Αφηρημένο

Ιστορικό

CHL1

γονίδιο (επίσης γνωστή ως

ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ

) για 3p26.3 κωδικοποιεί ένα one-pass trans-κυτταρική μεμβράνη μόριο προσκόλλησης (CAM). Προηγουμένως CAMs αυτού του τύπου, συμπεριλαμβανομένων των L1, είχαν αποδειχθεί ότι εμπλέκονται στην ανάπτυξη του καρκίνου και μετάσταση.

Μεθοδολογία /Principal Εκτίμηση

Χρησιμοποιήσαμε Clontech Cancer Profiling Arrays (19 διαφορετικά είδη καρκίνων, 395 δείγματα) για την ανάλυση της έκφρασης του

CHL1

γονίδιο. Τα αποτελέσματα περαιτέρω επικυρωθεί από RT-qPCR μαστού, νεφρών και τον καρκίνο του πνεύμονα. Καρκίνος προφίλ Arrays αποκάλυψε διαφορική έκφραση του γονιδίου: κάτω ρύθμιση /φίμωση στην πλειοψηφία των πρωτοπαθών όγκων και αυξητική ρύθμιση που σχετίζεται με επεμβατικές /μεταστατική ανάπτυξη. Συχνή κάτω ρύθμιση (& gt? 40% των περιπτώσεων) ανιχνεύθηκε σε 11 τύπους καρκίνου (του μαστού, του νεφρού, του ορθού, του παχέος εντέρου, του θυρεοειδούς, του στομάχου, του δέρματος, του λεπτού εντέρου, της ουροδόχου κύστης, του αιδοίου και του καρκίνου του παγκρέατος) και συχνές ανοδική ρύθμιση ( & gt? 40% των περιπτώσεων) – σε 5 τύπους (πνεύμονα, των ωοθηκών, της μήτρας, του ήπατος και τραχεία) του καρκίνου. Χρησιμοποιώντας πραγματικού χρόνου ποσοτική PCR (RT-qPCR) βρήκαμε ότι

CHL1

έκφραση μειώθηκε σε 61% του μαστού, το 60% του πνεύμονα, το 87% των κυττάρων και σαφών 89% θηλώδες δειγμάτων καρκίνου νεφρού (

P

& lt? 0,03 για όλες τις περιπτώσεις). Υπήρξε μια υψηλότερη συχνότητα

CHL1

mRNA μείωση του πνεύμονα πλακώδους καρκινώματος σε σύγκριση με το αδενοκαρκίνωμα (81% έναντι 38%,

P

= 0,02), χωρίς σύνδεση με την εξέλιξη του όγκου.

Συμπεράσματα /Σημασία

Τα αποτελέσματά μας πρότεινε ότι

CHL1

εμπλέκεται στην ανάπτυξη διαφόρων ανθρώπινων καρκίνων. Αρχικά, κατά τη διάρκεια της πρωτογενούς ανάπτυξης του όγκου

CHL1

θα μπορούσε να λειτουργήσει ως ένα υποθετικό ογκοκατασταλτικό και σιγήσει για τη διευκόλυνση

in situ ανάπτυξη

όγκου για 11 τύπους καρκίνου. Προτείναμε επίσης ότι η εκ νέου έκφραση του γονιδίου στην άκρη της μάζας του όγκου μπορεί να προωθήσει την τοπική επεμβατική ανάπτυξη και θα επιτρέψει την περαιτέρω μεταστατική εξάπλωση σε ωοθήκη, κόλον και του καρκίνου του μαστού. Τα δεδομένα μας υποστήριξε επίσης το ρόλο του

CHL1

ως ένα εν δυνάμει νέο ειδικό βιοδεικτών στην πρώιμη παθογένεση των δύο μεγάλων ιστολογικών τύπων καρκίνου του νεφρού

Παράθεση:. Senchenko VN, Krasnov GS, Dmitriev ΑΑ, Kudryavtseva AV, Anedchenko EA, Μπράγκα ΕΑ, et al. (2011) διαφορική έκφραση της CHL1 Gene κατά την ανάπτυξη των μεγάλων ανθρώπινων καρκίνων. PLoS ONE 6 (3): e15612. doi: 10.1371 /journal.pone.0015612

Συντάκτης: Τσαντ Creighton, Baylor College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 11 Αύγ 2010? Αποδεκτές: 17 του Νοέμ του 2010? Δημοσιεύθηκε: 7, Μαρτίου 2011

Copyright: © 2011 Senchenko et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις 08-04-01577 και 10-04-01213 από το ρωσικό Ίδρυμα βασικής Έρευνας? Δημοσίων συμβάσεων 02.740.11.5227 και 16.740.11.0173 με το ρωσικό Υπουργείο Παιδείας και Επιστημών? επιχορηγήσεις από τη Σουηδική Εταιρεία Καρκίνου, το Σουηδικό Συμβούλιο Έρευνας, το Σουηδικό Ινστιτούτο και Ινστιτούτο Καρολίνσκα και το Εθνικό Ινστιτούτο Καρκίνου, Κέντρο Έρευνας για τον Καρκίνο, εσωτερικό ερευνητικό πρόγραμμα της NCI. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

γονίδια του καρκίνου που σχετίζονται με εμπίπτουν σε δύο κύριες κατηγορίες: τα γονίδια που προκαλούν καρκίνο που οδηγούν κακοήθη μετασχηματισμό και τη διατήρηση της ανάπτυξης του όγκου, και τα γονίδια της εξέλιξης του καρκίνου που ενορχηστρώνουν την τοπική εισβολή και την περαιτέρω εξάπλωση των μεταστατικών κυττάρων και την ανάπτυξη των απομακρυσμένων μεταστάσεων [1 ], [2], [3]. Η

CHL1

γονίδιο – στενή ομόλογο του L1, επίσης γνωστή ως

ΠΡΟΣΚΛΗΣΗ

– κυτταρική προσκόλληση L1-όπως (GenBank Νο NM_006614.2) κωδικοποιεί ένα one-pass πρόσφυση trans-κυτταρική μεμβράνη μόριο (CAM) ικανό τόσο ομότυπη και ετερότυπη δέσμευση. Η πρωτεΐνη που κωδικοποιείται από αυτό το γονίδιο είναι ένα μέλος της οικογένειας του γονιδίου L1 νευρικών μορίων κυτταρικής προσκόλλησης. Είναι ένα νευρωνικό μόριο αναγνώρισης που μπορεί να εμπλέκονται σε μονοπάτια μεταγωγής σήματος.

CHL1

εκφράζεται σε φυσιολογικούς ιστούς εκτός του εγκεφάλου και εκφράζεται σε μια ποικιλία ανθρώπινων καρκινικών κυτταρικών σειρών και πρωτογενών καρκινικών ιστών [4], [5]. Αποδείχθηκε επίσης ότι το γονίδιο εμπλέκεται σε γενικές γνωστικές δραστηριότητες (g /IQ) [6], [7] και μερικές νευρολογικές ασθένειες (δηλ σχιζοφρένεια [8]). Η διαγραφή ενός αντιγράφου αυτού του γονιδίου μπορεί να είναι υπεύθυνη για την ψυχική ελαττώματα σε ασθενείς με σύνδρομο 3p-. Πρόσφατα διάφορα CAMs συμπεριλαμβανομένων L1 δείχθηκε ότι εμπλέκεται στην ανάπτυξη του καρκίνου και μετάσταση [9], [10].

CHL1

βρίσκεται στο 3p26, μια περιοχή που εμφανίζεται στο λιμάνι έναν υποψήφιο για την ευαισθησία του καρκίνου του προστάτη σε φινλανδικές οικογένειες με καρκίνο του προστάτη, αν και δεν ανιχνεύθηκαν μεταλλάξεις στο τμήμα κωδικοποίησης του γονιδίου [11]. Έτσι, αυτές οι αναφορές δείχνουν ότι

CHL1

παίζει ένα ρόλο στην ανάπτυξη του καρκίνου [12], όχι μόνο στην νευρωνική δραστηριότητα. Προηγουμένως, σε συνεργασία με τον Δρ Helen S. Smith, πραγματοποιήσαμε μια χαρτογράφηση διαγραφή της βραχύ σκέλος του χρωμοσώματος 3 σε ένα πάνελ των καρκίνων του μαστού και οριοθετείται τρεις περιοχές όπως υπόθαλψη γονίδια καταστολής του καρκίνου του μαστού υποψηφίου όγκου (ΕΠΠΕ), δηλαδή, 3p24- 26, 3p21-22, και 3p12-13 [13], [14], [15], [16]. Τότε θα κλωνοποιηθεί το

CHL1 (CALL)

γονιδίου 1997/1998 και ανέλυσε την έκφραση της στην ανάπτυξη του ποντικιού και εκτελούνται εκτεταμένες βιοπληροφορική ανάλυση [5].

Εδώ παρέχεται μια ολοκληρωμένη μελέτη του

CHL1

έκφραση του mRNA χρησιμοποιώντας δύο μεθόδους. Ποιοτική ανάλυση πραγματοποιήθηκε με τη χρήση Clontech Cancer Profiling Πίνακες, και περαιτέρω ποσοτική PCR πραγματικού χρόνου (RT-qPCR) χρησιμοποιήθηκε για την επικύρωση των δεδομένων μικροσυστοιχίας για τρεις κύριους τύπους καρκίνου: μη-μικροκυτταρικό καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC), τον καρκίνο του μαστού (BC) , και καρκινώματα νεφρικών κυττάρων (RCC). Τα αποτελέσματά μας πρότεινε ένα διπλό ρόλο του

CHL1

στην ογκογένεση: μπορεί να συμβάλει στην αρχική ανάπτυξη του όγκου και στη συνέχεια να την εξέλιξη και τελικά καρκινικών εξάπλωση /μετάσταση. Τα δεδομένα που υποστηρίζεται περαιτέρω το ρόλο του

CHL1

ως ένα εν δυνάμει νέο ειδικό βιοδεικτών στην πρώιμη παθογένεση των δύο μεγάλων ιστολογικών τύπων καρκίνου του νεφρού.

Το έργο είναι αφιερωμένο στη μνήμη του Δρ Helen S. Smith.

Αποτελέσματα

στο silico

ανάλυση της έκφρασης CHL1 στο φυσιολογικών και καρκινικών ιστών

Οι τεράστιες βάσεις δεδομένων της δημόσιας έκφρασης επιτρέπει την ανίχνευση και την ποσοτικοποίηση η έκφραση των περισσότερων αν όχι όλων των γνωστών γονιδίων REFSEQ (~ 20.000) σε φυσιολογικών και καρκινικών ιστών. Χρησιμοποιήσαμε αρκετές δημόσιους διακομιστές web-based για την ανάλυση ποντικού και ανθρώπου

CHL1

έκφραση [17], [18], [19], [20]. Τα δεδομένα που δείχνει

CHL1

εκφράζεται σε πολλούς φυσιολογικούς ενήλικες και εμβρυϊκούς ιστούς εκτός του εγκεφάλου και του περιφερειακού νευρικού συστήματος [17], [19]. Μεταβλητή έκφραση παρατηρήθηκε σε πολλούς όγκους? ήταν ιδιαίτερα υψηλό σε G361 μελανώματος κυτταρική γραμμή. Σύμφωνα με Oncomine [18] προκαταρκτικά δεδομένα που βασίζονται σε ανάλυση μικροσυστοιχιών, η

CHL1

έκφραση ποικίλλει επίσης σε πολλά σημαντικά είδη καρκίνου – νεφρική [21], [22], του τραχήλου της μήτρας [23], του παχέος εντέρου [24], [ ,,,0],25], ωοθήκη [26], του πνεύμονα [27], [28], το στομάχι [29] και του μαστού [30], [31] του καρκίνου. Η Oncomine έδειξε επίσης συν-έκφραση του

CHL1

με μια άλλη γνωστή καρκίνο της μετάστασης που σχετίζονται γονίδιο, λυσυλο οξειδάση (

LOX

) [32] σε μεταστατικό μελάνωμα.

Διερεύνηση έκφραση CHL1 με Καρκίνο Profiling πίνακες

Χρησιμοποιήσαμε τον Καρκίνο Profiling Πίνακες Ι και ΙΙ (Clontech) για να δοκιμαστεί η

CHL1

έκφρασης σε ένα μεγάλο δείγμα της ανθρώπινης πρωτογενείς όγκους, συμπεριλαμβανομένων του μαστού, του πνεύμονα, των νεφρών, των ωοθηκών , του παχέος εντέρου, του στομάχου και άλλων (Σχ. 1). Μόνο 395 δείγματα των 486, συμπεριλαμβανομένων 90 μεταστατικών όγκων και μεταστάσεων 12 ήταν κατατοπιστική. Αρχικά έδειξε ότι η αλλαγή του

CHL1

έκφραση σε όλους τους όγκους που μελετήθηκαν σε σύγκριση με τα συμφωνημένα μη καρκινικές (κανονικό) ιστούς ήταν στατιστικώς σημαντική (

P

& lt? 0,05, Fisher exact test ή χ

2 κριτήρια)

Οι συντομογραφίες που χρησιμοποιούνται:. ADC – αδενοκαρκίνωμα, ASC – αδενοχοληδωτό καρκίνωμα, BAC – αδενοκαρκίνωμα βρογχοκυψελιδικών, C – καρκίνωμα, CAC – κυσταδενοκαρκίνωμα, CC-ADC – σαφή κυττάρων αδενοκαρκινώματος, EDST – ενδοδερμικά κόλπων όγκου, ΕΝΒ – επιθηλιακά νεφροβλάστωμα, ESS – ενδομητρίου σάρκωμα στρωματικά, FAC – αδενοκαρκίνωμα του ωοθυλακίου, FS – ινοσάρκωμα, I-DC – διεισδύοντας πορογενές καρκίνωμα, I-IDC – διεισδύοντας ενδοπορικού καρκίνωμα, I-LC – διηθητικό καρκίνωμα lobular, LC – λοβιακό καρκίνωμα, LDC – μικτό λοβιακό-πορογενές καρκίνωμα, LM – λειομύωμα, M – κακόηθες μελάνωμα, MAC – βλεννώδες αδενοκαρκίνωμα, MBC – βλεννώδες οριακά καρκίνωμα, MC – μυελοειδές καρκίνωμα, MMMT – κακοήθη μικτό όγκο του Muller, NI-IDC – noninfiltrating ενδοπορικού καρκίνωμα , PAC – θηλώδες αδενοκαρκίνωμα, PC – θηλώδες καρκίνωμα, ΕΠΑ – θηλώδες ορώδες καρκίνωμα, PSCA – θηλώδες ορώδες κυσταδένωμα, PSCAC – θηλώδες ορώδες κυσταδενοκαρκινώματος, RCC – νεφροκυτταρικό καρκίνωμα, S – σεμίνωμα, SC – ορώδες καρκίνωμα, SCAC – ορώδες κυσταδενοκαρκινώματος, SCC – ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα, TAC – σωληνοειδή αδενοκαρκίνωμα, TC – σωληνοειδή καρκίνωμα, TCC – μεταβατικό καρκίνωμα, UBT – μήτρα καλοήθους όγκου. Οι αστερίσκοι (*) δείγματα δείχνουν με μεταστάσεις. ** G361 – μια κυτταρική γραμμή μελανώματος. Τα εγκλωβιστούμε δείγματα δείχνουν μια αντίστοιχη κανονική (αριστερά) – πρωτοπαθούς όγκου (κάτω δεξιά) ζευγάρι με ένα σχετικό δείγμα μεταστατικό (επάνω δεξιά γωνία του ένα κουτί). δείγματα όγκων – T? Ν – συμφωνημένα κανονική δείγματα ελέγχου

Η

κάτω ρύθμιση

Όπως αποδεικνύεται από τα στοιχεία του Καρκίνου Profiling πίνακες στα σχήματα 1 και 2, ένα υψηλό ποσοστό των ασθενών εμφανίζεται μια ρύθμιση προς τα κάτω της..

CHL1

έκφραση σε μαστό, νεφρό, του ορθού, του παχέος εντέρου, του θυρεοειδούς, του στομάχου, του δέρματος, του λεπτού εντέρου, της ουροδόχου κύστης, του αιδοίου και καρκίνο του παγκρέατος. Τα αποτελέσματα της ανάλυσης των δεδομένων των μικροσυστοιχιών παρουσιάστηκαν για 11 τύπους καρκίνου στον Πίνακα 1. Συνολικά, μια στατιστικά σημαντική μείωση της τάξης του

CHL1

έκφραση βρέθηκε στον καρκίνο του μαστού – 71% (45 από 63 περιπτώσεις), του παχέος εντέρου – 48% (23 από 48), του ορθού – 50% (14 από 28), του θυρεοειδούς – 69% (11 από 16), νεφρού – 75% (21 από 28) και του λεπτού εντέρου – 67% (6 από 9) των καρκίνων . Σημαντικά, μια στατιστικά σημαντική αύξηση της συχνότητας μειορύθμιση δείχθηκε σε δείγματα με μεταστάσεις σε σύγκριση με δείγματα χωρίς μεταστάσεις στο παχύ έντερο (83% έναντι 36%,

P

= 0,01) και του ορθού (75% έναντι 31 %,

P

= 0,05) καρκίνους. Η ίδια τάση βρέθηκε στον καρκίνο των ωοθηκών (60% έναντι 19%,

P

= 0,17).

Το ποσοστό των όγκων με

CHL1

πάνω ρύθμιση αυτή έδειξε με κόκκινο, κάτω ρύθμιση – πράσινο, το mRNA επίπεδο διατήρησης – κίτρινο. Δεδομένων αποκάλυψε με ανάλυση Clontech μικροσυστοιχιών. Οι αστερίσκοι (*) δείχνουν στατιστικά σημαντικές διαφορές μεταξύ των συχνοτήτων των

CHL1

έκφραση αλλάζει με πάνω και κάτω-ρύθμιση.

Η

Up-ρύθμιση.

Η

CHL1

πάνω ρύθμιση (συχνότητα από 20% έως 100%) βρέθηκε σε πνεύμονα, των ωοθηκών, της μήτρας, του ήπατος, του δέρματος, του προστάτη, του στομάχου, του τραχήλου και της τραχείας καρκίνων. Ωστόσο, η αύξηση του

CHL1

επίπεδο mRNA ήταν στατιστικά σημαντική μόνο στον καρκίνο του πνεύμονα -64% (16 από 25,

P

& lt? 0,01). Η πλειοψηφία αυτών των περιπτώσεων (14 από 22, Ρ & lt? 0,01) βρέθηκαν σε διαφορετικές histotypes του NSCLC (ADC, BAC, SCC) στο Στάδιο Ι Επίσης παρατηρήσαμε αρκετές περιπτώσεις

CHL1

ρύθμιση προς τα πάνω στο μεταστατικούς όγκους (στομάχου, του πνεύμονα, της τραχείας, των ωοθηκών και της μήτρας, Πίνακας 1). Έτσι, οι περιπτώσεις με

CHL1

πάνω ρύθμιση θα μπορούσαν να χρησιμεύσουν ως παραδείγματα του

CHL1

συμμετοχή τόσο στο αρχικό και ενδεχομένως στην περαιτέρω εξέλιξη και επεμβατική ανάπτυξη του όγκου.

απορρύθμιση.

Σε μήτρας και του καρκίνου των ωοθηκών η συχνότητα των πάνω και κάτω ρύθμιση ήταν κοντά (41% και 30%, 46% και 27%, αντίστοιχα). Στον καρκίνο των ωοθηκών η ρύθμιση προς τα κάτω ήταν μια διαδεδομένη περίπτωση (52%) σε δείγματα χωρίς μεταστάσεις, αντίθετα η ρύθμιση προς τα πάνω ήταν διαδεδομένη (60%) στην ομάδα των μεταστατικών όγκων. Στον καρκίνο του στομάχου μια στατιστικά σημαντική μεταβολή του

CHL1

έκφρασης (και τα δύο πάνω και κάτω ρύθμιση) παρουσιάστηκε στην ομάδα με μεταστάσεις σε σχέση με την ομάδα χωρίς μεταστάσεις (88% έναντι 45%,

P

= 0.02).

μεταστάσεις.

Παρατηρήσαμε εκ νέου την έκφραση του

CHL1

σε 4 από τα 12 μεταστάσεων (πρώτη συντεταγμένη), μαζί με χαμηλής

CHL1

επίπεδο του mRNA σε πρωτογενείς όγκους (δεύτερη συντεταγμένων): στην ωοθήκη (24K /24L), του παχέος εντέρου (14o /14P, 14V /14W) και του μαστού (4I /4J, Σχήμα 1, Array Ι.). Επιπλέον, βρήκαμε επίσης αποσιώπηση της γονιδιακής έκφρασης σε αμφότερες τις μετάσταση και πρωτογενείς όγκους, για παράδειγμα, ο καρκίνος του μαστού (4G /4Η, 4K /4L).

Η έκφραση CHL1 στο στήθος, τον πνεύμονα και η νεφρική καρκινικούς ιστούς μελέτησαν τη χρήση RT-qPCR

το

CHL1

περιεχόμενο mRNA μειώθηκε στην πλειονότητα των μελέτησε δείγματα όγκων σε σύγκριση με τα κανονικά δείγματα, αλλά σε ορισμένα δείγματα όγκων το

CHL1

έκφραση ήταν -regulated (Σχ. 3. Α, Β και Γ).

Α. Η σχετική

CHL1

επίπεδο mRNA (R) στον καρκίνο του μαστού (BC). Ν

0 – χωρίς μεταστάσεις, Ν

1-2 – μεταστάσεις στην περιφερειακή λεμφαδένες. Τα δείγματα # 1, 2 (στάδιο Ι), # 3-22 (στάδιο ΙΙ), # 23 (στάδιο IV)? δείγματα # 3-9 (βαθμός 1), # 10-21 (βαθμός 2). B. Η σχετική

CHL1

επίπεδο mRNA (R) στον καρκίνο του πνεύμονα (NSCLC). SCC – πνεύμονα καρκινώματα πλακωδών κυττάρων, ADC – αδενοκαρκινώματα πνεύμονα, Ν – κανονικά δείγματα από καρκίνο δωρεάν υγιείς δότες? Ν

0 – χωρίς μεταστάσεις, Ν

1-2 – μεταστάσεις στην περιφερειακή λεμφαδένες? Ι, ΙΙ και ΙΙΙ – Στάδια. C. Η σχετική

CHL1

επίπεδο mRNA (R) στη νεφρική καρκίνο (RCC). CC-RCC – διαυγοκυτταρικό νεφρική καρκινώματα, pRCC – θηλώδες νεφρικό καρκίνωμα? Ν

0 – χωρίς μεταστάσεις, Ν

1-2 – μεταστάσεις στην περιφερειακή λεμφαδένες? Ι, ΙΙ και ΙΙΙ. – Στάδια

Η

Ο καρκίνος του μαστού (BC)

Βρήκαμε ότι το

CHL1

επίπεδο mRNA μειώθηκε σε 61% (14. 23,

P

& lt? 0,03), αυξημένη σε 22% (5 από 23) και δεν έχει αλλάξει σε 17% (4 από 23) των δειγμάτων. Η μέγιστη μείωση του

CHL1

επίπεδο mRNA ήταν 20 φορές, η μέγιστη αύξηση ήταν 34 φορές. Δεν υπήρχε καμία εμφανής συσχέτιση μεταξύ της αλλαγής του

CHL1

έκφρασης και η εξέλιξη του όγκου (Σχ. 3 Α).

Μη μικροκυτταρικός καρκίνος του πνεύμονα (NSCLC).

Ο

CHL1

επίπεδο mRNA μειώθηκε σε 60% (18 από 30, Ρ & lt? 0,02) και ήταν φυσιολογικό σε 33% (10 από 30), δηλαδή λιγότερο από 2 φορές αλλαγές. Η μείωση ή αύξηση του επιπέδου mRNA ανιχνεύθηκε ούτε σε πνεύμονα μη καρκινικές (κανονικό) συμφωνημένα ιστών ούτε σε ιστούς από καρκίνο δωρεάν υγιείς δότες. Ωστόσο, για δύο ιστολογική υποτύπους του NSCLC (ADC και SCC) τη συχνότητα των αλλαγών mRNA ήταν διαφορετική. Κάτω ρύθμιση παρατηρήθηκε στο 38% (5 από 14) των δειγμάτων ADC. Η αύξηση του

CHL1

mRNA (7 φορές) ανιχνεύθηκε μόνο σε ένα δείγμα ADC. Αντίθετα, σε δείγματα SCC το

CHL1

έκφραση μειώθηκε σημαντικά σε 81%, (13 από 16,

P

& lt? 0,02).

LD

(επίπεδο μείωσης mRNA) κυμαίνεται από 2 έως 100 φορές σε ADC και από 2 έως 44 φορές σε SCC. Υπήρξε μια πιο σημαντική αύξηση της τάξης του

FD

(συχνότητα του mRNA μειώνει) τιμές σε SCC σε σύγκριση με ADC (81% έναντι 38%,

P

= 0,02) χωρίς εμφανή συσχέτιση με όγκο εξέλιξης (Εικ. 3, Β και Πίνακας 2).

Η

καρκίνωμα Clear κύτταρο νεφρικών κυττάρων (CC-RCC), θηλώδες καρκίνωμα νεφρικών κυττάρων (pRCC) και νεφρικών κυττάρων καρκινώματος γραμμές.

Μια σημαντική μείωση (από 3 έως 302 φορές) του

CHL1

mRNA ανιχνεύθηκε σε 87% (26 από 30,

P

& lt? 0,01) από δείγματα CC-RCC και 89% (8 από 9,

P

& lt? 0.02). της pRCC δείγματα με

LD

av

(γεωμετρικός μέσος της LD) ίσο με 18 και 19 φορές αντίστοιχα (Σχήμα 3, ΝΤΟ). Ως εκ τούτου, θα μπορούσαμε να συμπεράνουμε ότι η συχνότητα και το μέσο επίπεδο του

CHL1

μείωση έκφρασης ήταν παρόμοια και για τα δύο μεγάλα ιστολογικών τύπων καρκίνου του νεφρού, CC-RCC και pRCC. Η

LD

av

αξία ήταν σημαντική σε όλους τους όγκους RCC σε όλα τα αναπτυξιακά στάδια ανεξάρτητα από την παρουσία μεταστάσεων (Πίνακας 3). Σε CC-RCC με ή χωρίς μεταστάσεις, το

FD

και

LD

av

τιμές ήταν παρόμοιες.

Η

Οι εκτιμήσεις του

CHL1 επίπεδα

mRNA σε επτά κυτταρικές σειρές καρκίνου του νεφρού αποκάλυψαν ισχυρή κάτω ρύθμιση αυτού του γονιδίου: 80-φορές (Caki2, KRC /Υ), περίπου 1000 φορές (TK164) και το συνολικό σίγηση (TK10, KH39, ΗΝ4, Caki1, Εικ. 4).

το επίπεδο του mRNA του γονιδίου-στόχου ομαλοποιήθηκε με την αναφορά γονίδια

RPN1

και

GUSB

.

Η

Σύγκριση των μικροσυστοιχιών και τα δεδομένα RT-qPCR για καρκίνο του μαστού, των νεφρών και των πνευμόνων καρκίνου

Τα δεδομένα μικροσυστοιχιών για 61 π.Χ., 23 RCC και 25 δείγματα NSCLC συγκρίθηκαν με τα δεδομένα RT-qPCR για 23 π.Χ., 30 CC-RCC και 30 δείγματα NSCLC. Στη μελέτη σειρά μας μια σημαντική

CHL1

κάτω ρύθμιση παρουσιάστηκε για την πλειονότητα των δειγμάτων RCC? αυξητική ρύθμιση παρατηρήθηκε σε 3 μόνο περιπτώσεις. Τα αποτελέσματά μας έδειξαν επίσης την προς τα κάτω ρύθμιση του

CHL1

στα περισσότερα δείγματα π.Χ. ανεξάρτητη από την παρουσία των μεταστάσεων και ανοδική ρύθμιση μόνο σε 7 όγκους. Σχεδόν τα ίδια αποτελέσματα ελήφθησαν χρησιμοποιώντας RT-qPCR. Υπήρχαν ομοιότητες μεταξύ πίνακα και ποσοτικά στοιχεία για τη νεφρική και τον καρκίνο του μαστού (Πίνακας 4)

Η

Καρκίνος Profiling Πίνακες Ι και ΙΙ περιλαμβάνουν μια πολύ ετερογενή ομάδα του καρκίνου του πνεύμονα με διαφορετικές ιστολογικές υποτύπους:. BAC, ADC, SCC, καρκινοειδές με σταδίου Ι και ΙΙ, μόνο δύο μεταστατικών όγκων και περιορισμένο αριθμό των δειγμάτων κάθε υπότυπο. Συνολικά, υπήρχαν 15 SCC και 5 ADC που θα μπορούσαμε να συγκρίνουμε με τα δεδομένα RT-qPCR. Βρήκαμε μια ρύθμιση προς τα πάνω σε 11 SCC (6 από 11 ταυτοποιήθηκαν ως Στάδιο Ι) και 4 ADC (3 ADC ήταν σταδίου Ι, καθώς και)? κάτω ρύθμιση σε 2 SCC (13%) και 1 ADC (25%, Εικ. 1). Πρόσφατα, δείξαμε ένα πάνω ρύθμιση αρκετών TSG επί 3ρ σε πνεύμονα ADC στο Στάδιο Ι Οι όγκοι αυτοί χαρακτηρίστηκαν με υψηλού βαθμού διαφοροποίησης [33]. Από την άλλη πλευρά, σύμφωνα με τη συχνότητα δεδομένα RT-qPCR της μειωμένης έκφρασης ήταν 38% (5 από 14 περιπτώσεις) σε ADC και το 81% (13 από 16 περιπτώσεις, Ρ & lt? 0,02) σε SCC (βλέπε Πίνακα 2). Ένα up-ρύθμιση ανιχνεύθηκε μόνο σε 7% (1 από 14 περιπτώσεις) ADC και ποτέ σε SCC.

Συζήτηση

CHL1

, που βρίσκεται στο 3p26.1, ανήκει στην οικογένεια των μορίων κυτταρικής προσκόλλησης (CAM) – πρωτεΐνες κυτταρικής επιφάνειας μεσολαβούν κυττάρου-κυττάρου και κυττάρου-μήτρας. Μεταβολές στην έκφραση CAM (συμπεριλαμβανομένης

CHL1

) και λειτουργίες έχουν εμπλακεί στην ανάπτυξη διαφορετικών τύπων όγκων, για παράδειγμα, το μελάνωμα [34], ωοθήκη [9], [35], του προστάτη [11] και καρκίνο του παχέος εντέρου [36]. Σύμφωνα με [9], η αξιολόγηση των προτύπων ΑΕ στο ορώδες επιθηλιακό καρκίνο των ωοθηκών (EOC) πρότεινε ότι

CHL1

είναι υποψήφια ογκοκατασταλτικό (ΕΠΠΕ). Οι μελέτες που δημοσιεύονται από εμάς και άλλους συγγραφείς (βλέπε Εισαγωγή) πρότεινε ότι η

CHL1

γονίδιο θα μπορούσε να είναι μία από τις υποθετικές ογκοκατασταλτικών γονιδίων εντοπίζεται στο ανθρώπινο χρωμόσωμα 3 [12]. Ωστόσο, η υπερέκφραση του

CHL1

παρατηρήθηκε σε δείγματα ορώδες EOC [9]. Επιπλέον, L1 CAM υπερέκφραση σε κακόηθες μελάνωμα φάνηκε να σχετίζεται με μεταστάσεις [34].

Σύμφωνα με Oncomine τα προκαταρκτικά στοιχεία έκφρασης μικροσυστοιχιών [17] μαζί με την επικρατούσα

CHL1

ρύθμιση προς τα κάτω στην αρκετοί όγκοι (RCC, πνεύμονα SCC, ADC κόλον), η υπερέκφραση CHL1 βρέθηκε σε μελάνωμα. Η διαφορική έκφραση παρατηρήθηκε σε πνεύμονα ADC [26], του τραχήλου της μήτρας [22] και του μαστού [29], [30] ο καρκίνος.

Με βάση αυτά τα δεδομένα, υποθέσαμε ότι CHL1 και άλλων υποδοχέων αναγνώριση αυτού του τύπου θα μπορούσε έχουν διπλό ρόλο στον καρκίνο: στις αρχές του προ-επεμβατική ανάπτυξη θα μπορούσαν να χρησιμεύσουν ως ΕΠΠΕ και φιμώνονται? αργότερα εισβολή και τη μετάσταση στάδια τα γονίδια αυτά θα μπορούσαν να επαναχρησιμοποιηθούν εκφράζεται στην άκρη του όγκου για να οδηγήσει την τοπική εισβολή και επιτρέπουν μεταστατική εξάπλωση.

Αυτή η υπόθεση αναλύθηκαν στην παρούσα μελέτη, χρησιμοποιώντας ένα συνδυασμό των προκαταρκτικών διαλογής έκφρασης σε 19 διαφορετικούς τύπους επιθηλιακών όγκων με εμπορικές μικροσυστοιχίες (συνολικά 395 δείγματα κατατοπιστική, Πίνακας 1) και την αξιολόγηση του

CHL1

έκφραση mRNA σε πρωτογενείς όγκους χρησιμοποιώντας RT-qPCR. Αυτή η μέθοδος χρησιμοποιείται ευρέως για να επιβεβαιώσει υπογραφές έκφραση σχετίζεται με τη νόσο που προέρχονται από μικροσυστοιχίες. Επιπλέον, η τεχνολογία αυτή είναι κατάλληλη για τη μετάφραση των δεδομένων microarrays σε ακριβή και ποσοτικά, κλινικά χρήσιμη αναλύσεις [37].

Δείξαμε εδώ ότι η έκφραση του

CHL1

είχε απελευθερωθεί σε μεγάλες επιθηλιακά κακοήθειες ( 76%,

P

& lt? 0,01, συμπεριλαμβανομένης της ρύθμισης προς τα κάτω τις περιπτώσεις 54% σύμφωνα με τα στοιχεία των μικροσυστοιχιών). Στατιστικά σημαντική

FD

τιμές δείχνονται για μαστού, του παχέος εντέρου, του ορθού, του θυρεοειδούς, των νεφρών και καρκίνου του λεπτού εντέρου (Πίνακας 1). Για τρεις κοινωνικές σημαντικά /σημαντικούς τύπους καρκίνου – τα δεδομένα του μαστού, των νεφρών και των πνευμόνων μικροσυστοιχιών επικυρώθηκαν με RT-qPCR. Υπήρξε μια καλή συμφωνία μεταξύ των δεδομένων των δύο μεθόδων για τον νεφρό και τον καρκίνο του μαστού. Σύμφωνα με Oncomine δεδομένων μικροσυστοιχιών τη σημαντική μείωση του

CHL1

επίπεδο έκφρασης σε δείγματα CC-RCC δείχθηκε επίσης.

Clontech μικροσυστοιχιών (υπερέκφραση σε 64% δείγματα καρκίνου του πνεύμονα) και RT-qPCR ( κάτω ρύθμιση σε 38% του ADC και στο 81% των δειγμάτων SCC) δεν ήταν στην ομόνοια, γιατί διαφορετικά υποτύπων καρκίνου ήταν παρόντες στην σπούδασε δειγματοληψίες μικροσυστοιχιών. Η διαφωνία μεταξύ συστοιχιών και δεδομένα RT-qPCR για NSCLC θα μπορούσε επίσης να προκύψει από μη ομογενή δείγματα με διαφορετική περιεκτικότητα σε φυσιολογικά κύτταρα καθώς επίσης και περιορισμένο αριθμό δειγμάτων και μπορεί να είναι στατιστικώς μη σημαντικές. . Παρά το γεγονός ότι τα στοιχεία αυτά δεν είναι στατιστικά έγκυρα θα μπορούσαν να αντανακλούν τις σημαντικές τάσεις και τις ενώσεις

Ωστόσο υπήρχε μια αρκετά καλή συμφωνία μεταξύ των ποσοτικών αποτελεσμάτων μας για τον καρκίνο του πνεύμονα και Oncomine δεδομένων [17] για δύο μεγάλες histotypes καρκίνου του πνεύμονα – ADC και SCC.

είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι Oncomine κατορθώματα μικροσυστοιχίες βασίζεται σε εντελώς διαφορετική πλατφόρμα από Clontech Καρκίνου Profiling πίνακες. Παραδοσιακά μικροσυστοιχίες (Affymetrix, Agilent) περιέχει μια σειρά από διάφορες ανιχνευτές γονιδίου ακινητοποιημένο σε γυάλινες πλάκες. Μόνο ένα δείγμα cDNA μπορεί να υβριδοποιείται με τον ολισθητήρα. Αντιθέτως, Clontech Cancer προφίλ Arrays περιέχουν έναν αριθμό ακινητοποιημένων δείγματα cDNA από διάφορους όγκους και φυσιολογικούς ιστούς. Oncomine περιλαμβάνει δεδομένα παραδοσιακό μικροσυστοιχίες καθιστώντας δυνατή γονιδίωμα-ευρεία ανάλυση ενός περιορισμένου αριθμού δειγμάτων και πίνακες Καρκίνος προφίλ επιτρέπουν την ανάλυση ενός γονιδίου σε πολλούς όγκους σε ένα πείραμα.

Σύμφωνα με τα στοιχεία Clontech μικροσυστοιχιών, η αύξηση επίπεδο του mRNA παρατηρήθηκε για διάφορους τύπους όγκων – μήτρας, των ωοθηκών, του παχέος εντέρου, του στομάχου, του θυρεοειδούς, των πνευμόνων, των νεφρών και τραχεία – κυρίως για μη-μεταστατικών όγκων. Ωστόσο, επίσης, υπήρξαν συχνές περιπτώσεις το

CHL1

αύξηση επίπεδο mRNA σε μεταστατικούς όγκους, για παράδειγμα, στο στομάχι και ο καρκίνος του πνεύμονα.

Επιπλέον, σε τέσσερις μεταστάσεις (4I, 14o, 14V, 24K ) της 12ης διαθέσιμα για τις περιπτώσεις ανάλυση (δηλαδή όταν ένα πρωτεύον και μετάσταση όγκου για τον ίδιο ασθενή ήταν προσιτά) ανιχνεύσαμε μια αυξημένη

CHL1

έκφραση σε μετάσταση σε σύγκριση με πρωτογενή όγκο (ωοθήκη, κόλον και μαστού). Παρόμοια αποτελέσματα αναφέρθηκαν πρόσφατα για την μετάσταση που σχετίζεται με γονίδιο λυσυλο οξειδάση (

LOX

), του οποίου η έκφραση συνδέθηκε τόσο με την καταστολή του όγκου και την εξέλιξη του όγκου ανάλογα με την κατάσταση μετασχηματισμού [32]. Η υπερέκφραση ενός άλλου μορίου προσκόλλησης κυττάρου γονιδίου L1 συνδέθηκε με μετάσταση στο κακόηθες μελάνωμα [34].

Ο καρκίνος είναι μια θανατηφόρα ασθένεια την οποία επεμβατική ανάπτυξη τοπικών όγκων και τη μεταστατική εξάπλωση σε απομακρυσμένα ζωτικά όργανα με αποτέλεσμα λανθάνουσα ή /και την ενεργό την ανάπτυξη και την αναπόφευκτη θάνατο των ασθενών. Σε αντίθεση με τα προηγούμενα μοντέλα νέα στοιχεία έδειχναν ότι μεταστατικά κύτταρα θα μπορούσε να δημιουργηθεί ήδη κατά την αρχική ανάπτυξη ενός πρωτογενούς όγκου τοπική. Αυτά τα κύτταρα στη συνέχεια επιτύχει σε κύτταρο μετανάστευση /εισβολή, εμβολισμό, επιβίωση στην κυκλοφορία, σύλληψη σε μια μακρινή τριχοειδή κλίνη, και εξαγγείωση εντός και πολλαπλασιασμό εντός του παρεγχύματος μακρινό όργανο. Αποτυχία σε οποιοδήποτε από αυτά τα βήματα θα μπορούσαν να μπλοκάρουν το σύνολο της μεταστατικής διαδικασίας και μπορεί να οδηγήσει σε «νάρκη καρκινικά κύτταρα και αδρανών μικρομεταστάσεων». Η χειρουργική αφαίρεση του πρωτογενούς όγκου θα μπορούσε στη συνέχεια να οδηγήσει σε δραστική αύξηση [38]. Επειδή εξάπλωση του όγκου είναι υπεύθυνη για την πλειονότητα των θανάτων των ασθενών με καρκίνο, η ανάπτυξη θεραπευτικών παραγόντων που αναστέλλουν τη μετάσταση των όγκων είναι υψίστης σημασίας [39], [40], [41], [42], [43], [44] , [45], [46], [47].

Ένα από εμάς προβλέψει προηγουμένως [5] ότι η κυτταροπλασματική τέλος του CHL1 πρωτεΐνης μπορεί να αλληλεπιδρούν με τον κυτταρικό σκελετό και μπορεί να προκαλέσουν /ρυθμίζουν το σχηματισμό τΊΙοροάίβ οδήγηση μετανάστευση των καρκινικών κυττάρων και την εισβολή [41], [45], [46].

CHL1

συμπεριφορά στον καρκίνο είναι έτσι εντυπωσιακά παρόμοια με

L1

[10], [40] και

LOX

που εργάζονται και οι δύο μέσω του δικτύου ακτίνης.

Αυτή η μελέτη προτείνει ότι

CHL1

θα μπορούσαν να συμβάλουν στον καρκίνο επεμβατική ανάπτυξη και μετάσταση. Θα μπορούσε να ενεργεί είτε ως καταστολέας όγκου (πρώιμη ανάπτυξη) ή ογκογονιδίου (επεμβατικές και μεταστατικής ανάπτυξης, Σχ. 1, Πίνακας 1).

CHL1

ως εκ τούτου θα μπορούσε να ανήκει στη νέα ταχέως αναπτυσσόμενη κατηγορία των γονιδίων του καρκίνου που μπορεί να λειτουργήσει είτε ως εγγυημένα παραδοσιακά ιδιότυπα προϊόντα ή ογκογονίδια [32], [41], [43], [46], [47], [48] . Κατά την αρχική ανάπτυξη

CHL1

δεν εκφράζεται (σίγαση) σε κύτταρα όγκου για τη διευκόλυνση

in situ

ανάπτυξη του όγκου. Re-έκφραση του

CHL1

στην άκρη της μάζας του όγκου και γύρω από τα αιμοφόρα όγκου θα μπορούσε να προωθήσει τη μετανάστευση και την τοπική επεμβατική ανάπτυξη και, επιπλέον, επιτρέπει την κίνηση της μεταστατικής διαδικασίας. Έτσι, τα αποτελέσματα μας μαζί με τα ευρήματα που

CHL1

ήταν ένα μεταλλαγμένο υποψήφιος καρκινο-συναφές γονίδιο στον καρκίνο του παχέος εντέρου [1] πρότεινε ότι αυτό το είδος των υποδοχέων αναγνώρισης μπορεί πράγματι να έχει διπλό ρόλο στην καρκινογένεση. Οι μεταλλάξεις ανακαλύφθηκαν στην εξω-κυτταρικό τμήμα του

CHL1

μπορούσε να δώσει ένα θεραπευτικό αντίσωμα για τη θεραπεία ασθενών που επιλεκτικά [1]. Αυτό επικυρώνει

CHL1

σαν ένα μυθιστόρημα στόχο για εξατομικευμένες ανοσοποιητικό παρέμβαση σε καρκίνους που εκφράζουν μεταλλαγμένα

CHL1

. Νέες θεραπευτικές μικρό αναστολείς απευθύνονται σε

CHL1

θα μπορούσε να είναι αποτελεσματική στην συγκράτηση νέο σχηματισμό όγκων από αδρανείς μικρομεταστάσεων.

Τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι το

CHL1

γονίδιο θα μπορούσε να είναι σημαντική για την ανάπτυξη σημαντικών ανθρώπινων καρκίνων, καθώς επίσης και τη δυνατότητα να προτείνουν μια υπόθεση για ένα πιθανό διπλό ρόλο του

CHL1

, αν και μόνο για τρεις τύπους καρκίνου (των ωοθηκών, του παχέος εντέρου και του μαστού) έχουν μέχρι στιγμής λαμβάνονται υποστηρικτικά δεδομένα. Μια συχνή μείωση του επιπέδου έκφρασης ήταν διαδεδομένη για 11 με 19 τύπους όγκων και στατιστικά σημαντικές για καρκίνο του μαστού, του παχέος εντέρου, του ορθού, του θυρεοειδούς, των νεφρών και καρκίνου του λεπτού εντέρου.

Τα δεδομένα μας υποστήριξαν επίσης το ρόλο του

CHL1

ως ένα εν δυνάμει νέο βιοδείκτη στις αρχές της δεκαετίας παθογένεια των δύο μεγάλων ιστολογικών τύπων καρκίνου του νεφρού τόσο CC-RCC και pRCC. Αποτελέσματα προκύπτουν με 7 κυτταρικές γραμμές RCC τους πρότεινε ως πιθανή πρότυπο σύστημα για τη μελέτη της μεθυλίωσης ρόλο στην

CHL1

φίμωση.

Υλικά και Μέθοδοι

Καρκίνος του προφίλ ανάλυση συστοιχιών

Καρκίνος Profiling Συστοιχίες Ι και II (154 και 241 δείγματα αντίστοιχα, συνολικά 19 διαφορετικούς τύπους καρκίνων και συγκεκριμένα, του μαστού, του νεφρού, του ορθού, του παχέος εντέρου, του στομάχου, του δέρματος, του θυρεοειδούς, του λεπτού εντέρου, της ουροδόχου κύστης, του αιδοίου, του παγκρέατος, του προστάτη, τράχηλο, όρχεις, πνεύμονα, των ωοθηκών, της μήτρας, του ήπατος, της τραχείας) αγοράστηκε από την BD Biosciences Clontech (Palo Alto, CA), χρησιμοποιήθηκαν για την ανάλυση της έκφρασης του

CHL1

γονιδίου σε φυσιολογικών και καρκινικών ιστών. Πλήρη στοιχεία του δείγματος για Array I και II παρουσιάζεται στο Clontech Καταλόγου: Όχι 7841 – 1 και Νο 631777, αντίστοιχα (βλέπε «συστοιχίες πληροφορίες S1″)

Αναλύσαμε μόνο πληροφοριακό δείγματα με σαφή αναλογία κανονικοποιημένο. όγκου είδε την κίνηση του ένταση. Οι πληροφορίες για τα δείγματα της Array Καρκίνου προφίλ μου παρουσιάζεται παρακάτω.

1. Στήθος. Οι περισσότεροι από τους όγκους οι διηθητικά πορογενή (DC), ενδοπορικού (IC) και λοβιακό (LC) καρκινώματα. Στάδιο Ι: 2Q, 2R, 2S, 2Τ, 2U, 4S, 4D, 4F. Στάδιο ΙΙ: 2W, 4Ε, 4L, 4Ν. Στάδιο ΙΙΙ: 4Α, 4Β, 4Η, 4J, 4Μ. Συντεταγμένες της 18ης μεταστατικού (m) όγκοι είναι 2Β, 2C, 2D, 2Ε, 2Η, 2i, 2J, 2M, 2Ν, 2P, 4Η, 4J, 4L, 4O, 4P, 4R, 4S, 4U. Συντεταγμένες των μεταστάσεων είναι 4G, 4I, 4K.

2. Μήτρα. Οι περισσότεροι από τους όγκους είναι αδενοκαρκινώματα (ADC). Στάδιο Ι: 8C, 8F, 8Η, 8I, 8J, 8K, 8L, 8M, 8N, 8Ο, 8P, 8Q, 8R, 8S, 8U, 8X, 8Y, 8ΒΒ, 8CC, 8DD, 8EE, 8FF, 10Α, 10Β , 10C. Στάδιο ΙΙ: 8T. Συντεταγμένες των μεταστατικών όγκων 8W και 8ΑΑ, Stage III. Συντεταγμένες των μεταστάσεων είναι 8V, 8Z.

3. Άνω κάτω τελεία. Όλες οι όγκοι είναι ADC. Στάδιο Ι: 14L. Στάδιο ΙΙ: 14M, 14Ρ, 14q, 14ΑΑ. Στάδιο ΙΙΙ: 14S, 14U, 14V, 14Y, 14BB. Άλλα δείγματα δεν έχουν πληροφορίες σχετικά με το στάδιο. Συντεταγμένες των 9 μεταστατικών όγκων είναι 14Ε, 14N, 14Ρ, 14U, 14W, 14Y, 14CC, 16Α, 16Γ. Συντεταγμένες των μεταστάσεων είναι 14ο, 14T, 14V, 14Χ.

4. Στομάχι. Οι περισσότεροι από τους όγκους ADC. Δεν υπάρχει καμία πληροφορία σχετικά με το Στάδιο. Συντεταγμένες των 11 μεταστατικών όγκων είναι 20Α, 20Β, 20Ε, 20F, 20Η, 20Ι, 20Κ, 20S, 20T, 20V, 20Χ.

5. Ωοθήκη. Στάδιο Ι: 24B, 24D, 24Ε. Στάδιο ΙΙ: 24F. Στάδιο ΙΙΙ: 24A, 24G, 24Η, 24J, 24L. Οι περισσότεροι όγκοι είναι ADC. Συντεταγμένες των μεταστατικών όγκων είναι 24J, 24L, 24Μ, 24Ν. Συντεταγμένες των μεταστάσεων είναι 24ί, 24K.

6. Τράχηλος της μήτρας. 24X (αδενοχοληδωτό καρκίνωμα).

7. Πνεύμονας. Στάδιο Ι: 28E (πλακώδες καρκίνωμα, SCC), 28F (καρκινοειδές), 28Η (SCC), 28I (ADC), 28J (ADC), 28K (SCC), 28L (βρογχοκυψελιδικών αδενοκαρκίνωμα, BAC), 28Μ (SCC ), 28N (ADC). Άγνωστη Στάδιο: 28Α (SCC), 28Β (BAC), 28C (SCC), 28D (SCC), 28G (SCC), 28o (m, ADC), 28Ρ (m, BAC), 28Q (SCC), 28R (καρκινοειδές ), 28S (ASC), 28T (SCC), 28U (SCC).

8. Νεφρό. Φάση ΙΙΙ: 32D (καρκινοειδές). Άγνωστη Στάδιο: 32Α (διαυγές νεφροκυτταρικό καρκίνωμα κυττάρων, CC-RCC), 32Β (RCC), 32C (RCC), 32E (RCC), 32F (μεταβατικό καρκίνωμα), 32G (RCC), 32Η (m, RCC), 32i (oncocytoma), 32ι (RCC), 32K (RCC), 32L (m, RCC), 32M (RCC), 32Ν (m, RCC), 32o (RCC), 32Ρ (RCC), 32Q (RCC), 32R (RCC), 32S (RCC), 32T (RCC).

9. Πρωκτός. Όλες οι όγκοι είναι ADC. Στάδιο Ι: 36G. Στάδιο ΙΙ: 36J, 36F. Στάδιο ΙΙΙ: 36C, 36Η, 36i, 36L. Συντεταγμένες των 6 μεταστατικών όγκων είναι 36Β, 36Ε, 36L, 36M, 36q, 36R. Συντεταγμένη μετάσταση είναι 36K.

10. Το λεπτό έντερο. 36y (m, ADC), 36ζ (ADC).

11. Θυρεοειδούς αδένα. Όλες οι όγκοι είναι θηλώδες ADC, Στάδιο ΙΙ: 40D. Φάση ΙΙΙ:. 40C, 40Ε

12. Προστάτης. Όλες οι όγκοι είναι ADC. Στάδιο Ι:. 40Μ

13. Παγκρέας. Άγνωστη Στάδιο:. 40u (ADC)

Οι πληροφορίες για τα δείγματα της Array Καρκίνου Profiling II παρουσιάζεται παρακάτω

1.. Στήθος. Στάδιο Ι: 6Ε (DC), 6G (βλεννώδες ADC), 6Μ (DC). Στάδιο ΙΙ: 6I (DC), 6Κ (m, DC), 6L (DC), 6Ν (DC). Φάση ΙΙΙ:. 6F (m, DC), 6Η (m, DC), 6J (m, LC)

2. Μήτρα. Στάδιο Ι: 6Τ (ADC), 6Ζ (SCC), 6BB (ADC). Στάδιο ΙΙ: 6Χ (SCC), 6AA (ADC). Άγνωστη Στάδιο:. 6V (SCC)

3. Ωοθήκη. Στάδιο Ι: 10E (θηλώδες ορώδες κυσταδένωμα), 10Κ (βλεννώδες κυσταδενοκαρκινώματος). Στάδιο ΙΙ: 10i (ADC), 10J (λειομυώματα). Φάση ΙΙΙ: 10G (ADC), 10Η (CC-ADC), 10M (θηλώδες καρκίνωμα ορώδες επιφάνεια), 10Ν (θηλώδες ορώδες κυσταδένωμα). Στάδιο IV: 10L (ADC). Άγνωστη Στάδιο:. 10F (λειομυώματα)

4. Τράχηλος της μήτρας. Στάδιο Ι: 10Ζ (ADC), 10ΑΑ (SCC), 10ΒΒ (SCC). Στάδιο ΙΙ: 10V (SCC). Φάση ΙΙΙ:. 10S (m, SCC)

5. Άνω κάτω τελεία. Στάδιο Ι: 14Ε (tubulovillous αδένωμα, άλλοι όγκοι είναι ADC), 14F. Στάδιο ΙΙ: 14L. Φάση ΙΙΙ: 14Η (m), 14θ (m), 14ι, 14Κ (m), 14M, 14N (m). .