Αφηρημένο

Ιστορικό και στόχος

καρκίνος του οισοφάγου είναι μία από τις πιο κοινές και θανατηφόρες των καρκίνων σε όλο τον κόσμο. Η μελέτη μας προηγούμενης βασισμένη στον πληθυσμό ανέφεραν υψηλό επιπολασμό του καρκίνου του οισοφάγου σε Chaoshan, επαρχία Γκουανγκντόνγκ, την Κίνα. Πρόγονοι του πληθυσμού Chaoshan μετανάστευσε από την περιοχή Taihang βουνό της βόρειο-κεντρική Κίνα, η οποία είναι μια άλλη περιοχή υψηλής συχνότητας για τον καρκίνο του οισοφάγου. Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν να αποκτήσει αποδείξεις κληρονομήσει την ευαισθησία στον καρκίνο του οισοφάγου στον πληθυσμό Chaoshan, σε σχέση με τον πληθυσμό Taihang βουνό, με τελικό στόχο των μοριακή ταυτοποίηση των γονιδίων της νόσου.

Μέθοδοι

Διενεργήσαμε τον οικογενή συσχέτιση, συνεύρεση και πολύπλοκο διαχωρισμό αναλύσεις 224 οικογένειες από τον πληθυσμό Chaoshan και 403 οικογένειες από τον πληθυσμό Taihang χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα FPMM της SAGE έκδοση 5.3.0. Μια δεύτερη ανάλυση επικεντρώθηκε σε συγκεκριμένες οικογένειες που έχουν μεγάλο αριθμό των προσβεβλημένων ατόμων ή πρώιμη έναρξη της νόσου.

Αποτελέσματα

Για το γενικό πληθυσμό, μέτρια συσχέτιση αδελφών αδελφών είχε παρατηρήσει για τον καρκίνο του οισοφάγου. Επιπλέον, ο αδελφός αδελφός συσχετισμός ήταν ακόμη υψηλότερο. Συνεύρεση αναλύσεις έδειξαν ότι ένα τριών συστατικών μοντέλο διανομής καλύτερο λογαριασμούς για τη διακύμανση της ηλικίας της εμφάνισης του καρκίνου του οισοφάγου, και ότι ένα πολυπαραγοντικό μοντέλο παρέχει την καλύτερη προσαρμογή στα γενικά στοιχεία του πληθυσμού. Ένα αυτοσωματικό κυρίαρχο τρόπο και ένα κυρίαρχο ή υπολειπόμενη μείζον γονίδιο με πολυγονιδιακή κληρονομικότητα βρέθηκαν να είναι τα καλύτερα μοντέλα της κληρονομήσει την ευαισθησία σε καρκίνο του οισοφάγου σε ορισμένες μεγάλες οικογένειες.

Συμπεράσματα

Τα σημερινά αποτελέσματα παρέχουν ενδείξεις για την κληρονομική προδιάθεση για καρκίνο του οισοφάγου σε ορισμένες ομάδες υψηλού κινδύνου στην Κίνα, και την υποστήριξη των προσπαθειών για τον εντοπισμό των γονιδίων ευαισθησίας

Παράθεση:. Guohong Z, Min S, DuenMei W, Songnian Η, Min L, Jinsong L, et al. (2010) γενετική ετερογένεια του καρκίνου του οισοφάγου σε υψηλή συχνότητα-περιοχές της Νότιας και της Βόρειας Κίνας. PLoS ONE 5 (3): e9668. doi: 10.1371 /journal.pone.0009668

Επιμέλεια: Ειρήνη Oi Lin Ng, Το Πανεπιστήμιο του Χονγκ Κονγκ, Χονγκ Κονγκ

Ελήφθη: 1, Ιουλίου, 2008? Αποδεκτές: 12 Φεβρουαρίου του 2010? Δημοσιεύθηκε: 15, Μαρτίου, 2010

Copyright: © 2010 Guohong et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η έρευνα χρηματοδοτήθηκε από τις επιχορηγήσεις αρ 30210103904 από το Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας και Νο A1080203 από το Ίδρυμα Βασικά Φυσικών Επιστημών της επαρχία Γκουανγκντόνγκ της Κίνας. Οι χρηματοδότες δεν είχε κανένα ρόλο στο σχεδιασμό της μελέτης, τη συλλογή και ανάλυση των δεδομένων, η απόφαση για τη δημοσίευση, ή την προετοιμασία του χειρογράφου

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Η συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του οισοφάγου διαφέρει κατά περισσότερο από 300 φορές σε όλο τον κόσμο, με τα υψηλότερα ποσοστά καταγράφηκαν σε ορισμένες περιοχές της Κίνας και της κεντρικής Ασίας. [1], [2], [3] Για περισσότερες κινεζικές πληθυσμούς, η συντριπτική πλειοψηφία του οισοφάγου καρκίνων είναι καρκινώματα πλακωδών κυττάρων. [1], [4], [5] Στην βόρεια-κεντρική Κίνα, οι περιοχές υψηλής επίπτωσης βρίσκονται κυρίως κατά μήκος των βορείων συνόρων της τρεις επαρχίες-Hebei, Henan, και Shanxi -abutting το νότιο πλευρό των Taihang Όρη. Το ποσοστό θνησιμότητας μπορεί να είναι τόσο υψηλές όσο 1100 /100.000, όπως συμβαίνει σε Linxian, επαρχία Henan, και Yangcheng, επαρχία Shanxi. [6], [7], [8] Κατά τη διάρκεια των δύο τελευταίων δεκαετιών, Wu και οι συνεργάτες του [9 ] επεδίωξαν επιδημιολογικά στοιχεία της γενετικής προδιάθεσης για την ανάπτυξη του καρκίνου του οισοφάγου, καθώς και αποτελεσματικοί τρόποι διαλογής για τα άτομα που είναι ιδιαίτερα ευαίσθητα στην ασθένεια. Οικογενής συσσωμάτωση του καρκίνου του οισοφάγου βρέθηκε σε αυτήν την περιοχή υψηλής συχνότητας. [10] Επιπλέον, τα αποτελέσματα των μελετών διαχωρισμού από τους Wu et al. [7], [11] για 221 υψηλού κινδύνου πυρηνικές οικογένειες από Linxian, όλα με απογόνους ≥ 40 ετών, και 225 οικογένειες υψηλού κινδύνου που συλλέγονται από Yangquan πόλης πρότεινε ένα αυτοσωματικό υπολειπόμενο τρόπο κληρονομικότητας του καρκίνου του οισοφάγου σε αυτές τις δύο περιοχές υψηλού κινδύνου.

στη νότια Κίνα, στην παράκτια περιοχή Chaoshan δύο χιλιάδες χιλιόμετρα από το Taihang Όρη, υπάρχει μια άλλη περιοχή υψηλής συχνότητας για καρκίνο του οισοφάγου, κυρίως Nanao νησί. [4] Σύμφωνα με προηγούμενη μελέτη μας, η ηλικία-τυποποιημένα ποσοστά εμφάνισης καρκίνου του οισοφάγου σε άνδρες και γυναίκες ήταν 72-150 /100.000 και 26-64 /100.000, αντίστοιχα, 1995-2004 σε Nanao νησί. Οισοφαγικού καρκίνου και καρδιακών καρκίνου ήταν οι πιο διαδεδομένες νεοπλασίες, το οποίο περιλαμβάνει 52% του συνόλου των κακοήθων όγκων περιπτώσεις, και με τον καρκίνο του οισοφάγου παρουσιάζει ανοδική τάση. [12]

Παρά το γεωγραφικό διαχωρισμό, θα μπορούσε να υπάρξει μια κοινή αιτιολογία για καρκίνο του οισοφάγου σε αυτούς τους δύο τομείς; Ιστορικά αρχεία, που υποστηρίζεται από τις πρόσφατες γενετικά δεδομένα με τη μορφή των πολυμορφισμών τόσο του χρωμοσώματος Υ και μιτοχονδριακό DNA, δείχνουν ότι οι πρόγονοι των Chaoshan άνθρωποι μετανάστευσαν από την περιοχή Taihang βουνό. Ανάλυση του mtDNA απλοομάδων έδειξε ότι μια κοινή μητρικό γενετικό υπόβαθρο σχετίζεται με τους πληθυσμούς υψηλού κινδύνου στις δύο περιοχές. [13]

Επιδημιολογικές μελέτες έχουν δείξει ότι ορισμένα περιβαλλοντικούς παράγοντες κινδύνου συνδέονται επίσης με καρκίνο του οισοφάγου στην περιοχή Chaoshan, συμπεριλαμβανομένων υποστεί ζύμωση σάλτσα ψαριών, διατροφικές συνήθειες, η κατανάλωση αλκοόλ, το κάπνισμα και η κατανάλωση του τσαγιού Kongfu. [ ,,,0],6], [14], [15], [16], [17], [18], [19], [20], [21], [22] Παρ ‘όλα αυτά, οικογενή ομαδοποίηση του καρκίνου του οισοφάγου έχει τεκμηριωθεί σε ο Chaoshan πληθυσμού υψηλής συχνότητας, παρέχει μια σημαντική ένδειξη για τη γενετική αιτιολογία. [23] Επιπλέον, η ύπαρξη των δύο υψηλού κινδύνου πληθυσμούς-Chaoshan και Taihang-σε δύο προφανώς διαφορετικά περιβάλλοντα, αλλά οι οποίες σχετίζονται με κοινούς προγόνους, δείχνει ότι η γενετική προδιάθεση μπορεί να διαδραματίσει σημαντικό ρόλο στην κίνδυνο ανάπτυξης καρκίνου του οισοφάγου. Ως εκ τούτου, είναι σημαντικό να διερευνηθεί κατά πόσον οι γενετικοί παράγοντες είναι πράγματι εμπλέκονται στην αιτιολογία του καρκίνου του οισοφάγου στην περιοχή υψηλής συχνότητας Chaoshan.

Ο σκοπός της παρούσας μελέτης ήταν η συγκέντρωση αποδεικτικών στοιχείων ενός συγκεκριμένου μοντέλου κληρονομήσει την ευαισθησία σε καρκίνο του οισοφάγου στους πληθυσμούς υψηλού κινδύνου Chaoshan και Taihang βουνό που θα στηρίξει περαιτέρω μελέτες για τον εντοπισμό των γονιδίων ευαισθησίας στην οικογενή καρκίνο του οισοφάγου. Συνολικά 224 με βάση τον πληθυσμό γενεαλογία από την περιοχή Chaoshan και 403 νοσοκομείο που βασίζεται γενεαλογία από την περιοχή Taihang βουνό συλλέχθηκαν και μελετήθηκαν για την οικογενή συσχέτιση, συνεύρεση και πολύπλοκο διαχωρισμό χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα Στατιστική Ανάλυση για Γενετική Επιδημιολογία (SAGE).

Υλικά και Μέθοδοι

τα άτομα της μελέτης και της συλλογής δεδομένων

θέματα από δύο πληθυσμούς μελετήθηκαν: με βάση τον πληθυσμό θέματα Chaoshan στη νότια Κίνα, και το νοσοκομείο με βάση τα θέματα του βουνού Taihang περιοχή στη βόρεια Κίνα. Η περιοχή Chaoshan, με πληθυσμό περίπου 10 εκατομμυρίων, είναι μια παράκτια περιοχή στο ανατολικό τμήμα της επαρχίας Γκουανγκντόνγκ. μεγάλες πόλεις της είναι Σαντού, Chaozhou, και Jieyang. Άμεσα ανατολικά είναι επαρχία Fujian και προς τα νότια είναι η Θάλασσα της Νότιας Κίνας. Chaoshan κάτοικοι περιλαμβάνουν ένα σχετικά απομονωμένο πληθυσμό και έχουν διατηρήσει την παλιά κινεζική γλώσσα (Chaoshan διάλεκτο) και παραδοσιακά έθιμα. Nanao νησί, με πληθυσμό περίπου 70.000, είναι ένας νομός που συνδέονται με Σάντου, απέναντι από την Ταϊβάν. Οι κάτοικοι του νησιού Nanao συμμετέχουν σε μια μακροχρόνια μελέτη του καρκίνου του οισοφάγου, και ένα μητρώο καρκίνου για Nanao νησί λειτουργεί σε συνεργασία με το Τμήμα Παθολογίας, Πανεπιστήμιο Σάντου Medical College και το Γραφείο Υγείας της Nanao νησί από το 1995. Η σύστημα είναι ένα μεγάλο δίκτυο με βάση τον πληθυσμό που καλύπτουν κλινικές χωριό, καθώς και την πόλη και το νομό νοσοκομεία. Ηχογραφημένες πληροφορίες που περιλαμβάνει δημογραφικά στοιχεία του ασθενούς και η μητρική καταγωγή, ηλικία έναρξης, ακτίνων Χ και παθολογική επιβεβαίωση της διάγνωσης, και το στάδιο της νόσου για κάθε περίπτωση του οισοφάγου και της καρδιακής καρκίνου. Καθοδηγείται από τις εγγραφές και αφού λάβει ενημερωμένη συγκατάθεση, πήραμε συνέντευξη από όλα τα νέα θέματα στα σπίτια τους, που συνοδεύεται από το προσωπικό του τμήματος Υγείας του Nanao νησί. Ένα δομημένο ερωτηματολόγιο χορηγήθηκε σε ασθενείς, οι οποίοι κλήθηκαν να παράσχουν προφορικές απαντήσεις. Καταγράψαμε τις πληροφορίες, συμπεριλαμβανομένων συνήθειες του τρόπου ζωής (π.χ., το κάπνισμα και η κατανάλωση αλκοόλ) και διατροφή, καθώς και το οικογενειακό ιστορικό των τεσσάρων διαδοχικών γενεών. Κάθε φορά που ένα πρόγονο που ήταν σίγουροι για μια απάντηση, πήραμε συνέντευξη από επιπλέον μέλη της οικογένειας ή μεγαλύτερα γείτονες για να εξασφαλίσει την ακρίβεια των πληροφοριών. Επειδή δυσκολία στην κατάποση είναι ένα σημαντικό κλινικό σύμπτωμα, χρησιμοποιήθηκε για τη διάγνωση της νόσου? πριν από τη δεκαετία του 1980, όταν επικράτησε η κακή ιατρική συνθήκες, οι μεγαλύτερης ηλικίας ασθενείς του οισοφάγου καρκίνο οι οποίοι είχαν διαγνωστεί από τους γιατρούς του χωριού ή υπάρχουν υπόνοιες ότι πέθανε από ΕΚ είχε εξακριβωθεί με αυτή τη μέθοδο. Από αυτόν τον πληθυσμό, συνολικά 224 οισοφαγικού καρκίνου και καρδιακών καρκίνο γενεαλογία είχαν εγγραφεί από τα στοιχεία του μητρώου που συλλέγονται κατά το 2003 – 2005.

Η περιοχή Taihang βουνό έχει την υψηλότερη συχνότητα εμφάνισης του καρκίνου του οισοφάγου στο βόρειο τμήμα της Κίνας. Για αυτή την περιοχή διαλέξαμε μια μελέτη διατομής ενός νοσοκομείου με βάση τον πληθυσμό. Ερευνήσαμε τα ιατρικά αρχεία όλων των ασθενών με καρκίνο του οισοφάγου ο οποίος παρουσίασε σε τέσσερα νοσοκομεία-Linzhou (Linxian) Όγκων Νοσοκομείο, Linzhou άνθρωποι Νοσοκομείο, Κέντρο Νοσοκομείο Anyang, και Anyang Όγκων Νοσοκομείο-από τον Ιούνιο έως τον Αύγουστο του 2005. Μετά τη λήψη συγκατάθεσης από τους ασθενείς και τους γιατρούς τους, πήραμε συνέντευξη από τους ασθενείς. Οικογένειες διαπιστώθηκαν μέσω ενιαίου εξεταζομένων, με το πιο πρόσφατο μέλος της οικογένειας που επηρεάζονται να επιλεγεί ως ο δείκτης. Η οικογενής εμφάνιση του καρκίνου του οισοφάγου διερευνήθηκε σε πρόσωπο με πρόσωπο συνεντεύξεις. Ημερομηνία κατά τη διάγνωση καταγράφηκε για τον πρόγονο και για όλους τους πάσχοντες συγγενείς. Συνολικά 7379 άτομα σε 403 οικογένειες εξακριβωθεί μέσω εξεταζομένων είχαν εγγραφεί στη μελέτη

Για να εξερευνήσετε την ετερογένεια της ηλικίας κατά την έναρξη χρησιμοποιήσαμε τα ακόλουθα κριτήρια για την επιλογή των μεγάλων γενεαλογία:. Ασθενείς με καρκίνο του οισοφάγου σε τρεις διαδοχικές γενιές, και ηλικία εμφάνισης μειώθηκε προοδευτικά από γενιά σε γενιά. Τέλος, λάβαμε δύο οικογένειες πρώιμη έναρξη από 224 γενεαλογία στην Chaoshan, και τέσσερις πρώιμη έναρξη οικογένειες και μία εκτεταμένη pedigree (έξι γενεές βάθος) με 32 293 άτομα που πάσχουν από καρκίνο του οισοφάγου στα Taihang Όρη.

έγγραφα ενημέρωση-συναίνεση υπογράφηκαν από κάθε συμμετέχοντα πριν την εισαγωγή του έργου. Η μελέτη αυτή εγκρίθηκε από την επιτροπή δεοντολογίας αναθεώρηση του Πανεπιστημίου Σάντου

Η οικογενής συσχέτιση και στατιστική ανάλυση

Η οικογενής ανάλυση συσχέτισης πραγματοποιήθηκε με τη χρήση FCOR.? έκδοση 5.3.0 του S.A.G.E. FCOR χρησιμοποιήθηκε για να εκτιμηθούν οι συσχετίσεις σε τιμές γνώρισμα μεταξύ των ζευγών των συγγενών. Εδώ, του οισοφάγου κατάσταση καρκίνο ορίστηκε ως χαρακτηριστικό? συσχετίσεις ζευγάρι εκτιμήθηκαν και επικεντρώθηκε στα ακόλουθα σε σχέση με τους τύπους: τους γονείς και τα παιδιά, αδέλφια, καλόκαρδοι, και τα ξαδέρφια. Επιπλέον, Chi-square στατιστικές και Ρ-τιμές υπολογίστηκαν για τον έλεγχο της ομοιογένειας της συσχέτισης μεταξύ των υποτύπων σε κάθε κύριο τύπο.

συνεύρεση ανάλυση

Η δομή συνδιασποράς αναλύθηκε χρησιμοποιώντας τη συνεύρεση πρόγραμμα διαχωρισμού, έκδοση 5.3.0 του SAGE. Κατά τον καθορισμό των παραμέτρων, ένα, δύο, και διανομές τριών συστατικών εκτιμήθηκε, ξεχωριστά. Για κάθε διανομής, έχει καθοριστεί καμία μετάδοση. Οι άλλες παράμετροι για κάθε μέση συνιστώσα εκτιμήθηκαν από τη μέγιστη μέθοδο πιθανότητα, στην οποία όλοι οι αριθμητικές μεθόδους ξεκινούν από ένα δεδομένο σύνολο αρχικών τιμών των άγνωστων παραμέτρων, και στη συνέχεια να αρχίσει διέρχονται την επιφάνεια πιθανότητα μέχρι ένα όριο ικανοποιείται, ένα τοπικό μέγιστο έχει έχουν βρεθεί, ή αριθμητικές δυσκολίες που αντιμετωπίζουν.

συγκρότημα διαχωρισμού ανάλυση

Θα διεξαχθεί μια σύνθετη ανάλυση διαχωρισμού για τις οικογένειες για να διαμορφώσει τη γενετική προδιάθεση και την ηλικία κατά την πρώτη εμφάνιση του καρκίνου του οισοφάγου, χρησιμοποιώντας την τάξη των πεπερασμένων πολυγονιδιακή μικτό μοντέλο (FPMM), η οποία είναι η μόνη επιλογή που διατίθενται σήμερα για δυαδικά χαρακτηριστικά με μεταβλητή ηλικία έναρξης κάτω από ένα λειτουργικό σύστημα Linux 3.0, έκδοση 5.3.0 του SAGE

Αυτό το μοντέλο οδηγεί σε μια πιθανότητα που μπορεί να είναι υπολογίζεται με τη χρήση αποδοτικών αλγορίθμων που αναπτύχθηκαν για oligogenic μοντέλα. Τα προφίλ για FPMM ήταν πιο κοντά στο προφίλ για το συνηθισμένο μικτό μοντέλο με ακριβείς υπολογισμούς. [24], [25], [26] Η βασική θεωρία των πολύπλοκων ανάλυση διαχωρισμού είναι ότι ένα υποσύνολο των ατόμων του πληθυσμού θεωρείται ότι είναι ευαίσθητα για τον καρκίνο του οισοφάγου και ως εκ τούτου να έχουν ηλικία έναρξης του καρκίνου του οισοφάγου, παρέχοντας ζουν αρκετά μεγάλο χρονικό διάστημα, ενώ η κατανομή της ηλικίας έναρξης της νόσου μπορεί να εξαρτάται από τις πιθανές διαχωρισμού γονίδια. Αν υπάρχει Μέντελ μετάδοση, υποτίθεται να είναι μέσω ενός ενιαίου τόπου αυτοσωματικό με δύο αλληλόμορφα, Α και Β, Α να είναι το αλληλόμορφο υποτιθέμενη ασθένεια. Οι συχνότητες του αλληλόμορφου Α και Β σημειώνονται q

Α και (1- q

Α), αντίστοιχα. Ο διαχωρισμός μιας πιθανής σημαντική θέση επιτρέπεται για αφήνοντας μία ή περισσότερες παραμέτρους εξαρτώνται από ένα απαρατήρητο (λανθάνουσα) ποιοτική συντελεστής u = ΑΑ, ΑΒ ή ΒΒ. Καλούμε u τύπου ενός ατόμου. Σε αυτό το πλαίσιο, ο τύπος ορίζεται καλύτερα σε σχέση με την αναμενόμενη κατανομή των απογόνων ενός ατόμου. Έτσι χρησιμοποιούμε τον όρο είδος για να επιτρέψει για πολλά είδη διακριτών μετάδοσης, είτε του Mendel ή όχι. Η κατανομή των τύπων στον πληθυσμό υποτίθεται ότι είναι σε ισορροπία Hardy-Weinberg. Τα άτομα κάθε τύπου ανέλαβε να διαβιβάσει αλληλόμορφο Α στους απογόνους τους με τις πιθανότητες μετάδοσης τ

AA, τ

ΑΒ, και τ

ΒΒ, αντίστοιχα. . Αφήνοντας β είναι μια παράμετρος βασική γραμμή και α ο συντελεστής ηλικία

Σε αυτή τη μελέτη, την ηλικία, την κατάσταση του οισοφάγου καρκίνου, και το σεξ συμπεριλήφθηκαν να βελτιώσει την τοποθέτηση μοντέλο? κατάσταση καρκίνος θεωρήθηκε πρωτογενή δυαδικά, δηλαδή, 0 για καμία καρκίνος του οισοφάγου και 1 για τον καρκίνο, και το σεξ-code προσαρμόστηκε ως συμμεταβλητή για ένα πρωτεύον γνώρισμα, δηλαδή, 0 για άνδρες και 1 για τις γυναίκες. Σύμφωνα με FPMM ανάλυσης διαχωρισμού, τέσσερα μεγάλα μοντέλα Μέντελ γονίδιο (κυρίαρχη, υπολειπόμενο, συνεπικρατούν, φθίνουσα), πολυγενετικής μοντέλα (καθαρό πολυγενετικής, μεγάλες γονιδίων και πολυγενετικής) και τρεις μη γενετικά μοντέλα (καμία σημαντική τύπου, καθαρό περιβάλλοντος και γενικότερα) είναι εφαρμόζονται στα δεδομένα για να εκτιμηθεί ποιο μοντέλο είναι πιο συνεπής με τα παρατηρηθέντα δεδομένα. Υπάρχουν εννέα υποτιθέμενη μοντέλα ακόλουθα:

Μέντελ μοντέλα: Μέντελ μετάδοση ενός σημαντικού γονιδίου υποτίθεται σε αυτό το μοντέλο (τ

ΑΑ = 1, τ

ΑΒ = 0,5, τ

BB = 0). Στο

κυρίαρχο

μοντέλο, γονότυπο ΑΑ είναι ισοδύναμη με γονότυπο ΑΒ, όπως αντικατοπτρίζεται από τις παραμέτρους βασικής γραμμής β

ΑΑ = β

ΑΒ. Στο

υπολειπόμενο

μοντέλο, γονότυπο ΒΒ είναι το ίδιο με το γονότυπο ΑΒ, όπως αντικατοπτρίζεται από τις παραμέτρους βασικής γραμμής β

BB = β

ΑΒ. Στο

συνεπικρατούν

μοντέλο, γονότυπος ΑΒ είναι ενδιάμεσο γονότυπους ΑΑ και ΒΒ, όπως αντικατοπτρίζεται από τις παραμέτρους βασικής γραμμής β

ΑΒ = 1/2 (β

AA + β

BB). Στο

φθίνουσα

μοντέλο, γονότυπος β

AA≥β

AB≥β

BB

μη γενετικών μοντέλων:. Ένα περιβαλλοντικό μοντέλο είναι επίσης ταιριάζει ότι περιλαμβάνει ένα βασικό τύπο επίδραση που δεν μεταδίδεται από τους γονείς στα απογόνους: Ένα μη μεταβιβαζόμενο μοντέλο επιπτώσεις στο περιβάλλον, στην οποία έχει ληφθεί κάθε μία από τις πιθανότητες μετάδοσης να είναι ίση με τη συχνότητα του αλληλόμορφου Α, δηλαδή, τAA = τAB = τBB = ΔΠ. Στο άλλο περιβαλλοντικό μοντέλο, το οποίο επιτρέπει την πιθανή ετερογένεια των επιπέδων έκθεσης μεταξύ των γενεών, οι πιθανότητες μετάδοσης που να είναι ίση, δηλαδή, τAA = τAB = τBB? Καμία σημαντική μοντέλο τύπου, καμία μετάδοση και δεν υπάρχουν σημαντικές επιδράσεις των γονιδίων και του περιβάλλοντος τύπου? Γενικά (πολυπαραγοντική) μοντέλο, ένα πλήρες μοντέλο με αυθαίρετες πιθανότητες μετάδοσης, στην οποία όλες οι παράμετροι ήταν απεριόριστη και αφήνεται να χωρέσει τα δεδομένα

πολυγενετικής ή μείζονος γονιδίου και πολυγενετικής μοντέλα:. Η επιλογή της ηλικίας έναρξης της νόσου ή της ευαισθησίας έχει μια πολυγονιδιακή συστατικό που προβλέπονται από το μπλοκ FPMM. Στο πρόγραμμα, οι συχνότητες τύπου, παραμέτρους βασικής γραμμής (β), και τις πιθανότητες μετάδοσης εκτιμήθηκαν. Το μοντέλο με την τιμή χαμηλότερη Akaike για τα κριτήρια πληροφοριών (AIC) θεωρήθηκε ως το καλύτερο μοντέλο, που υποστηρίζεται από τις δοκιμές του λόγου πιθανοφάνειας.

Η

Για να διερευνήσουν για μεροληψία διαπίστωση και ένα μονό ή ένα διαπίστωση πολλαπλών σημείων, το μοντέλο -δωρεάν πιθανότητα κάθε γενεαλογικό ήταν εξαρτώνται από τον πρόγονο από την ηλικία κατά την πρώτη εμφάνιση και εκτιμάται. Η συνεύρεση πρόγραμμα ανάλυσης διαχωρισμού μπορεί να χρησιμοποιηθεί για να χωρέσει τα μείγματα δύο ή τρεις κανονικές κατανομές, ταυτόχρονα την εφαρμογή ενός μετασχηματισμού ρεύματος στα δεδομένα και επίσης επιτρέπει τόσο για διαπίστωση και υπολειμματικού οικογενή συσχετίσεις. [27]

Για να συγκρίνετε με το τα αποτελέσματα της πρώτης μελέτης κάτω από ένα μοντέλο της κατηγορίας Α, δημιουργήσαμε τις παρακάτω συμπαράγοντες που αντιπροσωπεύουν υπολειμματικό οικογενή αποτελέσματα όπως περιγράφεται από Carter et al. [11] Εν συντομία, αυτοί είναι F1 (επηρεάζονται επίδραση του πατέρα), Μ1 (που επηρεάζονται μητέρα επίδραση), S1 ( αριθμός των επηρεάζονται τα μεγαλύτερα αδελφοί)? F1, M1, και S1 κωδικοποιήθηκαν 1 αν επηρεάστηκαν ο πατέρας, η μητέρα ή sibs, αντίστοιχα, και 0 αν επηρεάζεται ή λείπει.

Αποτελέσματα

Σε Chaoshan, των 7224 ατόμων σε 224 γενεαλογία, 374 (5,18%) (συμπεριλαμβανομένου probands) είχαν καρκίνο του οισοφάγου (πίνακας 1). Σε Taihang, των 7379 ατόμων σε 402 γενεαλογία, 738 (10,0%) είχαν καρκίνο του οισοφάγου. Οι καταγωγές σε Chaoshan, με βάση τα στοιχεία του πληθυσμού, είχαν την τάση να είναι μεγάλη και γενεών (& gt? 3 γενιές), ενώ αυτά διαπιστώνεται από τα στοιχεία του νοσοκομείου που βασίζεται στο Taihang περιλαμβάνονται πολλές πυρηνικές οικογένειες μόνο δύο ή τρεις γενιές. Αυτές οι διαφορές στη δομή γενεαλογικό μπορεί να ευθύνονται για την εμφανή διαφορά στο διπλάσιο του ποσοστού του καρκίνου του οισοφάγου μεταξύ των δύο ομάδων της μελέτης.

Η

Τα Περιγραφικά χαρακτηριστικά των γενεαλογία που παρουσιάζονται στον πίνακα 1. Περισσότεροι άνδρες από ό, τι επηρεάστηκαν θηλυκά και στους δύο πληθυσμούς. Το ποσοστό των γενεαλογία με πολλαπλές (≥2) να επηρεάζονται τα μέλη ήταν παρόμοια μεταξύ των δύο πληθυσμών (40,18% το Chaoshan, 43.42% στο Taihang,

P

& gt? 0,05). Η μέση ηλικία έναρξης της νόσου (κατά τη διάγνωση) του καρκίνου του οισοφάγου σε Taihang (61,65 χρόνια) ήταν ελαφρώς υψηλότερο από ό, τι στο Chaoshan (60,75 χρόνια,

P

& gt? 0,05).

Η οικογενής συσχετίσεις

η οικογενής ανάλυση συσχέτισης διεξήχθη με χρήση FCOR (SAGE έκδοση 5.3) για την εκτίμηση των συσχετίσεων σε τιμές γνώρισμα μεταξύ των ζευγών των συγγενών όπως περιγράφεται στα Υλικά και μέθοδοι. Βρήκαμε ότι όλες οι τιμές συντελεστή συσχέτισης για τον πληθυσμό σε σχέση ζεύγη Chaoshan ήταν παρόμοια με αυτά για τον πληθυσμό Taihang (πίνακας 2). Συνολικά, τα υψηλότερα αδελφό-αδέρφια από συσχετισμούς γονέα-απογόνου βρέθηκαν, γεγονός που υποδηλώνει οικογενειακή ομαδοποίηση των γονιδίων, με κάθε γενιά ενδεχομένως να έχει ένα διαφορετικό περιβάλλον. Το φάσμα των αδελφικών συσχετίσεις ήταν 0,079 έως 0,149 σε Chaoshan και 0,102 έως 0,171 στο Taihang, με το συντελεστή συσχέτισης αδελφός αδελφός είναι σχετικά υψηλό σε σύγκριση με τα άλλα συγγενή-SIB συσχετίσεις. Αυτά τα αποτελέσματα υποδεικνύουν την εμπλοκή των γενετικών επιδράσεων στην αιτιολογία του καρκίνου του οισοφάγου στο γενικό πληθυσμό.

Η

Για τις μεγάλες οικογένειες, όλες οι τιμές συντελεστή συσχέτισης ήταν υψηλότερες από εκείνες για το γενικό πληθυσμό. Τα υψηλότερα συντελεστές συσχέτισης ήταν για τον αδελφό-αδελφό (0.488) και η αδελφή αδελφή (0,416) ζεύγη, υποδεικνύοντας μία ισχυρή γενετική επίδραση στην ευαισθησία σε καρκίνο του οισοφάγου στις μεγάλες οικογένειες και των δύο περιοχών Chanshan και Taihang (πίνακας 2).

συνεύρεση ανάλυση

συνεύρεση ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας τη συνεύρεση πρόγραμμα διαχωρισμού της SAGE (Έκδοση 5.3.0) για να εκτιμηθεί αν η κατανομή της μέσης ηλικίας κατά την έναρξη του καρκίνου του οισοφάγου στις οικογένειες θα μπορούσε να εξηγηθεί καλύτερα ως ένα μίγμα δύο ή περισσοτέρων κατανομές μάλλον παρά ένα ενιαίο διανομή, και να προσδιοριστεί ο αριθμός των μέσων για να χωρέσει στην ανάλυση διαχωρισμού (βλέπε παρακάτω). Τα αποτελέσματα της ανάλυσης κάθε επικάλυψη παρουσιάζονται στο σχ. 1.

Πίνακας Α: ο γενικός πληθυσμός της Chaoshan, Πίνακας Β: το γενικό πληθυσμό της Taihang. Τα ιστογράμματα δείχνουν ότι υπάρχει ένα μείγμα από διανομές στους δύο πληθυσμούς

Η

Ένα μείγμα από δύο διανομές ταιριάζει πολύ καλύτερα από ό, τι ένα ενιαίο διανομής (Chaoshan:. Χ

2 = 30.09,

P

& lt? 0.001, Taihang: χ

2 = 48,15,

P

& lt? 0.001). Ένα μείγμα από τρεις διανομές με τρεις αυθαίρετο μέσο έχει τη μεγαλύτερη πιθανότητα και ταιριάζει με τα δεδομένα ελαφρώς καλύτερα από ό, τι το μοντέλο δύο διανομής στην Chaoshan (γενικό πληθυσμό χ

2 = 4,1,

P

= 0,04288) και προφανώς καλύτερα στο Taihang (χ

2 = 19.54,

P

& lt? 0.001). Έτσι, οι κατανομές συνεύρεση των δύο πληθυσμών εξήγησε καλύτερα από μια μικτή κατανομή από ένα ενιαίο και είναι συμβατά με πιθανή σημαντική επίδραση του γονιδίου (εικ. 1).

Η ανάλυση του διαχωρισμού

Διαχωρισμός στο γενικό πληθυσμό.

Για να προσδιορίσετε μια πιθανή τρόπο κληρονομικότητας έχουμε τοποθετηθεί εννέα μοντέλα, μεταξύ των οποίων τέσσερις Μέντελ μοντέλα, μια πολυγονιδιακή μοντέλο, μια πολυγονιδιακή συν Μέντελ μοντέλο, ένα περιβαλλοντικό πρότυπο, χωρίς σημαντικές τύπου, και ένα πλήρες μοντέλο με αυθαίρετη πιθανότητες μετάδοσης (γενικά) όπως περιγράφεται στο Υλικά και μέθοδοι. Οι εκτιμώμενες παράμετροι και οι αντίστοιχες μοντέλα που χρησιμοποιούνται για πολύπλοκες αναλύσεις διαχωρισμό του καρκίνου του οισοφάγου σε αμφότερες γενικό πληθυσμό ήταν τα ίδια, και τα αποτελέσματα παρουσιάζονται στους Πίνακες 3 και 4. Για δύο πληθυσμούς, όλα

P

-τιμές ήταν λιγότερο από 0,05, και οι τιμές AIC ήταν χαμηλότερες από τις γενικές μοντέλα (3.870,98 σε Chaoshan και 7.562,54 στο Taihang βουνό). Με εξαίρεση τη γενική μοντέλο, βρήκαμε ότι το μοντέλο συνεπικρατούν (4.036,51) στον πληθυσμό Chaoshan και το καθαρό πολυγενετικής μοντέλο (7.896,56) στον πληθυσμό Taihang είχαν τις χαμηλότερες τιμές AIC. Τα αποτελέσματα από τις δύο γενικούς πληθυσμούς υποστηρίξει την πολυπαραγοντική μοντέλο ως το καλύτερο μοντέλο.

Η

Διαχωρισμός σε μεγάλες και επεκτάθηκε γενεαλογία.

Στις μεγάλες γενεαλογία και από τις δύο περιοχές, ο Μέντελ μοντέλα μετάδοσης είχαν τις χαμηλότερες AIC βαθμολογίες? η Chi-square και της αντίστοιχης

Τα P

-τιμές που παρουσιάζονται στους πίνακες 5 και 6. Τα αποτελέσματα αυτά δείχνουν ότι ένα σημαντικό μοντέλο γονίδιο κρύβεται πίσω από την αιτιολογία του καρκίνου του οισοφάγου σε αυτές τις οικογένειες. Για τα δύο μεγάλα γενεαλογία του Chaoshan, τα μοντέλα με τις μικρότερες τιμές AIC ήταν: υπολειπόμενη, κυρίαρχη και δεσπόζουσα θέση με πολυγονιδιακή τρόπο κληρονομικότητας (πίνακας 5). Για τις τέσσερις μεγάλες γενεαλογία της Taihang, το υπολειπόμενο με πολυγονιδιακή λειτουργία έδωσε την μικρότερη τιμή AIC και θεωρείται η καλύτερη-fit μοντέλο για αυτές τις πολύτεκνες οικογένειες (πίνακας 6). Στην εκτεταμένη γενεαλογία από Taihang βουνό, τα κυρίαρχα μοντέλα Μέντελ (πίνακας 7).

Η

Η

Συζήτηση

Μια πολυπαραγοντική τρόπο κληρονομικότητας είναι το καλύτερο μοντέλο για την ευαισθησία σε καρκίνο του οισοφάγου σε δύο γενικούς πληθυσμούς

τα αποτελέσματα της ανάλυσης FCOR επιβεβαίωσε ότι ο καρκίνος του οισοφάγου είναι μέτρια συσχέτιση μεταξύ των μελών της οικογένειας, και να υποστηρίξει την συμμετοχή ενός γενετική συνιστώσα για την οισοφαγική ευαισθησία του καρκίνου σε δύο γενικό πληθυσμό. Η μέτρια αδελφή αδελφή συσχέτιση βρέθηκε στην παρούσα μελέτη δείχνει ότι οι απόγονοι είχαν επιρροή αποτελέσματα από τους γονείς τους. Τα αποτελέσματά μας είναι συνεπείς με αυτές των προηγούμενων μελετών που δείχνουν οικογενή συσχέτιση και την ομαδοποίηση του καρκίνου του οισοφάγου σε οικογένειες στις δύο πληθυσμούς. [10], [23]

Το πιο ικανοποιητικό μοντέλο από την ανάλυση κάθε επικάλυψη για τους δύο γενικούς πληθυσμούς αποτελείται από ένα μίγμα τριών κατανομών, υποδεικνύοντας ότι περισσότερα από ένα συστατικά είναι απαραίτητη για να εξηγήσει την κατανομή του καρκίνου του οισοφάγου. Τα αποτελέσματά μας είναι συνεπή με εκείνα των προηγούμενων οικογενειακή σχέση και συνεύρεση μελέτες, οι οποίες έδειξαν ότι ένας παράγοντας (ες) γενετικού κινδύνου μπορεί να είναι πολύ σημαντική για τις περιοχές υψηλής επίπτωσης της Κίνας. [9] Η διαπίστωση πολλαπλές διανομές είναι συμβατή με μια μεγάλη γονίδιο υπόθεση? Ωστόσο, ανάμιξη μπορεί επίσης να προκύψει μέσα από άλλες αιτίες. Έτσι, η ανάλυση διαχωρισμός χρησιμοποιήθηκε για να καθοριστεί εάν αυτές οι σημαντικές επιδράσεις διαχωρίζονται σε οικογένειες ανάλογα με Μέντελ προσδοκίες.

Ανάπτυξη προηγμένων μεθόδων ανάλυσης διαχωρισμού και μελετώντας επιπλέον δείγματα από άλλες περιοχές υψηλού κινδύνου μπορεί να βοηθήσει στην καλύτερη κατανόηση η αιτιολογία του καρκίνου του οισοφάγου. [7] στην περιοχή Taihang βουνό, μια προηγούμενη ανάλυση διαχωρισμού εκτελέστηκε χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα REGTL κάτω από ένα οπισθοδρομικό μοντέλο της κατηγορίας α, και ένα αυτοσωματικό υπολειπόμενο γονίδιο μεγάλες προτάθηκε [7]. Ωστόσο, μέχρι τώρα, μια παρόμοια τυπική ανάλυση διαχωρισμού δεν είχε πραγματοποιηθεί στον πληθυσμό Chaoshan. Στην παρούσα μελέτη, πραγματοποιήσαμε μια σύνθετη ανάλυση διαχωρισμού χρησιμοποιώντας το πρόγραμμα SEGREG σύμφωνα με το μοντέλο FPMM. Πρόσφατες βελτιώσεις SEGREG δώσει σημαντικά πλεονεκτήματα έναντι των προγραμμάτων REGC, Regd, και REGTL της προηγούμενης S.A.G.E. εκδόσεις? και FPMM, η οποία είναι η μόνη επιλογή που διατίθενται σήμερα για δυαδικά χαρακτηριστικά με μεταβλητή ηλικία έναρξης, είναι πιο αποτελεσματικό από την κατηγορία A οπισθοδρομική μοντέλο για τα δεδομένα του οισοφάγου ασθένεια ως κύριο χαρακτηριστικό και η ηλικία έναρξης της νόσου ως λογοκρισία γνώρισμα. [28]

Όταν το πρότυπο ηλικία έναρξης, όλα Μέντελ μοντέλα, το καθαρό μοντέλο polygene, και το καθαρό περιβαλλοντικό μοντέλο απορρίφθηκαν, ενώ το γενικό μοντέλο έγινε δεκτή στο επίπεδο του πληθυσμού στις δύο περιοχές υψηλής επίπτωσης . Αν και δεν βρήκαμε στοιχεία που να υποστηρίζουν τη συμμετοχή ενός σημαντικού γονιδίου στην αιτιολογία του καρκίνου του οισοφάγου σε είτε των πληθυσμών, τα αποτελέσματά μας του πολυπαραγοντική κληρονομικότητα υποδηλώνουν ότι μία ποικιλία polygenes και περιβαλλοντικούς παράγοντες συμβάλλουν στην ασθένεια. Επιπλέον, στο γενικό πληθυσμό, το περιβαλλοντικό μοντέλο είχε τη χαμηλότερη τιμή AIC δίπλα από το γενικό μοντέλο, γεγονός που υποδηλώνει ότι υπάρχει ένας σημαντικός ρόλος για τους περιβαλλοντικούς παράγοντες στην ανάπτυξη του καρκίνου του οισοφάγου.

Τα αποτελέσματά μας είναι συνεπή με την υποστήριξη η γνώμη του Garavello et al. [7], [29], ότι το οικογενειακό ιστορικό καρκίνου σε συνδυασμό με το κάπνισμα και το ποτό να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου του οισοφάγου. Πρόσθετες γενετικές μοντέλα πρέπει να εξεταστούν, συμπεριλαμβανομένης της αλληλεπίδρασης των γονιδίων ευαισθησίας και περιβαλλοντικών παραγόντων κινδύνου σε επίπεδο πληθυσμού.

Η ανάλυση του διαχωρισμού είναι συνήθως ευαίσθητα στην προκατάληψη διαπίστωση, και ψευδείς παραδοχές για διαπίστωση θα μπορούσε να ανατρέψει τις εκτιμήσεις που λαμβάνονται μέσω του διαχωρισμού ανάλυση. Μια διόρθωση διαπίστωση εφαρμόστηκε με κλιματισμό και τον κίνδυνο για τις εξεταζομένων στον πληθυσμό Taihang.

Ένα σημαντικό Μέντελ συστατικό προσδίδει ευαισθησία σε καρκίνο του οισοφάγου σε μεγάλες οικογένειες

Μετά την ανάλυση των δύο γενικούς πληθυσμούς, δεύτερο μας προσέγγιση ήταν να επικεντρωθεί σε οικογένειες που έχουν ιστορικό καρκίνου του οισοφάγου, συμπεριλαμβανομένων των οικογενειών με μεγάλο αριθμό των προσβεβλημένων ατόμων ή πρώιμη ηλικία έναρξης. Από Taihang αξιολογήσαμε μια αδελφή 293 άτομα με 32 προσβεβλημένα μέλη, καθώς και τέσσερις άλλες μεγάλες γενεαλογία? από Chaoshan μελετήσαμε δύο μεγάλες γενεαλογία των οποίων η μέση ηλικία έναρξης ήταν 49,25 χρόνια.

Η οικογενειακή σχέση και συνεύρεση αναλύσεις έδειξαν ότι περισσότερα από ένα συστατικά που χρειάζεται για να εξηγήσει τις διανομές, με υποστήριξη για μια γενετική συνιστώσα. Ειδικότερα, οι υψηλές αδελφών αδελφών συσχετίσεις (r = 0,2610 και 0,2982) βρίσκονται στις μεγάλες οικογένειες υποδεικνύει ένα σημαντικό ρόλο για τη γονική παράγοντες που επηρεάζουν τα χαρακτηριστικά των απογόνων ».

Με την πολύπλοκη ανάλυση διαχωρισμού ενός μεγάλου pedigree από Taihang και δύο μεγάλα γενεαλογία από Chaoshan, τόσο καθαρό το περιβάλλον και την καθαρή πολυγονιδιακή μοντέλα απορρίφθηκαν? αυτοσωματικό κυρίαρχο και κυρίαρχο με πολυγονιδιακή μοντέλα ήταν τα καλύτερα-fit μοτίβα. Για τις άλλες τέσσερις γενεαλογία της Taihang, ένα υπολειπόμενο με πολυγονιδιακή μοντέλο ήταν το καλύτερο μοντέλο.

Τα αποτελέσματα υποστηρίζουν την ύπαρξη ενός σημαντικού τόπου ευαισθησίας με Μέντελ κληρονομικότητα σε ορισμένες μεγάλες οικογένειες.

Γενετική ετερογένεια οισοφαγικού καρκίνου στις δύο περιοχές υψηλής επίπτωσης

σε μια μελέτη από Wu et al, [7] για να εξερευνήσετε ετερογένεια στην ηλικία κατά την έναρξη του καρκίνου του οισοφάγου, οι συγγραφείς χωρίζονται οικογένειες σε δύο ομάδες, μία με εξεταζομένων των οποίων η ηλικία κατά την έναρξη ήταν & lt? 60 ετών και το άλλο με εξεταζομένων των οποίων η ηλικία κατά την πρώτη εμφάνιση ήταν & gt? 60 χρόνια? βρήκαν καμία ένδειξη σημαντικής ετερογένειας μεταξύ αυτών των δύο υποσύνολα. Ταυτοποίηση των υποσυνόλων των οικογενειών με διαφορετικές πιθανή γενετική αιτιολογία για τον καρκίνο oesophogeal λαμβάνεται ως απόδειξη της γενετικής ετερογένειας. Σε αυτή τη μελέτη, λήφθηκαν όχι μόνο η ηλικία των ατόμων, αλλά και οι επηρεαζόμενοι αριθμοί των ατόμων, οι γενιές με τα προσβεβλημένα άτομα, και την ηλικία διακύμανση υπόψη στην διαλέγετε τα υποσύνολα για ανάλυση. Τα δεδομένα μας δείχνουν ένα μη-Μέντελ τρόπο κληρονομικότητας στο γενικό πληθυσμό και μια φαινομενική κυρίαρχο τρόπο κληρονομικότητας σε ορισμένες μεγάλες οικογένειες. Αυτά τα ευρήματα υποδεικνύουν ότι ο καρκίνος του οισοφάγου έχει σημαντική γενετική ετερογένεια, ειδικά πολυπαραγοντική κληρονομικότητα στο γενικό πληθυσμό και αυτοσωματικό κυρίαρχο κληρονομιά σε ορισμένες υποομάδες του πληθυσμού. Επιπλέον, τα αποτελέσματα προηγούμενων μελετών πρότεινε τη συμμετοχή ενός μεγάλου υπολειπόμενο γονίδιο στον καρκίνο του οισοφάγου στο Yangquan, επαρχία Shanxi και Linxian, επαρχία Henan. [7], [11] Υπάρχουν επίσης ενδείξεις μιας οικογενειακής περιοχής του γονιδίου του οισοφάγου ευαισθησίας του καρκίνου στο χρωμόσωμα 13q. [30], [31], [32], [33] Επιπλέον, οι όγκοι από ασθενείς με θετικό οικογενειακό ιστορικό δεικνύουν περισσότερο συχνή απώλεια ετεροζυγωτίας (ΑΕ) για αυτό το χρωμόσωμα από ό, τι εκείνων που προέρχονται από ασθενείς χωρίς οικογενειακό ιστορικό. [34]

Όπως και για άλλους καρκίνους, ένα κυρίαρχο τρόπο κληρονομικότητας του καρκίνου oesoaphageal εμφανής μέσα σε λίγες πολύ μεγάλες οικογένειες υποδηλώνει τη συμμετοχή του κοινού γονιδίων ευαισθησίας. Σε άλλες οικογενείς περιπτώσεις καρκίνου του οισοφάγου και σε σποραδικές περιπτώσεις, μια πολυγονιδιακή /πολυπαραγοντική αιτιολογία μπορεί να υποτεθεί μέσω της κοινής χρήσης των αλληλόμορφα σε πολλούς τόπους, συνεισφέροντας ο καθένας με μια μικρή αύξηση του κινδύνου καρκίνου. [35] Για παράδειγμα, μόνο ένα υποσύνολο της οικογενειακής του μαστού ο καρκίνος είναι σαφώς κληρονομική, κυρίως λόγω μεταλλάξεις σε ένα μόνο γονίδιο. Πληροφορίες σχετικά με τη γενετική ετερογένεια του καρκίνου του οισοφάγου είναι σημαντικό να είναι σε θέση να προσδιορίσει τις διαφορετικές υποομάδες και τελικά να αποκαλύψει την loci ασθένεια.

Περαιτέρω μελέτες της γενετικής σύνδεσης και γονίδιο ευαισθησίας θέση

Σε συνδυασμό μοριακή γενετική ανάλυση και γενετική επιδημιολογία μπορεί να αποκαλύψει την υποκείμενη βάση της γενετικής προδιάθεσης για καρκίνο του οισοφάγου.