Αφηρημένο

Για την καλύτερη κατανόηση της λειτουργίας του προστάτη και τις ασθένειες, είναι σημαντικό να καθοριστούν και να εξερευνήσετε τα μοριακά συστατικά που σηματοδοτούν τον αδένα του προστάτη. Ο σκοπός αυτής της μελέτης ήταν να καθορίσει το ειδικό προστατικό μεταγραφικό και proteome, σε σύγκριση με 26 άλλους ανθρώπινους ιστούς. Βαθιά αλληλούχιση του mRNA (RNA-seq) και ανοσοϊστοχημεία με βάση πρωτεΐνη profiling συνενώθηκαν για τον εντοπισμό συγκεκριμένων προτύπων γονιδιακής έκφρασης του προστάτη και να εξερευνήσουν βιοδεικτών ιστού για δυνητική κλινική χρήση σε διαγνωστική του καρκίνου του προστάτη. Εντοπίσαμε 203 γονίδια με αυξημένη έκφραση στον προστάτη, 22 από τα οποία έδειξαν περισσότερο από πέντε φορές υψηλότερα επίπεδα έκφρασης σε σύγκριση με όλους τους άλλους τύπους ιστών. Εκτός από τις ήδη γνωστές πρωτεΐνες που εντοπίσαμε δύο καλά χαρακτηρισμένες πρωτεΐνες, TMEM79 και ACOXL, με δυνατότητα να γίνει διάκριση μεταξύ καλοήθων και καρκινικών προστατικών αδένων σε βιοψίες ιστού. Εν κατακλείδι, έχουμε εφαρμόσει μια ανάλυση του γονιδιώματος σε επίπεδο για να προσδιορίσετε τη συγκεκριμένη proteome προστάτη χρησιμοποιώντας transcriptomics και βασίζονται σε αντισώματα πρωτεΐνη προφίλ για τον εντοπισμό γονιδίων με αυξημένη έκφραση στον προστάτη. Τα δεδομένα μας παρέχει ένα σημείο εκκίνησης για περαιτέρω λειτουργικές μελέτες για τη διερεύνηση της μοριακής ρεπερτόριο των φυσιολογικών και νοσούντων προστάτη, συμπεριλαμβανομένων πιθανών δεικτών καρκίνου του προστάτη, όπως TMEM79 και ACOXL

Παράθεση:. O’Hurley G, Busch C, Fagerberg L, Χάλστρομ BM, Stadler C, Tolf A, et al. (2015) ανάλυση του ανθρώπινου ειδικού προστατικού Proteome Ορίζεται από Transcriptomics και που βασίζονται σε αντισώματα Profiling Προσδιορίζει TMEM79 και ACOXL ως δύο υποτιθέμενων, Διαγνωστικοί Δείκτες στον καρκίνο του προστάτη. PLoS ONE 10 (8): e0133449. doi: 10.1371 /journal.pone.0133449

Επιμέλεια: Νατάσα Κυπριανού, Πανεπιστήμιο του Κεντάκι College of Medicine, Ηνωμένες Πολιτείες