Αφηρημένο

Ιστορικό

Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν να διερευνήσει τις συνέπειες της αλληλεπίδρασης των pri-ας-7α 1-rs10739971 με

pepsinogen C

(

PGC

) και

επισκευή εκτομής σταυρό συμπληρώνοντας ομάδα 6

(

ERCC6

) πολυμορφισμών των γονιδίων και η σύνδεσή της με τους κινδύνους του καρκίνου του στομάχου και η ατροφική γαστρίτιδα. Ελπίζαμε να προσδιορίσει miRNA πολυμορφισμός ή ένα συνδυασμό διαφόρων πολυμορφισμών που θα μπορούσε να χρησιμεύσει ως βιοδείκτες για την πρόβλεψη του κινδύνου του γαστρικού καρκίνου και προκαρκινικών ασθενειών του.

Μέθοδοι

Sequenom MassARRAY μέθοδο πλατφόρμα χρησιμοποιήθηκε για την ανίχνευση πολυμορφισμούς των pri-ας-7α-1 rs10739971 G → A,

PGC

rs4711690 C → G,

PGC

rs6458238 G → A,

PGC

rs9471643 G → C, και

ERCC6

rs1917799 σε 471 ασθενείς με καρκίνο του στομάχου, 645 ασθενείς με ατροφική γαστρίτιδα και 717 μάρτυρες.

Αποτελέσματα

Ένα αποτέλεσμα της αλληλεπίδρασης των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμό με

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμός παρατηρήθηκε για τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (

P

αλληλεπίδρασης = 0,026)? και τις επιπτώσεις της αλληλεπίδρασης των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμού με

PGC

rs6458238 πολυμορφισμό (

P

αλληλεπίδρασης = 0,012) και

PGC

rs9471643 πολυμορφισμό (

P

αλληλεπίδρασης = 0,039) παρατηρήθηκε για τον κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα.

Συμπέρασμα

Ο συνδυασμός των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

ERCC6

και

PGC

πολυμορφισμούς θα μπορούσε να προσφέρει μια μεγαλύτερη δυνατότητα πρόβλεψης από ένα ενιαίο πολυμορφισμού από μόνη της. Οι μεγάλης κλίμακας μελέτες και έρευνα μοριακός μηχανισμός που απαιτούνται για να επιβεβαιώσουν τα ευρήματά μας

Παράθεση:. Xu Q, Liu J-w, Εκείνος C-y, η Sun L-p, Γκονγκ Υ-h, Jing J-J, et al. (2014) Η αλληλεπίδρασης Επιδράσεις pri-ας-7α 1-rs10739971 με

PGC

και

ERCC6

Gene πολυμορφισμοί στο γαστρικός καρκίνος και ατροφική γαστρίτιδα. PLoS ONE 9 (2): e89203. doi: 10.1371 /journal.pone.0089203

Επιμέλεια: Xiaoping Miao, MOE Βασικά Εργαστήριο Περιβάλλοντος και Υγείας, τη Σχολή Δημόσιας Υγείας, Tongji Medical College, Huazhong Πανεπιστήμιο Επιστήμης και Τεχνολογίας, η Κίνα

Ελήφθη: 20 Νοεμ 2013? Αποδεκτές: 16 Ιαν, 2014? Δημοσιεύθηκε: 25 Φεβρουαρίου, 2014

Copyright: © 2014 Xu et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Key Πρόγραμμα βασικής Έρευνας της Κίνας (973 Πρόγραμμα Ref No. 2010CB529304), το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Ref Νο 31200968), και το Έργο Επιστήμης Τεχνολογίας στην επαρχία Liaoning (Ref Νο 2011225002) . Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Τα άτομα με παρόμοιες συνήθειες ζωής και διαβίωσης σε παρόμοια περιβάλλοντα έχουν διαφορετικούς κινδύνους του καρκίνου. Ο εντοπισμός και η πρόβλεψη άτομα που διατρέχουν υψηλό κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου μπορεί να υποδεικνύουν την ανάγκη για αλλαγή συνήθειες ζωής. πολυμορφισμών απλού νουκλεοτιδίου (SNPs) διαδραματίζουν καίριο ρόλο στην πρόβλεψη των ατόμων με αυξημένο κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τα τελευταία χρόνια, πολυμορφισμοί των pri-miRNA έχουν αναφερθεί να είναι βιοδείκτες για την πρόβλεψη του κινδύνου καρκίνου, όπως pri-miR-34b /c rs4938723 πολυμορφισμός [1], pri-miR-218 rs11134527 πολυμορφισμός [2] και pri-miR-938 rs2505901 πολυμορφισμός [3]. Μελέτες έχουν δείξει ότι ο αριθμός των πολυμορφισμών μονού γονιδίου συνδέθηκε με τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου [4]. Ωστόσο, γαστρικό καρκίνο είναι ένα σύμπλοκο πολλών σταδίων ασθένεια με πολλά γονίδια που εμπλέκονται, και μονά SNPs έχουν περιορισμένη ικανότητα να προβλέψουμε γαστρικό κίνδυνο καρκίνου [5] – [7]. Αρκετές μελέτες έχουν αναφέρει ότι οι αλληλεπιδράσεις γονίδιο-γονίδιο είναι πιο σημαντική από την κύρια επίδραση ενός μόνο γονιδίου σε πολύπλοκες ασθένειες, όπως ο καρκίνος [7] – [9]. Η βασική προσέγγιση της έρευνας για τις αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίου είναι να διερευνηθεί ο συνδυασμός δύο ή περισσότερων πολυμορφισμοί με μικρές ή καθόλου επιδράσεις από προηγούμενες ενιαίο SNP μελέτες [10], [11]. Ωστόσο, οι περισσότερες προηγούμενες μελέτες έχουν επικεντρωθεί στην προγνωστική ρόλο ενός μόνο γονιδίου SNP και αγνοείται η δυνατότητα εφαρμογής των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-γονιδίου.

Προς το παρόν, οι ερευνητές εστιάζουν κυρίως στη γονιδιακή αλληλεπιδράσεις SNP-SNP, η οποία μπορεί να προκαλέσει σε πρωτεΐνες αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης, και λίγες μελέτες έχουν διερευνήσει τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ πολυμορφισμών miRNA και πολυμορφισμούς του γονιδίου, το οποίο μπορεί να προκαλέσει αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-RNA. miRNA έχει αναφερθεί να λάβουν μέρος στο δίκτυο πολλαπλών γονιδίων της γαστρικής καρκινογένεσης [12]. Το ίδιο miRNA αναφέρθηκε να ρυθμίσει πολλαπλές πρωτεΐνες-στόχους, και οι ίδιες οι πρωτεΐνες θα μπορούσαν να διαμορφώνονται από πολλαπλούς miRNA [13]. Ως αποτέλεσμα, οι επιπτώσεις των miRNA και τα γονίδια που σχηματίζεται ένα δίκτυο.

προηγούμενη μελέτη συσχέτισης υποψήφιων γονιδίων μας διερεύνησε τη σχέση του

pepsinogen C

(

PGC

) και

επισκευή εκτομή σταυρό ομάδα συμπληρώνει 6

(

ERCC6

) με τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου, και διαπίστωσε ότι

PGC

γονίδιο rs4711690 C → G, rs6458238 G → A, και rs9471643 G → πολυμορφισμοί C είχε προστατευτικές επιδράσεις έναντι ατροφική γαστρίτιδα [4]. PGC είχε προστατευτικές επιδράσεις στην κανονική στομάχι και έδειξε χαμηλή έκφραση σε καρκίνο του στομάχου, και η απώλεια της προστασίας συνδέθηκε με την εμφάνιση γαστρικού καρκίνου [14]. ERCC6 είναι ένα μέλος της οικογένειας επιδιόρθωσης του DNA, που συμμετέχει στην επιδιόρθωση της βλάβης του DNA στην καρκινογένεση [15].

ERCC6

rs1917799 Τ & gt? G πολυμορφισμός στην περιοχή υποκινητή συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου σε ένα κινεζικό πληθυσμό [16]. Ας-7a είναι ένας καταστολέας όγκων, και πρόσφατες μελέτες βρέθηκε ότι η λειτουργία του ώριμου let-7a είναι στενά συνδεδεμένη με τη συχνότητα και την ανάπτυξη του καρκίνου του στομάχου, και μειωμένη έκφραση της LET-7α σχετίζεται με κακοήθη βιολογική συμπεριφορά [17], [ ,,,0],18]. Ωστόσο, ας-7α γενετικές παραλλαγές που δεν εξετάστηκαν για τις ενώσεις τους και του γαστρικού καρκίνου κινδύνους. Rs10739971 είναι ένα SNP βρίσκεται -559 bp ανοδικά του ας-7α-1, το οποίο θα μπορούσε να είναι μια περιοχή του υποκινητή της ας-7α-1. Στο HapMap βάση δεδομένων, η ελάχιστη συχνότητα αλληλόμορφου του rs10739971 είναι ≥5% και στις δύο Ευρωπαίοι και Ασιάτες. Αλλά αν υπάρχει συσχέτιση μεταξύ rs10739971 και τον κίνδυνο της νόσου, και οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ rs10739971 και άλλους πολυμορφισμούς, παραμένουν άγνωστα. Υποθέσαμε ότι οι προαναφερθείσες παραλλαγές μπορεί να είναι ιδανικοί υποψήφιοι για τη διερεύνηση πιθανών αλληλεπιδράσεων SNP-SNP σε δύο ή περισσότερους τόπους που συμβάλλουν στην γαστρική αιτιολογία του καρκίνου.

Σε αυτή τη μελέτη ασθενών-μαρτύρων χρησιμοποιώντας ένα κινέζικο πληθυσμό, ερευνήσαμε το ένωση των pri-ας-7α-1 rs10739971 με γαστρικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, και οι επιπτώσεις της αλληλεπίδρασης των miRNA-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

PGC

και

ERCC6

πολυμορφισμούς σε δείγματα του ίδιο όμιλο, και να συζητήσουν τις προοπτικές εφαρμογής της σε καρκίνο του στομάχου και των προκαρκινικών ασθενειών του. Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη επιχειρεί να αξιολογήσει πιθανές αλληλεπιδράσεις SNP-SNP των miRNA SNPs και SNPs γονίδιο σε δύο ή περισσότερους τόπους που εμπλέκονται στην γαστρική ευαισθησία του καρκίνου. Ελπίζαμε να βρούμε συνδυασμούς των πολυμορφισμών του γονιδίου-γονίδιο που θα μπορούσε να προβλέψει τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου και προκαρκινικών ασθενειών του, και να παρέχει πειραματικές αποδείξεις για την έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου του στομάχου.

Μέθοδοι

Ασθενείς

σε αυτή τη μελέτη, ένα σύνολο 1834 ατόμων, η οποία περιελάμβανε 471 ασθενείς με καρκίνο του στομάχου, 646 ασθενείς με ατροφική γαστρίτιδα και 717 μάρτυρες, αναδρομικά προσληφθεί από ασθενείς που υποβλήθηκαν σε γαστροσκόπηση διαλογής εξέταση στην περιοχή και οι ασθενείς που υποβλήθηκαν σε γαστροσκόπηση εξέταση Zhuanghe ή γαστρική χειρουργική επέμβαση στην Πρώτη συνδεδεμένες νοσοκομείο της Κίνας Ιατρικό Πανεπιστήμιο, επαρχία Liaoning, στην Κίνα μεταξύ 2002 και 2011. η νηστεία φλεβικό αίμα συλλέχθηκε και όλοι οι εγγεγραμμένοι συμμετέχοντες διαγνώστηκαν με βάση γαστροσκοπική τους και ιστοπαθολογικές εξετάσεις. γαστρικό καρκίνο διαγνώστηκε με βάση τα κριτήρια του ΠΟΥ, και ατροφική γαστρίτιδα και επιφανειακή γαστρίτιδα ταξινομήθηκαν από την ταξινόμηση του Σίδνεϊ. Επιλέξιμες έλεγχοι ήταν αυτοί οι συμμετέχοντες με ένα κανονικό στομάχι ή μόνο γαστρίτιδα, σύμφωνα με γαστροσκοπική και παθολογικές εξετάσεις και δεν είχε άλλες ασθένειες.

Ο σχεδιασμός της μελέτης εγκρίθηκε από την Επιτροπή Ανθρωπίνων Δεοντολογίας της Κίνας Ιατρικού Πανεπιστημίου (Shenyang, Κίνα ). Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από όλους τους συμμετέχοντες. Ιατρικά ιστορικά (συμπεριλαμβανομένης της ηλικίας, του φύλου, το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ) ελήφθησαν από το ερωτηματολόγιο και τα αρχεία έχουν μηχανογραφηθεί. Κάθε άτομο που εμπλέκεται στη μελέτη υπό τον όρο γραπτή συγκατάθεση για την επιδημιολογική έρευνα. Λεπτομερείς χαρακτηριστικά συμμετέχων συνοψίζονται στον Πίνακα 1.

Η

Γονιδιωματικό DNA εκχυλίζεται

Γονιδιωματικό ϋΝΑ εξήχθη χρησιμοποιώντας μία προηγουμένως περιγραφείσα μέθοδο με ελαφρά τροποποίηση [19]. Εν συντομία, ένα κατεψυγμένο θρόμβος (500 μL) προστέθηκε σε 800 μL ρυθμιστικού ΤΕ (τριαιθανολαμίνη), αναμίχθηκαν καλά και φυγοκεντρήθηκαν στα 10.000 χ

g

για 5 λεπτά για να διαλύσει τον θρόμβο. Μετά διάσπαση θρόμβων, 400 μΙ ΤΕ, 25 μΙ 10% SDS και 5 μL των 20 mg /mL πρωτεϊνάσης Κ προστέθηκαν και επωάστηκαν στους 37 ° C όλη τη νύκτα. Το υπερκείμενο εκχυλίστηκε και προστέθηκε ένας ίσος όγκος φαινόλης. Ο σωλήνας τοποθετήθηκε σε περιστροφέα για 15 λεπτά και κατόπιν φυγοκεντρήθηκε στα 10.000 χ

g

για 15 λεπτά. Το υπερκείμενο απομακρύνθηκε και ένα δεύτερο εκχύλιση διεξήχθη με την προσθήκη ενός ίσου όγκου ενός μίγματος φαινόλης και χλωροφορμίου (1:01). Μετά από φυγοκέντρηση, το υπερκείμενο απομακρύνθηκε και μια τρίτη εκχύλιση διεξήχθη με την προσθήκη ενός ίσου όγκου χλωροφορμίου. Μετά από φυγοκέντρηση, το υπερκείμενο απορροφήθηκε και προστέθηκαν και επωάστηκαν για 2 ώρες στους -20 ° C δύο όγκων του διαλύματος καταβύθισης πρωτεΐνης (δύο όγκοι απόλυτης αιθανόλης που περιέχει 10% 3 mol /L οξικό νάτριο). Κάθε δείγμα φυγοκεντρήθηκε στα 10,000 χ

g

για 10 λεπτά. Μετά τη φυγοκέντρηση, το προκύπτον DNA σφαιρίο ξεπλύθηκε με 75% αιθανόλη και φυγοκεντρήθηκαν στις 10.000 χ

g

για 10 λεπτά. Η αιθανόλη 75% αποχύθηκε και ο σωλήνας αναστρέφεται για καθαρό απορροφητικό χαρτί για 30 λεπτά. Το προκύπτον DNA ανασυστάθηκε σε ρυθμιστικό ΤΕ και αποθηκεύεται στους -20 ° C μέχρι τη χρήση.

SNP γονοτυποποίηση

δείγματα DNA αραιώθηκαν σε συγκεντρώσεις εργασίας των 50 ng /μL πριν γονότυπου. Οι δοκιμασίες, αστάρι σχεδιασμό, και του γονότυπου των 29 χώρων πολυμορφισμού που επιλέγονται για ένα υποψήφιο γονίδιο που σχετίζεται μελέτη ήταν όλοι εκτελούνται από CapitalBio (Πεκίνο, Κίνα) με τη χρήση της πλατφόρμας Sequenom MassARRAY (Sequenom, San Diego, CA, USA) από τον Μάιο του 2011 και Δεκ 2011 με βάση τις οδηγίες του κατασκευαστή [4], [20]. Πέντε από 29 πολυμορφισμοί περαιτέρω επιλέγονται για ανάλυση αλληλεπίδρασης στην παρούσα μελέτη. Για την αξιολόγηση της ποιότητας του προσδιορισμού του γονότυπου, 5% επαναλαμβάνεται δείγματα γονότυπος και τα αποτελέσματα ήταν 100% συνεπείς.

Ανίχνευση του ελικοβακτηριδίου του πυλωρού σε

ορού

Οι ορολογικές εξετάσεις για το

H. pylori

έγιναν για να ελέγξετε την κατάσταση του

H. pylori

μόλυνση χρησιμοποιώντας ELISA (

Η. pylori

-IgG ELISA kit, BIOHIT Plc, Ελσίνκι, Φινλανδία), όπως περιγράφηκε προηγουμένως [21]. Θετική κρίθηκε ως ο τίτλος του

H. pylori

-IgG μεγαλύτερη από 34EIU (η τιμή αποκοπής δίνεται από το πρωτόκολλο). Εν συντομία, δείγματα ορού αραιώθηκαν 1:200 (5 μL + 995 μL) με ρυθμιστικό διάλυμα αραιωτικού και αναμίχθηκαν καλά. Στη συνέχεια 100 μL του τυφλού διαλύματος, βαθμονομητές, τους μάρτυρες και τα αραιωμένα δείγματα προστέθηκαν στα φρεάτια. Η πλάκα καλύφθηκε με το κάλυμμα επώασης και επωάστηκαν για 30 λεπτά στους 37 ° C. Μετά την επώαση, τα φρεάτια πλύθηκαν πέντε φορές με 350 μL του αραιωμένου (1:100) ρυθμιστικό διάλυμα πλύσης και η πλάκα κτυπιέται ελαφρά αρκετές φορές σε διηθητικό χαρτί. Στη συνέχεια 100 μL του μικτού διαλύματος συζυγούς προστέθηκαν στα φρεάτια και επωάστηκαν για 30 λεπτά στους 37 ° C. Μετά την επώαση, τα πηγάδια πλύθηκαν πάλι και 100 μL μικτού διαλύματος υποστρώματος προστέθηκαν στα φρεάτια πριν από την επώαση για 30 λεπτά σε θερμοκρασία δωματίου (20-25 ° C) σε σκοτεινό περιβάλλον. Τέλος, 100 μι μικτών διαλύματος διακοπής προστέθηκε και η απορρόφηση μετρήθηκε στα 450 nm εντός 30 λεπτών.

Στατιστική ανάλυση

Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας SPSS 16.0 (SPSS, Chicago , IL, USA). χ Pearson ‘s

2 τεστ που χρησιμοποιούνται για την αξιολόγηση των διαφορών μεταξύ των δύο φύλων σε περίπτωση που και ο έλεγχος των ομάδων. ANOVA διεξήχθη για να εκτιμηθούν οι όποιες διαφορές μεταξύ των ηλικιών στις διάφορες ομάδες. τεστ λόγου πιθανοφάνειας έγιναν για να εκτιμήσει τις επιπτώσεις της αλληλεπίδρασης με τον κίνδυνο του γαστρικού καρκίνου, συγκρίνοντας το μοντέλο που συμμετέχουν μόνο τα κύρια αποτελέσματα και το πλήρες μοντέλο που περιείχε επίσης τον όρο αλληλεπίδραση. Ένα

P

-τιμή & lt?. 0.05 για όλες διπλής όψης δοκιμές θεωρήθηκε ως στατιστικά σημαντική

Αποτελέσματα

Κύρια δράση αναλύσεις μεμονωμένων πολυμορφισμών

σε προηγούμενη μελέτη μας, διαπιστώσαμε ότι pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (OR = 2,59,

P

= 0,018) στο μικρότερο πληθυσμό της μελέτης, αλλά όχι στατιστικά σημαντική συσχέτιση βρέθηκε στην περαιτέρω μελέτη επικύρωσης ενός μεγαλύτερου πληθυσμού (μη δημοσιευμένα δεδομένα)? PG

C

rs4711690, rs6458238, και πολυμορφισμοί rs9471643 ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (

P

= 0.093, OR = 0,75?

P

= 0.015, OR = 0,73?

P

= 0.033, OR = 0,69, αντίστοιχα) [4]?

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμού συσχετίστηκε με αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (OR = 1,38,

P

= 0,035) [20].

Η αμφίδρομη αλληλεπίδραση pri του- επιτρέψτε-7α-1 rs10739971 και PGC, πολυμορφισμοί ERCC6 στον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου /ατροφική γαστρίτιδα

Για να διερευνήσουν κατά πόσο πολυμορφισμοί γονιδίων και miRNA πολυμορφισμός είχε συνέπειες της αλληλεπίδρασης, αναλύσαμε τις αλληλεπιδράσεις μεταξύ miRNA πολυμορφισμό και κάθε πολυμορφισμό του γονιδίου . Βρήκαμε ότι ο πολυμορφισμός miRNA και

PGC

και

ERCC6

πολυμορφισμών έδειξε ισχυρή στατιστική συσχέτιση με καρκίνο του στομάχου ή ατροφική γαστρίτιδα. Έτσι, αναλύσαμε το αποτέλεσμα της αλληλεπίδρασης των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

PGC

και

ERCC6

πολυμορφισμούς, και οι ενώσεις του, με τους κινδύνους του καρκίνου του στομάχου και η ατροφική γαστρίτιδα. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμός είχε επιπτώσεις αλληλεπίδρασης για γαστρικό κίνδυνο καρκίνου (

P

αλληλεπίδρασης = 0,026, Πίνακας 2). Αυτό το ζεύγος SNP έδειξαν αυξημένο κίνδυνο γαστρικού καρκίνου (OR = 2.59, 95% CI = 1,12 – 5,97). Pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

PGC

rs65458238 και rs9471643 πολυμορφισμών είχε επιπτώσεις αλληλεπίδρασης για τον κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (

P

αλληλεπίδρασης = 0,012 και 0,039 αντίστοιχα, Πίνακας 3). Για τον πολυμορφισμό rs65458238, το ζευγάρι SNP έδειξαν αυξημένο κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (OR = 2,77, 95% CI = 01.25 – 06.13)? ενώ το άλλο ζευγάρι SNP έδειξε μειωμένο κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (OR = 0,52, 95% CI = 0,28 – 0,97) για rs9471643 (Πίνακας 3).

Η

SNP-SNP αλληλεπιδράσεων με πολλαπλές SNPs μέθοδο της λογιστικής παλινδρόμησης

Εμείς διερευνηθεί περαιτέρω το SNP-SNP αλληλεπίδραση που περιλαμβάνει τρία θετικά SNPs (pri-ας-7α-1 rs10739971-

PGC

rs6458238-

PGC

rs9471643) και το αποτέλεσμα ήταν στατιστικώς σημαντική (

P

αλληλεπίδραση = 0,001, Πίνακας 4). Ο συνδυασμός SNP έδειξαν αυξημένο κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα (OR = 23,55, 95% CI = 3,73 – 148,71).

Η

Συζήτηση

Οι πολυμορφισμοί των γονιδίων ή miRNA θα μπορούσαν να χρησιμεύσουν ως πιθανοί βιοδείκτες για πρόβλεψη κινδύνου εκδήλωσης ασθένειας. Προηγούμενες μελέτες έχουν επικεντρωθεί κυρίως σχετικά με τη σύνδεση ενός μόνο γονιδίου πολυμορφισμού με τον κίνδυνο της νόσου, καθώς και ο κίνδυνος ήταν συχνά αδύναμος αποτέλεσμα (Ή & lt? 1.5). Όσο για το συνδυασμό δύο ή περισσοτέρων αλληλεπιδράσεων SNP-SNP, ο κίνδυνος ήταν συχνά μέτριας (OR≥1.5) ή ισχυρή επίδραση (OR≥2) [4], [10], [22] – [24]. Η παρούσα μελέτη, για πρώτη φορά, ερεύνησε τις επιπτώσεις της αλληλεπίδρασης των miRNA πολυμορφισμό και

PGC

και

ERCC6

πολυμορφισμούς σε Βόρεια κινεζικού πληθυσμού. Η μελέτη είχε ως στόχο να παρέχει πειραματικές αποδείξεις για την έγκαιρη διάγνωση και τους μηχανισμούς του καρκίνου του στομάχου, βρίσκοντας συνδυασμούς των πολυμορφισμών του γονιδίου-γονίδιο που θα μπορούσε να προβλέψει τον κίνδυνο γαστρικού καρκίνου και προκαρκινικών ασθενειών του.

Μεταξύ των SNPs από την ομάδα μας διερευνηθεί κατά τη διάρκεια του υποψηφίου μελέτη γονίδιο συλλόγου μας,

ERCC6

μονής τόπου έδειξε μια ασθενή επίδραση για γαστρικό κίνδυνο καρκίνου (OR = 1,46) [16]? του τρεις

PGC

μονής τόπου έδειξε ένα ασθενές προστατευτική δράση για την ατροφική γαστρίτιδα κίνδυνο (OR για rs4711690 = 0,75? Ή για rs6458238 = 0,73? Ή για rs9471643 = 0,69) [4]. Ως εκ τούτου υποθέσαμε ότι οι πολυμορφισμοί μπορεί να είναι ιδανικοί υποψήφιοι για τη διερεύνηση πιθανών αλληλεπιδράσεων SNP-SNP σε δύο ή περισσότερες θέσεις που συμβάλλουν στην γαστρική αιτιολογία του καρκίνου. Πραγματοποιήσαμε την ανάλυση αποτέλεσμα της αλληλεπίδρασης των miRNA πολυμορφισμό και το γονίδιο πολυμορφισμών και βρέθηκαν τρεις SNP-SNP ζεύγη που σχετίζονται με ασθένειες, των οποίων η αλληλεπίδραση ενός ζεύγους (PRI-ας-7α 1-rs10739971-

ERCC6

rs1917799) ήταν που σχετίζονται με γαστρικό κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, και οι αλληλεπιδράσεις των άλλων δύο ζεύγη (pri-ας-7α-1 rs10739971-

PGC

rs65458238, και pri-ας-7α-1 rs10739971-

PGC

rs9471643) συνδέθηκαν με ατροφική γαστρίτιδα κίνδυνο.

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμό και

PGC

rs6458238 και πολυμορφισμοί rs9471643 έχουν αναφερθεί προηγουμένως. Σε αυτή τη μελέτη, επιπλέον ανέλυσε pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός στην ίδια ομάδα. Το ζεύγος των pri-ας-7α-1 πολυμορφισμός rs10739971 και

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμού είχαν Ή αλληλεπίδρασης τους 2,59 για γαστρικό κίνδυνο καρκίνου, η οποία ήταν μεγαλύτερη από την ατομική ενιαίο τόπο αποτελέσματά τους 0,92 και 1,07, αντίστοιχα. Ομοίως, το ζεύγος των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

PGC

rs6458238 πολυμορφισμού είχαν Ή αλληλεπίδρασης τους 2,77 για ατροφική γαστρίτιδα του κινδύνου, η οποία ήταν μεγαλύτερη από την ατομική ενιαίο τόπο επιπτώσεις τους 0,74 και 1,23, αντίστοιχα. Το ζεύγος των pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός και

PGC

rs9471643 πολυμορφισμού είχαν Ή αλληλεπίδρασης τους 0,52 για ατροφική γαστρίτιδα κίνδυνο. Είναι ενδιαφέρον, ατομικές single-τόπου αποτελέσματά τους ήταν αντίθετες προς τις ανωτέρω διαπιστώσεις, με ή 1,65 και 1,06, αντίστοιχα, η οποία αξίζει περαιτέρω ανεξάρτητη αναπαραγωγή των ευρημάτων μας.

Επειδή pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός αποδειχθεί επιδράσεις της αλληλεπίδρασης τόσο με

PGC

SNPs σε ατροφική γαστρίτιδα κίνδυνο, έχουμε περαιτέρω διενεργείται ανάλυση της αλληλεπίδρασης των τριών θετικών πολυμορφισμούς. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η OR για τον κίνδυνο ατροφική γαστρίτιδα ήταν 23.55 (

P

= 0,001). Γενικά, ένα μονό-τόπος έχει μία ασθενή επίδραση (OR & lt? 1,5) σχετικά με τον κίνδυνο της νόσου, και ο συνδυασμός δύο ή περισσοτέρων αλληλεπιδράσεων SNP-SNP συχνά επιδεικνύει μέτρια (OR≥1.5) ή μια ισχυρή επίδραση (OR≥2). Στην παρούσα μελέτη, η OR των pri-ας-7α-1 ενιαία θέση ήταν 1,61? η OR για τις επιπτώσεις στην αλληλεπίδραση με

ERCC6

και

PGC

ήταν τόσο περισσότερο από 2? ο συνδυασμός των τριών θετικών loci επιδείξει ακόμη υψηλότερες ή του 23,55. Αυτά τα αποτελέσματα ανέφερε τις προοπτικές εφαρμογή ενός συνδυασμού δύο ή περισσοτέρων SNPs ως πιθανούς βιοδείκτες για την πρόβλεψη του κινδύνου της νόσου.

Διερευνώντας τις επιπτώσεις της αλληλεπίδρασης των πολυμορφισμών των miRNAs και πολυμορφισμοί του γονιδίου θα συμβάλει στην ολοκληρωμένη κατανόηση του δικτύου γονιδίων και η ρόλος του miRNA στην παθογόνο διαδικασία. Εκτίμηση του αλληλεπιδράσεων SNP-SNP έχουν συχνά υποκείμενων μηχανισμών αντί να είναι απλώς στατιστικά αποτελέσματα [9]. Τα τρία ζεύγη των SNPs έδειξε ότι miRNA μπορεί να αλληλεπιδρά με τα γονίδια σε γαστρικό καρκινογένεση. PGC πρωτεΐνη έχει μια προστατευτική επίδραση στο επιθήλιο του κανονικού στομάχι, και η έκφρασή του μειώνεται σε μια ατροφική γαστρίτιδα ομάδα σε σύγκριση με την κανονική ομάδα [14], [25]. Ο ακριβής ρόλος της ΔΕΠΑ στην ατροφική γαστρίτιδα δεν είναι ακόμη σαφής. ERCC6 εμπλέκεται στην οδό επιδιόρθωσης του DNA, και επαναλαμβανόμενες βλάβες στο DNA και επισκευή μπορεί να οδηγήσει σε κυτταρικό καρκινογένεση [15]. Με βάση τα ευρήματα της παρούσας μελέτης, είναι εύλογο να υποθέσουμε ότι αφήνω-7α μπορούν να συμμετέχουν στις διαδικασίες των PGC που προκαλεί ατροφική γαστρίτιδα και ERCC6 την πρόκληση καρκίνου του στομάχου. Σύμφωνα με τα αποτελέσματα από το λογισμικό πρόβλεψης στόχο miRNA, υπήρχαν πιθανές θέσεις σύνδεσης της αφήνω-7a με 3′-UTR τόσο για

PGC

και

ERCC6

. Αν οι SNP-SNP επιδράσεις αλληλεπίδραση που παρατηρήθηκε σε αυτή τη μελέτη ήταν λόγω της δέσμευσης των miRNA και γονιδίων στόχων του εξακολουθεί να απαιτεί περαιτέρω λειτουργική πειράματα.

Αυτή η μελέτη είχε κάποιους περιορισμούς. Κατ ‘αρχάς, αν είχαμε ένα σχετικό μεγάλο μέγεθος δείγματος 471 ασθενείς με γαστρικό καρκίνο, 645 ασθενείς με ατροφική γαστρίτιδα και 717 μάρτυρες, αυτό το μέγεθος του δείγματος μπορεί να εξακολουθεί να είναι ανεπαρκής για την ανίχνευση επιπτώσεις αλληλεπίδρασης, ιδιαίτερα για σπάνια αλληλόμορφα. Δεύτερον, οι μηχανισμοί των συνδεδεμένων αλληλεπιδράσεις SNP-SNP πρέπει να αποσαφηνιστούν, και οι επόμενες λειτουργικές πειράματα που απαιτούνται. Τρίτον, αρκετές μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία υποδηλώνουν μια ενσωμάτωση δεδομένων από μελέτες σύνδεσης γονιδίωμα-ευρεία του γαστρικού καρκίνου από την κινεζική πληθυσμούς? Ως εκ τούτου, τα δεδομένα θα πρέπει να ενσωματωθούν, και μπορούν να χρησιμοποιηθούν ως θέσεις υποψήφιος πολυμορφισμός να μελετηθεί στο μέλλον. Τέταρτον, η αλληλεπίδραση μεταξύ γονιδίων και περιβάλλοντος για γαστρικό κίνδυνο καρκίνου είναι ένας σημαντικός παράγοντας που πρέπει να εξεταστεί, όπως το κάπνισμα και το ποτό. Σε αυτή τη μελέτη, συλλέξαμε κάποια στοιχεία σχετικά με το κάπνισμα και το ποτό, αλλά εξακολουθεί να υπάρχει σχεδόν το ένα τρίτο των ελλειπόντων στοιχείων από τα δείγματα. πρέπει να εξεταστούν οι αλληλεπιδράσεις μεταξύ των γονιδίων και του καπνίσματος και της κατανάλωσης οινοπνεύματος στο γαστρικό κίνδυνο καρκίνου.

Συμπέρασμα

Αυτή η μελέτη, για πρώτη φορά, αναφέρει ότι pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμό και

ERCC6

rs1917799 πολυμορφισμός μπορεί να έχει ένα αποτέλεσμα της αλληλεπίδρασης στη γαστρική κίνδυνο καρκίνου? και pri-ας-7α-1 rs10739971 πολυμορφισμός μπορεί να έχει ένα αποτέλεσμα της αλληλεπίδρασης με το

PGC

rs6458238 και rs9471643 πολυμορφισμών σε ατροφική γαστρίτιδα κίνδυνο. Ορισμένα στοιχεία που έχουν συλλεχθεί προβλέπει την πιθανή κατασκευή ενός γαστρικού οδού δίκτυο καρκίνο. Μελλοντικές μελέτες και πειράματα μηχανισμό μεγάλης κλίμακας που απαιτούνται για να επιβεβαιώσουν τα ευρήματα αυτής της μελέτης.