Αφηρημένο

Στόχος

Ο μεταγραφικός παράγοντας 7-σαν 2 (

TCF7L2

) γονιδίου έχει προταθεί να παίζει σημαντικό ρόλο στην παθογένεση του καρκίνου. Ωστόσο, τα αποτελέσματα ήταν ασυνεπής. Σε αυτή τη μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για να διευκρινίσει τις ενώσεις μεταξύ των

TCF7L2

πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου.

Μέθοδοι

δημοσιευμένη βιβλιογραφία από PubMed και EMBASE ανακτήθηκαν. Συγκεντρωτικά αναλογίες πιθανοτήτων (OR) με 95% διάστημα εμπιστοσύνης (ΠΙ) υπολογίστηκαν με τη χρήση σταθερού ή τυχαίων δράσεων μοντέλο.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο των 19 μελετών (14,814 περιπτώσεις και 33.856 έλεγχοι) προσδιορίστηκαν για την ανάλυση της σχέσης μεταξύ του

TCF7L2

πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το

TCF7L2

πολυμορφισμός σχετίζεται με τον καρκίνο του μαστού (Ομογενή μοντέλο: OR = 1.17, 95% CI = 1,02 – 1,35,

I

2 = 21,8%,

σ

για ετερογένεια = 0,276? ετερογενείς μοντέλο: OR = 1,11, 95% CI = 01.03 με 01.20,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0,543), ο καρκίνος του προστάτη (Ομογενή μοντέλο: OR = 0.89, 95% CI = 0.84-0.96,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0.640? ετερογενής μοντέλο : OR = 0.89, 95% CI = 0.84-0.95,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0,871), και καρκίνο του παχέος εντέρου (ετερογενής μοντέλο: OR = 1.15, 95% CI = 01/01 – 01/31,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0.658), αλλά όχι με ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του πνεύμονα, και των ωοθηκών .

Συμπεράσματα

Η παρούσα μετα-ανάλυση έδειξε ότι υπήρχαν σημαντικά τις ενώσεις μεταξύ του

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμό και τον κίνδυνο καρκίνου του μαστού, του προστάτη και του παχέος εντέρου, και όχι καρκίνο του παχέος εντέρου , καρκίνο του πνεύμονα και τον καρκίνο των ωοθηκών

Παράθεση:. Chen J, Yuan Τ, Liu Μ, Chen P (2013) σύνδεσης μεταξύ TCF7L2 πολυμορφισμό του γονιδίου και τον κίνδυνο καρκίνου: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 8 (8): e71730. doi: 10.1371 /journal.pone.0071730

Επιμέλεια: Swati Palit Deb, Βιρτζίνια Πανεπιστήμιο της Κοινοπολιτείας, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 21 Φλεβάρη 2013? Αποδεκτές: 9 του Ιούλη 2013? Δημοσιεύθηκε: 9 Αυγ, 2013

Copyright: © 2013 Chen et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο μεταγραφικός παράγοντας 7-σαν 2 (

TCF7L2

) γονίδιο, έχουν αναφερθεί στο παρελθόν ως

TCF-4

, έχει βρεθεί ότι σχετίζεται με διαβήτη τύπου 2. Rs7903146 ​​παραλλαγή του

TCF7L2

γονιδίου ήταν αρχικά χαρακτηρίστηκε ως ένας δείκτης της ευαισθησίας του διαβήτη τύπου 2, από τη μελέτη σύνδεσης του γονιδιώματος σε επίπεδο [1]. Οι ακόλουθες μελέτες επιβεβαίωσαν περαιτέρω τη σχέση μεταξύ

TCF7L2

παραλλαγή rs7903146 ​​και διαβήτη τύπου 2 [2]. Επιπλέον, τα άτομα που μεταφέρουν Τ αλληλόμορφα του

TCF7L2

παραλλαγή rs7903146 ​​απέδειξαν υψηλό κίνδυνο αντίστασης στην ινσουλίνη [3]. Εναλλακτικά,

TCF7L2

μπορεί να επηρεάσει τον καρκίνο ανεξάρτητα από διαβήτη, όπως η

TCF7L2

γονιδιακό προϊόν εμπλέκεται ο /β-κατενίνης μονοπάτι σηματοδότησης Wnt. TCF7L2 σχηματίζει ένα δραστικό πυρηνικό συγκρότημα με β-κατενίνης που δεσμεύει και επάγει την έκφραση των γονιδίων στόχων που εμπλέκονται στον κυτταρικό πολλαπλασιασμό, αποφυγή της απόπτωσης, και εισβολή ιστού και μετάσταση.

Μέχρι σήμερα, πολλές μελέτες έχουν δημοσιευθεί διερευνούν το σύνδεσης μεταξύ

TCF7L2

rs7903146 ​​ή rs12255372 (είναι σε υψηλό ανισορροπία σύνδεσης με rs7903146) και διάφορους τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένων του καρκίνου του μαστού [4] – [8], του καρκίνου του προστάτη [5], [9] – [ ,,,0],12], ορθοκολικό καρκίνο [5], [13] – [15], καρκίνος του παχέος εντέρου [5], [16], ο καρκίνος του πνεύμονα [5] και τον καρκίνο των ωοθηκών [6]. Ωστόσο, τα συμπεράσματα ήταν αντικρουόμενες. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια μετα-ανάλυση για να διευκρινιστεί η σχέση μεταξύ

TCF7L2

παραλλαγή rs7903146 ​​και του καρκίνου του κινδύνου.

Υλικά και Μέθοδοι

Λογοτεχνία και στρατηγική αναζήτησης

Ψάξαμε τις βάσεις δεδομένων της βιβλιογραφίας PubMed και EMBASE. Η στρατηγική αναζήτησης για να εντοπίσει όλες τις πιθανές μελέτες που εμπλέκονται με τη χρήση των παρακάτω λέξεις-κλειδιά: (

TCF7L2

ή παράγοντα μεταγραφής 7-σαν 2 ή

TCF-4

) και (παραλλαγή ή παραλλαγή ή πολυμορφισμός ή γονότυπος) και (καρκίνος ή καρκίνωμα ή όγκου). συμπεριλήφθηκαν όλες οι σχετικές μελέτες που δημοσιεύθηκαν στην αγγλική γλώσσα. Οι κατάλογοι αναφοράς ανακτηθεί άρθρα αυτά χέρι-αναζήτηση. Εάν περισσότερα από ένα άρθρο δημοσιεύθηκαν χρησιμοποιώντας την ίδια σειρά περιστατικών, είχε συμπεριληφθεί μόνο η μελέτη με τα τελευταία στοιχεία. Η αναζήτηση βιβλιογραφίας ενημερώθηκε στις 18 Φεβρουαρίου, 2013.

Κριτήρια Ένταξης και Εξόρυξη Δεδομένων

Οι μελέτες που περιλαμβάνονται στη μετα-ανάλυση πρέπει να πληρούν όλα τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης: (1) αξιολογεί τις ενώσεις του

TCF7L2

πολυμορφισμού με τον κίνδυνο καρκίνου? (2) χρησιμοποιεί case-control ή σχέδιο ομαδικής? και (3) παρέχει επαρκή στοιχεία για τον υπολογισμό του λόγου πιθανοτήτων (OR), με διάστημα εμπιστοσύνης 95% (CI). Οι ακόλουθες πληροφορίες προέρχονται από κάθε μελέτη: (1) το όνομα του πρώτου συγγραφέα? (2) ετών από τη δημοσίευση? (3) τη χώρα προέλευσης? (4) εθνικότητα? (5) τύπος καρκίνου? (6) το μέγεθος του δείγματος των περιπτώσεων και ελέγχων? (7) συμπαράγοντες «προσαρμογή OR με 95% CI κάτω από συν-κυρίαρχο μοντέλο? (8) ελάσσονα συχνότητα αλληλίου σε περιπτώσεις και τους ελέγχους? (9)

σ

για δοκιμή Hardy Weinberg ισορροπία στους ελέγχους? και (10) μελέτησαν πολυμορφισμό. Οι δύο συγγραφείς ανεξάρτητα αξιολόγησε τα άρθρα για τη συμμόρφωση με τα κριτήρια ένταξης /αποκλεισμού, επιλύονται οι διαφωνίες και να φτάσει μια συνεπή απόφαση.

Στατιστική Ανάλυση

Η σύνδεση των

TCF7L2

πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου εκτιμήθηκε υπολογίζοντας συγκεντρωτικές ΕΑΠ και 95% ΠΙ κάτω από ένα συν-κυρίαρχο μοντέλο. Η σημασία των συγκεντρωμένων Ή προσδιορίστηκε με δοκιμή Z (P & lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική). δοκιμή Q διεξήχθη για να αξιολογηθεί η ετερογένεια μεταξύ των μελετών. Μια τυχαίου (μέθοδος Dersimonian-Laird [17] ή σταθερού (μέθοδος Mantel-Haenszel) [18] εφέ μοντέλο χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό των συγκεντρωμένων ή παρουσία (

P

≤0.10) ή απουσία (

P

& gt?.. 0.10) της ετερογένειας, αντίστοιχα ανάλυση υποομάδας με βάση τον τύπο του καρκίνου έγινε για την αντιμετώπιση του μεταξύ μελετών ετερογένεια προκατάληψη Δημοσίευση εκτιμήθηκε με δοκιμασία Begg του [19] και τη δοκιμή Egger [20] (

P

& lt? 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντική) η ανάλυση των δεδομένων έγινε με τη χρήση STATA έκδοση 11 (StataCorp LP, College Station, TX, USA)

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά των Μελετών

σε αυτή τη μελέτη, ακολουθήσαμε τη Δήλωση PRISMA (Checklist S1). ένα διάγραμμα ροής που περιγράφει τη διαδικασία της ένταξης /αποκλεισμού της μελέτης παρουσιάζεται στο Σχ. 1. Η βιβλιογραφική έρευνα εντόπισε συνολικά 128 εν δυνάμει σχετικών εγγράφων. από αυτούς, 112 έγγραφα αποκλείστηκαν λόγω των προφανών ασχετοσύνη από την ανάγνωση τους τίτλους και περιλήψεις. Επιπλέον, δύο έγγραφα εξαιρέθηκαν επειδή σχόλια. Στη συνέχεια, 14 έγγραφα πληρούσαν τα κριτήρια ένταξης πρωτοβάθμιας. Ωστόσο, ένα χαρτί αποκλείστηκε επειδή δεν παρέχουν επαρκή στοιχεία για τον υπολογισμό ή με 95% CI [21]. Από περισσότερες από μία μελέτη που περιλαμβάνονται σε δύο άρθρα από Folsom et al [5] και Goode et [6] al, θεωρήθηκαν ως ξεχωριστές μελέτες στη μετα-ανάλυση. Επιπλέον, δεδομένου ότι rs7903146 ​​ήταν σε υψηλό LD με rs12255372, συνδυάσαμε όλα τα περιλαμβάνονται μελέτες μαζί. Επιτέλους, 19 μελέτες για τη συσχέτιση μεταξύ

TCF7L2

πολυμορφισμού και του καρκίνου του κινδύνου συμπεριλήφθηκαν στην τελική μετα-ανάλυση. Από αυτούς, πέντε ήταν για τον καρκίνο του μαστού, πέντε ήταν για τον καρκίνο του προστάτη, οι τέσσερις ήταν σε καρκίνο του παχέος εντέρου, δύο ήταν για τον καρκίνο του παχέος εντέρου, δύο ήταν για τον καρκίνο του πνεύμονα, και ένα ήταν για τον καρκίνο των ωοθηκών. Τα χαρακτηριστικά που περιλαμβάνονται μελέτες που παρατίθενται στον Πίνακα 1. Θα πρέπει να σημειωθεί ότι, επειδή οι περισσότερες μελέτες που προβλέπονται συμπαράγοντες «προσαρμοστεί Ή με 95% CI κάτω από ένα συν-κυρίαρχο μοντέλο, υπολογίστηκε η συγκεντρωτική εκτίμηση βάσει μόνο αυτό το μοντέλο.

η μετα-ανάλυση των αποτελεσμάτων

Ένα σύνολο 14.814 περιπτώσεις και 33.856 ελέγχους εντοπίστηκαν για την ανάλυση της σχέσης μεταξύ του

TCF7L2

πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το

TCF7L2

πολυμορφισμός μπορεί να μην σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου στο πλαίσιο συν-κυρίαρχο μοντέλο (Ομογενή μοντέλο: OR = 1.07, 95% CI = 0,95 – 1,21,

I

2 = 61,4%,

σ

για ετερογένεια & lt? 0.001, Εικόνα 2? ετερογενείς μοντέλο: OR = 1,04, 95% CI = 0,97-1,12,

I

2 = 58,1%,

σ

για ετερογένεια = 0.001, Εικόνα 3). Ωστόσο, περαιτέρω ανάλυση μίας υποομάδας με βάση τον τύπο του καρκίνου πρότεινε ότι το μέγεθος της επίδρασης ήταν σημαντική για τον καρκίνο του μαστού (Ομογενή μοντέλο: OR = 1.17, 95% CI = 1,02 – 1,35,

I

2 = 21,8%,

σ

για ετερογένεια = 0,276? ετερογενείς μοντέλο: OR = 1,11, 95% CI = 01.03 έως 01.20,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0,543), ο καρκίνος του προστάτη (Ομογενή μοντέλο: OR = 0.89, 95% CI = 0.84-0.96,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0.640? ετερογενής μοντέλο: OR = 0.89, 95% CI = 0.84-0.95,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0,871), και καρκίνο του παχέος εντέρου (ετερογενής μοντέλο: Ή = 1.15, 95% CI = 01.01 έως 01.31,

I

2 = 0,0%,

σ

για ετερογένεια = 0.658), αλλά όχι για τον ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του πνεύμονα, των ωοθηκών και καρκίνο (όλα

σ

& gt? 0.05, Πίνακας 2)

Η

Η

Πιθανές δημοσίευση Bias

Όχι προκατάληψη δημοσίευση θα μπορούσε να ανιχνευθεί κάτω από ομοιογενείς. συν-κυρίαρχο μοντέλο (

σ

= 0,780 για τη δοκιμή Begg και

σ

= 0,123 για τη δοκιμή Egger) και ετερογενή συν-κυρίαρχο μοντέλο (

σ

= 0,889 για τη δοκιμή Begg του και

σ

= 0,274 για τη δοκιμή Egger του).

Συζήτηση

για το καλύτερο της γνώσης μας, μας μετα-ανάλυση αποτελεί την πρώτη διερεύνηση της συσχέτισης μεταξύ

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμός μπορεί να μην σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου. Ωστόσο, περαιτέρω στρωματοποιημένη ανάλυση κατέδειξε τη σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του μαστού, τον καρκίνο του προστάτη και του παχέος εντέρου, και όχι ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του πνεύμονα, και των ωοθηκών.

Είναι ενδιαφέρον ότι η Τ αλληλόμορφο πολυμορφισμού rs7903146, η οποία έχει συσχετισθεί με αυξημένο κίνδυνο για διαβήτη τύπου 2, έδειξε την αντίστροφη σχέση με τον καρκίνο του προστάτη με βάση μας μετα-ανάλυση. Το εύρημα ήταν συνεπή με εκείνα από τις μεμονωμένες μελέτες από Folsom et al. [5] και Machiela κ.ά. [12]. Ωστόσο, οι άλλοι τρεις που περιλαμβάνονται μελέτες δεν δείχνουν καμία συσχέτιση [9] – [11]. Επιπλέον, βρήκαμε θετική συσχέτιση μεταξύ του rs7903146 ​​πολυμορφισμό και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου του μαστού. Πρόσφατα, Μιχαηλίδου K et al. [22] βρήκαν rs7904519 στο ιντρόνιο 4 του

TCF7L2

(r

2 = 0,37 με rs7904519 /rs12255372), να συνδέεται με τον καρκίνο του μαστού. Περαιτέρω μελέτες είναι απαραίτητες για την εξέταση των πιθανών διαφορετικών μηχανισμών του

TCF7L2

πολυμορφισμός σε διάφορες μορφές καρκίνου.

Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών είναι κοινή σε μετα-ανάλυση των μελετών γενετικής σύνδεσης. Παρά το γεγονός ότι μπορεί να ληφθεί υπόψη η ετερογένεια εκτελώντας ένα μοντέλο τυχαίων δράσεων, θα αυξήσει τις πιθανότητες σφάλματος τύπου Ι [23]. Βρήκαμε σημαντικά μεταξύ μελετών ετερογένεια στην ένωση του

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου. Ως εκ τούτου, η ανάλυση μίας υποομάδας με βάση τους τύπους καρκίνου διεξήχθη για να διερευνήσει την πηγή της ετερογένειας. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η ετερογένεια μεταξύ των μελετών εξαφανίστηκαν σε διάφορες υποομάδες, αλλά παρέμεινε σε άλλες υποομάδες προτείνοντας άλλους συμπαράγοντες μπορεί να συγχύσει την ένωση.

Η τρέχουσα μετα-ανάλυση έχει αρκετές δυνάμεις. Κατ ‘αρχάς, OR (95% CI) μετά από προσαρμογή ως συμπαράγοντες από ατομική μελέτη χρησιμοποιήθηκε για τον υπολογισμό του συγκεντρώθηκαν την εκτίμηση, η οποία αύξησε την ακρίβεια της εκτίμησης αποτελέσματος. Δεύτερον, στατιστική ισχύ βελτιώθηκε σημαντικά για τη μελέτη σύνδεσης του

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμός στη συγκεντρωτική ανάλυση. Ωστόσο, πρέπει επίσης να σημειωθεί αρκετούς περιορισμούς. Κατ ‘αρχάς, η υπόθεση – σχεδιασμός της μελέτης ελέγχου δεν επιτρέπει τη συναγωγή της αιτιότητας μεταξύ του γονιδίου πολυμορφισμό και το αποτέλεσμα. Δεύτερον, η επίδραση του γονιδίου – γονιδίου /γονιδίων – των περιβαλλοντικών αλληλεπιδράσεων δεν απευθύνθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση. Τρίτον, αν και η εθνικότητα παίζει σημαντικό ρόλο στη σύνδεση των

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμού με τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου, εμείς δεν εκτελέσει την περαιτέρω ανάλυση υποομάδας με βάση την εθνικότητα, λόγω της περιορισμένης έκτασης μελέτες για κάθε τύπο καρκίνου.

Συμπερασματικά, τα αποτελέσματα έδειξαν ότι υπήρχε σημαντικά συσχέτιση μεταξύ

TCF7L2

rs7903146 ​​πολυμορφισμό και ο κίνδυνος καρκίνου του μαστού, ο καρκίνος του προστάτη και του παχέος εντέρου, και όχι ορθοκολικό καρκίνο, καρκίνο του πνεύμονα, και καρκίνου των ωοθηκών. Περαιτέρω καλά σχεδιασμένες μελέτες μεγάλης κλίμακας με την εξέταση των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος θα πρέπει να διεξάγεται για να ερευνήσει τη σχέση στο μέλλον.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Λίστα ελέγχου

doi:. 10.1371 /journal.pone.0071730.s001

(DOC)