Αφηρημένο

Ιστορικό

O

6-μεθυλγουανίνη-DNA μεθυλοτρανσφεράση (MGMT) είναι ένας από τους πιο σημαντικό ένζυμο επιδιόρθωσης του DNA κατά κοινή καρκινογόνες ουσίες, όπως αλκυλικό και τον καπνό. Η ανώμαλη μεθυλίωση προαγωγέα του γονιδίου παρατηρείται συχνά σε μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC). Ωστόσο, η σημασία της επιγενετική αδρανοποίηση του γονιδίου σε NSCLC δημοσιευθεί στη βιβλιογραφία έδειξαν inconsistence. Εμείς ποσοτικά τη συσχέτιση μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC χρησιμοποιώντας μια μέθοδο μετα-ανάλυση.

Μέθοδοι

συστηματικά επανεξεταστεί μελέτες του

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC στο PubMed, EMBASE, Οβίδιος, ISI Web of Science, Elsevier και CNKI βάσεις δεδομένων και ποσοτικά τη σχέση μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC χρησιμοποιώντας τη μέθοδο μετα-ανάλυση. αναλογία πιθανοτήτων (OR) και το αντίστοιχο 95% διάστημα εμπιστοσύνης (CI) υπολογίστηκαν για την αξιολόγηση της αντοχής του συνεταιρίζεσθαι. Πιθανές πηγές ετερογένειας αξιολογήθηκαν με ανάλυση υποομάδας και μετα-παλινδρόμησης.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 18 μελετών 2001-2011, με 1, 160 καρκινικών ιστών και 970 μάρτυρες, συμμετείχαν στην η μετα-ανάλυση. Οι συχνότητες του

MGMT

προώθηση μεθυλίωση κυμαίνονταν από 1,5% έως 70,0% (μέσος όρος 26,1%) σε NSCLC ιστό και 0,0% έως 55,0% (μέσος όρος 2,4%) σε μη-καρκινικές ελέγχου, αντίστοιχα. Η περίληψη της OR ήταν 4,43 (95% CI: 2,85, 6,89) στο μοντέλο τυχαίων δράσεων. Με διαστρωμάτωση με πιθανή πηγή της ετερογένειας, η Ή ήταν 20,45 (95% CI: 5.83, 71.73) σε ετερογενή υποομάδα ελέγχου, ενώ ήταν 4,16 (95% CI: 3,02, 5,72) σε αυτόλογη υποομάδα ελέγχου. Το OR ήταν 5,31 (95% CI: 3,00, 9,41) σε MSP υποομάδα και 3,06 (95% CI: 1,75, 5,33) σε Q-MSP υποομάδα

Συμπέρασμα

Αυτή η μετα-ανάλυση. εντόπισε μια ισχυρή συσχέτιση μεταξύ μεθυλίωσης του

MGMT

γονιδίου και NSCLC. Προοπτικές μελέτες θα πρέπει να απαιτείται να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα στο μέλλον

Παράθεση:. Gu C, Lu J, Cui Τ, Lu C, Shi H, Xu W, et al. (2013) Σύνδεσης μεταξύ

MGMT

Ανάδοχος μεθυλίωση και μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (9): e72633. doi: 10.1371 /journal.pone.0072633

Επεξεργαστής: Raffaele Μια Calogero, Πανεπιστήμιο του Τορίνο, Ιταλία

Ελήφθη: 12 Ιουνίου, 2013? Αποδεκτές: 18 του Ιούλ 2013? Δημοσιεύθηκε: 26 Σεπτέμβρη 2013

Copyright: © 2013 Gu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

καρκίνου

πνεύμονα είναι η κύρια αιτία της παγκόσμιας θανάτων από καρκίνο. κατά τις τελευταίες δεκαετίες [1]. Ανθρώπινα καρκίνο του πνεύμονα περιέχει δύο ιστολογικών τύπων, μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (SCLC) και μη μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC). Η τελευταία περιλαμβάνει την πλειονότητα του καρκίνου του πνεύμονα και έχει μια αυξανόμενη επίπτωση και τη θνησιμότητα κατά τις δύο τελευταίες δεκαετίες σε όλο τον κόσμο. Η μεθυλίωση του DNA είναι μια επιγενετική τροποποίηση του γονιδιώματος και μεθυλίωσης συνδέονται με φίμωση μπορεί να επηρεάσει τα γονίδια έκφρασης σε κυτταρικές οδούς [2]. Οι επιγενετικές αλλαγές είναι νωρίς και συχνά γεγονότα συνέβησαν στην καρκινογένεση. O

6-μεθυλγουανίνη-DNA μεθυλο-τρανσφεράση (MGMT) είναι μια πρωτεΐνη αντιστροφή της βλάβης του DNA έναντι σχηματισμού προϊόντος προσθήκης DNA από τις καρκινογόνες ουσίες [3,4]. Μπορεί να προστατεύσει τα κύτταρα από τις καρκινογόνες επιπτώσεις των παραγόντων αλκυλιώσεως αφαιρώντας προσαγωγές από την O

6 η θέση της γουανίνης [5]. Ως εκ τούτου, η ικανότητα επιδιόρθωσης της πρωτεΐνης MGMT βοηθά να μειώσετε την πιθανότητα ώστε το κατεστραμμένο γουανίνη γίνεται μεταλλαξιογόνες ιστοσελίδα. Η μεθυλίωση του

MGMT

γονίδιο υποκινητή της έχει συνδεθεί με την απώλεια ή μείωση του

MGMT

έκφρασης σε ιστούς όγκων διαφόρων καρκίνων, συμπεριλαμβανομένων των όγκων του πνεύμονα [6-8].

Στο σύνολό μαζί, μεθυλίωση του

MGMT

γονίδιο έχει θεωρηθεί ως δυνητικά χρήσιμο υποψήφιο βιοδείκτη για την έγκαιρη ανίχνευση του καρκίνου του πνεύμονα. Πολλές μελέτες είχαν δείξει επίσης ότι η μεθυλίωση του γονιδίου μπορεί να βρεθεί σε κλινικά δείγματα, όπως ιστοί, ορό και υγρό βρογχοκυψελικής πλύσης (BALF) του NSCLC [9-11].

Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να καταλαβαίνουν τη διαφορά του επιπολασμού της ανώμαλης μεθυλίωσης υποστηρικτής του

MGMT

στον NSCLC ιστού από τον έλεγχο. Πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση χρησιμοποιώντας τα διαθέσιμα δεδομένα στη βιβλιογραφία επί τη βάσει των

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC να προσδιορίσει καλύτερα τη σχέση μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC.

Υλικά και Μέθοδοι

κριτήρια επιλογής και αναζήτησης μελέτη

Ψάξαμε τις ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων σε απευθείας σύνδεση, συμπεριλαμβανομένων Pubmed, EMBASE, Οβίδιος, ISI Web of Science, Elsevier και η βάση δεδομένων CNKI, χρησιμοποιώντας τους όρους αναζήτησης «

MGMT

«,» NSCLC «και» μεθυλίωσης «. Η ακόλουθη στρατηγική αναζήτησης διεξήχθη στο Pubmed «NSCLC» (MESH), «μεθυλίωση» και «

MGMT

ή O

6-μεθυλγουανίνη-DNA μεθυλο-τρανσφεράση» για τη συλλογή επιλέξιμες άρθρα. Η αναζήτηση περιορίστηκε σε άρθρα που έχουν δημοσιευτεί στα αγγλικά και στα κινεζικά. Παρόμοιες έρευνες διεξήχθησαν σε άλλες βάσεις δεδομένων. Η αναζήτηση ενημερώθηκε μέχρι την 1η Ιουνίου 2013.

Οι μελέτες που επιλέχθηκαν έπρεπε να πληρούν τα ακόλουθα κριτήρια: (α) Η μελέτη ήταν περίπου

MGMT

μεθυλίωση και NSCLC. (Β) Οι συγγραφείς προσέφερε ένα μέτρο της σύνδεσης είτε ως εκτίμηση αποτελέσματος με 95% CI και OR, ή επαρκή στοιχεία στο αρχικό άρθρο για τον υπολογισμό του. (Γ)

MGTM

κατάσταση μεθυλίωσης εξετάστηκε χρησιμοποιώντας μεθυλίωσης-ειδική PCR (MSP) ή πραγματικού χρόνου ποσοτική MSP (Q-MSP). (Δ) Τα δείγματα των NSCLC χειρουργικά σεβαστή πρωτογενές δείγμα όγκου και το στυλ του ελέγχου που αποτελείται από πλάσμα ή μη-καρκινικούς ιστούς των πνευμόνων (NLT) συμπεριλαμβανομένων των αυτόλογων ελέγχου και ετερογενή έλεγχο.

Οι μελέτες είχαν εξαιρεθεί σύμφωνα με τα ακόλουθα κριτήρια : (α) Η μελέτη δεν παρείχε πληροφορίες ελέγχου. (Β) Τα άρθρα αυτά επαναλαμβανόμενα αναφέρονται, (γ) Τα είδη ερεύνησαν χρωμικό καρκίνο του πνεύμονα, εγκεφαλικές μεταστάσεις των καρκίνων του πνεύμονα και κακόηθες μεσοθηλίωμα υπεζωκότα [7,12,13]. Πρώτον, αξιολογείται κατά πόσον μια μελέτη που πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης με τίτλο και την περίληψη των αρχικών άρθρων αναζήτηση. Στη συνέχεια, όλοι οι εν δυνάμει σχετικά άρθρα αξιολογήθηκαν από την πρόσβαση σε χαρτί πλήρους κειμένου. Η διαδικασία επιλογής των μελετών απεικονίζονται στο διάγραμμα ροής δήλωση (Σχήμα 1).

Η

Αφαίρεση των δεδομένων και Αξιολόγησης της Ποιότητας

Όλα τα δεδομένα ανεξάρτητα αντλείται από τρεις συγγραφείς (Changmei Gu, Cheng Lu, και Hao Shi) με τη χρήση τυποποιημένων εντύπων δεδομένων εκχύλισης. Για κάθε μελέτη, τα ακόλουθα χαρακτηριστικά εξήχθησαν: πρώτο συγγραφέα όνομα, έτος δημοσίευσης, τη χώρα μελέτη, την εθνικότητα, την ηλικία, το μέγεθος του δείγματος, το είδος του ελέγχου, της μεθόδου για την μεθυλίωση ανίχνευσης, και το καθεστώς των

MGMT

μεθυλίωσης συλλέχθηκαν με τη χρήση τυποποιημένων εντύπων εξόρυξη δεδομένων. Αν υπήρχαν διαφωνίες, συζητήσαμε με Meixia Lu και Jiachun Lu επανειλημμένα, μέχρι να επιτευχθεί συναίνεση. Για να εξασφαλιστεί η διαφάνεια και πλήρη αναφορά αυτής της μετα-ανάλυσης, σχεδιάσαμε και ελέγχονται επιλεγμένες μελέτες σύμφωνα με τα στοιχεία που Προτεινόμενα Πληροφόρησης για συστηματικές ανασκοπήσεις και μετα-αναλύσεις (PRISMA) [14] δήλωση.

Στατιστικές Μέθοδοι

Οι εξόχως απόκεντρες περιοχές και 95% ΚΠ ήταν αντλούμενου ή υπολογίζεται να αξιολογήσει την αντοχή της σύνδεσης μεταξύ των

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και του κινδύνου NSCLC. Περίληψη του ή αποκτήθηκε από όλες τις μελέτες ή υπολογίζονται με τα δεδομένα σε επιλεγμένες μελέτες.

Εμείς, στη συνέχεια, διερευνήθηκε μεταξύ μελετών ετερογένεια από τη χρήση της δοκιμής Q Cochran με επίπεδο σημαντικότητας

P

αξία λιγότερο από 0,1 και ετερογένεια εξετάστηκε επίσης χρησιμοποιώντας το

I

2 στατιστική [15], το οποίο είναι ένα ποσοτικό μέτρο της ασυνέπειας μεταξύ των μελετών. Εάν

I

2 & gt? 50% ή

P

& lt? 0.1 θεωρείται ως μέτρο της σοβαρής ετερογένεια, τότε το μοντέλο τυχαίων επιδράσεων χρησιμοποιήθηκαν για τον υπολογισμό περίληψη ή σύμφωνα με τη μέθοδο Der-Simonian Laird? Αλλιώς, το μοντέλο σταθερών επιδράσεων (μέθοδος Matel-Haenszel) εφαρμόστηκε [16]. τ

2 χρησιμοποιήθηκε για να καθορίσει πόσο ετερογένεια εξηγείται από τις διαφορές υποομάδα. Η μετα-παλινδρόμησης έγινε για να εξερευνήσετε την πηγή της ετερογένειας με βάση την εθνότητα (Ασίας και του Καυκάσου), το έτος δημοσίευσης, το στυλ του ελέγχου (αυτογενής ή ετερογενής), η μέθοδος (MSP ή Q-MSP), και το μέγεθος του δείγματος. Αναλύσεις υποομάδων έγιναν ανάλογα με την εθνικότητα (Ασίας και του Καυκάσου), το στυλ έλεγχο (αυτογενής ή ετερογενείς) και η μέθοδος ανίχνευσης μεθυλίωσης (MSP ή Q-MSP) στην εξέταση της πηγής της ετερογένειας. αναλύσεις ευαισθησίας διεξήχθησαν επίσης να αξιολογήσει τις εισφορές κάθε μελέτη σχετικά με το συνολικό αποτέλεσμα με την παράλειψη μια μελέτη σε μια στιγμή. Η ασυμμετρία οικόπεδο χοάνη χρησιμοποιήθηκε για να αξιολογήσει την απόδειξη της μεροληψίας δημοσίευση. δοκιμή Πέτρου εφαρμόστηκε για να αξιολογηθεί ποσοτικά τις αποδείξεις για μεροληψία δημοσίευση [17]. Fail-safe αριθμό (Ν

fs) που εγκρίθηκε από Rosenthal [28] θεωρείται ότι είναι ένας χρήσιμος δείκτης της κλίνει [18]. Η μέθοδος μετα-τελειώματα χρησιμοποιήθηκε για την εκ νέου εκτίμηση του μεγέθους αποτέλεσμα όταν υπήρχε δυνατή προκατάληψη. Όλα

P τιμές

δύο-ουρά με ένα σημαντικό επίπεδο στο 0,05. Σε οικόπεδο δάσος εμφανίζεται στο Σχήμα 2, το μέγεθος του πλαισίου για κάθε μελέτης ήταν αντιστρόφως ανάλογη με την διακύμανση του σχετικού κινδύνου ημερολόγιο, και οι οριζόντιες γραμμές αντιπροσωπεύουν το 95% CI.

Η

Όλες οι στατιστικές αναλύσεις διεξάγεται με τη χρήση της Meta πακέτο (έκδοση 2,2 – 1) στο R (έκδοση 3.0, https://www.r-project.org/).

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά Μελέτη

Η ηλεκτρονική αναζήτηση διαπίστωσε ότι 145 δυνητικά σχετικές μελέτες είχαν αρχικά εντοπιστεί. Οι μελέτες αυτές υποβλήθηκαν σε περαιτέρω διαλογή με βάση κριτήρια συμπερίληψης και αποκλεισμού. Συνολικά 18 μελέτες (2001-2011) συμπεριλήφθηκαν στην ανάλυση (Σχήμα 1). Σε αυτές τις μελέτες, 6 μελέτες διεξήχθησαν στην Ασία (1 στην Ιαπωνία και 5 στην Κίνα) και τα υπόλοιπα 11 ήταν στις ΗΠΑ και 1 στην Ολλανδία.

Μεταξύ των 18 ανακτηθεί μελέτες, 14 μελέτες χρησιμοποίησαν methylation- συγκεκριμένες αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (MSP) και 4 μελέτες χρησιμοποίησαν σε πραγματικό χρόνο ποσοτική MSP (Q-MSP) να διερευνήσει

MGMT

μεθυλίωση σε NSCLC ιστό και τον έλεγχο. Υπήρχαν δύο μορφές ελέγχου, συμπεριλαμβανομένων αυτογενής ελέγχου (στους ιστούς από τους ίδιους τους ασθενείς) και ετερογενείς ελέγχου (δηλ Plasma, ιστός, και βρογχοκυψελιδική πλύση υγρό από άλλα άτομα). Τα κύρια χαρακτηριστικά αυτών των μελετών παρουσιάζονται στον Πίνακα 1.

Gender

Patients

Control

Control

Control

Study

Year

Country

Ethnicity

M/F

Age (x)

Method

M+/N

M+/N

style

source

Zochbauer[19]2001USACaucasian76/3128-81MSP22/1070/104AtissueBrabender[20]2003USACaucasian68/2263.3Q-MSP34/9016/90AtissueBrabender[20]2003USACaucasianNANRQ-MSP34/900/10HtissueGuo[9]2004USACaucasianNA42-83MSP14/201/15AtissueGuo[9]2004USACaucasianNA42-83MSP14/2011/20ABALFTopaloglu[21]2004USACaucasianNANAQ-MSP12/317/31AtissueRusso[22]2005USACaucasianNANAMSP18/336/33AserumSafar[23]2005USACaucasianNA67MSP4/321/32AtissueVallbohmer[24]2006USACaucasian69/2263MSP35/9116/91AtissueYanagawa[25]2007JapanAsian72/2939-86MSP14/1012/101AtissueBelinsky[26]2007USACaucasian49/2337-80MSP11/724/72AserumFeng[27]2008USACaucasian24/2364.3MSP4/491/49AtissueLin[28]2009ChinaAsianNANAMSP1/670/14HtissueDe Jong[29]2009NECaucasianNA40-70Q-MSP1/100/18HtissueLiu[30]2010ChinaAsian58/4032-68MSP31/980/98HtissueJin[31]2010ChinaAsian83/1132-75MSP16/942/94AtissueZhang[32]2011ChinaAsian58/2035-80MSP4/782/78AtissueHang[33]2011ChinaAsian64/3233-70MSP26/770/20HtissueTable 1. Χαρακτηριστικά των μελετών που περιλαμβάνονται σε αυτό το μετα-ανάλυση

Σύντμηση: Α:. Έλεγχος Autologos (τον έλεγχο από τους ίδιους τους NSCLC)? BALF: βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα? Η: ετερογενείς ελέγχου (ο έλεγχος από άλλα άτομα, συμπεριλαμβανομένου του ορού, βρογχοκυψελιδικό έκπλυμα ή ιστού)? Μ +: Ο αριθμός των μεθυλίωση? MSP: μεθυλίωσης αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης-ειδική? Ν: αριθμός των συνολικών? NA: Δεν ισχύει? ΒΑ: Ολλανδία? Q-MSP: πραγματικού χρόνου ποσοτική αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης μεθυλίωσης-ειδικά CSV Λήψη CSV

Υπάρχουν 1, 160 NSCLC ιστούς όγκων και 970 μάρτυρες. Οι συχνότητες του

MGMT

προώθηση μεθυλίωση κυμαίνονταν από 1,5% έως 70,0% (διάμεσος 26,1%) σε NSCLC ιστό και 0,0% έως 55,0% (διάμεσος 2,4%) σε μη-καρκινικές ελέγχου, αντίστοιχα, η οποία έδειξε την μεθυλίωση συχνότητα σε καρκινικό ιστό ήταν πολύ υψηλότερη από ότι στην ομάδα ελέγχου. Σύμφωνα με το μοντέλο τυχαίων δράσεων, η συγκεντρωτική ή του

MGMT

μεθυλίωση σε NSCLC ιστό ήταν 4,43 (95% CI: 2,85, 6,89), σε σύγκριση με την ομάδα ελέγχου (Σχήμα 2)

. μετα-παλινδρόμησης και αναλύσεις υποομάδων

Λαμβάνοντας υπόψη την ύπαρξη της ετερογένειας στη μετα-ανάλυση (

I

2 = 32,0%,

P

= 0. 095) , η μετα-παλινδρόμησης έγινε για την εξεύρεση της πηγής της ετερογένειας. Η περιορισμένη μέγιστη τροποποίηση πιθανότητας χρησιμοποιήθηκε για την εκτίμηση των διακυμάνσεων της μελέτης. Καθώς ο περιορισμός στην πρόσβαση σε ανεπεξέργαστα δεδομένα, υποθέτουμε η πηγή της ετερογένειας μπορεί να εμφανιστεί από το έτος δημοσίευσης, την εθνικότητα, τον τύπο του ελέγχου, τη μέθοδο ανίχνευσης και το μέγεθος του δείγματος. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι πηγές της ετερογένειας ήταν το ύφος του ελέγχου (

P

= 0.073) και η μέθοδος ανίχνευσης (

P

= 0,094). Άλλοι παράγοντες, όπως το μέγεθος του δείγματος, το έτος δημοσίευσης, και η εθνικότητα δεν μπορούσε να εξηγήσει την ετερογένεια (Πίνακας 2).

Η

Η 95% CI

Η ετερογένεια sources

Coefficients

Z

Lower

Upper

P

Year-0.1964-1.4009-0.47120.07840.161Control1.45011.7915-0.13643.03650.073Ethnicity0.94851.3741-0.40442.30150.169Method-0.8260-1.6752-1.79250.14040.094Sample size0.00140.4581-0.00460.00750.065Table 2. Μικτή επιπτώσεις μοντέλο ανάλυσης μετα-παλινδρόμησης.

CSV Λήψη CSV

Με αυτές τις παρατηρήσεις, πραγματοποιήσαμε υποομάδες ανάλυσης βασισμένες στο στυλ έλεγχο και τη μέθοδο ανίχνευσης. Η Ή στην ετερογενή υποομάδα ελέγχου ήταν 20,45 (95% CI: 5,83, 71,73? Μοντέλο σταθερών επιδράσεων), ενώ ήταν 4,16 (95% CI: 3.02,5.72? Μοντέλο σταθερών επιδράσεων) στη αυτόλογη υποομάδα ελέγχου.

I

2 άλλαξε σε 16,6% και 34,0% σε αυτές τις υποομάδες, αντίστοιχα, σε σύγκριση με το 32% του συνόλου. Διαστρωμάτωση από το στυλ του ελέγχου έδειξαν ότι το Ή στην ετερογενή υποομάδα ελέγχου ήταν υψηλότερη από ότι στην αυτόλογη υποομάδα ελέγχου. Μετά τη στρωματοποίηση με τη μέθοδο ανίχνευσης, το OR ήταν 5,31 (95% CI: 3,00, 9,41? Μοντέλο τυχαίων επιδράσεων) στη MSP υποομάδα και 3,06 (95% CI: 1,75, 5,33? Σταθερών επιδράσεων μοντέλο) στο Q-MSP υποομάδα (Πίνακας 3).

η Tumor

Ελέγχου

ΜΗ συγκεντρώνονται ή

β

D + L συγκεντρώνονται ή

α

ετερογένεια

η Ομάδα

Μ +

Ν

Μ +

Ν

OR (95% CI)

OR (95% CI)

I

2 (%)

P

Η τ

2

Ελέγχου groupAuologous202 818.698.104,16 (3,02, 5,72) 3,74 (2,54, 5,51) 16.60.2760.080Heterogeneous 93 342 016.020,45 (5.83, 71.73) 11.18 (2.14, 58.35 ) 34.00.1941.208EthnicityAsian 92 515 640.510,96 (5.20, 23.14) 7.36 (2.33, 23.19) 45.10.1050.8807Caucasian203 645.635.654,00 (2,85, 5,60) 3,49 (2,37, 5,14) 8.90.3580.0418MethodMSP214 939.468.216,17 (4,28, 8,91) 5,31 (3,00, 9,41 ) 40.20.0600.4155Q-MSP 81 221.231.493,06 (1,75, 5,33) 2,84 (1,62, 5,00) 0.00.674 & lt? 0.0001Total2951160699705.10 (3,77, 6,91) 4,43 (2,85, 6,89) 32.00.0950.2476Table 3. η ανάλυση των υποομάδων του συλλόγου μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC

D + L συγκεντρώνονται ή

α:. το αποτέλεσμα από τυχαία εφέ μοντέλο? ΜΗ συγκεντρώνονται ή

b: το αποτέλεσμα από σταθερό επιπτώσεις μοντέλο. CSV Λήψη CSV

Ανάλυση ευαισθησίας

Για τον προσδιορισμό των επιπτώσεων της παραλείποντας μία μεμονωμένη μελέτη σε έναν χρόνο στο συνολικό αποτέλεσμα, πραγματοποιήθηκε η ανάλυση ευαισθησίας. Η παράλειψη μιας μελέτης αλλάξει η συνολική Ή από 3,85 (95% CI: 2,66, 5,56) σε 4,87 (95% CI: 2,96, 8,02) χρησιμοποιώντας το τυχαία εφέ μοντέλο, το οποίο απέδειξε ότι δεν υπήρχε ενιαία ανάλυση ευαισθησίας (Σχήμα 3) .

η

προκατάληψη δημοσίευση

Ένα οικόπεδο χοάνη της κατάστασης μεθυλίωσης του όγκου έναντι του ελέγχου έδειξαν ότι υπήρχαν δύο μελέτες υπερβαίνει τα όρια εμπιστοσύνης 95%, όπως φαίνεται στο Σχήμα 4. Ωστόσο, καμία δημοσίευση προκατάληψη ανιχνεύθηκε με τη χρήση της δοκιμής του Πέτρου (

P

= 0,624). Χρησιμοποιήσαμε επίσης μια ασφαλή από αστοχία αριθμό (Ν

fs) για να εκτιμηθεί η αποτελεσματικότητα της μετα-ανάλυσης (

Z

= 45.63, Ν

fs0. 05 = 756.12, Ν

fs0. 01 = 365,52), η οποία έδειξε μια μικρή προκατάληψη δημοσίευση στην μετα-ανάλυση.

Κάθε κοίλο σημείο αντιπροσωπεύει μια ξεχωριστή μελέτη για την υποδεικνυόμενη ένωση. Η περιοχή του κοίλου σημείο αντανακλά το βάρος (αντίστροφο της διακύμανσης). Οριζόντια γραμμή αντιπροσωπεύει το μέσο μέγεθος της επίδρασης.

Η

Συζήτηση

Η ανώμαλη μεθυλίωση των περιοχών υποκινητή των γονιδίων επιδιόρθωσης του DNA είναι ένα σημαντικό γεγονός στο σχηματισμό και την εξέλιξη του καρκίνου. Το συμπέρασμα ήταν ότι τα γονίδια μεθυλίωση ήταν πιθανώς μια νέα γενιά του καρκίνου του βιοδείκτη [34]. Επιγενετική μεταβολή των CpG νησίδων στην περιοχή του υποκινητή του γονιδίου είναι ένας σημαντικός λόγος για τη δυσλειτουργία του γονιδίου [35], η οποία μπορεί να οδηγήσει στην μεταγραφή του γονιδίου κάτω ή σταματά [36].

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού είναι πολύ κοινό στην πρωτογενή NSCLC, η οποία έχει αναφερθεί σε μερικές μελέτες. Ωστόσο, τα αποτελέσματα για τη σχέση μεταξύ της κατάστασης του

MGMT

μεθυλίωση και NSCLC ήταν ασυνεπής. Οι Ή τιμές κυμάνθηκαν από 0,65 [28] για να 114.98 [24], έτσι ώστε να πραγματοποιηθεί αυτό το μετα-ανάλυση για να προσδιοριστεί η σχέση μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC.

Ένα σύνολο των 18 μελετών συμπεριλαμβανομένων των 1, 160 καρκινικών ιστών και 970 μάρτυρες που εμπλέκονται στη μετα-ανάλυση. Οι συχνότητες του

MGMT

προώθηση μεθυλίωση κυμαίνονταν από 1,5% έως 70,0% (διάμεσος? 26,1%) σε NSCLC ιστό και 0,0% έως 55,0% (διάμεσος? 2,4%) σε μη-καρκινικές ελέγχου, αντίστοιχα. Τα ευρήματα έδειξαν ότι η συχνότητα της μεθυλίωσης σε καρκινικό ιστό ήταν πολύ υψηλότερη από ότι στην ομάδα ελέγχου.

MGMT

μεθυλίωση είχαν αυξημένο κίνδυνο στον ιστό του όγκου (OR = 4,43? 95% CI: 2,85, 6,89) σε σύγκριση με μη καρκινικά δείγματα συμπεριλαμβανομένου του πλάσματος, των ιστών, και υγρό βρογχοκυψελικής πλύσης. Αυτό το εύρημα ήταν συνεπές με άλλες μελέτες [10,25]. Επιπλέον, η ανάλυση υποομάδας του στυλ έλεγχος έδειξε ότι μια Ή ήταν 20,45 (95% CI: 5,83, 71,73? Σταθερών επιδράσεων μοντέλο) στην ετερογενή υποομάδα ελέγχου στίχο 4,16 (95% CI: 3,02, 5,72? Τυχαίων δράσεων μοντέλο) στο αυτόλογους ιστούς υποομάδα, υποδεικνύοντας ότι η OR μεθυλίωσης σε ετερογενή ομάδα ελέγχου ήταν υψηλότερη από ότι στην αυτόλογη ομάδα ελέγχου. Πρότεινε ότι

μεθυλίωση MGMT

υποκινητή του γονιδίου ήταν ένα συχνό συμβάν σε NSCLC, αλλά σπάνια συνέβη στην ομάδα μη-όγκου. ανάλυση στρωματοποίησης με διαφορετικές μεθόδους ανίχνευσης μεθυλίωσης έδειξε ότι η OR για την υποομάδα MSP ήταν υψηλότερη από εκείνη για την Q-MSP υποομάδα.

Η ανάλυση ευαισθησίας πραγματοποιήθηκε για τον προσδιορισμό των επιπτώσεων, όταν παραλείποντας μία μεμονωμένη μελέτη σε έναν χρόνο για το συνολικό αποτέλεσμα. Τα αναλυτικά αποτελέσματα έδειξαν ότι καμία μελέτη θα μπορούσε να επηρεάσει την συνοψίζονται Ή. Επιπλέον, το σχήμα του οικοπέδου χοάνη δεν έδειξε κανένα αποδεικτικό στοιχείο της πλοκής χοάνη ασυμμετρίας και καμία προκατάληψη δημοσίευση ανιχνεύθηκε.

Η τρέχουσα μετα-ανάλυση έχει κάποιους περιορισμούς. Πρώτον, η προκατάληψη επιλογής είναι αναπόφευκτη, λόγω της στρατηγικής περιορίζεται σε άρθρα που έχουν δημοσιευτεί στα αγγλικά ή στα κινέζικα. Δεύτερον, αν και οι συνολικές διαστάσεις του δείγματος στη μετα-ανάλυση δεν ήταν πάνω από 1, 000, τα αποτελέσματα ίσως εξακολουθούν να μην έχουν έντονη ισχύ. Τρίτον, δεν είχαμε μελετήσει την κατάσταση μεθυλίωσης σε ιστολογικές υποτύπους, το κάπνισμα και τα διάφορα κλινικά στάδια, λόγω του περιορισμού των ανεπαρκών πρώτων υλών.

Εν κατακλείδι,

MGMT

γονίδιο είναι ένα σημαντικό γονίδιο επιδιόρθωσης του DNA σε διατήρηση της ακεραιότητας του γονιδιώματος. Παρεκκλίνουσα

MGMT

μεθυλίωση του υποκινητή μπορεί να συνδέεται με την εμφάνιση και την ανάπτυξη των NSCLC. Αυτή η μετα-ανάλυση εντόπισε μια ισχυρή συσχέτιση μεταξύ

MGMT

μεθυλίωση προαγωγού και NSCLC. Προοπτικές μελέτες θα πρέπει να απαιτείται να επιβεβαιωθούν τα αποτελέσματα στο μέλλον.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου.

doi: 10.1371 /journal.pone.0072633.s001

(DOCX)