Αφηρημένο

διαύλων καλίου έχουν γίνει το επίκεντρο στη βιολογία του καρκίνου καθώς παίζουν ρόλο στο κελί συμπεριφορές που συνδέονται με την εξέλιξη του καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του πολλαπλασιασμού, της μετανάστευσης και της απόπτωσης. Δύο πόρων τομέα (Κ

2P) διαύλων καλίου είναι τα κανάλια φόντο που επιτρέπουν τη διαρροή των ιόντων καλίου από τα κύτταρα. Δεδομένου ότι αυτά τα κανάλια είναι ανοικτά σε ανάπαυση έχουν βαθιά επίδραση στο δυναμικό της κυτταρικής μεμβράνης και στη συνέχεια την ηλεκτρική δραστηριότητα και τη συμπεριφορά των κυττάρων στα οποία εκφράζονται. Το K

2P οικογένεια των καναλιών έχει 15 μέλη των θηλαστικών και ήδη 4 μέλη αυτής της οικογένειας (Κ

2P2.1, Κ

2P3.1, Κ

2P9.1, Κ

2P5 0.1) έχουν ενοχοποιηθεί σε καρκίνο. Εδώ εξετάζουμε την έκφραση όλων των 15 μελών της οικογένειας Κ

2P καναλιών σε μια ποικιλία τύπων καρκίνου. Αυτό επιτεύχθηκε με τη χρήση του online βάση δεδομένων του καρκίνου των μικροσυστοιχιών, Oncomine (www.oncomine.org). Κάθε γονίδιο εξετάσθηκε σε 20 τύπους καρκίνου, σύγκριση της έκφρασης mRNA σε καρκινικά με φυσιολογικό ιστό. Αυτή η ανάλυση αποκάλυψε όλα τα αλλά 3 K

2P μέλη της οικογένειας (Κ

2P4.1, Κ

2P16.1, Κ

2P18.1) παρουσιάζουν αλλαγμένη έκφραση στον καρκίνο. Η υπερέκφραση του K

2P κανάλια παρατηρήθηκε σε ένα εύρος καρκίνων συμπεριλαμβανομένων του μαστού, της λευχαιμίας και του πνεύμονα, ενώ περισσότερο καρκίνων (εγκεφάλου, ορθοκολικό, γαστρεντερικά, νεφρό, πνεύμονα, μελάνωμα, οισοφαγικό) έδειξε υποέκφραση του ενός ή περισσότερων καναλιών. K

2P1.1, Κ

2P3.1, Κ

2P12.1, υπερεκφράστηκαν σε ένα εύρος καρκίνων. Ενώ K

2P1.1, Κ

2P3.1, Κ

2P5.1, Κ

2P6.1, Κ

2P7.1 και Κ

2P10.1 έδειξε σημαντική υποέκφραση σε όλες τις μορφές καρκίνου που εξετάστηκαν. Η ανάλυση αυτή υποστηρίζει την άποψη ότι η συγκεκριμένη K

2P κανάλια μπορεί να παίζουν ρόλο στη βιολογία του καρκίνου. αλλοιωμένη έκφραση τους μαζί με την ικανότητά τους να επηρεάσουν τη λειτουργία άλλων διαύλων ιόντων και την ευαισθησία τους σε περιβαλλοντικά ερεθίσματα (pO2, pH, γλυκόζη, τέντωμα) καθιστά την κατανόηση του ρόλου αυτά τα κανάλια παίζουν στον καρκίνο καίριας σημασίας.

Παράθεση : Williams S, Bateman Α, O’Kelly Ι (2013) αλλαγμένη έκφραση Δύο Pore τομέα κάλιο (K

2P) Κανάλια στον Καρκίνο. PLoS ONE 8 (10): e74589. doi: 10.1371 /journal.pone.0074589

Επιμέλεια: Sven Γ Meuth, Πανεπιστήμιο του Muenster, Γερμανία

Ελήφθη: 3, Ιουνίου του 2013? Αποδεκτές: 3 Αυγ, 2013? Δημοσιεύθηκε: 7 Οκτωβρίου 2013

Copyright: © 2013 Williams et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Κεφαλαιοποιητικά εργασίας από το Φιλανθρωπικό Ταμείο Gerald Kerkut (https://www.southampton.ac.uk/~gktrust/). Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Παραδοσιακά, η μελέτη των διαύλων ιόντων έχει επικεντρωθεί στην ρόλους τους σε διεγερτικά κύτταρα (νευρωνικές, καρδιακή και εκκριτική), ωστόσο, πιο πρόσφατα, τα κανάλια ιόντων έχουν αναγνωριστεί για τους ρόλους τους στις συμπεριφορές των καρκινικών κυττάρων και την ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου. Στην τελευταία 15 χρόνια αυξανόμενη απόδειξη υποστηρίζει το ρόλο των διαύλων ιόντων σε μιτογένεση, ο έλεγχος του κυτταρικού πολλαπλασιασμού και της απόπτωσης καθώς και η μετανάστευση των κυττάρων και τη μετάσταση [1] – [8]. Η υπερέκφραση κάποιων διαύλων ιόντων έχει συνδεθεί με την κακή πρόγνωση [9], ενώ άλλα κανάλια αναγνωρίζονται τώρα ως πιθανοί βιοδείκτες για συγκεκριμένους τύπους καρκίνου [10], [11]. Οι εκθέσεις αυτές, σε συνδυασμό με τη δυνατότητα στόχευσης λειτουργία καναλιού ιόντων μέσω φαρμακολογικής ρύθμισης, κάνει την κατανόηση του ρόλου των διαύλων ιόντων σε καρκίνο βιολογία καίριας σημασίας.

K

+ κανάλια παίζουν θεμελιώδη ρόλο στην συμπεριφορά των κυττάρων που συνδέονται με την εξέλιξης του καρκίνου, συμπεριλαμβανομένης της ρύθμισης του κυτταρικού πολλαπλασιασμού, η μετανάστευση, την απόπτωση και την αγγειογένεση [2], [12] – [14]. κυτταρικής μεμβράνης δυναμικό (καθοδηγείται από Κ

δραστηριότητα + κανάλι) παίζει σημαντικό ρυθμιστικό ρόλο στην εξέλιξη του κυτταρικού κύκλου και πολλαπλασιασμού, με εξαιρετικά πολλαπλασιαζόμενα κύτταρα εμφανίζουν ένα δυναμικό της μεμβράνης πιο θετική από αδρανή κύτταρα, ενώ μια παροδική υπερπόλωση μεμβράνη επιτρέπει G1 εξέλιξη [15 ] – [18]. Οι ακριβείς ρυθμιστικοί μηχανισμοί είναι ασαφές, αλλά αποδείξεις υποστηρίζει δύο υποθέσεις. Η πρώτη προτείνει ότι οι αλλαγές στο δυναμικό της μεμβράνης λόγω της Κ

δραστηριότητα + κανάλι ρυθμίζει τασεοελεγχόμενων Ca

2 + κανάλια, επηρεάζοντας έτσι Ca

2 + εισροή και κατάντη σηματοδότησης [17], [19]. Η εναλλακτική υπόθεση προτείνει ότι οι αλλαγές στον όγκο των κυττάρων παρατηρήθηκε κατά τη διάρκεια του πολλαπλασιασμού (κυτταρικό οίδημα) και την απόπτωση (συρρίκνωση των κυττάρων) μπορεί να ρυθμιστεί με Κ

+ δραστηριότητα του καναλιού [18], [20], [21]. Κατά παρόμοιο τρόπο, K

+ έλεγχος καναλιού του δυναμικού της μεμβράνης έχει δειχθεί ότι επηρεάζουν την κυτταρική μετανάστευση μέσω της ρύθμισης του κυτταρικού όγκου, το ρΗ και ενδοκυτταρικού Ca

2+ συγκέντρωση. Μια άμεση επίδραση της μεταβολής του δυναμικού της μεμβράνης σε κυτταροσκελετικές πολυμερισμό Έχει επίσης αποδειχθεί [14], [22], [23].

Altered

+ έκφραση διαύλου Κ και /ή λειτουργία λαμβάνει χώρα σε μια σειρά από τύπους καρκίνου, με διαύλους ιόντων από κάθε ένα από τα Κ

οικογένειες + κανάλι (τάση ευαίσθητα (Κ

V)? ασβεστίου ευαίσθητα (Κ

Ca)? εσωτερικής ανόρθωσης (K

ir)? και δύο -pore τομέα (Κ

2P) κανάλια) εμπλέκεται στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου. Εντός του

οικογένεια K V, Κ

V11.1 (hERG) δείχνει τροποποιημένη έκφραση σε μια σειρά από τύπους καρκίνου και έχει δειχθεί να έχει επίδραση κυτταρικό πολλαπλασιασμό (μελάνωμα, καρκίνο του παχέος εντέρου και οισοφάγος Barrett), τη μετανάστευση (μελάνωμα, θυρεοειδούς και του καρκίνου του μαστού), κακοήθη μετασχηματισμό (κεφαλή & amp? καρκίνωμα τραχήλου) και την απόπτωση (γαστρικό καρκίνο). Ενώ K

V11.1 συχνότερα αναφέρεται για το ρόλο της στον καρκίνο, μια σειρά από άλλες K

+ κανάλια έχουν επίσης προταθεί ως μοριακά συστατικά προώθηση της ανάπτυξης και της εξέλιξης [9] του καρκίνου [10], [24, ] – [80] (που συνοψίζονται στον πίνακα 1)

Η

Ο πιθανός ρόλος των Κ

2P κανάλια στον καρκίνο έχει ιδιαίτερο ενδιαφέρον.. Αυτά τα κανάλια συμπεριφορά προς τα έξω K

+ ρεύματα φόντο και δραστηριοποιούνται σε ανάπαυση δυναμικά μεμβράνης, έτσι έχουν μια άμεση επίδραση στη βασική κυτταρική δραστηριότητα των κυττάρων σε ηρεμία, συμπεριλαμβανομένων δυναμικό της μεμβράνης, ομοιόσταση του ασβεστίου και τη ρύθμιση του όγκου των κυττάρων. K

2P κανάλια παρουσιάζουν επίσης ευαισθησία σε φυσιολογικούς διεγέρτες συμπεριλαμβανομένων ρΗ, τάση οξυγόνου, συγκέντρωση γλυκόζης και να τεντώσει? βασικές φυσιολογικές παραμέτρους οι οποίες διασπώνται μέσα στα καρκινικά κύτταρα και το περιβάλλον τους [81] – [83].

Από τα μέλη της οικογένειας 15 θηλαστικών K

2P, τέσσερα K

2P κανάλια (Κ

2P2.1 (TREK-1), Κ

2P3.1 (TASK-1), Κ

2P9.1 (TASK-3) και Κ

2P5.1 (TASK-2)) έχουν ήδη εμπλακεί στον καρκίνο. Το 2003, Mu

et al

. [77] περιγράφεται KCNK9, το γονίδιο που κωδικοποιεί K

2P9.1, ως μια πιθανή πρωτο-ογκογονιδίου όπου γονιδιωματική υπερέκφραση του γονιδίου ανιχνεύθηκε στο 10% των καρκινωμάτων του μαστού και η πρωτεΐνη ανιχνεύθηκε στο 44% των όγκων του μαστού με ανοσοϊστοχημεία αλλά όχι σε φυσιολογικούς ελέγχους ιστό. Το ογκογόνο ικανότητα (μετρούμενη με πολλαπλασιαστικό πλεονέκτημα) αποδείχθηκε ότι εξαρτάται από μια λειτουργική καναλιού [84]. Κ

2P9.1 ανοσοθετικότητα συνέχεια έχει αναφερθεί σε ορθοκολικό καρκίνωμα [78] και δείγματα μελανώματος ιστών [85].

Αυξημένη K

έκφραση 2P2.1 ανιχνεύθηκε σε δείγματα αδενοκαρκίνωμα του προστάτη σε σύγκριση με την κανονική επιθήλιο του προστάτη και μείωσε τον πολλαπλασιασμό των κυτταρικών σειρών καρκίνου του προστάτη παρατηρήθηκε όταν Κ

2P2.1 πειραματικά γκρέμισε [74].

Μια μελέτη από Nogueira

et al

. (2010) [75] που συνδέονται K

2P3.1 έκφραση με την παραγωγή της αλδοστερόνης και στις δύο αδενώματα αλδοστερόνης παραγωγής και της κανονικής επινεφρίδια, και προτείνει K

2P3.1 μπορεί να παίζει ρόλο σε Ca

2+ ρύθμιση σηματοδότησης . Εξίσου, Κ

2P3.1 και Κ

2P9.1 έχουν προηγουμένως αναφερθεί ότι παίζει ένα ρόλο σε Κ

+ -. Εξαρτώμενη απόπτωση σε κύτταρο κόκκου νευρώνες σε καλλιέργεια [86]

ανάλυση μεταγραφικό σε ανθρώπινο πόρο του μαστού επιθηλιακών κυττάρων του όγκου γραμμή, T47D, είτε μετά διέγερση είτε με τον υποδοχέα οιστρογόνων (ER) α που επάγει τον πολλαπλασιασμό ή ΕΚβ που έχει αντιπολλαπλασιαστικά αποτελέσματα έδειξαν ότι η Κ

2P5.1 mRNA ρυθμίζεται αυξητικά από ΕΡα σηματοδότηση [87 ]. mRNA, πρωτεΐνης και λειτουργική έκφραση (οξύ ευαίσθητα προς τα έξω ρεύματα) του Κ

2P5.1 αναφέρθηκε ότι αυξάνεται σε απόκριση προς 17β-οιστραδιόλη διέγερση του ΕΚα σηματοδότησης σε T47D και ανθρώπινη κυτταρική σειρά αδενοκαρκινώματος μαστού, MCF-7. Ενώ πειραματική knockdown του K

2P5.1 μετρίως μειωμένη βασική πολλαπλασιασμό των κυττάρων T47D, παρατηρήθηκε σημαντικά μεγαλύτερη μείωση στον πολλαπλασιασμό των οιστρογόνων που προκαλείται από [76].

Τα στοιχεία από τις μελέτες αυτές υποστηρίζουν την υπόθεση ότι οι μεταβολές η έκφραση ή λειτουργία του K

2P κανάλια σε καρκινικά κύτταρα μπορεί να παίζει ένα ρόλο στην ανάπτυξη και εξέλιξη του καρκίνου. Στόχευση αυτά τα κανάλια μπορεί να οδηγήσει σε νέες θεραπείες του καρκίνου? Ως εκ τούτου, ζήτησε να καθοριστεί η έκφραση μεταγραφή του καθενός από τα K

2P κανάλια σε ένα εύρος καρκίνων χρησιμοποιώντας μια ηλεκτρονική βάση δεδομένων του καρκίνου των μικροσυστοιχιών, Oncomine (www.oncomine.org, βιοεπιστήμες Compendia, Ann Arbor, MI, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής). Αυτό ενημερωτικά έγγραφα αλλαγές στην έκφραση των

2P μέλη της οικογένειας Κ σε μια ποικιλία τύπων καρκίνου και παρέχει μια πολύτιμη πηγή για να επιτρέψει την περαιτέρω έρευνα σχετικά με την έκφραση της πρωτεΐνης και το δυναμικό τους ρόλους αυτών των σημαντικών σταθμών στην εξέλιξη του καρκίνου.

Μέθοδοι

ανάλυση της έκφρασης KCNK mRNA σε δείγματα καρκινικού ιστού (μετα-ανάλυση των γονιδίων KCNK και συναφείς στατιστικές αναλύσεις) διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας την ηλεκτρονική βάση δεδομένων του καρκίνου των μικροσυστοιχιών, Oncomine (www.oncomine.org, Compendia βιοεπιστήμες, Ann Arbor, MI, Ηνωμένες Πολιτείες της Αμερικής). Oncomine συγκεντρώνει δημόσια διαθέσιμα δεδομένα καρκίνο μικροσυστοιχιών και επεξεργάζεται όλα τα δεδομένα που επιβάλλουν τα ίδια κριτήρια [88]. Τα στοιχεία έκφρασης mRNA είναι οργανωμένη σε τύπους καρκίνου που ορίζονται στο πλαίσιο των αρχικών εκδόσεων. στοιχεία έκφρασης mRNA εξήχθη από Oncomine μεταξύ Αυγούστου 2012 και Ιανουαρίου 2013. Οι παραπομπές για όλους τους πρωτογενείς μελέτες που χρησιμοποιούνται μαζί με πληροφορίες για τον τύπο του καρκίνου και στάσης (εφόσον είναι διαθέσιμα) παρέχεται στον Πίνακα S1 στο S1 αρχείου.

Μόνο σύνολα δεδομένων εξέταση έκφραση του mRNA του γονιδίου KCNK σε καρκινικό ιστό που συνδυάζεται με φυσιολογικούς μάρτυρες ιστό (καρκίνος εναντίον κανονική) συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη αυτή. κριτήρια όριο θα έπρεπε να επιτευχθεί με κάθε μελέτη για να συμπεριληφθούν στην ανάλυση. Τα κριτήρια κατωφλίου που χρησιμοποιούνται για τη μελέτη αυτή ήταν μια τιμή p & lt? 0,05, μια πτυχή της αλλαγής & gt? 2 και ένα εκατοστημόριο γονίδιο rank & lt? 10%. P-τιμές που παρουσιάζονται σε αυτή τη μελέτη για διαφορική ανάλυση της έκφρασης των γονιδίων KCNK ήταν να υπολογίσει με Oncomine χρησιμοποιώντας t-test και πολλαπλές δοκιμές διόρθωση μιας διπλής όψης του Student [86], [87]. Πολλαπλές διόρθωση δοκιμές πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας τη μέθοδο ποσοστό εσφαλμένης ανακάλυψη, όπου διορθώνονται ρ-τιμές (τιμές Q) υπολογίστηκαν ως Q = NP /R (όπου Ρ = p-value, Ν = συνολικός αριθμός των γονιδίων και το R είναι η ταξινομημένη τάξη του p-value) [88], [89]. Σε αυτή τη μελέτη η p-τιμή μικρότερη από 0.05 θεωρήθηκε σημαντική. Fold αλλαγή ορίζεται ως η γραμμική αλλαγή στο mRNA για το γονίδιο ενδιαφέροντος σε καρκινικό ιστό σε σύγκριση με το φυσιολογικό επίπεδο έκφρασης για αυτόν τον ιστό, σε αυτή την περίπτωση μια φορές μεταβολής 2 και μεγαλύτερη συμπεριλήφθηκε για ανάλυση. Για κάθε σύνολο δεδομένων τα γονίδια που μελετήθηκαν ανάλογα με p-αξία τους. Η εκατοστημόριο γονίδιο κατάταξη είναι το ποσοστό κατάταξη του γονιδίου ενδιαφέροντος σε σύγκριση με όλα τα άλλα γονίδια που αναλύονται σε αυτό το σύνολο δεδομένων βασίζεται σε ρ-τιμές. Ο μέσος αριθμός των γονιδίων που εξετάστηκαν στα δεδομένα μικροσυστοιχίας που παρουσιάζονται σε αυτή τη μελέτη ήταν περίπου 14.000 γονίδια. συμπεριλήφθηκαν Σύνολα δεδομένων στα οποία το γονίδιο που μας ενδιαφέρει ήταν στο 10% των γονιδίων αλλάξει. Αυτές οι τιμές κατωφλίου που συνδέονται με την Boolean AND, ως εκ τούτου, η ανάλυση είχε χαρακτηριστεί μόνο ως ανωτέρω όριο, όταν πληρούνται και τα τρία κριτήρια.

Αρχικά γονίδια KCNK (KCNK1-18) εξετάστηκαν σε ένα ευρύ φάσμα των 20 τύπων καρκίνου, τα οποία έχουν ταξινομηθεί από τον ιστό προέλευσής τους (Πίνακας S2 στο αρχείο S1), συγκρίνοντας την έκφραση mRNA σε αυτόν τον τύπο καρκίνου σε φυσιολογικούς μάρτυρες ιστό. Gene περίληψη θέα σε Oncomine χρησιμοποιήθηκε κατά τη διάρκεια αυτής της ανάλυσης και παρουσιάζονται εδώ με την έκφραση κατάταξη υποδεικνύεται από το χρώμα σκίασης. Έκφραση χρωματισμός για ένα γονίδιο σε ένα συγκεκριμένο καρκίνο σχετίζεται με τις εκατοστημόριο γονίδιο κατάταξη για την υψηλότερη κατάταξη ανωτέρω ανάλυση κατωφλίου.

Περαιτέρω ανάλυση πραγματοποιήθηκε σε κάθε γονίδιο KCNK, για έκφραση σε πιο διαδεδομένες μορφές καρκίνου με βάση την GLOBACON 2008 ΠΟΥ βαθμολογίες (https://globocan.iarc.fr/) [90]. Λέμφωμα, μυέλωμα, σάρκωμα, το ήπαρ και τους καρκίνους των ωοθηκών απομακρύνθηκαν από περαιτέρω ανάλυση λόγω της χαμηλής έκφρασης KCNK. Ο υπότυπος ‘άλλους καρκίνους », η οποία ορίζεται ως καρκίνοι που δεν εμπίπτουν στις προβλέπονται υποτύπους (π.χ. της μήτρας και των επινεφριδίων καρκίνους) ήταν επίσης αφαιρεθεί από περαιτέρω ανάλυση, καθώς η μεγάλη ποικιλία των υποτύπων καρκίνου σε αυτήν την ομάδα θα κάνουν λεπτομερή ανάλυση uninformative. Χρησιμοποιώντας τα κριτήρια κατώφλι περιγράφηκε προηγουμένως όλα τα παραπάνω όριο αναλύσεις για κάθε γονίδιο KCNK εξήχθη από Oncomine και τηρούνται.

Αφού όλα τα παραπάνω στοιχεία όριο για κάθε γονίδιο KCNK είχαν τηρηθεί, συγκριτική μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκε σε υπότυπο του καρκίνου με περισσότερα από πέντε σύνολα δεδομένων (n≥5) διαθέσιμα, η ανάλυση αυτή παρέχεται ένα μεσαίο γονίδιο βαθμό και διάμεση τιμή p για το συγκεκριμένο υπότυπο του καρκίνου.

Αποτελέσματα και Συζήτηση

KCNK γονίδια δείχνουν αλλοιωμένη έκφραση σε διαφορετικούς καρκίνους

γονίδια KCNK 1-18 (με την παράλειψη της KCNK8, KCNK14 και KCNK11 που αποδόθηκαν πρωτεΐνες, αλλά στη συνέχεια αποσύρθηκε λόγω ονοματολογία επικάλυψη) κωδικοποιούν την οικογένεια θηλαστικών της Κ

2P κανάλια [91]. Αρχικά να αποκτήσει μια σφαιρική άποψη των αλλαγών στην Κ

έκφραση κανάλι 2P στον καρκίνο, χρησιμοποιήσαμε το Oncomine βάση δεδομένων του καρκίνου μικροσυστοιχιών να αναλύσει τις αλλαγές που παρατηρούνται στην έκφραση του mRNA του γονιδίου KCNK στα 20 πιο συχνά διαγιγνώσκονται καρκίνοι, ομαδοποιούνται από τον ιστό προέλευσής τους , σε σύγκριση με κανονικά συγκριτικά του ιστού. Για να συμπεριληφθούν στην ανάλυση, οι αλλαγές στην έκφραση γονιδίων σε σύγκριση με φυσιολογικούς μάρτυρες έπρεπε να πληρούν τα κριτήρια κατώφλι της επίτευξης τιμή p & lt? 0,05, μια πτυχή της αλλαγής & gt? 2 και ένα γονίδιο κατάταξη εκατοστημόριο & lt? 10%. Οι τιμές εκατοστημορίου γονίδιο κατάταξη για κάθε ένα από τα 15 γονίδια KCNK σε καρκίνους σε σύγκριση με κανονικά συγκριτικά του ιστού εξετάστηκαν και ο εκατοστημόριο των υψηλότερων αναλύσεων κατάταξη παρουσιάζονται για κάθε γονίδιο KCNK και κάθε τύπο καρκινικού ιστού στο Σχήμα 1. Εκτέλεση ανάλυση με αυτόν τον τρόπο επέτρεψε σύγκριση των μεταβολών στη γονιδιακή έκφραση που πρέπει να εκτελεστούν μεταξύ των διαφόρων πειραμάτων μικροσυστοιχιών και αποκάλυψε ότι όλα τα γονίδια KCNK με την εξαίρεση του KCNK4 (K

2P4.1 ή TRAAK), KCNK16 (K

2P16.1 ή TALK1) και KCNK18 (Κ

2P18.1 ή TRESK) δείχνουν τροποποιημένη έκφραση στους 20 τύπους καρκίνου που εξετάστηκαν σε σύγκριση με φυσιολογικούς ελέγχους ιστού (Σχήμα 1Α & amp? Β). Καρκίνοι από δεκατέσσερα τύπους ιστών έδειξε υπερ-έκφραση περισσοτέρων του ενός KCNK γονίδιο (Σχήμα 1Α) με τύπους πέντε καρκινικού ιστού (του μαστού, των νεφρών, της λευχαιμίας, του πνεύμονα, λέμφωμα) δείχνοντας υπερέκφραση των τριών ή περισσοτέρων γονιδίων KCNK (Σχήμα 1Α). Ενώ οι τύποι ιστών ευρεία καρκίνου που εξετάζονται στην παρούσα αρχική ανάλυση και περιλαμβάνουν μια σειρά από διαφορετικές ασθένειες καρκίνου, παρέχουν πολύτιμες προκαταρκτικές πληροφορίες σχετικά με την έκφραση των γονιδίων KCNK στον καρκίνο και περαιτέρω ανάλυση, λαμβάνοντας υπόψη τις ειδικές υποτύπους του καρκίνου (π.χ. οξεία έναντι χρόνιας λευχαιμίας) ήταν πραγματοποιήθηκε για συγκεκριμένα κανάλια σε επόμενες αναλύσεις.

Η έκφραση των γονιδίων KCNK (KCNK1-18) σε 20 καρκίνους σε σύγκριση με φυσιολογικούς μάρτυρες ιστό. Ορατή είναι τα ονόματα των γονιδίων και πρωτεϊνών για κάθε κανάλι. Α) υπερέκφραση των γονιδίων KCNK. Β) υποέκφραση των γονιδίων KCNK. Οι τύποι του καρκίνου που οργανώθηκε από ιστό προέλευσής τους, ο βαθμός του χρώματος συσχετίζεται με τις εκατοστημόριο γονίδιο βαθμό από τις υψηλότερες αναλύσεις κατάταξη. κριτήρια ήταν για σύνολα δεδομένων mRNA και του καρκίνου εναντίον μόνο κανονική ανάλυση, με τις οριακές τιμές του p-value & lt? 0,05, διπλώστε την αλλαγή & gt? 2 και το γονίδιο κατάταξη εκατοστημόριο & lt?. 10%

Η

Κατά την εξέταση υποέκφραση γονιδίων KCNK, καρκίνος από 19 από τους τύπους 20 ιστών που αναλύθηκαν έδειξαν μειωμένη έκφραση ενός ή περισσοτέρων γονιδίων KCNK σε σύγκριση με την κανονική έκφραση ιστού (Εικόνα 1 Β). Έξι K

2P μέλη της οικογένειας (KCNK1, KCNK2, KCNK3, KCNK5, KCNK7 και KCNK10) δείχνουν υποέκφραση σε πάνω από 5 διαφορετικούς τύπους καρκίνου ιστό (Εικόνα 1Β). Ενώ 10 διαφορετικούς τύπους καρκίνου των ιστών (εγκέφαλος, του μαστού, του παχέος εντέρου, του γαστρεντερικού, κεφαλής και λαιμού, νεφρού, πνεύμονα, μελανώματος, του προστάτη και σάρκωμα) δείχνουν υποέκφραση τουλάχιστον τρία γονίδια KCNK (Σχήμα 1Β). Εντυπωσιακά, ειδικές K

2P κανάλια εμφανίζουν αυξημένη έκφραση του mRNA σε ορισμένους καρκινικούς ιστούς, ενώ μειωμένη έκφραση σε άλλες. Αυτό είναι ιδιαίτερα εμφανές για KCNK1, KCNK3, KCNK5 και KCNK6, η οποία εμφανίζεται αλλαγές έκφρασης του mRNA (είτε προς τα πάνω ή προς τα κάτω σε διακριτές καρκίνων) που τους κατατάσσουν στην κορυφή του 1% των γονιδίων που δείχνει αλλοιωμένη έκφραση για αυτές τις μορφές καρκίνου. KCNK1, για παράδειγμα, είναι στην κορυφή του 1% των γονιδίων που δείχνει υπερέκφραση σε ουροδόχου κύστης, του τραχήλου της μήτρας, του πνεύμονα και του παγκρέατος, ενώ σε καρκίνους του κεντρικού νευρικού συστήματος KCNK1 δείχνει μία από τις υψηλότερες μειώσεις στην έκφραση όταν συγκρίθηκαν με φυσιολογικούς ελέγχους ιστού (πίνακας 2). Αυτές οι αναλύσεις δείχνουν ότι ο αντίκτυπος της ρύθμισης προς τα κάτω της Κ

2P κανάλια για τη λειτουργία των κυττάρων μπορεί να είναι εξίσου σημαντική μεταβολή, όπως αυξημένη έκφραση στη βιολογία του καρκίνου.

Η

έκφραση KCNK σε συγκεκριμένους τύπους καρκίνου

Τα 15 μέλη του

οικογένειας κανάλι 2P Κ διαιρείται σε 6 ξεχωριστές ομάδες με βάση την ομολογία αλληλουχίας τους και τον καθορισμό των βιοφυσικών χαρακτηριστικών. Η έκφραση του κάθε γονιδίου σε κάθε ένα από τους τύπους 14 καρκινικού ιστού (6 ιστοί αποκλείστηκαν από την ανάλυση αυτή λόγω χαμηλού αριθμού σύνολο δεδομένων ή υψηλή καρκίνος ποικιλομορφία υπότυπος) μελετήθηκε λεπτομερώς χρησιμοποιώντας τις τιμές κατωφλίου ανάλυση όπως και πριν (τιμή-ρ & lt? 0,05, φορές αλλαγή & gt? 2 και το γονίδιο κατάταξη εκατοστημόριο & lt? 10%) και τα αποτελέσματα παρουσιάζονται για κάθε ομάδα καναλιών (πίνακες 2, 3, 4, 5, 6 & amp? πίνακα S3 στο S1 αρχείου). Τα δεδομένα από τη συγκριτική μετα-ανάλυση πραγματοποιήθηκε για ειδικά γονίδια KCNK στον καρκίνο υπο-τύπους στους οποίους ένας επαρκής αριθμός μελετών microarray (n≥5) εξετάζοντας αυτά τα γονίδια είχαν διαθέσιμο παρουσιάζονται στους πίνακες 2, 3, 4, 5, 6 και διεξήχθη χρησιμοποιώντας όλα τα σύνολα δεδομένων στα οποία εξετάστηκε και όχι το γονίδιο ενδιαφέροντος μόνο για εκείνες που κατατάσσονται πάνω από τις τιμές κατωφλίου. Μετα-ανάλυση που παρέχει το μέσο γονίδιο βαθμό και διάμεση τιμή-p, επιτρέποντας έτσι τη σύγκριση μεταξύ διαφορετικών μελετών μικροσυστοιχιών. Αν η μέση κατάταξη ανάλυση είχε σημαντική p-value ανέφερε ότι η τάση έκφρασης αυτού του γονιδίου ήταν πιθανό να μεταβληθεί σε αυτό το υπότυπο του καρκίνου. Αν είναι μικρότερη από 5 ανεξάρτητες μελέτες για οποιοδήποτε από τα γονίδια σε ένα συγκεκριμένο υπότυπο του καρκίνου δεν ήταν διαθέσιμα για Oncomine, μετα-ανάλυση των στοιχείων που έφθασε το όριο δεν εκτελέστηκε, αλλά αντ ‘αυτού έχουν συγκεντρωθεί και παρουσιάζονται στον Πίνακα S3 στο S1 αρχείου.

Η

τομέα Δύο πόρων αδύναμο εσωτερικό διόρθωση K

+ (Twik) οικογενειακό κανάλι

Twik κανάλια περιλαμβάνουν KCNK1 (Κ

2P1.1, TWIK1), KCNK6 (Κ

2P6.1, TWIK2) και KCNK7 (Κ

2P7.1). Κανένα από αυτά τα κανάλια έχουν ήδη εμπλακεί σε παίζει ρόλο στον καρκίνο, αλλά η ανάλυση που παρουσιάζεται εδώ αποκαλύπτει μια σημαντική υπερέκφραση του KCNK1 στην πλειονότητα των καρκίνων που αναλύθηκαν (12 από 20 καρκίνου τύπων ιστού δείχνουν υπερέκφραση με KCNK1 κατατάσσεται στο top 10% των πλέον μεταβληθεί γονίδια) ενώ οι τύποι 6 καρκινικού ιστού έδειξε KCNK1 υποέκφραση σε σύγκριση με φυσιολογικό ιστό (Εικόνα 1). KCNK6 βρέθηκε να είναι μεταξύ των κορυφαίων 1% των γονιδίων υπερεκφράζεται σε καρκίνο του μαστού και την κορυφή του 1% των γονιδίων υποεκφράζεται σε καρκίνο του παχέος εντέρου. Ενώ KCNK7 απέτυχε να δείξει υπερέκφραση σε οποιαδήποτε από τις καρκίνο τύπων που εξετάστηκαν, έδειξαν σημαντικές υποέκφραση σε ένα εύρος καρκίνων και ήταν στην κορυφή του 1% των υποεκφράζεται γονιδίων τόσο μελανώματος και του τραχήλου της μήτρας (Σχήμα 1).

Καρκίνος οι υπότυποι στην οποία KCNK1 έδειξε ανωτέρω μεταβολές όριο στην έκφραση που παρουσιάζονται στον πίνακα 2 (εάν επαρκής μελέτες ήταν διαθέσιμοι για μετα-ανάλυση (n≥5)) ή Πίνακας S3 σε S1 File (αν ανεπαρκής αριθμός μελετών ήταν διαθέσιμοι για μετα-ανάλυση ( n≤4)). Όλα καρκίνος υπο-τύπους με KCNK1 υπερέκφραση επιλέξιμα για μετα-ανάλυση βρέθηκε ότι παρουσιάζουν σημαντικά επίπεδα υπερέκφρασης (μέση π-value≤0.05? Πίνακας 2). Lung αδενοκαρκινώματα είχε την πιο σημαντική αύξηση στην έκφραση σε σύγκριση με φυσιολογικό ιστό, με 3,22 ± 0,64 εννοώ φορές αύξηση από τις 4 μελέτες που έφθασε όριο για την ένταξη και διάμεση τιμή ρ 8.51E-13 (η = 7? Πίνακας 2) . Ενώ, παγκρεατικά αδενοκαρκινώματα εμφάνισαν την υψηλότερη μέση τιμή (± SEM) φορές αύξηση (4,80 ± 0,79) σε KCNK1 μεταγραφή σε σύγκριση με τους φυσιολογικούς ελέγχους στις 5 μελέτες παραπάνω κριτήρια όριο.

καρκίνους του εγκεφάλου των νευρογλοιακών κυττάρων προέλευσης (αστροκύτωμα, γλοιοβλάστωμα, oligodendrioglioma), μυελοβλάστωμα και μελανώματα έδειξαν όλα σημαντική προς τα κάτω ρύθμιση των KCNK1 σε σχέση με φυσιολογικούς ιστούς ελέγχου (Πίνακας S3 σε S1 File). Όλα όμως γλοιοβλάστωμα είχαν επαρκώς υψηλό αριθμό ανεξάρτητων αναλύσεων για να ενεργοποιήσετε ένταξη στην συγκριτική μετα-ανάλυση (Πίνακας S3 στο S1 File), ενώ στο γλοιοβλάστωμα 4 ανωτέρω όριο αναλύσεις έδειξαν υποέκφραση που κυμαίνονται από 8 έως 20 φορές μειώσεις στην έκφραση μεταγραφή KCNK1 ενώ μια μελέτη έδειξε ένα 3 φορές αύξηση του KCNK1 mRNA (Πίνακας 2). Συγκριτική μετα-ανάλυση όλων των 8 μελετών στις οποίες εξετάστηκε η έκφραση μεταγράφου KCNK1 αποκάλυψε μια συνολική σημαντική (ρ = 5.14E-6) μειωμένη έκφραση KCNK1 σε γλοιοβλάστωμα (Πίνακας 2). KCNK1 δεν είναι το μόνο γονίδιο για να δείξει προφανώς αντικρουόμενες προφίλ έκφρασης, αλλά αυτό μπορεί να οφείλεται στις ευρείες ομάδες σε κάθε ένα από τους τύπους καρκίνου. Σημαντικά αυτό παρατηρείται επίσης για KCNK10 στο γλοιοβλάστωμα του εγκεφάλου (Πίνακας 3)

Ενώ KCNK6 δείχνει υπερέκφραση τόσο του πόρου (μέση μεταβολή φορές 2,46? N = 2). Και επεμβατικές (πάσο μεταβολή 3,57 (n = 1)) καρκίνο του μαστού, συνολικά, KCNK6 και KCNK7 δείχνουν περισσότερο υποέκφραση μεταγραφής (Πίνακας 2). Αν και, μετα-ανάλυση της έκφρασης KCNK6 σε πορογενές καρκίνο του μαστού βρέθηκε την αυξημένη έκφραση δεν πρέπει να φθάσει σημασία (ρ = 0.076? N = 10). Τόσο KCNK6 και KCNK7 δείχνουν υποέκφραση στο μελάνωμα και του οισοφάγου αδενοκαρκινώματα. KCNK6 έδειξε σημαντική μειωμένη έκφραση σε ορθοκολικό αδενοκαρκίνωμα (διάμεση τιμή ρ = 0,028? N = 11) με μια μέση τιμή (± SEM) φορές μειωμένη έκφραση του 2.11 ± 0.02 στην 3 παραπάνω αναλύσεις όριο για υποέκφραση. KCNK7 υποεκφράζονται σε οισοφάγο Barrett σε σύγκριση με φυσιολογικούς μάρτυρες ιστό αλλά ανεπαρκή αριθμό των μελετών ήταν διαθέσιμα για να καταστεί δυνατή η περαιτέρω ανάλυση (Πίνακας S3 στο S1 αρχείου). KCNK7 έδειξαν σημαντική ρύθμιση προς τα κάτω σε καρκίνωμα του τραχήλου της μήτρας πλακωδών κυττάρων (διάμεση τιμή ρ 7.99E-04? Η = 5) με μέση (± SEM) φορές μειωμένη έκφραση 4,37 ± 1,19. Μια μειωμένη έκφραση KCNK7 παρατηρούνται στο γαστρεντερικό αδενοκαρκινώματα απέτυχε να δείξει τη σημασία παρακάτω μετα-ανάλυση (διάμεση τιμή ρ 0,446, η = 5) και πέτυχε μια διάμεση γονίδιο βαθμό του 9583 από περίπου 14.000 γονίδια που υποδηλώνει ότι μεταβολές στην έκφραση KCNK7 είναι λιγότερο σημαντικές στο γαστρεντερικό αδενοκαρκινώματα.

Twik που σχετίζονται με Κ

+ (TREK) οικογενειακό κανάλι

Η οικογένεια TREK έχει 3 μέλη της οικογένειας KCNK2 (Κ

2P2.1, TREK1), KCNK4 (Κ

2P4.1, TRAAK) και KCNK10 (Κ

2P10.1, TREK2). KCNK4 απέτυχε να δείξει αλλοιωμένη έκφραση πάνω από τα σετ όρια στις 20 καρκίνους που εξετάστηκαν και, ως εκ τούτου, δεν αναλύθηκε περαιτέρω.

KCNK2 ήταν μεταξύ των κορυφαίων 5% των γονιδίων πάνω εκφράζεται σε καρκίνους του πνεύμονα και κάτω από εκφράζονται σε μαστού, του γαστρεντερικού και κεφαλής και τραχήλου (Εικόνα 1). KCNK10 ήταν μεταξύ των κορυφαίων του 1% των γονιδίων υποεκφράζονται (σε ​​σύγκριση με φυσιολογικούς μάρτυρες ιστού) σε καρκίνους του παχέος εντέρου και των νεφρών, ενώ σε καρκίνους του μαστού και του εγκεφάλου KCNK10 ήταν μεταξύ των κορυφαίων 5% των γονιδίων υποεκφράζονται (Εικόνα 1Α & amp? Β). Όπως φαίνεται με KCNK1 σε γλοιοβλάστωμα, δύο από τα παραπάνω ορίου αναλύσεις δείχνουν μειωμένη έκφραση KCNK10 (σε σύγκριση με κανονικά συγκριτικά του ιστού) που κυμαίνεται από 2,9 έως 4,8 φορές μειώνεται, ενώ μια τρίτη ανάλυση δείχνει μία 2,5 φορές αύξηση στην έκφραση KCNK10. Η μετα-ανάλυση, συμπεριλαμβανομένων όλων των μελετών στις οποίες η έκφραση KCNK10 εξετάστηκε σε καρκίνο γλοιοβλαστώματος αποκάλυψε μια σημαντική μειωμένη έκφραση (μέση τιμή ρ = 5.03E-05? Η = 5), αλλά ενώ οι σαφείς μεταβολές στα επίπεδα έκφρασης παρατηρήθηκαν σε KCNK10 γλοιοβλάστωμα περαιτέρω μελέτες και ανάλυσης που απαιτούνται για να προσδιοριστεί η φύση αυτών των αλλαγών. KCNK10 επίσης κατατάσσονται στην κορυφή 10% των υπερ-εκφρασμένων γονιδίων σε οξεία μυελογενή λευχαιμία (Σχήμα 1Α & amp? Πίνακας S3 σε S1 αρχείου? N = 4), αλλά ανεπαρκής μελέτες ήταν διαθέσιμη για να ενεργοποιήσετε ισχυρή μετα-ανάλυση που πρέπει να εκτελεστούν για να προσδιοριστεί η σημασία αυτής της αλλαγής. KCNK10 δείχνει μειωμένη έκφραση σε πορογενές μαστού και λοβιακά καρκινώματα και ορθοκολικού αδενώματος, αδενοκαρκίνωμα και καρκίνωμα καθώς και των νεφρών σαφές καρκίνωμα (Πίνακας 3 & amp? Πίνακας S3 σε File S1). Μόνο πορογενές καρκίνωμα μαστού και ορθοκολικό αδενοκαρκίνωμα είχε επαρκή αριθμό μελετών για να ενεργοποιήσετε μετα-ανάλυση (Πίνακας 3). Αυτή η ανάλυση αποκάλυψε τις αλλαγές στο πορογενές καρκίνωμα του μαστού δεν είναι σημαντική (διάμεση τιμή ρ = 0,15? N = 5), ενώ ορθοκολικό αδενοκαρκίνωμα έδειξαν σημαντική μειωμένη έκφραση του KCNK10 (διάμεση τιμή ρ = 8.12E-07? N = 14)

KCNK2 έδειξαν μειωμένη έκφραση σε διηθητικό καρκίνο του μαστού, του γαστρεντερικού αδενοκαρκινώματος και κεφαλής και λαιμού καρκίνωμα από πλακώδες επιθήλιο αλλά αυτές οι μελέτες απέτυχαν είτε να συμπεριληφθεί στο μετα-ανάλυση λόγω αριθμούς χαμηλής μελέτη ή απέτυχε να δείξει τη σημασία εξής μετα-ανάλυση ( Πίνακας 3 & amp?.. πίνακα S3 στο S1 αρχείου)

Αυτά τα δεδομένα, ενώ περιορίζεται από το μέγεθος του δείγματος παρέχουν επαρκή στοιχεία που να δικαιολογούν την περαιτέρω έρευνα σχετικά με το ρόλο των KCNK10 τόσο γλοιοβλάστωμα και του παχέος αδενοκαρκίνωμα

Twik που σχετίζονται με οξύ ευαίσθητα Κ

+ (TASK) οικογενειακό κανάλι

Η οικογένεια TASK έχει τρία μέλη KCNK3 (Κ

2P3.1, TASK1), KCNK9 (Κ

2P9.1, TASK3) και KCNK15 (Κ

2P15.1, TASK5).

KCNK3 έδειξε αλλαγμένη έκφραση στην πλειοψηφία των καρκίνων που εξετάστηκαν (13 από 20) και ήταν στην κορυφή του 1% μέχρι ρυθμιζόμενα γονίδια στον καρκίνο του νεφρού και την κορυφή 5% μέχρι ρυθμιζόμενα γονίδια στο στήθος, λευχαιμία και λέμφωμα (Σχήμα 1Α). KCNK3 ήταν στην κορυφή του 1% των υπό-εκφρασμένων γονιδίων σε σάρκωμα, του μαστού, του πνεύμονα και του παγκρέατος. KCNK3 ήταν επίσης στο top 5% των γονιδίων υπό-εκφρασμένο σε καρκίνους του ΚΝΣ, της ουροδόχου κύστης, του παχέος εντέρου και του προστάτη (Σχήμα 1Β). Λεπτομερής μετα-ανάλυση των υποτύπων καρκίνου με μειωμένη έκφραση KCNK3 αποκάλυψε υποέκφραση να είναι σημαντική σε παγκρεατικό αδενοκαρκίνωμα (διάμεση τιμή ρ = 2.46E-07? N = 7), αδενοκαρκίνωμα πνεύμονα (διάμεση τιμή ρ = 4.33E-11? N = 6), ορθοκολικού αδενώματος (διάμεση τιμή ρ = 2.37E-04? η = 5) και γλοιοβλαστώματος (διάμεση τιμή ρ = 0,007? η = 7? Πίνακας 4). Lung πλακώδες καρκίνωμα έδειξαν τόσο το υψηλότερο επίπεδο σημαντικότητας παρακάτω μετα-ανάλυση 5 μελετών στις οποίες εξετάστηκε η έκφραση του γονιδίου KCNK3 (διάμεση τιμή ρ = 5.90E-20) και το υψηλότερο μέση ελάττωση φορές σε έκφραση KCNK3 από τις 4 μελέτες που επιτεύχθηκε κατωφλίου (6,98 ± 2,30? Πίνακας 4).

Ανάλυση της έκφρασης μεταγράφου KCNK3 σε ειδικούς καρκίνους εντός των γενικών τύπων καρκίνου δείχνει σημαντική αύξηση στην έκφραση KCNK3 σε επεμβατικές μαστού (διάμεση τιμή-ρ = 0.005) και σαφής νεφρικό κύτταρο (διάμεση τιμή ρ = 1.14E-04) καρκίνους με 4,5 έως 8,4 φορές αύξηση στην έκφραση σε σαφή κύτταρο νεφρού καρκινωμάτων σε σύγκριση με φυσιολογικούς ελέγχους ιστού (Πίνακας 4).

Ενώ K

2P9. 1 έχει προηγουμένως ταυτοποιηθεί σε μαστού, του παχέος εντέρου και μελάνωμα καρκίνων [78], [82], [83], KCNK9 έδειξε μόνο ένα άνω όριο για την ανάλυση διηθητικά καρκινώματα μαστού (τιμή-ρ = 1.16E-12? Πίνακας 4). Όταν συγκριτική μετα-ανάλυση διεξήχθη με 14 αναλύει την εξέταση KCNK9 σε διηθητικά καρκινώματα μαστού, οι αλλαγές που έγιναν διαπιστώθηκε ότι δεν ήταν σημαντική (διάμεση τιμή p-value = 0,459).

KCNK15 δείχνει σημαντική υπερέκφραση, από τη συγκριτική ανάλυση, πορογενές καρκίνωμα μαστού (διάμεση τιμή ρ = 0,008? 5,37 ± 1,88 εννοώ φορές αύξηση σε 3 παραπάνω αναλύσεις κατωφλίου) και υποέκφραση στη γαστρεντερική αδενοκαρκινώματα (διάμεση τιμή ρ = 0,043? Πίνακας 4).

Twik σχετίζονται αλκαλική pH ενεργοποιηθεί K

+ (TALK) της οικογένειας κανάλι

Η οικογένεια TALK έχει τρία μέλη της οικογένειας KCNK5 (Κ

2P5.1, TASK2), KCNK16 (Κ

2P16.1, TALK1) και KCNK17 (Κ

2P17.1, TALK2). KCNK16 απέτυχε να δείξει αλλοιωμένη έκφραση πάνω από τα σετ όρια στις 20 καρκινώματα που εξετάστηκαν αρχικά και, ως εκ τούτου, δεν αναλύθηκε περαιτέρω.

KCNK5 έδειξε αλλοιωμένη έκφραση στο 50% των καρκίνων που εξετάστηκαν. Ήταν στην κορυφή του 1% έως ρυθμιζόμενα γονίδια σε οισοφάγου καρκίνων και άνω 5% μέχρι ρυθμιζόμενα γονίδια σε καρκίνους του μαστού και του πνεύμονα (Σχήμα 1Α). Μειωμένη έκφραση KCNK5 παρατηρήθηκε σε ένα ευρύτερο φάσμα των υποτύπων καρκίνου με KCNK5 στην κορυφή του 1% των υπό-εκφρασμένων γονιδίων σε μελάνωμα και την κορυφή 5% των υπό-εκφρασμένων γονιδίων στο μαστό, ορθοκολικό, του νεφρού, λευχαιμία, καρκίνους ήπατος και σάρκωμα ( Εικόνα 1Β). Αν και δεν είναι όλα τους υποτύπους του καρκίνου η οποία κατέδειξε αλλαγές στην έκφραση του KCNK5 είχε επαρκή αριθμό μελετών για συγκριτική ανάλυση (Πίνακας S3 σε File S1), μετα-ανάλυση των μελετών ορθοκολικού αδενοκαρκινώματος έδειξε σημαντική μείωση στην έκφραση KCNK5 (διάμεση τιμή ρ = 2.35E -07? n = 11? Πίνακας 5) με μία μέση φορές μείωση του 2,96 ± 0,23 (η = 4). απαιτούνται περαιτέρω μελέτες για να καθοριστεί εάν η ρύθμιση προς τα κάτω των KCNK5 παρατηρούνται και σε άλλες υποκατηγορίες καρκίνου είναι επίσης σημαντική.

Μια ενιαία μελέτη έφτασε τα κριτήρια όριο και παρουσίασαν 3,26 φορές αύξηση στην έκφραση KCNK17 σε διηθητικά καρκινώματα μαστού (Πίνακας 5). Ωστόσο, όταν η συγκριτική μετα-ανάλυση έγινε με όλες τις αναλύσεις εξέταση KCNK17 σε διηθητικά καρκινώματα μαστού (n = 12), διαπιστώθηκε ότι δεν είναι σημαντική (διάμεση τιμή p = 0,752), γεγονός που υποδηλώνει τη μελέτη η οποία έφθασε το όριο μπορεί να μην είναι αντιπροσωπευτικό της έκφρασης KCNK17 στον καρκίνο του μαστού.

δύο αλοθάνιο τομέα πόρων αναστέλλεται Κ

+ (thik) οικογενειακό κανάλι

Η οικογένεια thik έχει δύο μέλη της οικογένειας KCNK12 (Κ

2P12.1, THIK1) . και KCNK13 (Κ

2P13.1, THIK2)

KCNK12 έδειξε αλλαγμένη έκφραση συγκριτικά με φυσιολογικούς ελέγχους ιστό σε 7 από τα 20 τύπων καρκίνου εξετάστηκαν τόσο με υπερέκφραση και υποέκφραση παρατηρήθηκε (Σχήμα 1 & amp? Πίνακας S3 στο S1 αρχείου). Πάνω μειώσεις παρατηρήθηκαν όριο στην έκφραση KCNK12 σε αστροκύτωμα και το γλοιοβλάστωμα, ενώ αυξημένη έκφραση παρατηρήθηκε σε οξεία λεμφοκυτταρική λευχαιμία και αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα, αλλά ανεπαρκή μεγέθη δείγματος για οποιαδήποτε από αυτές τις υποτύπους του καρκίνου εμποδίζεται κάθε συγκριτική μετα-ανάλυση των KCNK12 που πρέπει να εκτελεστούν.