Αφηρημένο

Καρκίνος στομάχου (GC) παραμένει μία από τις πιο κοινές πεπτικό καρκίνων σε όλο τον κόσμο? Ωστόσο, οι περισσότεροι ασθενείς παρουσιάζουν σε προχωρημένο στάδιο κατά την αρχική διάγνωση.

Zic1

είναι ένα νέο γονίδιο καταστολέα υποψήφιος όγκου που επιγενετικώς σιγήσει στο GC. Σε αυτή τη μελέτη, ερευνήσαμε

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού στο DNA του πλάσματος ως ένα νέο μοριακό δείκτη για την έγκαιρη διάγνωση και την παρακολούθηση της GC. αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (MSP) δοκιμασία μεθυλίωσης-ειδική διεξήχθη για την ανίχνευση

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε DNA πλάσμα από 20 υγιείς εθελοντές, 50 γαστρικό νεοπλασία ασθενείς ενδοεπιθηλιακά, και 104 ασθενείς GC. Η

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή στα δείγματα πλάσματος από την υγιή ομάδα ελέγχου ήταν 0%, αλλά έφθασε 54,0% στην ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία ομάδα και 60,6% στην ομάδα GC. Οι δύο τελευταίες τιμές ήταν σημαντικά υψηλότερες από εκείνη που βρέθηκε στην υγιή ομάδα ελέγχου (ρ & lt? 0,05), με ειδικότητα 100% για ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία και διάγνωση GC. Η θετική προγνωστική αξία του πλάσματος

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού για τη διάγνωση της ενδοεπιθηλιακής νεοπλασίας και GC ήταν 100%. κατάσταση μεθυλίωσης στην ομάδα GC δεν συσχετίστηκε σημαντικά με το μέγεθος του όγκου, τη διαφοροποίηση του όγκου, λέμφο μετάσταση στους λεμφαδένες, TNM στάσης, ή εισβολή του όγκου (ρ & gt? 0,05). Εκτίμηση της σημασίας της ανίχνευσης της καρκινο-εμβρυϊκό αντιγόνο (CEA) επίπεδο και

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή για διάγνωση GC αποκάλυψε ότι η ευαισθησία του

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού ήταν σημαντικά υψηλότερη από εκείνη της το επίπεδο CEA ως δείκτης και ότι η συνδυασμένη μέτρηση των δύο αυτών δεικτών (παράλληλη δοκιμή) βελτιωμένη ευαισθησία. Στο σύνολό τους, τα αποτελέσματά μας δείχνουν ότι το

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποστηρικτής στο DNA που προέρχονται από πλάσμα έχει μεγάλη σημασία για την έγκαιρη διάγνωση του GC και παρακολούθηση της ογκογένεσης.

Zic1

μεθυλίωση του υποκινητή μπορεί να χρησιμεύσει ως μια νέα μη επεμβατική βιοδείκτη πλάσματος για την έγκαιρη ανίχνευση του GC και για την αξιολόγηση του κινδύνου σε πληθυσμούς υψηλού κινδύνου. Η συνδυασμένη μέτρηση του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA (παράλληλη δοκιμή) μπορεί να ενισχύσει τις ισχύουσες κατευθυντήριες γραμμές για την έγκαιρη διάγνωση του GC

Παράθεση:. Τσεν Χ, Λιν Ζ, Xue Μ , Si J, ο Τσεν S (2015)

Zic1

υποστηρικτής υπερμεθυλίωση του DNA στο πλάσμα είναι μια πιθανή βιοδεικτών για γαστρικός καρκίνος και ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία. PLoS ONE 10 (7): e0133906. doi: 10.1371 /journal.pone.0133906

Επιμέλεια: Hiromu Suzuki, Σαπόρο Ιατρικό Πανεπιστήμιο, ΙΑΠΩΝΙΑ

Ελήφθη: 10, Απριλίου, 2015? Δεκτές: 2, Ιουλίου, 2015? Δημοσιεύθηκε: 24 Ιουλίου 2015

Copyright: © 2015 Chen et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Δεδομένα Διαθεσιμότητα: Όλα τα σχετικά δεδομένα είναι εντός του Υποστηρίζοντας αρχεία πληροφοριών του χαρτιού και

Χρηματοδότηση:. το έργο αυτό χρηματοδοτήθηκε από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας (81302070, 81372623) (https://www.nsfc.gov.cn), Zhejiang επαρχιακό Ιατρική και υγεία γενικό σχέδιο έρευνας (2014KYB121) (https://www.zjwst.gov.cn/), Zhejiang Provincial Τμήμα του σχεδίου έρευνας Εκπαίδευσης (Y201327398) (https://www.zjedu.gov.cn), και επαρχία Zhejiang κλειδί της ομάδας επιστήμη και την τεχνολογία καινοτομία (2013TD13) (https://www.zjkjt.gov.cn/). Ο χρηματοδότης Shujie Chen συνέλαβε και σχεδίασε τα πειράματα για αυτό το χειρόγραφο

Αντικρουόμενα συμφέροντα:.. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Εισαγωγή

Καρκίνος στομάχου (GC) είναι ένα από τα πιο κοινά πεπτικά καρκίνοι και η τρίτη κύρια αιτία των θανάτων που σχετίζονται με τον καρκίνο παγκοσμίως [1]. Η πλειοψηφία των ασθενών GC παρόντες σε προχωρημένο στάδιο, κατά την αρχική διάγνωση. Σε παγκόσμιο επίπεδο, GC αντιπροσωπεύει σχεδόν 952.000 νέες περιπτώσεις κάθε χρόνο, σύμφωνα με Globocan 2012 [2]. Στην Ιαπωνία, το ποσοστό επιβίωσης 5 ετών για τις αρχές του GC (EGC) είναι 86% σε σύγκριση με 32% για τις προηγμένες GC, όπως αναφέρθηκε από το αμερικανικό πρόγραμμα SEER [3].

Η ανώμαλη μεθυλίωση του DNA είναι ένα σημαντικό επιγενετική αλλαγή και ένα πρώιμο γεγονός στην καρκινογένεση [4]. Πρόσφατα, αρκετές ογκοκατασταλτικά γονίδια (ΕΠΠΕ), συμπεριλαμβανομένων των

FAM5C

,

MYLK

,

p16

και

E-cadherin

, έχουν αναφερθεί να είναι μεθυλιωμένα στον ορό /πλάσμα των ασθενών GC [5-7]. Επιπλέον, υπερμεθυλίωση ΕΠΠΕ τείνει να ενισχυθεί με την εξέλιξη της προ-καρκινικές βλάβες [8-9]. Ως εκ τούτου, η ανίχνευση του μεθυλιωμένου DNA στον ορό /πλάσμα μπορεί να είναι ένας πολλά υποσχόμενη προσέγγιση για την έγκαιρη διάγνωση του GC. Ενδοεπιθηλιακής νεοπλασίας (ΙΝ) είναι μία δυνητικά προκαρκινική αλλοίωση που προσδίδει υψηλό κίνδυνο GC? ως εκ τούτου, η διαλογή των ασθενών σε είναι ζωτικής σημασίας για τη διάγνωση και την πρόβλεψη του GC. Μερικές αναφορές υπερμεθυλιωμένων αναλύσεων DNA των δειγμάτων αίματος από γαστρικό ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία (GIN) ασθενείς είναι διαθέσιμες μέχρι σήμερα.

Growing στοιχεία δείχνουν ότι

Zic1

(

Zic

μέλος της οικογένειας 1 , μονές σε συνδυασμό Drosophila ομόλογο) συμμετέχει στην εξέλιξη των διαφόρων μορφών καρκίνου [10-13]. Έχουμε ανακαλύψει στο παρελθόν ότι

Zic1

, ένα μυθιστόρημα ΕΠΠΕ, έχει σιγήσει μέσω υπερμεθυλίωση προαγωγού σε δύο κύτταρα GC και ιστών [14]. Έχουμε, επίσης, έδειξε ότι

Zic1

εμπλέκεται στην αναστολή της κυτταρικής επιβίωσης GC και την απομείωση της κυτταρικής μετανάστευσης [15].

Στην παρούσα μελέτη, προσδιόρισε τις αρχές της διάγνωσης και πρόβλεψης δυνατότητες του

Zic1

υπερμεθυλίωση στο πλάσμα των ασθενών GC. Μετρήσαμε την κατάσταση μεθυλίωσης υποστηρικτής του

Zic1

στο πλάσμα ασθενών με GC ή τζιν και κανονικό έλεγχο (NC) άτομα. Η ένωση του

αξιολογήθηκε επίσης Zic1

μεθυλίωση προαγωγού με κλινικοπαθολογοανατομικές παραμέτρους. Επιπλέον, θα κατατάσσονται υψηλής ποιότητας IN και Τ1 GC ως EGC και τοποθετούνται οι ασθενείς GC και το τζιν σε GC συν στην ομάδα (GPI). Στη συνέχεια, αναλύσαμε το

Zic1

ποσοστά υπερμεθυλίωση τόσο στην EGC και ομάδες GPI. Περαιτέρω, η συνδυασμένη αξιολόγηση του καρκινο-εμβρυϊκό αντιγόνο (CEA) επίπεδο και

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού για διάγνωση GC εκτιμήθηκε χρησιμοποιώντας πλάσμα από τους ασθενείς GC και το τζιν.

Υλικά και Μέθοδοι

Κλινικά δείγματα

τα δείγματα πλάσματος λήφθηκαν προεγχειρητικά στο Sir Run Run Shaw Νοσοκομείο, Hangzhou, Zhejiang, Κίνα, από το Νοέμβριο του 2012 έως τον Απρίλιο του 2015. Όλοι οι ασθενείς που συμπεριλήφθηκαν στη μελέτη μας υποβλήθηκαν gastroendoscopy και ομαδοποιήθηκαν σύμφωνα με τη διάγνωση ιστοπαθολογία. Δείγματα πλάσματος συλλέχθηκαν από ασθενείς GC και το τζιν που είχαν υποβληθεί προηγουμένως σε θεραπευτικές αγωγές, όπως χημειοθεραπεία, ακτινοθεραπεία, χειρουργική εκτομή και. Τα κριτήρια αποκλεισμού που περιλαμβάνονται γαστρεντερικές παθήσεις με άλλες αιτίες και ασθένειες σε άλλα όργανα. Οι ασθενείς με γαστρικό μεταστάσεις από άλλες όγκοι επίσης εξαιρούνται.

αριθμούνται τα δείγματα σύμφωνα με τη σειρά με την οποία συλλέχθηκαν και στη συνέχεια εκτελείται αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης μεθυλίωσης-ειδική (MSP) για να αξιολογήσει τα δείγματα σε αριθμητική σειρά. Τα δείγματα περαιτέρω ομαδοποιούνται ανάλογα με τα αποτελέσματα παθολογία. Δείγματα πλάσματος συλλέχθηκαν από 104 ασθενείς GC με μέσο όρο ηλικίας 59.8 ετών, οι οποίοι είχαν διαγνωστεί σύμφωνα με τα κριτήρια του Παγκόσμιου Οργανισμού Υγείας [16]. Πενήντα ασθενείς GIN με μέσο όρο ηλικίας τα 58,0 χρόνια διαγνώστηκε με γαστροσκόπηση. Δείγματα αίματος επίσης συλλέχθηκαν από 20 υγιείς εθελοντές στην ομάδα NC με μέσο όρο ηλικίας τα 38,5 χρόνια.

Ηθική δήλωση

Το έργο μας λάβει έγκριση από την Κλινική Επιτροπή Ερευνητικής Δεοντολογίας του Ινστιτούτου Γαστρεντερολογίας του Πανεπιστημίου Zhejiang. Γραπτή συγκατάθεση λήφθηκε από κάθε ασθενή πριν από τη συλλογή του δείγματος. Τα άτομα που συμμετείχαν σε αυτή τη μελέτη έδωσαν γραπτή συγκατάθεση (όπως περιγράφεται στο

PLoS

έντυπο συγκατάθεσης) να δημοσιεύσει αυτά τα στοιχεία την περίπτωση.

απομόνωσης DNA και όξινο θειώδες τροποποίηση

DNA εκχυλίστηκε από τα δείγματα πλάσματος χρησιμοποιώντας ένα QIAamp Blood DNA Mini Kit (Qiagen, Hilden, Germany). Οι συγκεντρώσεις DNA μετρήθηκαν με φασματοσκοπία σε ένα μήκος κύματος 260 nm. DNA ήταν διθειώδες-επεξεργασία με ένα Zymo DNA Τροποποίηση Kit (Zymo Research, Orange, CA, USA). Το τροποποιημένο DNA αποθηκεύτηκε στους -20 ° C μέχρι τη χρήση.

δοκιμασίες MSP

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού εξετάστηκε με διεξαγωγή προσδιορισμού MSP, χρησιμοποιώντας τα προαναφερθέντα διθειώδες τροποποιημένου δωρεάν DNA στο πλάσμα σαν το εκμαγείο. MSP εκτελέστηκε για 40 κύκλους σε μία θερμοκρασία ανόπτησης των 56 ° C όπως περιγράφηκε προηγουμένως [14]. Η μεθυλίωση-ειδικούς εκκινητές ήταν ZIC1-MF (5′-GGATTTTTTGTTTCGTAATC) και ZIC1-MR (5′-CCCGTTAACCACGTTAAACG) και οι μη-μεθυλιωμένου-ειδικούς εκκινητές ήταν ZIC1-UF (5′-GGGATTTTTTGTTTTGTAATT) και ZIC1-UR (5′- CCCATTAACCACATTAAACA). Το PCR πρωτόκολλο συμπεριελάμβανε αρχική μετουσίωση στους 95 ° C για 10 λεπτά, ακολουθούμενη από 40 κύκλους μετουσίωσης στους 95 ° C για 30 s, ανόπτηση στους 56 ° C για 40 s, επέκταση εκκινητή στους 72 ° C για 40 s, και τελική επέκταση στους 72 ° C για 7 λεπτά. Τα προϊόντα της PCR υποβλήθηκαν σε ηλεκτροφόρηση σε πηκτές αγαρόζης 1,5%, χρωματίστηκαν με Gel Red, και οπτικοποιούνται με φωτισμό με υπεριώδη ακτινοβολία.

Serum CEA δοκιμές

Τα δείγματα ορού αποστέλλονται στο κλινικό εργαστήριο του Sir Run Run Shaw νοσοκομείο για τη δοκιμή, και η συγκέντρωση CEA του & gt? 5 ng /mL θεωρήθηκε ως μη φυσιολογικό.

Στατιστικές αναλύσεις

Οι συχνότητες μεθυλίωση και τα επίπεδα του CEA στα δείγματα πλάσματος συγκρίθηκαν χρησιμοποιώντας το ακριβές τεστ του Fisher. Η σύνδεση μεταξύ των κλινικοπαθολογοανατομικών χαρακτηριστικά και το DNA υπερμεθυλίωση αναλύθηκε χρησιμοποιώντας το τεστ chi-square. Η διαγνωστική αξία του συνδυασμού

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και το επίπεδο CEA πλάσμα αξιολογήθηκε σύμφωνα με την περιοχή κάτω από το δέκτη λειτουργεί χαρακτηριστική καμπύλη (AUC). Η ευαισθησία, η ειδικότητα, και θετική και αρνητική προγνωστική αξία για την παθολογική διάγνωση υπολογίστηκαν με διαστήματα εμπιστοσύνης 95% για

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού ή

Zic1

μεθυλίωση υποκινητή σε συνδυασμό με το επίπεδο CEA. Θετικές και αρνητικές αναλογίες πιθανότητα ήταν υπολογίζονται επίσης. Για όλες τις δοκιμασίες, ένα cut-off τιμή του p & lt? 0.05 εφαρμόστηκε για να προσδιοριστεί η στατιστική σημαντικότητα. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση SPSS 19.0 (SPSS Inc., Chicago, IL).

Αποτελέσματα

κατάσταση μεθυλίωσης στο

πλάσμα

Για την εκτίμηση αλλαγές στο

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε GC, ανιχνεύσαμε για πρώτη φορά την κατάσταση μεθυλίωσης του υποκινητή σε 104 ασθενείς με GC, 50 με τζιν, 31 με EGC και 20 NCs και πραγματοποιούνται συγκρίσεις μεταξύ των ομάδων. Τα ποσοστά μεθυλίωση των

Zic1

υποκινητή στα δείγματα πλάσματος ήταν 0% στην ομάδα NC (0%), με αύξηση σε 54,0% στην ομάδα τζιν και σε 60,6% στην ομάδα GC (ρ & lt? 0.001 τόσο για τζιν και GC εναντίον NC), με 100% ειδικότητα για GPI διάγνωση (20/20) (Σχήμα 1). Οι θετικές και αρνητικές τιμές πρόβλεψης και θετικά και αρνητικά ποσοστά πιθανότητας για τη διάγνωση IN και GC ήταν 100% (90/90), 23,8% (20/84), άπειρη και 0,42, αντίστοιχα. αποτελέσματα Εκπρόσωπος δοκιμασία MSP για

Zic1

μεθυλίωσης υποστηρικτής φαίνονται στο σχήμα 2.

Τα ποσοστά των

Zic1

μεθυλίωση υποστηρικτής ήταν 60,6% (63/104) στην GC, 54,0% (27/50) στην τζιν, 54,8% (17/31) στην EGC και 0,0% (0/20) στις ομάδες NC (*: ρ & lt? 0.001)

η

M: Μεθυλίωση-ειδικούς εκκινητές? U:. Μη μεθυλιωμένα-ειδικούς εκκινητές

Η

Σύλλογος κλινικοπαθολογοανατομικών χαρακτηριστικά με

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού στο πλάσμα των ασθενών GC

Στη συνέχεια συσχετίζονται τα κλινικοπαθολογοανατομικών χαρακτηριστικά με το

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποστηρικτής στο πλάσμα των ασθενών GC για τον εντοπισμό τυχόν ενώσεις. Τα αποτελέσματα έδειξαν καμία σημαντική συσχέτιση μεταξύ του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και οι κλινικές παραμέτρους, συμπεριλαμβανομένου του μεγέθους του όγκου, το βαθμό διαφοροποίησης, την κατάσταση των λεμφαδένων, το βάθος εισβολή όγκου και το στάδιο ΤΝΜ (p & gt? 0,05) (Πίνακας 1) .

Η

συνδυασμένη προσδιορισμό του

Zic1

υπερμεθυλίωση και το επίπεδο CEA

Η σημασία της συνδυασμένης προσδιορισμό του

Zic1

ποσοστό υπερμεθυλίωση και το CEA επίπεδο για τη διάγνωση και την έγκαιρη πρόβλεψη της GC αναλύθηκε. Μετρήσαμε τα επίπεδα CEA σε 9 NCs, 24 ασθενείς GIN και 71 ασθενείς GC πριν από τη θεραπεία. Οι ευαισθησίες του επιπέδου CEA στις ομάδες GC, ΙΝ, και EGC ήταν 22,5% (16/71), 16.7% (4/24) και 10,5% (2/19), αντίστοιχα. Σε όλα 3 από τις ομάδες, η ευαισθησία του

Zic1

μεθυλίωση υποστηρικτής ήταν σημαντικά υψηλότερη από εκείνη του επιπέδου CEA (p & lt? 0,05).

Συνδυασμένη προσδιορισμό του

Zic1

υπερμεθυλίωση και το επίπεδο του CEA στην ομάδα GC.

στην ομάδα GC, η ευαισθησία και η ειδικότητα της συνδυασμένης προσδιορισμό του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA (δοκιμή tandem) ήταν 16,9 % και 90,9%, αντίστοιχα (Πίνακας 2). Η ευαισθησία της συνδυασμένη ανάλυση των δύο αυτών παραμέτρων (παράλληλη δοκιμή) ήταν 69,0% (Πίνακας 2), η οποία ήταν υψηλότερη από τις ευαισθησίες επιτυγχάνεται με τη δοκιμή του και μόνο δύο παραμέτρων. ανάλυση της καμπύλης ROC διεξήχθη για να αξιολογήσει τη σημασία του ποσοστού της μεθυλίωσης του DNA και το επίπεδο CEA για την διάγνωση GC. Η AUC για

Zic1

δοκιμές μεθυλίωση υποστηρικτής μόνο ήταν 0.610 (S1 σχήμα) και ότι για την συνδυασμένη αξιολόγηση των

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και το επίπεδο CEA (δοκιμή tandem) ήταν 0.539 (S2 σχήμα) . Αξίζει να σημειωθεί ότι, όταν

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και το επίπεδο CEA προσδιορίστηκαν παράλληλα, η AUC αυξήθηκε σε 0,633 (Σχήμα 3). Με βάση τα παραπάνω αποτελέσματα, η συνδυασμένη προσδιορισμός του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και επίπεδο CEA (παράλληλη δοκιμή) για τη διάγνωση GC βρέθηκε να είναι συνεργιστική σε σύγκριση με την χρήση του κάθε μόνη μέθοδος.

Μια καμπύλη ROC για την αξιολόγηση της σημασίας της συνδυασμένης ανίχνευση των δύο παραμέτρων για τη διάγνωση GC.

η

συνδυασμένη προσδιορισμό του

Zic1

υπερμεθυλίωση και το επίπεδο του CEA στην ομάδα GPI.

στην ομάδα GPI, η ευαισθησία και η ειδικότητα της συνδυασμένης προσδιορισμό του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA (δοκιμή tandem) ήταν 15,8% και 100,0%, αντίστοιχα (Πίνακας 3) . Η συνδυασμένη εκτίμηση αυτών των δύο παραμέτρων (παράλληλη δοκιμή) είχε την υψηλότερη ευαισθησία στο 65,3%, με θετική προγνωστική αξία φθάνοντας 98,4% (Πίνακας 3). ανάλυση της καμπύλης ROC διεξήχθη για να αξιολογήσει τη σημασία του ποσοστού της μεθυλίωσης του DNA και το επίπεδο CEA για GPI διάγνωση. Η AUC για

Zic1

δοκιμές μεθυλίωση υποστηρικτής μόνο ήταν 0.792 (S3 σχήμα) και ότι για την συνδυασμένη αξιολόγηση των

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA (παράλληλη δοκιμή) ήταν 0,771 (Εικ 4). Ως εκ τούτου, η ανίχνευση του

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού θα μπορούσε να είναι μια πιο αποτελεσματική εναλλακτική λύση για GPI διάγνωση.

Μια καμπύλη ROC για να αξιολογηθεί η σημασία της συνδυασμένης ανίχνευση αυτών των δύο παραμέτρων για GPI διάγνωση.

Η

Συζήτηση

Πρόσφατα, έχουν πολλά γονίδια που έχουν βρεθεί να είναι μεθυλιωμένα σε ιστούς GC, συμπεριλαμβανομένων των

E-cadherin

,

RASSF1A

,

p16

,

GSTP1

,

SOCS1

,

SFRP1

και

PTEN

[17]. Αναφέρθηκαν συχνότητες μεθυλίωση κυμαίνονταν από 56% έως 96% [17]. Μεθυλίωσης του DNA έχει επίσης παρατηρηθεί σε δείγματα αίματος από ασθενείς GC. Αρκετές ΕΠΠΕ έχουν βρεθεί να είναι μεθυλιωμένα σε δείγματα αίματος από ασθενείς GC, συμπεριλαμβανομένων των

p16

,

E-cadherin

, και

RAR

, με ποσοστά ανίχνευσης του 37% σε 48%, αντίστοιχα [18-21].

Zic1

είναι έκτροπα μειωτικά σε ορισμένους τύπους καρκίνου, ενδεικτικό της λειτουργίας του ως ΕΠΠΕ. προηγούμενη εργασία μας έδειξε ότι το

Zic1

υποστηρικτής συχνά μεθυλιώνονται σε πρωτογενείς ιστούς γαστρικού καρκινώματος, με υψηλό ποσοστό ανίχνευσης του 94,6%, αλλά όχι σε φυσιολογικό γαστρικό ιστούς [14]. Τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι

Zic1

είναι ένα μυθιστόρημα υποψήφιος ΕΠΙΠ που ρυθμίζεται προς τα κάτω μέσω υπερμεθυλίωση προαγωγού σε GC. πλάσμα Ωστόσο, εξ όσων γνωρίζουμε, δεν έχει μελετηθεί

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε GC ή GIN.

Στην παρούσα μελέτη, αποδείξαμε πρώτα ότι παρεκκλίνουσα μεθυλίωση του

Zic1

υποκινητή θα μπορούσε να ανιχνευθεί σε πλάσμα από ασθενείς GC και το τζιν σε συχνότητες 60,6% και 54,0%, αντίστοιχα, οι οποίες ήταν σημαντικά υψηλότερη από εκείνη των NCs. Αυτά τα αποτελέσματα συμφωνούν με εκείνα των προηγούμενων μελετών [14]. Από διαγνωστική άποψη,

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού παρουσίασαν υψηλή εξειδίκευση για την διευκρίνιση των NCs από τους ασθενείς GC και το τζιν (100%). Τα αποτελέσματά μας έδειξαν επίσης ότι η ανίχνευση του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή είχε μια υψηλή θετική προγνωστική αξία και μια θετική αναλογία πιθανότητας και AUC για GC και διάγνωση GIN, γεγονός που υποδηλώνει ότι

Zic1

αξιολόγηση μεθυλίωση ανάδοχος έχει δυνητική χρησιμότητα για τη διάγνωση και την έγκαιρη πρόβλεψη του GC.

Πολλές προηγούμενες μελέτες έχουν επικεντρωθεί στην περιφερειακή μεθυλίωσης του DNA στο αίμα σε GC αντί ασθενείς GIN, με μόνο μια χούφτα των μελετών με επίκεντρο τις μεθυλίωσης του DNA σε gin. Η ανάπτυξη των ενδοσκοπικών τεχνικών επέτρεψε για τη διαθεσιμότητα των πιο αποτελεσματική και λιγότερο επεμβατικές θεραπείες για τους ασθενείς EGC και το τζιν. Συνολικά, η διαλογή για το gin συμβάλλει στην παρακολούθηση του GC και στη μείωση των θανάτων που σχετίζονται με GC-. Μια ενδιαφέρουσα πτυχή της παρούσας μελέτης είναι ότι δείξαμε παρεκκλίνουσα

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε πλάσμα από ασθενείς τζιν, με ένα ποσοστό ανίχνευσης που ήταν σημαντικά υψηλότερο από εκείνο των θεμάτων NC (p & lt? 0.001). Στο μέλλον, η ανίχνευση της υπερμεθυλίωση του

Zic1

υποστηρικτής θα μπορούσε δυνητικά να χρησιμοποιηθεί ως ένα σημάδι έγκαιρης προειδοποίησης ή για τη διαλογή GC σε ομάδες υψηλού κινδύνου.

Θα αξιολογηθεί επίσης

Zic1

μεθυλίωση υποστηρικτής στο πλάσμα ασθενών GC σε συνδυασμό με διάφορες κλινικοπαθολογοανατομικές παραμέτρους. Δεν παρατηρήθηκε στατιστικά σημαντική σχέση δεν παρατηρήθηκε μεταξύ των

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και οι διάφορες κλινικές παραμέτρους, συμπεριλαμβανομένου του μεγέθους του όγκου, το βαθμό διαφοροποίησης, την κατάσταση των λεμφαδένων, το βάθος εισβολή όγκου και το στάδιο TNM? Ωστόσο, σε προηγούμενη μελέτη μας [15],

Zic1

μεθυλίωση έχει βρεθεί ότι εμπλέκεται στην διεισδυτικότητα GC. Στην παρούσα μελέτη, οι περισσότεροι από τους ασθενείς GC είχαν διαγνωστεί και αντιμετωπιστεί σε πρώιμο στάδιο, οι οποίες μπορεί να έχουν επηρεάσει τα τελικά αποτελέσματα. Επικύρωση σε μεγαλύτερο πληθυσμό θα μπορούσε να παρέχει γνώσεις σε αυτά τα διαφορετικά αποτελέσματα. Αν υπάρχει κάποια συσχέτιση μεταξύ της ανώμαλης

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και GC κλινικά χαρακτηριστικά απαιτεί διευκρινίσεις από περαιτέρω ανάλυση.

Το CEA είναι ένα κλασικό δείκτη όγκου που συνήθως αξιολογούνται στην κλινική. Αυτός ο δείκτης θεωρείται ότι είναι η πιο συχνά υπάρχουν σε ασθενείς αργά GC? Ωστόσο, πολλές μελέτες έχουν δείξει ότι η μεθυλίωση του DNA μπορεί να ανιχνευθεί ξεκινώντας από τα πρώτα στάδια της GC. Στη παρούσα μελέτη μας, ένας καμπύλη ROC δημιουργήθηκε για να αξιολογηθεί η σημασία της συνδυασμένης ανίχνευση του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και επίπεδο CEA (παράλληλες δοκιμές) για τη διάγνωση του GC, αποκαλύπτοντας ότι οι συνδυασμένες ανίχνευσή τους παρήγαγαν περισσότερο σημαντικά αποτελέσματα από την ανίχνευση των μόνος είτε παραμέτρου. Ως εκ τούτου, προτείνουμε ότι η συνδυασμένη μέτρηση του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA μπορεί να ενισχύσει τη διάγνωση της GC.

Εν κατακλείδι, τα αποτελέσματά μας έδειξαν ότι η μέτρηση της

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού στο DNA που προέρχονται από πλάσμα έχει σημασία για την έγκαιρη ανίχνευση του GC και για την αξιολόγηση του κινδύνου σε πληθυσμούς υψηλού κινδύνου. Η συνδυασμένη μέτρηση του

Zic1

ποσοστό μεθυλίωσης υποκινητή και το επίπεδο CEA (παράλληλη δοκιμή) μπορεί να ενισχύσει τις ισχύουσες κατευθυντήριες γραμμές για την έγκαιρη διάγνωση του GC? Ωστόσο, απαιτούνται περαιτέρω μελέτες με μεγαλύτερα μεγέθη δειγμάτων και στην κλινική επικύρωση απαιτείται.

Υποστήριξη Πληροφορίες

S1 Εικ. Ανίχνευση των δειγμάτων πλάσματος

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε καρκίνο του στομάχου (GC).

Μια καμπύλη ROC για την αξιολόγηση της σημασίας του

Zic1

δοκιμές μεθυλίωση προαγωγού για τη διάγνωση GC.

Doi : 10.1371 /journal.pone.0133906.s001

(ΔΕΘ)

S2 Εικ. Συνδυασμένη ανίχνευση των δειγμάτων πλάσματος

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού και το επίπεδο CEA (δοκιμή tandem) σε γαστρικό καρκίνο (GC).

Μια καμπύλη ROC για να αξιολογηθεί η σημασία της συνδυασμένης ανίχνευση των δύο παραμέτρων (δοκιμές tandem .) για τη διάγνωση GC

doi: 10.1371 /journal.pone.0133906.s002

(ΔΕΘ)

S3 Εικ. Ανίχνευση των δειγμάτων πλάσματος

Zic1

μεθυλίωση προαγωγού σε γαστρικό ενδοεπιθηλιακή νεοπλασία (GPI).

Μια καμπύλη ROC για την αξιολόγηση της σημασίας του

Zic1

υποστηρικτής δοκιμές μεθυλίωσης για GPI διάγνωση.

doi: 10.1371 /journal.pone.0133906.s003

(ΔΕΘ)