Αφηρημένο

Αδιάσειστα τεκμήρια έχουν δείξει ότι η ομάδα υψηλής κινητικότητας box-1 (HMGB1) γονίδιο διαδραματίζει έναν κρίσιμο ρόλο στην την ανάπτυξη του καρκίνου και της εξέλιξης. Η παρούσα μελέτη στοχεύει να αξιολογήσει τις επιπτώσεις των πολυμορφισμών απλού νουκλεοτιδίου (SNPs) στο

HMGB1

γονίδιο για την επιβίωση του γαστρικού καρκίνου (GC) ασθενείς. Τρεις SNPs ετικέτα από το

επιλέχθηκαν HMGB1

γονίδιο και γονότυπος χρήση του συστήματος προσδιορισμού του γονότυπου Sequenom IPEX σε μία ομάδα από 1030 ασθενείς GC (704 στο σύνολο εκπαίδευσης, 326 στο σύνολο επικύρωσης). Η πολυπαραγοντική Cox αναλογικό μοντέλο κινδύνου και Kaplan-Meier Curve χρησιμοποιήθηκαν για την ανάλυση πρόγνωση. γονότυπους AG /AA των SNP rs1045411 στο

HMGB1

γονίδιο που σχετίζονταν σημαντικά με καλύτερη συνολική επιβίωση (OS) σε ένα σύνολο 704 ασθενών GC, σε σύγκριση με γονότυπους GG (HR = 0,77, 95% CI: 0,60 – 0,97 ,

P

= 0,032). Αυτή η προγνωστική επίδραση επιβεβαιώθηκε σε ένα ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης και συγκεντρωτική ανάλυση (HR = 0,80, 95% CI: 0,62 – 0,99,

P

= 0,046? HR = 0,78, 95% CI: 0,55 – 0,98,

P

= 0,043, αντίστοιχα). Σε στρωματοποιημένη ανάλυση, η προστατευτική επίδραση του rs1045411 γονότυπους AG /AA ήταν περισσότερο εμφανής σε ασθενείς με δυσμενείς στρώματα, σε σύγκριση με τους ασθενείς με ευνοϊκές στρώματα. Επιπλέον, η κοινή προβλεπτική επιπτώσεις στο λειτουργικό σύστημα των ασθενών GC σημειώθηκαν μεταξύ των γονότυπων rs1045411 και ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο ή επικουρική χημειοθεραπεία. Επιπλέον, λειτουργική ανάλυση έδειξε μια σημαντική επίδραση της rs1045411 στο

HMGB1

έκφρασης. Τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι rs1045411 στο

HMGB1

συνδέεται σημαντικά με την κλινική έκβαση των ασθενών κινεζική GC μετά από χειρουργική επέμβαση, ιδιαίτερα σε εκείνους με επιθετική κατάσταση, η οποία χρήζει περαιτέρω επικύρωση σε άλλες πληθυσμιακές ομάδες

Αιτιολογική αναφορά.: Bao G, Qu F, Ο L, Zhao Η, Wang Ν, Ji G, et al. (2016) προγνωστική σημασία των ετικετών SNP rs1045411 στο

HMGB1

του επιθετικού καρκίνου του γαστρικού σε ένα κινεζικό πληθυσμό. PLoS ONE 11 (4): e0154378. doi: 10.1371 /journal.pone.0154378

Επιμέλεια: Qing-Yi Wei, Δούκα Ινστιτούτο Καρκίνου, Ηνωμένες Πολιτείες |

Ελήφθη: 23 του Γενάρη του 2016? Αποδεκτές: 12 του Απρίλη του 2016? Δημοσιεύθηκε: 26 Απρ, 2016

Αυτό είναι ένα ανοικτό άρθρο πρόσβασης, χωρίς όλα τα πνευματικά δικαιώματα, και δεν μπορεί να αναπαραχθεί ελεύθερα, διανεμηθεί, να μεταδοθεί, τροποποιηθεί, χτισμένο πάνω, ή ειδάλλως να χρησιμοποιηθεί από οποιονδήποτε για οποιονδήποτε νόμιμο λόγο. Το έργο γίνεται διαθέσιμα υπό την Creative Commons CC0 αφοσίωση δημόσιο τομέα

Δεδομένα Διαθεσιμότητα:.. Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση: Το έργο υποστηρίχθηκε από επιχορηγήσεις από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (Αρ 81272201 και Νο 81572916 έως GB? Νο 81200330 έως ΒΔ)

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

. εισαγωγή

Καρκίνος στομάχου (GC) είναι η τέταρτη πιο κοινή μορφή καρκίνου στον κόσμο, αντιπροσωπεύοντας περίπου το 8% των νέων κρουσμάτων καρκίνου και το 10% των θανάτων από καρκίνο [1]. Από τις περιπτώσεις αυτές, το 70% σημειώθηκε στις αναπτυσσόμενες χώρες, και το ήμισυ του παγκόσμιου συνόλου συνέβη στην Ανατολική Ασία, κυρίως στην Κίνα [2]. Κατά τη διάρκεια των τελευταίων δεκαετιών, παρά τη σημαντική αύξηση των επενδύσεων και η πρόοδος στη διάγνωση και τη θεραπεία του GC, η συνολική επιβίωση (OS) για προηγμένη GC εξακολουθεί να είναι θλιβερή, με ποσοστό επιβίωσης 5 ετών μικρότερη από 25% [3 ]. Επί του παρόντος, η επιβίωση και την πρόγνωση των ασθενών με GC εξακολουθούν να εξαρτώνται από το στάδιο του όγκου κατά τη στιγμή της διάγνωσης. Ωστόσο, λόγω των σαφώς σημαντικές διαφορές μέσα στην ίδια φάση, το στάδιο του όγκου από μόνη της δεν είναι επαρκής για να προβλέψουμε την πρόγνωση του GC [4]. Ως εκ τούτου, για να ανακαλύψουν νέες μοριακές υπογραφές ως αξιόπιστη προγνωστικοί δείκτες για GC είναι πολύ σημαντική και απαιτητική. Τα τελευταία χρόνια, μελέτες έχουν επικεντρωθεί στη διερεύνηση των γενετικών παραλλαγών που προδιαθέτουν στην ανάπτυξη και εξέλιξη της GC [5].

box-1 Ομάδα υψηλού κινητικότητας (HMGB1), ένα σημαντικό μέλος της ομάδας υψηλού κινητικότητα πρωτεΐνη υπεροικογένειας, περιέχει δύο πεδία 80 αμινοξέων δέσμευσης DNA (Α-box και Β-box) και μία όξινη καρβοξυλ ουρά [6]. Λειτουργεί ως χρωματίνης δομική πρωτεΐνη εντός του πυρήνα και προφλεγμονωδών κυτοκινών εξωκυτταρικά. Ως πυρηνική πρωτεΐνη, HMGB1 δεσμεύεται μη-ειδικά προς την μικρή αύλακα του DNA και διευκολύνει την συναρμολόγηση των στόχων DNA site-specific [7]. Σε αντίθεση, εξωκυτταρική HMGB1 λειτουργεί ως μια κυτοκίνη που διαδίδεται προσβολή από ή τραυματισμούς που προκαλούνται φλεγμονώδεις αντιδράσεις [8]. Η συνεχής απελευθέρωση της HMGB1 από νεκρωτικό καρκινικά κύτταρα μπορεί να δημιουργήσει ένα μικροπεριβάλλον που μοιάζει με χρόνια φλεγμονή? μια κατάσταση που είναι γνωστή να συμβάλει στην ανάπτυξη των επιθηλιακών κακοηθειών, ιδιαίτερα σχετίζεται με φλεγμονή του καρκίνου [9]. Στην πραγματικότητα, πολλές μελέτες έχουν δείξει προηγουμένως την υπερ-έκφραση της HMGB1 σε πολλούς τύπους καρκίνου [10-13], συμπεριλαμβανομένων GC [14]. Επιπλέον, αναγκάζοντας αποδείξεις επιβεβαίωσαν επίσης ότι HMGB1 υπερέκφραση συνδέεται στενά με την ανάπτυξη του όγκου με τη μεσολάβηση του πολλαπλασιασμού, εισβολή και τη μετανάστευση των καρκινικών κυττάρων [15, 16]. Ως εκ τούτου, η HMGB1 μπορεί να είναι ένα ενδιαφέρον υποψήφιο ως νέο προγνωστικός δείκτης ή θεραπευτικό στόχο για GC.

Συσσωρευμένα αποδείξεις έχουν προτείνει ότι γενετικό υπόβαθρο μπορεί να επηρεάσουν τον κίνδυνο και την πρόγνωση της GC [17]. Πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου (SNP) είναι η πιο κοινή γενετική παραλλαγή, και μπορεί να είναι οι πολλά υποσχόμενες υποκατάστατο βιοδείκτες γενετικών υποβάθρων των ασθενών για την πρόβλεψη θεραπευτικής απόκρισης και την πρόγνωση [18]. Οι γενετικές παραλλαγές έχουν εντοπιστεί στο ανθρώπινο

HMGB1

γονίδιο [19], αλλά η συσχέτιση μεταξύ των

HMGB1

πολυμορφισμό του γονιδίου και την έκβαση της επιβίωσης GC δεν έχει προσδιοριστεί. Δεδομένου του κρίσιμου ρόλου της HMGB1 στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου, είναι εύλογο ότι οι πολυμορφισμοί του

HMGB1

μπορούν να επηρεάσουν τα κλινικά αποτελέσματα της GC. Στο παρόν, δεν αξιολόγησε τα αποτελέσματα των τριών SNPs ετικέτα στο

HMGB1

στην κλινική έκβαση των 1030 ασθενών κινεζική GC (704 στο σύνολο εκπαίδευσης, 326 στον ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης) που έλαβαν ριζική θεραπεία εκτομή. Επιπλέον, το αποτέλεσμα ενός προσδιορισμένου σχετικού SNP ετικέτα για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης εξετάστηκε περαιτέρω από μια

in vitro

λειτουργική δοκιμασία. Για το καλύτερο της γνώσης μας, αυτή είναι η πρώτη έρευνα της σύνδεσης μεταξύ των πολυμορφισμών του

HMGB1

και την κλινική έκβαση της GC.

Υλικά και Μέθοδοι

Ηθική

η μελέτη εγκρίθηκε από την Επιτροπή Ηθικής του The Fourth Military Medical University. Οι διαδικασίες πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα με τις εγκεκριμένες κατευθυντήριες γραμμές και τη Διακήρυξη του 1964 του Ελσίνκι και τις μεταγενέστερες τροποποιήσεις της ή συγκρίσιμες ηθικά πρότυπα. Η υπογεγραμμένη ενημερωμένη συγκατάθεση λήφθηκε από κάθε συμμετέχοντα που περιλαμβάνονται στη μελέτη.

πληθυσμός Μελέτη

Ένα σύνολο 1030 Κινέζων Χαν ασθενείς με πρωτοπαθή γαστρικό αδενοκαρκίνωμα εντάχθηκαν από δύο ανεξάρτητους χώρους, Tangdu Νοσοκομείο και Xijing νοσοκομείο Νοσημάτων Πεπτικού, σε Xi’an, Κίνα. Όλες οι περιπτώσεις GC έλαβαν χειρουργική εκτομή και δεν είχαν προηγούμενο ιστορικό άλλων μορφών καρκίνου ή οποιαδήποτε προεγχειρητική αντικαρκινική θεραπεία ή μετάγγιση αίματος μέσα σε 3 μήνες πριν από την επέμβαση. Δεν υπήρχαν ηλικία, το φύλο, ή νόσο περιορισμοί στάδιο για την περίπτωση πρόσληψης. Μεταξύ αυτών, οι 704 ασθενείς (Τμήμα Γενικής Χειρουργικής, Tangdu Νοσοκομείο, μεταξύ Ιουλίου 2008 και του Ιουνίου 2013) χρησιμοποιήθηκαν ως ένα σύνολο εκπαίδευσης σε αυτή τη μελέτη. Μια άλλη ομάδα 326 ασθενών (Xijing Νοσοκομείο Νοσημάτων Πεπτικού, μεταξύ Ιανουαρίου 2008 και Δεκεμβρίου 2010) χρησιμοποιήθηκαν ως ένα ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης. Ο στόχος ήταν να προσδιορίσει την κλινικά σημαντική προγνωστική αξία των SNPs στο

HMGB1

γονίδιο από το σύνολο εκπαίδευσης και δοκιμαστεί στο ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης.

Δημογραφικά και κλινικά δεδομένα

Δημογραφικά και κλινικά δεδομένα συλλέχθηκαν μέσω συνεντεύξεων πρόσωπο με πρόσωπο κατά την αρχική επίσκεψη ή παρακολούθηση στις κλινικές, ιατρικά αρχεία, ή διαβούλευση με τους θεράποντες ιατρούς, όπως η ηλικία, το φύλο, την εθνικότητα, κατοικημένη περιοχή, το χρόνο της διάγνωσης, το χρόνο της χειρουργικής επέμβασης και ή /και επικουρική χημειοθεραπεία (ACT), ο χρόνος υποτροπής ή /και το θάνατο, το στάδιο του όγκου, την ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίηση, ιστολογικό τύπο, και το πρωτόκολλο θεραπείας. Συνέχεια πληροφορίες ενημερώνονται ανά διαστήματα 6 μηνών μέσα στο χώρο του συνέντευξη, τηλεφωνική επικοινωνία, ή την επανεξέταση ιατρικά αρχεία από ειδικούς εκπαιδευμένους έρευνα. Η τελευταία παρακολούθηση ημερομηνία ήταν Ιούνη 2015 και η διάμεση διάρκεια παρακολούθησης ήταν 51 μήνες (εύρος 6 έως 89 μήνες). Το ποσοστό των ασθενών χάνονται κατά τη διάρκεια παρακολούθησης ήταν 9,8%. OS ορίστηκε ως ο χρόνος από τη χειρουργική επέμβαση στο θάνατο GC-ειδική. RFS (επιβίωση χωρίς υποτροπή) ορίστηκε ως ο χρόνος από τη χειρουργική επέμβαση με την ημερομηνία της πρώτης υποτροπής ή μακρινή μετάσταση του GC. Ασθενείς ζωντανός κατά την τελευταία παρακολούθηση ήταν λογοκρίνεται.

Συλλογή, επεξεργασία και διατήρηση των δειγμάτων

Πριν από τη χειρουργική επέμβαση, 5 ml φλεβικού αίματος συλλέχθηκαν από κάθε ασθενείς GC για να εξαγάγετε DNA χρησιμοποιώντας το E.Z.N.A. DNA Midi Kit αίματος (Omega Bio-Tek, Norcross, GA, USA). Εξήντα γαστρικό καρκινικούς ιστούς ήταν ταυτόχρονα συγκεντρώθηκαν από το σύνολο επικύρωσης για πραγματικού χρόνου ποσοτική PCR αντίστροφης μεταγραφής (RT-PCR) προσδιορισμούς.

επιλογή SNP και του γονότυπου

Ο υποψήφιος ετικέτα επιλογή SNPs του

HMGB1

γονίδιο διεξήχθησαν όπως μια διαδικασία δύο σταδίων. Πρώτον, χρησιμοποιήσαμε ένα σύνολο από web-based εργαλεία επιλογής SNP (https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpfunc.htm) για να αναζητήσετε υποψήφιο SNPs του

HMGB1

[20]. Όλα τα επικυρωμένα πολυμορφισμών σε

HMGB1 περιοχή

γονιδίου, συμπεριλαμβανομένων των 5 kb ανάντη του πρώτου εξονίου και 5 kb καθοδικά του τελευταίου εξωνίου, θεωρήθηκαν ως υποψήφιος SNPs. Αυτοί οι SNPs με μια μικρή συχνότητα αλληλόμορφο ≥ 5% στο HapMap CHB (Κινέζων Χαν στο Πεκίνο) του πληθυσμού και μια ανά ζεύγος ανισορροπία σύνδεσης τετράγωνο του συντελεστή συσχέτισης (r

2) & gt? 0.8 επιλέχθηκαν ως υποψήφια SNPs. Δεύτερον, SNPs ετικέτα επιλέχθηκαν από αυτές τις υποψήφιες SNPs χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων Διεθνούς Φάση HapMap Έργου ΙΙ του πληθυσμού της Κίνας (https://www.hapmap.org/, πρόσβαση 18, Νοεμβρίου 2013) και HAPLOVIEW έκδοση 4.2. Τέλος, τρεις SNPs ετικέτα (μέση τιμή r

2 = 0.981) επιλέχθηκαν: rs1045411 (G & gt? Α), rs1412125 (T & gt? C) και rs2249825 (C & gt? G) .Genotyping πραγματοποιήθηκε με τη χρήση του συστήματος προσδιορισμού του γονότυπου Sequenom IPLEX (Sequenom Inc., San Diego, CA, USA) σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή. Οι εργαστηριακές πρόσωπα που διεξήγαγε τις δοκιμασίες του γονότυπου τυφλώθηκαν στις πληροφορίες των ασθενών. Εσωτερικών ελέγχων ποιότητας και αρνητικοί μάρτυρες χρησιμοποιήθηκαν για να εξασφαλιστεί η ακρίβεια του γονότυπου, και 5 δείγματα επιλέχθηκαν τυχαία και ο γονότυπος εις διπλούν με 100% συμφωνία. Πρόσκληση ποσοστό για γονοτυπική κυμάνθηκε μεταξύ 99,3% και 99,7%. Οι λεπτομερείς πληροφορίες των SNPs και τα αποτελέσματα του γονότυπου έχουν περιληφθεί στον πίνακα S1.

Λειτουργική

δοκιμασία

Τα λειτουργικά αποτελέσματα του rs1045411 SNP ετικέτα που βρίσκεται στην 3’UTR του

HMGB1

γονίδιο διερευνήθηκαν μέσω χρησιμοποιώντας τη δοκιμασία λουσιφεράσης. Εν συντομία, 49-bp διπλής έλικος DNA που φέρει είτε άγριου γονότυπο ή παραλλαγή γονότυπου του rs1045411 συνετέθη και κλωνοποιήθηκε εντός του φορέα pMIR-REPORT (Ambion, Austin, Tex, USA) χρησιμοποιώντας ένζυμα περιορισμού Spe Ι και Hind III (Takara, Dalian, Κίνα). Όλα τα κατασκευάσματα επιβεβαιώθηκαν με αλληλούχιση DNA. Ανθρώπινες κυτταρικές GC γραμμές SGC-7901 και ανθρώπινου εμβρυϊκού νεφρού κυτταρική γραμμή ΗΕΚ-293Τ, στο οποίο έχει-miR-505 ήταν αταξινόμητους να εκφράζεται θετικά με τη χρήση του κιτ TaqMan microRNA Αντίστροφη Μεταγραφή (Applied Biosystem, Foster City, CA, USA) όπως προηγουμένως περιγράφεται [21], συν-επιμολύνθηκαν με είτε pMIR-rs1045411-Α ή pMIR-rs1045411-G (200 ng /φρεάτιο), με ή χωρίς αντι-miR-505 (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) και τον εσωτερικό έλεγχο πλασμίδιο αναφοράς pRLTK (Promega, Madison, WI, USA) (20 ng /φρεάτιο) χρησιμοποιώντας Λιποφεκταμίνη 2000 (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) σε μια πλάκα 24-φρεατίων με 2 × 10

5 κύτταρα ανά φρεάτιο. κυτταρικές σειρές ΗΕΚ293 SGC-7901 και αγοράστηκαν από το Type Culture Collection από την Κινεζική Ακαδημία Επιστημών (CAS) (Σανγκάη, Κίνα), όπου ελέγχθηκαν με ανίχνευση μυκόπλασμα, DNA-δακτυλικών αποτυπωμάτων, ανίχνευση ισοένζυμο και την ανίχνευση των κυττάρων ζωτικότητα. Ένα κατεψυγμένο φιαλίδιο από κάθε κυτταρική γραμμή 147, η οποία αμέσως επεκτάθηκε και καταψύχονται όταν παραληφθεί από τον πωλητή, είχε ανάνηψη και χρησιμοποιούνται για την παρούσα μελέτη. Μετά από 48 ώρες, τα κύτταρα συλλέχθηκαν για να προσδιοριστεί δραστικότητα λουσιφεράσης χρησιμοποιώντας ένα κιτ διπλής λουσιφεράσης σύστημα προσδιορισμού ανταποκριτή (Promega, Madison, WI, USA) με ένα φωτόμετρο (Tecan, Μάνερντορφ, Ελβετία). Όλες οι επιμολύνσεις έγιναν εις τριπλούν, και όλα τα πειράματα ανεξάρτητα επαναλήφθηκε τρεις φορές.

Για να αξιολογηθεί περαιτέρω η επίδραση της γονότυπων rs1045411 SNP ετικέτα στην έκφραση του

HMGB1

mRNA, ολικό RNA απομονώθηκε από 60 δείγματα ιστού GC (30 με ΑΑ γονότυπο και 30 με AG /GG γονότυπους του rs1045411) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Στη συνέχεια, cDNA συντέθηκαν χρησιμοποιώντας PrimeScript RT κιτ αντιδραστηρίων (Takara, Dalian, Κίνα). RT-PCR πραγματοποιήθηκε με χρήση των ακόλουθων

HMGB1

εκκινητές: προς τα εμπρός, 5′-TAAGAAGCCGAGAGGCAAAA-3 ‘? αντίστροφη, 5’-AGGCCAGGATGTTCTCCTTT- 3 ‘, και β-ακτίνη χρησιμοποιήθηκε ως εσωτερικός έλεγχος (εκκινητές: προς τα εμπρός, 5′-AAGACGTACTCAGGCCATGTCC-3′? αντίστροφη, 5’-GACCCAAATGTCGCAGTCAG-3 ‘) [13]. Σχετική έκφραση

HMGB1

επίπεδα mRNA προσδιορίστηκε χρησιμοποιώντας τη σχετική μέθοδο ποσοτικοποίησης και 2

-ΔΔCt ανάλυση.

Η στατιστική ανάλυση

Στατιστικά αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του IBM SPSS Statistics 19.0 λογισμικού (IBM). Κανονικά διανέμεται συνεχείς μεταβλητές εκφράσθηκαν ως μέση τιμή ± SD, ενώ ασυνήθιστα διανέμεται συνεχείς μεταβλητές εκφράσθηκαν ως μέση τιμή και εύρος. χ Pearson ‘s

2-test χρησιμοποιήθηκε για να δοκιμαστούν οι διαφορές των κατηγορικών μεταβλητών. Η διαφορά των κανονικά κατανεμημένων συνεχών μεταβλητών μεταξύ των δύο ομάδων αναλύθηκε με τη χρήση του Student

t-test

, ενώ Mann-Whitney U test χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση των ασυνήθιστα διανέμονται συνεχείς μεταβλητές. Πολυμεταβλητή μοντέλο Cox παλινδρόμησης αναλογικών κινδύνων εφαρμόστηκε για την εκτίμηση της επίδρασης των επιμέρους SNP και τα χαρακτηριστικά των ασθενών σε OS ή την RFS. αναλογίες κινδύνου (HR) και 95% διαστήματα εμπιστοσύνης (ΠΙ) εκτιμήθηκαν με προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, την ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο TNM και ACT. Καμπύλες Kaplan-Meier και οι δοκιμές log-rank χρησιμοποιήθηκαν επίσης για να αξιολογηθεί η επίδραση των μεμονωμένων SNPs στο χρόνο επιβίωσης. Στατιστικά σημαντικότητας ορίστηκε στο επίπεδο του 0,05 και όλα

P

τιμές που αναφέρονται σε αυτή τη μελέτη ήταν δύο όψεων.

Αποτελέσματα

Κατανομή των χαρακτηριστικών των ασθενών και την πρόγνωση ανάλυση

χαρακτηριστικά των ασθενών GC »συνοψίστηκε στον πίνακα S2. Λόγω της καθυστερημένης ημερομηνία λήξης της εγγραφής των ασθενών για το σύνολο εκπαίδευσης, ο μέσος χρόνος παρακολούθησης ήταν μικρότερη στο σύνολο εκπαίδευσης (46 μήνες, που κυμαίνονται 6 με 80 μήνες) από ότι στο ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης (72 μήνες, που κυμαίνονται από 6 να 89 μήνες). Έτσι, σε σύγκριση με τους ασθενείς στην ανεξάρτητη ομάδα επικύρωσης, εκείνοι στο σύνολο εκπαίδευσης είχαν χαμηλότερα ποσοστά υποτροπής (58,4%

vs

. 66,8%,

P

= 0,005) και του θανάτου (41,4%

vs

. 55,8%,

P

= 0,001). Δεν υπήρχαν διαφορές μεταξύ των σετ κατάρτισης και επικύρωσης που όσον αφορά την ηλικία, το site του όγκου, ταξινόμηση Lauren, το στάδιο TNM, της διαφοροποίησης και της ACT (

P

τιμή που κυμαίνεται 0,082 έως 0,898). Στην τελευταία παρακολούθηση, 641 ασθενείς (423 και 218 στο σύνολο εκπαίδευσης και επικύρωσης, αντίστοιχα) ανέπτυξε υποτροπή και 482 έχασαν τη ζωή τους (300 και 182 στο σύνολο εκπαίδευσης και επικύρωσης, αντίστοιχα). Η πολυπαραγοντική Cox ανάλυση παλινδρόμησης έδειξε ότι υπήρχαν σημαντικά υψηλότερο κίνδυνο θανάτου και υποτροπής σε ασθενείς με διάχυτη τύπου, κακή διαφοροποίηση και το στάδιο του όγκου III και IV σε σύγκριση με τους ασθενείς με εντερική τύπου, και /μέτρια διαφοροποίηση και το στάδιο του όγκου Ι και ΙΙ μεταξύ σύνολο εκπαίδευσης, σετ επικύρωση και συγκεντρωτική ανάλυση. Επιπλέον, με βάση την πλατίνα ACT μετά από χειρουργική επέμβαση έδειξαν σημαντική προστατευτική δράση τόσο OS και RFS των ασθενών GC (S3 πίνακα).

Σύλλογος

HMGB1

SNPs με την κλινική έκβαση σε ασθενείς GC

Θα αξιολογηθούν με τη σύνδεση των

HMGB1

SNP γονοτύπων με GC κλινική έκβαση χρησιμοποιώντας την πολυπαραγοντική ανάλυση παλινδρόμησης Cox με προσαρμογή για την ηλικία, το φύλο, θέση του όγκου, ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο TNM και ACT (όπως φαίνονται στον πίνακα 1). Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η ετικέτα SNP rs1045411 συσχετίστηκε σημαντικά με λειτουργικό σύστημα των ασθενών GC στο σύνολο εκπαίδευσης. Σε σύγκριση με τους ασθενείς με γονότυπο GG, εκείνοι με την παραλλαγή αλληλόμορφα (AG και γονοτύπων ΑΑ) είχαν σημαντικά χαμηλότερο κίνδυνο θανάτου (HR = 0,77, 95% CI: 0,60 – 0,97,

P

= 0,032). Η σημαντική αυτή διαπίστωση αυτή επιβεβαιώθηκε στην ανεξάρτητη ομάδα επικύρωσης και συγκεντρωτική ανάλυση, με ώρας 0.80 (95% CI: 0,62 – 0,99?

P

= 0,046) και 0,78 (95% CI: 0,55 – 0,98?

P

= 0.043), αντίστοιχα. Ανάλυση Kaplan-Meier καμπύλες παρέχεται επίσης μια ισχυρή συσχέτιση με το λειτουργικό σύστημα. Οι ασθενείς που μεταφέρουν AG /GG γονότυπους του rs1045411 είχε καλύτερη OS από ό, τι τα άτομα με GG γονότυπο στο σύνολο εκπαίδευσης (

P

= 0,024, σχήμα 1Α), σύνολο επικύρωσης (

P

= 0,017, σχήμα 1Β ) και συγκεντρωτική ανάλυση (

P

= 0,001, σχήμα 1Γ).

OS ασθενών GC στρωματοποιημένη με SNP rs1045411 στο σύνολο εκπαίδευσης (Α), σύνολο επικύρωσης (Β) και συγκεντρωτική ανάλυση ( ΝΤΟ). αριθμοί ασθενής δεν μπορεί να προσθέσει μέχρι και το 100% των διαθέσιμων θεμάτων, λόγω των ελλειπόντων στοιχείων του γονότυπου.

Η

Στρωματοποιημένη ανάλυση σχετικά με τη σύνδεση των rs1045411 με λειτουργικό σύστημα από μεταβλητές υποδοχής

Διενεργήσαμε στρωματοποιημένη αναλύσεις για την αξιολόγηση των συσχετίσεων μεταξύ γονότυπων του rs1045411 και OS ασθενών GC με την ηλικία, την ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο TNM και ACT. Οι σημαντικές προστατευτικές επιδράσεις που απορρέουν από rs1045411 ήταν πιο εμφανή σε αντίξοες υποομάδες με μια σειρά HR 0,39 – 0,69 (Σχήμα 2Α). Για λεπτομέρειες, η σημαντική μείωση του κινδύνου θανάτου που σχετίζεται με τους γονότυπους παραλλαγή που περιέχουν (AG /ΑΑ) του rs1045411 παρατηρήθηκε σε ηλικιωμένους ασθενείς (HR = 0,69, 95% CI: 0,48 – 0,99), διάχυτη τύπου (HR = 0,67, 95% CI: 0,47 – 0,95), η κακή διαφοροποίηση (HR = 0,66, 95% CI: 0,45 – 0,95), κλινικό στάδιο ΙΙΙ και IV (HR = 0,58, 95% CI: 0,37 – 0,93) και χωρίς ACT (HR = 0,39, 95 % CI: 0,20 – 0,76). Επιπλέον, η παρούσα στρωματοποιημένη ανάλυση έδειξε μια παρόμοια τάση για RFS με μια σειρά HR από 0,44 να 0,79 (Σχήμα 2Β). Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι γονότυπους AG /AA του rs1045411 παρέχει την πιο ευνοϊκή πρόγνωση στις δυσμενείς ομάδες.

Στρωματοποιημένη αναλύσεις των συσχετίσεων μεταξύ γονότυπων του rs1045411 και OS ασθενών GC με την ηλικία, Lauren ταξινόμηση, τη διαφοροποίηση, το στάδιο TNM και ACT (2Α), και η επίδραση στην RFS του rs1045411 γονότυπους AG /ΑΑ στη δυσμενή ομάδες (2Β). αριθμοί ασθενής δεν μπορεί να προσθέσει μέχρι και το 100% των διαθέσιμων θεμάτων, λόγω των ελλειπόντων στοιχείων του γονότυπου.

Η

Κοινή δράση μεταξύ rs1045411 και ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο ή ACT σε OS

Προηγούμενες μελέτες έχουν δείξει ότι τόσο γενετικές παραλλαγές και κλινικά χαρακτηριστικά αλληλεπιδρούν για να παίζουν κρίσιμους ρόλους στην εξέλιξη GC [17]? και ότι, όταν υπάρχουν αλληλεπιδράσεις, τα αποτελέσματα των κλινικών στοιχείων για την εξέλιξη του όγκου θα τροποποιηθούν με γονότυπους. Ως εκ τούτου, μια κοινή ανάλυση διεξήχθη για να αξιολογηθεί η δυνατότητα διαμόρφωσης επίδραση του rs1045411 σε αυτά τα κλινικά χαρακτηριστικά (ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίησης, το στάδιο και ACT) αντιπροσωπεύει την κατάσταση της εξέλιξης του όγκου σε OS ασθενών GC. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, υπήρχε σημαντική αλληλεπίδραση μεταξύ των γονοτύπων του rs1045411 και ταξινόμηση Lauren, διαφοροποίηση, στάδιο ή ACT (όλα

P

αλληλεπίδραση & lt? 0.001). Σε σύγκριση με τα άτομα που μεταφέρουν γονότυπους AG /ΑΑ και εντερικό τύπο, τα άτομα με GG γονότυπο και διάχυτη τύπου είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο θανάτου (HR = 2,09, 95% CI: 1,42 – 3,08,

P

& lt? 0.001). Τα παρόμοια αποτελέσματα βρέθηκαν επίσης σε ασθενείς που φέρουν GG γονότυπο με κακή διαφοροποίηση (HR = 2,48, 95% CI: 1,70 – 3,62,

P

& lt? 0,001), σε ασθενείς με γονότυπο GG του σταδίου III /IV ( HR = 2,99, 95% CI: 2,04 – 4,38,

P

& lt? 0.001), καθώς και σε ασθενείς που φέρουν GG γονότυπο με ACT (HR = 4,49, 95% CI: 2,70 – 7,45,

P

& lt?. 0.001) σε σύγκριση με την αντίστοιχη ομάδα αναφοράς

η

Λειτουργική επιπτώσεις της rs1045411 στη γονιδιακή έκφραση ανάλυση

Βιοπληροφορική (https://www.microrna.org/microrna /home.do) αποκάλυψε στενή γειτνίαση με rs1045411 SNP ετικέτα στο προβλεπόμενο microRNA θέσεις σύνδεσης (HSA-miR-505) στην 3′-αμετάφραστη περιοχή (3’UTR) του

HMGB1

γονίδιο [22] (Σχήμα 3Α). Εμείς επιβεβαίωσε για πρώτη φορά την έκφραση του miR-505 στην SGC-7901 και κυτταρικές σειρές ΗΕΚ-293Τ, και διαπίστωσε ότι το miR-505 είχε ένα σχετικά υψηλότερο επίπεδο έκφρασης (Σχήμα 3Β). Για να διερευνηθεί κατά πόσο οι γονότυποι του rs1045411 SNP ετικέτας στην 3’UTR του

HMGB1

γονίδιο θα μπορούσε να αλλάξει την έκφραση του γονιδίου, δύο κυτταρικές σειρές επιμολύνθηκαν με πλασμίδια αναφοράς της λουσιφεράσης που περιέχουν είτε την άγρια ​​(ΦΕΚ) ή παραλλαγής (ΑΑ) γονότυπος του SNP rs1045411 (Σχήμα 3C). Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το SNP rs1045411 έδειξαν σημαντικά επίδραση επί της κανονικοποιημένης δραστηριότητα λουσιφεράσης σε αμφότερα τα επιμολυσμένα κύτταρα. Σε σύγκριση με κύτταρα επιμολυσμένα με κατασκευάσματα που φέρουν άγρια ​​γονότυπο (GG) της SNP rs1045411, κύτταρα επιμολυσμένα με κατασκευάσματα που φέρουν την παραλλαγή γονότυπου (ΑΑ) παρουσίασαν σημαντική μειωμένη δραστικότητα λουσιφεράσης. Η επίδραση των αντι-miR-505 στην δραστικότητα λουσιφεράσης των πλασμιδίων ανταποκριτή αξιολογήθηκε επίσης στη μελέτη. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η δράση της λουσιφεράσης των δύο UTR κατασκευασμάτων (ρ-MIR-G και ρ-MIR-Α) αυξήθηκε σημαντικά με αντι-miR-505 στις δύο κυτταρικές σειρές με εξαλειφθούν οι διαφορές της δραστηριότητας της λουσιφεράσης μεταξύ δύο πλασμίδια ανταποκριτές. Επιπλέον, χρησιμοποιήσαμε ποσοτική RT-PCR για να διερευνηθεί η επίδραση της SNP γονοτύπων rs1045411 στην έκφραση του mRNA HMGB1 σε 60 ιστούς GC (30 με GG γονότυπο και 30 με γονότυπους AG /ΑΑ) από σετ επικύρωσης. Όπως φαίνεται στο Σχ 3D, βρήκαμε ότι το επίπεδο έκφρασης του mRNA της HMGB1 ήταν σημαντικά υψηλότερη στους μεταφορείς με άγρια ​​(GG) γονότυπο του rs1056560 από εκείνους που διεξάγεται παραλλαγή (AG /ΑΑ) γονότυπους (1,04 ± 0,50

vs

. 0,79 ± 0,37,

P

= 0,004).

(Α) Η αλληλουχία συμπεριλαμβανομένων των SNP rs1045411 στην 3’UTR του

HMGB1

γονίδιο. (Β) Τα σχετικά επίπεδα έκφρασης της HSA-miR-505 σε SGC-7901 και τα κύτταρα ΗΕΚ-293Τ. (Γ) Η επίδραση των SNP rs1045411 γονότυπους για την έκφραση

HMGB1

γονιδίων σε SGC-7901 και τα κύτταρα ΗΕΚ-293Τ. (D) Σχετικό επίπεδο έκφρασης του mRNA της

HMGB1

γονιδίου σε 60 ιστούς GC με διαφορετικούς γονότυπους rs1045411 SNP. Ανασυνδυασμένο φορέα (pMIR-rs1045411-G ή pMIR- rs1045411-Α) και pTL-ΤΚ συν-επιμολύνθηκαν σε SGC-7901 και τα κύτταρα ΗΕΚ-293Τ. Τα δεδομένα εκφράζονται ως μέση τιμή ± τυπική απόκλιση (SD) τριών ανεξάρτητων πειραμάτων. Μαθητή

t

test χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει στατιστική διαφορά.

Η

Συζήτηση

Στην παρούσα μελέτη, διερευνήθηκε η συσχέτιση των γενετικών πολυμορφισμών στο

HMGB1

γονίδιο με την πρόγνωση των ασθενών με ανάλυση GC δύο στάδια της κατάρτισης και επικύρωσης σετ. Έχουμε αποδείξει ότι οι γονότυποι AG /ΑΑ της ετικέτας rs1045411 SNP στο

HMGB1

3′-UTR σχετίζονται σημαντικά με καλύτερη OS σε ένα σύνολο 704 ασθενών GC, σε σύγκριση με γονότυπους GG. Αυτή η σημαντική συσχέτιση αυτή επιβεβαιώθηκε σε ένα ανεξάρτητο σύνολο επικύρωσης των 326 ασθενών GC καθώς και μια συγκεντρωτική ανάλυση όλων των ασθενών 1030 GC. Λειτουργική ανάλυση έδειξε ότι το SNP rs1045411 γονότυπους είχε σημαντική επίδραση στην έκφραση του mRNA της

HMGB1

στους ιστούς GC καθώς και δύο κυτταρικές σειρές όγκων. Επιπλέον, η ευνοϊκή επίδραση της προγνωστικής rs1045411 ήταν περισσότερο εμφανής στις δυσμενείς υποομάδες ασθενών GC. Επιπλέον, η κοινή ανάλυση έδειξε σημαντική αλληλεπίδραση γονιδίων-κλινικά στοιχεία. Για το καλύτερο της γνώσης μας, η μελέτη αυτή για πρώτη φορά ανέφερε ότι η συσχέτιση μεταξύ των

HMGB1 πολυμορφισμούς

γονιδίου και πρόγνωση GC. Όταν ολοκληρωθεί η επικύρωση,

HMGB1

SNP rs1045411 μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως προγνωστικός δείκτης σε συνδυασμό με την παραδοσιακή κλινικούς παράγοντες πρόγνωση για τη λήψη αποφάσεων της GC ατομικής μεταχείρισης.

Οι αυξανόμενες αποδείξεις προτείνουν ότι η αυξημένη HMGB1 είναι συνδέεται με τη μετάσταση του όγκου και κακή πρόγνωση [16, 23-26], καθιστώντας HMGB1 μια ελκυστική βιοδείκτη όγκου. Έχει προταθεί ότι HMGB1 λειτουργεί ως δυνητικά ογκογόνο πρωτεΐνη για την προώθηση της προόδου όγκου [15, 27, 28], και η υπερέκφραση του σε καρκινικά κύτταρα επηρεάζει την αντικαρκινική απόκριση Τ-κυττάρων μέσω της ενεργοποίησης του ενδοκυτταρικής σηματοδότησης [15, 29]. Πράγματι, η αυξημένη έκφραση της HMGB1 έχει ανιχνευθεί σε ασθενείς με GC και άλλους τύπους καρκίνου [30-32], και η έκφρασή της είναι στενά συνδεδεμένο με ογκογένεση [33], εισβολή όγκου και η μετάσταση [29]. Επιπλέον, Chung et al [34] έδειξαν ότι τα επίπεδα στον ορό HMGB1 σχετίζονταν επίσης σημαντικά με εισβολή όγκου, μετάσταση, ανάπτυξη, καθώς και κακή πρόγνωση. Συλλογικά, τα ευρήματα αυτά υποστηρίζουν ένα σημαντικό ρόλο της HMGB1 στον μετασχηματισμό του καρκίνου, την ανάπτυξη του όγκου και την εισβολή.

Παρά τις εκτεταμένες έρευνες της έκφρασης HMGB1 στους ιστούς και την αντίστοιχη ορολογική δραστηριότητα του σχετικά με την εξέλιξη του καρκίνου, υπάρχουν λίγες μελέτες με επίκεντρο η επίδραση της SNPs στο

HMGB1

γονίδιο για την πρόγνωση του καρκίνου ή την ανταπόκριση στη θεραπεία μέχρι σήμερα. Σε μια ομάδα Κινέζων ασθενών με καρκίνο του πνεύμονα, δύο SNPs, rs141215 και rs2249825, έχουν συσχετισθεί με βάση την πλατίνα αποκρίσεις χημειοθεραπεία [35]. Ομοίως, σε ασθενείς με στοματικό καρκίνωμα πλακωδών κυττάρων, ένα άλλο

HMGB1

πολυμορφισμός στα rs3742305 SNP έχει συσχετιστεί με την εξέλιξη του όγκου και επιβίωση χωρίς υποτροπή [36]. Ωστόσο, εξαιρούνται τα rs3742305 SNP από την παρούσα μελέτη, επειδή είναι σε ισχυρή ανισορροπία σύνδεσης με τους rs1045411 SNP. Στην παρούσα μελέτη, διαπιστώσαμε ότι παραλλαγή που περιέχουν (AG /ΑΑ) γονότυπους του rs1045411 SNP ετικέτα σχετίζονταν σημαντικά με καλύτερη OS σε ασθενείς με GC, υποστηρίζοντας σημαντικό ρόλο της HMGB1 στην εξέλιξη GC.

Από το SNP rs1045411 βρίσκεται στην περιοχή 3’UTR του

HMGB1

γονίδιο, μπορεί να επηρεάσει την έκφραση του

HMGB1

γονιδίου σε ασθενείς GC. Μέχρι σήμερα, όμως, δεν υπάρχουν μελέτες για την αξιολόγηση των λειτουργιών των rs1045411 SNP. Βρήκαμε ότι rs1045411 βρίσκεται σε στενή γειτνίαση με μια προβλεπόμενη θέση microRNA πρόσδεσης (έχει-miR-505) [22], υποδηλώνοντας ότι μια τέτοια παραλλαγή σε αυτή τη θέση μπορεί να επηρεάσει την σταθερότητα του mRNA και της δραστηριότητας σύνδεσης προς microRNA, διαμορφώνοντας με αυτόν τον τρόπο την έκφραση του γονιδίου [ ,,,0],37]. Πράγματι, αναλύσεις λουσιφεράσης μας επιβεβαίωσε μια σημαντική επιρροή του rs1045411 στην μετα-μεταγραφική ρύθμιση του

HMGB1

γονιδίου σε ένα miR-505-εξαρτώμενο τρόπο. Επιπλέον, εξετάζοντας το επίπεδο έκφρασης HMGB1 mRNA σε δείγματα 60 GC ιστού με δεδομένα γονότυπο του SNP rs1045411, βρήκαμε ότι οι ιστοί που φέρουν την παραλλαγή που περιέχει (AG /ΑΑ) γονότυπους είχε μειωθεί σημαντικά τα επίπεδα έκφρασης του mRNA HMGB1 σε σύγκριση με εκείνους με ομόζυγο άγριου (GG ) γονότυπο. Στο σύνολό τους, τα πειραματικά μας δεδομένα έδειξαν ότι η ευνοϊκή προγνωστική ισχύ που παρέχεται από την παραλλαγή που περιέχουν (AG /ΑΑ) γονότυπους του rs1045411 ήταν στενά συνδεδεμένη με παρεκκλίνουσα έκφραση

HMGB1

.

τρέχουσα μελέτη μας έδειξε ότι οι σημαντικές ή οριακή προστατευτική δράση της παραλλαγής που περιέχουν (AG /ΑΑ) γονότυπους των SNP rs1045411 στο λειτουργικό σύστημα και RFS των ασθενών GC βρέθηκαν σχεδόν πλήρως στο ανεπιθύμητων (αλλά όχι σε ευνοϊκή) στρώματα ασθενείς. Αυτό συμφωνεί με προηγούμενες μελέτες που δείχνουν ότι SNPs επηρεάζουν την επιβίωση του καρκίνου πιο εμφανή σε συγκεκριμένες ασθενείς υποομάδα. Για παράδειγμα, ο Wang

et al

[38] έχουν αναφέρει ότι

PSCA

rs2294008 συνδέεται σημαντικά με την επιβίωση αποτελεσμάτων μεταξύ διάχυτου τύπου γαστρικό καρκίνο, αλλά γαστρικό καρκίνο δεν εντερικού τύπου. Pu

et al

[39] έχουν επίσης προταθεί ότι γενετικές παραλλαγές microRNA που σχετίζονται περισσότερο εντυπωσιακά σχετίζεται με μη μικροκυτταρικό επιβίωση του καρκίνου του πνεύμονα σε ασθενείς με πρώιμο στάδιο. Παρατηρήσαμε επίσης μία σημαντική επιδράσεις αλληλεπίδραση μεταξύ των γονότυπων rs1045411 και κλινικών στοιχείων, όπως Lauren ταξινόμηση, η διαφοροποίηση, κλινικό στάδιο, και επικουρική χημειοθεραπεία στη ρύθμιση την πρόγνωση του GC. Αυτές οι σημαντικές συσχετίσεις πρότειναν ότι το SNP rs1045411 μπορεί να έχουν δυναμικό ρόλους διαμόρφωσης σε αυτά τα κλινικά χαρακτηριστικά που αντιπροσωπεύουν την εξέλιξη του όγκου. Ωστόσο, οι υποκείμενοι μηχανισμοί παραμένουν να διερευνηθεί περαιτέρω στο μέλλον.

Η παρούσα μελέτη έχει πολλά ιδιαίτερα χαρακτηριστικά. Πρώτον, οι εγγεγραμμένων ασθενών προέρχονται κυρίως από Shaanxi και των γειτονικών περιοχών, το οποίο είναι κατάλληλο για τη διεξαγωγή έρευνας με βάση τον πληθυσμό, λόγω της γεωγραφικής της σταθερότητας με χαμηλό ποσοστό κινητικότητας. Δεύτερον, η σχετική μεγάλο μέγεθος του πληθυσμού που εγγράφονται στο παρόν μελέτη μας επέτρεψε να διεξάγει ανάλυση στάδιο-στρωματοποιημένη στην κατάρτιση και την επικύρωση συνόλων, η οποία περιόρισε τις συγχυτικούς παράγοντες του όγκου και της ετερογένειας της θεραπείας. Ένας σημαντικός περιορισμός αυτής της μελέτης είναι ότι η σχετική μικρός πληθυσμός στο σύνολο επικύρωσης μπορεί να οδηγήσει σε ψευδώς αρνητικά. Επιπλέον, δεδομένου ότι η μελέτη μας περιορίστηκε σε Κινέζων Χαν, δεν μπορούμε να αποκλείσουμε το ζήτημα γενίκευσης. Οι μελλοντικές μελέτες σε μεγαλύτερους πληθυσμούς και άλλες εθνικότητες δικαιολογημένη.

Σε γενικές γραμμές, η πρώτη μελέτη παρατηρώντας την επίδραση του

πολυμορφισμών HMGB1

γονιδίων στην πρόγνωση GC σε ένα κινεζικό πληθυσμό, τα δεδομένα μας υποδεικνύουν έντονα ότι ετικέτας SNP rs1045411 στο

HMGB1

γονίδιο έχει σημαντική επίδραση στην κλινική έκβαση των ασθενών GC, ιδιαίτερα για ασθενείς με προχωρημένο στάδιο ή άλλες επιθετικές κλινικοπαθολογοανατομικές κατάσταση. Η παρούσα μελέτη έχει πιθανή κλινική σημασία στο να βοηθήσει να βελτιώσετε θεραπευτικές αποφάσεις στη θεραπεία της GC.

Υποστήριξη Πληροφορίες

Πίνακα S1. Οι πληροφορίες και τα γονοτυπική αποτελέσματα της HMGB1 SNPs

doi:. 10.1371 /journal.pone.0154378.s001

(DOC)

S2 πίνακα. Επιλεγμένα δημογραφικά και κλινικά χαρακτηριστικά του γαστρικού καρκίνου πληθυσμού των ασθενών

doi:. 10.1371 /journal.pone.0154378.s002

(DOC)

S3 πίνακα. Κατανομή των χαρακτηριστικών των ασθενών και την ανάλυση πρόγνωση στο σετ εκπαίδευσης και το σύνολο επικύρωσης

doi:. 10.1371 /journal.pone.0154378.s003

(DOC)