PLoS One: Αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro Πολυμορφισμός και του κινδύνου καρκίνου ωοθηκών: Μια μετα-ανάλυση


Abstract

Σκοπός

Τα αλληλόμορφα του πολυμορφισμού στο κωδικόνιο 72 του γονιδίου καταστολής όγκων ρ53 προκαλεί ανισορροπία έκφρασης πρωτεΐνης ρ53. Προγενέστερες μελέτες έχουν δείξει συσχέτιση μεταξύ αλληλόμορφων του πολυμορφισμού στο κωδικόνιο 72 του γονιδίου ρ53 με κίνδυνο καρκίνου των ωοθηκών (OC)? Ωστόσο, τα αποτελέσματα είναι ασαφή και αντικρουόμενες. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε αυτή την μετα-ανάλυση για τη διερεύνηση της σχέσης μεταξύ της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt?. Pro πολυμορφισμός και η συνολική ευαισθησία OC

Μέθοδοι

Ψάξαμε όλα τα επιλέξιμα δημοσιευμένες μελέτες με βάση τη σχέση μεταξύ κωδικονίου 72 του p53 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο της OC. Τα δεδομένα συνενώθηκαν μαζί από μεμονωμένες μελέτες και μετα-ανάλυση διεξήχθη. Συγκεντρωτικά πιθανότητες αναλογίες (ΕΑΠ) και 95% CI υπολογίστηκαν για την αντίθεση αλληλόμορφο, ομόζυγο, ετερόζυγη, κυρίαρχη και υπολειπόμενη γενετική μοντέλα.

Αποτελέσματα

Ένα σύνολο δώδεκα μελέτες που αποτελείται από 993 υποθέσεις οργανωμένου εγκλήματος και 1264 υγιείς μάρτυρες συμπεριλήφθηκαν σε αυτή την μετα-ανάλυση. Συνολικά, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση ανιχνεύθηκε για Pro φορέα αλληλόμορφο (Pro εναντίον Arg: p = 0,916? OR = 0.980, 95% CI = 0,677 – 1,419), ομόζυγο (Pro /Pro εναντίον του Arg /Arg: p = 0,419? Ή = 0,731, 95% CI = 0,341 – 1,564), ετερόζυγη (Arg /Pro εναντίον του Arg /Arg: p = 0,248? OR = 1.237, 95% CI = 0,862 – 1,773), κυρίαρχη (Pro /Pro + Arg /Pro vsArg /Arg: p = 0,699? OR = 1.089, 95% CI = 0,706 – 1,681), και υποτελούς (Pro /Pro vs Arg /Arg + Arg /Pro: p = 0,329? OR = 0.754, 95% CI = 0,428 – 1,329 ) γενετικά μοντέλα, αντίστοιχα. Επίσης, στην στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση του πολυμορφισμού με τον κίνδυνο της OC βρέθηκε σε Καυκάσιο πληθυσμό.

Συμπεράσματα

Αυτή η μετα-ανάλυση έδειξε ότι κωδικόνιο 72 του p53 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός μπορεί να μην συμβάλουν σημαντικά στην ωοθήκη ευαισθησίας στον καρκίνο. Ωστόσο, οι μελλοντικές μεγάλες μελέτες με τις αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος που απαιτούνται για την επικύρωση αυτών των ευρημάτων

Παράθεση:. Alqumber ΜΑΑ, Akhter Ν, Haque S, το Panda AK, Mandal RK (2014) Αξιολόγηση της σύνδεσης μεταξύ p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro Πολυμορφισμός και του κινδύνου καρκίνου ωοθηκών: Μια μετα-ανάλυση. PLoS ONE 9 (4): e94874. doi: 10.1371 /journal.pone.0094874

Επιμέλεια: Klaus Roemer, του Πανεπιστημίου του Saarland Ιατρική Σχολή, Γερμανία

Ελήφθη: 2, Γενάρη 2014? Αποδεκτές: 20, Μαρ 2014? Δημοσιεύθηκε: 18 Απριλίου του 2014

Copyright: © 2014 Alqumber et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Οι συγγραφείς δεν έχουν καμία υποστήριξη ή χρηματοδότηση για να αναφέρετε

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ωοθηκών καρκίνου (OC) είναι η πιο κοινή καρκίνωμα. μεταξύ των γυναικών με κακή πρόγνωση. Είναι η έκτη κύρια αιτία θανάτου μεταξύ των γυναικολογικών κακοηθειών σε γυναίκες σε όλο τον κόσμο [1], [2]. Η αιτιολογία της OC είναι ακόμα ασαφής και επιδημιολογικές μελέτες έχουν προτείνει ότι η ευαισθησία σε OC ενός ατόμου επηρεάζεται από διάφορους γενετικούς παράγοντες [3]. Ωστόσο, δεν υπάρχει καμία λεπτομερή τεχνική διαλογής για αυτή την κακοήθεια, υποδεικνύοντας ότι η αναγνώριση ενός γονιδίου που σχετίζονται με τον κίνδυνο OC μπορεί να βελτιώσει την έγκαιρη διάγνωση και πρόληψη αυτής της θανάσιμης ασθένειας.

Ο ογκοκατασταλτικού γονιδίου ρ53 (ΤΡ53 σε 17p13), αναγνωρίζονται ως «φύλακας του γονιδιώματος», παίζει ένα σημαντικό ρόλο στη σύλληψη του κυτταρικού κύκλου, γήρανση, την επισκευή βλάβης του DNA, ρυθμίζει τον κυτταρικό κύκλο και απαιτεί απώλεια των μεταλλάξεων λειτουργίας για τον σχηματισμό όγκων [4].

Τα πρωτεΐνη ρ53 λειτουργεί παρεμβαίνοντας με κεντρική ρυθμιστές της υποξίας οι οποίες μεσολαβούν την αγγειογένεση, και τελικά αναστέλλουν την παραγωγή των προ-αγγειογόνων παραγόντων και ενδογενών αναστολέων αγγειογένεσης [5], [6], [7]. Η ικανότητα της ρ53 να εξαλείψει το υπερβολικό, κατεστραμμένα ή μολυσμένα κύτταρα με απόπτωση είναι απαραίτητη για την σωστή ρύθμιση του κυτταρικού πολλαπλασιασμού σε πολυκύτταροι οργανισμοί. Διαφορική έκφραση του p53 σε διάφορους καρκίνους και σύνδεσης των επιπέδων ρ53 ορού με κακοήθεις όγκους υπογραμμίζει τη σημασία του ρόλου του ρ53 σε κακοήθειας [8], [9]. Οι κύριες λειτουργίες του ΤΡ53 αδρανοποίησης είναι υποκαταστάσεις μονής βάσης και απώλεια αλληλόμορφα, με αδρανοποίηση από ιικές ή κυτταρικές πρωτεΐνες [10].

Αρκετές πολυμορφισμοί έχουν ανιχνευθεί τόσο κωδικοποίησης και μη-κωδικοποίησης περιοχή αυτού του γονιδίου [ ,,,0],11]. Ένα σημαντικό μοναδικού νουκλεοτιδίου βλαστικής πολυμορφισμό γραμμή στην προλίνη πλούσια περιοχή του εξονίου 4 του γονιδίου ρ53 επάγει μια αργινίνης σε προλίνη αλλαγή υπόλειμμα στη θέση αμινοξέος 72 [12]. Οι δύο πολυμορφικές μορφές (Pro72 και Arg72) του γονιδίου p53 έχουν διαφορετικές πρωτεύουσες δομές, ηλεκτροφορητική μετανάστευση και λειτουργικές ιδιότητες [13]. Η αργινίνη (Arg72) αλληλόμορφο αυξάνει την ικανότητα του ρ53 να εντοπίσει στα μιτοχόνδρια και επαγωγή κυτταρικού θανάτου, ενώ προλίνη αλληλόμορφο (Pro72) προσδίδουν μια χαμηλότερη αποπτωτικό δυναμικό και μία αυξημένη κυτταρική σύλληψη στη φάση G1 του κυτταρικού κύκλου [14].

Λαμβάνοντας υπόψη τη λειτουργική σημασία του γονιδίου p53 στην καρκινογένεση, πιθανολογείται ότι κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός μπορεί να είναι ένας πιθανός παράγοντας ευαισθησίας για OC. Τον τελευταίο καιρό, αρκετές μελέτες ασθενών-μαρτύρων επιδημιολογικές έχουν αξιολογήσει τη συσχέτιση μεταξύ p53codon 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμών και των κινδύνων OC [15] – [26]. Παρά τις πολλές μελέτες σε παγκόσμιο επίπεδο, η υποτιθέμενη σχέση μεταξύ p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro γενετικό πολυμορφισμό και τον κίνδυνο OC παραμένει αβέβαιη και στερείται συναίνεσης. Ως εκ τούτου, να αποκομίσουν μια πιο ακριβή σύναψη της πιθανής συσχέτισης μεταξύ p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο OC, μια μετα-ανάλυση έγινε με βάση την επιλέξιμη δημοσιευμένες μελέτες

Υλικά και Μέθοδοι

Δημοσίευση στρατηγική αναζήτησης

Πραγματοποιήσαμε μία PubMed (Medline), EMBASE και το Google Scholar Αναζήτηση διαδικτυακή βάση δεδομένων που καλύπτει όλα τα ερευνητικά άρθρα δημοσιεύονται με ένα συνδυασμό από τις ακόλουθες λέξεις κλειδιά: «γονίδιο p53 (πολυμορφισμός ή μετάλλαξη ή παραλλαγή) κΑΙ καρκίνωμα των ωοθηκών ή καρκίνο των ωοθηκών, την ευαισθησία του όγκου (τελευταία ενημέρωση τον Νοέμβριο του 2013). Όλες οι μελέτες αναζήτηση ανακτήθηκαν και ελέγχθηκαν, καθώς και λίστες αναφοράς για άλλες σχετικές μελέτες. Όταν, περισσότερες από μία του ίδιου πληθυσμού περιλήφθηκε σε αρκετές δημοσιεύσεις, μόνο η πιο πρόσφατη ή πλήρη μελέτη περιλήφθηκε σε αυτό το μετα-ανάλυση. Επειδή, αυτό είναι μια μετα-ανάλυση δημοσιευμένων άρθρων με βάση την ένωση του p53 κωδικονίου 72 Arg & gt?. Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο OC, τόσο ηθικά έγκριση δεν απαιτείται για τη μελέτη αυτή

κριτήρια

Ένταξη και αποκλεισμού

για να ελαχιστοποιηθεί η ετερογένεια και διευκολύνει την κατάλληλη ερμηνεία αυτής της μελέτης, που δημοσιεύθηκε άρθρα που περιλαμβάνονται στο σημερινό μετα-ανάλυση έπρεπε να πληρούν όλα τα ακόλουθα κριτήρια ένταξης: α) οι μελέτες θα πρέπει να έχουν μια εγκάρσια τομή, περίπτωση ελέγχου ή ομάδα σχεδιασμού, β) πρέπει να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο OC, γ) προσλαμβάνονται παθολογικά ή ιστολογικά επιβεβαιωμένη OC ασθενείς και υγιείς μάρτυρες, δ) να διαθέτουν συχνότητα του γονότυπου στην υπόθεση και έλεγχο, ε) και δημοσιεύθηκε στα αγγλικά γλώσσα. Επίσης, όταν η μελέτη ασθενών-μαρτύρων περιλήφθηκε κατά περισσότερο από ένα άρθρο της έρευνας με τη χρήση της ίδιας σειράς περίπτωση, επιλέξαμε τη μελέτη που περιελάμβανε το μεγαλύτερο αριθμό ατόμων. Από την άλλη πλευρά, οι κυριότεροι λόγοι για τον αποκλεισμό της μελέτης ήταν, επικάλυψη των δεδομένων, την περίπτωση μόνο μελέτες, άρθρα ανασκόπησης, και ραδιοσυχνοτήτων ή αριθμών γονότυπο δεν έχουν αναφερθεί. Η διαδικασία επιλογής μελέτη έχει δείξει με τη μορφή της ροής διάγραμμα όπως στην Εικόνα S1 (PRISMA Flow Diagram).

Εξαγωγή δεδομένων και αξιολόγηση της ποιότητας

Για κάθε ανακτηθεί δημοσίευση της έρευνας, τη μεθοδολογική αξιολόγηση της ποιότητας και εξόρυξη δεδομένων έγιναν ανεξάρτητα αντλείται εις διπλούν χρησιμοποιώντας ένα πρότυπο πρωτόκολλο από δύο ανεξάρτητους ερευνητές. μορφή συλλογής δεδομένων χρησιμοποιήθηκε για να εγγυηθεί την ακρίβεια των στοιχείων που συλλέγονται από αυστηρά σύμφωνα με τα κριτήρια ένταξης-αποκλεισμού που αναφέρονται παραπάνω. Τα κύρια χαρακτηριστικά που αντλείται από τα ανακτηθεί μελέτες περιλαμβάνεται το όνομα του πρώτου συγγραφέα, το έτος δημοσίευσης, τη χώρα προέλευσης, τον αριθμό των περιπτώσεων και των ελέγχων, το είδος της μελέτης, και τις συχνότητες γονότυπο. Περιπτώσεις που συνδέονται με διαφωνία σχετικά με οποιοδήποτε στοιχείο των δεδομένων από τα συλλεχθέντα ερευνητικές μελέτες είχαν πλήρως συζητηθεί με τους ερευνητές για να επιτευχθεί μια τελική συναίνεση.

Η στατιστική ανάλυση

Για να εξεταστεί η σχέση μεταξύ της p53 κωδικόνιο 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο OC, συγκεντρωτικές ΕΑΠ και τα αντίστοιχα 95% των πιστωτικών ιδρυμάτων έχουν εκτιμηθεί. παραδοχή ετερογένεια εξετάστηκε από την Q-chi-square test με βάση [27]. Ετερογένεια θεωρήθηκε σημαντική όταν p-value & lt? 0,05. Τα δεδομένα από ενιαίο σύγκριση συνενώθηκε με τη χρήση σταθερών μοντέλο επιπτώσεις [28], όταν παρουσιάστηκε καμία ετερογένεια. Σε αντίθετη περίπτωση, το μοντέλο τυχαίων δράσεων [29] χρησιμοποιήθηκε για τη συγκέντρωση σκοπό. Επιπλέον, I

2 στατιστικών στοιχείων χρησιμοποιήθηκε για την ποσοτικοποίηση μεταβλητότητας μεταξύ μελέτης και μεγαλύτερες τιμές πρότεινε έναν αυξανόμενο βαθμό ετερογένειας [30]. Hardy-Weinberg ισορροπία (HWE) στους ελέγχους υπολογίστηκε μέσω τεστ chi-square. οικόπεδο χοάνη ασυμμετρία υπολογίστηκε με γραμμική παλινδρόμηση δοκιμή Egger, η οποία είναι ένα είδος γραμμικής παλινδρόμησης μεθοδολογίας για τη μέτρηση της ασυμμετρίας οικόπεδο χοάνη για το φυσικό λογάριθμο κλίμακα των ΙΑΠ. Η σημασία της τομής προσδιορίζεται από το t-test εξετάζει τιμή p & lt? 0,05 ως αναπαράσταση στατιστικά σημαντική προκατάληψη δημοσίευση [31]. Επίσης, η ανάλυση των υποομάδων πραγματοποιήθηκε από την εθνικότητα, και η εθνικότητα ορίστηκε κυρίως ως Καυκάσιους. Μια συγκριτική εξέταση των λογισμικών «μετα-ανάλυση» πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας τη διεύθυνση URL https://www.meta-analysis.com/pages/comparisons.html. Η Περιεκτική μετα-ανάλυση (CMA) Έκδοση 2 πρόγραμμα λογισμικού (Biostat, USA) επιλέχθηκε και χρησιμοποιήθηκε για να εκτελέσει όλες τις στατιστικές αναλύσεις που εμπλέκονται σε αυτή τη μελέτη.

Αποτελέσματα

Χαρακτηριστικά του περιλαμβάνονται μελέτες

Σύμφωνα με την επιλογή μας (ένταξη αποκλεισμού) κριτήρια, συνολικά δώδεκα ερευνητικά άρθρα περιλήφθηκαν τελικώς μέσα από βιβλιογραφική έρευνα από το PubMed (Medline), EMBASE και βάσεις δεδομένων ιστού Google Scholar σε αυτό το μετα-ανάλυση. Όλα ανακτηθεί ερευνητικές δημοσιεύσεις εξετάστηκαν προσεκτικά από την ανάγνωση τους τίτλους και περιλήψεις, και τα πλήρη κείμενα των εν δυνάμει σχετικών ερευνητικών άρθρων περαιτέρω έλεγχος για την καταλληλότητα τους για το τρέχον μετα-ανάλυση. Μελέτες είτε δείχνοντας p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός να προβλέψει την επιβίωση σε ασθενείς OC ή θεωρώντας παραλλαγές p53 ως ένα δείκτες για την ανταπόκριση στη θεραπεία αποκλείστηκαν αμέσως. Ομοίως, επίσης εξαιρούνται μελέτες που διερευνούν τα επίπεδα του mRNA p53 ή έκφραση της πρωτεΐνης ή σχετικά άρθρα ανασκόπησης. Στην παρούσα μετα-ανάλυση, συμπεριλήφθηκαν μόνο περίπτωση ελέγχου ή σχέδιο ομαδικής μελέτες που έχουν συχνότητα των τριών γονοτύπων. Εκτός από την αναζήτηση της βάσης δεδομένων, οι πίνακες αναφοράς που υπάρχουν στα ανακτηθούν άρθρα ελέγχθηκαν επίσης για άλλες πιθανές ερευνητικές δημοσιεύσεις (Πίνακας 1). Κατανομή των γονότυπων, έλασσον αλληλόμορφο συχνότητας (MAF) και HWE στους ελέγχους και περιπτώσεις έχουν παρουσιαστεί στον Πίνακα 2.

Η

προκατάληψη Δημοσίευση

οικόπεδο χοάνη Begg και δοκιμή Egger του διεξήχθησαν να αξιολογηθεί η προκατάληψη δημοσίευση μεταξύ των επιλεγμένων μελετών για την μετα-ανάλυση. Η εμφάνιση του σχήματος των οικοπέδων χοάνη φαινόταν να είναι συμμετρική σε όλες τις γενετικά μοντέλα. δοκιμή του Egger ήταν για την παροχή της στατιστικά στοιχεία του οικοπέδου χοάνη. Τα αποτελέσματα έδειξαν έλλειψη μεροληψίας δημοσίευση μεταξύ όλων των μοντέλων σύγκρισης (Πίνακας 3).

Η

Αξιολόγηση της ετερογένειας

Για να αναλυθεί η ανομοιογένεια μεταξύ των επιλεγμένων μελετών, Q-test και I

2 στατιστικά στοιχεία που χρησιμοποιούνται και την ετερογένεια παρατηρήθηκε σε όλες τις πέντε γενετικές μοντέλα. Ως εκ τούτου, τυχαίες επιδράσεις μοντέλο εφαρμόστηκε για να συνθέσει τα δεδομένα (Πίνακας 3)

Σύλλογος p53 κωδικονίου 72 Arg & gt?. Pro πολυμορφισμό και την ευαισθησία OC

συγκεντρώνονται όλες τις δώδεκα μελέτες μαζί και είχε ως αποτέλεσμα σε 1264 ελέγχους και 993 υποθέσεις οργανωμένου εγκλήματος, να επανεξετάσει τη συνολική σχέση μεταξύ p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο OC. Συνολικά συγκεντρωτική ανάλυση δεν έδειξε κάποια συσχέτιση μεταξύ της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμό και OC κινδύνου σε όλα τα πέντε μοντέλα γενετικές συγκρίσεις, δηλαδή, αλληλόμορφο (Pro εναντίον Arg: p = 0,916? OR = 0.980, 95% CI = 0,677 για 1.419), ομόζυγο (Pro.Pro εναντίον Arg.Arg: p = 0,419? OR = 0.731, 95% CI = 0,341 – 1,564), ετερόζυγη (Arg.Pro εναντίον Arg.Arg: p = 0,248? OR = 1.237, 95% CI = 0,862 – 1,773), υπολειπόμενο (Pro.Pro εναντίον Arg.Arg + Arg.Pro: p = 0,329? OR = 0.754, 95% CI = 0,428 – 1,329) και κυρίαρχου μοντέλου (Pro.Pro + Arg. Pro εναντίον Arg.Arg:. p = 0,699? OR = 1.089, 95% CI = 0,706 – 1,681) (Εικόνα 1)

Μαύρο τετράγωνο αντιπροσωπεύει την αξία του ή και το μέγεθος της πλατείας δείχνει το αντίστροφο αναλογία σε σχέση με την διακύμανση της. Οριζόντια γραμμή είναι το 95% CI της OR. Οι μελέτες που αναφέρονται από το έτος δημοσίευσης.

Η

Η ανάλυση των υποομάδων της φυλετικής καταγωγής

Έχουμε αναλύσει μόνο Καυκάσιο πληθυσμό από το σχεδιασμό της μελέτης και τους συμμετέχοντες. Αυτή η μετα-ανάλυση περιλάμβανε οκτώ μελέτες (717 περιπτώσεις και 797 έλεγχοι), ετερογένεια παρατηρήθηκε σε όλες τις γενετικές μοντέλα? Έτσι, τυχαία μοντέλο επίδραση εφαρμόστηκε για την ανάλυση των δεδομένων. Στην υποομάδα προκατάληψη δημοσίευση ανάλυση δεν υπήρχε (Πίνακας 4). Εμείς δεν τήρησε καμία συσχέτιση της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμού με κίνδυνο OC σε Καυκάσιο πληθυσμό σε όλα τα μοντέλα της γενετικής σύγκριση, δηλαδή, αλληλόμορφο (Pro εναντίον Arg: p = 0,542? OR = 0,862, 95% CI = 0,535 – 1,388 ), ομόζυγο (Pro.Pro εναντίον Arg.Arg: p = 0,307? OR = 0.630, 95% CI = 0,260 – 1,527), ετερόζυγη (Arg.Pro εναντίον Arg.Arg: p = 0,781? OR = 1.059, 95 % CI = 0,707 – 1,586), υπολειπόμενο (Pro.Pro εναντίον Arg.Arg + Arg.Pro: p = 0,259? OR = 0.686, 95% CI = 0,356 – 1,320) και κυρίαρχου μοντέλου (Pro.Pro + Arg.Pro εναντίον Arg.Arg: p = 0,710? OR = 0,905, 95% CI = 0,534 – 1,532) (Εικόνα 2)

Μαύρο τετράγωνο αντιπροσωπεύει την αξία του ή και το μέγεθος της πλατείας δείχνει την αντίστροφη αναλογία σε σχέση με διακύμανση της. Οριζόντια γραμμή είναι το 95% CI της OR. Οι μελέτες που αναφέρονται από το έτος δημοσίευσης.

Η

Συζήτηση

Η ρ53 ογκοκατασταλτικό γονίδιο, μεταλλάσσεται σε πολλούς ανθρώπινους τύπους καρκίνου, υποδεικνύει καθοριστικό ρόλο της στην άμυνα του ξενιστή ενάντια κακοήθεια [6]. Το κυτταρικό επίπεδο της πρωτεΐνης ρ53 ρυθμίζεται με πολύπλοκο τρόπο από ένα αρνητικό βρόχου ανάδρασης που περιλαμβάνει ουβικιτίνη φαρμακευτική αποδόμησης [32]. Με βάση τη φύση του γενετικού προσβολή, άγριου-τύπου ρ53 προκαλεί είτε διακοπή αύξησης ή απόπτωση. Οποιεσδήποτε αλλαγές στο γονίδιο p53 περιορίσουν αυτές τις δραστηριότητες και θα επιτρέψει τη συνεχή πολλαπλασιασμό των κυττάρων, οδηγώντας τελικά στην εξέλιξη της κακοήθειας [33].

Παρά την αξιοσημείωτη πρόοδο στη μηχανιστική κατανόηση της δομής και της λειτουργίας ρ53, τη συμβολή των ειδικών p53 γονιδίου πολυμορφισμούς σε κίνδυνο OC παραμένει διφορούμενη και αποδειχθεί ότι είναι εξαιρετικά πολύπλοκο βιοδείκτες. Το ενδιαφέρον για τη γενετική ευαισθησία σε OC έχει οδηγήσει σε μια αναδυόμενη τάση στη μελέτη των πολυμορφισμών των γονιδίων που εμπλέκονται σε κίνδυνο OC. Λόγω των διαφορετικών ρόλων του γονιδίου p53 στο ανθρώπινο γονιδίωμα, έχει υποτεθεί ότι κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός σχετίζεται με τον κίνδυνο της OC. Ως αποτέλεσμα, ένας μεγάλος αριθμός μελετών έχουν διεξαχθεί για να αξιολογηθεί η συσχέτιση μεταξύ του κωδικονίου p53 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμό και κίνδυνο OC, αλλά τα αποτελέσματα από διαφορετικές δημοσιευμένες μελέτες στερείται συναίνεση. Ασυνέπεια στα αποτελέσματα από αυτές τις μελέτες μπορεί να αποδοθεί στη χαμηλή στατιστική ισχύ για να αξιολογηθεί η συνολική επίδραση της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμού με τον κίνδυνο OC. Η απάντηση σε αυτόν τον περιορισμό είναι μια μετα-ανάλυση, ένα ισχυρό εργαλείο για τη διερεύνηση των παραγόντων κινδύνου που σχετίζονται με γενετικές ασθένειες, η οποία απασχολεί ποσοτική τεχνική για να συγκεντρώσουν τα στοιχεία από μεμονωμένες μελέτες όπου οι επιμέρους μεγέθη των δειγμάτων είναι μικρό με μικρότερη στατιστική δύναμη, και παρέχει αξιόπιστα συμπεράσματα [34]. Ως εκ τούτου, έχουμε κάνει την παρούσα μετα-ανάλυση από δώδεκα επιλέξιμες μελέτες που δημοσιεύθηκαν περίπτωση ελέγχου για την αξιολόγηση της εν λόγω σχέση του p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός και τον κίνδυνο της OC. Η μελέτη αυτή θα μπορούσε να βοηθήσει να εξερευνήσουν μια πιο ισχυρή εκτίμηση για το ρόλο αυτού του πολυμορφισμού με τον κίνδυνο OC, καθώς συνδυάζει δεδομένα από πολλές μελέτες έχει το πλεονέκτημα των μειωμένων τυχαία σφάλματα [35].

Τα συνολικά ενοποιημένα αποτελέσματα αυτής της μετα -την ανάλυση αποκάλυψε ότι το p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός δεν επηρέασε αυξημένο ή μειωμένο κίνδυνο OC σε όλες τις πέντε γενετικές μοντέλα σύμφωνα με τις επιλέξιμες μελέτες, σε σύγκριση με τον άγριο αλληλόμορφο τύπου. Ακόμη και στην στρωματοποιημένη ανάλυση ανά εθνικότητα, δεν παρατηρήθηκε στατιστικά σημαντική σχέση μεταξύ της p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro γονότυπου και του κινδύνου OC ανιχνεύθηκε σε Καυκάσιο πληθυσμό. Μια πιθανή εξήγηση είναι ότι έχουν αρκετές άλλες SNPs έχουν αναφερθεί στο γονίδιο ρ53 και προηγούμενες έρευνες έδειξαν ότι οι διάφορες άλλες SNPs που σχετίζονται με την ευαισθησία σε OC. Είναι πιθανό ότι ο αναλύθηκαν παραλλαγή δεν ενεργεί ως πρωταρχικό πολυμορφισμός ευαισθησία και μπορεί να την αναστολή της λειτουργίας της ρ53 με τη σύνδεση με άλλα λειτουργικά αλληλόμορφα πολυμορφισμό που βρέθηκαν σε ανισορροπία σύνδεσης (LD). Τα αποτελέσματα μας είναι σε συμφωνία με το Shen et al. [36], ενώ Zhang et al. 2008 ανέφερε μειωμένο κίνδυνο [37]. Επιπλέον, συγκεντρώθηκαν και μετα-αναλύσεις για μαστού [38], του πνεύμονα [39] και του ενδομητρίου [40] καρκίνοι δεν υποστηρίζουν ένα σημαντικό ρόλο για αυτόν τον πολυμορφισμό στην επιδεκτικότητα. Ευαισθησία σε OC είναι μια διαδικασία πολλών σταδίων στην οποία περιβαλλοντικούς και γενετικούς παράγοντες αλληλεπιδρούν στενά και μια ενιαία γενετική παραλλαγή είναι συνήθως ανεπαρκής για να προβλέψει τον κίνδυνο αυτής της θανάσιμης ασθένειας.

Η ετερογένεια μεταξύ των μελετών είναι πολύ κοινό στις γενετικές μελέτες σύνδεσης των μετα-ανάλυση. Στην παρούσα μετα-ανάλυση βρήκαμε ετερογένεια μεταξύ μελέτη σε συνολική ανάλυση. Υπάρχουν διάφοροι παράγοντες που ευθύνονται για τέτοια ετερογένεια, δηλαδή, τα γενετικά υπόβαθρα για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους, διαφορετικά διανομή γονότυπο του κωδικονίου 72 Arg & gt?. Pro σε διαφορετικές εθνοτικές ομάδες και άνιση κριτήρια επιλογής για τις περιπτώσεις και τους ελέγχους σε διάφορες μελέτες

Παρά τα σημαντικά ευρήματα από την τρέχουσα ανάλυση μας, έχουμε ακόμη να αναγνωρίσουμε κάποιους περιορισμούς της μελέτης αυτής. Κατ ‘αρχάς, θα περιλαμβάνονται μόνο οι μελέτες που δημοσιεύθηκε στην αγγλική γλώσσα, που αντλείται και καταχωρίζονται από τις επιλεγμένες ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων για την ανάλυση των δεδομένων? είναι πιθανό ότι μερικοί σχετικές εκθέσεις που δημοσιεύονται σε άλλες γλώσσες και αναπροσαρμόζονται σε άλλες ηλεκτρονικές βάσεις δεδομένων μπορεί να έχουν χαθεί. Δεύτερον, το αποτέλεσμα αυτής της μετα-ανάλυση βασίστηκε σε αδιόρθωτη ΕΑΠ, διότι δεν είναι όλες οι επιλέξιμες μελέτες δήλωσε προσαρμοσμένη ΕΑΠ. Τρίτον, ο ρόλος των αλληλεπιδράσεων γονιδίων-περιβάλλοντος δεν θεωρήθηκαν που μπορούν να επηρεάσουν τον κίνδυνο της OC. Επίσης, αξίζει να αναφέρουμε πολλά δυνατά σημεία της μελέτης μας. Πρώτον, έχουμε συμπεριλάβει σημαντικά περισσότερο τον αριθμό των περιπτώσεων και ελέγχει σύγκριση με την προηγούμενη μελέτη μετα-ανάλυση με τη χρήση αποτελεσματικών και αποδοτικών στρατηγική αναζήτησης για να αυξηθεί η στατιστική ισχύς της ανάλυσης. Δεύτερον, η ποιότητα των μελετών ασθενών-μαρτύρων που περιλαμβάνονται στην παρούσα ανάλυση από κοινού ήταν ικανοποιητική και συναντήθηκε με τα προκαθορισμένα κριτήρια ένταξης.

Συμπέρασμα

Εν κατακλείδι, μια μετα-ανάλυση είναι μια ορθολογική προσέγγιση της ανάλυσης δεδομένων που πισίνες και τα δύο στατιστικά σημαντική και μη σημαντικά ευρήματα από μεμονωμένες μελέτες για τη βελτίωση της στατιστικής απόδοσης με την αύξηση του μεγέθους του δείγματος. μετα-ανάλυση μας δείχνει ότι η p53 κωδικονίου 72 Arg & gt? Pro πολυμορφισμός μπορεί να μην διαμορφώνουν σημαντικά τον κίνδυνο OC. Ωστόσο, το μέλλον καλά σχεδιασμένη μεγάλες μελέτες, ιδιαίτερα στρωματοποιημένη από τις αλληλεπιδράσεις γονιδίων-γονιδίων και γονιδίων-περιβάλλοντος μπορεί να είναι αναγκαίο να διευκρινιστεί ο πιθανός ρόλος του p53 κωδικονίου 72 Arg & gt?. Pro πολυμορφισμός στην ευαισθησία σε OC

Υποστήριξη Πληροφοριών

Εικόνα S1.

PRISMA 2009 Διάγραμμα ροής. Εμφάνιση προσδιορισμό και την επιλογή των μελετών για την μετα-ανάλυση

doi:. 10.1371 /journal.pone.0094874.s001

(ΔΕΘ)

Λίστα ελέγχου S1.

PRISMA Checklist 2009

doi:. 10.1371 /journal.pone.0094874.s002

(DOC)

Ευχαριστίες

Σας ευχαριστούμε Ινστιτούτο Επιστημών Ζωής (Μπούμπανεσβαρ, Ινδία ) και το Πανεπιστήμιο Albaha (Albaha, Σαουδική Αραβία) για την παροχή της που σχετίζονται με το λογισμικό υποστήριξης ανάλυσης δεδομένων.

You must be logged into post a comment.