του καρκίνου των ωοθηκών παραμένει ελάχιστα κατανοητή. Ο στόχος αυτής της μελέτης ήταν να διερευνήσει το μοντέλο κληρονομιά που ταιριάζει καλύτερα την παρατηρούμενη μοτίβο μετάδοσης του καρκίνου των ωοθηκών μεταξύ 7669 μελών του 1919 γενεαλογία εξακριβωθεί μέσω εξεταζομένων από το Αρχείο Καρκίνου Τζίλντα Radner οικογενής των ωοθηκών στο Roswell Park Cancer Institute, Μπάφαλο, Νέα Υόρκη.

Μεθοδολογία /Κύρια Ευρήματα

Χρησιμοποιώντας τη στατιστική ανάλυση για το πρόγραμμα γενετικής επιδημιολογίας, θα πραγματοποιηθεί συγκρότημα διαχωρισμού αναλύσεις της κατάστασης του καρκίνου των ωοθηκών αγάπη με την τοποθέτηση διαφορετικών γενετικών οπισθοδρομική πολυπαραγοντική λογιστική μοντέλα υπόθεση που βασίζεται. Αξιολογήσαμε την πιθανότητα σποραδικών, μεγάλες γονιδίου, του περιβάλλοντος, γενικά, και έξι τύπους του Μέντελ μοντέλα. Κάτω από κάθε υπόθεση μοντέλο, εκτιμάται επίσης τη συχνότητα αλληλόμορφο ευαισθησίας, οι πιθανότητες μετάδοσης για το αλληλόμορφο ευαισθησίας, βασική ευαισθησία και τις εκτιμήσεις της οικογενούς σύνδεσης. Συγκρίσεις μεταξύ των μοντέλων διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας είτε μέγιστη δοκιμή λόγου πιθανοφάνειας στην περίπτωση των ιεραρχικά μοντέλα, ή το κριτήριο του Akaike για μη-ένθετη μοντέλα. Όταν αξιολογείται κατά σποραδικές μοντέλο χωρίς οικογενειακό σύνδεση, το μοντέλο με τις δύο γονέα-απογόνου και συγγενών-SIB υπολειμματική ένωση δεν θα μπορούσε να απορριφθεί. Ομοίως, ο Μέντελ κυρίαρχο μοντέλο που περιλάμβανε οικογενειακό υπολειμματική ένωση παρέχεται η καλύτερη τοποθέτηση για την κληρονομικότητα του καρκίνου των ωοθηκών. Η εκτιμώμενη συχνότητα αλληλόμορφο ασθένειας στο κυρίαρχο μοντέλο ήταν 0,21.

Συμπεράσματα /Σημασία

Η παρούσα έκθεση παρέχει υποστήριξη για ένα γενετικό ρόλο στην προδιάθεση στον καρκίνο των ωοθηκών με μια μεγάλη αυτοσωματικό κυρίαρχο στοιχείο. Αυτό το μοντέλο δεν αποκλείει τη δυνατότητα πολυγονιδιακή κληρονομικότητα των συνδυασμένων επιπτώσεων των πολλαπλών αλληλομόρφων χαμηλή ευαισθησία διεισδυτικότητα διαχωρισμό δεσπόζει

Παράθεση:. Tayo BO, DiCioccio RA, Liang Υ, Trevisan Μ, Cooper RS, Lele S, et al . (2009) Συγκρότημα Διαχωρισμός Ανάλυση καταγωγές από την Τζίλντα Radner οικογενή καρκίνο των ωοθηκών Μητρώο αποκαλύπτει στοιχεία για Μέντελ Κυρίαρχο Κληρονομικότητα. PLoS ONE 4 (6): e5939. doi: 10.1371 /journal.pone.0005939

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 9 Μαρ 2009? Αποδεκτές: 19 Μάη 2009? Δημοσιεύθηκε: 17 Ιουνίου, 2009

Copyright: © 2009 Tayo et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η έρευνα υποστηρίχθηκε, εν μέρει, από το NCI Κέντρο Καρκίνου Υποστήριξη Grant σε Roswell Park Cancer Institute (CA016156)? το Cancer Research Institute Ομάδα καρκίνο των ωοθηκών εργασίας Grant (KO)? και το Hilton-Ludwig Cancer Μετάσταση Πρωτοβουλία του Ludwig Institute for Cancer Research (KO). Μερικά από τα αποτελέσματα αυτής της εργασίας ελήφθησαν με τη χρήση του πακέτου λογισμικού S.A.G.E., η οποία υποστηρίζεται από ένα Υπηρεσίας Δημόσιας Υγείας Grant Resource Η.Π.Α. (RR03655) από το Εθνικό Κέντρο Έρευνας Πόρων. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ιδρύθηκε γενετικοί παράγοντες κινδύνου για επιθηλιακό καρκίνο των ωοθηκών (EOC) περιλαμβάνουν την παρουσία ενός κληρονομείται μετάλλαξη σε ένα από τα τέσσερα γονίδια ευαισθησίας στον καρκίνο των ωοθηκών, BRCA1, BRCA2, MSH2 ή MLH1 [1] – [6]. Ωστόσο, δεν είναι όλες οι οικογένειες με ιστορικό καρκίνου των ωοθηκών θα είναι φορείς οποιουδήποτε από αυτά τα γονίδια και, σε εκείνες τις μετάλλαξη θετικά οικογένειες, κατά μέσο όρο, μόνο το ήμισυ των σε κίνδυνο γυναίκες θα είναι φορείς. Σε μια προσπάθεια να κατανοήσουμε τον ρόλο των γενετικών παραγόντων στην αιτιολογία του καρκίνου των ωοθηκών, διάφορες μελέτες έχουν διεξαχθεί σε διαφορετικούς ανθρώπινους πληθυσμούς [1], [5], [7] – [18]. Οι μελέτες αυτές κυμαίνονταν από γενετικές επιδημιολογικές και διαχωρισμού αναλύσεις [8], [14] που διερευνούν μεταλλάξεις σε συγκεκριμένα γονίδια από μοριακής γενετικής [10], [11], [13], [17], να ρισκάρει και αναλύσεις επιβίωσης [5], [12], [18] μεταξύ των οικογενειών και καταγωγές με τις επηρεαζόμενες συγγενείς. Παρά αυτές τις μελέτες, ο τρόπος κληρονομικότητας της ευαισθησίας στον καρκίνο των ωοθηκών δεν είναι πλήρως κατανοητός. Σε μια πρόσφατη μελέτη, τα μέλη 283 επιθηλιακού οικογένειες με καρκίνο των ωοθηκών από το Ηνωμένο Βασίλειο (UK) και τις Ηνωμένες Πολιτείες (US) υποβλήθηκαν σε διαλογή για την κωδικοποίηση αλλαγές αλληλουχίας και μεγάλων γονιδιωματικών μεταβολών (αναδιατάξεων και διαγραφές) στην BRCA1 και γονιδίων BRCA2 [19] . Από τις επιβλαβείς μεταλλάξεις που προσδιορίζονται στις οικογένειες, 37% και 9% βρέθηκαν σε γονίδια BRCA1 και BRCA2 αντίστοιχα. Επιπλέον, ο έλεγχος για MSH2 και MLH1 μεταλλάξεις σε 77 περιπτώσεις οικογενούς καρκίνου των ωοθηκών, ο οποίος προηγουμένως ήταν αρνητικό για BRCA1 και BRCA2 μεταλλάξεις, αποκάλυψε 2 περιπτώσεις με μεταλλάξεις MSH2 και κανένας με μια μετάλλαξη MLH1 [20]. Ενώ αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι BRCA1, BRCA2 και MSH2 είναι σημαντικά γονίδια προδιάθεσης για καρκίνο των ωοθηκών, είναι επίσης σαφές ότι μπορεί να υπάρχουν γονίδιο (α) άλλα ευαισθησία.

Η ανάλυση του διαχωρισμού είναι συχνά ένα σημείο εκκίνησης για την οικογένεια με βάση τη γενετική μελέτες των πολύπλοκων ανθρώπινων ασθενειών [21]. Βοηθά να εκτιμηθεί η πιθανή γενετική λειτουργία του διαχωρισμού της ασθένειας από την εξέταση των σχετικών υποθέσεων που βασίζονται σε μαθηματικά μοντέλα. Ένα πλεονέκτημα της ανάλυσης διαχωρισμού είναι ότι δεν απαιτεί αυστηρά διαθεσιμότητα των γενετικών δεικτών για τους συμμετέχοντες της μελέτης. Τα ευρήματα από τις αναλύσεις διαχωρισμού που χρησιμοποιείται συχνά για τη διαμόρφωση προσαρμοσμένη ερευνητικές υποθέσεις σχετικά με τη νόσο υπό έρευνα, ή /και να αποφασίσει σχετικά με το είδος της ερευνητικής προσπάθειας σχετικά με τη νόσο. Συνεπώς, η παρούσα μελέτη διεξήχθη για να αξιολογηθεί τύπους οικογενούς εξάρτηση στον καρκίνο των ωοθηκών, να ερευνήσει πιθανή απόδειξη μετάδοσης της μείζονος γονιδίου (ων) για καρκίνο των ωοθηκών? και να καθορίσει τον καλύτερο τρόπο μετάδοσης για τέτοιες μεγάλες γονίδιο (α) στα δεδομένα μας για το 1919 γενεαλογία από την Τζίλντα Radner οικογενή καρκίνο των ωοθηκών Μητρώου (GRFOCR). Η μελέτη αυτή είχε ως στόχο να παράσχει στοιχεία σχετικά με τη φύση του γενετικού ρόλο στην προφανή οικογενειακό μοντέλο της ευαισθησίας του καρκίνου των ωοθηκών σε αυτόν τον πληθυσμό της μελέτης.

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των μελών GRFOCR

ο Πίνακας 1 δείχνει την κατανομή των τύπων σχέσεων και το συνολικό αριθμό των συμμετεχόντων στη μελέτη περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη. Από το 7669 συνολικό αριθμό των ατόμων στα δεδομένα, 6213 ήταν γυναίκες και 1456 άνδρες. Από τις 6213 γυναίκες, 3802 επηρεάστηκαν και 2253 δεν επηρεάζεται, ενώ το καθεστώς αγάπη για 158 γυναίκες ήταν άγνωστη. Τα άτομα με άγνωστη κατάσταση στοργή διατηρήθηκαν στα δεδομένα για τη δημιουργία σχέσης μέσα γενεαλογία, αλλά δεν χρησιμοποιήθηκαν στην ανάλυση επειδή οι τιμές φαινότυπο τους τέθηκαν σε λείπει. Συνολικά, τα δεδομένα αποτελείται από 15.336 ζευγάρια γονέα-απογόνου, 4825 διαφορετικές συγγενή-ζεύγη κατανεμημένα σε αδελφή αδελφή (n = 2900), αδελφή αδελφός n = 1543), ο αδελφός αδελφός (n = 382), και το μισό συγγενών (n = 8) ζεύγη (Πίνακας 1). Στις σχετικές κατηγορίες δεύτερου και τρίτου βαθμού, υπήρχαν 9742 grandparental, 2709 καλόκαρδοι και 4 ζεύγη ξάδελφος. Ο αριθμός των γενεών ανά γενεαλογία κυμαίνεται από 2 έως 5 γενεών (Σχήμα 1), η οποία φαίνεται να αντιπροσωπεύουν το μεγάλο εύρος αριθμού των πυρηνικών οικογενειών ανά γενεαλογία και την κατανομή της κληρονομικότητας bits φορέα φαίνεται στα δεδομένα (Εικόνα 2). Μεταξύ των ζευγαριών σχέση, υπήρχαν 1062 γονέας /απόγονος, 935 αδελφή /αδελφή, 2 μισά συγγενών, 161 grandparental και 272 καλόκαρδοι συμφωνούν για τον καρκίνο των ωοθηκών (Πίνακας 2).

Η

Η

Το BRCA1, BRCA2, MSH2 και MLH1 κατάσταση μετάλλαξης ενός υποσυνόλου των μελών GRFOCR πρόσφατα αναφερθεί [19], [22]. Σε 137 οικογένειες GRFOCR, η συχνότητα του BRCA1 και BRCA2 μεταλλάξεις ήταν 39%. Σε 77 από αυτές τις οικογένειες αρνητική για BRCA1 ή BRCA2 μετάλλαξη, η συχνότητα των MSH2 ή MLH1 μετάλλαξη ήταν 2,6% και 0%, αντίστοιχα. Αυτά τα αποτελέσματα επιβεβαιώνουν ότι το BRCA1, BRCA2, MSH2 και MLH1 μεταλλάξεις δεν ευθύνεται πλήρως για την οικογενή προδιάθεση για καρκίνο των ωοθηκών.

Διαχωρισμός αναλύσεις δείχνουν στοιχεία για την οικογενειακή μετάδοση ενός σημαντικού γονιδίου σε ΕΓΚ

Η οι εκτιμήσεις των παραμέτρων και των στατιστικών δοκιμών από τις πολύπλοκες αναλύσεις διαχωρισμού παρουσιάζονται στον πίνακα 3. Όλες οι αναλύσεις περιορίζονται σε θηλυκά με τη ρύθμιση της διεισδυτικότητα (την πιθανότητα ότι θα επηρεαστεί ένα άτομο) για τους άνδρες ίση με το μηδέν. Για να ληφθεί υπόψη για την παρουσία άλλων τύπων καρκίνου του ενδιαφέροντος, που ενσωματώνονται στα μοντέλα μας επιπλέον συμμεταβλητή, αλλά επειδή υπήρχαν μόνο λίγα άτομα με τέτοιο άλλους τύπους καρκίνου, την ένταξη ή τον αποκλεισμό της συμμεταβλητή δεν είχε καμία επίδραση στα μοντέλα (τα δεδομένα δεν απεικονίζεται). Αυτό συμμεταβλητή στη συνέχεια έπεσε από όλες τις αναλύσεις που αναφέρονται στην παρούσα μελέτη

Η

Για να προσδιορίσετε την υποστήριξη για οικογενειακές ή υπολειμματική σύνδεση στα δεδομένα, πρώτον συγκρίναμε τρεις σποραδικές μοντέλα, το καθένα με διαφορετικό τύπο της οικογενούς ένωση -. Γονέα -offspring, αδελφό ή και τα δύο γονέα-απογόνου και αδελφό. Το μοντέλο με δύο γονέα-απογόνου και αδελφό υπολειμματική ένωση εφοδιασμένα τα δεδομένα καλύτερα από οποιοδήποτε από τα άλλα δύο (τα αποτελέσματα δεν φαίνονται). Δεύτερον, στη συνέχεια, σε σύγκριση με σποραδικές μοντέλο χωρίς υπολειμματική παραμέτρων σύνδεσης (υπόδειγμα 1) με τη σποραδική μοντέλο που περιελάμβανε τόσο απογόνους και αδελφών υπολειμματική ένωση (υπόδειγμα 2). Το μοντέλο με οικογενή συσχέτιση τοποθετηθεί σημαντικά τα δεδομένα καλύτερα από ό, τι το ένα χωρίς (Υπόδειγμα 2 εναντίον 1,), παρέχοντας έτσι υποστήριξη για την ύπαρξη της οικογενειακής σύνδεσης στα δεδομένα και την αιτιολόγηση για την εκτίμηση της οικογενούς παραμέτρους σύνδεσης στα επόμενα μοντέλα.

Στη συνέχεια, ελέγξαμε την υπόθεση της χωρίς σημαντικές γονιδίων με τη σύγκριση της σποραδικές μοντέλο 2 (σποραδικά με FA) με το γενικό ή το πλήρες μοντέλο (μοντέλο 12). Η σποραδική μοντέλο ήταν έντονα απορρίφθηκε (), παρέχοντας έτσι υποστήριξη για την ύπαρξη ενός κύριου γονιδίου. Η υπόθεση ενός σημαντικού γονιδίου μόνο ελέγχθηκε με τη σύγκριση μοντέλο 3 και το μοντέλο 12. Και πάλι, η υπόθεση ενός σημαντικού γονιδίου μόνο απερρίφθη (). Για να διερευνήσουν πιθανή μετάδοση της μείζονος γονιδίου, η υπόθεση της «μη ειδικού τύπου μετάδοση» εκτιμήθηκε από τη σύγκριση της περιβαλλοντικής μοντέλο (μοντέλο 10), στην οποία οι παράμετροι μετάδοσης περιορίζονται ίσο με το αλληλόμορφο συχνότητα, με το γενικό μοντέλο (μοντέλο 12) τα οποία εκτιμήθηκαν μετάδοσης και τις παραμέτρους της συχνότητας αλληλόμορφο. Η υπόθεση της μη ειδικού τύπου μετάδοσης απορρίφθηκε επίσης (Model 10 εναντίον 12:). Η απόρριψη της περιβαλλοντικής μοντέλο είναι μια ένδειξη της μετάδοσης των μεγάλων γονιδίου ειδικού τύπου.

Για να καθορίσει τα στοιχεία για διαχωρισμό των μεγάλων γονιδίου (ων), η υπόθεση του Μέντελ μετάδοσης πρέπει να παραλείψει να απορριφθεί εκτός από την την απόρριψη των δύο υποθέσεων των «χωρίς σημαντική επίδραση» και «δεν υπάρχει μετάδοση σημαντική επίδραση» [23], [24]. Δεδομένου ότι τα δύο τελευταία κριτήρια πληρούνται, η υπόθεση της «Μέντελ μετάδοσης», κατά συνέπεια, δοκιμάστηκε συγκρίνοντας όλους τους διαφορετικούς τύπους του Μέντελ μοντέλα (μοντέλα 4-9) με το γενικό πρότυπο. Το κυρίαρχο μοντέλο του Mendel (μοντέλο 5) δεν θα μπορούσε να απορριφθεί (), παρέχοντας έτσι αποδεικτικά στοιχεία για τη μετάδοση σημαντικών γονιδίων με συχνότητα αλληλόμορφο ευαισθησίας των 0,21.

EOC απομονώνει σε ένα Μέντελ κυρίαρχη μόδα

Για να καθοριστεί περαιτέρω εάν οι πιθανότητες μετάδοσης του κύριου γονιδίου στα δεδομένα συμμορφώνονται με Μέντελ λειτουργία, συγκρίναμε το μοντέλο στο οποίο εκτιμήθηκε μόνο ο (μοντέλο 11) με το κυρίαρχο μοντέλο του Μέντελ. Οι Akaike Information Criterion (AIC) τιμές δείχνουν ότι το κυρίαρχο μοντέλο είναι ένα μοντέλο καλύτερη τοποθέτηση (Υπόδειγμα 5 (AIC = 5627,23) έναντι Μοντέλο 11 (AIC = 5760,38)). Επειδή οι BRCA1, BRCA2, MSH2 και MLH1 μεταλλάξεις είναι γνωστό ότι σχετίζονται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου των ωοθηκών και μεταδίδονται με αυτοσωματικό κυρίαρχο τρόπο, ερευνήσαμε εάν η παρατηρούμενη απόδειξη για την επικρατούσα κληρονομικότητα οδηγήθηκε από μία μονή ή πολλαπλή τόπους. Χρησιμοποιώντας το κυρίαρχο Μέντελ μοντέλο, έχουμε τοποθετηθεί πολλές πολυγονιδιακή μικτά μοντέλα με μια παράμετρο για διαφορετικό αριθμό loci. Η τιμή AIC για το κυρίαρχο μοντέλο Μέντελ, υπολογίζοντας τρεις πολυγονιδιακή loci ήταν η μικρότερη (6.413,02) σε σύγκριση με τα άλλα μοντέλα υποθέτοντας δύο (AIC = 6441,18) ή τέσσερις (AIC = 6424,61) πολυγονιδιακή τόπους. Επομένως, δεν είναι απίθανο ότι η παρατηρούμενη κατάσταση αποτελείται από πολυγονιδιακή κληρονομικότητα των συνδυασμένων επιπτώσεων των πολλαπλών αλληλομόρφων χαμηλή ευαισθησία διεισδυτικότητα διαχωρισμού δεσπόζει. Τα αποτελέσματα αυτής της μελέτης έτσι παρέχουν ενδείξεις για γενετική ρόλο στην αιτιολογία του καρκίνου των ωοθηκών, δείχνοντας υποστήριξη για Μέντελ κυρίαρχος τρόπος διαχωρισμού της ευαισθησίας στην επιθηλιακού καρκίνου των ωοθηκών.

Συζήτηση

Σας παρουσιάζουμε εδώ τα αποτελέσματα από πολύπλοκη ανάλυση διαχωρισμού των επιδεκτικότητα καρκίνου των ωοθηκών. Αναλύσαμε 1919 γενεαλογία που προέρχονται από την Τζίλντα Radner οικογενή καρκίνο των ωοθηκών Μητρώου (στο παρελθόν ως οικογενής καρκίνου των ωοθηκών Registry) στο Roswell Park Cancer Institute (RPCI), Μπάφαλο, Νέα Υόρκη, ΗΠΑ. Κάθε γενεαλογικό διαπιστώθηκε μέσω επηρεάζεται πρόγονο και λόγω των κριτηρίων ένταξης συζητούνται τα στοιχεία σύμφωνα με τα υλικά και τις μεθόδους παραπάνω, το δείγμα μας ήταν λίγο πιο εμπλουτισμένο με προσβεβλημένα άτομα, ενδεχομένως, περισσότερο από ό, τι θα έχουν παρατηρηθεί σε μη επιλεγμένα δείγματα. Σε αυτή τη μελέτη, περιορίζεται ανάλυση για τα θηλυκά μέλη γενεαλογία αφού ο καρκίνος των ωοθηκών δεν παρουσιάζεται στους άνδρες. Για την επίτευξη αυτού περιοριστική ανάλυση, αντιμετωπίζονται όλα τα αρσενικά ως ανεπηρέαστο και, στη συνέχεια, ρυθμίστε την διεισδυτικότητα για την ευαισθησία στον καρκίνο των ωοθηκών ως μηδέν για τους άνδρες. Για να εκτιμηθεί η υπόθεση της μη οικογενή συνεταιρίζεσθαι, συγκρίναμε την πιθανότητα σποραδικών μοντέλο χωρίς οικογενειακή εξαρτήματα με εκείνο στο οποίο οι παράμετροι τόσο για γονέα-απογόνου και συγγενών-SIB εκτιμήθηκαν. Δεδομένου ότι οι αναλύσεις περιορίζονται μόνο σε γυναίκες, οι παράμετροι γονέα-απογόνου και συγγενών-SIB ερμηνευθεί ως μητέρα-κόρη και αδελφή αδελφή, αντίστοιχα. Το μοντέλο με οικογενή παραμέτρους σύνδεσης που προβλέπεται ταιριάζουν καλύτερα από ό, τι είναι ομόλογό που δεν περιλαμβάνουν την οικογενή εξαρτήματα σύνδεσης. Η καλύτερη εφαρμογή του προτύπου που προβλέπεται ως εκ τούτου απόδειξη της οικογενούς ένωση στην ευαισθησία στον καρκίνο των ωοθηκών

Διερευνήθηκε επίσης ο τρόπος κληρονομικότητας της ευαισθησίας του καρκίνου των ωοθηκών.? αν ήταν σποραδική, του περιβάλλοντος, ή του Mendel. Παρά το γεγονός ότι η παρατηρούμενη συνάθροιση του καθεστώτος στοργή στα σημεία δεδομένων για την οικογενειακή του συνεταιρίζεσθαι και είναι συνεπής με βάση κληρονομιά, θα έπρεπε να αξιολογεί όλους τους σχετικούς πιθανές γενετικές μοντέλα για να εξακριβώσει το πιο πιθανό τρόπο κληρονομικότητας. Υπολογίσαμε τη συχνότητα αλληλόμορφου νόσο παράλληλα με τις παραμέτρους ευαισθησίας και μετάδοσης ανάλογα με τις ειδικές παραδοχή για τα μοντέλα. Επειδή όλα τα μοντέλα υπόθεση που βασίζεται ήταν ιεραρχική στο περιβάλλον, δεδομένου ότι είχαν ένθετα με τον πιο γενικό μοντέλο, που βασίζεται στατιστικά συμπεράσματα μας για τεστ λόγου πιθανοφανειών. Τα δεδομένα μας δείχνουν ότι (i) η σποραδική μοντέλο διαχωρισμού ενός μείζονος γονιδίου με οικογενή ένωση πρέπει να απορριφθούν σε σύγκριση με το γενικό με οικογενή συστατικό (ii) η υπόθεση του Μέντελ μετάδοσης πρέπει να γίνει δεκτή υπέρ της γενικής μετάδοσης, και (iii ) η υπόθεση της μη μετάδοση ενός σημαντικού γονιδίου πρέπει να απορριφθεί όταν συγκρίνεται με τη γενική μετάδοση. Δείξαμε ότι τόσο η σποραδική και περιβαλλοντικές συνθήκες (όχι μοντέλο μετάδοσης) απορρίφθηκαν με ρ-τιμές πολύ λιγότερο από 0.001, ενώ το αυτοσωματικό κυρίαρχο Μέντελ μοντέλο δεν θα μπορούσε να απορριφθεί κατά τον πλέον γενικό μοντέλο (Πίνακας 3).

σε προηγούμενη μελέτη, ανάλυση διαχωρισμού των οικογενειών καρκίνου των ωοθηκών 112 υψηλού κινδύνου διαπίστωσε ότι BRCA1 /2 μεταλλάξεις αντιπροσώπευαν μόνο το ένα μισό του οικογενούς καρκίνου των ωοθηκών (5). Ωστόσο, λίγα ήταν τα στοιχεία που αποδεικνύουν ότι άλλες μεγάλες γονίδια ευαισθησίας υψηλής διεισδυτικότητας καρκίνο των ωοθηκών εξηγήσει την υπολειμματική οικογενή καρκίνο των ωοθηκών [5]. Αν και μη-BRCA1 /2 κίνδυνο για καρκίνο των ωοθηκών και του μαστού μπορεί να μεταδοθεί από διαφορετικούς τρόπους, μια ανάλυση διαχωρισμού των 858 οικογενειών του καρκίνου του μαστού πρώιμης έναρξης ανέφερε μια υπολειμματική δεσπόζει κληρονόμησε κίνδυνο καρκίνου του μαστού, εκτός από τον κίνδυνο που προέρχεται από μεταλλάξεις στο BRCA1 /2. [25]. Στο GRFOCR, BRCA1 /2 μεταλλάξεις βρέθηκαν στο 39% των 137 οικογενειών δοκιμαστεί και MSH2 μεταλλάξεις βρέθηκαν στο 2.6% των 77 οικογενειών δοκιμαστεί [19]. Ο περιορισμένος αριθμός των οικογενειών που δοκιμάζονται αποκλείεται ερευνά την πιθανή επίδραση των γονιδίων BRCA1 /2 μεταλλάξεις στο παρατηρήθηκε κυρίαρχο Μέντελ τρόπος διαχωρισμού του καρκίνου των ωοθηκών στην τρέχουσα μελέτη του 1919 οικογένειες GRFOCR. Παρά τον περιορισμό αυτό, οι έρευνες με τη χρήση του GRFOCR παρέχουν στοιχεία που να υποστηρίζουν μια κυρίαρχη λειτουργία του διαχωρισμού της ευαισθησίας στον καρκίνο των ωοθηκών και τη δυνατότητα των γονιδίων ωοθηκών ευαισθησίας στον καρκίνο εκτός από BRCA1, BRCA2 και MSH2.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική Δήλωση

Η Gilda Radner οικογενή καρκίνο των ωοθηκών μητρώου: Οικογένεια και το ιατρικό ιστορικό και βιολογικό δείγμα πόρων (CIC 95 έως 27) πρωτόκολλο έχει ελεγχθεί και εγκριθεί το IRB Διοικητικό Roswell Park Cancer Institute

τα άτομα της μελέτης και τα χαρακτηριστικά των μελών της οικογένειας.

τα άτομα της μελέτης για τη μελέτη αυτή προήλθαν από την Τζίλντα Radner οικογενή καρκίνο των ωοθηκών μητρώου (στο παρελθόν ως το Αρχείο Καρκίνου οικογενής ωοθηκών). Η Radner οικογενής ωοθηκών Μητρώο Καρκίνου Gilda (GRFOCR) είναι μια αυτο-αναφέρεται Μητρώο των οικογενειών με δύο ή περισσότερες περιπτώσεις καρκίνου των ωοθηκών σε συγγενείς εξ αίματος. Ιδρύθηκε το 1981 στο Roswell Park Cancer Institute από τον Δρ Μ Steven Piver να μελετήσει την επίπτωση της οικογενούς καρκίνου των ωοθηκών [26] – [29]. Η κύρια λειτουργία του Μητρώου είναι να λαμβάνουν πληροφορίες οικογένειά του καρκίνου συνέβαλαν εθελοντικά σε όλες τις Ηνωμένες Πολιτείες από ασθενείς με καρκίνο των ωοθηκών, αναφερόμενος και ανησυχεί τους γιατρούς, αφορούσε γυναίκες, και οι ασθενείς του Roswell Park Cancer Institute (RPCI) Τμήμα Ογκολογίας Γυναικολογικής. Οι στόχοι του μητρώου περιλαμβάνουν (i) τη λήψη λεπτομερών οικογενειακές ιστορίες από άτομα που είναι προφανώς από τις οικογένειες με δύο ή περισσότερες περιπτώσεις καρκίνου των ωοθηκών ή σύνδρομο πιθανώς σχετίζονται με τον καρκίνο των ωοθηκών? (Ii) την τεκμηρίωση μέσω ιατρικά αρχεία και μέσω της αναθεώρησης παθολόγος ιστών η εμφάνιση του καρκίνου? (Iii) τη συλλογή, την επεξεργασία και την αποθήκευση βιολογικών δειγμάτων, όταν είναι δυνατόν, από τους συμμετέχοντες Μητρώο? και (iv) καθιστώντας τις πληροφορίες και τα βιολογικά δείγματα που διατίθενται για την έρευνα στο πλαίσιο επιτροπή δεοντολογίας ενέκρινε ερευνητικών πρωτοκόλλων.

Πρόσληψη των θεμάτων.

Οι συμμετέχοντες Μητρώο που προσλήφθηκαν μέσω εξεταζομένων ή πρόσωπα δείκτη πληρούν τουλάχιστον ένα από τα ακόλουθα κριτήρια: (i) οικογενειακό ιστορικό δύο ή περισσότερων περιπτώσεων καρκίνου των ωοθηκών? (Ii) οικογενειακό ιστορικό μία περίπτωση καρκίνου των ωοθηκών και δύο περιπτώσεις καρκίνου σε οποιοδήποτε άλλο site? (Iii) οικογενειακό ιστορικό τουλάχιστον μία θηλυκή με δύο ή περισσότερες πρωτογενείς όγκους με μία από τις προκριματικές είναι ο καρκίνος των ωοθηκών? (Iv) οικογενειακό ιστορικό δύο ή περισσοτέρων περιπτώσεις καρκίνου με τουλάχιστον μία περίπτωση καρκίνου των ωοθηκών που είναι και το άλλο καρκίνος θεωρείται ότι είναι πρόωρη έναρξη (≤45 ετών). Εκτός από τη συνάντηση τουλάχιστον ένα από τα προηγούμενα κριτήρια, κάθε συμμετέχων είναι υποχρεωμένος να υπογράψετε ένα έντυπο συγκατάθεσης. Τα άτομα που δεν μπορούν να δώσουν τη συγκατάθεσή ως αποτέλεσμα της ψυχικής, πνευματικής ή γνωστικά ελλείμματα αποκλείεται, ωστόσο, όπως θα μπορούσε να εμφανιστεί στο Μητρώο μέσω της συλλογής των δεδομένων οικογενειακή ιστορία, αλλά χωρίς συλλογή βιολογικών δειγμάτων από αυτούς. Θέματα για τη μελέτη αυτή αποτελούνταν από 7669 ενήλικα μέλη από το 1919 διαφορετικές καταγωγές από το GRFOCR. Οι οικογένειες που περιλαμβάνονται στην παρούσα μελέτη αποτελείται από 1412 οικογένειες διαπιστώθηκε να έχουν δύο ή περισσότερες περιπτώσεις καρκίνου των ωοθηκών? 17 οικογένειες με μία περίπτωση καρκίνου των ωοθηκών και δύο περιπτώσεις καρκίνου σε άλλες θέσεις? και 490 οικογένειες στην κατηγορία των προσώπων τα οποία έχουν τουλάχιστον μία θηλυκή με περισσότερα από ένα πρωτογενείς όγκους με μία από τις προκριματικές είναι ο καρκίνος των ωοθηκών ή που έχουν περισσότερες από μία περίπτωση καρκίνου με τουλάχιστον μία περίπτωση είναι ο καρκίνος των ωοθηκών και το άλλο καρκίνο θεωρούνται της πρώιμης έναρξης.

η συλλογή δεδομένων.

τα στοιχεία συλλέγονται μέσω Έντυπα Οικογενειακή Ιστορία συμπληρώνεται από θέματα. Επιπλέον, τα άτομα δώσει άδεια για να απελευθερώσει τα ιατρικά αρχεία και αρχειακές ιστούς (όπου είναι διαθέσιμες). Τόσο η ολοκληρωθεί Οικογενειακής Ιστορίας Μορφή και ανακτώνται ιατρικά αρχεία επανεξετάζεται να εξακριβωθεί η επιλεξιμότητα πριν από τα υποκείμενα που έχουν εισαχθεί στο Μητρώο. Οι πληροφορίες που συλλέγονται σχετικά με τα άτομα που δεν πληρούν τα κριτήρια ένταξης κατά τη στιγμή της συλλογής, δεν έχουν εγγραφεί στο Μητρώο, και είτε καταστρέφονται, τοποθετείται σε ένα ανενεργό κλειδωμένο αρχείο, ή να επιστραφεί στα άτομα κατόπιν αιτήματος. Μετά την επίσημη έναρξη του Μητρώου, τα άτομα παρέχονται με μια επιδημιολογική έντυπο της έρευνας για τη συλλογή λεπτομερών επιδημιολογικών δεδομένων και μια μορφή αιμοδοσίας για τη συλλογή βιολογικού δείγματος. Την άδεια να καλέσει τους συγγενείς Ζητείται επίσης από τους συμμετέχοντες Μητρώο και επιστολή της εισαγωγής αποστέλλονται σε συγγενείς, για τους οποίους έχει χορηγηθεί άδεια να προσκαλέσετε. Κληθείς συγγενείς που δέχονται να συμμετάσχουν καλούνται επίσης να υπογράψετε ένα έντυπο συγκατάθεσης μετά από την οποία καλούνται να συμπληρώσουν εθελοντικά όλα τα απαραίτητα στοιχεία και έντυπα συλλογής βιολογικού δείγματος.

Κατασκευή γενεαλογία.

Με βάση τις πληροφορίες που συλλέγονται μέσω του Family Φόρμα Ιστορία, ιδρύσαμε την οικογένεια και η γενεαλογία της σχέσης του κάθε θέματος. Γενεαλογία που χρησιμοποιούνται σε αυτή τη μελέτη είχαν κατασκευαστεί από τους συγγενείς εξακριβωθεί μέσω εξεταζομένων χρήση κωδικών υπολογιστή γραπτώς και εφαρμόζονται σε SAS [30], όπως μακροεντολές και τα προκύπτοντα καθιερωμένες σχέσεις γενεαλογικό ελέγχθηκαν και διορθώθηκαν για πιθανά σφάλματα χρησιμοποιώντας MADELINE [31] πακέτο λογισμικού. Εφόσον είναι αναγκαίο, εικονική άτομα προστέθηκαν σε οικογένειες με σκοπό τη σύνδεση τους συγγενείς μέσα γενεαλογία, και η κατάσταση αγάπη για τέτοιες κινήσεις άτομα ορίστηκε να λείπουν και έτσι δεν χρησιμοποιήθηκαν στις αναλύσεις. Συνολικά 7669 πραγματικά μέλη γενεαλογία και 6647 συνδέει ομοίωμα άτομα που περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη.

Στατιστική ανάλυση.

Στην παρούσα μελέτη, τα δεδομένα που χρησιμοποιούνται περιλαμβάνονται πληροφορίες σχετικά με (i) το φύλο, (ii ) κατάσταση στοργή ωοθηκών ορίζεται ως πληγείσες, ανεπηρέαστα ή άγνωστο? (Iii) πληροφορίες σχετικά με την κατάσταση αγάπη για άλλα site καρκίνου, όπως του μαστού, του παγκρέατος και της μήτρας /ενδομητρίου, ορίζεται επίσης ότι επηρεάζονται, ανεπηρέαστη ή άγνωστο? και (iv) της οικογένειας /γενεαλογία σχέσεις. Εκτίμηση των κατανομών των τύπων σχέσεων και την κατάσταση των ωοθηκών καρκίνο αγάπη μεταξύ ζευγαριών σχέσης πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση της στατιστικής ανάλυσης για Γενετική Επιδημιολογία (SAGE) PEDINFO πρόγραμμα, έκδοση 5.2 [32]. Παρά το γεγονός ότι οι αναλύσεις περιορίζονται σε θηλυκά μέλη της γενεαλογίας, άνδρες συγγενείς έπρεπε να συμπεριληφθούν για τον καθορισμό των σχέσεων pedigree.

Για να ληφθεί υπόψη για πρόγονο διαπίστωση, διόρθωση διαπίστωση εφαρμόστηκε σε όλα τα διαχωρισμού αναλύσεις κλιματισμού πιθανότητα που έχει κάθε γενεαλογικό για το κατάσταση αγάπη του ατόμου δείκτη.

διαχωρισμός ανάλυση.

για να διερευνήσουν τη λειτουργία της οικογενούς μετάδοσης της ευαισθησίας στον καρκίνο των ωοθηκών, πραγματοποιήσαμε πολύπλοκη ανάλυση διαχωρισμού χρησιμοποιώντας τη μέγιστη μέθοδο πιθανότητα για την εκτίμηση των παραμέτρων σε κάθε των μαθηματικών μοντέλων υπόθεση που βασίζεται εξετάστηκαν. Από την παρουσία μιας κατάστασης BRCA1 ή BRCA2 μετάλλαξη δεν αποκλείει την παρουσία επιπλέον γονίδιο (α) την ευαισθησία που θα μπορούσαν να συμβάλουν στην διεισδυτικότητα της νόσου, η μετάλλαξη θετικοί ασθενείς είχαν ως εκ τούτου, δεν αποκλείονται από την ανάλυση αυτή. Το πρόγραμμα SEGREG της SAGE, έκδοση 5.2 [32] σύμφωνα με το λειτουργικό σύστημα Linux χρησιμοποιήθηκε για να ταιριάζουν σε κάθε μοντέλο. Για κάθε μοντέλο, υποθέτουμε ότι η παρουσία (ή απουσία) του αλληλόμορφου υποτιθέμενη ασθένεια επηρεάζει την ευαισθησία στον καρκίνο των ωοθηκών, και στη συνέχεια εφάρμοσε την οπισθοδρομική πολυπαραγοντική λογιστική μοντέλο για δυαδικό χαρακτηριστικό, όπως περιγράφεται από Karunaratne και Elston [33]. Η προσέγγιση αυτή μας επέτρεψε να περιλαμβάνουν διαθέσιμα συμπαράγοντες του ενδιαφέροντος για τις εντοιχισμένες μοντέλα. Οι εξοπλισμένα μοντέλα υποτεθεί ότι, υπό την αίρεση της φαινότυπο και το μεγαλύτερο είδος της κάθε άτομο που ανήκει σε δύο πυρηνικές οικογένειες, οι πιθανοτήτων για τις δύο πυρηνικές οικογένειες είναι ανεξάρτητες. Ως εκ τούτου, η οριακή πιθανότητα (ή ευαισθησία), που κάθε μέλος γενεαλογικό έχει ένα συγκεκριμένο φαινότυπο είναι η ίδια για όλα τα μέλη που έχουν τις ίδιες αξίες τυχόν συμμεταβλητές στο μοντέλο. Αυτή η ευαισθησία δίνεται από τη σωρευτική aswhere λογιστική συνάρτηση

y

i

είναι ο φαινότυπος κατάσταση αγάπη του

i-th

άτομο?

θ

(i)

είναι η logit της ευαισθησίας για το

i-th

ατόμου η οποία ορίζεται aswhere

β

είναι η παράμετρος βασική γραμμή?

g

είναι η λανθάνουσα γενετική «τύπος» [34] ή «ousiotype» [35]? και

X

είναι η συμμεταβλητή φορέα. Σύμφωνα με ένα σημαντικό μοντέλο τόπου με δύο αλληλόμορφα, Α και Β, Α είναι το αλληλόμορφο ευαισθησίας, οι τρεις τύποι αντιστοιχούν σε γονότυπο g = ΑΑ, ΑΒ ή ΒΒ διαβιβάζονται σύμφωνα με Μέντελ λειτουργία. Οι αντίστοιχες παράμετροι βασικής γραμμής για ευαισθησία είναι τότε Οι παράμετροι μεταδόσεως που αντιπροσωπεύεται όπως στο κάθε μοντέλο είναι οι υπό όρους πιθανοτήτων ότι ένας γονέας ενός δεδομένου γονότυπο μεταδίδει την ευαισθησία αλληλόμορφο Α στους απογόνους [36], [37]. Οι παράμετροι μετάδοσης και η παράμετρος συχνότητας αλληλόμορφου, για το αλληλόμορφο ευαισθησίας εκτιμάται μαζί με τις τρεις βασικές παραμέτρους για επιδεκτικότητα σε κάθε μοντέλο, ανάλογα με την καθορισμένη υπόθεση. Για παράδειγμα, με την παραδοχή του Μέντελ κληρονομικότητα, οι παράμετροι μετάδοσης περιορίζεται σε. Οι ακόλουθες σποραδικές, περιβαλλοντικών και γενετικών μοντέλων εξετάστηκαν στην εκτίμηση του τύπου της οικογενειακής σύνδεσης και πιθανές ενδείξεις μετάδοσης σημαντική επίδραση.

Σποραδικές ή καμία σημαντική μοντέλο γονιδίου. Σε αυτό το μοντέλο, τόσο οικογενειακή ένωση (FA) (δηλαδή ο πατέρας-μητέρα (FM), η μητέρα-απογόνων (MD), ο πατέρας-απογόνων (FO) ή αδελφό (SS)), και η μετάδοση των μεγάλων γονιδίου (MG) (δηλαδή) δεν υποτίθεται. Υπάρχει μόνο μία βασική παράμετρος (δηλαδή), η οποία ερμηνεύεται ως ο φυσικός λογάριθμος των αποδόσεων της ευαισθησίας έναντι μη ευαισθησία σε καρκίνο των ωοθηκών, ελλείψει άλλων παραγόντων.

Σποραδικές μοντέλο με οικογενή ένωση. Το μοντέλο αυτό περιλαμβάνει εκτίμηση των παραμέτρων για την οικογενή συσχέτιση (γονέα-απογόνου (PO) και αδέρφια) απουσία της μετάδοσης ενός σημαντικού γονιδίου. Τρία διαφορετικά μοντέλα – το πρώτο με μόνο παράμετρο γονέα-απογόνου, δεύτερη μόνο με αδέρφια παράμετρο, και το τρίτο με δύο παραμέτρους γονέα-απογόνου και αδέρφια, είχαν τοποθετηθεί

Κύριες γονίδιο χωρίς οικογενειακό μοντέλο σύνδεσης.. Το μοντέλο αυτό προϋποθέτει τη μετάδοση ενός σημαντικού γονιδίου, αλλά χωρίς οικογενειακή ένωση. Εδώ η συχνότητα αλληλόμορφο ευαισθησίας εκτιμάται, ενώ οι παράμετροι μετάδοσης περιορίζεται στο Μέντελ λειτουργία.

Μέντελ μοντέλο συνεπικρατούν με οικογενή ένωση. Αυτό προϋποθέτει τη μετάδοση ενός σημαντικού γονιδίου και οικογενειακό σύνδεση. Σ ‘αυτό και όλα τα μοντέλα Μέντελ εξετάστηκαν σε αυτή τη μελέτη, οι παράμετροι μετάδοσης περιορίστηκαν στο Μέντελ λειτουργία ως. Η συχνότητα αλληλόμορφο, οικογενειακό ή υπολειμματικά ενώσεις, και βασική ευαισθησία, εκτιμήθηκαν σε αυτό και τα άλλα Μέντελ μοντέλα που δοκιμάστηκαν.

Μέντελ κυρίαρχο μοντέλο, το οποίο είναι παρόμοιο με συνεπικρατούν παραπάνω μοντέλο, εκτός από το ότι οι παράμετροι βασικής γραμμής ευαισθησίας για γονότυπους ΑΑ και ΑΒ περιορίζονται ίσες ως

Μέντελ υπολειπόμενο μοντέλο στο οποίο οι παράμετροι βασικής γραμμής ευαισθησίας για γονότυπους ΑΒ και ΒΒ περιορίζεται ίσες μεταξύ τους ως

Μέντελ μοντέλο πρόσθετης στο οποίο περιορίζεται βασική παράμετρος ευαισθησίας για γονότυπο AB να είναι ενδιάμεσο εκείνων των ΑΑ και ΒΒ ως.

Μέντελ μοντέλο μειώνοντας περιλαμβάνει την υπόθεση της μείωσης ευαισθησίας με τις μέγιστες και ελάχιστες ευαισθησία παραμέτρους περιορίζεται σε γονότυποι ΑΑ και ΒΒ, αντίστοιχα, όπως.

Μέντελ αυξάνοντας το μοντέλο είναι η αντίστροφη της ανωτέρω μείωσης το μοντέλο με τις παραμέτρους βασικής γραμμής ευαισθησία περιορίζεται ως

Περιβαλλοντική μοντέλο στο οποίο υποτίθεται καμία μετάδοση του αλληλόμορφου ευαισθησίας. Αυτό είναι ένα μη-Μέντελ μοντέλο μετάδοση κατά την οποία όλες οι πιθανότητες μετάδοσης τίθεται ίση με την συχνότητα αλληλίου ως αλλά και οι τρεις παράμετροι ευαισθησία εκτιμηθεί. Το μοντέλο υποθέτει ότι η παρατηρούμενη οικογενειακή ένωση και ο διαχωρισμός είναι τόσο λόγω καθαρά για να μη μεταδοτικές επιπτώσεις στο περιβάλλον και όχι κάποιο μείζον γονίδιο.

Tau AB δωρεάν μοντέλο στο οποίο οι παράμετροι μετάδοσης για γονότυπους ΑΑ και ΒΒ περιορίζεται σε 1 και 0, αντίστοιχα, ενώ η παράμετρος για την ΑΒ εκτιμάται ακτίνα 0-1 ως.

Γενική μη-Μέντελ μοντέλο στο οποίο υπολογίζονται όλες οι παράμετροι. Ως εκ τούτου, όλα τα άλλα μοντέλα ένθετα στη γενική ή πλήρους μοντέλου και έτσι η γενική μοντέλο χρησιμοποιείται ως βασική γραμμή για να συγκρίνει όλα τα άλλα μοντέλα σε αυτή τη μελέτη.

Η

Στα παραπάνω μοντέλα 3 έως 11 όπου μεγάλες γονίδιο υποτίθεται, υποθέτουμε επίσης ότι οι συχνότητες γονοτύπου είναι Hardy-Weinberg αναλογίες (π.χ.,). Επίσης, επειδή διαπίστωση ήταν μέσω εξεταζομένων, διορθώσαμε για διαπίστωση μεροληψία σε κάθε μοντέλο με κλιματισμό η πιθανότητα κάθε γενεαλογικό σχετικά με την κατάσταση αγάπη του ατόμου δείκτη.

Για τον έλεγχο των διαφόρων υποθέσεων που αντιπροσωπεύεται από τα μοντέλα, που χρησιμοποιούνται για την τεστ λόγου πιθανοφανειών (LRT). Δεδομένου ότι τα μοντέλα είναι ιεραρχική, ελέγξαμε κάθε υπομοντέλο από το γενικό μοντέλο, χρησιμοποιώντας το στατιστικό αποτέλεσμα της δοκιμής υπολογίζεται ως μείον το διπλάσιο της διαφοράς μεταξύ του φυσικού log πιθανότητα του γενικού μοντέλου και ότι το συγκεκριμένο υπομοντέλου. Αυτή η στατιστική είναι ασυμπτωτικά διανέμεται ως κατανομή χι-τετράγωνο με βαθμό ελευθερίας ίσο με τη διαφορά του αριθμού των παραμέτρων εκτιμώνται σε δύο μοντέλα. Χρησιμοποιώντας αυτή τη δοκιμασία, μια σημαντική chi-square δείχνει ότι η υπομοντέλου δοκιμαστεί μπορεί να απορριφθεί στο δεδομένο επίπεδο άλφα, το οποίο σημαίνει ότι η υποτιθέμενη μοντέλο δεν ταιριάζει τα δεδομένα. Για τη σύγκριση των μη ένθετων μοντέλα όπως σποραδικές μοντέλα ή Μέντελ μοντέλα, που χρησιμοποιούνται για τις Akaike Information Criterion (AIC) τιμές [38] για να επιλέξετε την πιο φειδωλή μοντέλο για τα δεδομένα. Το AIC για οποιοδήποτε μοντέλο ορίζεται ως [-2ln (L) 2 (αριθμός των παραμέτρων που υπολογίζεται στο μοντέλο)]. Το μοντέλο με το μικρότερο AIC κρίνεται το μοντέλο καλύτερη τοποθέτηση για τα δεδομένα.