Αφηρημένο

ARLTS1

είναι ένα πρόσφατα χαρακτηρίζεται ογκοκατασταλτικό γονίδιο σε 13q14.3, μια περιοχή διαγραφεί συχνά τόσο σποραδική και τον κληρονομικό καρκίνο του προστάτη (PCA).

ARLTS1

παραλλαγές, ιδιαίτερα Cys148Arg (T442C), να αυξήσει την ευαισθησία σε διαφορετικές μορφές καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του προστάτη. Σε αυτή τη μελέτη, ο ρόλος της υποκατάστασης Cys148Arg ερευνήθηκε ως παράγοντας κινδύνου για την PCA χρησιμοποιώντας τόσο γενετική και λειτουργική ανάλυση. Cys148Arg γονότυπους και την έκφραση του

ARLTS1

διερευνήθηκαν σε ένα μεγάλο σύνολο των οικογενειακών και μη επιλεγμένων περιπτώσεων προστάτη, κλινικά δείγματα όγκων, ξενομοσχεύματα, κυτταρικές σειρές καρκίνου του προστάτη και της καλοήθους υπερπλασίας του προστάτη (BPH) δείγματα. Η συχνότητα της Κ.Ε. παραλλαγή γονότυπο ήταν σημαντικά υψηλότερη στην οικογενή (OR = 1,67, 95% CI = 1,08 – 2,56,

P

= 0.019) και μη επιλεγμένους ασθενείς (OR = 1,52, 95% CI = 1,18 – 1,97 ,

P

= 0.001) και ο συνολικός κίνδυνος αυξήθηκε (OR = 1,54, 95% CI = 1,20 – 1,98,

P

= 0.0007). Πρόσθετες ανάλυση με κλινικοπαθολογοανατομικές δεδομένων αποκάλυψε μια σχέση με μια επιθετική νόσο (OR = 1,28, 95% CI = 1,05-∞,

P

= 0,02). Το CC γονότυπο της παραλλαγής Cys148Arg επίσης συμβάλλουν στη χαμηλωμένη

ARLTS1

κατάσταση έκφρασης σε λεμφοβλαστοειδή κύτταρα από ασθενείς με οικογενή. Επιπλέον σημαντικά μείωσε

ARLTS1

έκφραση παρατηρήθηκε σε κλινικά δείγματα όγκου σε σύγκριση με τα δείγματα ΒΡΗ (

P

= 0,01). Η

ARLTS1

υπογραφής συν-έκφραση με βάση προηγουμένως δημοσιευμένα δεδομένα μικροσυστοιχιών δημιουργήθηκε από 1587 δείγματα καρκίνο επιβεβαιώνοντας τη χαμηλή έκφραση της ARLTS1 σε προστάτη και έδειξε ότι

ARLTS1

έκφρασης συνδέθηκε έντονα με το ανοσοποιητικό διαδικασίες. Αυτή η μελέτη παρέχει ισχυρά επιβεβαίωση του σημαντικού ρόλου του

ARLTS1

Cys148Arg παραλλαγή ως συνεργάτης σε προστάτη προδιάθεση και ένα δυναμικό δείκτη για την επιθετική έκβαση της νόσου

Παράθεση:. Siltanen S, Wahlfors Τ, Schindler M , Saramäki Ή, Mpindi JP, Latonen L, et al. (2011) Συμβολή του

ARLTS1

Cys148Arg (T442C) Παραλλαγή με καρκίνο του προστάτη Κινδύνου και ARLTS1 Λειτουργία σε κύτταρα καρκίνου του προστάτη. PLoS ONE 6 (10): e26595. doi: 10.1371 /journal.pone.0026595

Επιμέλεια: Surinder. Κ Batra, Πανεπιστήμιο της Νεμπράσκα Ιατρικό Κέντρο, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 26η του Απριλίου 2011? Αποδεκτές: 29 Σεπ, 2011? Δημοσιεύθηκε: 20, Οκτωβρίου, 2011

Copyright: © 2011 Siltanen et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτό το έργο υποστηρίχθηκε από το ανταγωνιστικό Έρευνα Χρηματοδότηση του Pirkanmaa Νοσοκομείου Περιφέρεια (αριθμός επιχορήγηση 9L091), Reino Ίδρυμα Lahtikari, φινλανδική οργανώσεις του καρκίνου, Sigrid Ίδρυμα Juselius και η Ακαδημία της Φινλανδίας [αριθμός επιχορήγηση 126.714 σε TW και 116.437 σε J.S.]. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

ADP-ριβοσυλίωση ογκοκατασταλτικό γονίδιο του παράγοντα-όπως 1 (

ARLTS1

), επίσης γνωστή ως πρωτεΐνη παράγοντα όπως ADP-ριβοσυλίωση 11 (

ARL11

), είναι ένα πρόσφατα χαρακτηρίζεται γονίδιο που βρίσκεται σε τόπο 13q14.3. ARLTS1 ανήκει στον παράγοντα ADP-ριβοσυλίωση (ARF) -ARF-όπως (ARL) της οικογένειας της πρωτεΐνης Ras υπεροικογένειας [1]. ARFs είναι πρωτεΐνες γουανίνης-νουκλεοτιδίου δέσμευσης που είναι κρίσιμα συστατικά πολλών διαφορετικών οδών διακίνησης ευκαρυωτικά κυστίδια. Όπως και με άλλα μέλη της υπεροικογένειας Ras, ARFs λειτουργούν ως μοριακοί διακόπτες με ποδήλατο μεταξύ ανενεργών ΑΕΠ- και ενεργή ΟΤΡ-δεσμευμένη διαμορφώσεων [2]. ARLTS1 έχει χαρακτηριστεί ως μια ενδοκυτταρική πρωτεΐνη η οποία έχει ειδική ιστού έκφραση στον πνεύμονα και λευκοκύτταρα.

ARLTS1

παραλλαγές, όπως η ανοησία πολυμορφισμός Trp149Stop (G446A) και εσφαλμένου νοήματος πολυμορφισμού Cys148Arg (T442C), έχουν προταθεί για να έχουν ένα ρόλο σε διαφορετικές μορφές καρκίνου [3] – [6].

ο καρκίνος του προστάτη είναι η πιο συχνά διαγιγνώσκεται καρκίνος στους άνδρες σε πολλές χώρες, συμπεριλαμβανομένης της Φινλανδίας. Γήρανση και τη βελτίωση της διάγνωσης πιο προφανώς την αύξηση του αριθμού των νέων περιπτώσεων, αλλά η συχνότητα εμφάνισης επηρεάζεται επίσης από μερικούς άγνωστους παράγοντες. Αύξηση του αριθμού των νέων περιπτώσεων δημιουργούν πίεση στο σύστημα υγειονομικής περίθαλψης και νέα εργαλεία για τη διάγνωση του προστάτη, προγνωστικά και θεραπείας που απαιτείται, ειδικά για να αποφευχθεί η υπερβολική θεραπεία και περιττές βιοψίες. Κατά τη διάρκεια των τελευταίων αρκετών ετών υπήρξε εκτεταμένη έρευνα σε προστάτη αιτιολογία και μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία έχουν αποκαλύψει πολλά κοινά χαμηλή διεισδυτικότητα γενετικές αλλοιώσεις. Η συσχέτιση αυτών των παραλλαγών με κλινικοπαθολογική χαρακτηριστικά και πρόγνωση παραμένει ασαφής και τα αποτελέσματα στερούνται κλινικές επιπτώσεις.

Δείξαμε πρόσφατα μια σημαντική συσχέτιση withCys148Arg (T442C) παραλλαγή και τον κίνδυνο προστάτη [7]. Περαιτέρω αξιολόγηση αυτής της παραλλαγής είναι αναγκαία για να αυξήσει τη δύναμη του σωματείου και τη μελέτη του λειτουργικού ρόλου της παραλλαγής στη ΣΕΣΣ. Περισσότερα δείγματα είναι επίσης αναγκαία για την αξιολόγηση της επιπτώσεις αυτής της παραλλαγής με την κλινική έκβαση και μια πιθανή ρόλο στην προγνωστική βιοδείκτη του προστάτη.

Εκτός από τις γενετικές παραλλαγές, τον αριθμό αντιγράφων του DNA εκτροπές είναι ένα από τα πιο συχνά παρατηρούμενες γενετικές αλλαγές σε οικογενή και σποραδική προστάτη [8] – [10]. Στις περισσότερες από τις περιπτώσεις στοχεύουν δεν είναι πλήρως ταυτοποιημένα γονίδια για τις εκτροπές. Είναι ενδιαφέρον ότι, αλληλικές ανισορροπία (ΑΙ) έχει ανιχνευθεί σε 13q14.2-13q14.3, και αυτό είναι ένα σημαντικό γεγονός στην εξέλιξη της εντοπισμένης προστάτη [11]. Οι διαφορές των 13q14 απώλειας της ετεροζυγωτίας (ΑΕ) σε διαφορετικές ομάδες του προστάτη θα μπορούσε επίσης να χρησιμοποιηθεί για να διακρίνει κλινικά ασήμαντη προστάτη [12], [13].

Στην παρούσα μελέτη αναλύσαμε τον ρόλο του

ARLTS1

με περισσότερες λεπτομέρειες, ιδιαίτερα ο ρόλος των Cys148Arg (T442C) σε προστάτη του κινδύνου. Χρωμοσωμική ανωμαλία στο 13q14.3 αναλύθηκε με aCGH να αξιολογηθεί η

ARLTS1

αντιγράψετε αριθμός αλλάζει σε ξενομοσχεύματα προστάτη και κυτταρικές σειρές. Η έκφραση του

ARLTS1

μελετήθηκε σε κλινικά δείγματα όγκων, δείγματα ΚΥΠ και, επίσης, συν-έκφραση φόρμα δεδομένων προηγουμένως δημοσιευμένα δεδομένα αναλύθηκαν.

Μέθοδοι

πληθυσμός Μελέτη

Όλα τα δείγματα που συλλέγονται είναι φινλανδικής καταγωγής. Ο προσδιορισμός και η συλλογή των φινλανδικών οικογενειών ΚΕΚ έχουν περιγραφεί αλλού [14]. Οι οικογενειακές δείγματα γονότυπος σε αυτή τη μελέτη είχαν τουλάχιστον ένα προσβεβλημένο πρώτου ή δεύτερου βαθμού συγγενή. Τα κλινικά χαρακτηριστικά των οικογενειακών ασθενείς μπορούν να βρεθούν στον Πίνακα S1.

Οι ασθενείς με καρκίνο του προστάτη μη επιλεγμένα συνεχόμενες διαγνώστηκαν με προστάτη μεταξύ των ετών 1999 και 2005 στο Τμήμα Ουρολογίας του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Tampere. Το νοσοκομείο είναι ένα περιφερειακό κέντρο παραπομπής στην περιοχή για όλους τους ασθενείς με προστάτη, η οποία οδηγεί σε μη επιλεγμένα, με βάση τον πληθυσμό συλλογή των ασθενών. Τα κλινικά χαρακτηριστικά της συνεχόμενων μη επιλεγμένων προστάτη μπορούν να βρεθούν στον Πίνακα S1.

Ένα σύνολο της καλοήθους υπερπλασίας του προστάτη (ΚΥΠ) περιπτώσεις χρησιμοποιήθηκε επίσης στη μελέτη αυτή. Η διάγνωση της καλοήθους υπερπλασίας του προστάτη ομάδα βασίστηκε σε συμπτώματα κατώτερου ουροποιητικού συστήματος, χωρίς ουροροομετρία, και τα αποδεικτικά στοιχεία της αύξηση του μεγέθους του προστάτη που λαμβάνεται με ψηλάφηση ή διορθικό υπερηχογράφημα. Αν PSA ανυψώθηκε ή δακτυλική εξέταση ή διορθικό υπερηχογράφημα έδειξε καμία ανωμαλία ενδεικτική του προστάτη, οι ασθενείς υποβλήθηκαν σε βιοψίες να αποκλείσει διαγνώσεις του προστάτη, υψηλού βαθμού ενδοεπιθηλιακή προστάτη νεοπλασία (ΡΙΝ), άτυπα πολλαπλασιασμό μικρών κυψελιδικά κυττάρων (ASAP), ή υποψία κακοήθεια.

Κλινική όγκους του προστάτη ελήφθησαν από Τάμπερε Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο (Τάμπερε, Φινλανδία) συμπεριλαμβανομένου φρέσκα κατεψυγμένα δείγματα όγκων του προστάτη που αντιπροσωπεύει καλοήθη υπερπλασία του προστάτη (ΚΥΠ,

n

= 14), ανδρογόνο-εξαρτώμενη (

n

= 14) και ορμονοάντοχου (

n

= 6) καρκινώματα. Τα ιστολογικά δείγματα εξετάστηκαν για την παρουσία των κυττάρων του όγκου με τη χρήση Η &? Χρώση Ε. Μόνον δείγματα τα οποία περιέχουν & gt? 60% καρκινικές ή υπερπλαστικά επιθηλιακά κύτταρα επελέγησαν για τις αναλύσεις. Τα δείγματα ΒΡΗ ελήφθησαν από δείγματα προστατεκτομή από ασθενείς με καρκίνο και είχαν ιστολογικά επαλήθευσε ότι δεν περιέχουν κανένα καρκινικά κύτταρα. Δείγματα από ορμονοάντοχου καρκινώματα ελήφθησαν από διουρηθρική εκτομές του προστάτη (TURP) από ασθενείς με συμπτώματα απόφραξης της ουρήθρας, παρά τη συνεχιζόμενη ορμονική θεραπεία. Ο χρόνος από την έναρξη της ορμονικής θεραπείας έως την πρόοδο (TURP) κυμαίνονταν από 15 έως 60 μήνες. Η χρήση του κλινικού υλικού όγκου εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας του Πανεπιστημίου του Τάμπερε Νοσοκομείου.

Τα δείγματα ελέγχου αποτελούνταν από δείγματα DNA από ανώνυμους, εθελοντικές και υγιείς δότες αίματος που λαμβάνεται από το Κέντρο Αίματος του φινλανδικού Ερυθρού Σταυρού Τάμπερε. Τα δείγματα EDTA αίματος που χρησιμοποιούνται ως σημείο αναφοράς στην Q-RT-PCR ήταν από υγιείς δότες ανώνυμα.

πληροφορίες και τα δείγματα των ασθενών ελήφθησαν με πλήρη ενημερωμένη συγκατάθεση. Η μελέτη διεξήχθη σύμφωνα με τις κατάλληλες άδειες έρευνας από τις Επιτροπές Δεοντολογίας του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου του Τάμπερε, Φινλανδία, καθώς και το Υπουργείο Κοινωνικών Υποθέσεων και Υγείας της Φινλανδίας.

Οι κυτταρικές σειρές και ξενομοσχεύματα

Η προστάτη κυτταρικές σειρές LNCaP, DU145, PC-3, NCI-660 και 22Rv1 λήφθηκαν από την American Type Culture Collection (Manassas, VA, USA), ενώ LAPC-4 παρασχέθηκε ευγενώς από τον Dr. Charles Sawyers (UCLA, Los Angeles, CA ), και η κυτταρική γραμμή vcap παρασχέθηκε από τον Δρ Τζακ Schalken (Πανεπιστήμιο Radboud Nijmegen Medical Centre, Nijmegen, Ολλανδία). Όλες οι κυτταρικές σειρές καλλιεργήθηκαν υπό τις συνιστώμενες συνθήκες. πρωτογενή κύτταρα PrEC ελήφθησαν από την Lonza (Walkersville, MD, USA). EP156T είναι μια h-τριτ αθανατοποιημένων φυσιολογικό προστάτη επιθηλιακή κυτταρική γραμμή [15] που έγινε διαθέσιμη από έναν από τους συγγραφείς (Ο.Κ.). DNA εκχυλίζεται σύμφωνα με τις τυποποιημένες εργαστηριακές πρωτόκολλα και ολικό RNA εκχυλίστηκε με το αντιδραστήριο ΤΚΙζοΙ (Invitrogen Life Technologies, Carlsbad, CA, USA).

Δεκαεννέα ξενομοσχευμάτων ανθρώπινου PCA της σειράς LuCaP χρησιμοποιούνται σε άμεση αλληλούχιση και δεκαπέντε του τους χρησιμοποιούνται σε Q-RT-PCR έγιναν διαθέσιμες από έναν από τους συγγραφείς (RLV) και έχουν περιγραφεί αλλού [16], [17].

Οι λεμφοβλαστοειδείς κυτταρικές σειρές παρήχθησαν με μετασχηματισμό ιού Epstein-Barr των περιφερικών μονοπύρηνων λευκοκυττάρων από ασθενείς. Λεμφοβλαστοειδείς κυτταρικές γραμμές αναπτύχθηκαν σε μέσο RPMI-1640 (Lonza, Walkersville, MD, USA) συμπληρωμένο με 10% βόειο εμβρυϊκό ορό (Sigma-Aldrich, St. Louis, ΜΟ, USA) και αντιβιοτικά. Οι σβώλοι κυττάρων καταψύχθηκαν και ολικό RNA εκχυλίστηκε από τα κύτταρα με Trizol® σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA).

διαλογής Mutation

διαλογή Μετάλλαξη το γονιδιωματικό DNA διεξήχθη με άμεση αλληλούχιση. Διεξήχθη αλληλούχιση σε ένα Applied Biosystems 3130xl Genetic Analyzer (Life Technologies Corporation, Carlsbad, CA, USA) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Αστάρια και συνθήκες PCR χρησιμοποιείται στον έλεγχο μετάλλαξη είναι διαθέσιμα κατόπιν αιτήματος.

Γονοτυπικές

Γονοτυπικές έγινε με το SNP Δοκιμασία Γονοτυπικές Προσαρμοσμένη TaqMan® χρησιμοποιώντας το σύστημα ανίχνευσης ακολουθίας ΑΒΙ Prism 7900HT (Life Technologies Corporation , Carlsbad, CA, USA) σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή. Εκκινητές και ανιχνευτές για τα rs3803185 Cys148Arg (T442C) SNP παρασχέθηκαν από την Applied Biosystems, μέσω της Builder File 3.1 λογισμικό.

ποσοτική πραγματικού χρόνου αντίστροφη μεταγραφή-ΡΟΚ

Η γονιδιακή έκφραση αναλύσεις έγιναν χρησιμοποιώντας LightCycler ® (Roche, Mannheim, Germany) και Bio-Rad CFX96 ™ σε πραγματικό χρόνο σύστημα ανίχνευσης PCR (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA). Ολικό RNA απομονώθηκε από τις κυτταρικές γραμμές, κλινικά δείγματα όγκου και ξενομοσχεύματα όπως περιγράφηκε προηγουμένως [18], [19]. RNA από κυτταρικές γραμμές μεταγράφηκε αντίστροφα σε cDNA πρώτου κλώνου χρησιμοποιώντας το κιτ SuperScript ™ III First-Strand Synthesis SuperMix (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) και τυχαία εξαμερή. RNA από τα δείγματα και ξενομοσχεύματα κλινική όγκου μεταγράφηκε αντίστροφα όπως περιγράφηκε προηγουμένως [18], [19]. Φυσιολογικό ανθρώπινο RNA προστάτη ελήφθη από Ambion (Cambridgeshire, Ηνωμένο Βασίλειο). Για τις αναλύσεις LightCycler®, εκκινητών και ανιχνευτών ελήφθησαν από TIB MolBiol (Βερολίνο, Γερμανία). Οι αντιδράσεις PCR πραγματοποιήθηκαν με LightCycler® FastStart DNA Μάστερ

PLUS κιτ HybProbe (Roche, Mannheim, Germany). LightCycler® λογισμικό (Roche, Mannheim, Germany) χρησιμοποιήθηκε για την ανάλυση των δεδομένων. Η δοκιμασία TaqMan για

ARLTS1

χρησιμοποιήθηκε για αναλύσεις Bio-Rad. Οι εκκινητές και ανιχνευτές ελήφθησαν από ΤΙΒ MolBiol (Βερολίνο, Γερμανία). Bio-Rad του iQ Supermix χρησιμοποιήθηκε για τις αντιδράσεις PCR και CFX Διευθυντής Λογισμικό ™ έκδοση 1.6 για την ανάλυση δεδομένων. τα επίπεδα έκφρασης των

ARLTS1

ομαλοποιήθηκαν έναντι του γονιδίου καθαριότητας

TBP

(πρωτεΐνη που δεσμεύεται με ΤΑΤΑ) ή κατά επίπεδα RNA.

ΤΒΡ

επιλέχθηκε ως γονίδιο αναφοράς, επειδή δεν υπάρχουν γνωστές retropseudogenes για αυτό, και η έκφραση του

ΤΒΡ

είναι χαμηλότερη από εκείνη των πολλών που χρησιμοποιούνται συνήθως, εκφράζεται σε αφθονία γονίδια αναφοράς [20] .

κηλίδωση Western

τα κύτταρα λύθηκαν σε ένα ρυθμιστικό διάλυμα που περιέχει 50 mM Tris-HCl ρΗ 7,5, 150 mM NaCl, 0,5% Triton-X-100, 1 mM DTT, 1 mM PMSF και 1 × πλήρης κοκτέιλ αναστολέα πρωτεάσης (Roche, Mannheim, Germany). Τα υλικά λύσεως υποβλήθηκαν σε υπερήχους 4 × 30 s με μέσο Bioruptor (Diagenode, Liege, Belgium) και το κυτταρικό απόρριμμα απομακρύνθηκε με φυγοκέντρηση. Οι πρωτεΐνες διαχωρίστηκαν με ηλεκτροφόρηση σε πηκτή πολυακρυλαμιδίου (SDS-PAGE) και μεταφέρθηκαν σε μεμβράνη PVDF (Immobilon-Ρ? Millipore, Billerica, ΜΑ, USA). Πρωτογενή αντισώματα που χρησιμοποιήθηκαν ήταν αντι-ARL11 (Aviva Systems Biology, San Diego, CA, USA) και αντι-ακτίνης (τηγάνι, κλώνος ACTN05, NeoMarkers, Fremont, CA, USA), που ανιχνεύθηκαν με συζευγμένο με HRP δεύτερα αντισώματα (ϋΑΚΟ, Δανία) και κηλίδωση αντιδραστήριο Δυτική λουμινόλη (Santa Cruz Biotechnologies, CA, USA) με αυτοραδιογραφία.

Array συγκριτικής γονιδιωματικής υβριδοποίησης

Array συγκριτικής γονιδιωματικής υβριδοποίησης (aCGH) πραγματοποιήθηκε σε κυτταρικές σειρές προστάτη και ξενομοσχεύματα με το Ανθρώπινο Γονιδίωμα CGH μικροσυστοιχιών Kit 244Α (Agilent, Santa Clara, CA, USA), και όπως περιγράφεται στο Saramäki Ή κ.ά., 2006 [19].

η στατιστική ανάλυση

Σύλλογος του Cys148Arg (T442C) παραλλαγή ελέγχθηκε με ανάλυση λογιστικής παλινδρόμησης με τη χρήση SPSS πακέτο στατιστικού λογισμικού (SPSS 15.0? SPSS Inc, Chicago, IL, USA). Σύνδεσης με κλινικά και παθολογικά χαρακτηριστικά της νόσου (ηλικία έναρξης, τιμή PSA κατά τη διάγνωση, Τ, Ν και Μ-στάδιο, ΠΟΥ βαθμό και το σκορ Gleason) ελέγχθηκε μεταξύ οικογενή και μη επιλεγμένες περιπτώσεις προστάτη από τη δοκιμή Kruskal-Wallis, του Fisher exact test και t-test που περιλαμβάνονται στο πακέτο R «Στατιστικά». ασθενείς προστάτη ταξινομήθηκαν ως έχοντες μια επιθετική νόσο, αν είχαν κάποιο από τα ακόλουθα χαρακτηριστικά: α τοπικά προχωρημένο ή μεταστατικό όγκο (στάδιο Τ3, Τ4, N1, ή M1, με βάση την παθολογία, αν έγινε ριζική προστατεκτομή? Αλλιώς, κλινικό στάδιο), όγκου Gleason βαθμό κατά τη διάγνωση ≥7, ελάχιστα διαφοροποιημένες βαθμός (WHO βαθμού ΙΙΙ, αν δεν Gleason βαθμού διαθέσιμο) ή προεπεξεργασίας PSA κατά τη διάγνωση ≥20 ng /ml.

ανάλυση Συν-έκφραση του

ARLTS1

στο παρελθόν δημοσιευθεί σύνολα δεδομένων μικροσυστοιχιών

Το

ARLTS1

υπογραφής συν-έκφραση δημιουργήθηκε από τις GeneSapiens [21] βάση δεδομένων της έκφρασης του mRNA.

προσδιορίστηκε ARLTS1

έκφρασης μεταξύ 1587 δείγματα όγκων και μεταξύ 497 φυσιολογικά δείγματα. Χρησιμοποιήσαμε Pearson συσχέτιση για τον εντοπισμό γονιδίων που θετικά και αρνητικά με

ARLTS1

μεταξύ κανονικών δειγμάτων και των δειγμάτων όγκου.

Λειτουργική σχολιασμό ανάλυση

σετ Gene διερευνήθηκαν για τον εμπλουτισμό των λειτουργικών κατηγορίες σχολιασμού όπως η γονιδιακή οντολογίας (GO), χρησιμοποιώντας τα εργαλεία στο πλαίσιο του προγράμματος ΕΑΣΕ (https://david.abcc.ncifcrf.gov/) [22]. Τα 100 κορυφαία γονίδια που είχαν θετικά συσχετίζεται με

ARLTS1

μεταξύ φυσιολογικά δείγματα ελέγχθηκαν για το εμπλουτισμένο γονιδίων Οντολογία.

Αποτελέσματα

Η όλη περιοχή κωδικοποίησης του

ARLTS1

προηγουμένως σε διαλογή σε ένα σύνολο 164 ασθενών οικογενή PCa και σε συνολικά 377 μη επιλεγμένων ασθενών PCa, καθώς επίσης και σε 381 δείγματα ελέγχου [7]. Εδώ η Cys148Arg (T442C) παραλλαγή περαιτέρω γονότυπος σε 48 οικογενή ασθενείς ΣΕΣ, 1471 μη επιλεγμένους ασθενείς ΣΕΣ, 375 ασθενείς BPH και 379 μάρτυρες. Με τη χρησιμοποίηση προηγούμενων δεδομένων μας και τον προσδιορισμό του γονότυπου πιο οικογενειακό και μη επιλεγμένες περιπτώσεις προστάτη, έχουμε επικυρώσει μια στατιστικά σημαντική συσχέτιση μεταξύ Cys148Arg (T442C) και προστάτη του κινδύνου (Πίνακας 1). Κατά την εξέταση των οικογενείς περιπτώσεις προστάτη, και τη σύνδεση με το αλληλόμορφο κινδύνου C, η ομόζυγη μορφή CC φτάσει σε ένα

P

αξίας 0.019 (OR 1,67? 95% CI 1,08 – 2,56). Μέσα σε μη επιλεγμένες περιπτώσεις, ο κίνδυνος ήταν επίσης σημαντική (OR 1,52, 95% CI 1,18 έως 1,97,

P

= 0,001). Όταν συνδυάζοντας τα σύνολα δεδομένων των οικογενειακών και μη επιλεγμένων περιπτώσεων (2060 δείγματα συνολικά), η Cys148Arg (T442C) παραλλαγή βρέθηκε να σχετίζεται σημαντικά με προστάτη τον κίνδυνο (OR 1.54, 95% CI 1,20 έως 1,98,

P

= 0.0007 ). Σημαντική συσχέτιση βρέθηκε μόνο κατά τη σύγκριση των συχνοτήτων των ομόζυγη μορφή του αλληλόμορφου κίνδυνο C στις συχνότητες της ομόζυγη μορφή του Τ αλληλόμορφου άγριου τύπου Δεν βρέθηκε κάποια σχέση μεταξύ της συχνότητας των CC και BPH (Πίνακας 1).

κατά τη μελέτη του διαχωρισμού των Cys148Arg (T442C) CC γονότυπο σε 86 οικογένειες όπου ο δείκτης ανιχνεύθηκε ως φορέας, πλήρης διαχωρισμός της παραλλαγής CC με φαινότυπο καρκίνου παρατηρήθηκε σε μια οικογένεια (οικογένεια 427 στο σχήμα . 1). Στο υπόλοιπο του διαχωρισμού των οικογενειών ήταν ελλιπής, αλλά δείχνει μια σαφή σύνδεση με

ARLTS1

γονότυπο CC ή TC και φαινότυπο καρκίνου (οικογένειες 402 και 408 στο Σχ. 1).

τετράγωνα αντιπροσωπεύουν τα αρσενικά ? κύκλοι αντιπροσωπεύουν τα θηλυκά. Ανοικτό σύμβολα υποδεικνύουν καμία νεοπλασία και γεμάτα σύμβολα δηλώνουν περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη. + Υποδεικνύει την παρουσία της παραλλαγής T442C στο δείγμα DNA των μελών της οικογένειας, που ακολουθείται από την πραγματική γονότυπο. Ένα βέλος δείχνει το άτομο αρχικά ελέγχονται για

ARLTS1

παραλλαγές σειράς. Ηλικία κατά τη διάγνωση για ασθενείς με καρκίνο του προστάτη (σε έτη) υποδεικνύεται κάτω από το σύμβολο για κάθε μέλος της οικογένειας. Ένας αστερίσκος (*) υποδηλώνει τα πρόσωπα χωρίς διαθέσιμο δείγμα.

Η

Άμεση αλληλουχίας χρησιμοποιήθηκε για να εξετάσει τις συχνότητες

ARLTS1

παραλλαγές στην κλινική όγκους του προστάτη. Στις κλινικές καρκινώματα του προστάτη, βρήκαμε παραλλαγές σε τέσσερις θέσεις, Gly65Val (G194T), Pro131Leu (C392T), Cys148Arg (T442C) και Trp149Stop (G446A) (Πίνακας 2). Στη θέση Cys148Arg (T442C), η συχνότητα του καρκίνου που συνδέεται γονότυπο κίνδυνος CC ήταν σχετικά υψηλό (28,3%) σε σύγκριση με τη συνδυασμένη συχνότητα της οικογενούς και μη επιλεγμένων περιπτώσεων 21,2% (Πίνακας 1). Ωστόσο, η υψηλότερη συχνότητα του Cys148Arg (T442C) CC γονότυπο ανιχνεύθηκε σε δείγματα ξενομοσχεύματος (42,1%). Αυτό είναι ενδιαφέρουσα δεδομένου ότι τα δείγματα LuCaP ξενομόσχευμα θεωρείται ως ένα πολύ ομοιογενές αναπαράσταση του προστάτη.

Η

Για να διερευνήσουν το ρόλο της Cys148Arg (T442C) γονότυπου στο

ARLTS1

έκφραση επιλέξαμε 24 οικογενή ασθενείς , συμπεριλαμβανομένων οκτώ από κάθε ομάδα γονότυπο ΤΤ, CT και CC. Έκφραση αναλύσεις από την Q-RT-PCR διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας το RNA που εκχυλίζεται από λεμφοβλαστοειδείς κυτταρικές σειρές από τους ασθενείς.

ARLTS1

mRNA εκφράστηκε διαφορικά μεταξύ των τριών ομάδων γονότυπο (Σχ. 2). Η έκφραση ήταν σημαντικά μειωμένη στους ασθενείς που φέρουν το γονότυπο CC (

P

= 0,02).

Προσδιορίζεται με Q-RT-PCR. *,

P

& lt? 0,05. Στήλες, σημαίνει οκτώ άτομα? μπαρ, SD.

Η

ARLTS1

επίπεδα έκφρασης αναλύθηκαν επίσης σε δεκαπέντε δείγματα ξενομόσχευμα LuCaP, έξι κυτταρικές σειρές προστάτη, επιθηλιακών κυτταρικών σειρών δύο προστάτη και σε RNA από δείγμα φυσιολογικού προστάτη. Μεταξύ των αναλύθηκαν ξενομοσχεύματος δείγματα, μια σημαντική μείωση σε

ARLTS1

έκφραση παρατηρήθηκε σε δύο από τα δείγματα (13%) σε σύγκριση με την έκφραση του σε φυσιολογικό δείγμα προστάτη (Σχ. 3Α). Ολική απώλεια της έκφρασης παρατηρήθηκε σε 11 (73%) των δειγμάτων ξενομοσχεύματος (Σχ. 3Α). Δύο από τα δείγματα ξενομοσχεύματος, LuCaP23.1 και LuCaP49, είχαν υψηλότερα

ARLTS1

επίπεδα έκφρασης σε σύγκριση με τον φυσιολογικό ιστό. Έξι από τα δεκατέσσερα (43%)

ARLTS1

κάτω-ρυθμίζονται δείγματα ξενομόσχευμα είχε CC γονότυπο για την Cys148Arg (T442C) παραλλαγή. Όταν συστοιχία συγκριτική γονιδιωματική υβριδισμού (aCGH) πραγματοποιήθηκε με τη χρήση αυτών των δειγμάτων, 12/15 δείγματα ξενομόσχευμα έδειξε μια απώλεια για την χρωμοσωμική περιοχή 13q14.3 (Εικ. 3Α).

Η Cys148Arg (T442C) γονότυπο, καθώς και όπως η εκτροπή choromosomal εμφανίζεται. C, Cys148Arg (T442C) παραλλαγή σε δύο κλινικά δείγματα καρκινικού ιστού και δύο κανονικές DNA του αίματος (αλληλουχίες είναι σε ανάστροφο προσανατολισμό). * Ορίζεται ως το Saramäki Ή et al., 2006.

Η

Σε κυτταρικές σειρές προστάτη, 5/6 (83%) παρουσίασαν μειωμένη ή έχασαν την έκφραση του

ARLTS1

σε σύγκριση με φυσιολογικό RNA προστάτη (Σχ. 3Α). Ένα

ARLTS1

τόπο διαγραφής στο 13q14.3 βρέθηκε σε PC-3, vcap, LNCaP και DU-145. Μεταξύ αυτών, η τελευταία είχε επίσης την CC γονότυπο για Cys148Arg (T442C). Είναι ενδιαφέρον ότι η Cys148Arg (T442C) παραλλαγή ήταν το μόνο

ARLTS1

παραλλαγή βρέθηκε σε οποιαδήποτε από τις κυτταρικές σειρές του προστάτη. Προστάτη των επιθηλιακών EP156T κυτταρική σειρά έδειξαν απώλεια της έκφρασης. Αυτά τα αποτελέσματα δείχνουν ότι πιθανόν

ARLTS1

έκφραση είναι χαμηλή στα επιθηλιακά κύτταρα του προστάτη.

ARLTS1

έκφραση αξιολογήθηκε επίσης με την ίδια προσέγγιση σε ένα πάνελ των δειγμάτων ιστού δεκατέσσερις καλοήθη υπερπλασία του προστάτη , δεκατέσσερα πρωτοβάθμιας και έξι δείγματα όγκων ορμονοάντοχου (Σχ. 3Β).

ARLTS1

έκφραση ήταν signinificantly χαμηλότερη (

P

= 0.01) σε κλινικές όγκους σε σύγκριση με τα δείγματα ΒΡΗ, η οποία υποστηρίζει περαιτέρω το ρόλο της ως καταστολέας όγκου πρωτεΐνης (Σχ. 3Β).

Σε κλινικές όγκους του προστάτη, η ύπαρξη του LOH μελετήθηκε. Βλαστικής σειράς DNA από ασθενείς που φέρουν το Cys148Arg (T442C) παραλλαγή αναλύθηκε με άμεση αλληλούχιση. Αποτελέσματα Ανάλυση αλληλουχίας έδειξε ότι σε δύο περιπτώσεις (δείγματα 261 και 530), η Τ αλληλίου στο αίμα είχε αντικατασταθεί με ένα αλληλόμορφο C σε καρκινικό ιστό (Σχ. 3C), η οποία προτείνει ένα ρόλο για το

ARLTS1

σε καταστολή όγκου δηλαδή, αδρανοποίηση των δύο αλληλόμορφα στην καρκινογένεση. Όταν (, ΠΟΥ βαθμό Gleason και T-score) εξετάστηκαν κλινικές παραμέτρους, μία από τις δύο παραλλαγές που μεταφέρουν «ΑΕ-ασθενείς» είχε ένα σκορ Gleason της 9ης και της ΠΟΥ βαθμού 3, δείχνοντας μια επιθετική μορφή της νόσου. Η άλλη περίπτωση είχε ένα βαθμό ΠΟΥ 3 αλλά δεν Gleason σκορ ήταν διαθέσιμο.

Έκφραση

ARLTS1 περαιτέρω προσδιορίζεται με κηλίδωση Western (Εικ. 4). Κυτταρολύματα ήταν διαθέσιμα από κυτταρικές γραμμές καρκίνου προστάτη έξι, (22Rv1, LAPC-4, PC-3, VCAP, LnCaP, DU-145) και από το φυσιολογικό επιθηλιακό προστάτη EP156T κυτταρική γραμμή. έκφραση ARLTS1 ήταν ιδιαίτερα συγκλίνει προς το καθεστώς ARLTS1 mRNA έδειξε στο σχήμα. 3Α. Όπως ήταν αναμενόμενο, κυτταρικές σειρές LnCaP, DU-145 και EP156T έδειξε αρνητική έκφραση. Σε καρκίνο του προστάτη κυτταρικές γραμμές 22Rv1 και PC-3 έκφραση ARLTS1 ήταν αντιστοιχούν σε σχετικές τιμές έκφρασης του mRNA, ενώ σε PCA κυτταρική γραμμή κατάστασης έκφρασης πρωτεΐνης LAPC4 ήταν χαμηλότερο από το επίπεδο έκφρασης του mRNA. PCA κυτταρική γραμμή VCAP έδειξε την υψηλότερη έκφραση ARLTS1 η οποία δεν αντιστοιχεί σε αρνητική κατάσταση σχετική έκφραση παρατηρείται σε Q-RT-PCR.

κατάσταση έκφρασης πρωτεΐνης σε κυτταρικές γραμμές καρκίνου του προστάτη έξι και σε μία φυσιολογική κυτταρική σειρά επιθηλιακών προστάτη. Actin παρουσιάζεται ως έλεγχος φόρτωσης. ARL11 αναμένεται /παρατηρήθηκε Mw 21.4 kDa. Ένα μη-ειδική ζώνη που σημειώνονται με αστερίσκο (*).

Η

Όταν τα κλινικά χαρακτηριστικά (ηλικία κατά τη διάγνωση, τιμή PSA κατά τη διάγνωση, Τ, Ν και Μ-στάδιο, ΠΟΥ βαθμού και Gleason βαθμολογία ) συμπεριλήφθηκαν στις αναλύσεις της βλαστικής σειράς δεδομένων γονότυπο, το CC γονότυπο συσχετίστηκε σημαντικά με νεαρότερη ηλικία κατά τη διάγνωση και την αξία του PSA (

P

= 0,05 και

P

= 0,03, αντίστοιχα) μεταξύ των το μη επιλεγμένο υλικό. Το φαινόμενο αυτό παρατηρήθηκε επίσης σε προηγούμενη μελέτη μας, όπου η CC γονότυπο του Cys148Arg (T442C) συνδέθηκε με υψηλά σκορ Gleason (

P

= 0,01) και υψηλό διαφημίσεις κοινωνικού ενδιαφέροντος (≥7) κατά τη διάγνωση (

P

= 0,05) [7]. Όταν εξετάστηκε η συσχέτιση μεταξύ της κατάστασης επιθετική νόσο και την εμφάνιση του CC γονότυπο, βρήκαμε μια στατιστικά σημαντική συσχέτιση (

P

= 0,02) μεταξύ των μη επιλεγμένων περιπτώσεων (Πίνακας 3). Μέσα σε οικογενείς περιπτώσεις προστάτη, δεν διαπιστώθηκε καμία συσχέτιση μεταξύ του γονοτύπου CC στο Cys148Arg (T442C) ενεργητική και οποιαδήποτε από τις κλινικές μεταβλητές ή με επιθετική προστάτη.

Η

ARLTS1

έκφραση στο διάφορους ιστούς του σώματος παρουσιάζεται στο Σχήμα S1. Το σχήμα απεικονίζει ότι

ARLTS1

εκφράζεται έντονα στο αιματολογικές και του λεμφικού συστήματος. Τα αποτελέσματα από την ανάλυση συν-έκφραση απεικονίζουν μια ισχυρή συσχέτιση με τις διαδικασίες του ανοσοποιητικού συστήματος, αποκαλύπτοντας μια εμπλουτισμού βαθμολογία για το σύμπλεγμα των 6,67 και μια τιμή ρ της 2.1ε-7. Αυτά τα αποτελέσματα που παρήχθησαν από τα 100 κορυφαία γονίδια με μία τιμή συσχέτισης μεγαλύτερο από 0,3 μεταξύ των κανονικών δειγμάτων. Μεταξύ των δειγμάτων καρκίνου, η κατηγορία των διαδικασιών ανοσοποιητικό σύστημα είχε το υψηλότερο εμπλουτισμό σκορ 14.89, με τιμή p 5.3e-21 και προσαρμόζεται βαθμολογία Benjamin των 2.8e-17. Εμείς δεν εντόπισε κανένα ισχυρό γονίδιο οντολογία που συνδέονται με τα 100 κορυφαία γονίδια που συσχετίζεται αρνητικά με το

ARLTS1

μεταξύ των δειγμάτων καρκίνου. Εμείς επιβεβαίωσε τα ευρήματά μας χρησιμοποιώντας ένα ξεχωριστό σύνολο δεδομένων από expo (ΔΔ:. Έκφραση του έργου για την Ογκολογία 2008 [https://www.intgen.org/expo.cfm]). Τα αποτελέσματα δείχνουν ότι το 56% των γονιδίων που συνήθως εντοπίζονται να συσχετίζονται θετικά με

ARLTS1

σε κάθε σύνολο δεδομένων αποτελείται από δείγματα καρκίνου. Τα γονίδια με μια θετική συσχέτιση πάνω από 0,3 εντοπίζονται στην διασταύρωση έδωσε ένα πολύ ισχυρό αποτέλεσμα εμπλουτισμό γονίδιο οντολογία του 18,12 για τη διαδικασία του ανοσοποιητικού συστήματος με μια τιμή ρ της 2.1ε-24 όπως φαίνεται στο Σχήμα S2. γονιδιακή έκφραση μεταξύ των δειγμάτων του προστάτη φαίνεται να είναι πολύ χαμηλή για

ARLTS1

. Εμείς δεν θα μπορούσε να ορίσει με βεβαιότητα οποιαδήποτε σημαντική σύνδεση με προστάτη για

ARLTS1

χρησιμοποιώντας δεδομένα γονιδιακής έκφρασης λόγω των χαμηλών επιπέδων έκφρασης.

Συζήτηση

Το

ARLTS1

γονίδιο και έχουν

ARLTS1

πολυμορφισμοί έχουν αποδειχθεί ότι έχουν ένα ρόλο στην παθογένεση πολλών καρκίνων. Ο πολυμορφισμός ανοησία στο τέλος της κωδικεύουσας περιοχής έχει αποκαλυφθεί να προδιαθέτουν για οικογενή καρκίνο [8]. Λειτουργικές αναλύσεις της κομμένης πρωτεΐνης έχουν δείξει ότι η παραλλαγή Trp149Stop μπορεί να επηρεάσει την απόπτωση και την καταστολή του όγκου. Ένα άλλο

ARLTS1

παραλλαγή, η παρανοηματικές πολυμορφισμός Cys148Arg (T442C), και ειδικά το CC γονότυπο, έχει βρεθεί ότι σχετίζονται σημαντικά με υψηλού κινδύνου καρκίνου του μαστού οικογενή [4]. Η ίδια παραλλαγή βρέθηκε επίσης να σχετίζεται με προδιάθεση για μελάνωμα [5]. Οι ρόλοι του

ARLTS1

παραλλαγές έχουν επίσης μελετηθεί με καρκίνο του παχέος εντέρου [23] και χρόνια λεμφοκυτταρική λευχαιμία (ΧΛΛ) [24], αλλά δεν έχουν τις ενώσεις έχουν βρεθεί.

Στην παρούσα μελέτη, έδειξαν μια σύνδεση με το

ARLTS1

Cys148Arg (T442C) παραλλαγή και αυξημένο κίνδυνο προστάτη, την επικύρωση προηγούμενα αποτελέσματα μας [7]. Προηγουμένως, έχουμε αλληλουχία 164 οικογενειακό και 377 μη επιλεγμένα δείγματα προστάτη μαζί με 809 ελέγχους και Cys148Arg (T442C) έδειξε σημαντική συσχέτιση με προστάτη τον κίνδυνο (OR 1,19? 95% CI 1,02 έως 1,39,

P

= 0,020), αλλά η σημασία δεν κατείχε, όταν τα δεδομένα υποδιαιρούνται σε οικογενειακό και μη επιλεγμένες περιπτώσεις. Ωστόσο, όταν το αλληλόμορφο C θεωρήθηκε ότι είναι υπολειπόμενο, όλα τα δεδομένα (οικογενής και μη επιλεγείσες) έδειξαν σημαντική συσχέτιση μεταξύ του γονοτύπου CC και PCa κινδύνου (

P

= 0,005). Εδώ ήταν ο γονότυπος πιο οικογενειακό και μη επιλεγείσες περιπτώσεις προστάτη και Cys148Arg (T442C) αποκάλυψε μια στατιστικά σημαντική συσχέτιση με προστάτη του κινδύνου μεταξύ των δύο οικογενή (OR = 1,67, 95% CI = 1,08 – 2,56,

P

= 0.019) και μη επιλεγμένα ασθενείς προστάτη (OR = 1,52, 95% CI = 1,18 – 1,97,

P

= 0,001). Στα συνδυασμένα στοιχεία των δύο οικογενή και μη επιλεγμένες περιπτώσεις, ο συνολικός κίνδυνος ήταν ακόμα πιο αυξημένη (OR = 1,54, 95% CI = 1,20 – 1,98,

P

= 0.0007). Το γεγονός ότι η προηγούμενη ανάλυση δεν κατέχει όταν διαιρεθεί σε υποκατηγορίες μπορούσε συνεπώς να εξηγηθεί από το μέγεθος της μελέτης. Η τρέχουσα μελέτη έχει μια δύναμη περίπου 100% για την ανίχνευση σύνδεσης σε σύγκριση με το 94% της προηγούμενης μελέτης. Περαιτέρω παρακολούθηση με μεγαλύτερο μέγεθος δείγματος θα ήταν πιθανόν να υλοποιηθεί η σύνδεση ακόμη ισχυρότερη. Εμείς δεν βρήκε καμία συσχέτιση μεταξύ αυτής της παραλλαγής και της καλοήθους υπερπλασίας του προστάτη, γεγονός που υποδηλώνει ότι ο ρόλος του Cys148Arg (T442C) είναι ήσσονος σημασίας και ο καρκίνος προδιαθέτουν αποτέλεσμα προκύπτει μόνο σε πιο προχωρημένες περιπτώσεις, ειδικά εκείνοι με μια επιθετική κατάσταση του προστάτη. Εναλλακτικά, καλοήθη υπερπλασία του προστάτη και του προστάτη είναι ανεξάρτητα γεγονότα ή τουλάχιστον

ARLTS1

δεν είναι παρεπόμενες για την καλοήθη υπερπλασία του προστάτη μετασχηματισμό προς PCA. Η πλέον παρακολούθηση των ασθενών ΒΡΗ είναι αναγκαία για την αξιολόγηση του κατά πόσον οι ασθενείς που φέρουν CC γονότυπο (16%) είναι εκείνοι ανάπτυξης καρκίνου αργότερα.

Μόνο η ομόζυγη μορφή του αλληλόμορφου C της Cys148Arg (T442C) παραλλαγή οδήγησε σε μια ένωση με προστάτη τον κίνδυνο σε σύγκριση με το γονότυπο ΤΤ. Αυτό υποστηρίζει τα αποτελέσματα από προηγούμενες μελέτες με καρκίνο του μαστού [4], η οποία έδειξε ότι το C είναι το αλληλόμορφο κινδύνου, ενώ η Τ αλληλόμορφο έχει μια προστατευτική ή ουδέτερη επίδραση στην καρκινογένεση.

ARLTS1

Cys148Arg (T442C) ιδίως έχει προδιαθεσικούς επίδραση στην σποραδικές ΣΕΣΣ. Περαιτέρω, η Cys148Arg ήταν το μόνο

ARLTS1

παραλλαγή που παρατηρείται με μεγαλύτερη συχνότητα μεταξύ των δειγμάτων ιστού PCa και ξενομοσχεύματα, όπου οι συχνότητες ήταν 28,3% και πάνω από 40 τοις εκατό, αντίστοιχα. Αυτό δείχνει επίσης έναν πιθανό ρόλο για

ARLTS1

στην καρκινογένεση του προστάτη. Είναι ενδιαφέρον ότι, η πλήρης απουσία Trp149Stop (G446C) παρατηρήθηκε τόσο σε κλινικά δείγματα όγκων και σε ξενομοσχεύματα που δείχνει ότι αυτή η παραλλαγή δεν έχει να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην ανάπτυξη του προστάτη.

Ο πληθυσμός ελέγχου στη μελέτη μας δεν ήταν σε Hardy- Weinberg ισορροπία (HWE), γεγονός που υποδηλώνει ότι Cys148Arg μπορούσε να είναι μια νέα παραλλαγή. Σε δεδομένα μας, περίσσεια ετεροζυγωτών παρατηρήθηκε το οποίο μπορεί να υποδεικνύει την παρουσία πάνω από κυρίαρχης επιλογής ή την εμφάνιση της outbreeding. Το φαινόμενο της ετερόζυγο πλεονέκτημα επιτρέπει την φυσική επιλογή για τη διατήρηση του πολυμορφισμού. Το ίδιο πληθυσμό ελέγχου έχει χρησιμοποιηθεί πολλές φορές σε διαφορετικές αναλύσεις, και ποτέ πριν δεν ήταν ασύμφωνα από HWE [25]. Είναι ενδιαφέρον ότι, στην αφρικανική πληθυσμού της Υποσαχάριας Αφρικής, η CC γονότυπο δεν υπάρχει, και στην ασιατική πληθυσμού της είναι παρούσα μόνο σε ένα μικρό κλάσμα (https://www.ncbi.nlm.nih.gov). Μόνο στο πλαίσιο του ευρωπαϊκού πληθυσμού κάνει CC υφίστανται σε μεγαλύτερο ποσοστό. Λαμβάνοντας υπόψη τον πιθανό ρόλο του

ARLTS1

στο ανοσοποιητικό σύστημα, μπορεί να είναι ότι το CC γονότυπο έχει παράσχει μια προστατευτική επίδραση μεταξύ των Ευρωπαίων. HW ανισορροπία μεταξύ των ελέγχων δεν είναι ούτε αποτέλεσμα του λάθους του γονότυπου επειδή άμεση αλληλούχιση προηγουμένως χρησιμοποιήθηκε για να γονότυπο 164 των οικογενειακών δείγματα προστάτη και οι γονότυπους συνδυάζεται με τα αποτελέσματα της ανάλυσης TaqMan.