Αφηρημένο

Ο καρκίνος του προστάτη είναι η πιο κοινή μορφή καρκίνου του δέρματος μη και η δεύτερη κύρια αιτία θνησιμότητας που σχετίζονται με τον καρκίνο για τους άνδρες στις Ηνωμένες Πολιτείες. Υπάρχει ισχυρή εμπειρική και επιδημιολογικά στοιχεία που να υποστηρίζουν έναν ισχυρότερο ρόλο της γενετικής στον καρκίνο του προστάτη πρώιμης έναρξης. Πραγματοποιήσαμε ένα γονιδίωμα-ευρεία σάρωση σύνδεσης για πρώιμης έναρξης του καρκίνου του προστάτη. Μυθιστόρημα πτυχές αυτής της μελέτης περιλαμβάνουν την εστίαση στην ασθένεια πρώιμης έναρξης (που ορίζεται ως άνδρες με καρκίνο του προστάτη διαγιγνώσκονται πριν από την ηλικία 56 χρόνων) και τη χρήση των διαθέσιμων στο κοινό δεδομένων γονότυπο ελέγχου από προηγούμενες μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία. Βρήκαμε γονιδίωμα-ευρεία σημαντική (p & lt? 5 × 10

-8) αποδεικτικά στοιχεία για παραλλαγές στο 8q24 και 11p15 και ισχυρή ενθαρρυντικά στοιχεία για τον αριθμό των ήδη αναφερθεί τόπους. Βρήκαμε ελάχιστες ενδείξεις για τις μεμονωμένες ή συστηματικές φουσκωμένα ευρήματα ένωση που προκύπτει από τη χρήση των δημόσιων ελέγχων, αποδεικνύοντας τη χρησιμότητα της χρήσης δεδομένων δημόσιου ελέγχου σε μεγάλης κλίμακας μελέτες γενετικής συσχέτισης των κοινών παραλλαγών. Στο σύνολό τους, τα αποτελέσματα αυτά καταδεικνύουν τη σημασία των καθιερωμένων κοινών γενετικών παραλλαγών για τον καρκίνο του προστάτη πρώιμη έναρξη και τη δύναμη της, συμπεριλαμβανομένων πρώιμης έναρξης περιπτώσεις καρκίνου του προστάτη σε γενετικές μελέτες σύνδεσης

Παράθεση:. Lange EM, Johnson AM, Γουάνγκ Υ, Zühlke KA, Lu Υ, Ribado JV, et al. (2014) Genome-Wide σάρωσης Ένωση για παραλλαγές που σχετίζονται με πρώιμη εμφάνιση καρκίνου του προστάτη. PLoS ONE 9 (4): e93436. doi: 10.1371 /journal.pone.0093436

Συντάκτης: Amanda Ewart Toland, Πολιτειακό Πανεπιστήμιο του Οχάιο Medical Center, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής

Ελήφθη: 12η Δεκεμβρίου 2013? Αποδεκτές: 3 Μάρτη του 2014? Δημοσιεύθηκε: 16, Απριλίου, 2014

Copyright: © 2014 Lange et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Υποστήριξη ήταν που παρέχεται από NIH Κονδυλίων Έρευνας του έργου: R01-CA136621, R01-F023000 και NCI SPORE P50-CA69568. Ο χρηματοδότης δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Ο καρκίνος του προστάτη (PCA) είναι η κύρια αιτία θνησιμότητας από καρκίνο στους άνδρες. Το 2013, εκτιμάται ότι 238.590 άνθρωποι θα διαγνωστούν με και 29.720 άνδρες θα πεθάνουν από την ασθένεια [1]. Περίπου 1 στους 6 άνδρες θα διαγνωστεί με προστάτη κατά τη διάρκεια της ζωής τους με βάση τις τρέχουσες τιμές συχνότητα [1], [2]. Οι μεγάλες αναγνωρίζονται παράγοντες κινδύνου για την PCA αύξηση της ηλικίας, αφρικανικής καταγωγής και θετικό οικογενειακό ιστορικό.

Γονιδίωμα-ευρύ ένωση (GWA) μελέτες και μελέτες παρακολούθησης έχουν εντοπίσει και να αναπαραχθεί -65 πολυμορφισμών μονού νουκλεοτιδίου (SNPs) που σχετίζονται με προστάτη σε άνδρες ευρωπαϊκής καταγωγής [3] – [17]. Οι περισσότερες από αυτές τις μελέτες έχουν συμπεριλάβει κυρίως τα μεγαλύτερα περιπτώσεις προστάτη, αντανακλώντας τα δημογραφικά στοιχεία της νόσου, καθώς και, σε ορισμένες περιπτώσεις, οι περιορισμοί του σχεδιασμού της μελέτης. Για πιο σύνθετες διαταραχές, συμπεριλαμβανομένων των κοινών καρκίνων, πρώιμη ηλικία κατά τη διάγνωση είναι ένας δείκτης του κληρονομικές μορφές της νόσου. Μεταξύ κληρονομική οικογένειες προστάτη, η νόσος έχει διαγνωστεί 6-7 χρόνια νεότερος από σποραδική νόσο και ο κίνδυνος για την PCA αυξάνει με τη μείωση της ηλικίας των προσβεβλημένων μελών της οικογένειας [18]. Περαιτέρω, μελέτες έχουν δείξει ότι οι άνδρες διαγνώστηκαν με προστάτη νωρίτερα στη ζωή τους έχουν περισσότερες πιθανότητες να πεθάνουν από τη νόσο τους σε σύγκριση με τους άνδρες, με παρόμοια κλινικά χαρακτηριστικά της νόσου, διαγνώστηκαν σε μεγαλύτερη ηλικία [19], [20]. Για να αξιολογηθεί η σημασία των κοινών γενετικών παραλλαγών με πρώιμη έναρξη προστάτη, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη GWA για πρώιμη έναρξη ΣΕΣ, που ορίζεται εδώ ως προστάτη διαγνώστηκε πριν από την ηλικία 56 χρόνων, σε 931 άνδρες ευρωπαϊκής καταγωγής που είχαν διαγνωστεί με προστάτη κατά μέσο όρο ηλικία των 49,7 χρόνων και 4120 Ευρωπαϊκό ελέγχων καθόδου. Η μελέτη αυτή αποτελεί τη μεγαλύτερη μελέτη GWA μέχρι σήμερα με ιδιαίτερη έμφαση στα άτομα με πρώιμη έναρξη του προστάτη.

Υλικά και Μέθοδοι

Δήλωση Ηθικής

Το Πανεπιστήμιο του Michigan IRBMED έχει αναθεωρηθεί και ενέκρινε την προγραμματισμένη συνεχούς επανεξέτασης (SCR) που υποβλήθηκαν για το Πανεπιστήμιο του Michigan Καρκίνος του προστάτη Γενετικής του έργου. Η IRB διαπίστωσε ότι η προτεινόμενη έρευνα συνεχίζει να συμμορφώνεται με τις ισχύουσες κατευθυντήριες γραμμές, πολιτειακούς και ομοσπονδιακούς κανονισμούς, και το Πανεπιστήμιο της διασφάλισης της Ομοσπονδιακής σε όλη του Μίτσιγκαν (FWA), με το Υπουργείο Υγείας και Ανθρωπίνων Υπηρεσιών (HHS). Όλα Πανεπιστημίου του Michigan θέματα που περιλαμβάνονται στην παρούσα μελέτη παρέχει γραπτή συγκατάθεση για συμμετοχή στη μελέτη? τα έγγραφα πρωτόκολλο και συγκατάθεση εγκρίθηκαν από το Διοικητικό Συμβούλιο αναθεώρηση Θεσμικών στο Πανεπιστήμιο του Michigan Ιατρική Σχολή.

Τα δεδομένα γενότυπο από δείγματα παρακολούθησης για αυτή τη μελέτη ελήφθησαν από το Πανεπιστήμιο Johns Hopkins (JHU). Αυτή η πρόταση έρευνας σε ανθρώπινα υποκείμενα εξετάστηκε και εγκρίθηκε από το Διοικητικό Συμβούλιο Johns Hopkins Medicine Institutional Review (JHM IRB). JHU προστάτη περίπτωση DNA που ελήφθησαν από παθολογικά δείγματα αποχαρακτηριστούν και αποφασιστική, με JHM IRB, να απαλλάσσονται από την απαίτηση της γραπτής ή προφορικής συναίνεση. Δείγματα Παρακολούθηση DNA ελέγχου ελήφθησαν από PCa διαλογή άνδρες αρνητικό για την ασθένεια. Όλα JHU ελέγχους που προβλέπονται γραπτή συγκατάθεση? τα έγγραφα πρωτόκολλο και συγκατάθεση εγκρίθηκαν από JHM IRB. Αναλύσεις για αυτή τη μελέτη που διεξήχθη στο Πανεπιστήμιο της Βόρειας Καρολίνας στο Chapel Hill χρησιμοποιώντας de-εντοπίστηκαν δεδομένα. Το Πανεπιστήμιο της Βόρειας Καρολίνας Διοικητικού κριτική Θεσμικών ενέκρινε την προτεινόμενη μελέτη. Οι συμφωνίες μεταφοράς υλικού δεδομένα υπογράφηκαν μεταξύ των υπαλλήλων στο Πανεπιστήμιο της Βόρειας Καρολίνας, του Πανεπιστημίου του Michigan και του Πανεπιστημίου Johns Hopkins.

Δείγματα Μελέτη

Το τελικό δείγμα περίπτωση μελέτη συμπεριέλαβε 931 γονότυπος επιτυχώς άσχετα πρώιμης έναρξης περιπτώσεις προστάτη (διαγνωστεί πριν την ηλικία των 56 χρόνων) της Ευρωπαϊκής καταγωγής από το Πανεπιστήμιο του Michigan Καρκίνος του προστάτη Γενετικής του έργου (UM-PCGP). Περιγραφικές πληροφορίες σχετικά με τις περιπτώσεις που παρουσιάζονται στον Πίνακα 1. Η μέση (τυπική απόκλιση) και μέση ηλικία (εύρος) της διάγνωσης του καρκίνου του προστάτη σε αυτές τις 931 περιπτώσεις ήταν 49,7 (4,1) έτη και 50 (27-55) έτη, αντίστοιχα. Αξίζει να σημειωθεί ότι το δείγμα αυτό των ανδρών είναι εμπλουτισμένη για θετικό οικογενειακό ιστορικό (576/931 ή 61,9%, με αναφερόμενη πρώτου ή δεύτερου βαθμού συγγενείς με PCA), εν μέρει συνέπεια της μερικά δείγματα (n = 127) που διαπιστώθηκε από τις οικογένειες που περιλαμβάνονται στο UM -PCGP μελέτη σύνδεσης στην κληρονομική του προστάτη. Περιγραφές των κληρονομικών οικογένειες προστάτη UM-PCGP μπορεί να βρεθεί αλλού [21], [22]. Ένα σύνολο 351 περιπτώσεων προέρχονταν από οικογένειες που είχαν DNA που συλλέγονται σε πολλές περιπτώσεις? 817/931 περιπτώσεις ήταν είτε οικογένεια εξεταζομένων ή διαπιστώνεται άμεσα λόγω νεαρή ηλικία κατά τη διάγνωση. Σε οικογένειες που είχαν περισσότερες από μία περίπτωση προστάτη διαγιγνώσκονται πριν από την ηλικία 56 χρόνων, μόνο ο νεότερος διαθέσιμη υπόθεση συμπεριλήφθηκε στην παρούσα μελέτη. Τα κλινικά χαρακτηριστικά της UM-PCGP περιπτώσεις προστάτη πρώιμη έναρξη παρουσιάζονται στον Πίνακα 1.

Η

Μη συνδεδεμένοι ελέγχους με τα δεδομένα SNP μελέτη GWA επιλέχθηκαν από δημόσια διαθέσιμους πόρους μέσω dbGap (www.ncbi.nlm.nih. gov /κενό) και Illumina (www.illumina.com). Έλεγχοι επιλέχθηκαν για να έχουν ευρωπαϊκή αναφερόμενων στοιχείων καταγωγή και τον γονότυπο, που παράγεται από μια μελέτη GWA εμπορική πλατφόρμα παρόμοια με την πλατφόρμα που χρησιμοποιείται σε περιπτώσεις UM-PCGP. Για να διατηρηθεί η ανεξάρτητη αποτελέσματα από προηγούμενες δημοσιευμένες μελέτες προστάτη GWA, δημόσια έλεγχοι που χρησιμοποιούνται σε αυτές τις προγενέστερες μελέτες προστάτη αποκλείστηκαν από την εξέταση. Ελέγχους, η οποία περιελάμβανε γυναίκες, δεν ήταν, με τις γνώσεις μας, ελέγχονται για ΣΕΣΣ. Έλεγχοι προήλθε από τη γενετική του καρκίνου Δείκτες Ευαισθησίας (CGEMS) (n = 1135) GWA μελέτη για τον καρκίνο του μαστού [23] και η βάση δεδομένων iControlDB Illumina του (n = 2985) (www.Illumina.com). Μόνο CGEMS καρκίνο του μαστού

έλεγχοι

συμπεριλήφθηκαν. Περιορισμένη περιγραφικές πληροφορίες, όπως η ηλικία, το φύλο και καταγωγή, σε επιλεγμένα θέματα iControlDB μπορούν να ληφθούν από την ιστοσελίδα της Illumina. Το σκεπτικό για τη συμπερίληψη των γυναικών ελέγχων παρέχεται στη συζήτηση. Ξεχωριστές αναλύσεις περιλαμβάνοντας μόνο άρρενες iControlDB πραγματοποιήθηκαν επίσης

Ένα υποσύνολο των νέων SNPs. (P & lt? 5.0 × 10

-5 και δεν είχαν προηγουμένως αναφερθεί να σχετίζεται με προστάτη) αναλύθηκαν σε ένα πρόσθετο δείγμα 2571 άσχετες περιπτώσεις προστάτη (1053 διαγνωστεί πριν την ηλικία των 56 χρόνων) και 921 ελέγχονται οι έλεγχοι της ευρωπαϊκής καταγωγής από JHU (βλέπε Ewing et al. [24] για την περιγραφή των θεμάτων).

Γονοτυπικές

938 Ευρω-αμερικανικού περιπτώσεις προστάτη πρώιμης έναρξης UM-PCGP αρχικά ο γονότυπος στο Πανεπιστήμιο Wake Forest χρησιμοποιώντας HumanHap 660W-Quad v1.1 BeadChip Illumina του. CGEMS ελέγχου του καρκίνου του μαστού ήταν ο γονότυπος προηγουμένως χρησιμοποιώντας HumanHap550v1 Illumina του [23]. Τα θέματα iControlsDB γονότυπος προηγουμένως χρησιμοποιώντας HumanHap550v1 Illumina του (n = 1478) ή HumanHap550v3 (n = 1507) οι εμπορικές πλατφόρμες του γονότυπου. Παρακολούθηση του γονότυπου για JHU θέματα διεξήχθη στο Πανεπιστήμιο Wake Forest με τη χρήση του συστήματος Sequenom. Όλες οι διαδικασίες που ακολουθούνται iPlex οδηγός του κατασκευαστή Εφαρμογή (Sequenom, Inc. SanDiego, CA) και όλα τα αντιδραστήρια ανάλυσης αγοράστηκαν από Sequenom. Για τη διασφάλιση της ποιότητας του προσδιορισμού του γονότυπου, περίπου το 2% των διπλών δειγμάτων και 2% των αρνητικών μαρτύρων, στο οποίο το νερό αντικατέστησε DNA, εφαρμόστηκαν.

Στατιστικές Αναλύσεις

ποιότητα Γονοτυπικές ελέγχου (QC) μέθοδος αυτή εφαρμόζεται ομοιόμορφα σε όλα τα δείγματα. Για να μειωθούν οι ενδεχόμενες επιπτώσεις της μεροληψίας λόγω «παρτίδα» γονοτύπησης αποτελέσματα, SNPs λείπει γονότυπο καλεί σε & gt? 2% των ατόμων σε

οποιαδήποτε

από τα τέσσερα σύνολα δειγμάτων (περιπτώσεις UM-PCGP, έλεγχοι CGEMS καρκίνο του μαστού, Illumina iControls V1 ή iControls V3) αποκλείστηκαν. Θέματα που λείπουν & gt? 5% των SNP γονοτυπική κλήσεις επίσης εξαιρούνται. Για τις περιπτώσεις UM-PCGP, του γονότυπου κλήσεις μεταξύ HumanHap 660W-Quad αποτελέσματα v1.1 BeadChip Illumina και 14 SNPs στο παρελθόν ο γονότυπος χρησιμοποιώντας TaqMan [25] συγκρίθηκαν για την επαλήθευση της ταυτότητας του δείγματος και να αξιολογήσει τη συνολική συμφωνία των κλήσεων γονότυπου ανάμεσα στις δύο πλατφόρμες. Επιπλέον, 21 διπλά δείγματα συμπεριλήφθηκαν για την εκτίμηση του συσχετισμού κλήσεις γονότυπο με HumanHap 660W-Quad αποτελέσματα v1.1 BeadChip της Illumina του. Το προσωπικό του εργαστηρίου δεν γνώριζαν την ταυτότητα των εις διπλούν. Ευρωπαϊκή καταγωγή για όλα τα θέματα, συμπεριλαμβανομένων των ελέγχων, επαληθεύτηκε χρησιμοποιώντας την πρόσμιξη λογισμικού [26]? άτομα με εμφανή Λανθασμένη ταυτοποίηση καταγωγή ή μικτή καταγωγή αφαιρέθηκαν από την εξέταση.

γονότυπου καταλογισμό διεξήχθη για να επεκτείνετε την κάλυψη των παραλλαγών στη μελέτη μας GWA να SNPs που δεν συμπεριλήφθηκαν στο HumanHap 660W-Quad v1.1 BeadChip Illumina ή που είχαν συμπεριληφθεί στην BeadChip αλλά χάθηκαν κατά τη διάρκεια της QC, χρησιμοποιώντας το Mach πακέτο λογισμικού [27], [28]. Γονότυπο καταλογισμό διεξήχθη χωριστά, συμπεριλαμβανομένων SNPs από HapMap Φάσης ΙΙ (δείγματα αναφοράς CEU) και HapMap Φάσης ΙΙΙ (δείγματα αναφοράς CEU + ΤΠΔ). Τεκμαρτά στοιχεία γονότυπο αναλύθηκαν ως τιμές δοσολογία (αναμενόμενο αριθμό αντιγράφων των ανήλικων αλληλόμορφα) σε μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης εφαρμοστεί σε Mach2dat [28]. Τα μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης περιλαμβάνεται συμμεταβλητή ρύθμιση για τα πρώτα 10 κύρια συστατικά για την καταγωγή και /ή παρτίδα αποτελέσματα. Ανάλυση σε κύριες συνιστώσες πραγματοποιήθηκε με τη χρήση του λογισμικού Eigenstrat [29] σχετικά με τη συνδυασμένη δείγμα των υποθέσεων και των ελέγχων χρησιμοποιώντας ένα δεσμό-ανισορροπίας (LD) κλαδεύονται σύνολο των SNPs. Όλα τα δεδομένα γονότυπου για SNPs που εξαιρέθηκαν με βάση τον έλεγχο της ποιότητας αναλύσεις λόγω ποσοστά γονότυπο-λείπει σε ένα ή περισσότερα από τα τέσσερα σύνολα δείγματος μηδενίζεται έξω σε όλα τα σύνολα δείγμα τεσσάρων στόχο πριν από τον καταλογισμό για να μειωθεί η πιθανότητα ανεπιθύμητων παρτίδας γονότυπο που επηρεάζουν το καταλογισμό με βάση τα αποτελέσματα συσχέτιση SNP. Προτίμηση δόθηκε στη Φάση ΙΙΙ αποτελέσματα του συνυπολογισμού όταν ένα SNP καταλογίστηκε με επιτυχία χρησιμοποιώντας δείγματα τόσο Φάσης ΙΙ και Φάσης ΙΙΙ HapMap. Γονιδίωμα-ευρεία σημασία ορίστηκε ως ρ & lt? 5.0 × 10

-8. παραλλαγές του χρωμοσώματος Χ δεν καταλογίστηκαν. αναλύει

Ενιαία σύνδεση παραλλαγή για άμεσα ο γονότυπος δεδομένων SNP πραγματοποιήθηκαν επίσης χρησιμοποιώντας το plink λογισμικού [30]. Μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης αναλύονται συστηματικά με συμμεταβλητή ρύθμιση για τα πρώτα 10 κύρια συστατικά που προέρχονται από Eigenstrat. Μόνο SNPs που γονότυπος & gt? Ποσοστό 98% σε όλες τις τέσσερις ομάδες δειγμάτων περιλήφθηκαν στην γονότυπος-SNP αναλύσεις. αναλύσεις χρωμόσωμα Χ πραγματοποιήθηκαν σε απευθείας γονότυπος SNPs και περιορίζεται να περιλαμβάνει μόνο τις 1126 άρρενες iControlDB

Ένα υποσύνολο των SNPs φθάνοντας σ & lt?. 5 × 10

-5 στη μελέτη GWA ακολουθήθηκαν σε ένα ανεξάρτητο δείγμα 2571 περιπτώσεων προστάτη και 921 εξετάζονται μάρτυρες από JHU. SNPs αναλύθηκαν ξεχωριστά χρησιμοποιώντας chi-square τεστ. αναλύσεις υποσύνολο πραγματοποιήθηκαν περιορίζουν περιπτώσεις σε αυτούς (n = 1053) διαγνωστεί με προστάτη πριν από την ηλικία 56 χρόνων.

Αποτελέσματα

592.652 SNPs γονότυπος σε 938 άσχετες ευρωπαϊκή-αμερικανική περιπτώσεις UM-PCGP με πρώιμης έναρξης του προστάτη. QC αναλύσεις διεξήχθησαν για να εκτιμήσει τη συνολική ακρίβεια και την πληρότητα των δεδομένων γονότυπο. Πέντε άτομα UM-PCGP αφαιρέθηκαν για το χαμηλό ποσοστό γονότυπο (& lt? 95% των SNPs με δεδομένα γονότυπο). Δύο πρόσθετα θέματα UM-PCGP είχε μεγάλη αναμενόμενη αναλογία των μη ευρωπαϊκών καταγωγή και αφαιρέθηκαν. Μετά την απομάκρυνση του δείγματος, συνολικά 931 άσχετες περιπτώσεις UM-PCGP προστάτη περάσει, QC, και συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη. ποσοστά γονότυπο αντιστοιχία μεταξύ HumanHap 660W-Quad v1.1 BeadChip και Taqman κλήσεις γονότυπο ήταν & gt? 99% και η εσωτερική συμφωνία του HumanHap 660W-Quad v1.1 BeadChip κλήσεις σε 21 ζεύγη διπλούν ήταν & gt?. 99,99%

συνολικά 458.162 SNPs αυτοσωματικό με μια επιτυχημένη ποσοστό του γονότυπου & gt? 98% σε κάθε δείγμα (UM-PCGP, CGEMS καρκίνο του μαστού ελέγχους, iControls V1, iControls V3) έχουν συμπεριληφθεί στην τελική στόχο που είχε τεθεί για το γονότυπο καταλογισμό. Γονότυπο καταλογισμό επέτρεψε συνολικά 2.639.562 SNPs αυτοσωματικό, με Mach βαθμολογία ποιότητας καταλογισμό R

2 & gt? 0.3, πρέπει να αναλυθούν για σύνδεση με προστάτη. Τα αποτελέσματα σε όλη την γονιδίωμα απεικονίζονται γραφικά στο Σχήμα 1 και τα κορυφαία ευρήματα (p & lt? 1,0 × 10

-5) παρουσιάζονται στον Πίνακα 2. Το κορυφαίο αποτέλεσμα ήταν για ένα ασυνήθιστο (ήσσονος σημασίας συχνότητα αλληλόμορφο υπολογίζεται σε 1,5% σε συνδυασμό δείγμα case-control) του χρωμοσώματος 13 SNP rs11839053 (p = 8.7 × 10

-10) βασίζεται σε δεδομένα καταλογισμό HapMap Φάση ΙΙ. Για τους λόγους που περιγράφονται στη συζήτηση, πιστεύουμε ότι το αποτέλεσμα για αυτόν τον SNP θα πρέπει να εξετάζεται με προσοχή. Δύο ιδρύθηκε 8q24 SNPs (rs10505477, p = 9.4 × 10

-9? Rs6983267, σ = 1.2 × 10

-8) και δύο καθιερωμένων 11p15 SNPs (rs7126629, p = 2.3 × 10

-8? rs7114836, p = 3.7 × 10

-8) και έφτασε γονιδίωμα-ευρεία σημασία. Τα κορυφαία νέα αποτελέσματα ήταν για το χρωμόσωμα 18 SNP rs11664910 (p = 2.3 × 10

-6) και το χρωμόσωμα 17q21-22 rs8064701 SNP (p = 4.8 × 10

-6).

Η

αποτελέσματα για αναλύσεις απευθείας γονότυπου SNPs ήταν σύμφωνα με τα αποτελέσματα από τις τεκμαρτή δεδομένα γονότυπου για SNPs περιλαμβάνεται και στα δύο σύνολα δεδομένων (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Αξίζει να σημειωθεί ότι, rs6983267 κατέληξε επίσης γονιδίωμα-ευρεία σημασία στην γονότυπος-SNP αναλύσεις (p = 1.3 × 10

-8). Λίγα στοιχεία για ένα συστηματικό σφάλμα φουσκωμένα τύπου Ι παρατηρήθηκε όταν λαμβάνοντας υπόψη την κατανομή όλων των αποτελεσμάτων (γονιδιωματική συντελεστή πληθωρισμού 1.026) [31]. Συνολικά 11.397 άμεσα ο γονότυπος SNPs στο χρωμόσωμα Χ Αναλύθηκαν επίσης? η κορυφή εύρημα βρίσκεται στο rs5906300 (p = 8.1 × 10

-5) και δεν υπήρχε ένδειξη για οποιαδήποτε συστηματική διόγκωση του σφάλματος τύπου Ι σε όλο το χρωμόσωμα Χ (Genomic συντελεστή πληθωρισμού = 1.00).

τριάντα εννέα SNPs προηγουμένως αναφερθεί να σχετίζεται με προστάτη σε άνδρες ευρωπαϊκής καταγωγής, συνοψίζονται στον Goh et al. [32], αξιολογήθηκαν για επιβεβαιωτική μαρτυρία στη μελέτη μας των ανδρών με πρώιμη έναρξη της νόσου (Πίνακας 3). Είκοσι τρία από τα 39 SNPs ήταν τουλάχιστον ονομαστικά σημαντική (p & lt? 0,05) στην παρούσα μελέτη? όλα τα 23 είχαν κατευθύνσεις του αποτελέσματος σύμφωνα με τις προηγούμενες εκθέσεις. Δώδεκα από τους 16 SNPs που δεν έφθασαν ονομαστική σημασία είχε επίσης την κατεύθυνση της επίδρασης συνάδει με τις προηγούμενες εκθέσεις. Εκτιμώμενη ποιότητας καταλογισμό για τη συντριπτική πλειοψηφία αυτών των SNPs ήταν εξαιρετική.

Η

Τα αποτελέσματα από τη συνεργασία αναλύσεις που περιελάμβαναν μόνο οι 1126 άνδρες εθελοντές iControlDB ήταν παρόμοια με αυτά που λαμβάνονται χρησιμοποιώντας το μεγαλύτερο φύλο σε συνδυασμό δείγμα ελέγχου. Γονιδίωμα-ευρύ σημαντικά ευρήματα ελήφθησαν για τα δύο προαναφερθέντα χρωμόσωμα 8q24 SNPs (rs10505477, p = 1,7 × 10

-9? Rs6983267, σ = 1.8 × 10

-9) και είναι γνωστό χρωμόσωμα 17

TCF2

-intronic rs4430796 SNP (p = 4.1 × 10

-8). Χρωμόσωμα 11p15 SNPs rs7126629 (p = 1.6 × 10

-6) και rs7114836 (p = 9,9 × 10

-6) και το χρωμόσωμα 13 SNP rs11839053 (p = 1.2 × 10

-4) δεν φθάνουν γονιδίωμα-ευρεία σημασία, όταν χρησιμοποιεί το μικρότερο δείγμα ελέγχου

Δεκατρείς ανεξάρτητοι SNPs που επέδειξε ισχυρή ονομαστική σύνδεση με προστάτη. (ορίζεται εδώ ως p & lt? 5 × 10

-5), όταν χρησιμοποιείτε το πλήρες δείγμα ελέγχου, και που δεν έχουν προηγουμένως ενοχοποιηθεί να συνδέονται με προστάτη ήταν ο γονότυπος και δοκιμάστηκαν για σύνδεση με PCA σε ένα ανεξάρτητο δείγμα 2571 άσχετες ευρωπαϊκή καταγωγή περιπτώσεις προστάτη και 921 εξετάζονται μάρτυρες από JHU. Όταν τα αποτελέσματα ήταν παρόμοια μεταξύ του άνω τεκμαρτών SNP και άμεσα ο γονότυπος SNP στην ίδια περιοχή, επιλέχθηκε το SNP γονότυπος άμεσα για παρακολούθηση. Μόνο ένα SNP, rs11664910, έφτασε ονομαστική σημαντικότητα (p & lt? 0,05)? Ωστόσο, η κατεύθυνση της επίδρασης για αυτό το SNP δεν ήταν σύμφωνο με την αρχική μελέτη GWA αποτέλεσμα (Πίνακας 4). Τα αποτελέσματα ήταν παρόμοια όταν τον περιορισμό της συνέχειας περίπτωση δείγμα για περιπτώσεις διαγιγνώσκονται πριν από την ηλικία 56 χρόνων (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται).

Η

Συζήτηση

Από την περίοδο 2005-2009, η μέση ηλικία κατά την προστάτη διάγνωση στις Ηνωμένες Πολιτείες ήταν 67 ετών και μόνο ~ 10% των περιπτώσεων είχαν διαγνωστεί πριν την ηλικία των 55 ετών [1]. Δεδομένου του μικρό ποσοστό των περιπτώσεων προστάτη διαγιγνώσκονται σε αυτή την ηλικιακή ομάδα, οι περισσότερες γενετικές μελέτες για την PCA συμπυκνώθηκε σε άνδρες διαγνώστηκαν με τη νόσο αργότερα στη ζωή παρά την απόδειξη ότι η πρώιμη ηλικία κατά τη διάγνωση είναι ένας δείκτης αυξημένης γενετικής ευαισθησίας. Για παράδειγμα, μια σουηδική μελέτη έδειξε ότι το οικογενειακό ιστορικό είναι ιδιαίτερα σημαντική στους άνδρες που έχουν μία ή περισσότερες συγγενείς πρώτου βαθμού που είχαν διαγνωστεί με προστάτη σε σχετικά νεαρή ηλικία [19]. Ο σχετικός κίνδυνος για την ανάπτυξη του προστάτη για έναν άνθρωπο του οποίου ο πατέρας είχε διαγνωστεί με προστάτη σε ηλικία 60 ετών και άνω εκτιμάται ότι είναι 1,5. Ο σχετικός κίνδυνος ανάπτυξης προστάτη αυξήθηκε σε 2,5 εάν ο πατέρας διαγνώσθηκε πριν από την ηλικία των 60 ετών. Ομοίως, εάν κάποιος αδελφός είχε διαγνωστεί με προστάτη σε ηλικία 60 ετών ή μεγαλύτεροι, στη συνέχεια, ο σχετικός κίνδυνος για έναν άνδρα την ανάπτυξη του προστάτη εκτιμήθηκε να είναι 2, ενώ ο σχετικός κίνδυνος εκτιμάται ότι είναι 3, εάν ότι ο αδελφός είχε διαγνωστεί με προστάτη πριν από την ηλικία των 60 ετών [19 ]. Σε μια μετα-ανάλυση, ο κίνδυνος προστάτη έδειξε να αυξάνει με τη μείωση της ηλικίας κατά προστάτη διάγνωση ενός συγγενή πρώτου βαθμού [20].

Έχουμε περιγράψει μια μελέτη GWA για πρώιμη έναρξη του προστάτη βασίζεται εξ ολοκλήρου των περιπτώσεων διαγνωστεί με την ασθένεια πριν από την ηλικία 56 ετών. Ένα ενιαίο νέο τόπο, χρωμοσώματος 13 SNP rs11839053 (p = 8.7 × 10

-10), έφτασε γονιδιώματος σε επίπεδο σημαντικότητας (p & lt? 5 × 10

-8), αν και καλούμε προσοχή στην ερμηνεία αυτού του αποτελέσματος (βλέπε παρακάτω). Συνολικά τέσσερις παραλλαγές σε γνωστές περιοχές του συνεταιρίζεσθαι προστάτη έφτασε γονιδίωμα-ευρεία σημασία: δύο 8q24 παραλλαγές, rs6983267 (p = 9.5 × 10

-9) και rs10505477 (p = 9.4 × 10

-9), και δύο 11p15 παραλλαγές, rs7126629, (p = 2.3 × 10

-8) και rs7114836, (p = 3.7 × 10

-8). Εκτός από αυτούς τους τόπους, υπήρξε έντονη ενθαρρυντικά στοιχεία σε μια σειρά από προηγουμένως συσταθεί τόπους προστάτη (Πίνακας 3). Αξίζει να σημειωθεί ότι για την καθιερωμένη τόπους οι παρατηρούμενες αναλογίες πιθανότητες ήταν συγκρίσιμες με τις αναλογίες πιθανοτήτων στις αρχικές μελέτες ανακάλυψη παρά τις εκτιμήσεις αναλογία πιθανοτήτων πιθανό προς τα πάνω μεροληπτεί στις αρχικές εκθέσεις, λόγω της «νικητές κατάρα» φαινόμενο στην SNP ανακάλυψη ένωση [33] , και η χρήση της γυναικείας και μη ελεγμένων αρσενικό ελέγχους στην παρούσα μελέτη.

στην έκθεση αυτή, παρατηρήσαμε μια νέα σημαντική συσχέτιση για το χρωμόσωμα 13 SNP rs11839053 με βάση HapMap φάσης ΙΙ δεδομένων καταλογισμό (p = 8.7 × 10

-10). Σημειώσαμε μια ισχυρή διαφορά μεταξύ των αποτελεσμάτων από HapMap Φάσης ΙΙ (p = 1,0 × 10

-9) και Φάσης ΙΙΙ (p = 0.98) έχει ως αποτέλεσμα τον καταλογισμό για τις γειτονικές SNP rs11843540, η οποία βρίσκεται σε ισχυρή LD με rs11839053 (R

2 = 1,0 σε δείγματα HapMap Φάση ΙΙ CEU). Rs11839053 δεν γονότυπου σε δείγματα HapMap Φάσης ΙΙΙ. Η ισχυρή διαφορά μεταξύ των αποτελεσμάτων για rs11843540 με βάση Φάσης ΙΙ και Φάσης ΙΙΙ δεδομένων καταλογισμό ήταν η μόνη σημειωθεί σημαντική διαφορά μεταξύ αυτών των δύο συνόλων δεδομένων σε όλους τους SNPs που καταλογίστηκαν χρησιμοποιώντας και τα δύο δείγματα αναφοράς? αποτελέσματα ήταν επίσης εξαιρετικά συμφωνούσαν μεταξύ γονότυπου και των τεκμαρτών SNPs (συσχετίσεις Spearman είναι: 0,98, 0,98, 0,96, μεταξύ των αποτελεσμάτων για τη φάση ΙΙ έναντι γονότυπο, Φάση ΙΙΙ εναντίον γονότυπο, και Φάσης III εναντίον της φάσης ΙΙ, αντίστοιχα). Είναι ενδιαφέρον ότι, η σημαντική αποτέλεσμα στο rs11839053 παρατηρήθηκε επίσης όταν περιορισμό αναλύσεις στις CGEMS ελέγχους καρκίνου του μαστού και κατά την ανάλυση των δεδομένων τεκμαρτή γονότυπο που παράγονται χρησιμοποιώντας 1,000 δεδομένα Γονιδιώματα Έργου (3

απελευθέρωσης rd) ως πίνακας αναφοράς (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται). Σημειώνουμε ότι ποιότητες καταλογισμό για rs11839053 και rs11843540 ήταν σχετικά φτωχή (r

2~0.6 σε όλους τους πίνακες αναφοράς για κάθε SNP), παρατηρήσαμε ελάχιστα στοιχεία σύνδεσης (όλα τα p & gt? 0.001) για κάθε άμεσα ο γονότυπος SNPs στα 500 kb περιοχή αμέσως γύρω από τα δύο SNPs, και δεν παρατηρήσαμε κανένα αποδεικτικό στοιχείο για τη σύνδεση στο rs11839053 στη μελέτη παρακολούθησης μας 2571 περιπτώσεις και 921 εξετάζονται μάρτυρες από JHU (Πίνακας 3). Ενώ η μελέτη μας χρησιμοποιώντας τη δημόσια έλεγχοι φαίνεται να έχουν καλή συνολικό έλεγχο του σφάλματος τύπου Ι, οποιοδήποτε άτομο αποτέλεσμα πρέπει να θεωρείται ύποπτη. Δεν είναι σαφές αν το αποτέλεσμα στο rs11839053 στη μελέτη μας GWA είναι ένα κατασκεύασμα της χρησιμοποιώντας δεδομένα γονότυπου δημόσιο έλεγχο (δηλαδή «παρτίδα» αποτελέσματα για ένα ή περισσότερα γονότυπου SNPs στην περιοχή επηρεάζοντας καταλογισμού του φόρου) ή ένα πραγματικό σήμα. . Μελλοντικές μελέτες θα πρέπει να επιβεβαιώσετε το αποτέλεσμα ένωση πριν ο τόπος θα πρέπει να θεωρείται νόμιμο τόπο προστάτη

Εντοπίσαμε 12 επιπλέον νέες περιοχές που περιλαμβάνονται παραλλαγές που είχε ενδεικτικά στοιχεία για την ένωση (ορίζεται εδώ ως p & lt? 5 × 10

-5). Ένας εκπρόσωπος SNP επιλέχθηκε σε κάθε περιοχή και συνέχεια στα δείγματα JHU? καμία σημαντική στοιχεία που να υποστηρίζουν οποιοδήποτε από τα αποτελέσματα στην αρχική μελέτη παρατηρήθηκαν (Πίνακας 3). Αναμφισβήτητα το πιο ενδιαφέρον αποτέλεσμα μεταξύ αυτών δώδεκα θέσεις ήταν για το χρωμόσωμα 17q21-22 τεκμαρτών SNP rs8064701 και σε κοντινή απόσταση απ ‘ευθείας γονότυπου rs7225566 SNP. Πρόσφατα ανακαλύψαμε μια ασυνήθιστη παραλλαγή εσφαλμένου νοήματος, G84E /rs138213197, στο

HOXB13

που σχετίζεται με προστάτη [24]. Η παραλλαγή G84E είναι περίπου 1,2 Mb εγγύς προς rs8064701 και rs7225566. Μεταξύ των 931 περιπτώσεις στην τρέχουσα μελέτη (η οποία επίσης περιλαμβάνεται στην αρχική

HOXB13

έκθεση), 23 (-2,5%) έφεραν το αλληλόμορφο παραλλαγή στο

HOXB13

. Πραγματοποιήσαμε απλότυπου μεγάλης εμβέλειας, χρησιμοποιώντας FastPhase2 [34] και προσδιόρισε ένα ενιαίο μεγάλου βεληνεκούς απλότυπος που περιείχε όλα τα παραλλαγή 23 G84E αλληλόμορφα (μία περίπτωση, χωρίς την αλληλόμορφο παραλλαγή επίσης είχε προβλεφθεί να έχουν την ίδια μεγάλης εμβέλειας απλότυπος). Η συχνότητα του αλληλόμορφου ήσσονος σημασίας (κίνδυνος) για rs7225566 στη μελέτη GWA ήταν 15% στις περιπτώσεις και το 11% σε ελέγχους. Δεκαπέντε από τις 23 περιπτώσεις που φέρει το

HOXB13

G84E κινδύνου αλληλόμορφο πραγματοποιείται επίσης τον ανήλικο /αλληλόμορφο κινδύνου για rs7225566, συμπεριλαμβανομένου ενός ομοζυγώτες. Τα αποτελέσματα αυτά υποδεικνύουν τις παρατηρούμενες ονομαστικά σημαντικές συσχετίσεις στο rs8064701 και rs7225566 οφείλονται εν μέρει σε ανισορροπία σύνδεσης με το

HOXB13

G84E. Ενώ υπήρξε μια μικρή αύξηση στη συχνότητα του αλληλόμορφου κινδύνου rs7225566 στα δεδομένα JHU (11% των περιπτώσεων έναντι 10% στην ομάδα ελέγχου), το αποτέλεσμα δεν ήταν στατιστικά σημαντική. Τέλος, σημειώνουμε ότι rs7225566 είναι ~362 kb περιφερικά rs7210100, μια ασυνήθιστη παραλλαγή που είχε προηγουμένως εντοπιστεί να σχετίζεται με προστάτη σε μια μελέτη GWA των Αφροαμερικανών [35]. Rs7210100 δεν ήταν άμεσα ο γονότυπος ή με επιτυχία το τεκμαρτό, λόγω της απουσίας του Καυκάσου μεταφορέων στις HapMap πίνακες αναφοράς, στα δείγματα μας μελέτη GWA. Η απουσία /σπανιότητα του αλληλόμορφου κινδύνου για rs7210100 σε πληθυσμούς ευρωπαϊκής καταγωγής υποδηλώνει έντονα εύρημα μας στο rs7225566 είναι ανεξάρτητη από αυτή προηγούμενων αναφερθεί παραλλαγή. Αξίζει να σημειωθεί ότι, όπως έχει ήδη αναφερθεί (Συμπληρωματικό Υλικό Ewing et al. [24]), μεταξύ των 24 αφρικανικών φορέων κινδύνου αλληλόμορφο αμερικανική rs7210100, κανένας πραγματοποιείται η

HOXB13

G84E κινδύνου αλληλόμορφο.

μας αρχική μελέτη ανακάλυψη περιελάμβανε μόνο δημόσια διαθέσιμα δεδομένα γονότυπου ελέγχου σε αντίθεση με τη χρήση ενός ίδιας ηλικίας δείγματος ελέγχου προβληθεί χρυσό πρότυπο. Το UM-PCGP, είναι μια οικογένεια που βασίζεται και υπόθεση μόνο της μελέτης, δεν έχουν πρόσβαση σε μια ιδανική μεγάλο δείγμα ελέγχου από τον ίδιο πληθυσμό με τις περιπτώσεις. εσφαλμένης ταξινόμησης της νόσου, η οποία πιθανόν να πραγματοποιούνται σε υψηλότερες τιμές όταν χρησιμοποιούν τα δεδομένα δημόσιο έλεγχο, μπορεί να προκαλέσει μείωση της στατιστικής ισχύος για την ανίχνευση πραγματικά συνδεδεμένων γενετικών τόπων. Τα περισσότερα δημόσια δεδομένα γονότυπο διαθέσιμο ελέγχου προέρχονται από μελέτες με πολύ περιορισμένες πληροφορίες για την κατάσταση του προστάτη. Ενώ δεν υπάρχει υπάρχουν στη διάθεση του κοινού τα γενετικά δεδομένα σχετικά προστάτη εξετάζονται μάρτυρες από προηγούμενες μελέτες προστάτη GWA, έχουμε εκλεγεί για να αποφύγετε τη χρήση τους ελέγχους από αυτές τις μελέτες, προκειμένου να αποκτήσουν ανεξάρτητη αποτελέσματα. Εμείς, και άλλοι [36] – [39], έχουν δείξει ότι οι γενετικές μελέτες σύνδεσης, περιλαμβανομένων των μεγαλύτερων αριθμών των μη ελεγμένων έλεγχοι έχουν γενικά μεγαλύτερη δύναμη για την ανακάλυψη από τις μελέτες χρησιμοποιώντας ένα μικρότερο αριθμό των ελεγμένων ελέγχων που προβλέπονται το ποσοστό εσφαλμένης ταξινόμησης της νόσου δεν είναι υψηλό. Για τις πρωτογενείς αναλύσεις μας, επιλέξαμε να περιλαμβάνουν τόσο αρσενικά και θηλυκά κρατικού ελέγχου πάνω από ένα δείγμα ελέγχου περιορίζεται σε μη ελεγμένων αρσενικά. Ο επιπολασμός της διαγνώστηκε PCA σε ευρωπαϊκή-αμερικανική άνδρες έως 56 ετών είναι λιγότερο από 1%, έτσι ο ρυθμός της εσφαλμένης ταξινόμησης της νόσου για τους άνδρες μας και γυναικείο κοινό έλεγχοι δεν πρέπει να είναι ότι πολύ μεγαλύτερο από ό, τι θα ήταν για ίδιας ηλικίας ελέγχονται οι έλεγχοι από αυτή την ηλικιακή ομάδα.

Η παρούσα μελέτη περιλαμβάνει ένα μεγάλο αριθμό των ανδρών με θετικό οικογενειακό ιστορικό της ασθένειας (576/931 είχαν πρώτου ή δευτέρου βαθμού συγγενή με PCA). Μέρος αυτής της εμπλουτισμού ήταν άμεσα λόγω κριτήρια διαπίστωση, αλλά οι περισσότεροι είναι πιθανό οφείλεται στην αύξηση των ποσοστών της νόσου, εξαιτίας τόσο της γενετικής ευαισθησίας και ενισχυμένη προβολή, σε οικογένειες με πρώιμη έναρξη της νόσου. Αυτή η μελέτη προσθέτει στην αυξανόμενα στοιχεία ότι η μελέτη GWA κοινές παραλλαγές διαδραματίζουν σημαντικό ρόλο στην οικογενειακή και την πρώιμη έναρξη του προστάτη [17], [25], [40], [41]. Καθώς οι νέες μεταλλάξεις υψηλού διεισδυτικό ανιχνευθεί μέσω αλληλούχισης επόμενης γενιάς, την εκτίμηση της σχετικής ρόλο των κοινών παραλλαγών κινδύνου και σπάνιες μεταλλάξεις σε οικογενειακή ομαδοποίηση ασθένεια θα γίνει ένα συναρπαστικό χώρο της έρευνας. Για παράδειγμα, Karlsson et al. [42] πρόσφατα έδειξε ότι μεταφέρουν ένα

HOXB13

G84E μετάλλαξη [24], η οποία εμφανίζεται σε συχνότητα ~ 1,3% στη Σουηδία, είναι πιο έντονα σχετίζονται με κληρονομικές (OR = 6,6) και πρώιμης έναρξης (OR = 8.6), του προστάτη και ότι ο κίνδυνος για τους μεταφορείς μετάλλαξη G84E ανάπτυξης της νόσου αυξάνεται σημαντικά για όσους μεταφέρουν ένα μεγαλύτερο βάρος των καθιερωμένων κοινές παραλλαγές μελέτη GWA.

Εν κατακλείδι, περιγράφουμε τα αποτελέσματα από το πρώτο στάδιο της δύο -Στάδιο μελέτη GWA για πρώιμη εμφάνιση του προστάτη. σχεδιασμός της μελέτης σε δύο στάδια μας ακολουθεί τη στρατηγική που περιγράφεται από Ho και Lange [39], που αυξάνει την εξουσία των μελετών παραδοσιακών case-control GWA με την ενσωμάτωση των δεδομένων του δημόσιου ελέγχου γονότυπο στη φάση ανακάλυψης στάδιο 1. Όπως συμβαίνει και για οποιαδήποτε μελέτη, χρησιμοποιώντας δεδομένα του δημόσιου ελέγχου, πρέπει να ληφθεί μέριμνα για την ερμηνεία κάθε επιμέρους αποτελέσματος οφείλεται σε παράγοντες όπως οι επιδράσεις της παρτίδας του γονότυπου και διαφορική επιλεκτικές πιέσεις στους πληθυσμούς, τα οποία είναι δύσκολο να ελεγχθούν πλήρως για πειραματικά ή αναλυτικά. Τα αποτελέσματά μας παρέχουν απόδειξη αρχικού κεφαλαίου που ένα τέτοιο σχεδιασμό της μελέτης είναι λογικό, δεδομένης της ισχυρά αποδεικτικά στοιχεία σε μια σειρά από προηγουμένως συσταθεί προστάτη τόπους και την έλλειψη αποδεικτικών στοιχείων, με την πιθανή εξαίρεση του χρωμοσώματος 13 rs11839053 εύρημα, για ψευδή αποτελέσματα. Συνολικά, τα αποτελέσματα μας παρέχουν πειστικές ενδείξεις που υποστηρίζουν τη σημασία των κοινών γενετικών παραλλαγών σε πρώιμη εμφάνιση του προστάτη.

Ευχαριστίες

Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε όλους τους άνδρες με καρκίνο του προστάτη που συμμετείχαν σε αυτό το ερευνητικό πρόγραμμα. Εκτιμούμε ιδιαίτερα την υποστήριξη του Δρ Joel Nelson και τους ασθενείς του. Οι συγγραφείς εκφράζουν την ευγνωμοσύνη στον Δρ Claudia Σαλίνας και την κα Linda Okoth για την παροχή βοήθειας με τις προετοιμασίες του δείγματος UM-PCGP και η συλλογή κλινικών δεδομένων.