PLoS One: Γενετικές μεταλλάξεις σε γονίδια που τριτο-CLPTM1L και κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική γυναίκες Nonsmokers


Αφηρημένο

Ιστορικό

Το γονίδιο TERT είναι η αντίστροφη μεταγραφάση συστατικό της τελομεράσης και είναι απαραίτητη για την η διατήρηση των τελομερών μήκος DNA, χρωμοσωμικό σταθερότητα και την κυτταρική αθανασία. CLPTM1L γονίδιο κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη που συνδέεται με σισπλατίνη αντίσταση, και είναι καλά διατηρημένη και εκφράζουν σε διάφορα φυσιολογικά ή κακοήθεις ιστούς, συμπεριλαμβανομένου του πνεύμονα.

Μέθοδοι

Για να ελεγχθεί αυτή η υπόθεση, έχουμε γονότυπου για δύο σημαντικές SNPs TERT-rs2736098 και rs4016981 CLPTM1L-σε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων με 501 περιπτώσεις καρκίνου και 576 του καρκίνου χωρίς ελέγχους στα κινέζικα nonsmoking πληθυσμού. Πληροφορίες σχετικά με τη δημογραφική και τους παράγοντες κινδύνου ελήφθησαν για κάθε περίπτωση και τον έλεγχο από έναν εκπαιδευμένο ερευνητή. πολυμορφισμών του γονιδίου προσδιορίστηκαν με τη μεθοδολογία TaqMan.

Αποτελέσματα

Βρήκαμε ότι η ομόζυγη γενετικό μοντέλο παραλλαγή του γονιδίου TERT σχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα με προσαρμογή OR 1,72 (95% CI = 1,19 – 2,51,

P

= 0.004 για την ετερογένεια). Η κοινή δράση της TERT και CLPTM1L αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα με προσαρμογή OR είναι 1,31 (95% CI = 1,00 – 1,74,

P

= 0,052 για την ετερογένεια).

Συμπέρασμα

Γενετικές παραλλαγές στο TERT και CLPTM1L μπορεί να επηρεάσει την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα, ειδικά αδενοκαρκινώματος στην κινεζική γυναίκες καπνίστριες

Παράθεση:. Li C, Γιν Ζ, Γου W, Λι Χ, Υ Ρεν, Zhou Β (2013 ) Γενετική παραλλαγές στα γονίδια τ-CLPTM1L και κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα στην κινεζική γυναίκες μη καπνιστές. PLoS ONE 8 (5): e64988. doi: 10.1371 /journal.pone.0064988

Επιμέλεια: Graham R. Wallace, Πανεπιστήμιο του Birmingham, Ηνωμένο Βασίλειο

Ελήφθη: 24 Οκτ, 2012? Αποδεκτές: 19 Απρίλη 2013? Δημοσιεύθηκε: May 30, 2013

Copyright: © 2013 Li et al. Αυτό είναι ένα άρθρο ανοικτής πρόσβασης διανέμεται υπό τους όρους της άδειας χρήσης Creative Commons Attribution, το οποίο επιτρέπει απεριόριστη χρήση, τη διανομή και την αναπαραγωγή σε οποιοδήποτε μέσο, ​​με την προϋπόθεση το αρχικό συγγραφέα και την πηγή πιστώνονται

Χρηματοδότηση:. Αυτή η μελέτη υποστηρίχθηκε από no.81272293 επιχορήγηση από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας, χορηγεί no.81102194 από το Εθνικό Ίδρυμα Φυσικών Επιστημών της Κίνας, χορηγεί no.LS2010168 από Liaoning επαρχιακή Υπουργείο Παιδείας, και να χορηγήσει no.00726 από την Κίνα Ιατρικό συμβούλιο.

Αντικρουόμενα συμφέροντα:. Οι συγγραφείς έχουν δηλώσει ότι δεν υπάρχουν ανταγωνιστικά συμφέροντα

Ιστορικό

Παγκοσμίως, ο καρκίνος είναι ένα από τα πιο κύρια αιτία των θανάτων από καρκίνο. Οι περισσότεροι τύποι καρκίνου αποδίδεται σε γονιδίων-περιβάλλοντος φαινόμενο της αλληλεπίδρασης. Ένας μεγάλος αριθμός ερευνών έχουν εστιάσει σε πολυμορφισμό του γονιδίου και της ευαισθησίας στον καρκίνο. Εκτός από τα διάφορα είδη των κληρονομικών όγκων, οι περισσότερες σποραδικές περιπτώσεις δεν έχει καθοριστεί ακόμα. Οι τελευταίες μελέτες δώσουν προσοχή στην τελομεράσης ανάστροφης μεταγραφάσης (TERT), χειλεογναθουπερωιοσχιστία διαμεμβρανική 1-σαν παραλλαγή του γονιδίου (CLPTM1L), η οποία τόπου στο χρωμόσωμα 5p15.33. Πολλές μελέτες συσχέτισης γονιδιώματος-ευρεία (GWAS) του καρκίνου έχουν αναφερθεί και με την προϋπόθεση ότι η γονιδιωματική περιοχή τ-CLPTM1L σχετίζεται τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Στις περισσότερες από τις μελέτες, ο κύριος των υποθέσεων και των ελέγχων ήταν καπνιστές τσιγάρων που έκανε δύσκολο να κρίνουμε κατά πόσον αυτά τα γονίδια που σχετίζονται με τον καρκίνο του πνεύμονα ή του καπνού χρησιμοποιούν [1]. Επιπλέον, ένα σημαντικό ποσοστό του καρκίνου του πνεύμονα στις γυναίκες της Ασίας εμφανίζεται μεταξύ των μη καπνιστών, οι οποίοι έχουν ενδιαφέροντα σχετικά υψηλό οργή του καρκίνου [2]. Επιπλέον, προηγούμενη μελέτη έδειξε τα στοιχεία που οι ενώσεις των πολυμορφισμών γονότυπο με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα θα μπορούσε να συγχέεται με το φύλο ή το κάπνισμα [3]. Ως εκ τούτου, πραγματοποιήσαμε μια μελέτη σύνδεσης γονιδίωμα-ευρεία σε ποτέ το κάπνισμα σε γυναίκες σε πληθυσμό Κινέζοι Χαν.

Το γονίδιο TERT είναι η αντίστροφη μεταγραφάση συστατικό της τελομεράσης και είναι απαραίτητη για τη διατήρηση του μήκους των τελομερών του DNA, χρωμοσωμικές σταθερότητα και κυτταρική αθανασία [4], [5]. δραστικότητα τελομεράσης βρέθηκε στο 85% -90% των ανθρώπινων καρκίνων. Επιπλέον, το μήκος των τελομερών στους περισσότερους όγκους θα διατηρηθεί για χάρη της ασυνήθιστα ρητή του τελομερών σε κακοήθη κύτταρα όπως τα περισσότερα από τα καρκινικά κύτταρα. Ωστόσο, αυτό το φαινόμενο δεν έχουν αποκαλύψει σε ιστό ή κύτταρα υγεία [6]. CLPTM1L γονίδιο κωδικοποιεί μια πρωτεΐνη που συνδέεται με σισπλατίνη αντίσταση μυρμήγκι είναι καλά διατηρημένη και εκφράζουν σε διάφορα φυσιολογικά ή κακοήθεις ιστούς, όπως του πνεύμονα του δέρματος, του μαστού, των ωοθηκών του τραχήλου της μήτρας [7].

Προηγούμενες μελέτες ανέφεραν ότι το γονίδιο TERT και CLPTM1L γονίδιο που σχετίζεται με τον κίνδυνο πολλών είδος των καρκίνων. Πρόσφατα, δύο γονιδίωμα-ευρεία μελέτες συσχέτισης έχουν προσδιορίσει το ίδιο ευαίσθητο περιοχή για τον καρκίνο του πνεύμονα. Μεταξύ αυτών των sites, rs2736098 οποία τόπου σε γονίδιο TERT έχει προσδιοριστεί το ευαίσθητο. Ταυτόχρονα, rs401681 βρίσκονται σε περιοχή υψηλής ανισορροπίας σύνδεσης (LD) που περιλαμβάνει τις περιοχές υποκινητή της TERT και ολόκληρη την κωδικεύουσα περιοχή του γονιδίου CLPTM1L ανέφερε επίσης πολλά. Για να ελέγξει την υπόθεση αυτή, που ο γονότυπος για δύο σημαντικές SNPs τ-rs2736098 και rs4016981 CLPTM1L-σε μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων με 501 περιπτώσεις καρκίνου και 576 του καρκίνου χωρίς ελέγχους στα κινεζικά πληθυσμό μη-καπνιζόντων.

Υλικά και Μέθοδοι

μελέτη Θέμα

Έχουμε λάβει έγκριση δεοντολογίας για τη μελέτη μας. Το όνομα της επιτροπής δεοντολογίας είναι η Κίνα Ιατρικού Πανεπιστημίου επιτροπή δεοντολογίας. Μπορούμε επίσης να φορτώσετε μια επίσημη γραπτή παραίτηση από την έγκριση ηθικής στο σύστημά σας.

Αυτή ήταν μια μελέτη ασθενών-μαρτύρων νοσοκομείο με βάση στα βορειοανατολικά της Κίνας. Όλα τα θέματα που είχαν σχέση εθνοτικών Κινέζων Χαν. Υπήρχαν κανένας περιορισμός ηλικίας και ιστολογία για την πρόσληψη και τα κριτήρια αποκλεισμού από τις περιπτώσεις που περιλαμβάνονται μετάσταση του καρκίνου, την προηγούμενη καρκίνο και η προηγούμενη ακτινοθεραπεία ή χημειοθεραπεία. Συνολικά 501 περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα ελήφθησαν 2002-2010 στο πρώτο συνδεδεμένες νοσοκομείο της Κίνας Ιατρικού Πανεπιστημίου και ιστοπαθολογικά καρκίνο Liaoning επιβεβαίωσε πρωτοπαθή καρκίνο του πνεύμονα. Οι 576 χωρίς καρκίνο έλεγχοι επιλέχθηκαν από το ίδιο νοσοκομείο ή να παρουσιάσει ιστορικό κακοήθους νόσου κατά την ίδια χρονική περίοδο, όπως είχαν προσληφθεί οι υποθέσεις και αντιστοιχήθηκαν συχνότητα σε διάκριση θέματα ανάλογα με την ηλικία (± 5 έτη). Έλεγχοι υπέφερε κυρίως από βρογχίτιδα, πνευμονική νόσο και εμφύσημα. Όλα τα άτομα που περιλαμβάνονται σε αυτή τη μελέτη είχαν εγγραφεί μόνο μετά την παροχή γραπτή συγκατάθεση για να συμμετάσχουν.

γονότυπου Ανάλυση

Το γονιδιακό DNA εκχυλίζεται από ένα σφαιρίδιο λευκοκυττάρων με τη χρήση πέψης πρωτεϊνάσης Κ που ακολουθείται από εκχύλιση με φαινόλη-χλωροφόρμιο και καταβύθιση αιθανόλης όπως περιγράφηκε προηγουμένως [8]. SNPs σε τόσο τ-rs2736098 και CLPTM1L-rs401681 γονότυπος από τους ερευνητές τύφλωσε με case-control κατάσταση, προκειμένου να αποφευχθεί οποιαδήποτε προκατάληψη του γονότυπου, χρησιμοποιώντας μεθοδολογία TaqMan και σε συνδυασμό με το λογισμικό εντοπισμού Sequence σε Applied Bio-systems 7500 FAST Real-Time PCR Σύστημα σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή (Applied Biosystems, Foster City, CA). εκκινητές TaqMan PCR και ανιχνευτές που παρέχονται από την Applied Biosystems. Κάθε πλάκα περιλάμβανε ένα αρνητικό μάρτυρα (όχι DNA), διπλές εμπορική θετικοί έλεγχοι (TaqMan Ελέγχου Γονιδιωματικό DNA? Applied Biosystems). Η ενίσχυση έγινε υπό τις ακόλουθες συνθήκες: 95 ° C για 10 λεπτά που ακολουθείται από 47 κύκλους των 92 ° C για 30s και 60 ° C για 1 λεπτό. Για την επικύρωση των αποτελεσμάτων του γονότυπου, 10% τυχαία επιλεγμένα δείγματα αντιγραφεί και όλα διπλές ήταν συμφωνημένα.

Στατιστική Ανάλυση

Δύο όψεων

x

2 τεστ χρησιμοποιήθηκε να εξετάσει διαφορές στις κατανομές των δημογραφικών χαρακτηριστικών, επιλεγμένες μεταβλητές και γονοτύπων μεταξύ ασθενών και μαρτύρων. Οι ενώσεις των γονότυπων της TERT και CLPTM1L με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα εκτιμήθηκε υπολογίζοντας τις αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και το 95% διάστημα εμπιστοσύνης τους (ΠΙ) και από τις δύο μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική μοντέλα λογιστικής παλινδρόμησης στην ανάλυση ασθενών-μαρτύρων. Η ισορροπία Hardy-Weinberg για κάθε SNP δοκιμάστηκε με

x

2 δοκιμασία Pearson ‘s. Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με προσαρμογή για την ηλικία και το εισόδημα και όλα τα άτομα ήταν γυναίκες το κάπνισμα. Όλες οι δοκιμασίες ήταν δύο όψεων, και η P & lt? 0,05 θεωρήθηκε σημαντική. Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν με τη χρήση του στατιστικού προϊόντος και Λύσεις Υπηρεσία λογισμικού. (V.16.0? SPSS Ινστιτούτο Cary, Chicago, IL)

Αποτελέσματα

Τα δημογραφικά στοιχεία για 501 περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα και 576 του καρκίνου οι -δωρεάν έλεγχοι παρουσιάζονται στον πίνακα 1, με μέσο όρο ηλικίας των περιπτώσεων και ελέγχων (μέση ± SD) είναι σχεδόν πανομοιότυπη (56,7 ± 11,6 και 56,2 ± 13,0 έτη αντίστοιχα). Δεν υπήρχε σημαντική διαφορά στην ηλικία μεταξύ των περιπτώσεων και των ελέγχων (

P

= 0.471). Περιπτώσεις περιλαμβάνονται 334 αδενοκαρκινώματα, 90 ακανθοκυτταρικό καρκίνωμα και 77 άλλων όγκων με μια ποικιλία διαφορετικών παθολογικών καταστάσεων (συμπεριλαμβανομένων των μεγάλων κυττάρων, μικροκυτταρικό καρκίνωμα και μικτών κυττάρων ή αδιαφοροποίητα καρκινώματα). Όλα τα άτομα που ήταν μη-καπνιστών θηλυκά.

Η

Οι παρατηρούμενες συχνότητες γονοτύπου μεταξύ των ατόμων της ομάδας ελέγχου ήταν τόσο σε συμφωνία με εκείνη που αναμενόταν υπό την ισορροπία Hardy-Weinberg (p

2 + 2pq + q

2 = 1,

P

= 0,065 για rs2736098 και 0,463 για rs401681). Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, το αλληλόμορφο rs2736098 Τ στο γονίδιο TERT συσχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων (

P

= 0,009 για την ετερογένεια), με προσαρμοσμένη ΕΑΠ 1,27 (95% CI = 1,06 – 1,52 ). Εν τω μεταξύ, θα μπορούσαμε να παρατηρήσουμε μια αυξημένη συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού rs2736098 και του κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα σε ένα γενετικό μοντέλο (TT vs CC: OR = 1.72, 95% CI = 1,19 – 2,51,

P

= 0,004 για την ετερογένεια ). Επιπλέον, όταν συνδυάσαμε τους γονότυπους παραλλαγή (ΤΤ + TC) υποθέτοντας ένα κυρίαρχο γενετικό μοντέλο, οι συνδυασμένες γονότυπους παραλλαγή αυξημένη μη σημαντικά την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα. Ωστόσο, δεν υπάρχει σημαντική συσχέτιση έδειξε μεταξύ τους γενετικό μοντέλο μεταξύ rs401681 στην CLPTM1L και τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα. Στη συνέχεια θα συνδυαστούν τα δύο SNPs να αξιολογήσει την κοινή τους επίδραση στον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα. Έχουμε κατηγοριοποιούνται όλες γονότυπων κάθε SNP σε τρεις ή δύο διαφορετικές ομάδες (trichotomized και διαχωρίστηκαν μεταξύ τους) σύμφωνα με τον αριθμό της παραλλαγής γονότυπους. Όπως φαίνεται στον Πίνακα 2, για διαχωρίστηκαν μεταξύ τους ομάδες, τα άτομα με 2 παραλλαγή γονότυπους είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα, σε σύγκριση με τα άτομα με 0 ή 1 παραλλαγή γονότυπους. Η προσαρμοσμένη OR είναι 1,31 (95% CI = 1,00 – 1,74,

P

= 0,052 για την ετερογένεια).

Η

Πίνακας 3 συνοψίζεται η σχέση μεταξύ της τ-rs2736098 και CLPTM1L-rs401681 γονότυπους στις περιπτώσεις καρκίνου του πνεύμονα και των ελέγχων, ανά τύπο ιστολογία. Το αλληλόμορφο rs2736098 Τ στο γονίδιο TERT συσχετίστηκε με σημαντικά αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε αδενοκαρκίνωμα υποομάδα (P & lt? 0,001 για ετερογένεια), με προσαρμοσμένη ΕΑΠ 1,43 (95% CI = 1,17 – 1,75). Λάβαμε επίσης μια στατιστικά σημαντική αυξημένη συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού rs2736098 και του κινδύνου adencarcinoma σε δύο γενετικά μοντέλα (TT vs CC: OR = 2.17, 95% CI = 1,44 – 3,25,

P

& lt? 0,001 για ετερογένεια? CT + CC vs CC: OR = 1.40, 95% CI = 1,05 – 1,86,

P

= 0,026 για την ετερογένεια). Επίσης, όπως περιγράφεται στον Πίνακα 3, C αλληλόμορφο σε CLPTM1L-rs401681 αυξάνει τον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα υποομάδας και την προσαρμογή OR είναι 1,23 (95% CI = 1.00-1.52,

P

= 0,046 για την ετερογένεια).

Συζήτηση

Για τις γνώσεις μας, αυτή είναι η πρώτη μελέτη που διερεύνησε αν οι δύο GWAS προσδιορισμένες γενετικές παραλλαγές (τ-rs2736098 και CLPTM1L-rs401681) στα 5p5.33 τόπο είναι σχετίζεται με τον κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων στους ποτέ το κάπνισμα σε Han-κινεζικές γυναίκες. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι το γονίδιο παραλλαγής αλληλόμορφο του rs2736098 ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, ιδιαίτερα σε αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα. Από την άλλη πλευρά, η μελέτη μας λαμβάνονται τα δεδομένα σχετικά με τον αυξημένο κίνδυνο αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα και το αλληλόμορφο rs401681 C στο γονίδιο CLPTM1L, ενώ οι άλλες γενετικές μοντέλα δεν είχαν στατιστικά σημαντική συσχέτιση με τον καρκίνο του πνεύμονα στις γυναίκες καπνίστριες.

Η γονίδιο TERT έχει χαρτογραφηθεί στο χρωμόσωμα 5p15.33 και αποτελούνταν από 16 εξώνια και 15 εσώνια που εκτείνονται 35KB γονιδιακού DNA [9], rs2736098 εντοπίζεται προς το δεύτερο εξώνιο του γονιδίου της τελομεράσης TERT. πρωτεΐνη TERT είναι μια καταλυτική υπομονάδα και ένας ρυθμιστής κλειδί της δραστικότητας τελομεράσης. Ως εκ τούτου, το τριτο θεωρήθηκε ότι είναι πιο αληθοφανής εκλέγεσθαι στις 5p15.33 για τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [4]. Η υπερέκφραση του TERT και τελομεράσης δραστικότητα έχει παρατηρηθεί σε πολλούς όγκους, όπως ο καρκίνος του πνεύμονα, ο καρκίνος του δέρματος, γλοίωμα. Παρ ‘όλα αυτά, η λειτουργική σημασία των rs2736098 SNP δεν ήταν σαφής και ο μοριακός μηχανισμός με τον οποίο ο πολυμορφισμός επηρεάζει τον κίνδυνο καρκίνου των πνευμόνων δεν έχει ακόμη διευκρινιστεί. Η έρευνά μας έδωσε την ισχυρή απόδειξη από το κινεζικό πληθυσμό που η 5p15.33 μπορεί να είναι αιτιώδης περιοχής να προδιαθέτουν για την ευαισθησία του καρκίνου του πνεύμονα, και το αποτέλεσμα των rs2736098 SNP ήταν η ίδια με την κορεατική πληθυσμού στην Ασία [10]. Μέχρι στιγμής, κανένα από τα ενδιαφερόμενα τη σχέση μεταξύ rs2736098 στο TERT και τον καρκίνο του πνεύμονα σε Καυκάσιο πληθυσμό, αν και βρήκαμε ότι η συχνότητα αλληλόμορφο μετάλλαξη σε Καυκάσιο πληθυσμό ήταν 37% μέσω HapMap μελετών, καθώς και τα δεδομένα στο ασιατικό πληθυσμό ήταν 41% (http : //snp.cshl.org/cgi-perl/gbrowse/hapmap24_B36/). Το γονίδιο CLPTM1L βρίσκεται επίσης στο χρωμόσωμα 5p15.33 και μπορεί να παίζει ένα ρόλο στην αποπτωτική απόκριση. Επιπλέον, CLPTM1L αποτελεί ένα ελκυστικό γονίδιο ευαισθησίας στον καρκίνο καθώς κωδικοποιεί μια μεταγραφή του οποίου η υπερέκφραση έχει συνδεθεί με την αντίσταση σισπλατίνη [7]. Η υπερέκφραση του mRNA CLPTM1L έχει παρατηρηθεί σε πολλούς τύπους καρκίνου, συμπεριλαμβανομένου του καρκίνου του πνεύμονα. Βάση για τα αποτελέσματά μας, rs401681 παραλλαγή αλληλόμορφο TERT δεν συμβάλλουν στον κίνδυνο του καρκίνου του πνεύμονα στις γυναίκες μη καπνίστρια. Παρ ‘όλα αυτά, όταν στρωματοποιημένη κατά παθολογία, το αλληλόμορφο C σε CLPTM1L-rs401681 αυξάνει τον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα υποομάδας και η προσαρμογή OR είναι 1,23 (95% CI = 1.00-1.52,

P

= 0,046 για την ετερογένεια). Ως εκ τούτου, η μελέτη μας προτείνει ότι παραλλαγή CLPTM1L-rs401681 γονότυπους μπορεί να παίζει διαφορετικούς ρόλους σε διαφορετικές υποομάδες παθολογία του καρκίνου του πνεύμονα. Κοιτάζοντας πίσω σε προηγούμενες μελέτες, τα αποτελέσματα που έχουν αναφερθεί δεν ήταν ικανοποιητικές, ακόμη και αντικρουόμενες. Για παράδειγμα, μια πρώιμη μελέτη ανέφερε ότι οι γονότυποι CLPTM1L Τ δεν συνδέθηκαν με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε έναν Καυκάσιο πληθυσμό [11]. Επιπλέον, δύο έρευνες ανέφεραν ότι πολυμορφισμό του γονιδίου CLPTM1L δεν συσχετίστηκε με τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα σε ένα ασιατικό πληθυσμό [15], [16]. Και οι δύο από αυτούς ήταν σύνολα δεδομένων νοσοκομείο. Παρ ‘όλα αυτά, οκτώ μελέτες συσχέτισης έδειξε ότι rs401681 αλληλόμορφο C οριακά αυξημένη συνολική καρκίνων του πνεύμονα κινδύνου, τόσο σε Καυκάσιους και μια ασιατική πληθυσμού [3], [12], [17] – [22]. Όχι πολύ καιρό πριν, μια μετα-ανάλυση ερευνηθεί από Yin et al. Διαπιστώθηκε ότι τα άτομα με τους γονότυπους αλληλόμορφο C είχαν υψηλότερο κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα [23]. Αν και αυτή τη μελέτη, εντυπωσιακά αυξημένος κίνδυνος βρέθηκε στην συνδέονται με το κάπνισμα καρκίνους, όπως ο καρκίνος του πνεύμονα. Μπορεί να εξηγηθεί ότι CLPTM1L πρωτεΐνη μπορεί να εμπλέκεται στην απόκριση απόπτωσης γονιδιοτοξικών στρες. Η πιθανή εξήγηση για τις διαφορές αυτές θα μπορούσαν να είναι ότι οι συχνότητες αλληλομόρφων σε διαφορετικές εθνικότητα ήταν αρκετά διαφορετική. Δεδομένα σε HapMap αποδεικνύουν ότι η συχνότητα αλληλόμορφο Τ σε Καυκάσιο πληθυσμό ήταν 43%, αλλά τα δεδομένα στην ασιατική πληθυσμού ήταν 29% (https://snp.cshl.org/cgi-perl/gbrowse/hapmap24_B36/). Η διακριτή επίσης, θα μπορούσε, λόγω της μεγάλης διαφοράς σε κάθε δείγμα μεγέθη. Οι περισσότερες από τις τελευταίες μελέτες GWAS περιείχε περισσότερα από δέκα χιλιάδες περιπτώσεις, καθώς και τους ελέγχους. Αντίθετα, όταν χρησιμοποιεί το TaqMan ή μεθοδολογία PCR-RFLP, οι άλλες έρευνες περιείχαν σχεδόν χίλια περιπτώσεις ή απλά αρκετές εκατοντάδες περιπτώσεις καρκίνου. Επιπλέον, οι διαφορές θα μπορούσαν να οφείλεται σε διαφορετική πηγή της ομάδας ελέγχου ή της μεθόδου του γονότυπου. Η ακριβής λειτουργική του CLPTM1L παραμένει ασαφής. Η προηγούμενη μελέτη εικάζουν ότι μπορεί να είναι σε ισχυρή LD με άλλα πιθανά λειτουργικά ή συνάφεια SNPs [7]. Ακόμη περισσότερο, μια θετική σχέση μεταξύ αλληλόμορφο rs401681 C και μικρότερο σε σχέση με το μήκος των τελομερών πρότεινε ότι το γονίδιο CLPTM1L ήταν υποψήφιος στις επηρεάζει τον καρκίνο του πνεύμονα ευαισθησία [24]. Ήταν ίδιο με το τριτο-rs2736098. Επιπλέον, η βάση για την πιθανή επίδραση που αλληλεπιδρούν μεταξύ TERT και CLPTM1L, θα κατηγοριοποιούνται όλες γονότυπους κάθε SNP σε δύο διαφορετικές ομάδες ανάλογα με τον αριθμό των παραλλαγή γονότυπους. Το μοντέλο διχοτομήσει έδειξε ότι τα άτομα με 2 παραλλαγή γονότυπους είχαν σημαντικά αυξημένο κίνδυνο για καρκίνο του πνεύμονα, σε σύγκριση με τα άτομα με 0 ή 1 παραλλαγή γονότυπους.

τ-CLPTM1L γονιδιωματικής περιοχής έχουν εκτενώς μελέτες σε πολλές περιοχές του καρκίνου σε διαφορετικούς πληθυσμούς, αλλά τα αποτελέσματα είναι αντικρουόμενα. Gago-Dominguez et al. [13] διαπίστωσαν ότι το γονίδιο παραλλαγής αλληλόμορφο και στα δύο τ-rs2736098 και CLPTM1L-rs401681 ήταν σημαντικά σχετίζεται με αυξημένο κίνδυνο καρκίνου της ουροδόχου κύστης στους κινεζικού πληθυσμού. Παρ ‘όλα αυτά, υπήρχε έλλειψη σύνδεσης μεταξύ των κοινών πολυμορφισμών ενός νουκλεοτιδίου στο τριτο-CLPTM1L τόπο και τον καρκίνο του μαστού σε μη ισπανόφωνων λευκών. Επίσης Chen et al. [14] ανέφεραν ότι ομόζυγη παραλλαγή γενετικό μοντέλο TERT-rs2736098 αυξημένο κίνδυνο γλοιώματος. Είναι αξιοσημείωτο ότι TERT-CLPTM1L γονιδιωματική περιοχή μεταξύ των ασιατικών πληθυσμός έχει συνδεθεί με αυξημένο κίνδυνο αρκετών τύπων καρκίνου. Αντίθετα, η έλλειψη μελετών ερεύνησαν άλλες εθνικότητες. Περισσότερες αποδείξεις πρέπει να παρέχονται στο μέλλον όσον αφορά τη σχέση μεταξύ τριτο-CLPTM1L γονιδιωματική περιοχή και τον κίνδυνο εμφάνισης καρκίνου σε διαφορετικές φυλές. Περαιτέρω μελέτες που λαμβάνουν υπόψη την ανάλυση υπόψη υποομάδας και περιβαλλοντικές πιέσεις στην περιοχή αυτή είναι απαραίτητη.

Συμπέρασμα

Εν κατακλείδι, η μελέτη μας έδειξε ότι τ-rs2736098 πολυμορφισμός μπορεί να αυξήσει τον κίνδυνο καρκίνου του πνεύμονα, ιδίως στο αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα στις γυναίκες καπνίστριες σε κινεζικού πληθυσμού. Επιπλέον, C αλληλόμορφο γονίδιο CLPTM1L-rs401680 μπορεί να μεταβάλλει τον κίνδυνο αδενοκαρκινώματος του πνεύμονα. Επειδή γενετικών πολυμορφισμών συχνά διαφέρουν μεταξύ των εθνοτικών ομάδων, η έρευνα αυτή θα μπορούσε να επεκταθεί και σε καλά σχεδιασμένες μελλοντικές μελέτες σε διαφορετικές εθνοτικές γυναίκες καπνίστριες.

You must be logged into post a comment.